計(jì)算數(shù)理実踐-HPC-課件

1、12009年度計(jì)算數(shù)理実踐-HPC-第3回遠(yuǎn)藤 敏夫2009年10月19日OpenMP共有(1)12009年度計(jì)算數(shù)理実踐-HPC-第3回遠(yuǎn)藤 敏夫Op2並列，分類逐次/共有分散達(dá)共通可能 OpenMP(言語(yǔ)拡張) pthread() CUDA (言語(yǔ)拡張)間通信必要 MPI () socket () UPC, HPF(言語(yǔ)拡張)2並列，分類逐次3並列分類分類MIMD(multiple instruction, multiple data)共有分散必一対一対応3並列分類分類共有4共有様対稱型共有Symmetric multi-processor(SMP)分散共有Distributed shar

2、ed memory(DSM)同性能 PC性能差 TSUBAME各 Origin 20004共有様対稱型共有5TSUBAME內(nèi):共有間:分散近年共有分散組合BlueGene, RoadRunner, T2K, 地球28DSM6556個(gè)2個(gè)図Tesla, ClearSpeed省5TSUBAME內(nèi):共有6內(nèi)場(chǎng)合(TSUBAME16並列以下)共有 (OpenMP)分散 (MPI)場(chǎng)合分散分散共有 (MPI + OpenMP)共有分散分散SMPDSM分散共有最適化違考慮6內(nèi)場(chǎng)合(TSU7OpenMP共有並列APIC言語(yǔ)，C+, Fortran対応並列化指示文，関數(shù)指示文：#pragma openmp 基

3、本Fork-Join変數(shù)基本的間共有以下明示的記述分割間同期変數(shù)共有區(qū)別7OpenMP共有並列A8OpenMP並列Region#include int main()A;#pragma omp parallelB;C;#pragma omp parallelD;E;ABCDE#pragma omp parallel直後文並列Region並列Region呼関數(shù)並列実行forkjoin8OpenMP並列Region#include omp.9數(shù)指定取得數(shù)指定外，OMP_NUM_THREADS環(huán)境変數(shù)n1ge-smp n內(nèi)omp_set_num_threads(n)関數(shù)#pragma omp para

4、llel num_threads(n)數(shù)取得omp_get_num_threads()関數(shù)自番號(hào)取得omp_get_thread_num()関數(shù)0以上數(shù)未満9數(shù)指定取得數(shù)指定10OpenMP対応近年増加PGI (pgcc)時(shí)時(shí)-mp並列?(7.2確認(rèn))Intel (icc)時(shí)時(shí)-openmp並列(10.1確認(rèn))Gcc 4.2以降時(shí)時(shí)-fopenmpTSUBAME殘念4.110OpenMP対応近年増加OpenMP用円周率tendo/aahpc09/pi-omp実行例： ./pi 1000000行列積tendo/aahpc09/mm1-omp 実行例: ./mm1 500 500 500実行前、e

5、xport OMP_NUM_THREADS=4 數(shù)指定利用指示文、次回紹介11OpenMP用円周率1112參考文獻(xiàn)OpenMP official site: OpenMP http:/phase.hpcc.jp/Omni/openmp-tutorial/index.htm東大OpenMPhttp:/www.cc.u-tokyo.ac.jp/seminar/kosyu/kosyu-openmp_c.pdf牛島省，OpenMP並列數(shù)値計(jì)算法，丸善，2006Red-black SOR, LU分解，F(xiàn)FTFORTRAN言語(yǔ)12參考文獻(xiàn)OpenMP official site: ht13連絡(luò)先/ContactTSUBAME，以下連絡(luò)計(jì)算世界観課金登録endois.titech.ac.jp題名：計(jì)算數(shù)理実踐subject: HPC lecture account専攻研究室學(xué)年氏名名E-mail (titech.ac.jp)Lecture web page:http:/compview.titech.ac.jp/Members/endot/