認(rèn)識(shí)新版pubmed課件

1、外文數(shù)據(jù)庫(kù)檢索浙江中醫(yī)藥大學(xué)圖書館 劉春金外文數(shù)據(jù)庫(kù)檢索MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)PubMedMedLine數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介Medline數(shù)據(jù)庫(kù)是當(dāng)前國(guó)際上公認(rèn)最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。是當(dāng)前檢索外文文獻(xiàn)使用頻率最高的數(shù)據(jù)庫(kù)。版權(quán)歸美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館 期刊收錄：1966年至今，共計(jì)4600多種刊物MedLine數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介數(shù)據(jù)庫(kù)類型為題錄型數(shù)據(jù)庫(kù)，其內(nèi)容包含印刷型檢索工具Index Medicus（美國(guó)醫(yī)學(xué)索引，IM）、Index to Dental Literature（牙科文獻(xiàn)索引）、International Nursing Index（國(guó)際護(hù)理索引）。大部分為英語(yǔ)語(yǔ)種的文獻(xiàn)，其中我國(guó)大陸期刊80多種。

2、MedLine數(shù)據(jù)庫(kù)使用形式 Medline數(shù)據(jù)庫(kù)按照提供服務(wù)的方式，共有三種使用形式： 1、Medline數(shù)據(jù)庫(kù)國(guó)際聯(lián)機(jī)檢索 2、Medline CD-ROM 3、基于WWW的因特網(wǎng)查詢系統(tǒng)PubMed。 MedLine數(shù)據(jù)庫(kù)使用形式MedLine CD-ROM由出版商將數(shù)據(jù)庫(kù)制成了光盤，然后郵寄給用戶 。不同出版商的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索界面略有不同，我國(guó)主要引進(jìn)Ovid（原Silver Platter)公司產(chǎn)品。檢索界面與CBMdisc類似。MedLine數(shù)據(jù)庫(kù)使用形式PubMed(=Public+Medicine)是美國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開(kāi)發(fā)的、基于WWW

3、的因特網(wǎng)檢索系統(tǒng)PubMed。 包括 MEDLINE和PREMEDLINE的完整內(nèi)容。它還包括一些被MEDLINE認(rèn)為超出范圍的文章和雜志。因此 PubMed 是比MEDLINE 的更大的集合。 NCBI相關(guān)介紹NCBI(National Center for Biotechnology Information，美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心)NCBI是目前國(guó)際上幾個(gè)重要分子生物信息網(wǎng)站之一，其成立的原因是為已故的參議院議員Claude Pepper發(fā)現(xiàn)計(jì)算信息處理方法對(duì)生物醫(yī)學(xué)研究的重要性，因此，在1988年11月4日成立NCBI。NCBI是National Institutes of Healt

4、h（NIH）底下的National Library of Medicine（NLM）的部門之一。由于NLM具有建立與維護(hù)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)經(jīng)驗(yàn)，且因它是NIH的單位，因此可執(zhí)行計(jì)算分子生物計(jì)劃。NIH目前是全世界最大的生物醫(yī)學(xué)研究單位。 NIH NLM NCBINCBI成立的主要任務(wù)為：提供生物醫(yī)學(xué)的分析與計(jì)算工具，協(xié)助研究人員了解生物的語(yǔ)言-DNA在健康與疾病中所扮演的角色發(fā)展新技術(shù)協(xié)助了解調(diào)控健康與疾病的基本分子與遺傳過(guò)程， 包括建立儲(chǔ)存與分析分子生物、生化與遺傳學(xué)知識(shí)的自動(dòng)系統(tǒng)；促 進(jìn)研究與醫(yī)學(xué)社群使用數(shù)據(jù)庫(kù)與軟件；協(xié)調(diào)生物技術(shù)信息的傳遞與管理；執(zhí)行以計(jì)算機(jī)為基礎(chǔ)的進(jìn)階信息分析過(guò)程，用以分析

5、生物重要分子的結(jié)構(gòu)與功能。NCBI組織架構(gòu)Computational Biology Branch （CBB）Information Engineering Branch（IEB）Information Resources Branch（IRB）NCBI組織架構(gòu)Computational Biology Branch（CBB）處理運(yùn)算、數(shù)學(xué)及分子生物、生物與遺傳學(xué)理論問(wèn)題的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究，包括基因體分析、序列比對(duì)、序列搜尋方法、巨分子結(jié)構(gòu)、動(dòng)力學(xué)與交互作用、結(jié)構(gòu)/功能預(yù)測(cè)等。建立NIH實(shí)驗(yàn)室、政府機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)單位與產(chǎn)業(yè)界之生物學(xué)家、化學(xué)家、數(shù)學(xué)家與計(jì)算機(jī)科學(xué)家間的計(jì)算分子生物合作研究計(jì)劃。提供研

6、究分子生物分析工具的咨詢與建議。與分子生物社群互動(dòng)，利用計(jì)算與理論方法提高實(shí)驗(yàn)研究質(zhì)量。NCBI組織架構(gòu)Information Resources Branch（IRB）計(jì)劃、監(jiān)督與管理NCBI的計(jì)算機(jī)技術(shù)操作，包含用來(lái)研究、發(fā)展與存取公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)。提供NCBI人員與外來(lái)使用者技術(shù)支持。提供NCBI服務(wù)之網(wǎng)絡(luò)操作指導(dǎo)。規(guī)劃使用NCBI資源的教育訓(xùn)練與研討會(huì)。計(jì)劃、發(fā)展與管理政府合約與合作協(xié)議書，已獲得支持NCBI信息功能的設(shè)備與服務(wù)。作為基因體計(jì)劃使用者與服務(wù)辦事處之聯(lián)絡(luò)人。執(zhí)行應(yīng)用研究與發(fā)展，提供技術(shù)支持與指導(dǎo)，鑒定使用者需求；管理生物使用社群之問(wèn)卷調(diào)查，以評(píng)估NCBI發(fā)展的軟件使

7、用情形。協(xié)調(diào)政府其它辦事處與生物信息資源，促進(jìn)NCBI數(shù)據(jù)儲(chǔ)存的發(fā)展。NCBI組織架構(gòu)NCBI還有一個(gè)跨多學(xué)科的基礎(chǔ)研究群，組成人員包括計(jì)算機(jī)科學(xué)家、分子生物學(xué)家、數(shù)學(xué)家、生化學(xué)家與物理學(xué)家，共同致力于計(jì)算分子生物的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究。他們一起研究利用數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)方法解決分子層面的基本生物醫(yī)學(xué)問(wèn)題，這些問(wèn)題包含了基因結(jié)構(gòu)偵測(cè)與分析、序列分析、立體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、重復(fù)序列類型（Pattern）、建立基因體圖譜、HIV感染動(dòng)力學(xué)的數(shù)學(xué)模型、分析序列錯(cuò)誤對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋的影響、發(fā)展數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋與多重序列比對(duì)的新算法、建立無(wú)重復(fù)的序列數(shù)據(jù)庫(kù)、使用數(shù)學(xué)模型評(píng)估序列相似性在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的重要性、建立文章檢索的載體（Vecto

8、r）模型等。除此之外，這些研究人員尚與NIH的研究單位、學(xué)術(shù)單位的研究實(shí)驗(yàn)室與政府機(jī)構(gòu)的研究實(shí)驗(yàn)室間維持合作關(guān)系，目前仍有多項(xiàng)研究計(jì)劃正在進(jìn)行當(dāng)中。NCBI資源生物數(shù)據(jù)庫(kù)生物數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)永久數(shù)據(jù)的大的組織體，通常結(jié)合計(jì)算機(jī)軟件執(zhí)行更新、查詢與存取數(shù)據(jù)的功能。對(duì)于研究人員而言，數(shù)據(jù)庫(kù)必須符合兩項(xiàng)功能：1,容易取得信息;2,只取得回答特殊生物問(wèn)題的信息。NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋與存取系統(tǒng)-Entrez，可用來(lái)獲取單一數(shù)據(jù)庫(kù)或許多數(shù)據(jù)庫(kù)的整合數(shù)據(jù)。例如Entrez蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)除了可查詢蛋白質(zhì)信息，同時(shí)亦可連結(jié)到生物分類數(shù)據(jù)庫(kù)查詢生物分類信息。目前，NCBI提供的公開(kāi)（Open Access）數(shù)據(jù)庫(kù)包括如

9、下：Entrez以及BLASTEntrez是NCBI的為用戶提供整合的訪問(wèn)序列，定位，分類和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的搜索和檢索系統(tǒng)。Entrez同時(shí)也提供序列和染色體圖譜的圖形視圖。Entrez是一個(gè)用以整合NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中信息的搜尋和檢索工具。這些數(shù)據(jù)庫(kù)包括核酸序列，蛋白序列，大分子結(jié)構(gòu)，全基因組和通過(guò)PubMed檢索的MEDLINE。Entrez的一個(gè)強(qiáng)大和獨(dú)特的特點(diǎn)是檢索相關(guān)的序列，結(jié)構(gòu)和參考文獻(xiàn)的能力。PubMed是一個(gè)網(wǎng)絡(luò)搜索界面，可以提供對(duì)在MEDLINE上的九百萬(wàn)雜志引用的訪問(wèn)，包含了鏈接到參與的出版商網(wǎng)絡(luò)站點(diǎn)的全文文章。 BLAST是一個(gè)NCBI開(kāi)發(fā)的序列相似搜索程序，還可作為鑒別基因和遺傳

10、特點(diǎn)的手段。BLAST能夠在小于15秒的時(shí)間內(nèi)對(duì)整個(gè)DNA數(shù)據(jù)庫(kù)執(zhí)行序列搜索。NCBI提供的附加的軟件工具有：開(kāi)放閱讀框?qū)ひ捚鳎∣RF Finder），電子PCR，和序列提交工具，Sequin和BankIt。所有的NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件工具可以從HTTP或FTP來(lái)獲得。Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫(kù)Books 出版社提供之?dāng)?shù)字生物醫(yī)學(xué)圖書與醫(yī)生參考書籍?dāng)?shù)據(jù)庫(kù)Cancer Chromosomes 美國(guó)國(guó)立癌癥研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer數(shù)據(jù)庫(kù)里已經(jīng)整合好的cytogenetic、臨床與文獻(xiàn)相關(guān)數(shù)據(jù)Conserved

11、 Domain Database（CDD），蛋白質(zhì)功能區(qū)塊保留序列數(shù)據(jù)庫(kù)3D Domains，蛋白質(zhì)功能區(qū)塊立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)Gene，包含許多物種的基因數(shù)據(jù)庫(kù)Genome，包含超過(guò)800種物種的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)GENSAT，小鼠中樞神經(jīng)系統(tǒng)基因表現(xiàn)圖譜GEO Datasets，基因表現(xiàn)實(shí)驗(yàn)與生物芯片數(shù)值結(jié)果數(shù)據(jù)GEO Profiles，基因表現(xiàn)圖譜HomoloGene，同源基因批注數(shù)據(jù)庫(kù)Journals，期刊文獻(xiàn)（包含PubMed）MeSH，醫(yī)學(xué)主題詞數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI Web Site，所有NCBI網(wǎng)頁(yè)NLM Catalog，美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館館藏書目、期刊、視聽(tīng)數(shù)據(jù)目錄Nucleotide seque

12、nce database，核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)（包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列數(shù)據(jù)庫(kù)）Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫(kù)Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人類遺傳疾病相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)PopSet，族群演化分析相關(guān)研究資料Protein sequence database，蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)（包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等數(shù)據(jù)庫(kù)與從GenBank、RefSeq核酸序列轉(zhuǎn)譯之蛋白質(zhì)序列資料）PubChem BioAssay，化學(xué)成分之生物活性篩選資料PubChem Compound，小分子化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)PubChem Sub

13、stance，具生物活性之化學(xué)物質(zhì)篩選數(shù)據(jù)PubMed，科學(xué)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed Central，科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)字全文數(shù)據(jù)庫(kù)Site Search，可搜尋NCBI的網(wǎng)頁(yè)與FTPSNP，單點(diǎn)核酸多樣性數(shù)據(jù)庫(kù)(dbSNP)Structure，分子模型數(shù)據(jù)(MMDB) Taxonomy，以核酸或蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的分類學(xué)信息UniGene，人類unique基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)UniSTS，unique序列卷標(biāo)地址數(shù)據(jù)庫(kù)Clinical Queries：為臨床醫(yī)生設(shè)置，通過(guò)過(guò)濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范圍：治療、診斷、病因與預(yù)后 循證PubMed簡(jiǎn)介 基于WWW的因特網(wǎng)檢索系統(tǒng)，網(wǎng)址：/pubmed/； 也

14、可由Google搜索引擎鏈接進(jìn)入（搜索詞為PubMed)正如其名字 PubMed=Public+Medicine所暗示，從1997年起完全免費(fèi)。PubMed數(shù)據(jù)范圍數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接。特點(diǎn)：免費(fèi)提供題錄和文摘提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費(fèi)獲取） 提供檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配操作簡(jiǎn)便、快捷In process citation提供MEDLINE尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。獲MeSH詞后，再加入MEDLINE。記錄中用PubMed-in process標(biāo)記表示。Publisher Supplied Citations出版商直接向PubMed提供電子記錄包括MEDLINE未收錄的部分

15、記錄記錄中用PubMed-as supplied by publisher標(biāo)記表示。OldMedline1950-1965年間發(fā)表的200多萬(wàn)篇文獻(xiàn)沒(méi)有MeSH字段和摘要記錄中用PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966標(biāo)記表示。PubMed not MedlinePubMed收錄Medline不收錄的文獻(xiàn)。記錄中用PubMed標(biāo)記表示。PreMedlinePubMedMedlinePubMed與MEDLINE的區(qū)別收錄范圍廣：MEDLINE收錄的部分生命科學(xué)相關(guān)文章的非醫(yī)學(xué)專業(yè)期刊（物理、天文、化學(xué)等）收錄記錄新：在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄文獻(xiàn)類型全：提供電子原文鏈

16、接（部分免費(fèi)）認(rèn)識(shí)新版PubMedPubMed首頁(yè)P(yáng)ubMed檢索結(jié)果頁(yè)P(yáng)ubMed結(jié)果顯示PubMed摘要顯示新版PubMed特色：簡(jiǎn)潔、清新檢索速度較快2022/10/335選擇數(shù)據(jù)庫(kù)/pubmed常用工具Welcome to PubMed使用幫助更多服務(wù)檢索詞輸入框出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))Summary結(jié)果篩選檢索提示認(rèn)識(shí)新版PubMed認(rèn)識(shí)新版PubMed調(diào)整顯示設(shè)置可改變顯示模式，顯示數(shù)量及檢索結(jié)果排序顯示設(shè)置顯示摘要顯示數(shù)量排序模式2022/10/339結(jié)果輸出在摘要顯示模式下可以看到詳細(xì)的文獻(xiàn)信息作者地址文獻(xiàn)摘要文獻(xiàn)作者文獻(xiàn)篇名全文鏈接文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)主題詞認(rèn)識(shí)新版P

17、ubMed出版社上傳PreMedlinePubMedMedlinePubMed數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的文獻(xiàn)的狀態(tài)，主要為Medline相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索檢索詳情認(rèn)識(shí)新版PubMed非英文的文獻(xiàn)篇名上有中括號(hào) 且注明有語(yǔ)種英文文獻(xiàn)土耳其語(yǔ) 篇名 英文文獻(xiàn)認(rèn)識(shí)新版PubMed電子優(yōu)先即最新文獻(xiàn)，一般比印刷出版提前三個(gè)月以上電子優(yōu)先2009年5月2008年9月認(rèn)識(shí)新版PubMedPubMed檢索方法PubMed基本檢索PubMed高級(jí)檢索PubMed限定檢索PubMed主題檢索臨床查詢檢索PubMed全文獲取 PubMed基本檢索在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會(huì)自

18、動(dòng)在主題詞表，期刊名表，短語(yǔ)表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點(diǎn)擊“Go”按鈕。 PubMed將自動(dòng)地利用它的“自動(dòng)詞匯匹配”功能將重要的詞語(yǔ)結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語(yǔ)轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動(dòng)轉(zhuǎn)換為：neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配： PubMed對(duì)輸入檢索框中的檢索詞進(jìn)行智能化地校對(duì)，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫(kù)中的各類術(shù)語(yǔ)

19、匹配的原則。MeSH Translation Table主題詞注釋表Journals Translation Table期刊注釋表Common Phrase List常用詞組表Author Index作者索引表No Mapping檢索詞拆分ANDPUBMED詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入檢索詞，系統(tǒng)將按順序使用如下4種索引，對(duì)檢索詞進(jìn)行轉(zhuǎn)換后再檢索。 （1）MeSH轉(zhuǎn)換表（MeSH Translation Table），包括MeSH詞、參見(jiàn)詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會(huì)自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和Text word詞（題名詞和文摘詞）進(jìn)

20、行檢索。例如：鍵入“Vitamin h，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成Biotin MeSH Terms OR Vitamin h Text word后進(jìn)行檢索。 PUBMED詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能（2）刊名轉(zhuǎn)換表（Journal Tanslation Table），包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號(hào)。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為MEDLINE縮寫后進(jìn)行檢索。如：在檢索提問(wèn)框中鍵入：“new england journal of medicine, PubMed將其轉(zhuǎn)換為N Engl J Med后進(jìn)行檢索。 PUBMED詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能（3）短語(yǔ)表（Phrase list）。該表中的短語(yǔ)來(lái)自Me

21、SH、含有同義詞或不同英文詞匯書寫形式的統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語(yǔ)言系統(tǒng)和補(bǔ)充概念（物質(zhì)）名稱表。如果PubMed 系統(tǒng)在MeSH和刊名轉(zhuǎn)換表中未發(fā)現(xiàn)與檢索詞相匹配的詞，就會(huì)查找短語(yǔ)表。 PUBMED詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能（4）著者索引（Author Index）。如果鍵入的詞語(yǔ)未在上述各表中找到相匹配的詞，或者鍵入的詞是一個(gè)后面跟有12個(gè)字母的短語(yǔ)，PubMed即查著者索引 PUBMED詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能 如果仍然找不到匹配詞，PubMed就會(huì)把該詞斷開(kāi)后再重復(fù)上述轉(zhuǎn)換過(guò)程，直到找到為止。若仍然沒(méi)有匹配詞，單個(gè)詞會(huì)被用AND連在一起，在全部字段中檢索。如：single cell，系統(tǒng)就會(huì)自動(dòng)將其分成兩個(gè)詞：“sin

22、gle“和“cell”檢索，其檢索表達(dá)式為：“single AND cell”。要查驗(yàn)檢索詞的轉(zhuǎn)換情況，可點(diǎn)擊“Details”鍵。自由詞檢索時(shí)PubMed自動(dòng)將不規(guī)范的詞轉(zhuǎn)換成規(guī)范的詞進(jìn)行檢索自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換PubMed基本檢索布爾邏輯組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND，OR，NOT等A BA B 邏輯與（AND） -檢出記錄中同時(shí)含有檢索詞A和檢索詞B. 如：A AND B 邏輯非（NOT） -在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。 如：A NOT B 邏輯或（OR） -檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時(shí)含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。 如：A OR BA BPubMed基本檢索 作者姓名檢

23、索 按照姓+名縮寫（不用標(biāo)點(diǎn)）的格式鍵入作者姓名，如：smith ja或jones k, 系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。姓名第一個(gè)字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。 考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索，如：smith j將檢索成smith ja,smith jb,smith jr 等。 精確檢索：可以用雙引號(hào)將作者名引起來(lái)，再加作者字段限定AU，如：smith jau，這樣可避免PubMed自動(dòng)轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找。PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標(biāo)點(diǎn)鍵入作者姓名smith jPubMed基本檢索

24、精確檢索避免PubMed自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找smith jauPubMed基本檢索期刊檢索 在檢索框中鍵入期刊名，如：molecular biology of the cell，系統(tǒng)的“自動(dòng)詞語(yǔ)匹配”功能會(huì)將它轉(zhuǎn)換成mol biol celljournal進(jìn)行檢索。 也可以直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式，如：mol biol cell，或者是輸入刊物的ISSN（國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進(jìn)行檢索，如：1059-1524。 如果一個(gè)雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer， science，cell等，PubMed會(huì)首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進(jìn)行檢索。因此，需要將檢索

25、請(qǐng)求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，即在雜志名后面加TA。如：celltaPubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號(hào)Eur J ImmunolPubMed基本檢索期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢索，是在期刊名后面加字段限定TA. 比如:celltacelltaPubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫(kù)（journal database)期刊數(shù)據(jù)庫(kù)的作用：1、可以查看期刊的詳細(xì)信息，包括出版國(guó)家，出版社，出版語(yǔ)言，期刊類目等等；2、可以根據(jù)期刊的主題分類，查看medline收錄的各學(xué)科的期刊，比如查看medline收錄的關(guān)于麻醉學(xué)(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便檢索某本期刊上被PubM

26、ed收錄的所有文章。比如：我們想知道期刊Acad Pediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：點(diǎn)擊導(dǎo)航欄上的Journal database，打開(kāi)期刊數(shù)據(jù)庫(kù)檢索界面，在檢索框中輸入Acad Pediatr，再點(diǎn)擊Go按鈕即可。PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫(kù)在PubMed首頁(yè)導(dǎo)航欄的右下角部分期刊數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫(kù)可以查看指定期刊的詳細(xì)信息Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed基本檢索按期刊主題瀏覽medline收錄的各學(xué)科的期刊期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed基本檢索按字母順序?yàn)g覽medline收錄的各學(xué)科期刊麻醉學(xué)方面PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫(kù)

27、可以方便的查看medline收錄的各學(xué)科方面的期刊medline收錄的麻醉學(xué)方面的期刊PubMed基本檢索 截詞檢索截詞檢索的作用：擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個(gè)字符，將*加在檢索詞后可以表示對(duì)所有以該詞開(kāi)頭的詞進(jìn)行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多600個(gè)單詞。PubMed基本檢索截詞檢索可以擴(kuò)大檢索范圍提高查全率。bacter*TIPubMed基本檢索字段限制檢索采用字段限制方式進(jìn)行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1字段標(biāo)識(shí) 邏輯運(yùn)算符 檢索詞2字段標(biāo)識(shí)如：查找作者為crick在1993年

28、發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn).檢索式：DNAmh AND crickau AND 1993dpPubMed基本檢索字段限制檢索其規(guī)則是：檢索詞+字段標(biāo)識(shí) DNAmh AND crickau AND 1993dpPubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)Titleti：篇名字段Abstractab：摘要字段Affiliation ad：著者地址字段。Author nameau：文章的作者，檢索格式：姓+名。如：smith jaauJournal titleta：期刊名稱。如：celltaLanguagela：論文出版語(yǔ)種。語(yǔ)種檢索時(shí)可只輸入前3個(gè)字母，如：chila=chinesela；Engli

29、shlang=engla比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式:hypertensionti AND chilaPubMed基本檢索hypertensionti AND chila檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)Publication datedp:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DDDP要檢索一段時(shí)期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號(hào)，如：1993/01:1995/06DPPublication typept:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗(yàn)等。如：reviewptMeSH termsmh：主題詞字段。如：

30、hypertensionmhSubheadingssh:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如：檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)。hypertensionmh AND 1995/01:1996/12DP AND reviewptPubMed基本檢索檢索 1995 年到 1996 年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)hypertensionmh AND 1995/01:1996/12DP AND reviewptPubMed基本檢索強(qiáng)制檢索功能PubMed允許使用雙引號(hào)來(lái)強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語(yǔ)檢索。如：在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入“single cell”，并用雙引號(hào)引起來(lái)。

31、點(diǎn)擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫(kù)的全部字段中進(jìn)行檢索。如果不使用雙引號(hào)進(jìn)行強(qiáng)制檢索，系統(tǒng)就會(huì)將其分成2個(gè)詞：single和cell檢索，其檢索表達(dá)式為：single AND cell. 很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號(hào)要求的。PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索普通檢索single cellsingle cellPubMed基本檢索高級(jí)檢索PubMed高級(jí)檢索PubMed高級(jí)檢索預(yù)覽檢索詳情檢索史高級(jí)檢索界面下可以看到明細(xì)欄，預(yù)覽，檢索史，限定和組合檢索等姚開(kāi)泰院士2001年以來(lái)被Medline收錄的文獻(xiàn)2022/10/378高級(jí)檢索2022/10/3792022/10/3802

32、022/10/381檢索結(jié)果PubMed限定檢索限定檢索范圍為發(fā)表在臨床核心期刊上的有全文鏈接的英文文獻(xiàn)出版時(shí)間臨床核心期刊限定為英文Limit限定有全文鏈接文獻(xiàn)類型年齡段PubMed主題檢索醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(kù)(MeSH Database) 醫(yī)學(xué)主題詞表是對(duì)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表，它的作用是使醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的主題標(biāo)引和檢索達(dá)到統(tǒng)一和一致，并指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)。它可以指導(dǎo)用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關(guān)系。醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(kù)(MeSH Database)利用主題詞進(jìn)行檢索方法:1、點(diǎn)擊主頁(yè)右下角的MeSH Database進(jìn)入主

33、題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點(diǎn)擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞；3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹(shù)狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點(diǎn)擊send to按鈕，進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口；5、點(diǎn)擊Search PubMed將顯示檢索結(jié)果。PubMed主題檢索主題詞數(shù)據(jù)庫(kù)在PubMed首頁(yè)導(dǎo)航欄的右下角主題詞數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed主題檢索輸入普通詞查找對(duì)應(yīng)主題詞MeSH主題詞檢索可以指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)PubMed主題檢索一般一個(gè)主題詞還要配合一個(gè)副主題詞進(jìn)行組合檢索選擇副主題詞PubMed主題檢索Search Box with AND點(diǎn)Sent to 將

34、檢索詞添加到檢索表達(dá)式瀏覽窗口PubMed主題檢索Search PubMed主題詞檢索可以達(dá)到比較滿意的查全率和查準(zhǔn)率PubMed主題檢索主題詞檢索是在有主題標(biāo)引的Medline數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索主題詞檢索結(jié)果PubMed主題檢索普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結(jié)果相關(guān)度低普通詞檢索結(jié)果PubMed主題檢索PubMed記錄字段說(shuō)明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識(shí)別號(hào)著者群版權(quán)說(shuō)明參考評(píng)論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評(píng)論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號(hào)基因符號(hào)期編號(hào)

35、資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)美國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館識(shí)別號(hào)期刊全稱最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識(shí)別號(hào)病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁(yè)數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間期刊出版國(guó)數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)編號(hào)作為主題詞的個(gè)人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子） 參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)以及文章討論的分子序列訪問(wèn)號(hào)原文來(lái)源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼臨床查詢檢索 “Clinical queries”是專門為臨床醫(yī)生研究設(shè)計(jì)的內(nèi)置的臨床方法學(xué)“過(guò)濾

36、器” （Clinical Methodology Filters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)研究人員Haynes RB等人在1994年提出來(lái)的，并進(jìn)行了查全率和查準(zhǔn)率分析。用戶通過(guò)這一臨床方法學(xué)檢索過(guò)濾器，不需掌握復(fù)雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻(xiàn)。 “Clinical queries”通過(guò)過(guò)濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范圍：治療、診斷、病因與預(yù)后、循證 使用方法:1、點(diǎn)擊主頁(yè)左側(cè)導(dǎo)航欄的Clinical Queries進(jìn)入臨床查詢頁(yè)面；2、在檢索框中輸入檢索詞，并選擇副主題詞組配，指定檢索結(jié)果是查全(sensitive)，還是查準(zhǔn)(specific)；3、點(diǎn)擊GO按鈕執(zhí)行檢索。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngeal cancer治療方面的研究文獻(xiàn)”臨床查詢檢索臨床查詢?cè)赑ubMed首頁(yè)導(dǎo)航欄的中間部分臨床查詢臨床查詢檢索臨床查詢主要用于檢索臨床方面的研究文獻(xiàn)臨床查詢檢索臨床查詢檢索臨床查詢主要包括某種疾病的治療，診斷病因和預(yù)后四個(gè)方面檢索結(jié)果臨床查詢檢索PubMed