超聲診斷學基礎(chǔ)

1、超聲診斷學基礎(chǔ)第1頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三一、PubMed數(shù)據(jù)庫簡介 PubMed是美國國家醫(yī)學圖書館(NLM)下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學數(shù)據(jù)庫查詢系統(tǒng)。PubMed的網(wǎng)址：特點：收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備，可少部分獲取原文。P75第2頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三二、通過PubMed可檢索到如下的信息 MEDLINE PreMedline 出版商提供的書目信息 NCBI其它數(shù)據(jù)庫的相關(guān)記錄第3頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三MEDLINE MEDLIN

2、E：是美國國立醫(yī)學圖書館MEDLARS系統(tǒng)中最大的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫，收錄1966年以來70多個國家近4300種生物醫(yī)學期刊的書目信息和著者文摘，每周更新。每條記錄均帶有PubMed-Indexed for MEDLINE標志。第4頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三PreMedline：收集未正式給予MeSH詞、出版類型等深度標引信息的一個臨時庫。NLM每天把最新記錄加入到PreMedline庫中，每條記錄均帶有PubMed-in Process標志。工作人員在一周內(nèi)將這些記錄標引，然后轉(zhuǎn)入MEDLINE，同時從PreMedline中刪去。PreMedline第5頁，共81

3、頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三Pre-MedlineMedlineNew DataCollectPubMedProcessPubMed第6頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三出版商提供的書目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分沒有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存，在記錄中做PubMed-as supplied by publisher的標記。第7頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三圖1以下是幾條PubMed的記錄，標記不同，其出自的分庫也不同第8頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三NCBI其它數(shù)

4、據(jù)庫的相關(guān)記錄：PubMed建立了與NCBI其他數(shù)據(jù)庫之間聯(lián)系。它們是雙向網(wǎng)絡(luò)互連的關(guān)系（見下頁圖）。其它庫第9頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三NCBI中通過Entrez可互查的數(shù)據(jù)庫第10頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三三、PubMed頁面的結(jié)構(gòu) 登錄 PubMed主頁第11頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第12頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三PubMed頁面的結(jié)構(gòu) 檢索提問區(qū)相關(guān)數(shù)據(jù)庫鏈接、 檢索提問框 、輔助檢索工具檢索提示區(qū)對各項檢索功能的簡單描述輔助功能區(qū)Entrez簡介、 Pub

5、Med服務(wù)、特有檢索、相關(guān)資源第13頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三NCBI數(shù)據(jù)庫Nucleotide：DNA序列數(shù)據(jù)庫Protein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫Genome：基因組序列數(shù)據(jù)庫Structure：分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫Popset：種群、種系發(fā)生或突變序列數(shù)據(jù)庫Taxonomy：微生物類別數(shù)據(jù)庫OMIM：人類孟德爾遺傳學在線數(shù)據(jù)庫。第14頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三PubMed輔助檢索工具Limits （限制功能）Preview/Index（預覽/索引）History（檢索史）Clipboard（剪貼板或文件夾）Details（明細欄）

6、第15頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三Journal Browser-雜志瀏覽器MeSH Browser-主題詞瀏覽器Citation Matcher-在表格輸入刊物的引文信息來定位特定文章。Clinical Queries-與臨床相關(guān)的療法，診斷，病因，預后Cubby-提供檢索策略存儲空間Order Documents-購買原文Grateful Med-連接到NLM提供的其他服務(wù)。Clinical Alerts-公布NIH資助重要臨床研究結(jié)果Clinical Trials-對公眾提供臨床科研的當前信息PubMed Central-可免費提供全文生命科學文獻服務(wù)功能第

7、16頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能詞語檢索及自動詞語匹配作者姓名檢索雜志名稱檢索截詞檢索短語檢索邏輯運算符檢索第17頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（一）詞語檢索及自動詞語匹配在檢索框中鍵入一到多個檢索詞，按“GO”鍵，即顯示檢索結(jié)果。 “clear”按鈕可以幫你清除查詢框中的內(nèi)容，然后開始一個新的查詢。第18頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第19頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第20頁，共81頁，2022年，5月20日，10點2

8、1分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（一）自動詞語匹配PubMed能自動利用它的“自動詞語匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成規(guī)范的用詞。如：輸入vitamin c common cold，系統(tǒng)會將自動轉(zhuǎn)換成(“ascorbic acid”MeSH Terms OR vitamin cText Word) AND (“common cold”MeSH Terms OR common cold Text Word)進行檢索。這種處理能使檢索結(jié)果更精確和全面。第21頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第22頁，共81頁，2022年，5月20日，10點

9、21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（二）作者姓名檢索 在檢索框內(nèi)按照姓+名縮寫(不用標點)的格式鍵入作者姓名，如Smith ja，系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。 如果想進行更精確的檢索，可以用雙引號將作者名引起來，再加au，如“smith j”au 第23頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第24頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（三）雜志名檢索在檢索框中鍵入雜志全名molecular biology of the cell也可以直接鍵入Medline的期刊標準縮寫形式，如：mol boil cell，鍵入

10、刊物的ISSN(國際標準出版物代碼）進行檢索，如1059-1524。Cell transplantation ta第25頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第26頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（四）截詞檢索可利用系統(tǒng)的截詞功能獲取更多的相關(guān)文獻，這與Medline光盤中截詞檢索的用法是相同的：截詞符“*”可代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索；如：bacter*，可以檢出bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage等詞。PubMed一次最多可以檢

11、索出150個詞形變異詞。如staph*，可以產(chǎn)生150個起作用，可以采取加長詞根的方法進行檢索。第27頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（五）短語檢索PubMed首先將鍵入的檢索詞（詞組）視為合理的短語在短語索引中進行查找。如：poison ivy，PubMed將其視為詞組進行查找。當PubMed沒有找到該詞組時，系統(tǒng)將自動把兩個詞分開進行檢索；如果不希望系統(tǒng)將兩詞分開，則需要用“”把檢索詞括起來，即強迫PubMed進行詞組檢索。如“single cell”。當用雙引號括起詞語時，PubMed將不執(zhí)行自動詞語匹配功能。 第28頁，共81頁，

12、2022年，5月20日，10點21分，星期三四、PubMed的基本檢索功能（六）邏輯運算符檢索在檢索框中輸入邏輯運算符，注意要大寫，執(zhí)行順序從左向右，可用括號來改變此順序。如：lung cancer AND smok* #1 OR #2 (#1 OR #2) AND #3第29頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三五、 PubMed輔助檢索工具（一）1. Limits（限制功能）:對檢索詞的限定和修飾，包括字段、年齡、性別、研究對象、出版類型、語種、出版或輸入日期以及子字段等。第30頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三All Field（字段選擇）：共

13、有23個字段可供選擇Publication Types（出版物類型選擇）：有8種類型Languages（語種選擇）：提供常用的7種語種Ages（年齡組選擇）：共有12個年齡段Gender（性別選擇）：男性、女性Human or Animal（人或動物實驗選擇）Subsets（子集）：8個子集Dates（日期）limited第31頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三五、 PubMed輔助檢索工具（二）2. Preview/Index：Preview是對檢索結(jié)果進行預覽，顯示檢索結(jié)果的條數(shù)和最近三次檢索式，用戶可根據(jù)具體情況在檢索提問框中用邏輯運算符組配新的檢索式。Index

14、是對提交的檢索詞列出按字順排列的某一字段的索引詞表的位置和數(shù)量（括弧內(nèi)），可用流動條來回進行查看列表。選中的詞高亮顯示，然后選擇合適的邏輯運算符進行檢索。第32頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三preview1檢索Common Cold AND Vitamin C第33頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第34頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第35頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第36頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第37頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分

15、，星期三3. History: 保留所有的檢索策略和結(jié)果，只有在執(zhí)行了一次檢索后，History才能有記錄。顯示檢索序號、檢索詞、檢索時間以及檢索結(jié)果數(shù)量。可在檢索序號之間添加邏輯運算符進行檢索，如#2 AND #6單擊記錄條數(shù)超級鏈接可以重新顯示檢索結(jié)果。點擊Clear History按鍵可以清除History和Preiew/Index中的信息。最多存貯檢索式數(shù)為100個，檢索式的存貯時間為1小時。五、 PubMed輔助檢索工具（三）第38頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第39頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三五、 PubMed輔助檢索工具（

16、四）4. Clipboard：剪貼板或文件夾。用于用戶將檢索選中記錄的暫時保存，方便用戶集中打印、下載或索取原文。剪貼板中可存的最多記錄為500條，如果一小時內(nèi)無作何操作，記錄將自動消失。 將文獻添加到Clipboard 在檢索結(jié)果界面點擊記錄左側(cè)的復選框，再點Add Clip。被添加到Clipboard中的記錄，檢索記錄的數(shù)字將變成綠色。第40頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第41頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第42頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第43頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三五

17、、 PubMed輔助檢索工具（五）5. Details：了解PubMed通過自動詞語匹配功能、句法規(guī)則轉(zhuǎn)換出的實際檢索策略和調(diào)整、保存檢索策略。在檢索框下面，顯示出檢索結(jié)果的總數(shù)?？梢栽跈z索框中修改檢索策略，再點擊Search按鍵重新執(zhí)行檢索。點URL按鈕，檢索策略將顯示在URL框中，再用瀏覽器的書簽收藏功能保存該策略。第44頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第45頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三六、特別檢索服務(wù)Journal Browser：期刊瀏覽器MeSH Browser： 主題詞瀏覽器Citation Matcher：單篇/多篇 引文匹

18、配器 Clinical Queries： 臨床咨詢第46頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三1. Journal Browser：期刊瀏覽器 查找指定期刊上發(fā)表的文章?？煞謩e以期刊的全名或名稱某個詞、期刊名稱在MEDLINE的縮寫或ISSN號來檢索；若點擊超鏈 journals with links to full-text web sites，可獲取與PubMed鏈接提供全文的期刊名單。第47頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第48頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第49頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，

19、星期三2. MeSH Browser：主題詞瀏覽器 幫助用戶查找MeSH詞進行檢索，瀏覽器提供了每個主題詞的信息和層次結(jié)構(gòu)，此外，用戶可以直接選用副主題詞來限制主題詞的主要領(lǐng)域。如果輸入的詞在MeSH詞表中沒有，MeSH瀏覽器將顯示相關(guān)的MeSH詞。第50頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第51頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第52頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三3. Citation Matcher單篇/多篇引文匹配器 單篇引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找論文的題錄。經(jīng)常用

20、于核對參考文獻的著錄細節(jié)。 多篇引文匹配器是給出版商用的，一般用戶不使用。第53頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第54頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第55頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三4. Clinical Queries臨床咨詢(一) 為了幫助臨床醫(yī)生更有效地獲取PubMed數(shù)據(jù)庫中一般疾病的病因?qū)W、預后、診斷、預防以及治療等方面的信息，PubMed系統(tǒng)設(shè)置了Clinical queries功能項。該項具備特殊的過濾器裝置能將上述主題文獻集中提供檢索，這樣可以濾除部分不相關(guān)或相關(guān)性差的文獻。 第56頁，共81頁

21、，2022年，5月20日，10點21分，星期三4. Clinical Queries臨床咨詢（二） 治療（therapy)研究范疇 診斷(diagnosis) (Category) 病因(etiology) 預后(prognosis) 強調(diào)程度 靈敏度Sensitivity(Emphasis) 專指度Specificity第57頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三第58頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三七、檢索結(jié)果的處理（一）顯示檢索結(jié)果(Display)：PubMed可用6種不同的格式顯示檢索結(jié)果，默認Summary格式。可通過Display下拉

22、菜單選擇其它顯示方式：Brief，Abstract，Citation，MEDLINE and ASN.1等，可以根據(jù)需要進行選擇。 點擊Text鍵，系統(tǒng)顯示記錄的純文本形式。 點擊Show鍵，可選擇每頁顯示的記錄條數(shù)。 點擊Select Page的數(shù)字，顯示相應(yīng)Web頁的記錄點擊Sort鍵，可以分類顯示。第59頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三Display第60頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三text第61頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三text1第62頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三sho

23、w第63頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三page第64頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三sore第65頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三各種顯示方式的主要內(nèi)容Summary作者姓名、文章題目、出處、記錄狀態(tài)、語種、出版物類型、PMID。Brief作者姓名、文章題目的前30個字母、PMIDAbstract出處、記錄狀態(tài)、文章題目、作者姓名、作者單位、文摘、出版物類型、縮寫、注釋、PMID等。Citation出處、記錄狀態(tài)、文章題目、作者姓名、作者單位、文摘、出版物類型、縮寫、注釋、MeSH、化學物質(zhì)名稱、SI數(shù)據(jù)庫索取號、

24、基金號、PMID等。MEDLINE所有記錄字段都是以兩個字目格式顯示，應(yīng)用該格式保存套錄記錄可以用文獻管理者軟件保存。第66頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三七、檢索結(jié)果的處理（二）保存(Save)瀏覽器提供的保存功能可保存當前屏幕上的結(jié)果；點擊sent to file，可以保存所有的檢索結(jié)果或選擇保存；系統(tǒng)允許以不同的顯示格式保存檢索結(jié)果；最多一次可以保存10000條。可以保存Clipboard中的記錄，Clipboard中最多可有500條記錄。存盤時PubMed默認文件名為“query.fcgi”。該文件名可以修改，文件格式也可在“.fcgi”和“.txt”中選擇。第67頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三save直接全部存在本地盤第68頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三save1第69頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三save2第70頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三七、檢索結(jié)果的處理（三）打印(Print)可以利用瀏覽器的打印鍵進行屏幕上內(nèi)容的打印。如果要選擇打印，可以先將所選的文獻添加到Clipboard，然后再打印。第71頁，共81頁，2022年，5月20日，10點21分，星期三七、檢索結(jié)