如何查找基因的序列

1、如何查找基因序列？（轉載）如何查找基因序列？在G中尋找目的基因的實例獻給受類似問題困擾的廣大酷友，以及給我動力和信心發(fā)表原創(chuàng)帖的基因酷的朋友們?？嵊迅醒裕壕W(wǎng)絡的世界很精彩，網(wǎng)絡的查詢很無奈。為了我們的科學研究事業(yè)，為了我們能夠順利畢業(yè)，我們的廣大酷友們在網(wǎng)絡的海洋里遨游遨游咋就找不到彼岸呢？今天要設計這個基因的引物，明天又要查那個基因的信息，那么大一張網(wǎng)，唉想起來就郁悶鑒此，我們推出了利用G查找基因序列的帖子，希望對大家有所幫助，并請大家多多指教！當然，如果您已經是此中高手，那就權當我是班門弄斧了，呵呵。1.根據(jù)文獻搞肯定要讀文獻的，如果你曾經在文獻中看到過你感興趣的基因，而且文中還提到了該基

2、因在G中的號,那就好辦了,直接打開，在后的下拉框中選擇，把G號輸入GO前面的文本框中，點“GO”,就可以找到他了。舉例說明，例如：在年的文章（Integrin-linkedKinaseDemonstratesanEssentialRoleinroteininaseBktcti）中出現(xiàn)了“calreticulin（GenBankaccessionnumbergi16151096）”，那么把“16151096”輸入GO前面的文本框中，點“GO”，就可以找到該基因了（當然包括基因序列等相關信息）。在出現(xiàn)了檢索結果界面（下圖）后，直接點擊紅箭頭所指的AY047586就可以看到基因的相關信息了.（.呵呵

3、，是不是有點太easy了）這里需要指出一下，在顯示基因的頁面右側有一個ink點擊后出現(xiàn)一個小菜單，里面是與該基因相關的鏈接，很有用的，值得一個一個地去看看，這里我就不多說了。點擊0后出現(xiàn)的界面如下：如果你只想獲得序列（例如去設計引物的時候），那就可以選擇S這樣就得到了格式的序列文件，沒有其他數(shù)字和格式的干擾。（縮略圖，點擊圖片鏈接看原圖）這就是格式的序列：（縮略圖，點擊圖片鏈接看原圖）2.根據(jù)已經獲得的基因的相關信息進行查找（待續(xù)）.鼓勵一下吧，累壞了正如路漫漫所說，如果只是知道基因的名字，怎么查序列呢？還是舉例說明，比如我想做的基因名稱是人的G基因，那么怎么在Genbank中找到它呢？還是一

4、步一步來打開ttncbinlmnigo在searc后面的下拉框中選擇Gene，然后在中間的文本框中輸入基因名稱“VEGF”，點擊GO搜索結果出來了，啊，怎么這么多？條，哪一條是我想要的基因呢？（作者注：這也許是大多數(shù)人對G的第一印象，即東西太多了,不知道是哪個。）別急，咱們慢慢來，我就要亮出去偽存真的秘密武器了，呵呵點擊箭頭所指的的意思其實就是高級檢索，你可以在這里對檢索詞進彳丁很多限制，這樣能大大精簡查詢結果。我們接著來，在這個界面，先選擇查詢的限定范圍。我們要找什么基因來著？想起來了，是人的VEGF基因，那就開始選擇：先選G基因名稱）然后再選擇（生物分類限定）中的（人類），然后再點擊“GO

5、”哇，只有一個結果，是不是搞定了？（呵呵，好有面子哦）直接點擊基因名稱“VEGFA”就可以看到有關基因的信息了。需要指出的是，在G中，基因有很多別名（A）,和G中記錄的名稱有可能不一致，大家要睜大眼睛哦。比如在這里，VEGFA是G中記錄的基因名稱，而它還有很多別名，比如GVEGF（這就是我們要找的基因名稱）VEGFA；還有，在這里可以看到該基因在染色體上的位置點擊VEGFA后出現(xiàn)界面再往下看，可以看到Genomriecgiotnr）a,n）crainpdtr）o,du，這里顯示了該基因在基因組中的位置，以及轉錄本的生成情況：就看見了目的基因的的鏈接（如2）5和3蛋6白6質.的鏈接（如）這里得說

6、兩句，有的基因也許只有一個編碼序列，但有的基因有很多的剪接體，但都是歸在一個基因名稱下面。比如，在基因下面有個序列，分別是r但是哪個是自己想找的基因呢？這就需要根據(jù)你自己查閱的文獻以及在這些基因序列后面的解釋來確定了。如果我想找的基因是第一個序列即就可以點擊，得到如下界面：怎么，是不是很熟悉，下面的東西就不用我羅嗦了吧（磚頭來了，我閃）總結一下說來其實很簡單，就是利用的檢索功能。也許大家的檢索文獻能力很強，但是面對這個龐然大物有卻些打怵，加之初涉基因，相關知識不足，所以很多時候都是費力無窮卻無功而返。還是那句話，戰(zhàn)略上藐視，實踐中重視。多花些時間了解，不要上來就狂查一通。先把檢索功能學習學習會更容易達到目的，磨刀不