生物信息學(xué)專業(yè)畢業(yè)實(shí)習(xí)學(xué)術(shù)型實(shí)踐教學(xué)大綱

1、生物信息學(xué)專業(yè)畢業(yè)實(shí)習(xí)學(xué)術(shù)型實(shí)踐教學(xué)大綱課程代碼：BIOI1041課程名稱：畢業(yè)實(shí)習(xí) 英文名稱：Graduation Practice 實(shí)驗(yàn)室名稱：生物信息實(shí)驗(yàn)室（404#4221）課程學(xué)時(shí)：9周實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí)：9周一、本課程實(shí)踐教學(xué)目的與要求能夠根據(jù)給定的生物學(xué)問(wèn)題，首先通過(guò)自主查閱相關(guān)生物學(xué)文獻(xiàn)資料，并結(jié)合所學(xué)的生物信息學(xué)知識(shí)和技能，從生物信息學(xué)的角度給出解決方案或思路；能夠靈活運(yùn)用各種生物信息學(xué)工具軟件和分析平臺(tái)，對(duì)該問(wèn)題所涉及的生物信息學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)資源進(jìn)行計(jì)算分析和數(shù)據(jù)挖掘，并能夠結(jié)合生物學(xué)知識(shí)，解釋其中可能隱含的生物學(xué)意義，最后，能夠自主查閱生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)資料，提出實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的方案或思路。通

2、過(guò)該實(shí)踐環(huán)節(jié)的訓(xùn)練，使學(xué)生能夠把生物學(xué)傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)與生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)相結(jié)合，提高學(xué)生獨(dú)立自主地分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力。二、主要儀器設(shè)備及現(xiàn)有臺(tái)套數(shù)專業(yè)服務(wù)器1臺(tái)教師用臺(tái)式計(jì)算機(jī)2臺(tái)學(xué)生用臺(tái)式計(jì)算機(jī)30臺(tái)教學(xué)示范用投影儀1臺(tái)三、實(shí)施辦法：收集我院各個(gè)學(xué)科科研中碰到的與生物信息學(xué)相關(guān)的問(wèn)題，從中提煉出側(cè)重于學(xué)術(shù)型的題目，并向?qū)W生公開。由學(xué)生根據(jù)自身的興趣愛好來(lái)自主選擇題目，同時(shí)也鼓勵(lì)學(xué)生自己提出問(wèn)題，有專業(yè)指導(dǎo)老師評(píng)價(jià)認(rèn)可后，也可實(shí)施。范例1：某研究組使用基因芯片技術(shù)來(lái)研究某個(gè)生物學(xué)問(wèn)題的分子機(jī)制，獲得了高通量的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。=接下來(lái)該怎么辦？范例2：某課題組計(jì)劃研究肺癌發(fā)生的分子機(jī)理，經(jīng)調(diào)研發(fā)現(xiàn)，

3、已有大量公開的肺癌相關(guān)的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。=接下來(lái)該怎么辦？范例3：某研究室通過(guò)EST消減法得到兩組樣本之間的差異表達(dá)ESTs，他們想知道這些ESTs中，哪些是新基因，哪些是已知基因？這些已知基因的生物學(xué)功能、相關(guān)作用關(guān)系如何？=接下來(lái)該怎么辦？四、考核方式1、實(shí)驗(yàn)報(bào)告電子版實(shí)驗(yàn)報(bào)告。2、考核方式（1）平時(shí)成績(jī)10%計(jì)入總成績(jī)。（2）每周小結(jié)報(bào)告成績(jī)20%計(jì)入總成績(jī)。（3）最終的總結(jié)報(bào)告成績(jī)70%計(jì)入總成績(jī)。生物信息學(xué)專業(yè)畢業(yè)實(shí)習(xí)（應(yīng)用型）實(shí)踐教學(xué)大綱課程代碼：BIOI1043課程名稱：畢業(yè)實(shí)習(xí) 英文名稱：Graduation Practice 實(shí)驗(yàn)室名稱：生物信息實(shí)驗(yàn)室（404#4221）課程

4、學(xué)時(shí)：9周實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí)：9周一、本課程實(shí)踐教學(xué)目的與要求能夠根據(jù)給定的生物信息應(yīng)用開發(fā)問(wèn)題，首先通過(guò)自主查閱相關(guān)程序應(yīng)用開發(fā)文獻(xiàn)資料，并結(jié)合所學(xué)生物信息學(xué)知識(shí)和技能、以及現(xiàn)有的生物信息學(xué)開源模塊，提出整個(gè)應(yīng)用開發(fā)的框架和流程，并能夠?qū)嵱米陨硭莆盏木幊陶Z(yǔ)言，將其實(shí)現(xiàn)，而后使用現(xiàn)有的公開數(shù)據(jù)源對(duì)其進(jìn)行測(cè)試，并成功通過(guò)。通過(guò)該實(shí)踐環(huán)節(jié)的訓(xùn)練，使學(xué)生能夠靈活地運(yùn)用各種開源代碼和軟件模塊，開發(fā)一些比較簡(jiǎn)單的應(yīng)用程序，提高學(xué)生獨(dú)立自主地分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力。二、主要儀器設(shè)備及現(xiàn)有臺(tái)套數(shù)專業(yè)服務(wù)器1臺(tái)教師用臺(tái)式計(jì)算機(jī)2臺(tái)學(xué)生用臺(tái)式計(jì)算機(jī)30臺(tái)教學(xué)示范用投影儀1臺(tái)三、實(shí)施辦法收集我院各個(gè)學(xué)科科研中碰到的與生物信息學(xué)相關(guān)的問(wèn)題，從中提煉出側(cè)重于學(xué)術(shù)型的題目，并向?qū)W生公開。由學(xué)生根據(jù)自身的興趣愛好來(lái)自主選擇題目，同時(shí)也鼓勵(lì)學(xué)生自己提出問(wèn)題，有專業(yè)指導(dǎo)老師評(píng)價(jià)認(rèn)可后，也可實(shí)施。范例1：某個(gè)課題組建立了一個(gè)物種的EST文庫(kù)，他們想鑒別其中的新基因。=接下來(lái)該怎么辦？范例2：某研究小組通過(guò)得到兩個(gè)樣本組的EST/cDNA序列庫(kù)，現(xiàn)在他們想知道這兩組樣本之間的差異。=接下來(lái)該怎么辦？范例3：通過(guò)高通量測(cè)序，某課題組得到大量的轉(zhuǎn)錄本序列，現(xiàn)在他們想根據(jù)給定的特定序列，對(duì)其進(jìn)行篩選，并向指導(dǎo)這些篩選出來(lái)的序列在基因組上的定位，是否來(lái)自于某個(gè)已知基因等信息。=接下來(lái)該怎么辦？四、考核方