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1、第三章 細(xì)胞生物學(xué)研究方法細(xì)胞生物學(xué)研究方法第一節(jié) 細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)的觀察方法第二節(jié) 細(xì)胞及其組分的分析方法第三節(jié) 細(xì)胞培養(yǎng)與細(xì)胞工程第四節(jié) 細(xì)胞及生物大分子的動(dòng)態(tài)變化第五節(jié) 模式生物與功能基因組的研究第一節(jié) 細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)的觀察方法第一節(jié) 細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)的觀察方法一、光學(xué)顯微鏡二、電子顯微鏡三、掃描隧道顯微鏡一、光學(xué)顯微(light microscope)(P49,30)(一)普通復(fù)式光學(xué)顯微鏡組成:光學(xué)放大系統(tǒng)、照明系統(tǒng)、鏡架及樣品調(diào)節(jié)系統(tǒng);性能參數(shù):放大倍數(shù)、分辨率、清晰度、焦點(diǎn)深度、鏡像亮度等,其中最重要的是分辨率。分辨率(分辨本領(lǐng)):能區(qū)分開兩個(gè)質(zhì)點(diǎn)間的最小距離。該距離越小,則分辨率越高。顯
2、微鏡的分辨率計(jì)算公式:D=0.61/Nsin(/2) 光源波長(zhǎng),物鏡鏡口角,N介質(zhì)折射率光學(xué)顯微鏡的最大分辨率最大值140;最小波長(zhǎng)450nm;介質(zhì)折射率N 油浸下1.5( N 空氣1.0 );因此普通光鏡的分辨力極限為0.2微米,此數(shù)值亦為顯微水平和亞微水平的分界點(diǎn)。(稱為瑞利極限,Rayleigh limit)普通光鏡有效放大倍數(shù)(經(jīng)驗(yàn)值)=物鏡最大鏡口率(數(shù)值孔徑NA numerical aperture)1000提高光學(xué)顯微鏡分辨力的手段a、縮短照明光線波長(zhǎng);b、應(yīng)用特殊光學(xué)效應(yīng),增強(qiáng)反差。光學(xué)顯微鏡樣品制備取材固定(fixation):使用固定劑(fixative)殺死細(xì)胞,并使細(xì)胞
3、結(jié)構(gòu)盡可能接近活細(xì)胞;包埋:石蠟切片:切片機(jī)脫蠟、染色:多種染料封片、觀察。顯微鏡技術(shù)和計(jì)算機(jī)技術(shù)結(jié)合倒置顯微鏡(二)相差和微分干涉顯微鏡(P51,31)1、相差顯微鏡:(phase-contrast microscope, Ph )1935年P(guān). Zernicke(德)發(fā)明,1953年獲得Nobel物理獎(jiǎng);它利用光的衍射和干涉原理,將光的相位差(人眼無法感受)振幅差(人眼可以感受);無色透明物體中的細(xì)節(jié)表現(xiàn)為明與暗的對(duì)比;適合觀察活細(xì)胞和未染色的樣品 。 兩束光波之間的相互干涉2、微分干涉顯微鏡(P51,32)(differentialinterference microscope ,DIM
4、)DIM獲得的反差取決于光線穿過樣品折射率變化的速率。樣品邊緣結(jié)構(gòu)反差增大(相對(duì)小的距離內(nèi)折射率發(fā)生明顯變化)。Nomarski microscope推薦閱讀細(xì)胞實(shí)驗(yàn)指南下冊(cè),科學(xué)出版社,P896(三)熒光顯微鏡(fluorescence microscopy)原理:以紫外光為光源,激發(fā)標(biāo)本中的熒光物質(zhì)產(chǎn)生熒光,從而對(duì)某些物質(zhì)進(jìn)行定性和定位分析。熒光種類: 自發(fā)熒光:細(xì)胞內(nèi)某些天然物質(zhì)被UV激發(fā)產(chǎn)生的熒光,如葉綠素產(chǎn)生血紅色熒光。 誘發(fā)熒光:細(xì)胞中加入熒光染料,與特定成分結(jié)合,經(jīng)過UV照射發(fā)出熒光。(四)激光掃描共聚焦顯微技術(shù)(P53,33)(laser scanning confocal m
5、icroscope,LSCM)推薦閱讀細(xì)胞生物學(xué)熒光技術(shù)原理和應(yīng)用劉愛平等中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)出版社The Nobel Prize in Chemistry 2008Green Fluorescent Protein, GFPGFP用途作為報(bào)告基因構(gòu)建基因工程載體;目的基因的功能研究;蛋白質(zhì)締合作用研究;病原體與宿主關(guān)系的研究;GFP 在生態(tài)學(xué)中的應(yīng)用;GFP 在生物防治中的應(yīng)用GFP 作為一種新型免疫標(biāo)記物的探索二、電子顯微鏡(P56,34)1932年E.Ruska(德國(guó)),1986年獲得Nobel物理獎(jiǎng)(一)電子顯微鏡基本知識(shí)電子顯微鏡是模仿光學(xué)顯微鏡的工作原理,用電子束來代替可見光束,用電磁
6、線圈代替玻璃透鏡匯聚電子束,通過熒光屏或者膠片捕獲圖像的觀察工具,理論分辨率可達(dá)0.2nm 。1、電子顯微鏡與光學(xué)顯微鏡的基本區(qū)別(表31)HITACHI H-8100透射電子顯微鏡3、電子顯微鏡基本構(gòu)造(P57,35)電鏡特點(diǎn)(1)“照明”光源電子束(2)放大倍數(shù)調(diào)節(jié)方式改變磁透鏡電流強(qiáng)度(3)高電壓工作幾萬十幾萬伏(4)內(nèi)部高真空104托(5)樣品厚度90nm電子穿透力有限,產(chǎn)熱(6)標(biāo)本染色技術(shù)不同重金屬鹽(正染,負(fù)染)超薄切片技術(shù)正染冰凍蝕刻(冰凍斷裂)技術(shù)freezeetching(freezefracture)樣品于-190快速冰凍在真空中用冷卻刀切割撕裂真空中冰升華暴露出的斷裂面
7、噴碳膜或者碳-鉑膜(表面復(fù)型膜)用有機(jī)溶劑或酶去除樣品將膜金屬噴鍍后在電鏡下觀察4、電鏡三維重構(gòu)與低溫電鏡技術(shù)低溫電鏡:不經(jīng)固定、染色、干燥,低溫下成像。5、掃描電鏡技術(shù)(P62,38)(scanning electron microscope,SEM)SEM發(fā)明于1965年;工作原理:利用電子束逐點(diǎn)掃描樣品表面,通過檢測(cè)樣品表面散發(fā)的二次電子,將樣品表面的形貌逐點(diǎn)成像,并合成為放大的圖像。 PHILIPS XL20掃描電子顯微鏡SEM的特點(diǎn):(1)可觀察較大較厚的樣品;(2)景深大,圖像清晰逼真,具有強(qiáng)烈的立體感;(3)放大倍數(shù)在2020萬倍間連續(xù)變換,無需多次聚焦;(4)樣品可在樣品室內(nèi)多
8、方位移動(dòng)和轉(zhuǎn)動(dòng);(5)分辨力不太高:310nm(6)只能觀察標(biāo)本表面,不能觀察內(nèi)部。推薦閱讀實(shí)用電子顯微鏡技術(shù)付洪蘭 高等教育出版社三、掃描隧道顯微鏡(scanning tunneling microscope,STM)(P63)1981年發(fā)明;用于探測(cè)物質(zhì)表面形貌的儀器;利用量子力學(xué)中的隧道效應(yīng)。STM的特點(diǎn):(1)具有原子尺度的高分辨本領(lǐng);(2)真空、大氣、液體環(huán)境中都能工作;(3)非破壞性測(cè)量,保持樣品原貌。原子力顯微鏡(atomic force microscope,AFM)本 節(jié) 完第二節(jié) 細(xì)胞及其組分的分析方法一、超速離心技術(shù)(P64,39)離心技術(shù)原理不同的細(xì)胞器具有不同的密度和
9、體積,因此,可以利用離心方法加以分離和純化。1、差速離心(differential centrifugation)利用不同的離心速度產(chǎn)生的不同的離心力,將各種亞細(xì)胞組分和各種顆粒分離開來。適合分離沉降速率差別較大的亞微結(jié)構(gòu)顆粒。多次離心達(dá)到純化的目的2、密度梯度離心(P65)(1)速度沉降分離密度接近大小不一的組分(2)等密度沉降分離不同密度的組分將介質(zhì)形成一涵蓋所有組分密度的密度梯度,不同的樣品由于其密度差異,在離心過程中進(jìn)入到等密度介質(zhì)區(qū)域即不再移動(dòng),從而實(shí)現(xiàn)分離的目的。速度沉降和等密度沉降的比較二、細(xì)胞成分的細(xì)胞化學(xué)顯示方法(P65,40)利用一些顯色劑與被測(cè)物質(zhì)中的某些基團(tuán)特異性結(jié)合,
10、來判斷核酸、蛋白質(zhì)(酶)、糖類、脂類在細(xì)胞中的分布和含量。福爾根(Feulgen)反應(yīng)顯示DNA格莫瑞(Gomori)反應(yīng)顯示堿性磷酸酶三、特異蛋白抗原的定位與定性P66,40原理:抗體能夠自行識(shí)別并結(jié)合對(duì)應(yīng)的抗原目的:檢測(cè)特定蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的分布狀況和含量。(一)免疫熒光技術(shù)(二)免疫電鏡技術(shù)人成纖維細(xì)胞中肌動(dòng)蛋白束(800)BHK細(xì)胞中的微管蛋白(500)四、細(xì)胞內(nèi)特異核酸的定位和定性研究對(duì)象:細(xì)胞內(nèi)特異核酸(DNA或RNA)目的:定位、定量分析方法: 原位雜交(in situ hybridization,ISH) 以目標(biāo)核酸的互補(bǔ)序列為探針,對(duì)細(xì)胞或者組織標(biāo)本進(jìn)行雜交處理,使目標(biāo)核酸可視
11、呈現(xiàn)的技術(shù)。 是細(xì)胞生物學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)、分子生物學(xué)相互交融的研究手段。構(gòu)建DNA分子物理圖譜核型分析光譜核型分析(spectral karyotype, SKY)SKY of Human五、定量細(xì)胞化學(xué)分析與細(xì)胞分選技術(shù)P69,41 細(xì)胞分選(cell sorting) 是細(xì)胞生物學(xué)中較新技術(shù),是利用流式細(xì)胞儀(flow cytometery,F(xiàn)CM)對(duì)細(xì)胞或者其他生物微粒(如染色體)進(jìn)行分選,并對(duì)其進(jìn)行定量分析(大小、形狀、核酸含量和蛋白質(zhì)含量等)的技術(shù)。1、流式細(xì)胞儀(FCM) 是集合了流體噴射、激光、伽馬射線能譜、電子計(jì)算機(jī)、顯微熒光光度計(jì)量等技術(shù)于一體的設(shè)備;可以定性和定量分析生物顆粒
12、(包括細(xì)胞)的物理化學(xué)特性并將之分離純化;目前的FCM已經(jīng)運(yùn)用于細(xì)胞生物學(xué)、腫瘤學(xué)、免疫學(xué)、血清學(xué)、藥物學(xué)等研究領(lǐng)域,可以用來分析免疫復(fù)合物、病毒、脂質(zhì)體、細(xì)胞器、原核細(xì)胞、真核細(xì)胞、簡(jiǎn)單多細(xì)胞生物等等。BECKMAN MOFOLXDP流式細(xì)胞儀流式細(xì)胞儀結(jié)構(gòu)和工作原理2、標(biāo)記細(xì)胞: 免疫熒光染色 熒光素標(biāo)記抗體:異硫氰酸熒光素(FITC)、藻紅素(PE)、德克薩斯紅(Texas Red) 熒光染色分為:直接染色和間接染色 熒光染料直接染色 使用PI(碘化丙啶, propidium iodide)或DAPI,對(duì)固定處理過的細(xì)胞(核)直接進(jìn)行染色第三節(jié) 細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞工程與顯微操作技術(shù)一、細(xì)胞培
13、養(yǎng)P70,421、什么是細(xì)胞培養(yǎng) 是指從機(jī)體內(nèi)取出某種組織或者細(xì)胞,模擬機(jī)體內(nèi)的生理?xiàng)l件使其在體外生存、生長(zhǎng)和繁殖的過程。細(xì)胞培養(yǎng)示意圖2、細(xì)胞培養(yǎng)分類:按照培養(yǎng)過程中培養(yǎng)物是否經(jīng)過了分割,分類為:(1)原代培養(yǎng)(primary culture) 直接從機(jī)體取出組織或者細(xì)胞后所進(jìn)行的首次培養(yǎng)。(2)繼代培養(yǎng)(secondary culture)/傳代培養(yǎng)(subculture) 當(dāng)原代培養(yǎng)的細(xì)胞增殖到一定的密度后,將其從原培養(yǎng)容器中取出,按照一定的比例向另外一(多)個(gè)容器中接種所進(jìn)行的再培養(yǎng),簡(jiǎn)稱傳代。傳代的累計(jì)次數(shù)就是細(xì)胞的代數(shù)。兩個(gè)概念(1)細(xì)胞系(cell line):通過原代培養(yǎng)并且經(jīng)
14、過傳代后所形成的細(xì)胞群體,由于來源于原代培養(yǎng)物,故一個(gè)細(xì)胞系往往由多個(gè)生物學(xué)性狀不同的細(xì)胞群體組成。如HeLa、CHO等。(2)細(xì)胞株(cell strain):利用單細(xì)胞分離培養(yǎng)法或者克隆形成法從原代培養(yǎng)物或者細(xì)胞系中選擇出來的細(xì)胞群體,一個(gè)細(xì)胞株往往具有特殊的生物學(xué)性狀或者標(biāo)記,并且可以持續(xù)存在。二、細(xì)胞工程(cell engineering)細(xì)胞培養(yǎng)、分化誘導(dǎo)、細(xì)胞融合、顯微注射等。(一)細(xì)胞融合與單克隆抗體技術(shù)1、細(xì)胞融合(cell fusion)兩個(gè)或者多個(gè)細(xì)胞融合成雙核或者多核細(xì)胞的現(xiàn)象。產(chǎn)生的細(xì)胞稱為融合細(xì)胞。2、細(xì)胞融合的應(yīng)用:動(dòng)物和植物的不同種、屬之間的細(xì)胞可以融合;動(dòng)植物之間的細(xì)胞可以融合; 應(yīng)用于研究核質(zhì)關(guān)系、繪制染色體基因圖譜、制備單克隆抗體、研究腫瘤發(fā)生機(jī)制等領(lǐng)域。3、人工誘導(dǎo)細(xì)胞融合:病毒誘導(dǎo)融合:滅活的仙臺(tái)病毒等。化學(xué)誘導(dǎo)融合:PEG電激誘導(dǎo)融合:?jiǎn)慰寺】贵w技術(shù)(1984年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng))(二)顯微操作技術(shù)與動(dòng)物克隆第四節(jié) 細(xì)胞及生物大分子的動(dòng)態(tài)一、熒光漂白恢復(fù)技術(shù)(P45)Fluorescence Photobleaching Rev
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