園藝植物生物技術(shù)課后習(xí)題答案_第1頁(yè)
園藝植物生物技術(shù)課后習(xí)題答案_第2頁(yè)
園藝植物生物技術(shù)課后習(xí)題答案_第3頁(yè)
園藝植物生物技術(shù)課后習(xí)題答案_第4頁(yè)
園藝植物生物技術(shù)課后習(xí)題答案_第5頁(yè)
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1、第一章至第五章一、 主要名詞和概念:一1.  植物細(xì)胞全能性:植物體的每一個(gè)具有完整細(xì)胞核的細(xì)胞都具有該物種全部遺傳物質(zhì),在一定條件下具有發(fā)育成為完整植物體的潛在能力。2. 脫分化:將已分化的不分裂的靜止細(xì)胞放在培養(yǎng)基上培養(yǎng)后,細(xì)胞重新進(jìn)去分裂狀態(tài),一個(gè)成熟細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)榉稚鸂顟B(tài)的過(guò)程。3. 再分化:經(jīng)脫分化的組織或細(xì)胞在一定的培養(yǎng)條件下可轉(zhuǎn)變?yōu)楦鞣N不同的細(xì)胞類型,形成完整植株的過(guò)程。4. 器官發(fā)生途徑:由外植體或愈傷組織誘導(dǎo)形成不定根或不定芽,再獲得再生植株的方法5. 體細(xì)胞胚胎發(fā)生途徑:在組織培養(yǎng)中起源于一個(gè)非合子細(xì)胞,經(jīng)過(guò)胚胎發(fā)生和胚胎發(fā)育過(guò)程,形成具有雙極性的胚狀結(jié)構(gòu)而發(fā)育成再生

2、植株的途徑。6. 外植體:由活體植物體上切去下來(lái)的,用于組織培養(yǎng)的各種接種材料。包括各種器官、組織、細(xì)胞或原生質(zhì)體等。7. 褐化現(xiàn)象:指在外植體誘導(dǎo)初分化或再分化過(guò)程中,自身組織從表面想培養(yǎng)基釋放褐色物質(zhì)以至培養(yǎng)基逐漸變成褐色,外植體也隨之進(jìn)一步變褐而死亡的現(xiàn)象。8. 看護(hù)培養(yǎng):利用活躍生長(zhǎng)的愈傷組織來(lái)看護(hù)單個(gè)細(xì)胞,使其持續(xù)分裂和增殖的培養(yǎng)方法。9. 分批培養(yǎng);把細(xì)胞分散在一定容積的培養(yǎng)基中培養(yǎng),當(dāng)培養(yǎng)物增值到一定量時(shí),轉(zhuǎn)接繼代,建立起單細(xì)胞培養(yǎng)物。10. 連續(xù)培養(yǎng):利用特質(zhì)的培養(yǎng)容器進(jìn)行大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)的一種培養(yǎng)方式。11. 體細(xì)胞雜交:使分離出來(lái)的不同親本的原生質(zhì)體,在人工控制條件下,相互融

3、合成一體,形成雜種細(xì)胞,并進(jìn)一步發(fā)育成雜種植株的技術(shù)。12. 雄核發(fā)育:在適宜的離體培養(yǎng)條件下,花粉(小孢子)的發(fā)育可偏離活體時(shí)的正常發(fā)育轉(zhuǎn)向孢子體發(fā)育,經(jīng)胚狀體途徑或器官發(fā)生途徑形成完整植株。13. 雌核發(fā)育:以未受精子房或胚珠為外植體誘導(dǎo)單倍體的方法。14. 非整倍體:生物體的核內(nèi)染色體數(shù)不是染色體基數(shù)整數(shù)倍,而發(fā)生個(gè)別染色體數(shù)目增減的生物體。15. 代換系:生物體的染色體被異源種屬染色體所代換的品系。16. 易位系:某染色體的一個(gè)區(qū)段移接在非同源的另一個(gè)染色體上,具有發(fā)生染色體易位的品種。17. 附加系:將同種或異種的染色體導(dǎo)入受體中,叫做染色體附加。具有附加染色體的品種或品系叫附加系。

4、18. 限制生長(zhǎng)保存:改變培養(yǎng)物生長(zhǎng)的外界環(huán)境條件,限制離體保存材料的生長(zhǎng)速度,使細(xì)胞生長(zhǎng)至最小限度,但不死亡,從而達(dá)到延長(zhǎng)繼代培養(yǎng)的目的。19. 超低溫保存:指在-80(干冰溫度)至-196(液氮溫度)甚至更低溫度下保存生物材料。20. 體細(xì)胞無(wú)性系變異:將植物外植體在組織培養(yǎng)過(guò)程中,由于受到非生物因子的誘導(dǎo)發(fā)生變異,進(jìn)而導(dǎo)致再生植株發(fā)生遺傳變異的現(xiàn)象。二、 各章需掌握的主要內(nèi)容1. 植物組織培養(yǎng)的類型有哪些?(1) 按照外植體類型:胚胎培養(yǎng);器官培養(yǎng);組織培養(yǎng);細(xì)胞培養(yǎng);原生質(zhì)體培養(yǎng)(2) 按照培養(yǎng)基性質(zhì):固體培養(yǎng);液體培養(yǎng);(3) 按照培養(yǎng)方法: 精制培養(yǎng);震蕩培養(yǎng);看護(hù)培養(yǎng);飼喂培養(yǎng);

5、微室培養(yǎng)2.植株再生途徑主要有哪些?(1)經(jīng)由成愈傷組織再生植株;(2)經(jīng)由胚狀體再生植株3.完整的植物組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)室包括哪些部分?每一部分具有哪些功能?需要配備哪些儀器設(shè)備?自己能獨(dú)立設(shè)計(jì)一個(gè)組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)室。(1) 準(zhǔn)備室,接種室,培養(yǎng)室(2) A:準(zhǔn)備室配置培養(yǎng)基B:接種室采用無(wú)菌操作把材料接種到培養(yǎng)基上C:培養(yǎng)室在無(wú)菌和適宜的培養(yǎng)條件下進(jìn)行培養(yǎng)。4.培養(yǎng)基的組成成分包括哪些?常用的植物激素和生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑有哪些?需掌握化學(xué)名稱和縮寫符號(hào)。(1) 無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng),有機(jī)營(yíng)養(yǎng),植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)物質(zhì),糖類,水,瓊脂(2) 生長(zhǎng)素AUX,細(xì)胞分裂素CTK,赤霉素GA,脫落酸ABA5.莖尖培養(yǎng)的概念,以種苗繁殖為

6、目的的莖尖培養(yǎng)包括哪些階段?各階段對(duì)培養(yǎng)基條件有哪些要求?(1) 莖尖培養(yǎng):把莖尖分生組織或包括此分生組織的莖尖分離進(jìn)行無(wú)菌培養(yǎng)。(2) 無(wú)菌培養(yǎng)體系的建立芽的增殖中間繁殖體的增殖誘導(dǎo)生根試管苗的移植(3) 一般用MS培養(yǎng)基,之后根據(jù)發(fā)育方向配制培養(yǎng)基6.莖尖分生組織培養(yǎng)脫毒的原理是什么?影響脫毒效果的主要因素有哪些?病毒檢測(cè)方法有哪些?其他脫毒方法還有哪些?(1) 感染病毒后,植株體內(nèi)病毒的分布并不均勻,病毒的數(shù)量隨植株部位及年齡而異,越靠近經(jīng)頂端的區(qū)域,病毒感染率越低,生長(zhǎng)點(diǎn)則幾乎不含或含病毒很少。(2) 莖尖大小,取穗大小,取樣時(shí)間,溫度,持續(xù)時(shí)間,濕度和光照,前處理(3) 莖尖培養(yǎng)脫毒

7、,微體嫁接脫毒,熱處理脫毒(4) 花器官等培養(yǎng)脫毒,珠心胚培養(yǎng)脫毒,合并使用熱處理、莖尖培養(yǎng)或微莖尖嫁接脫毒7.種苗離體快繁中污染發(fā)生的原因主要有哪些?如何控制污染的發(fā)生?(1) A:材料內(nèi)部滅菌處理不好B:正常滅菌條件下,內(nèi)生菌能夠存活C:來(lái)自寄生植物的污染D:培養(yǎng)基中材料超過(guò)一塊相互污染(2) A:嚴(yán)格保證無(wú)菌操作的規(guī)范性,對(duì)培養(yǎng)基接種工具及接種室的嚴(yán)格消毒處理B:抗生素對(duì)細(xì)菌操作污染的防治C:真菌污染的防治D:常用防治污染方法8.原生質(zhì)體分離中材料預(yù)處理方法有哪些?原生質(zhì)體分離常用的酶類有哪些?原生質(zhì)體如何分離和如何純化?原生質(zhì)體培養(yǎng)方法有哪些?(1) 低溫處理;等滲溶液處理(2) 纖維

8、素酶;半纖維素酶;果膠酶;崩潰酶(3) A:分離:取材酶液配制酶解處理使酶解后的混合物穿過(guò)鎳絲網(wǎng)B:純化:離心法:利用比重原理,低速離心使原生質(zhì)體沉于底部 漂浮法:根據(jù)原生體與細(xì)胞碎片或細(xì)胞器比重的不同來(lái)分離原生質(zhì)體 界面法:采用兩種不同密度的溶液,離心后使完整的原生質(zhì)體處在兩液相的界面(4) 平板培養(yǎng)法;看護(hù)培養(yǎng)法;微室培養(yǎng)法;液體淺層培養(yǎng)法;固-液體雙層培養(yǎng)法9.原生質(zhì)體融合方法有哪些?雜種細(xì)胞如何篩選?(1) A:化學(xué)誘導(dǎo)融合:鹽類融合法;高pH高鈣離子法;PEG法B:物理誘導(dǎo)融合:顯微操作;離心震蕩;激光照射;電融合(2) A:顯微篩選技術(shù):熒光染料標(biāo)記,異硫氰酸熒光素(發(fā)綠色熒光),

9、堿性蕊香紅熒 光素(發(fā)紅色熒光)B:互補(bǔ)選擇法:利用兩個(gè)親本具有不同的遺傳和生理特征,在特定培養(yǎng)條件下,只有發(fā)生互補(bǔ)作用的雜種細(xì)胞才能生長(zhǎng)的選擇方法C:遺傳標(biāo)記篩選技術(shù):基因互補(bǔ)篩選,利用隱性非等位基因互補(bǔ)篩選體細(xì)胞雜種10.離體小孢子發(fā)育(雄核發(fā)育)途徑有哪些?花粉分離方法有哪些?影響花藥和花粉培養(yǎng)的主要因素有哪些?培養(yǎng)適宜時(shí)期是哪個(gè)時(shí)期?預(yù)處理方法有哪些?(1) 小孢子發(fā)育途徑;營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞發(fā)育途徑;生殖細(xì)胞發(fā)育途徑;生殖細(xì)胞和營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞共同發(fā)育途徑(2) 花粉漂浮自然釋放法;人工擠壓法;機(jī)械法(3) 供體植株基因型;小孢子發(fā)育時(shí)期;供體植株生理狀態(tài);預(yù)處理;培養(yǎng)及成分;培 養(yǎng)條件;接種密度和方

10、向(4) 一般來(lái)說(shuō)是小孢子發(fā)育到單核期左右(第一次有絲分裂前)(5) 低溫;熱激;化學(xué)藥劑;高滲透壓;離心11.植物染色體加倍方法有哪些?化學(xué)方法誘導(dǎo)加倍常用試劑有哪些?影響加倍的因素包括哪些?多倍體鑒定方法有哪些?(1) 機(jī)械損傷;各種射線;高速離心;異常溫度(2) 秋水仙素;氨磺靈;氟樂(lè)靈(3) 外植體;加倍劑類型;加倍劑濃度和處理時(shí)間;加倍劑的加入時(shí)間;助劑(4) A:形態(tài)學(xué)鑒定:各自獨(dú)特的外觀B:細(xì)胞學(xué)鑒定:染色體計(jì)數(shù)法C:生理生化鑒定:各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的含量、酶活性的測(cè)定D:分子生物學(xué)鑒定:分子原位雜交;分子標(biāo)記12.限制生長(zhǎng)保存方法有哪些?超低溫保存的基本程序是什么?(1) 低溫保存;

11、干燥保存;生長(zhǎng)抑制保存;高滲透壓保存(2) 材料準(zhǔn)備預(yù)處理冷凍處理冷凍儲(chǔ)存解凍再培養(yǎng)13.體細(xì)胞無(wú)性系變異的來(lái)源有哪些?無(wú)性系變異的發(fā)生與哪些因素有關(guān)?(1) A:外植體細(xì)胞中預(yù)先存在而在再生植株中表現(xiàn)出來(lái)的變異;B:組織培養(yǎng)過(guò)程中誘導(dǎo)產(chǎn)生的變異(2) A:染色體數(shù)目變異:整倍型變異;非整倍型變異B:體細(xì)胞染色體結(jié)構(gòu)變異C:基因突變:核基因突變;細(xì)胞質(zhì)基因突變D:轉(zhuǎn)座因子的活化:轉(zhuǎn)座因子的激活也是導(dǎo)致植物體細(xì)胞無(wú)性系高頻率變異的主要原因之一。轉(zhuǎn)座因子是指能在基因組中移動(dòng)和修飾基因表達(dá)的DNA序列E:DNA甲基化狀態(tài)的改變第六章 園藝植物的染色體工程1.園藝植物單倍體制備有哪些途徑?答:(1)雄

12、配子途徑。采用花藥培養(yǎng)或花粉培養(yǎng),使小孢子改變?cè)瓉?lái)的配子體發(fā)育途徑,轉(zhuǎn)向孢子體發(fā)育途徑,形成花粉胚或花粉愈傷組織,最后形成花粉植株,從中鑒定出單倍體植株并使之加倍成純合二倍體。(2)雌配子途徑。使園藝植物的胚囊中具有單倍性染色體構(gòu)成的細(xì)胞,如未受精的子房或胚珠,在適當(dāng)?shù)臈l件下發(fā)育成單倍體植株。2.離體條件下,雄(雌)核發(fā)育各有哪些發(fā)育途徑?答:雄核:(1)小孢子發(fā)育途徑 (2)營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞發(fā)育途徑 (3)生殖細(xì)胞發(fā)育途徑 (4)生殖細(xì)胞和營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞共同發(fā)育途徑。雌核:(1)助細(xì)胞或胚囊的無(wú)配子生殖產(chǎn)生單倍體 (2)卵細(xì)胞、助細(xì)胞和反足細(xì)胞發(fā)育產(chǎn)生單倍體 (3)非正常發(fā)育的大孢子四分體產(chǎn)生單倍體。3.

13、試述花藥(花粉)培養(yǎng)的全過(guò)程及主要影響因素。答:基本程序應(yīng)包括外植體選擇、預(yù)處理、表面滅菌、接種、培養(yǎng)、再生植株、單倍體植株鑒定、染色體加倍及獲得純合二倍體等步驟。影響因素:(1) 供體植株基因型。(2) 小孢子發(fā)育時(shí)期。一般來(lái)說(shuō)單核期最適合。(3) 供體植株的生理狀態(tài)。內(nèi)源激素水平。(4) 預(yù)處理。(5) 培養(yǎng)基成分。(6) 培養(yǎng)條件。溫度、光照。(7) 接種密度和方向。4.采用秋水仙素誘導(dǎo)園藝植物多倍體有哪些方法?答:(1)浸種法;(2)浸芽法;(3)滴苗法;(4)涂抹法;(5)套罩法;(6)毛細(xì)管法。5.創(chuàng)制園藝植物易位系、代換系和附加系分別有哪些方法?答:(1)易位系。包括常規(guī)方法誘導(dǎo)

14、的輻射誘導(dǎo)和雜交誘導(dǎo),和組織培養(yǎng)誘導(dǎo)中的胚拯救、細(xì)胞培養(yǎng)和原生質(zhì)體培養(yǎng)。6.試述園藝植物單倍體、多倍體和非整倍體的主要鑒定方法和輔助鑒定方法。答:(1)形態(tài)學(xué)鑒定。生長(zhǎng)勢(shì),分枝數(shù),葉片形狀、大小、顏色,花蕾數(shù)量、形狀,果實(shí)形狀等都可以作為鑒定的依據(jù)。 (2)細(xì)胞學(xué)鑒定。染色體計(jì)數(shù)法、流式細(xì)胞分析法、核型分析法、氣孔大小及保衛(wèi)細(xì)胞葉綠體數(shù)目鑒定法、染色中心直徑和異染色質(zhì)數(shù)目法、花粉發(fā)育過(guò)程和花粉活力觀察法、減數(shù)分裂行為觀察法等。 (3)生理生化鑒定。通過(guò)對(duì)各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的含量、各種酶活性等方面的測(cè)定來(lái)對(duì)園藝植物染色體工程產(chǎn)物進(jìn)行輔助鑒定。 (4)分子生物學(xué)鑒定。分子原位雜交,分子標(biāo)記等。7.目前園

15、藝植物染色體工程還存在著哪些問(wèn)題?你認(rèn)為應(yīng)該如何解決?答:(1)單倍體。發(fā)展相對(duì)緩慢,至今仍有很多空白。發(fā)展方向:解決有些物種誘導(dǎo)率、可重復(fù)性差,很難實(shí)際應(yīng)用的問(wèn)題;探明通過(guò)胚狀體途徑誘導(dǎo)雄核發(fā)育和雌核發(fā)育的適宜條件;找到克服花藥培養(yǎng)中的白化現(xiàn)象,二倍體組織的生長(zhǎng)對(duì)單倍體誘導(dǎo)的影響等問(wèn)題的有效措施。 (2)多倍體。多倍體基因組發(fā)生了廣泛的遺傳變化,其基因平衡遭到破壞,存在一些缺陷,還有嵌合體問(wèn)題。發(fā)展方向:找出園藝植物各自的適宜倍性,研究和解決多倍體的缺陷、嵌合體問(wèn)題。 (3)非整數(shù)倍體。尚處在初級(jí)階段,成果有限。發(fā)展方向:努力拓展園藝植物的研究范圍,加強(qiáng)生物技術(shù)在園藝植物非整倍體制備中的應(yīng)用

16、。8.你怎么看待園藝植物染色體工程的前景?第七章 植物基因工程的基礎(chǔ)知識(shí)與技術(shù)1.簡(jiǎn)述DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模式的要點(diǎn)及其與DNA生物學(xué)功能的關(guān)系。答:(1)生物的遺傳信息儲(chǔ)存于DNA的核苷酸序列中; (2)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性主要由互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵和堿基堆積力來(lái)維持; (3)DNA雙鏈經(jīng)過(guò)盤繞壓縮使松弛型DNA更為緊密,體積變得更小,在細(xì)胞的生命活動(dòng)中更能保持DNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。2.比較RNA和DNA在結(jié)構(gòu)上的異同點(diǎn)。答:(1)基本單位不同,DNA為脫氧核苷酸、RNA為核糖核苷酸 (2)DNA的五碳糖為脫氧核糖,RNA的五碳糖為核糖 (3)DNA的堿基為腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶,RNA

17、的為腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶 (4)與DNA相比,RNA種類繁多,分子質(zhì)量相對(duì)較小,通常以單鏈形式存在,RNA沒(méi)有形成雙螺旋,但也可以有局部的二級(jí)結(jié)構(gòu)或三級(jí)結(jié)構(gòu)。3.試述RNA的種類及其生物學(xué)作用。答:(1)mRNA。直接指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成。 (2)tRNA。攜帶相應(yīng)的氨基酸將其轉(zhuǎn)運(yùn)到核糖體上以供蛋白質(zhì)合成。 (3)rRNA。蛋白質(zhì)合成工廠核糖體的組成成分。4.基因工程常用的工具酶有哪些?答:(1)限制性內(nèi)切酶。一類能夠識(shí)別雙鏈DNA分子總某一特定核苷酸序列,并能對(duì)核酸內(nèi)部的磷酸二酯鍵進(jìn)行切割的一種內(nèi)切核酸酶。 (2)DNA連接酶。催化連接分離的DNA片段。 (3)DNA聚合酶。限制性核酸內(nèi)

18、切酶切割DNADNA連接酶生成3- 5磷酸二酯鍵DNA聚合酶探針標(biāo)記、補(bǔ)平3末端反轉(zhuǎn)錄酶cDNA合成多聚核苷酸激酶5磷酸化、探針標(biāo)記末端轉(zhuǎn)移酶3末端多聚尾堿性磷酸酶3切除末端磷酸基DNA外切酶3末端切除單核苷酸噬菌體DNA外切酶5末端切除單核苷酸5.質(zhì)粒載體、柯斯質(zhì)粒載體、噬菌體載體和酵母人工染色體有何異同點(diǎn)?答:(1)質(zhì)粒是能自主復(fù)制的雙鏈環(huán)狀DNA分子。(2)以噬菌體DNA為載體構(gòu)成的重組DNA分子必須包裝成完整病毒顆粒后才具有感染宿主的能力。經(jīng)包裝后重組DNA分子轉(zhuǎn)化率提高100-1000倍。這類載體可以有效克隆15kb大小的外源基因。(3)科斯質(zhì)粒是人工構(gòu)建的,含有DNA 的粘性(co

19、s)末端序列、質(zhì)粒復(fù)制起始區(qū)及質(zhì)粒一個(gè)抗藥性標(biāo)記的、兼具質(zhì)粒與噬菌體DNA載體雙重性質(zhì)的特殊載體。(4)YAC 載體主要是用來(lái)構(gòu)建大片段 DNA 文庫(kù),特別用來(lái)構(gòu)建高等真核生物的基因組文庫(kù),并不用作常規(guī)的基因克隆。 6.簡(jiǎn)述PCR技術(shù)的基本原理。答:根據(jù)已知的待擴(kuò)增的DNA片段序列,人工合成與該DNA兩條鏈末端互補(bǔ)的兩段寡核苷酸引物,在體外將DNA模板在酶促作用下進(jìn)行擴(kuò)增。PCR全過(guò)程可分為DNA模板變性、退火、延伸三個(gè)步驟,經(jīng)若干循環(huán)所組成。首先高溫作用使模板DNA變性解鏈,然后降低溫度使引物與模板DNA鏈退火,在TaqDNA 聚合酶作用及dNTP底物存在下,引物鏈將沿著5 3方向延伸與模板

20、互補(bǔ)的新鏈,新鏈則可作為下一次反應(yīng)的模板,因此擴(kuò)增產(chǎn)物的量以指數(shù)級(jí)方式增加。通常單一拷貝的基因經(jīng)2530循環(huán)可擴(kuò)增100萬(wàn)200萬(wàn)拷貝。7.核酸分離主要有哪些方法?答:DNA的分離:CTAB法,SDS法;RNA的分離:1)總RNA的提取 苯酚法,異硫氰酸胍法及氯化鋰沉淀法 2)mRNA的分離 親和層析的原理8.什么是分子雜交?分子雜交的主要技術(shù)有哪些?答:當(dāng)帶有互補(bǔ)的特定核苷酸序列的單鏈DNA或RNA混合在一起時(shí),其特定的同源區(qū)段將會(huì)退火形成雙鏈結(jié)構(gòu)??梢酝ㄟ^(guò)觀察雜種核酸分子的形成情況來(lái)判斷不同來(lái)源DNA的親緣關(guān)系。 Southern雜交:檢測(cè)經(jīng)限制性內(nèi)切核酸酶切割后的DNA片段中是否存在與探

21、針同源的序列。 Northern雜交:指將RNA變性及電泳分離后,并轉(zhuǎn)移到固相支持物上,用雜交反應(yīng)來(lái)鑒定其中特定mRNA分子的含量及其大小。 Western印跡:蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)SDS-PAGE后,轉(zhuǎn)移到膜上再與抗體探針結(jié)合進(jìn)行檢測(cè)的方法。 菌落原位雜交:將細(xì)菌從培養(yǎng)平板轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素濾膜上,然后將濾膜上的菌落裂解以釋放DNA,將DNA烘干固定于膜上與32P標(biāo)記的探針雜交,放射自顯影檢測(cè)菌落雜交信號(hào),并與平板上的菌落對(duì)位。第八章1.什么是基因組文庫(kù)?簡(jiǎn)述構(gòu)建大片段基因組文庫(kù)的主要步驟。答:園藝植物基因組文庫(kù):指的是來(lái)自園藝植物基因組全部DNA片段組成的基因文庫(kù)?;蚪MDNA文庫(kù)反映基因組的全部遺傳

22、信息。 構(gòu)建大片段基因組文庫(kù)的主要步驟:1,載體的制備(包括載體DNA的分離,載體DNA的酶切,載體的脫磷酸化,載體DNA的純化等步驟);2.大片段基因組DNA的制備;3,大片段DNA與克隆載體的連接;4,載體的遺傳轉(zhuǎn)化;5,克隆的挑取、驗(yàn)證;6,文庫(kù)的擴(kuò)增、分裝及保存。2.簡(jiǎn)述合成cDNA第二鏈的主要方法。答:自身引導(dǎo)合成法、置換合成法、同聚物引導(dǎo)法。3.簡(jiǎn)述圖位克隆技術(shù)的原理及其優(yōu)缺點(diǎn)。答:原理:首先找到一個(gè)與目標(biāo)基因相連的DNA分子標(biāo)記,然后通過(guò)染色體步移技術(shù)克隆分離出目標(biāo)基因。優(yōu)缺點(diǎn):到目前為止,已有多個(gè)植物抗病基因通過(guò)該技術(shù)被分離,但是他們都具有較小的基因組、高密度的分子標(biāo)記連鎖圖和

23、較穩(wěn)定成熟的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)。而對(duì)于基因組較大、重復(fù)序列較多的一些園藝植物,采用圖位克隆法分離基因要步移大量的DNA片段,投資大,效率低。而且由于基因組中往往存在大量的重復(fù)序列,以及被用來(lái)步移的DNA大片段插入文庫(kù)含有許多嵌套克隆或克隆后的重排現(xiàn)象等原因,染色體步移十分困難。4.簡(jiǎn)述轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法的基本步驟及其優(yōu)缺點(diǎn)。答:利用異源轉(zhuǎn)座子分離植物基因的一般操作步驟是:1,采取農(nóng)桿菌介導(dǎo)等適當(dāng)?shù)霓D(zhuǎn)化方法把轉(zhuǎn)座子導(dǎo)入目標(biāo)之五,設(shè)法將轉(zhuǎn)座子插入到目標(biāo)基因內(nèi)部或鄰近位點(diǎn),引起表型突變。2,通過(guò)表型篩選獲得純合突變株。3,構(gòu)建純合突變株的基因組文庫(kù)。4,以轉(zhuǎn)座子片段作為探針,從該基因組文庫(kù)中篩選含轉(zhuǎn)座子片段的克隆。

24、5,以該克隆作為探針,篩選另一正常植株的核基因組文庫(kù),獲得完整的正常目的基因。優(yōu)缺點(diǎn):利用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法可在不了解基因產(chǎn)物的生化性質(zhì)和表達(dá)模式的情況下分離植物基因,因此該技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于植物功能基因的克隆研究,目前利用該法已經(jīng)從多種植物中克隆了上百個(gè)基因。但是該技術(shù)的前提條件是要篩選出轉(zhuǎn)座子插入的突變體。在實(shí)際操作中,由于轉(zhuǎn)座頻率往往很低,因此需要篩選的突變體群體較大。而且,對(duì)于那些需在特定環(huán)境或特定發(fā)育階段才有突變表型的基因,往往由于看不到明顯的突變表型而被忽略。另外,由于基因的功能補(bǔ)償?shù)葯C(jī)制的作用,即使有些基因產(chǎn)生了插入突變,也可能看不到突變表型,因而不能運(yùn)用該方法。5.差異表達(dá)基因分離法

25、主要包括哪幾種方法?各有何優(yōu)缺點(diǎn)?答:mRNA差異顯示(DDRT-PCR)、抑制性消減雜交(SSH)、代表性差異分析(RDA)、基因表達(dá)系列分析(SAGE)、cDNA-AFLP技術(shù)。mRNA差異顯示(DDRT-PCR):優(yōu)點(diǎn):簡(jiǎn)便、快速、RNA有量少、效率高。主要用于比較兩種以上特定生理狀態(tài)或不同發(fā)育階段的mRNA樣品間基因表達(dá)的差異。缺點(diǎn):1,假陽(yáng)性特別高,增加了后續(xù)工作難度。2,由于PCR自身反應(yīng)條件的敏感性,mRNA差異顯示技術(shù)重復(fù)性較差。3,擴(kuò)增片段較小,不能代表真正差異表達(dá)的基因,且上游的差異表達(dá)信息量的不到檢測(cè)。4,對(duì)高拷貝數(shù)mRNA有較強(qiáng)的傾向性,不能用于反映低拷貝數(shù)的mRNA。

26、抑制性消減雜交(SSH):優(yōu)點(diǎn):1,假陽(yáng)性率大大降低;2,目的序列富集程度較高,且豐度相對(duì)一致,確保了低豐度表達(dá)的cDNA有被檢測(cè)的可能性極大地提高了檢測(cè)效率;3,SSH靈敏度很高,重復(fù)性強(qiáng)。缺點(diǎn):1,需要較多的其實(shí)材料的mRNA;2,更多地依賴于PCR技術(shù),不能同時(shí)對(duì)數(shù)個(gè)材料進(jìn)行比較;3,材料之間存在的過(guò)多的差異及小片段缺失也不能有效地被檢測(cè)。代表性差異分析(RDA):優(yōu)點(diǎn):1,免去了物理方法分離單、雙鏈的繁瑣操作,通過(guò)接頭“修飾”設(shè)計(jì),借助PCR技術(shù)即能使目的片段得到有效擴(kuò)增,減少假陽(yáng)性。2,差減雜交在擴(kuò)增后的cDNA群體之間進(jìn)行,不再受供試的mRNA量的限制,拓寬了差減雜交的應(yīng)用范圍。3

27、,一次實(shí)驗(yàn)課分離得到多個(gè)在T組和D組間差異表達(dá)基因的cDNA克隆,并能發(fā)現(xiàn)與表性相關(guān)的異?;颍瑱z測(cè)基因的上調(diào)和下調(diào)表達(dá)。缺點(diǎn):1,目的基因間豐度的差異在數(shù)輪差減雜交后的群體中保留了下來(lái),在后續(xù)的篩選中,高豐度的差異基因容易得到,低豐度的差異基因不易檢出,而低豐度的表達(dá)產(chǎn)物往往代表相對(duì)重要的基因。2,分離出來(lái)的差異基因也可能與其表型無(wú)關(guān),增加了后續(xù)鑒定的工作量。3,對(duì)樣品T組和D組的純度要求很高,如果兩組材料間差別較大,則用此方法將達(dá)不到鑒定差別表達(dá)基因的目的?;虮磉_(dá)系列分析(SAGE):優(yōu)點(diǎn):成本低效率高,能很靈敏的檢測(cè)出那些低豐度表達(dá)的基因。缺點(diǎn):1,只有那些基因庫(kù)中存儲(chǔ)標(biāo)簽所代表的基因

28、才能被鑒定,對(duì)未搜索到匹配序列的標(biāo)簽鑒定存在困難,而且其效率依賴于現(xiàn)有的序列數(shù)據(jù) 。2,如果堿基序列發(fā)生錯(cuò)誤,或者擴(kuò)增效率發(fā)生變化,也會(huì)導(dǎo)致結(jié)果失真。3,該法雖然不需分別測(cè)定各cDNA的序列,但工作量仍然很大,且操作較為繁瑣,需要使用測(cè)序儀,普通實(shí)驗(yàn)室無(wú)法做到。cDNA-AFLP技術(shù):優(yōu)點(diǎn):它可以對(duì)生物體全部的mRNA樣品進(jìn)行篩選,具有重復(fù)性高、假陽(yáng)性率低的特點(diǎn),其可靠性強(qiáng),重復(fù)性可達(dá)95%。而且,在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物高度表達(dá)時(shí),擴(kuò)增條帶的強(qiáng)度能準(zhǔn)確反映基因間表達(dá)量的差別。缺點(diǎn):操作過(guò)程繁瑣,假陽(yáng)性率有時(shí)也較高。6.簡(jiǎn)述基于同源序列的候選基因法分離目的基因的主要方法。答:1,根據(jù)已知基因的保守區(qū)設(shè)計(jì)引物

29、,以待分離此基因的植物基因組DNA或cDNA為模板直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序并與已知基因進(jìn)行序列比較,從而確定該基因是否為待分離基因。2,用用已知序列的基因制備探針,篩選待分離基因的植物核DNA或cDNA文庫(kù)。再對(duì)陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序,并與已知基因序列進(jìn)行同源性比較,最后經(jīng)轉(zhuǎn)化鑒定是否為待分離的基因。7.簡(jiǎn)述RACE技術(shù)的基本原理及其優(yōu)缺點(diǎn)。答: 原理:RACE 是采用PCR 技術(shù)由已知的部分cDNA 順序來(lái)擴(kuò)增出完整cDNA5和3末端,是一種簡(jiǎn)便而有效的方法, 又被稱為錨定 PCR和單邊PCR。3RACE的原理一)加入oligo(dT)17和反轉(zhuǎn)錄酶對(duì)mRNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄得到(-)cDNA

30、;二)以oligo(dT)l7和一個(gè)35bp的接頭(dT17-adaptor)為引物,其中在引物的接頭中有一在基因組DNA中罕見(jiàn)的限制酶的酶切位點(diǎn)。這樣就在未知cDNA末端接上了一段特殊的接頭序列。再用一個(gè)基因特異性引物(3 amp)與少量第一鏈(-)cDNA退火并延伸,產(chǎn)生互補(bǔ)的第二鏈(+)cDNA。三)利用3amp和接頭引物進(jìn)行PCR循環(huán)即可擴(kuò)增得到cDNA雙鏈。擴(kuò)增的特異性取決于3amp的堿基只與目的cDNA分子互補(bǔ)而用接頭引物來(lái)取代dT17一adaptor則可阻止長(zhǎng)(dT)堿基引起的錯(cuò)配。5RACE的原理5RACE與3 RACE略有不同。首先,引物多設(shè)計(jì)了一個(gè)用于逆轉(zhuǎn)錄的基因特異引物G

31、SP-RT;其次,在酶促反應(yīng)中增加了逆轉(zhuǎn)錄和加尾步驟,即先用GSP-RT逆轉(zhuǎn)錄 mRNA獲得第一鏈(-)cDNA后, 用脫氧核糖核酸末端轉(zhuǎn)移酶和dATP在cDNA5 端加poly(A)尾,再用錨定引物合成第二鏈(+)cDNA,接下來(lái)與3 RACE過(guò)程相同。用接頭引物和位于延伸引物上游的基因特異性引物(5amp)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。全長(zhǎng)基因的獲得:1,對(duì)3RACE和5RACE的產(chǎn)物序列的重疊區(qū)域分析,經(jīng)過(guò)拼接獲得全長(zhǎng)cDNA2,通過(guò)分析RACE產(chǎn)物的3和5端序列,重新設(shè)計(jì)合成相應(yīng)引物,PCR擴(kuò)增出全長(zhǎng)cDNA優(yōu)缺點(diǎn);優(yōu)點(diǎn);操作速度快,節(jié)省時(shí)間,可在短期內(nèi)獲得全長(zhǎng)的cDNA。只需極少量的起始反應(yīng)物質(zhì),

32、具有快速、簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì)、實(shí)用性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),還幾乎不存在產(chǎn)生非特異產(chǎn)物的可能。缺點(diǎn):利用RACE技術(shù)來(lái)獲得全長(zhǎng)基因并不容易,甚至經(jīng)常會(huì)發(fā)生錯(cuò)誤的擴(kuò)增和克隆結(jié)果,尤其是對(duì)于豐度較低、長(zhǎng)度較長(zhǎng)的基因。8.簡(jiǎn)述基因芯片技術(shù)的原理及其優(yōu)缺點(diǎn)。答:原理:將許多特定的寡核苷酸片段或基因片段作為探針,有規(guī)律地排列固定于支持物上,然后使其與待測(cè)的標(biāo)記樣品基因按劍姬配對(duì)原理進(jìn)行雜交,再通過(guò)共聚焦熒光檢測(cè)系統(tǒng)等對(duì)芯片進(jìn)行掃描,并配以計(jì)算機(jī)系統(tǒng)對(duì)每一探針上的熒光信號(hào)做出比較和檢測(cè),從而迅速得出所要的信息。優(yōu)缺點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):具有高度的敏感性和特異性,有高信息量、快速、樣品用量少、用途廣泛等優(yōu)點(diǎn)。缺點(diǎn):基因芯片需要大量已知的、準(zhǔn)

33、確的DNA和cDNA片段的序列信息,而且,需要高密度芯片制作的精密機(jī)械系統(tǒng)和操作工藝及微弱的雜交信號(hào)檢出裝置,芯片的制作和使用成本均較高,所以尚難在一般的實(shí)驗(yàn)室中普及使用。第九章 園藝植物遺傳轉(zhuǎn)化載體的構(gòu)建1.什么叫卸甲載體?常用的卸甲載體有幾種類型?卸甲載體是無(wú)毒的Ti質(zhì)粒載體,又稱onc-載體。是指為了使野生型的Ti質(zhì)粒成為基因轉(zhuǎn)化的載體,必須切除T-DNA中onc基因,即“解除”其“武裝”,構(gòu)建成“卸甲載體”。常用的卸甲載體類型:pGV3850載體、pGV2250載體和pTiB6S3-SE載體3種。2.Ti共整合轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng)的特點(diǎn)及構(gòu)建策略是什么?特點(diǎn):1.Ti共整合載體由兩個(gè)質(zhì)粒組成,

34、其中一個(gè)是E.coli質(zhì)粒中間載體,另一個(gè)是卸甲Ti質(zhì)粒組成;2.農(nóng)桿菌中兩個(gè)質(zhì)粒形成一個(gè)大的共整合載體,E.coli質(zhì)粒進(jìn)入到根癌農(nóng)桿菌后,以同源重組的方式與Ti質(zhì)粒整合在一起,形成共合體,相對(duì)分子質(zhì)量較大;3.共合體的形成頻率與兩個(gè)質(zhì)粒的重組頻率有關(guān),相對(duì)較低;4.必須用Sounthern雜交或PCR對(duì)大的共整合體質(zhì)粒進(jìn)行檢測(cè);5.構(gòu)建是比較困難。Ti共整合轉(zhuǎn)化載體構(gòu)建策略:基于中間載體與受體Ti質(zhì)粒重組序列的不同,共整合載體可分為以pBR322序列為同源序列的轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng)和基于左邊界內(nèi)部同源區(qū)(LIH)的轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng),即SEV系統(tǒng)。1.基于pBR322同源序列的共整合載體的構(gòu)建策略: 中

35、間載體導(dǎo)入農(nóng)桿菌;(2)中間載體與受體Ti質(zhì)粒的同源重組;(3) 共整合載體的選擇2.SEV系統(tǒng)的構(gòu)建:(1) pTiB63S3-SE質(zhì)粒作為卸甲載體;(2)pMON200作為SEV中間載體;(3)通過(guò)三親雜交將中間載體pMON200或pCIT30導(dǎo)入農(nóng)桿菌,形成SEV的共整合載體。3.Ti雙元表達(dá)載體系統(tǒng)有什么特點(diǎn)?它對(duì)于共整合系統(tǒng)具有哪些優(yōu)點(diǎn)?雙元載體系統(tǒng)特點(diǎn):1.具有RK2質(zhì)粒的復(fù)制功能,可以在大腸桿菌和根癌農(nóng)桿菌中復(fù)制,并且與Ti質(zhì)粒是向容的;2.具有Ti質(zhì)粒的左右兩側(cè)或右側(cè)的邊緣區(qū)序列,使DNA可以轉(zhuǎn)移到植物細(xì)胞; 3.邊緣區(qū)序列內(nèi)包含植物選擇標(biāo)記嵌合基因,用于轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性株的初步篩選

36、; 4.帶有抗生素基因,可以作為細(xì)菌轉(zhuǎn)化因子的選擇記號(hào)。與共整合系統(tǒng)比較的優(yōu)點(diǎn):1.構(gòu)建簡(jiǎn)單2.具有雙復(fù)制位點(diǎn)3.接合頻率更高4.在鑒定上更為容易。4.發(fā)根農(nóng)桿菌Ri質(zhì)粒有什么特點(diǎn)?它可否與Ti質(zhì)粒在異源T-DNA與Vir區(qū)的情況下完成DNA的轉(zhuǎn)移?特點(diǎn):1.可以不經(jīng)“解除武裝”進(jìn)行轉(zhuǎn)化,并且轉(zhuǎn)化產(chǎn)生的發(fā)根能夠再生植株;2.發(fā)狀根是一個(gè)單細(xì)胞克隆,可以避免嵌合體;3.Ri質(zhì)??芍苯幼鳛橹虚g載體;4.Ri質(zhì)粒和Ti質(zhì)??梢耘浜鲜褂媒㈦p元載體系統(tǒng),拓展了兩類質(zhì)粒在植物基因工程中的應(yīng)用范圍;5.發(fā)根適合于進(jìn)行離體培養(yǎng)。Ri質(zhì)粒的T-DNA可以在Ti質(zhì)粒Vir基因的誘導(dǎo)下進(jìn)行T-DNA的轉(zhuǎn)化。5.選

37、擇標(biāo)記基因和報(bào)告基因的特點(diǎn)是什么?常用的選擇基因和報(bào)告基因各有哪幾種?選擇標(biāo)記基因特點(diǎn):1.編碼一種不存在于正常植物細(xì)胞中的酶;2.基因較小,可構(gòu)成嵌合基因;3.能在轉(zhuǎn)化細(xì)胞中得到充分表達(dá);4.檢測(cè)容易,并能定量分析。列舉:新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(npt II)、潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(hpt)、二氫葉酸還原酶基因(dhfr)、草丁膦乙酰轉(zhuǎn)移酶基因(bar)報(bào)告基因特點(diǎn):1.其產(chǎn)物在原植物中不存在或本底很低,并對(duì)宿主植物細(xì)胞無(wú)毒性;2.表達(dá)產(chǎn)物應(yīng)有適度的穩(wěn)定性以利于檢測(cè);3.檢測(cè)手段高度敏感,檢測(cè)方法簡(jiǎn)單、靈敏并可以定量;4.檢測(cè)過(guò)程應(yīng)不具有破壞性。列舉:冠癭堿合成酶基因、螢火蟲熒光素基因、綠色熒

38、光蛋白基因、花青素合成相關(guān)基因。6.園藝植物常用的遺傳轉(zhuǎn)化載體類型包括哪些?正以表達(dá)載體、反義表達(dá)載體、RNA干涉載體、基因打靶載體、啟動(dòng)子缺失載體和瞬時(shí)表達(dá)載體等。7.目的基因與載體的連接方法有哪些?1.插入滅活發(fā);2.定向克隆法:(1)同聚物加尾法(2)銜接物連接法(3)DNA接頭連接法。第十章 園藝植物遺傳轉(zhuǎn)化1.園藝植物遺傳轉(zhuǎn)化方法有哪些?各有哪些優(yōu)缺點(diǎn)?一外援裸露DNA的轉(zhuǎn)化:(1)化學(xué)誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化法(2)電穿孔轉(zhuǎn)化法 (3)基因槍轉(zhuǎn)化法(4)激光微束穿孔轉(zhuǎn)化法(5)體內(nèi)注射轉(zhuǎn)化法(6)脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)化法二載體介導(dǎo)的DNA轉(zhuǎn)化:(1)根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化(2)發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化三

39、種質(zhì)轉(zhuǎn)化法:(1)植物原位真空滲入法(2)花粉管通道轉(zhuǎn)化法(3)種子浸泡轉(zhuǎn)化法2.什么叫選擇標(biāo)記基因和報(bào)告基因?試舉例說(shuō)明怎樣使用。選擇標(biāo)記基因:是指在選擇壓下,編碼產(chǎn)物能夠使轉(zhuǎn)化細(xì)胞、組織具有對(duì)抗生素或除草劑的抗性,而非轉(zhuǎn)化細(xì)胞則不能在使用選擇劑的條件下生長(zhǎng)、發(fā)育和分化的基因。舉例:在園藝植物遺傳轉(zhuǎn)化中,將npt II一同轉(zhuǎn)化植物受體細(xì)胞,使轉(zhuǎn)化體具有npt II表達(dá)產(chǎn)物而對(duì)卡那霉素具有抗性。報(bào)告基因:指其編碼產(chǎn)物在受體細(xì)胞、組織或器官中具有表達(dá)活性,能夠被快速地測(cè)定的一類特殊用途的基因。舉例:依據(jù)螢火蟲熒光素酶在鎂離子、三磷酸腺苷和氧的作用下,催化6-羥基喹啉物質(zhì)生成氧化熒光素,同時(shí)放出光

40、子,檢測(cè)簡(jiǎn)便、靈敏。3.比較Southern雜交、Northern雜交和Western雜交的原理及鑒定目的。Southern雜交原理:指模板DNA經(jīng)酶切、凝膠電泳分離、轉(zhuǎn)膜等步驟后,再用標(biāo)記的單鏈DNA探針雜交探測(cè)的一種技術(shù),其理論基礎(chǔ)是堿基互補(bǔ)配對(duì)原則。鑒定目的:進(jìn)行核酸序列分析、重組子鑒定和檢測(cè)外源基因整合及表達(dá)情況,還可清除操作過(guò)程中的DNA污染和轉(zhuǎn)化中的質(zhì)粒殘留所引起的假陽(yáng)性信號(hào)。Northern雜交原理:RNA樣品經(jīng)凝膠電泳、轉(zhuǎn)膜、預(yù)雜交后,再用標(biāo)記的探針與膜上的RNA雜交,以檢驗(yàn)RNA樣品中是否有與探針同源的序列,如果有雜交信號(hào),表明整合到植物染色體上的外源基因能正常表達(dá)。鑒定目的

41、:研究轉(zhuǎn)基因植株外源基因表達(dá)及調(diào)控。Western雜交原理:從植物中提取總蛋白或目的蛋白,將蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行SDS-PAGE,使蛋白質(zhì)按大小分離,將分離的各種蛋白質(zhì)條帶原位印跡到固相膜上,然后加入特異抗體(一抗),印跡上的目的蛋白(抗原)與一抗結(jié)合后,再加入到能與一抗專一結(jié)合的被標(biāo)記的二抗,最后通過(guò)二抗上的標(biāo)記化合物進(jìn)行檢測(cè)。鑒定目的:鑒定轉(zhuǎn)基因植株是否能產(chǎn)生特異抗體。4.什么叫轉(zhuǎn)基因沉默?怎樣克服?轉(zhuǎn)基因沉默:導(dǎo)入并整合進(jìn)受體基因組中的外源基因在轉(zhuǎn)化體的當(dāng)代或其后代中出現(xiàn)表達(dá)受到抑制,甚至完全不表達(dá)的現(xiàn)象,稱為轉(zhuǎn)基因沉默。怎樣克服:1.采用合適的轉(zhuǎn)化方法2.使用信號(hào)肽3.使用強(qiáng)啟動(dòng)子和誘導(dǎo)型啟

42、動(dòng)子4.使用強(qiáng)終止子5.使用增強(qiáng)子6.使用植物偏愛(ài)的密碼子7.使用基質(zhì)結(jié)合區(qū)序列8.防止甲基化9.改造外源基因。5.試述基因靶向技術(shù)的原理、步驟及當(dāng)前的應(yīng)用概況?;虬邢蚣夹g(shù)原理:利用同源重組、點(diǎn)突變或隨機(jī)突變、RNAi等途徑使機(jī)體已知結(jié)構(gòu)的特定基因失活或缺失。(一)同源重組進(jìn)行基因打靶原理:應(yīng)用同源重組原理,用設(shè)計(jì)的同源片段替代靶基因片段,從而達(dá)到基因剔除的目的。步驟:1.構(gòu)建含目的基因和標(biāo)記基因的重組載體;2.受體細(xì)胞的制備;3.用電穿孔、顯微注射等方法把重組DNA轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞內(nèi),實(shí)現(xiàn)同源重組;4.用選擇培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)化細(xì)胞;5.轉(zhuǎn)化體培養(yǎng)、篩選及利用表型變化研究目的基因功能。(二)隨機(jī)插入

43、突變進(jìn)行基因打靶原理:利用某些能隨機(jī)插入基因序列的病毒、細(xì)菌或其他基因載體,在目標(biāo)細(xì)胞基因組中進(jìn)行隨機(jī)插入突變,建立一個(gè)攜帶隨機(jī)插入突變的細(xì)胞庫(kù),然后通過(guò)相應(yīng)的標(biāo)記進(jìn)行篩選獲得相應(yīng)的基因剔除細(xì)胞。步驟:1.構(gòu)建含目的基因的T-DNA載體;2.農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化植株;3.轉(zhuǎn)基因植株的堅(jiān)定;4.插入失活突變植株篩選;5.T-DNA插入位點(diǎn)基因的克隆。第十一章1.與傳統(tǒng)育種技術(shù)相比較,應(yīng)用基因工程技術(shù)進(jìn)行園藝植物遺傳改良有哪些優(yōu)點(diǎn)?答:(1)可提高作物產(chǎn)量和改善作物的抗蟲、抗病、抗除草劑等抗逆能力; (2)改善園藝產(chǎn)品的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和食用風(fēng)味,如營(yíng)養(yǎng)成分含量、風(fēng)味品質(zhì)、延長(zhǎng)貨架壽命和保存時(shí)間,以及用食品工

44、程菌生產(chǎn)食品添加劑和功能因子等。2.舉例說(shuō)明利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)可以改良蔬菜作物的哪些性狀?答:(1)Li等在番茄中超量表達(dá)土豆多酚氧化酶基因(PPO)的cDNA,結(jié)果表明強(qiáng)烈抑制了細(xì)菌的生長(zhǎng),使感染葉片中細(xì)菌密度減少到原來(lái)的10%,極大地提高了番茄植株對(duì)于細(xì)菌性病害的抗性。 (2)脯氨酶合成酶基因P5CS在胡蘿卜中表達(dá)使植物的耐鹽能力得到了明顯提高。 (3)Meyer等將玉米的DFR基因?qū)氚咨珷颗V仓曛?,是二氫黃酮醇還原為花葵素,轉(zhuǎn)化后的矮牽?;ㄉ邪咨兂纱u紅色。3.生物技術(shù)在園藝植物育種中的應(yīng)用有哪些方面?答:(1)創(chuàng)造雄性核不育系 途徑1.通過(guò)核酸酶基因的特異空間表達(dá)創(chuàng)造雄性不育系 2.

45、利用胼胝質(zhì)酶提前降解胼胝質(zhì)壁是雄性不育 3.利用反義基因獲得植物雄性不育 4.改變激素含量與比例獲得雄性不育植株 5.導(dǎo)入細(xì)胞質(zhì)雄性不育的有關(guān)基因?qū)е轮参镄孕圆挥?6.通過(guò)共抑制及RNAi轉(zhuǎn)基因沉默創(chuàng)造植物雄性不育 (2)基因工程雄性不育系的恢復(fù)與保持 途徑1.利用引起雄性不育基因的抑制基因來(lái)恢復(fù)育性 2.通過(guò)化學(xué)調(diào)控恢復(fù)育性 3.利用定位重組系統(tǒng)來(lái)恢復(fù)不育植株的育性4.如何應(yīng)用生物技術(shù)提高園藝植物的光合能力和固氮能力?答:(1)提高光合能力:A:C4光合途徑關(guān)鍵酶基因的克隆和轉(zhuǎn)化。將C4途徑涉及到的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、磷酸丙酮酸二激情酶(PPDK)和蘋果酸酶的基因從C4植物中

46、克隆出來(lái)并導(dǎo)入C3植物。如把玉米的PPDK基因?qū)腭R鈴薯中,PPDK活性比對(duì)照高5.4倍。 B:果糖-1,6-二磷酸酶(FBPase)基因。將土豆葉綠體中的FBPase基因轉(zhuǎn)化到土豆塊莖的造粉體中,有著更高的活性,合成了更多的淀粉。 (2)提高固氮能力:向不能或固氮能力差的微生物中導(dǎo)入強(qiáng)的固氮基因。將克氏肺炎桿菌固氮基因(nif)導(dǎo)入不能固氮的植物或微生物中,以獲得固氮植物或固氮微生物。把帶有固氮基因的智力PRD1從大腸桿菌K12jc5564導(dǎo)入無(wú)固氮能力的水稻根系菌4502Y中,表現(xiàn)出較強(qiáng)的固氮能力。5.抗蟲轉(zhuǎn)基因園藝植物的獲得有哪些途徑?答:將抗蟲基因?qū)胫仓曛小?抗蟲基因來(lái)源有植物、動(dòng)物

47、、昆蟲、真菌、細(xì)菌和病毒。第十二章1.植物研究中常用的遺傳標(biāo)記有哪幾類?又有何優(yōu)缺點(diǎn)??jī)?yōu)點(diǎn)缺點(diǎn)形態(tài)標(biāo)記簡(jiǎn)單直觀,容易觀察可利用的形態(tài)標(biāo)記較少;許多標(biāo)記為隱性;生育后期磁能觀察到;受環(huán)境影響大;與不良現(xiàn)狀連鎖細(xì)胞學(xué)標(biāo)記克服了形態(tài)標(biāo)記易受環(huán)境影響的缺點(diǎn),實(shí)現(xiàn)基因的染色體定位篩選和創(chuàng)造花費(fèi)大量人力物力;難以保存或遺傳穩(wěn)定;常伴隨有害效應(yīng),難觀測(cè)鑒定;標(biāo)記數(shù)目有限生化標(biāo)記多態(tài)性高;受環(huán)境影響少;表現(xiàn)共顯性;可期鑒定;所需材料少標(biāo)記數(shù)目有限;蛋白質(zhì)電泳分辨率有限,不能檢測(cè)所有突變;每種同工酶標(biāo)記都要特定顯色方法;某些酶活性具有組織或發(fā)育特異性分子標(biāo)記多態(tài)性高;表現(xiàn)穩(wěn)定;許多分子標(biāo)記為共顯性;表現(xiàn)中性,不

48、影響表達(dá),無(wú)必然連鎖;DNA變異廣泛存在2.分子標(biāo)記產(chǎn)生的分子基礎(chǔ)是什么?答:(1)DNA序列酶切位點(diǎn)的堿基發(fā)生突變,導(dǎo)致酶切位點(diǎn)消失、酶切產(chǎn)物減少。 (2)DNA序列酶切位點(diǎn)之間缺失或插入一段核苷酸序列,或是酶切位點(diǎn)之間的串聯(lián)重復(fù)單元數(shù)目發(fā)生了改變,倒是酶切產(chǎn)物片段長(zhǎng)度改變。 (3)單核苷酸突變,即單堿基轉(zhuǎn)換或顛換。3.園藝植物常用的分子標(biāo)記有哪些?產(chǎn)生的原理是什么?答:(1) RFLP標(biāo)記:基于Southern雜交。RFLP標(biāo)記是用限制性內(nèi)切酶酶解具有相對(duì)性狀的兩個(gè)群體的DNA,然后通過(guò)電泳和Southern雜交技術(shù)在酶切后形成的DNA片段中發(fā)現(xiàn)這種不同。根據(jù)含有與雜交探針同原序列的酶切片

49、段的長(zhǎng)度來(lái)檢測(cè)DNA序列。(2) 小衛(wèi)星標(biāo)記:基于Southern雜交。與RFLP標(biāo)記原理大致相同,只對(duì)限制性內(nèi)切核酸酶和雜交探針有特殊要求。(3) RAPD標(biāo)記:基于PCR擴(kuò)增。RAPD標(biāo)記的操作步驟與常規(guī)PCR基本相似,只是引物不同。常規(guī)PCR使用雙引物,通常1830bp,RAPD標(biāo)記使用單引物,通常為10 bp的隨機(jī)序列。(4) SSR標(biāo)記:基于PCR擴(kuò)增。SSR標(biāo)記就是根據(jù)簡(jiǎn)單重復(fù)序列外兩翼的特定序列設(shè)計(jì)引物,用來(lái)擴(kuò)增重復(fù)序列本身,由于重復(fù)的長(zhǎng)度變化極大,所以會(huì)得到不同長(zhǎng)度的片段。如果擴(kuò)增出來(lái)的某個(gè)片段與某個(gè)特定性狀存在對(duì)應(yīng)關(guān)系,則該片段為該性狀的SSR標(biāo)記。(5) ISSR標(biāo)記:基于

50、PCR擴(kuò)增。設(shè)計(jì)出各種能與SSR序列結(jié)合的PCR引物,這些引物的3端或5端加上24個(gè)隨機(jī)核苷酸,通過(guò)PCR反應(yīng),對(duì)兩個(gè)相距較近,方向相反的重復(fù)序列之間的DNA序列進(jìn)行擴(kuò)增。所擴(kuò)增的inter SSR區(qū)域的多個(gè)條帶通過(guò)聚丙烯酰胺凝膠電泳或者瓊脂糖凝膠電泳得以分辨,擴(kuò)增帶多為顯性表現(xiàn)。(6) AFLP標(biāo)記;基于PCR擴(kuò)增。原理是選擇性擴(kuò)增園藝植物基因組DNA的雙酶切片段,檢測(cè)的多態(tài)性是酶切位點(diǎn)的變化或酶切片段間DNA序列的插入和缺失。AFLP標(biāo)記是用DNA限制性內(nèi)切酶酶解具有相對(duì)性狀的兩個(gè)群體的DNA,然后對(duì)酶切產(chǎn)物進(jìn)行選擇性擴(kuò)增,最后在形成的擴(kuò)增產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)不同。這種不同就是與目的性狀相連鎖的AF

51、LP標(biāo)記。(7) SRAP和TRAP標(biāo)記:基于PCR擴(kuò)增。SRAP標(biāo)記原理是利用外顯子G/C含量豐富而內(nèi)含子A/T含量豐富的特點(diǎn),分別是即正向引物和反向引物,對(duì)可讀框的外顯子和內(nèi)含子、啟動(dòng)子進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而產(chǎn)生基于外顯子和內(nèi)含子的多態(tài)性。TRAP差別僅在于引物不同。(8) STS、SCAR、CAPS標(biāo)記(9) SNP標(biāo)記:基于Southern雜交和PCR擴(kuò)增。園藝植物基因組由于單個(gè)核苷酸變異而引起DNA序列多態(tài)性,包括單堿基轉(zhuǎn)換、顛換以及單堿基的插入或缺失。4.園藝植物分子標(biāo)記數(shù)據(jù)收集過(guò)程中應(yīng)注意哪些問(wèn)題?答:多態(tài)性=(總條帶數(shù)-共有條帶數(shù))/總條帶數(shù) 相關(guān)系數(shù),距離系數(shù),聯(lián)合系數(shù)。5.分

52、子標(biāo)記在園藝植物研究中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在哪些方面?答:(1)分子遺傳圖譜構(gòu)建和基因定位分子遺傳圖譜構(gòu)建 園藝植物分子遺傳圖譜的構(gòu)建及基因定位 (2)分子標(biāo)記輔助選擇育種 與目標(biāo)基因連鎖分子標(biāo)記的獲得 園藝植物分子標(biāo)記輔助選擇 (3)遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析 (4)核心種質(zhì)構(gòu)建 核心種質(zhì)構(gòu)建的原理 園藝植物核心種質(zhì)的構(gòu)建 (5)園藝植物品種鑒定與純度分析6.構(gòu)建園藝植物分子遺傳圖譜時(shí)常用的分離群體有哪些?各有何優(yōu)缺點(diǎn)?方法優(yōu)點(diǎn)缺點(diǎn)F2分離群體分離群體容易構(gòu)建存在雜合基因;不能長(zhǎng)久保存BC1分離群體直接放映F1配子分離比例不能長(zhǎng)久保存F1分離群體DH分離群體穩(wěn)定繁殖;直接放映F1配子分離比例花藥培養(yǎng)

53、破壞DH遺傳結(jié)構(gòu),偏分離,影響作圖RIL分離群體純合永久分離群體構(gòu)建周期長(zhǎng)7.利用BSA法獲得與園藝植物目標(biāo)性狀緊密連鎖分子標(biāo)記的原理是什么?答:BSA法的原理是將分離群體中的個(gè)體依據(jù)研究的目標(biāo)性狀(如抗病和染?。┓殖蓛山M,在每組群體中把各個(gè)個(gè)體的DNA等量混合,形成兩個(gè)DNA混合池。因此又稱為近等基因池法。它克服了許多植物不易獲得近等基因系的缺點(diǎn)。8.構(gòu)建園藝植物核心種質(zhì)的基本步驟有哪些?(1)數(shù)據(jù)收集:收集所有種質(zhì)資源的現(xiàn)有數(shù)據(jù)資料。(2)數(shù)據(jù)分組:把具有相似數(shù)據(jù)的種質(zhì)資源分為一組。(3)樣品選擇:把所有種質(zhì)資料科學(xué)地分組后,以合理的取樣方法及取樣比例選取核心種質(zhì)。(4)核心種質(zhì)管理:建立

54、完善的核心種質(zhì)繁殖、供種及管理體制,以保證核心種質(zhì)的有效利用。第十三章1.生物信息學(xué)研究的任務(wù)及內(nèi)容: 任務(wù):以計(jì)算機(jī)科學(xué)、工程和應(yīng)用數(shù)學(xué)為基礎(chǔ),進(jìn)行相關(guān)的生物信息的獲取,加工、儲(chǔ)藏、分配、分析和解釋等,即依賴試驗(yàn)和衍生數(shù)據(jù)的大量存儲(chǔ),將各種各樣的生物信息,如基因序列、染色體定位、基因產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)和功能及個(gè)生物中間的進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行搜集、分類和分析,并實(shí)現(xiàn)全世界生命科學(xué)界的信息資源共享。 內(nèi)容:1)生物信息的收集儲(chǔ)藏和管理。2)基因序列信息的分析,開發(fā)信息檢索工具及之后的信息自動(dòng)化處理3)基因功能分析,闡明基因功能 4)生物大分子結(jié)構(gòu)模擬(預(yù)測(cè))5)生物信息分析的技術(shù)與方法(軟件、數(shù)據(jù)庫(kù)、數(shù)據(jù)庫(kù)的分

55、析工具、新方法、新技術(shù))2.常用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)有哪些 基本數(shù)據(jù)庫(kù)(DNA序列,蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)) 二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)(對(duì)基本數(shù)據(jù)庫(kù)的分析、提煉、加工) 1)DNA數(shù)據(jù)庫(kù):GenBank(美國(guó)) EMBL歐洲) DDBJ(日本) Biosino(中國(guó)) 2)基因組數(shù)據(jù)庫(kù) 人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(GDB)、酵母基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(SGD)、 擬南芥基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(TAIR) 3)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù) SWISS-PROT(瑞士):序列、結(jié)構(gòu)域、功能、修飾、突變體 TrEMBL PIR數(shù)據(jù)庫(kù)(4部分):PIR1序列清楚;PIR2序列被檢測(cè)分類,但冗 余;PIR3未被檢測(cè);PIR4未被驗(yàn)證 NRL-3D 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)已知 OWL數(shù)據(jù)庫(kù) 4)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(由X射線晶體衍射和核磁

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