生物化學知識要點(上)

1、14生物化學生物化學湖北大學生命科學學院2015/5/1 生物化學知識要點（上）第二章：氨基酸 1. 氨基酸的區(qū)別在于側鏈r基的不同。二十種常見氨基酸分類：按照r基的化學結構，20種氨基酸可分為脂肪族，芳香族和雜環(huán)族3類。脂肪族氨基酸含5種中性氨基酸（甘氨酸，丙氨酸，纈氨酸，亮氨酸，異亮氨酸）;含羥基或硫元素的氨基酸4種（絲氨酸，蘇氨酸，半胱氨酸，甲硫氨酸）；酸性氨基酸及其酰胺4種（天冬氨酸，天冬酰胺，谷氨酸，谷氨酰胺）；堿性氨基酸2種（賴氨酸，精氨酸）雜環(huán)氨基酸2種（組氨酸，脯氨酸）；芳香族氨基酸3種（苯丙氨酸，酪氨酸，色氨酸） 組氨酸也是一種堿性氨基酸按r基的極性大?。ㄖ冈诩毎鹥h即ph=

2、7左右的解離狀態(tài)下）： 非極性氨基酸: Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp, Met R基具極性不帶電荷的氨基酸: Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln R基帶正電荷的氨基酸: Lys, Arg, His R基帶負電荷的氨基酸: Asp, Glu2.氨基酸的等電點（概念及計算式，性質） 概念：當溶液濃度為某一pH值時，氨基酸分子中所含的正負電荷正好相等，凈電荷為0。這一pH值即為氨基酸的等電點，簡稱pI。在等電點時，氨基酸既不向正極也不向負極移動，即氨基酸處于兩性離子狀態(tài) 計算式：側鏈不含離解基團的中性氨基酸，其等電點是它的pK1和

3、pK2的算術平均值： pI = (pK1 + pK2 )/2 側鏈含有可解離基團的氨基酸，其pI值也決定于等電兼性離子兩邊的pK值的算術平均值。 酸性氨基酸： pI = (pK1 + pKR-COO- )/2 鹼性氨基酸： pI = (pK2 + pKR-NH2 )/2 無論氨基酸側鏈是否解離，其pI值均決定于凈電荷為零的等電兼性離子兩邊的pK值算術平均值性質：當?shù)陀诘入婞c的任一ph時，氨基酸帶有凈正電荷，向負極移動；當高于等電點的任一ph時，氨基酸帶有凈負電荷，向正極移動。在一定的ph范圍內氨基酸溶液的ph離等電點越遠，氨基酸所帶凈電荷越多。3.氨基酸的光譜性質（后面的蛋白質同樣具有） &#

4、160;芳香族氨基酸（酪氨酸，色氨酸，苯丙氨酸）在280nm波長附近有最大的紫外吸收峰，由于大多數(shù)蛋白質含有這些氨基酸殘基，氨基酸殘基數(shù)與蛋白質含量成正比，故通過對波長的紫外吸光度的測量可對蛋白質溶液進行定量分析（核酸在260nm處有最大的吸收峰）第三章：蛋白質的通性，純化和表征1.蛋白質的性質：膠體性質（具有丁達爾效應）；沉淀（特殊的：鹽析）2.蛋白質的等電點同氨基酸，與它所含的酸性氨基酸和堿性氨基酸的數(shù)目比例有關。處于等電點處時，蛋白質的溶解度最小。3.蛋白質的等離子點：當沒有溶液中的離子干擾時，蛋白質分子本身的質子供體集團解離出來的質子數(shù)與它的質子受體基因結合的質子數(shù)相等時溶液ph.第四

5、章:蛋白質的共價結構（一級結構）（一起說明蛋白質的高級結構） 1.蛋白質的一級結構：即蛋白質分子中氨基酸的排列順序。主要化學鍵：肽鍵，有些蛋白質還包含二硫鍵。 、蛋白質的高級結構：包括二級、三級、四級結構3.蛋白質的二級結構：指蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構，也就是該段肽鏈骨架原子的相對空間位置，并不涉及氨基酸殘基側鏈的構象。二級結構以一級結構為基礎，多為短距離效應?？煞譃槁菪憾嚯逆溨麈渿@中心軸呈有規(guī)律地螺旋式上升，順時鐘走向，即右手螺旋，每隔3.6個氨基酸殘基上升一圈，螺距為0.540nm。螺旋的每個肽鍵的和第四個肽鍵的羧基氧形成氫鍵，氫鍵的方向與螺旋長軸基本平形 -折疊：多肽鏈充

6、分伸展，各肽鍵平面折疊成鋸齒狀結構，側鏈基團交錯位于鋸齒狀結構上下方；它們之間靠鏈間肽鍵羧基上的氧和亞氨基上的氫形成氫鍵維系構象穩(wěn)定 . -轉角：常發(fā)生于肽鏈進行180度回折時的轉角上，常有個氨基酸殘基組成，第二個殘基常為脯氨酸。 注：無規(guī)卷曲：無確定規(guī)律性的那段肽鏈。主要化學鍵：氫鍵 4.蛋白質的三級結構：蛋白質的三級結構：指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置，顯示為長距離效應。主要化學鍵：疏水鍵（最主要）、鹽鍵、二硫鍵、氫鍵、范德華力。5.蛋白質的四級結構：對蛋白質分子的二、三級結構而言，只涉及一條多肽鏈卷曲而成的蛋白質。在體內有許多蛋白質分子含有二條或多條肽鏈，每一條多肽鏈都有其完整

7、的三級結構，稱為蛋白質的亞基，亞基與亞基之間呈特定的三維空間排布，并以非共價鍵相連接。這種蛋白質分子中各個亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用，為四級結構。由一條肽鏈形成的蛋白質沒有四級結構。主要化學鍵：疏水鍵、氫鍵、離子鍵重要：多肽鏈的部分裂解(p49)蛋白酶是一類肽鏈內切酶稱為內肽酶。在蛋白質測序中常用到的有：1. 胰蛋白酶：最常用到的，專一性強，只斷裂堿性氨基酸（賴氨酸殘基或者是精氨酸殘基的羧基參與形成的肽鍵，多得到以arg（精氨酸），lys（賴氨酸）為c-末端殘基的肽段。2. 胰凝乳蛋白酶（糜蛋白酶）：專一性不如胰蛋白酶，斷裂含苯環(huán)的氨基酸（苯丙氨酸，色氨酸，酪氨酸等疏水氨基酸

8、的羧基端肽鍵）。若斷裂點附近的基團是堿性的，裂解能力增強，反之，減弱。3. 胃蛋白酶：其專一性與胰凝乳蛋白酶相似，但它斷裂的是苯丙氨酸，色氨酸，酪氨酸或纈氨酸等疏水性氨基酸的氨基端肽鍵。（與胰凝乳蛋白酶不同點在于酶作用的最適ph不同，胃蛋白是ph=2，而胰凝乳蛋白酶的是ph=89.4. 葡萄球菌蛋白酶：作用于酸性氨基酸，專一斷裂谷氨酸殘基或者是天冬氨酸殘基的羧基端肽鍵。第五章：第七節(jié):球狀蛋白質與三維特點（p66） 球狀蛋白質與三維結構的特征：1. 球狀蛋白質同時含有幾種類型二級結構元件（螺旋,轉角, 折疊）2. 具有明顯的折疊層次(包括二級結構,超二級結構,結構域,三級結構,四級結構)3.

9、球狀蛋白質是致密的球狀或橢球狀實體.4. 球狀蛋白質分子疏水殘基埋藏在分子內部,親水殘基埋在分子表面5. 球狀蛋白質分子的表面有一個空穴或者一個裂溝. 第八節(jié)，亞基締合與四級結構（p67） 1 ）四級結構：很多蛋白質以三級結構的球狀蛋白通過非共價鍵彼此締合在一起形成聚集體，這就是蛋白質的四級結構。亞基又稱單體,四級結構的蛋白質中每個球狀蛋白質稱為亞基或亞單位，亞基一般是一條多肽鏈，但有的亞基由二條或多條肽鏈通過二硫鍵連接而成,本身具有完整的三級結構,.單體蛋白質：指無四級結構的蛋白質，如肌紅蛋白、溶菌酶等,寡聚蛋白質(多亞基蛋白質或多聚蛋白質)：指由兩條或更多條多肽鏈（亞基）組成的蛋白質.只由

10、一種亞基組成的寡聚蛋白質稱為同多聚蛋白質.由幾種不同的亞基組成多聚蛋白質稱為雜多聚蛋白質. 多聚蛋白質分子的一般特點:亞基數(shù)目一般為偶數(shù)(尤以2和4為多),極少數(shù)的為奇數(shù);亞基的數(shù)目一般的是一種或兩種,少數(shù)的多于兩種. 穩(wěn)定四級結構的力與穩(wěn)定三級結構的力相同。一級 結構指蛋白質分子中多肽鏈的氨 基酸殘基排列順序，一級結構是由基因上遺傳 密碼的排列順序決定的。穩(wěn)定結構主要是共價鍵，還有 二硫鍵。二級 結構指多肽鏈中主鏈原子在各局 部空間的排列分布狀況，而 不涉及各R側鏈的空間排布。主要形式包括-螺旋結 構、-折疊和-轉角等。 基本單位是肽鍵平面或稱 酰胺平面穩(wěn)定二級結構的主要因素 是氫鍵。另外還

11、有肽鍵。三級 結構是指上述蛋白質的-螺旋、 -折疊以及線狀等二級結構 受側鏈和各主鏈構象單元間 的相互作用，從而進一步卷 曲、折疊成具有一定規(guī)律性 的三度空間結構。三級結構包括每一條肽鏈 內全部二級結構的總和及 所有側基原子的空間排布 和它們相互作用的關系。除了主鍵肽鍵外，還有氫鍵、離子鍵、疏水相互作用和二硫鍵等以及范德華力的作用四級 結構是指由兩條以上具有獨立三 級結構的多肽鏈通過非共價 鍵相互結合而成一定空間結 構的聚合體，四級結構中每條具有獨立 三級結構的多肽鏈稱為亞 基。穩(wěn)定四級結構的是非共價鍵。其中亞基中有離子鍵、氫鍵、疏水相互作用 和范德華力。但以前兩者 為主2）別構蛋白質和別構效

12、應別構蛋白質：又叫調節(jié)蛋白質，為寡聚蛋白質,分子中每個亞基都有活性部位或者還有別構部位（調節(jié)部位）,如天冬氨酸轉氨甲酰酶，活性部位與別構部位分屬不同的亞基別構效應：指別構蛋白（如血紅蛋白、別構酶等）與配基結合后，蛋白質的構象發(fā)生改變，進而改變了該別構蛋白生物活性的現(xiàn)象第九節(jié)：蛋白質變性與功能丟失 蛋白質變性：在某些物理和化學因素作用下，其特定的空間構象被破壞，從而導致其理化性質的改變和生物活性的喪失。主要為二硫鍵和非共價鍵的破壞，不涉及一級結構的改變。變性后，其溶解度降低，粘度增加，結晶能力消失，生物活性喪失，易被蛋白酶水解。常見的導致變性的因素有：物理因素，加熱，超聲波、紫外線、震蕩、化學因

13、素，氯仿，丙酮，苯酚，乙醇等有機溶劑、強酸、強堿（極端ph）、重金屬離子及生物堿試劑等。某些溶質如尿素，鹽酸胍以及去污劑如十二烷基硫酸鈉（sds）等。這些變性劑作用溫和，處理多肽鏈時共價鍵不被破壞。有機溶劑，去污劑，尿素及胍主要是破壞球狀蛋白質內核的疏水相互作用，極端ph是改變蛋白質上的靜電荷，引起靜電排斥和破壞某些氫鍵。這些處理，最終的變性狀態(tài)是一樣的。 蛋白質的復性：當變性因素去除后，變性蛋白質又重新回到天然構象的現(xiàn)象。第六章：蛋白質的功能和進化(p73)，第七章;糖類和糖生物學(p89)了解第九章：酶引論 1酶作為生物催化劑的特點（p136）：a、酶的催化能力高（高效性）；b、酶的專一性

14、強(專一性)；c、酶的活力受到調節(jié)；d、作用條件較溫和，易失活。 2.酶的分類和編號（p139）:大多數(shù)酶是催化電子、原子或官能團轉移。根據(jù)轉移反應的性質及基團供體和基團受體的類型，對酶進行分類，給予分類編號和系統(tǒng)名稱。 國際酶學委員會根據(jù)各種酶所催化反應的類型把酶分為6大類，分別用1、2、3、4、5、6表示。再根據(jù)底物中被作用的基團或鍵的特點將每一大類分為若干亞類，用1、2、3、4 編號。每一亞類可再分為亞亞類，仍用1、2、3、4 編號。一種酶只有一個名稱和一個編號。 （P.140 表9-4） 1.氧化還原酶類(oxidoreductases)指催化底物進行氧化還原反應（轉移電子、h-離子或

15、h原子）的酶類。例如，乳酸脫氫酶、琥珀酸脫氫酶、細胞色素氧化酶、過氧化氫酶等。 2.轉移酶類(transferases)指催化底物之間進行某些基團的轉移或交換的酶類。如轉甲基酶、轉氨酸、己糖激酶、磷酸化酶等（基團轉移 ，從一個分子到另一個分子）3.水解酶類(hydrolases)指催化底物發(fā)生水解反應的酶類。例如、淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、磷酸酶等。（水解斷裂）4.裂合酶類(lyases)指催化一個底物分解為兩個化合物或兩個化合物合成為一個化合物的酶類。例如檸檬酸合成酶、醛縮酶等。（向雙鍵加入基團，或其逆反應）. 5.異構酶類(isomerases)指催化各種同分異構體之間相互轉化的酶類。例如，

16、磷酸丙糖異構酶、消旋酶等（分子內重排，形成異構體）. 6.合成酶類(連接酶類，ligases)指催化兩分子底物合成為一分子化合物，同時還必須偶聯(lián)有ATP的磷酸鍵斷裂的酶類。例如，谷氨酰胺合成酶、氨基酸：tRNA連接酶等。(通過與ATP裂解相偶聯(lián)的縮合反應形成c-c、c-s、c-o和c-n健等)。3.關于酶的專一性的假說（p141）.酶的專一性分類（p140）了解a. 鎖鑰學說認為整個酶分子的天然構象是具有剛性結構的，酶表面具有特定的形狀。酶與底物的結合如同一把鑰匙對一把鎖一樣 b. 誘導契合學說該學說認為酶表面并沒有一種與底物互補的固定形狀，而只是由于底物的誘導才形成了互補形狀.（重要） c.

17、“三點附著”學說:酶與底物的結合必須多于兩個結合點。酶只有對那些至少有三個結合點都是互相匹配的底物才能夠發(fā)揮催化作用。誘導契合：a、酶和底物都是動態(tài)分子；b、酶和底物是相互作用的；c、二者相互誘導，構想發(fā)生改變；d、契合成酶-底物復合體。第十章：酶動力學（重點是米-曼氏方程，酶的抑制類型及實用舉例） 1.酶反應： 一級反應：反應速率與反應物濃度的一次方成正比，其半衰期(t1/2)與反應物初濃度無關，即不管反應物初濃度是多少，半衰期是一樣的。二級反應（混合級反應）：反應速率與反應物濃度的二次方成正比。其半衰期與初濃度成反比，即初濃度愈大，反應物減少一半所需的時間愈短。 零級反應：反應半衰期與初濃

18、度成正比，即初濃度愈大，半衰期(反應物初始濃度降至一半的時間)愈長。 2.米氏方程 由于反應系統(tǒng)中S遠大于Et，當S很高時所有的酶都被底物所飽和， Et =ES，反應達到最大速度Vmax=k2ES=k2 Et,代入上式得： 這就是根據(jù)穩(wěn)態(tài)理論推導出的動力學方程，稱為米-曼氏方程，Km稱為米氏常數(shù)。 米-曼氏方程表明了當已知Km及Vmax時，酶反應速度與S間的定量關系a. Vmax的意義：在Et一定時，酶對特定S的Vmax是常數(shù)。同一種酶對不同底物的Vmax不同，pH、溫度、離子強度等也影響Vmax。當S很大時，Vmax與Et成線形關系當SE，酶可被底物飽和的情況下，反應速率與酶濃度成正比。關系

19、式為：V = k3 E b.km：在數(shù)值上面等于當速率等于vmax的一半的時候的底物濃度。反應了酶與底物的親和力。Km越小，表示酶與底物的親和力越強，反之，越弱。3.酶的抑制作用（p162） 1.抑制作用：某些能夠干擾催化作用的分子因素使得酶促反應速率減慢或者完全停止的效應。這些分子因素即抑制劑（凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白變性的物質稱為酶的抑制劑） 抑制是指抑制劑與酶分子的某些必要基團（主要是活性部位的基團）結合，而使得酶活力下降或者喪失。 失活：酶分子在變性劑的作用下引起酶活力降低或者喪失。抑制劑與變性劑：抑制劑對酶具有選擇性，(特異性)，它涉及酶的局部結構（主要是活性中心）；變性

20、劑對酶沒有選擇性，他影響酶的整個三維結構（包括酶的活性中心）酶的抑制劑一般具備兩個方面的特點：a.在化學結構上與被抑制的底物分子或底物的過渡狀態(tài)相似。b.能夠與酶的活性中心以非共價或共價的方式形成比較穩(wěn)定的復合體或結合物2抑制作用類型及特點。(p163) a.可逆抑制作用（重要）： 酶與抑制劑非共價結合，可以通過透析、超濾或稀釋等物理方法將抑制劑除去，恢復酶的催化活性 。根椐抑制劑與酶結合的情況，又可以分為：競爭性抑制、非競爭性抑制和反競爭性抑制。 不可逆抑制作用：與酶共價結合，不能通過透析、超濾或稀釋等方法將其除去。b. 1.競爭性抑制：某些抑制劑的化學結構與底物相似，因而能與底物竟爭酶的活

21、性中心。酶的活性部位不能與底物和抑制劑同時結合，當抑制劑與活性中心結合后，底物被排斥在反應中心之外，其結果是酶促反應被抑制了。竟爭性抑制通?？梢酝ㄟ^增大底物濃度，即提高底物的競爭能力來消除。 (酶可以與底物結合，也可以與抑制劑結合。抑制劑與酶的活性中心結合，最終表現(xiàn)為km增大，vmax不變。)2.反竟爭性抑制：酶只有與底物結合后才能與抑制劑結合，ESI三元復合物不能進一步分解為產物因而使酶活力降低。（抑制劑不能夠和酶結合，只能與酶-底物結合形成三元復合體，不影響酶與底物結合，他在酶的活性部位以外的結合部位與酶結合，阻止三元復合體釋放產物。這種抑制傾向于使得酶-底物復合體更穩(wěn)定。加入更多的底物，

22、速率雖然增加，但總比原來無抑制劑小。動力學上表現(xiàn)為km減小，vmax減?。?3.非競爭性抑制：酶可同時與底物及抑制劑結合，引起酶分子構象變化，導致酶活性下降。由于這類物質并不是與底物競爭結合酶的活性中心，所以稱為非競爭性抑制劑。如某些金屬離子（Cu2+、Ag+、Hg2+）以及EDTA等，通常能與酶分子的調控部中的-SH基團作用，改變酶的空間構象，引起非競爭性抑制（抑制劑在活性之外的地方方與酶結合，既能與酶結合，又能與酶-底物復合體結合，二者互不干擾。在動力學上表現(xiàn)為km不變，vmax減?。?c.酶抑制劑的應用舉例: （p168） 實驗室和臨床醫(yī)學上 如乙酰膽堿酯酶與不可逆抑制劑有機磷化合物 四

23、氫葉酸合成酶與可逆抑制劑磺胺藥物 誤服乙二醇（本身無毒，但轉變?yōu)椴菟嵊卸荆?，利用乙醇作為乙醇脫氫酶的競爭性抑制劑第十一章：酶作用機制和酶活性調節(jié)（p172）重點，酶活性的別構調節(jié)（p183）a.酶活性部位：酶分子中直接與底物結合，并催化底物發(fā) 生 反應的部位.酶活性部位的特點：只占酶分子總體相當小的部分,是一個三維實體,活性部位與底物分子經(jīng)誘導契合互補；底物通過較弱的次級鍵與酶結合；位于酶分子表面的一個裂縫內；活性部位具有柔性或可運動性 b. 別構調節(jié)：酶的調節(jié)部位與某些化合物可逆的非共價結合后引起酶構象變化進而改變酶的活性狀態(tài)，稱為別構調節(jié)。別構酶：具有別構調節(jié)作用的酶。效應物：凡能使酶分子

24、發(fā)生別構作用的物質稱為效應物或別構劑。使酶活性增加的效應物稱正效應物，反之為負效應物。同促效應：底物分子本身對別構酶的調節(jié)作用。異促效應：非底物分子的調節(jié)物對別構酶的調節(jié)作用 別構酶的性質、特點：一般是寡聚酶，多個亞基構成，有四級結構,有協(xié)同效應，其S對V的曲線為S形曲線（正協(xié)同）或表觀雙曲線（負協(xié)同），非雙曲線補充： 同工酶是指催化相同的化學反應，但存在多種四級締合形式，并因而在理化性質和免疫性等方面有所差異的一組酶。C.協(xié)同性配體結合的模型（p184）了解第十二章：維生素與輔酶（了解）P196第十三章：核酸通論（p216了解） 第十四章：核酸的結構（重點RNA的一級結構，DNA的高級結構，

25、RNA的高級結構）1. RNA的一級結構mRNA：占細胞中RNA總量的3%-5%，分子量大小不一，不穩(wěn)定，代謝活躍，更新迅速，是合成蛋白質的模板。rRNA：細胞中含量最多的RNA，70%-80%, 核糖體的組成成分。tRNA：約占細胞中RNA總量的15%。約由75-90個核苷酸組成。蛋白質合成中攜帶活化的氨基酸 。tRNA的一級結構特點; tRNA分子具有以下特點分子量25000左右，大約由7090個核苷酸組成。分子中含有較多的修飾成分,3'-末端都具有CpCpAOH 的結構.。mRNA的一級結構特點：真核生物中的mRNA都是單順反子，其5端有帽子（cap）結構，然后依次是5端非翻譯區(qū)

26、、編碼區(qū)、3非翻譯區(qū)、3端為（長約20250）聚腺氨酸（polya）尾巴，分子內還有極少數(shù)的甲基化的堿基。在原核生物中，mRNA為多順反子mRNA。rRNA的一級結構特點: 原核生物核糖體有三類rRNA：5S rRNA，16S rRNA，23S rRNA; 真核細胞核糖體rRNA有四類：5SrRNA，5.8SrRNA，18SrRNA，28SrRNA。許多rRNA的一級結構及由一級結構推導出來的二級結構都已闡明;其功能除作為核糖體骨架外，還分別與mRNA和tRNA作用催化肽鍵形成2. DNA的高級結構DNA的雙螺旋結構特點a.兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞同一個中心軸相互纏繞;兩條鏈均為右手螺旋。

27、b每一單鏈具有 5和 3方向，兩條單鏈反向平行，圍繞同一中心軸，相互纏繞，向 右 盤 旋 (B-form）.堿基(嘌呤和嘧啶堿)在內側，兩條單鏈間按A-T（二個氫鍵）、G-C（三個氫鍵 ）配對連接.磷酸與核糖在外側，通過磷酸二酯鍵連接，以C 3 C 5為正向，雙 螺 旋 中 存 在大溝、小 溝c.螺旋橫截面的直徑約為2 nm，每條鏈相鄰兩個堿基平面之間的距離為0.34nm，每10個核苷酸形成一個螺旋，其螺矩（即螺旋旋轉一圈）高度為3.4 nm。 d. 兩條DNA鏈相互結合以及形成雙螺旋的力是鏈間的堿基對所形成的氫鍵。堿基的相互結合具有嚴格的配對規(guī)律，即腺嘌呤（A）與胸腺嘧啶（T）結合，鳥嘌呤（

28、G）與胞嘧啶（C）結合，這種配對關系，稱為堿基互補。A和T之間形成二個氫鍵，G與C之間形成三個氫鍵。e.堿基在一條鏈上的排列順序不受任何干擾。補充：維持DNA雙螺旋結構的穩(wěn)定性的作用力.氫鍵：兩條多核苷酸鏈間互補堿基對間的氫鍵堿基堆積力：堿基的含N芳香環(huán)間的疏水相互作用，堆積堿基間的范德華力。離子鍵：磷酸基團上的負電荷與介質中的陽離子或陽離子化合物之間所形成的離子鍵（鹽鍵）3. RNA的高級結構RNA是單鏈分子，因此，在RNA分子中，并不遵守堿基種類的數(shù)量比例關系，即分子中的嘌呤堿基總數(shù)不一定等于嘧啶堿基的總數(shù)。RNA分子中，部分區(qū)域也能形成雙螺旋結構，不能形成雙螺旋的部分，則形成突環(huán)。這種結

29、構可以形象地稱為“發(fā)夾型”結構。tRNA的高級結構： 在RNA的雙螺旋結構中，堿基的配對情況不象DNA中嚴格。G 除了可以和C 配對外，也可以和U 配對。G-U 配對形成的氫鍵較弱。不同類型的RNA, 其二級結構有明顯的差異。tRNA中除了常見的堿基外，還存在一些稀有堿基，這類堿基大部分位于突環(huán)部分. tRNA的二級結構都呈三葉草型，由于雙螺旋結構所占的比例很大，其二級結構十分穩(wěn)定。三葉草型二級結構由氨基酸臂或受體臂、二氫尿嘧啶環(huán)（dhu）、反密碼子環(huán)、額外環(huán)或可變環(huán)和胸苷-假嘧啶-胞苷環(huán)等5個部分組成。穩(wěn)定tRNA的構象的主要因素是相鄰堿基之間的疏水堆積作用。（p240）tRNA的三級結構:

30、 在三葉草型二級結構的基礎上，突環(huán)上未配對的堿基由于整個分子的扭曲而配成對，目前已知的tRNA的三級結構均為倒L型.（p241）4. 核酸的紫外吸收（p248）a. 嘌呤堿與嘧啶堿具有芳香共軛體系，使得堿基、核苷、核苷酸和核酸在240-290nm的紫外波段具有一強烈的吸收峰，最大的吸收峰值為260nm附近。b. 用紫外分光光度法鑒定核酸的純度。讀出260nm與280nm處的吸光度即光密度（od）.從A260nm/A280nm的比值即可判斷樣品的純度。c.根據(jù)A260/A280比值判斷核酸樣品的純度:純DNA：A260/A280=1.8純RNA：A260/A280=2.0若含有RNA，則A260/A280會明顯升高,若樣品中含有雜蛋白或苯酚，則A260/A280比值明顯降低A260/A280 1.8 純DNA A260/A280<1.8 DNA含雜質A260/A280=2.0 純RNA A260/A280<2.0 RNA含雜質雙螺旋結構使得堿基對的電子云發(fā)生重疊，減少了對紫外光的吸收。d.低（減）色效應：在天然的雙螺旋DNA分子中，由于堿基之間的致密堆積并藏在核酸分子內側，使其在260nm處的吸收受到抑制，比組成雙螺旋的兩條單鏈D