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文檔簡介
1、BD FACSCalibur流式細胞儀FACS101 Handbook本課程介紹表面抗原流式分析有關(guān)之基礎(chǔ)工作原理。如期望進一步了解流式細胞技術(shù)應(yīng)用,請至本公司網(wǎng)站訂閱FACSinformation電子報.tw/bdb/index.html。如需要本課程手冊,歡迎至本公司網(wǎng)站下載 .tw/bdb/10-5-3-1.html 。如需要免疫熒光染色方法,請至本公司網(wǎng)站下載 .tw/bdb/10-5-4-1.html 。一、BD FACSCalibur基本結(jié)構(gòu)1.1儀器本體:1. 電源開關(guān):在BD FACSCalibur儀器右側(cè)下方,先啟動儀器本體,再打開計算機。2. 光學(xué)系統(tǒng):BD FACSCal
2、ibur 基本配有一支波長488 nm 的氬離子雷射以BD FACSCalibur 基本型為例Ø FSC Diode 只收488 nm波長散射光Ø SSC PMT 只收488 nm波長散射光Ø FL1 PMT 熒光光譜峰值落在綠色范圍(波長515-545 nm)Ø FL2 PMT 熒光光譜峰值落在橙紅色范圍(波長564-606 nm)Ø FL3 PMT 熒光光譜峰值落在深紅色范圍(波長 >650 nm)3. 儀器面板:儀器前方面板的右下方有三個流速把握鍵、及三個功能把握鍵。流速把握:LO: 樣品流速:12 ml /minMED:樣品流速:
3、35 ml /minHI: 樣品流速:60 ml /min功能把握:· RUN:此時上樣管加壓,使細胞懸液從進樣針進入流淌室。(正常顯示綠色;黃色時表示儀器不正常,請檢查是否失壓。)· STANDBY:無樣品或暖機時之正常位置,此時鞘液停止流淌,雷射功率自動降低。· PRIME:去除流淌室中的氣泡,流淌室施以反向壓力,將液流從流淌室沖入樣品管,持續(xù)肯定時間后,以鞘液回注滿流淌室。PRIME 結(jié)束,儀器恢復(fù)STANDBY狀態(tài)。4. 儲液箱抽屜:在主機左下方之儲液箱抽屜??上蚯袄_,內(nèi)含鞘流液筒、廢液筒、鞘液過濾器Sheath Filter,及空氣濾網(wǎng) Air fil
4、ter。請留意氣路減壓閥VENT TOGGLE之位置。· 鞘液筒:位于抽屜左側(cè),容積4升。裝八分滿鞘液筒,儀器可以運行大約 3小時。筒上裝有液面感應(yīng)器,鞘液用完時,儀器軟件上會有顯示。鞘液筒蓋上有金屬環(huán)扣,保證鞘液筒密閉。· 廢液筒:位于抽屜右側(cè),容積4升。筒上裝有液面感應(yīng)器,廢液盛滿時,儀器軟件上會有顯示。留意廢液可能有潛在的生物傳染性。· 鞘液過濾器:0.22mm過濾器,去除鞘液中的雜質(zhì),保證進入流淌室的鞘液是潔凈的。· 氣路減壓閥:沿箭頭方向移動閥門開關(guān),鞘液筒減壓,氣壓恢復(fù)正常。在鞘液筒添加鞘液時,需要減壓。· 空氣過濾網(wǎng):用于過濾冷卻
5、雷射的空氣。5. 上樣品區(qū):上樣品區(qū)是樣本管的上樣位置。它包括三個部分,一個是進樣針 Sample Injection Tube,將樣本輸入流淌室,還有就是支撐架 Tube Support Arm、和液滴存留系統(tǒng) Droplet Containment System。· 進樣針:是一根不銹鋼管,將細胞從樣本針中吸入流淌室。進樣管外有一套管,是液滴保留系統(tǒng)的一部分。· 支撐架:用于支撐樣本管、并負責(zé)啟動液滴存留系統(tǒng)。支撐架有三個位置:位于樣本管之下的中位,樣本管左側(cè)或右側(cè)。液滴存留系統(tǒng):系統(tǒng)由支撐架、真空幫浦和外套管組成。當支撐架位于左側(cè)或右側(cè)位置時,真空幫浦就會啟動,將液體
6、從外管吸入廢液筒內(nèi)。上樣時,須留意將支撐架位于中位,以避開過多樣品被抽吸到廢液筒內(nèi)(當支撐架位于中位,真空幫浦停止工作)。更換樣品時,讓儀器保持RUN的模式,使得進樣針可以反沖;切換到STANDBY模式前,確保液路已沖洗徹底以免碎片沈積到流淌室中。1.2 Macintosh計算機與打印機:預(yù)備您的細胞樣品1. 抱負樣品濃度調(diào)至1-10 X 105 cells/ml?一般試驗只需0.5 ml的樣品。2. 細胞樣品務(wù)必放至BD FALCON 352052 試管中,否則無法上機。3. 上機前務(wù)必去除樣品中之細胞團塊,以防止管路堵塞?可使用附濾網(wǎng)BD FALCON試管 (Cat. No.352235)
7、 或35-55 mm的尼龍篩網(wǎng)。4. 供流式分析的樣品是單細胞懸浮液,而且大部分樣品都需經(jīng)熒光染色。表面抗原熒光染色的方法大致有兩種:直接免疫熒光、間接免疫熒光染色。爭辯生可至本公司網(wǎng)站下載染色方法 .tw/bdb/10-5-4-1.html · 直接免疫熒光染色· Lysed - No - Wash Procedure· Lysed - And - Wash Procedure, SimulTEST & HLA-B27· Peripheral Blood Mononuclear Cell Procedure· Leukemia and
8、 Lymphoma Procedure 1· Leukemia and Lymphoma Procedure 2, B-cell Clonality Assay· 間接免疫熒光染色· 滴定抗體濃度· 常用試劑5. 如因特殊因素?zé)o法下載上述試驗方法,請e-mail:yenchichen.tw或 austin_bdtwn.tw。二、開機、關(guān)機標準操作2.1 FACS Calibur 開機1. 開啟細胞儀電源。2. 開啟其它周邊配備電源,如打印機及MO機。3. 開啟計算機。4. 確認鞘流液筒有八分滿的FACS Flow,的確旋緊 (鞘液筒容量為4L)。5. 將
9、廢液倒掉,并在廢液筒中加入200 ml 家用漂白水 (廢液筒容量為4L)。6. 將減壓閥方向調(diào)在加壓(Pressurize)位置。7. 排解液流管路與過濾器中的氣泡。8. 取下樣品管,執(zhí)行 PRIME 功能兩次。9. 使用1ml PBS,HIGH RUN 兩分鐘。10. 可開頭分析樣品。2.2 FACS Calibur 關(guān)機關(guān)機前必要動作:清洗進樣管和外套管,防止進樣管堵塞、或有染料殘留。1. 將樣品支持架左移,取 2 ml FACSClean(10%Bleach)上樣品,讓儀器的真空系統(tǒng)抽取約 1 ml 的液體。2. 將樣品支持架回正,按 HI RUN,然后讓 FACSClean 清洗管路1
10、0分鐘。3. 按 Standby,取下樣品管,執(zhí)行 PRIME功能兩次。4. 取 2 ml dH2O,重復(fù)上述步驟1-3。5. 留意最終只留約 1 ml dH2O 在試管中。6. 按 STANDBY 五分鐘,使風(fēng)扇冷卻雷射后,關(guān)閉細胞儀(必要動作,以愛護雷射光源。)7. 倒掉廢液,并回填 200 ml漂白水。8. 將減壓閥放在VENT 漏氣位置。將鞘流液筒充填至八分滿。9. 退出軟件“File”à“Quit”(如有對話選項,選擇“Dont save”)。確認退出計算機中全部BD應(yīng)用軟件,全部數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)已儲存?zhèn)浞荨?0. 關(guān)閉計算機?!癝pecial”à“Shutdown”。三
11、、上機分析流程建議首次試機避開進行大量試驗,僅需預(yù)備下列樣品。(1)Negative Control(不加任何抗體)。(2)CD3-FITC(FL1 單染)。(3)CD19-PE(FL2 單染)。(4)CD3-FITC /CD19-PE(FL1/FL2 雙染)。3.1 Calibur 開機1. 先開啟細胞儀本體再打開計算機。 *秘技1:如挨次相反,儀器和計算機之間無法建立正常通訊,無法執(zhí)行“connect to cytometer”。 解決之道,兩者都關(guān)機、然后以正確方式重開。2. 向前拉開儲液箱抽屜,檢查鞘液筒、廢液筒水量,如需充填鞘液,將減壓閥方向調(diào)在VENT位置(箭頭方向)。3. 儀器會
12、對鞘流液筒打氣加壓,請確認筒蓋的確旋緊。 *秘技2:將減壓閥方向調(diào)在加壓(向前)位置。減壓閥如在VENT(箭頭方向)位置,按RUN功能鍵時將顯示橙黃色(表示儀器不正常,請檢查是否失壓),正常為綠色顯示。3.2開啟CellQuest 軟件、編輯試驗文件4. 在蘋果菜單下點擊CELLQuest 啟動軟件。桌面會消滅一Untitled 試驗文件,可點擊試驗文件的右上角的放大鈕,將試驗文件窗口放大。5. 從工具板中點擊散點圖圖示。在試驗文件的空白區(qū)點擊,拖曳對角線至適當大小,然后放開鼠標。消滅散點圖對話方框。6. 在消滅的散點圖對話方框中點擊Plot Source,選擇Acquisition (收取)
13、 ,確認X和Y軸參數(shù)預(yù)設(shè)為FSC-H 1024、SSC-H 1024。在顏色方框中點擊Multicolor Gating(收取樣品時,門內(nèi)細胞將消滅顏色)。點擊OK。此時試驗文件會消滅FSC/SSC散點圖。7. 說明:散點圖(Dotplot),又稱二維散點圖是流式分析最常用圖譜,它可以顯示兩個獨立參數(shù)的相互關(guān)系。在圖中,橫坐標X軸為為熒光1強度的相對值,單位是道數(shù),縱坐標Y軸則通常表示熒光2或光散射強度的相對值。儀器使用者可因應(yīng)試驗需求來修改全部圖譜中顯示之參數(shù)。第一圖X和Y軸參數(shù)分別設(shè)為FSC-H 1024、SSC-H 1024;其次圖X和Y軸參數(shù)分別設(shè)為FL1-H 1024、FL2-H 1
14、024。修改動作為輕擊圖譜上X和Y軸參數(shù),并依需要選擇之(FSC:細胞大小,SSC:細胞折射率,F(xiàn)L1:FITC綠色熒光,F(xiàn)L2:PE橙色熒光,F(xiàn)L3:PerCP紅色熒光)。8. 從屏幕上方Plots菜單中選擇Dot Plot功能,可復(fù)制一個同樣大小的散點圖,在消滅的對話方框內(nèi)選擇X軸:FL1-H 1024,Y軸:FL2-H 1024。點擊OK,F(xiàn)L1/FL2的散點圖消滅。完成后可將重制圖移至原圖右方。9. 在工具板中選擇四象限工具,在FL1/FL2散點圖上拖動Quadrant的中心將它設(shè)定在(x,y)(101,101)處,這些象限將指定陰性/陽性區(qū)域。建立儀器和計算機之間通訊10. 從Acq
15、uire菜單中選擇Connect to Cytometer,此時會消滅Acquisition Control 對話方框。假如無法選擇Connect to Cytometer,參考秘技 #1。假如沒見到Acquisition Control 對話,可到屏幕上方Windows菜單中選擇Show Acquisition Control。儀器設(shè)置文件留意:試驗數(shù)據(jù)質(zhì)量,取決于最適化儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件不能在數(shù)據(jù)收取后再更改,爭辯人員必需在第一次就使用正確的儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件(Instrument settings),含信號器高壓(Detector/ Amps),閾值(Threshold)
16、,熒光補償(Compensation)等儀器條件的組合。一般而言,儀器設(shè)定的挨次為Detector/Amps - Threshold - Compensation。11. 檢查現(xiàn)有儀器條件,從Cytometer菜單中選擇Detectors/Amps。消滅 Detectors/Amps窗口。在Detectors/Amps窗口確認FSC與SSC為LIN(線性放大),其它FL1-3為LOG(對數(shù)放大),將其拖至空白區(qū)。12. 從Cytometer菜單中選擇Threshold,消滅 Threshold 窗口在Threshold 窗口:確認FSC為設(shè)閾參數(shù),初步確認預(yù)設(shè)閾值52。將其拖至空白區(qū)。13.
17、從Cytometer菜單中選擇Compensation,確認全部預(yù)設(shè)數(shù)值皆為零。將其拖至空白區(qū)。3.3 上樣品、設(shè)置儀器14. 使儀器處于High RUN,支撐架左移,上陰性對比管樣品,支撐架回位。確認Acquisition Control 窗口中ý Setup前需打叉或打勾 (即不儲存數(shù)據(jù)),點擊Acquire。 調(diào)整FSC/SSC探測器(電壓)15. 觀看FSC/SSC圖的變化。FSC電壓(Voltage)預(yù)設(shè)為E00,可調(diào)整 Amp Gain 從1.009.99 使主要細胞群得以清楚顯示(如細胞較大,將FSC電壓設(shè)置于E-1;較小細胞,將FSC電壓設(shè)置于E01)。調(diào)整SSC電壓
18、使主要細胞群得以清楚呈現(xiàn)。調(diào)整FSC/SSC圖的原則,在于能得到一獨立離散的細胞族群,該細胞群不與其它族群、細胞碎片有重迭現(xiàn)象。調(diào)整定位后,點擊Acquisition Control 窗口中的Pause。Gating 圈選細胞檢品中,常含有大小不同、性質(zhì)相異的細胞群體。我們常用前方散射與側(cè)方散射的二維位圖,即散射光圖譜(Scatter Plot),來圈選出不同細胞群的范圍,選擇性顯示出有意義的細胞群體,如下圖圈選白血球之淋巴細胞族群。16. 在工具板中選擇多邊形的Region,在FSC/SSC散點圖上劃定淋巴細胞R1 區(qū)域(如下圖)。分析樣品時,區(qū)域內(nèi)細胞應(yīng)會呈現(xiàn)成紅色,可移動或轉(zhuǎn)變外形來圈選
19、有意義的細胞。假如要刪除R1區(qū)域,您可以在工具欄中點選Gates Region list ,以鼠標點選 R1,再按Delete 鍵刪除R1 區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。17. 選取期望Gate的FL1/FL2散點圖,從Plots菜單中選擇Format dot plot。在消滅的對話方框內(nèi),將No Gate 改選 G1=R1。點擊OK。 調(diào)整FL1、FL2的探測器(電壓)18. 點擊Acquisition Control 窗口中的Restart。在Detector/Amps 窗口中調(diào)整FL1、FL2的電壓,使Negative Control細胞群著落在所選直方圖或散點圖之10
20、0-101處。19. 在Threshold 窗口,適當?shù)靥岣逨SC閾值>52,以去除碎片或低階噪音。唯需留意不要切掉主要細胞族群。 20. 點擊Acquisition Control 窗口中的Pause、Abort。移去陰性對比管,關(guān)閉Detector/Amps、Threshold窗口,我們已設(shè)定好有意義細胞群之自體熒光。調(diào)整熒光補償說明:最適化的最終一步是調(diào)整光譜重迭。(如是單色熒光試驗可跳過此步驟)如是2色樣本,必要時需調(diào)整FL2-%FL1,F(xiàn)L1-%FL2(若3色樣本,必要時需調(diào)整FL2-%FL1、FL1-%FL2、FL3-%FL2、FL2-%FL3的補償)。21. High RU
21、N,換上單染CD3-FITC管。點擊Acquisition Control窗口中的Acquire。調(diào)整FL2-%FL1使FITC陽性細胞在FL1/FL2散點圖的右下象限。補償調(diào)整可通過點擊¯來選擇或直接拖動滑標上下移動。調(diào)整完畢,點擊Acquisition Control窗口中的Pause。22. 移去單染CD3,換上單染CD19-PE管。點擊Acquisition Control窗口中的Restart。調(diào)整FL1-%FL2使PE+細胞在FL1/FL2散點圖的左上象限。調(diào)整完畢,點擊Acquisition Control窗口中的Pause。23. 最終以CD3-FITC/
22、CD19-PE雙染樣本上機,點擊Acquisition Control窗口中的Restart,確定三群細胞工整垂直。當您已完成2色熒光之光譜重迭時,點擊Acquisition Control窗口中的Pause、Abort。24. 移去樣本管,換上dH2O管,讓儀器暫且處于Standby狀態(tài)。關(guān)閉Compensation窗口。您已完成2色熒光之最適化。3.4收集試驗數(shù)據(jù)打算儲存細胞總數(shù)25. 預(yù)設(shè)之儲存細胞總數(shù)為10000。如需修改,從Acquire菜單中選擇Acquisition & Storage,并在消滅的窗口功,確認Collection Criteria從10000 of All
23、,再點擊OK。 26. 找個檔案匣預(yù)備儲存數(shù)據(jù)。從Acquire 菜單中選擇Parameter Description,消滅Parameter Description對話方框。點擊Folder,并在隨后消滅之對話方框,選擇Your Folder或新建活頁夾,點擊此對話方框的Select Your Folder。27. 命名即將儲存之文件名:點擊Parameter Description對話方框的File,消滅文件名編輯窗口。在Custom Prefix中:輸入文件名20031231,點擊此對話方框的OK。日期為最常用之文件名系統(tǒng)。28. Optional:如有需要,可選擇或在P1-P5后的空格
24、中輸入相關(guān)參數(shù)名。如P1:Size, P2:Granularity, P3:CD3 FITC。輸入?yún)?shù)名會存入試驗檔案中,顯示在圖譜上。計數(shù)器Counters29. 從Acquire 菜單中選擇Counters. 窗口會顯示樣品分析速率、與總數(shù)進度。收集試驗數(shù)據(jù)30. 你可以開頭收集試驗數(shù)據(jù)了。HIGH RUN,將第一管樣品放到檢測區(qū),在Acquisition Control窗口中,將 ý Setup 改成 ¨ Setup,此時CellQuest會自動顯示 Your Folder:20031231.001為資料文件名。點擊“Acquire” 便可啟動樣品之分析測定與數(shù)據(jù)儲存
25、。當計算機成功地收取足夠數(shù)據(jù),會自動儲存數(shù)據(jù)文件20031231.001,并會以“嘟”聲告知,CellQuest會自動升冪附加檔名成20031231.002。等待下一指示。31. 你可以換上下一管樣品,點擊“Acquire” 啟動樣品之分析測定與數(shù)據(jù)儲存??蛇B續(xù)分析直到全部檢品都分析完畢。3.5試驗數(shù)據(jù)之儲存與備份:32. 不建議長期使用硬盤儲存數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),可考慮以燒光盤(如配有 CD-RW)、口袋硬盤(Flash Drive)來備份大量試驗數(shù)據(jù),以免占用原有硬盤的內(nèi)存,影響數(shù)據(jù)處理速度??蓪浞莺笾當?shù)據(jù),拿到另一蘋果計算機或個人PC進行離機分析。33. 確認全部檔案皆己備份后,以鼠標圈選欲刪除
26、數(shù)據(jù),將其拖拉至Trash筒。退出軟件34. 檢品分析完畢后,記得從屏幕上方 File 指令欄選擇 Save As,儲存試驗文件,以備日后使用,不需每次重新編輯。35. 從屏幕上方 Cytometer 指令欄,選擇Instrument Setting,消滅Instrument Setting窗口。點系print打印此次試驗條件,可貼入試驗筆記留底,再點擊Save以儲存此一試驗的儀器條件,供日后再使用。點系SAVE后會消滅文件保存對話方框,選擇文件名目及文件名(例:Your Folder:/Your Setting1),點擊Save。點擊Done。36. 檢品分析完畢后,用鼠標從屏幕上方 Acq
27、uire 指令欄中,選取Disconnect to Cytometer 以斷絕計算機與儀器間之聯(lián)機。之后如不分析數(shù)據(jù),您可退出軟件“File”à“Quit”(遇有選項永久選擇“Dont save”),進行關(guān)機程序。 管路清洗37. 以2 ml 10 漂白水取代樣品,將樣品架置于左位以外管吸除約1 ml,再將樣品架置于中位 HI RUN 格外鐘。改用 2 ml DI water。重復(fù)上述程序,樣品架上留約 1 ml DI water 。按STANDBY五分鐘。關(guān)主機、關(guān)計算機四、數(shù)據(jù)分析FCS list mode數(shù)據(jù)文件:說明:FCS list mode數(shù)據(jù)文件是流式細胞儀的標準格式檔
28、案(FCS2.0)。該文件含有從流式細胞儀收取的平均10,000個細胞數(shù)的資料,含有46個參數(shù)。一般軟件無法打開list mode數(shù)據(jù)文件,需藉助如CellQuest, WinList, WinMDI, 等Flow 分析軟件,才可開啟、繪圖、并進行分析統(tǒng)計。4.1 開啟一CellQuest試驗文件1. 從屏幕上方File 菜單中選擇New。桌面會消滅一Untitled 試驗文件,可點擊試驗文件的右上角的放大鈕,將試驗文件窗口放大。4.2散點圖之統(tǒng)計分析(雙色)2. 從工具板中點擊散點圖圖示。在試驗文件的空白區(qū)點擊,然后拖動對角線至適當大小。Plot 拖曳完成后可以在右方看到Dot Plot對話
29、框。3. 在Dot Plot方框中,Plot Source應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點擊 Select File 鈕,并用隨后之方框來開啟預(yù)存之 Sample Files,它們的路徑位于Mac HD:BD Applications:CellQuest Folder:Sample Files。連續(xù)雙擊鼠標來打開次名目,找到檔案后,點擊 Open來開啟 NORM001 檔案。X 與 Y 參數(shù)項會消滅默認值FSC-H 256 與 SSC-H 256,在Color方框中點擊Multicolor Gating,確認無誤之后,點擊 OK 便完成了一個 NORM001 的 FSC /SSC散點圖。4. 工
30、具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor 移至FSC/SSC散點圖上,并沿著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點擊兩次可關(guān)閉該區(qū)域。你已完成 R1區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來圈選淋巴細胞。(假如要刪除R1區(qū)域,您可以在工具欄中點選Gates Region list,以鼠標點選 R1,再按Delete 鍵刪除R1 區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)5. 從Plots菜單中選擇Dot Plot可復(fù)制一個同樣大小的散點圖,屏幕上會消滅一 Dot Plot 對話方框。點擊X Parameter 鈕來顯示 NORM001 檔案中全部的參數(shù)項 (FSC, SSC, FL1, FL2) 將 X 參數(shù)
31、項改成FL1-H 256 Gamma-1,Y 參數(shù)項改成FL2-H 256 Gamma-2。從Gate輸入欄中將 NoGate 改成G1= R1。6. 點擊 OK 便完成了一個以 G1 圈選的 FL1/ FL2 散點圖,可將復(fù)制圖移至原圖右方。NORM001 檔案為本組試驗之陰性對比組,我們將以之來界定陰性與陽性之界限。7. 從屏幕左列工具板中,選取 Quadrant Marker 工具,然后在 FL1/ FL2 散點圖中心處點擊并拖曳至定點,一般而言是緊挨著陰性細胞聚落。8. FL1/ FL2 二維散點圖現(xiàn)在被區(qū)隔出四個象限,欲計算各象線中細胞的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),從屏幕上方Stats菜單中選擇Qua
32、drant Stats??梢缘玫皆搱D之四象限統(tǒng)計結(jié)果。UL:左上象限,UR:右上象限,LL:左下象限,LR:右下象限打印報告、輸出統(tǒng)計數(shù)值9. 從屏幕上方File菜單中選擇Print One,可以打印工作中試驗文件。10. 點選四象限統(tǒng)計表,從屏幕上方File菜單中選擇Export Statistics可輸出統(tǒng)計數(shù)值至Excel檔案。在消滅方框中命名檔案,并打算欲存放檔案匣,點擊Save。4.3 開啟其它List Mode Data11. 如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標以拖曳方式選取全部圖表 (文件中全部圖譜的四角會消滅黑色方塊,表示被選擇上) ,接著從Plots菜單選擇Nex
33、t Data File,軟件會自動以新檔案來替換現(xiàn)有檔案,您只要確認圈選范圍、與 Quadrant Marker 的位置是否恰當,即可打印報告、或輸出統(tǒng)計數(shù)值。12. 對于存在不同檔案匣之系列檔案,可用鼠標以拖曳方式選取全部圖表 (文件中全部圖譜的四角會消滅黑色方塊,表示被選擇上) ,接著從Plots菜單選擇Change Data Files,并在隨后消滅之對話方框,選擇所在新名目與欲分析檔案。點擊OPEN。可調(diào)整圈選區(qū)域,Quadrant Marker陰陽界限,軟件會重新計算、統(tǒng)計報告。13. 常規(guī)使用之試驗文件 (內(nèi)含散點圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計報告) ,我們建議您將它另存新檔
34、File Save As,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。4.3直方圖之統(tǒng)計分析(單色)1. 從屏幕上方File 菜單中選擇New。桌面會消滅一Untitled 試驗文件,可點擊試驗文件的右上角的放大鈕,將試驗文件窗口放大。2. 從工具板中點擊散點圖圖示。在試驗文件的空白區(qū)點擊,然后拖曳對角線至適當大小。Plot 拖曳完成后可以在右方看到Dot Plot對話框。3. 在Dot Plot方框中,Plot Source應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點擊 Select File 鈕,并用隨后之方框來開啟預(yù)存之 Sample Files,它們的路徑位于Mac HD:BD Applications:Ce
35、llQuest Folder:Sample Files。連續(xù)雙擊鼠標來打開次名目,找到檔案后,點擊 Open來開啟 NORM001 檔案。X 與 Y 參數(shù)項會消滅默認值FSC-H 256 與 SSC-H 256,在Color方框中點擊Multicolor Gating,確認無誤之后,點擊 OK 便完成了一個 NORM001 的 FSC /SSC散點圖。4. 工具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor 移至FSC/SSC散點圖上,并沿著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點擊兩次可關(guān)閉該區(qū)域。你已完成 R1區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來圈選淋巴細胞。(假如要刪除R1區(qū)域,您可以在工具欄中點選Gates Re
36、gion list,以鼠標點選 R1,再按Delete 鍵刪除R1 區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)5. 從Plots菜單中選擇Histogram,屏幕上會消滅一 Histogram 對話方框。點擊 Select File 鈕,再點擊 Open來開啟 NORM001 檔案。說明:直方圖(Histogram)表明一個參數(shù)與細胞數(shù)量之間的關(guān)系,在圖中,橫坐標X軸為熒光或光散射強度的相對值,單位是道數(shù)(channel number),縱坐標Y軸則通常表示細胞消滅的頻率,即相對細胞數(shù)。6. 點擊 Parameter 鈕來顯示 NORM001 檔案中全部的參數(shù)項,將參數(shù)項改成FL2-H
37、 256 Gamma-2。從Gate輸入欄中將 No Gate 改成G1= R1,點擊 OK 便完成了一個以G1圈選的 FL2直方圖,圖形的 X 軸為橙黃色熒光強度,Y 軸為細胞頻率,NORM001 檔案為本組試驗之陰性對比組,我們將以之來界定陰性與陽性之界限。7. 從屏幕左列工具板中,選取 Histogram Marker 工具,然后在圖的左緣處點擊并拖曳至定點,一般而言是陰性信號的右緣。放開鼠標后即完成Marker 1(M1)。重復(fù)前述步驟以增畫另一Marker,一般而言 M2 始自 M1 的右緣,最終圖的右界。8. FL2 直方圖現(xiàn)在被區(qū)隔出兩個區(qū)域,欲計算各區(qū)域中細胞的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),可從
38、Stats 指令欄中選擇 Histogram Stats。打印報告、輸出統(tǒng)計數(shù)值9. 從屏幕上方File菜單中選擇Print One,可以打印工作中試驗文件。10. 點選四象限統(tǒng)計表,從屏幕上方File菜單中選擇Export Statistics可輸出統(tǒng)計數(shù)值至Excel檔案。在消滅方框中命名檔案,并打算欲存放檔案匣,點擊Save。4.3 開啟其它List Mode Data11. 如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標以拖曳方式選取全部圖表 (文件中全部圖譜的四角會消滅黑色方塊,表示被選擇上) ,接著從Plots菜單選擇Next Data File,軟件會自動以新檔案來替換現(xiàn)有檔案,
39、您只要確認圈選范圍、與 Quadrant Marker 的位置是否恰當,即可打印報告、或輸出統(tǒng)計數(shù)值。12. 對于存在不同檔案匣之系列檔案,可用鼠標以拖曳方式選取全部圖表 (文件中全部圖譜的四角會消滅黑色方塊,表示被選擇上) ,接著從Plots菜單選擇Change Data Files,并在隨后消滅之對話方框,選擇所在新名目與欲分析檔案。點擊OPEN??烧{(diào)整圈選區(qū)域,Markers界限,軟件會重新計算、統(tǒng)計報告。13. 常規(guī)使用之試驗文件 (內(nèi)含散點圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計報告) ,我們建議您將它另存新檔 File Save As,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。五、錯誤信號、疑難
40、排解5.1 儀器狀態(tài)(Status): 在CELLQuest菜單位于Cytometer菜單中。用來在收取的任何時候查看流式細胞儀的運行狀態(tài),以利解決儀器運行中消滅的問題。狀態(tài):顯示儀器運行模式Not Ready:激光器正在預(yù)熱、鞘液桶空、廢液桶滿。Ready:樣本管放置在進樣區(qū),且支撐臂位于中位,樣本管加壓,儀器在RUN狀態(tài)。Standby:儀器在Standby 狀態(tài)、或儀器在Run 狀態(tài)而無樣本管在進樣區(qū)上、或支撐架位于側(cè)位、或樣本管未完全加壓。Standby時儀器的雷射電源降低。5.2 常見故障排解程序5.2.1 樣品試管上不去Ø 誤用不適合的試管。(請用BD Falcon 35
41、2052)Ø 試管支持架需調(diào)整。旋轉(zhuǎn)調(diào)整試管支持架(順時鐘向下、逆時鐘向上)。Ø Bal Seal 磨損。(汰換 Bal seal)5.2.2 儀器處于N0T READY狀況檢查以下狀況:Ø 鞘液筒中的鞘液是否用完。Ø 廢液筒中的廢液是否已裝滿。Ø 開機需要5分鐘時間預(yù)熱。Ø 鞘液筒的液面檢測器連接是否松動、或未連接。5.2.3 儀器處于STANDBY狀況(儀器失壓)假如儀器未加壓,上樣管放好后,雖然把握面板處于RUN模式,但儀器仍未能達到READY狀況,此時儀器仍處于STANDBY狀況。這可能是由于鞘液筒蓋漏氣、壓力閥未加壓,樣本管
42、不能被加壓等緣由造成的壓力問題。此時,樣本不能良好地進入流淌室,無法檢測。此時,檢查以下狀況:Ø 壓力閥未加壓。Ø 鞘液筒是否漏氣(蓋緊鞘液筒蓋)。Ø 樣本管是否有破損。Ø 上樣針上的Bal seal是否己磨損。Ø 鞘液筒上的藍色接頭是否連接好。5.2.4 儀器訊號噪聲過高鞘液過濾器中有氣泡,儀器記錄了氣泡產(chǎn)生的信號,造成了噪聲數(shù)據(jù)的干擾。氣泡還可以轉(zhuǎn)變樣本流,造成檢測結(jié)果不抱負;此時,儀器需要做PRIME,排解液路中的氣泡干擾。假如鞘液筒吸干了,應(yīng)當重新裝滿鞘液,然后先取下樣品管進行5-10次PRIME,再換上3ml dH2O上樣管HI RU
43、N 30分鐘,待鞘液流中的氣泡排解之后,再進行樣本測定。5.2.5 計算機屏幕上見不到細胞顯示檢查以下狀況:Ø 假如儀器始終處于STANDBY狀態(tài),則檢查System Status。Ø 假如STATUS窗日顯示READY,則檢查樣本管中細胞濃度是否夠,上樣前是否混勻了。Ø 檢查試驗的Instrument Settings是否正確。Ø 檢查閾值是否設(shè)置過高,導(dǎo)致無法檢測目標細胞群。Ø 檢查CELLQuest軟件Cytometer名目下的Status窗口,是否己被更新。假如未更新,說明儀器與計算機之間的通訊發(fā)生了故障,此時,應(yīng)關(guān)閉計算機和FACSC
44、alibur,重新打開儀器,連續(xù)試驗。Ø PRIME儀器液流,去除流淌室中可能存在的氣泡。若流淌室中存在氣泡,可能使樣本流的位置偏離激光束,導(dǎo)致無細胞信號。5.2.6 加樣針有鞘液反流檢查以下狀況:Ø 檢查上樣針外管是否安好,可以將外管旋下,向上推動,重新擰緊。Ø 更換上樣針上部的O型膠環(huán)。Ø 檢查液流保存系統(tǒng)的真空幫浦是否工作。假如樣本管支撐架位于旁位時,聽不到真空幫浦的工作聲音,可能是真空幫浦停了,關(guān)閉FACSCalibur,再啟動;移開支撐架時,假如馬達仍舊不動,請致電BD客戶服務(wù)部門尋求掛念。試驗文件1:2 Color ACQ試驗文件2:2 Color ANA表一、常用熒光染劑測量參數(shù)熒光染劑吸光波長(nm)熒光波長(nm)標示抗體用染劑Fluorescein, FITC490520Phycoeryth
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