PCR_RFLP技術(shù)分析沼氣池厭氧活性污泥細菌的多樣性_蔣建林

1、 第4期 蔣建林等 : PCR - RF LP 技術(shù)分析沼氣池厭氧活性污泥細菌的多樣 性 377 16S r DNA 克隆是互 養(yǎng)型微生 物, 都屬 于 Del t a - p rot eobact er ia ( Sy ntr op haceae , 相近 的種 分別是 Sy nt rop hus ( G W 18 和 Sm it hell a ( GW26、 GW31 。 Sy ntr op hus 主要是發(fā)酵分解芳香族化合物的 11 細菌, 如將苯甲酸酯分解為乙酸、 CO2 、 H 2 。 Smi thel l a 與丙酸鹽的氧化有關(guān) , 丙酸鹽在沼氣池中 積累過多時就會導(dǎo)致厭氧發(fā)酵失敗

2、 12 。 Chlor of l ex i 是一類廣泛分布在環(huán)境厭氧生物反應(yīng)器中的細 菌, 當前將其劃分為五個綱 13 。該文庫所得到 5 個克隆 ( GW29 , 屬于亞門 。這類成員是化能有 機營養(yǎng)型 , 極少部分是可培養(yǎng)的, 可利用不同的碳水化合物和氨基酸為底物進行生長 14 。在我們所 構(gòu)建的克隆文庫中, A ct inobacter i a 有 10 個克隆, 它們能廣泛利用有機物降解的有機酸 15 。 利用 P CR - RFL P 指紋圖譜、克隆文庫和測序等方法 , 比較全面、準確地了解與沼氣發(fā)酵相關(guān)的 細菌群落結(jié)構(gòu)。通過研究表明 , 沼氣池厭氧活性污泥細菌的群落結(jié)構(gòu)較復(fù)雜, 多

3、樣性較高。在此基礎(chǔ) 上, 我們還將進一步對沼氣池中其他微生物類群 ( 如古細菌、真菌 進行分析 , 研究各類微生物間的 相互關(guān)系 , 找出最優(yōu)產(chǎn)氣時的群落比例 , 以優(yōu)化沼氣發(fā)酵的效率。 參考文獻: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Z ENG LER K , RICH N OW H H , ROSSEL L - M O RA R , et al. M ethane for matio n fr om lo ng - cha in alkanes by anaero bic micro org anisms J . Natur e, 1999, 401 ( 6750 : 266

4、- 269. NA RIH IRO T , SEK IGU CH I Y . M icro bial co mmunities in anaero bic digestion pro cesses fo r waste and w astewat er treatment: a micr obiolog ical update J . Curr Opin Biotechno l, 2007, 18 ( 3 : 273 - 278. PACE N R. A molecular view of micro bial div ersity and the biosphere J . Science,

5、 1997, 276 ( 5313 : 734 - 740. VON WINT ZINGERODE F, G BEL U B, STACK EBRA NDT E . Determination of microbial diversity in env ironmental samples: pitfalls of PCR - based rRN A analysis J . F EM S M icrobiol Rev , 1997, 21 ( 3 : 213 - 29. H U G ENH OL T Z P , GO EBEL B M , P A CE N R. Im pact of cul

6、tur e - independent studies on the emer ging phylog enetic v iew of bact erial diversit y J . J Bacter iol, 1998, 180 ( 18 : 4765 - 4774. 薩姆 布魯克 J, 拉塞爾 D W . 分子克隆實驗指南 M . 北京 : 科學(xué)出版 社 , 2002: 1595. Z HO U J, BR U NS M A, T I EDJE J M . DN A r eco ver y from soils of div erse co mpo sitio n J . A ppl

7、Envir M icro biol, 1996, 62 ( 2 : 316 - 22. HI LL T C J, W A LSH K A , HA RR IS J A, et al. U sing eco lo gical div ersity measures wit h bacter ial co mmunities J . F EM S M icro biol Eco l, 2003, 43 ( 1 : 1 - 11. H U RT R A, QI U X, WU L, et al. Simultaneous r ecover y of RN A and DN A fr om so il

8、s and sediments J . Appl Envir M icr obiol, 2001, 67 ( 10 : 4495 -4503. CHOU ARI R, LE PASLIER D, DA EGELEN P, et al. Novel predominant archaeal and bacter ial gr oups r evealed by molecular analysis of an anaerobic sludge digester J . Environ M icrobiol, 2005, 7 ( 8 : 1104 - 1115. L EV N L , ERIK S

9、SO N A R, SCH N R ER A . Effect of process temperatur e o n bacter ial and ar chaeal co mmunities in t wo methanog enic bio reactor s treating org anic household w aste J . FEM S M icr obiol Eco l, 12 13 2007, 59 ( 3 : 683 693. AR IESY A DY H D , IT O T , YO SHI GU CHI K , et a l. Phylog enetic and

10、functional diver sity of pro pionate o x idizing bacter ia in an anaer obic digester sludg e J . Appl M icr obio l Biotechno l, 2007, 75 ( 3 : 673 - 683. HU G EN HO LT Z P, ST ACK EBRA N DT E. Reclassification of sphaero bacter thermo philus fro m the subclass sphaerobacteridae in the phy lum sct in

11、obacter ia to the class sher momicr obia ( emended descr iption in the phy lum shloro flex i ( emended descriptio n J . Int J Sy st Evol M icr obiol, 2004, 54 ( 6 : 2049 2051. 14 Y A M A DA T , SEK IGU CH I Y , IM A CH I H, et al. Div ersity , localization, and phy siolog ical pro pert ies o f f ilamentous micro bes belong ing to Chlor of lex i subphylum I in meso philic and t her mophilic methano genic sludg e g r anules J . A ppl Env iro n M icrobio l, 2005, 71 ( 11 : 7493 - 7503. 15 V O N W IN T ZIN G ER ODE F, G OBEL U B, SID DIQ U I RA , et al. Salana multiv or ans g en. no v.