iTRAQTMT高通量蛋白質(zhì)組學(xué)ppt課件

1、iTRAQ/TMT高通量蛋白質(zhì)組學(xué)高通量蛋白質(zhì)組學(xué)主要內(nèi)容主要內(nèi)容一、一、高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究背景高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究背景三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹2四、四、應(yīng)用范圍及案例應(yīng)用范圍及案例3一、一、高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究背景高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究背景蛋白質(zhì)組(Proteome)是在宏觀的層面上細(xì)胞、組織或機(jī)體全部蛋白質(zhì)的存在及其活動方式。在細(xì)胞、組織、器官乃至生物體整體層面上分析蛋白質(zhì)組的特性，是研究蛋白質(zhì)作用模式、功能機(jī)理、調(diào)節(jié)控制以及相互作用網(wǎng)絡(luò)的主要前提。在“后基因組時代”，隨著人類蛋白質(zhì)草圖的構(gòu)建完成，高通量蛋白質(zhì)組

2、學(xué)分析成為生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和應(yīng)用開發(fā)的重要前沿和突破口，從而引領(lǐng)進(jìn)入“蛋白質(zhì)組學(xué)時代”。高通量定量蛋白質(zhì)組分析對于揭示各種生物學(xué)現(xiàn)象和疾病發(fā)生、發(fā)展機(jī)理，以及蛋白質(zhì)生物標(biāo)記物的鑒定、蛋白質(zhì)藥物靶點(diǎn)的篩選都有重大意義。4二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹5二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹6二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹7二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹 iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)是由AB Sciex公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù) TMT(Tandem Mass

3、 Tags)是由Thermo公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)8二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹9二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹實(shí)驗(yàn)流程實(shí)驗(yàn)流程10二、二、iTRAQ/TMT技術(shù)的介紹技術(shù)的介紹 一次實(shí)驗(yàn)同時對多達(dá)210個樣本進(jìn)行定量分析 體外標(biāo)記， 可標(biāo)記各種動物組織、植物組織、微生物、體液、細(xì)胞等樣本 重復(fù)性好，靈敏度高，蛋白覆蓋范圍廣 標(biāo)記效率高達(dá)97% 以上，不增加樣品的復(fù)雜程度 一次實(shí)驗(yàn)可鑒定大于4000種蛋白，高通量的數(shù)據(jù)有利于后續(xù)系統(tǒng)生物學(xué)分析技術(shù)優(yōu)勢技術(shù)優(yōu)勢生物學(xué)重復(fù)和技術(shù)重復(fù)生物學(xué)重復(fù)和技術(shù)重復(fù) 三次生物學(xué)重復(fù)或三次技術(shù)重復(fù)11景杰的儀器平臺景杰的儀

4、器平臺Q ExactiveQ Exactive PlusOrbitrap Fusion12三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析數(shù)據(jù)處理數(shù)據(jù)處理需要完整的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)處理軟件為Mascot控制FDR20定量差異倍數(shù): 1.2, 1.5, 2.0; P0.0513三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析14三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析分類統(tǒng)計分類統(tǒng)計15三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析功能富集（包括功能富集（包括GO、KEGG pathway、protein domain等）等）16三、數(shù)據(jù)處理和生物信息

5、學(xué)分析三、數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué)分析功能聚類功能聚類17四、應(yīng)用范圍及案例四、應(yīng)用范圍及案例藥物應(yīng)答、脅迫處理、基因敲除下蛋白表達(dá)譜分析疾病生物標(biāo)志物與藥物作用下靶點(diǎn)高通量篩選蛋白作用機(jī)制研究與特殊功能蛋白質(zhì)篩選植物、微生物脅迫與逆境生理研究各物種的蛋白質(zhì)組草圖構(gòu)建18發(fā)表文章發(fā)表文章四、應(yīng)用范圍及案例四、應(yīng)用范圍及案例1、Cappellesso R, et al. (2015) Lumican is overexpressed in lung adenocarcinoma pleural effusions. PLoS One. 10(5): e0126458.2、Munir RI, et a

6、l. (2015) Quantitative proteomic analysis of the cellulolytic system of Clostridium termitidis CT1112 reveals distinct protein expression profiles upon growth on -cellulose and cellobiose. J Proteomics. S1874-3919(15)00207-9.3、Sahu A, et al. (2014) Host response profile of human brain proteome in toxoplasma encephalitis co-infected with HIV. Clin Proteomics. 11(1):39.4、Marianowski P, et al. (2013) Proteomic analysis of eutopic and ectopic endometriotic tissues based on isobaric peptide tags for relative and abso