文獻(xiàn)檢索第四課Pubmed

1、外文信息資源檢索-PUBMED溫州醫(yī)科大學(xué)圖書館 林薇 初識(shí)初識(shí)PubMedPubMed PubMedPubMed基本檢索基本檢索 PubMedPubMed高級(jí)檢索高級(jí)檢索 PubMedPubMed主題詞檢索主題詞檢索 PubMedPubMed期刊檢索期刊檢索 PubMedPubMed檢索結(jié)果處理檢索結(jié)果處理Contents標(biāo)引質(zhì)量高標(biāo)引質(zhì)量高更新速度快更新速度快信息量大信息量大使用方便使用方便初識(shí)初識(shí) PubMedNIH、NLM、NCBI與與pubmed NIH(National Institute of Health)：美國美國國立衛(wèi)生研究院國立衛(wèi)生研究院 NLM(Natioanl Lib

2、rary of Medicine)：美美國國立醫(yī)學(xué)圖書館國國立醫(yī)學(xué)圖書館 NCBI(National Center for Biotechnology Information) ：美國生美國生物技術(shù)信息中心物技術(shù)信息中心/pubmed//美國國立衛(wèi)生研究院美國國立衛(wèi)生研究院/美國國立醫(yī)學(xué)圖書館/國家生物技術(shù)信息中心Entrez資源整合系統(tǒng)NCBI資源整合系統(tǒng)，基于Web界面的綜合生物

3、信息數(shù)據(jù)庫，可實(shí)現(xiàn)跨庫檢索，包括(1) GenBank和Nucletide(2) Genoma(3) OMIM(4) Protein(5) Structure(6) Pubmed(7) PMC初識(shí)Pubmed一、Pubmed檢索系統(tǒng)（一）Pubmed收藏范圍： （P46）(1) Medline:標(biāo)注為Pubmed-indexed for Medline(2) OldMedline:標(biāo)注為Pubmed-OldMedline(3) In Progress Citations:標(biāo)注為Pubmed-in Process(4) Publisher Supplied Citation:標(biāo)注為Pubmed-

4、as supplied by PublisherPubmed基本檢索一、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索 基本檢索基本檢索Pubmed基本檢索一、 Pubmed的檢索規(guī)則1. 邏輯運(yùn)算符: AND OR NOT如：aspirin AND diabetes 將檢索出同時(shí)包含阿司匹林和糖尿病兩個(gè)檢索詞的文獻(xiàn)。如：hypertension therapy NOT nifedipine 將檢索關(guān)于高血壓治療但不含硝苯地平的文獻(xiàn) Pubmed基本檢索一、 Pubmed的檢索規(guī)則2.詞語自動(dòng)轉(zhuǎn)換詞語自動(dòng)轉(zhuǎn)換：自然語言轉(zhuǎn)換 Mesh轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表、著者索引對(duì)常用醫(yī)學(xué)名詞進(jìn)行自動(dòng)在M

5、eSH轉(zhuǎn)換表 、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表、著者索引及所有記錄字段中轉(zhuǎn)換匹配。 如： diabetes mellitus （糖尿?。?轉(zhuǎn)換為 diabetes mellitusMeSH Terms OR (diabetesAll Fields AND mellitusAll Fields) OR diabetes mellitusAll FieldsVS diabetesPubmed基本檢索一、 Pubmed的檢索規(guī)則3.截詞檢索功能截詞符：”*”作為通配符進(jìn)行截詞檢索。 例如：bacter* （系統(tǒng)會(huì)找到前一部分是bacter的單詞， 如：bacteria、bacterium等）4.短語精確檢索用雙

6、引號(hào)來強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語檢索。 例如：“oxygen free radicals” （不再自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配和 擴(kuò)展檢索）Pubmed基本檢索一、 Pubmed的檢索規(guī)則5.著者檢索 姓前名后，姓用全稱，名用首字母。全稱?？s寫。 Smith SR6.字段限定檢索 P47不同字段 作者AU 語種LA 7.期刊檢索基本檢索習(xí)題習(xí)題1： 基本檢索：肺癌和吸煙關(guān)系的文獻(xiàn) lung cancer， smoke ，smoking， smoked（用截詞符*）Pubmed高級(jí)檢索1. 檢索構(gòu)建器 search builder2. 檢索歷史 高級(jí)檢索高級(jí)檢索Pubmed高級(jí)檢索Advanced Search高級(jí)檢索習(xí)

7、題1. 檢索作者姓為Black，且標(biāo)題中有Hypertension的文獻(xiàn)（習(xí)題3） 2. 檢索題目或摘要中有中醫(yī)Chinese Traditional Medicine 和藥理學(xué)pharmacology 的中文文獻(xiàn)Pubmed主題詞檢索二、Pubmed檢索系統(tǒng)（四）Pubmed主題詞檢索主題詞概念與優(yōu)勢：統(tǒng)一概念，可擴(kuò)展檢索方法例：欲查腎衰竭（renal failure）飲食療法(diet therapy) 的相關(guān)文獻(xiàn)？Mesh SearchPubmed主題詞檢索舉例1. 欲查腎衰竭（renal failure）飲食療法(diet therapy) 的相關(guān)文獻(xiàn)？注意：主題檢索優(yōu)缺點(diǎn)Subhea

8、dings款目詞款目詞樹狀詞表樹狀詞表檢索檢索檢索結(jié)果檢索結(jié)果Pubmed主題詞檢索舉例2. 主題數(shù)據(jù)庫（Mesh Database）檢索：艾滋?。ˋIDS）預(yù)防和控制（Prevention and Control）（習(xí)題4）Pubmed期刊檢索期刊數(shù)據(jù)庫檢索通過輸入刊名、縮寫名、ISSN等,瀏覽期刊文獻(xiàn)提供電子原文的超鏈鍵兩個(gè)方面 檢索該期刊被Pubmed收錄的文獻(xiàn) 檢索該期刊的信息 舉例：the new england journal of medicinePubmed期刊檢索 期刊數(shù)據(jù)期刊數(shù)據(jù)庫庫期刊檢索習(xí)題習(xí)題5：期刊數(shù)據(jù)庫（Journals Database）檢索： PubMed中收

9、錄關(guān)于視力測定(Optometry)的期刊有哪些？Pubmed檢索結(jié)果檢索結(jié)果的顯示、評(píng)價(jià)、分析與管理1. 結(jié)果顯示：2. 檢索結(jié)果的保存及輸出3. 檢索結(jié)果的記錄顯示4. 檢索結(jié)果的限定和過濾檢索結(jié)果檢索結(jié)果顯示方式顯示方式保存方式保存方式詳細(xì)顯示詳細(xì)顯示結(jié)果限定結(jié)果限定作業(yè)習(xí)題習(xí)題2：檢索2007年以來2歲（即出生至23個(gè)月）小兒哮喘的綜述文獻(xiàn)（asthma)習(xí)題6：找出腎性高血壓（renal hypertension）的主題詞，以及其上位主題詞和下位主題詞。第二節(jié) Pubmed與NCBI三、其他工具和鏈接（一）My NCBI個(gè)性化功能1. 保存檢索策略及E-mail發(fā)送功能2. 保存檢索結(jié)果3. 過濾檢索結(jié)果（二）Linkout：全文鏈接（三）批量引文匹配器（四）臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)庫Pubmed與GopubmedGopubmed知識(shí)挖掘分析工具1. Gopubmed概述2. Gopubmed的分類統(tǒng)計(jì)功能(1) 主題分布(2) 作者分布(3) 文獻(xiàn)來源分布(4) 年度分布3. Gopubmed與SCI信息分析功能比較Gopubmed是一種Pubmed檢索工具，是對(duì)于Pubmed資源的另一種組合檢索方式，它比Pubmed的優(yōu)點(diǎn)集中在于對(duì)于某一方面的研究我們能夠直觀得知研究時(shí)間、研究者、地域、研究過程、研究動(dòng)態(tài)和