蛋白質(zhì)組學(xué)及其研究方法(1)

1、蛋白質(zhì)組學(xué)及其研究方法2009年11月6日湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 蛋白質(zhì)組蛋白質(zhì)組 澳大利亞學(xué)者澳大利亞學(xué)者Williams和和Wilkins于于19941994年首先提出年首先提出protein + genome = proteome 一個(gè)基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)一個(gè)基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì) 一個(gè)細(xì)胞或一個(gè)機(jī)體的基因所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)一個(gè)細(xì)胞或一個(gè)機(jī)體的基因所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)組是：蛋白質(zhì)組是： 對(duì)應(yīng)于基因組的所有蛋白質(zhì)構(gòu)成的整體，不是局限對(duì)應(yīng)于基因組的所有蛋白質(zhì)構(gòu)成的整體，不是局限于一個(gè)或幾個(gè)蛋白質(zhì)。于一個(gè)或幾個(gè)蛋白質(zhì)。 同一基因組在不同細(xì)胞、不同組織中的表達(dá)情況各同一基因組在不同細(xì)胞、不同組織

2、中的表達(dá)情況各不相同不相同 。 在空間和時(shí)間上動(dòng)態(tài)變化著的整體。在空間和時(shí)間上動(dòng)態(tài)變化著的整體。蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué) 旨在闡明生物體全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式與功能模式旨在闡明生物體全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式與功能模式 從整體的角度分析、鑒定細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)從整體的角度分析、鑒定細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、表達(dá)水平與修飾狀態(tài)的組成、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、表達(dá)水平與修飾狀態(tài), ,了解了解蛋白質(zhì)之間、蛋白質(zhì)與大分子之間的相互作用與蛋白質(zhì)之間、蛋白質(zhì)與大分子之間的相互作用與聯(lián)系聯(lián)系, ,揭示蛋白質(zhì)的功能與細(xì)胞生命活動(dòng)的規(guī)律揭示蛋白質(zhì)的功能與細(xì)胞生命活動(dòng)的規(guī)律 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究?jī)?nèi)容主要有兩個(gè)方面：蛋白質(zhì)

3、組學(xué)的研究?jī)?nèi)容主要有兩個(gè)方面： 結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)和和功能蛋白質(zhì)組學(xué)功能蛋白質(zhì)組學(xué) 結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)(Structural proteomics)主要是蛋主要是蛋白質(zhì)表達(dá)模式的研究，包括蛋白質(zhì)氨基酸序列分白質(zhì)表達(dá)模式的研究，包括蛋白質(zhì)氨基酸序列分析及空間結(jié)構(gòu)的解析、種類分析及數(shù)量確定；析及空間結(jié)構(gòu)的解析、種類分析及數(shù)量確定； 功能蛋白質(zhì)組學(xué)功能蛋白質(zhì)組學(xué)(functional proteomics)主要是蛋主要是蛋白質(zhì)功能模式的研究，白質(zhì)功能模式的研究， 包括蛋白質(zhì)的功能及蛋白包括蛋白質(zhì)的功能及蛋白質(zhì)間的相互作用。質(zhì)間的相互作用。蛋白質(zhì)的各級(jí)結(jié)構(gòu)0.50nm0.54nm氫

4、鍵-碳原子側(cè)鏈反平行俯視側(cè)視 所以，蛋白質(zhì)組學(xué)研究是對(duì)不同時(shí)間和空間所以，蛋白質(zhì)組學(xué)研究是對(duì)不同時(shí)間和空間發(fā)揮發(fā)揮功能的特定蛋白質(zhì)功能的特定蛋白質(zhì)群體的研究群體的研究, , 從蛋白質(zhì)水平上從蛋白質(zhì)水平上探索蛋白質(zhì)探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機(jī)理、調(diào)節(jié)控制作用模式、功能機(jī)理、調(diào)節(jié)控制以及以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)相互作用蛋白質(zhì)群體內(nèi)相互作用, , 為臨床診斷、病理研究、為臨床診斷、病理研究、藥物篩選、新藥開發(fā)、新陳代謝途徑研究等提供藥物篩選、新藥開發(fā)、新陳代謝途徑研究等提供理論依據(jù)和基礎(chǔ)理論依據(jù)和基礎(chǔ). . 從從mRNA mRNA 表達(dá)水平并不能預(yù)測(cè)蛋白表達(dá)水平。表達(dá)水平并不能預(yù)測(cè)蛋白表達(dá)水平。用基用基因表達(dá)

5、連續(xù)分析法因表達(dá)連續(xù)分析法( SAGE) ( SAGE) 研究對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期啤酒研究對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期啤酒酵母的酵母的80 80 個(gè)基因，結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)翻譯和轉(zhuǎn)錄豐度個(gè)基因，結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)翻譯和轉(zhuǎn)錄豐度有明顯相關(guān)；對(duì)某些基因，相同的有明顯相關(guān)；對(duì)某些基因，相同的mRNA mRNA 豐度翻譯豐度翻譯成蛋白的量的差異可達(dá)成蛋白的量的差異可達(dá)50 50 倍；而相等的蛋白量可倍；而相等的蛋白量可由豐度相差由豐度相差40 40 倍的倍的mRNA mRNA 轉(zhuǎn)錄而來。這說明轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄而來。這說明轉(zhuǎn)錄和翻譯水平對(duì)蛋白的含量有幾乎相同的重要性。和翻譯水平對(duì)蛋白的含量有幾乎相同的重要性。 蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)修飾和加工并非必須來自基因序

6、列。蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)修飾和加工并非必須來自基因序列。蛋白質(zhì)在翻譯后可有多種調(diào)節(jié)方式，如糖基化、蛋白質(zhì)在翻譯后可有多種調(diào)節(jié)方式，如糖基化、磷酸化、異戊二烯化、?；饔玫?。此外，許多磷酸化、異戊二烯化、?；饔玫取４送?，許多蛋白質(zhì)只有與其它分子結(jié)合后才有功能，這種修蛋白質(zhì)只有與其它分子結(jié)合后才有功能，這種修飾是動(dòng)態(tài)的、可逆的。飾是動(dòng)態(tài)的、可逆的。 蛋白質(zhì)組動(dòng)態(tài)地反映生物系統(tǒng)所處的狀態(tài)。蛋白質(zhì)組動(dòng)態(tài)地反映生物系統(tǒng)所處的狀態(tài)。細(xì)胞細(xì)胞周期的特定時(shí)期、分化的不同階段、對(duì)應(yīng)的生長(zhǎng)周期的特定時(shí)期、分化的不同階段、對(duì)應(yīng)的生長(zhǎng)和營(yíng)養(yǎng)狀況、溫度、應(yīng)激和病理狀態(tài)等其相應(yīng)的和營(yíng)養(yǎng)狀況、溫度、應(yīng)激和病理狀態(tài)等其相應(yīng)的蛋白質(zhì)

7、組之間存在差異。對(duì)其中蛋白質(zhì)合成、降蛋白質(zhì)組之間存在差異。對(duì)其中蛋白質(zhì)合成、降解、加工、修飾的調(diào)控過程解、加工、修飾的調(diào)控過程, ,只有通過蛋白質(zhì)的直只有通過蛋白質(zhì)的直接分析才能提示。接分析才能提示。蛋白質(zhì)組研究的理論基礎(chǔ)DNAmRNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯基因蛋白質(zhì)細(xì)胞特異性基因表達(dá)生理狀態(tài)溫度應(yīng)激狀態(tài)培養(yǎng)條件藥物作用數(shù)量有限結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定復(fù)雜性多變性直接反應(yīng)生命現(xiàn)象復(fù)雜的調(diào)控蛋白質(zhì)組表達(dá)模式蛋白質(zhì)組表達(dá)模式（expression profile）： 研究蛋白質(zhì)組的組成成分研究蛋白質(zhì)組的組成成分 支 撐 技 術(shù) 主 要 有 ：支 撐 技 術(shù) 主 要 有 ： 雙 向 凝 膠 電 泳雙 向 凝 膠 電 泳

8、 ( ( 2 D electrophoresis) )、以以質(zhì)譜質(zhì)譜( (mass spectrograph) )為為代 表 的 蛋 白 質(zhì) 鑒 定 技 術(shù)代 表 的 蛋 白 質(zhì) 鑒 定 技 術(shù) , , 以 及以 及 生 物 信 息 學(xué)生 物 信 息 學(xué)( (Bioinformatics) )分析。分析。Protein sampleImage analysisProtein in gelProtein on membraneProtein in solution2-D PAGEExcisionBlottingElutionPartial degradationPeptide mixtureMa

9、ss of proteinN-terminalsequenceMSEdman degradation Peptide mass fingerprintPeptide sequence MS/MS dataDatabase searchingNovel or previously studied proteinCharacterization of post-translocation modifications蛋蛋 白白 質(zhì)質(zhì) 組組 的的 分分 析析 流流 程程（一）蛋白質(zhì)組研究中的樣品制備 通?？刹捎眉?xì)胞或組織中的全蛋白質(zhì)組分進(jìn)行蛋通?？刹捎眉?xì)胞或組織中的全蛋白質(zhì)組分進(jìn)行蛋白質(zhì)組分析。白質(zhì)組

10、分析。 也可以進(jìn)行樣品預(yù)分級(jí)，即將細(xì)胞或組織中的全也可以進(jìn)行樣品預(yù)分級(jí)，即將細(xì)胞或組織中的全體蛋白質(zhì)分成不同部分，分別進(jìn)行研究。體蛋白質(zhì)分成不同部分，分別進(jìn)行研究。 樣品預(yù)分級(jí)主要作用在于提高低豐度蛋白質(zhì)的上樣品預(yù)分級(jí)主要作用在于提高低豐度蛋白質(zhì)的上樣量和檢測(cè)靈敏度。樣量和檢測(cè)靈敏度。 樣品預(yù)分級(jí)的主要方法樣品預(yù)分級(jí)的主要方法 蛋白質(zhì)溶解性：可溶性蛋白、非溶性蛋白等蛋白質(zhì)溶解性：可溶性蛋白、非溶性蛋白等 蛋白質(zhì)定位：膜蛋白、核蛋白等蛋白質(zhì)定位：膜蛋白、核蛋白等 蛋白質(zhì)細(xì)胞器定位：線粒體、高爾基體、葉綠體蛋白質(zhì)細(xì)胞器定位：線粒體、高爾基體、葉綠體等等三三種種常常用用的的植植物物蛋蛋白白提提取取方

11、方法法（二）蛋白質(zhì)組研究中的樣品分離 雙向凝膠電泳雙向凝膠電泳( (two-dimensional electrophoresis，2-DE) )，是目前蛋白質(zhì)組研究中最有效的分析鑒，是目前蛋白質(zhì)組研究中最有效的分析鑒定技術(shù)之一。定技術(shù)之一。 由兩相組成：由兩相組成： 第一相：等電聚焦凝膠電泳第一相：等電聚焦凝膠電泳 根據(jù)蛋白質(zhì)電荷差異根據(jù)蛋白質(zhì)電荷差異 第二相：第二相：SDSSDS聚丙烯酰胺凝膠電泳聚丙烯酰胺凝膠電泳 根據(jù)蛋白質(zhì)分子量差異根據(jù)蛋白質(zhì)分子量差異二維雙向電泳(2D electrophoresis) 基本原理第一向在高壓電場(chǎng)下對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行等電聚焦第一向在高壓電場(chǎng)下對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行等電聚

12、焦(IEF), 再在第再在第一向垂直方向上進(jìn)行第二向一向垂直方向上進(jìn)行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)。IEF-focused proteinsSDS-charged proteins in IPG stripSDS-charged proteinsresolved according to sizes in SDS-PAGE gel2-DE原理示意圖2-DE分析的基本步驟蛋白質(zhì)溶解變性還原去除蛋白質(zhì)雜志利用不同pK固定化電解質(zhì)可配置不同pH范圍的凝膠或利用商業(yè)化軟件設(shè)計(jì) 第一相電泳：IPGIFE平衡 第二相電泳：SDSPAGE考馬斯亮藍(lán)染色、銀染色、銅染

13、色樣品制備IPG膠制備雙相電泳 染色2-DE的操作SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳聚丙烯酰胺凝膠電泳SDS-PAGE SDS polyacrylamide gel electrophoresisSDSSDS帶負(fù)電荷，破壞蛋白質(zhì)的氫帶負(fù)電荷，破壞蛋白質(zhì)的氫鍵、疏水鍵，使之形成單個(gè)亞基。鍵、疏水鍵，使之形成單個(gè)亞基。SDS-SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物為雪茄形的蛋白質(zhì)復(fù)合物為雪茄形的長(zhǎng)橢圓棒長(zhǎng)橢圓棒，消除或掩蓋了不同種消除或掩蓋了不同種類蛋白質(zhì)間原有電荷的差異類蛋白質(zhì)間原有電荷的差異。SDSSDS - -蛋白質(zhì)復(fù)合物在凝膠電泳蛋白質(zhì)復(fù)合物在凝膠電泳中的中的遷移遷移率只是蛋白質(zhì)分子量的率只是蛋白質(zhì)分子量的函數(shù)有關(guān)

14、函數(shù)有關(guān)。 制膠：制膠： 試劑試劑 分離膠（分離膠（ml） 濃縮膠（濃縮膠（ml） 1.5M Tris-HCl （pH 8.9） 2.50 30%單體單體 3.50 1.00 10%SDS 0.10 0.10 蒸餾水蒸餾水 3.84 6.340.5M Tris-HCl （pH 6.8） 2.5010%過硫酸銨過硫酸銨AP 0.05 0.05四甲基乙二胺四甲基乙二胺TEMED 0.01 0.01 樣品處理：樣品處理：Loading buffer40%甘油甘油溴酚蘭溴酚蘭SDS-巰基乙醇巰基乙醇0.5M Tris-HCl（pH 6.8）50ul樣品樣品50ul(2)Loading buffer M

15、ix950C/5min 電泳槽電泳槽上電極緩沖液上電極緩沖液下電極緩沖液下電極緩沖液樣品槽樣品槽上樣器上樣器陰極陰極陽極陽極電泳電泳方向方向聚丙烯酰胺凝膠板聚丙烯酰胺凝膠板蛋白質(zhì)點(diǎn)的染色蛋白質(zhì)點(diǎn)的染色 凝膠上的蛋白質(zhì)點(diǎn)染色常用方法有銀染法、考馬凝膠上的蛋白質(zhì)點(diǎn)染色常用方法有銀染法、考馬斯亮藍(lán)染色法斯亮藍(lán)染色法, , 另外還采用以下染色試劑另外還采用以下染色試劑: :麗春紅麗春紅S S、氨基黑、印度墨、氨基黑、印度墨、3535S S 硫脲銀、膠態(tài)金、咪唑硫脲銀、膠態(tài)金、咪唑鋅等鋅等. . 銀染法廣泛用于雙向凝膠電泳分離后蛋白質(zhì)點(diǎn)的銀染法廣泛用于雙向凝膠電泳分離后蛋白質(zhì)點(diǎn)的染色染色, , 該法靈敏

16、度為該法靈敏度為4 ng , 4 ng , 但對(duì)質(zhì)譜測(cè)定有干擾但對(duì)質(zhì)譜測(cè)定有干擾, , 必須先脫銀必須先脫銀. . 考馬斯亮藍(lán)染色法可用于膠上或膜上蛋白質(zhì)點(diǎn)染考馬斯亮藍(lán)染色法可用于膠上或膜上蛋白質(zhì)點(diǎn)染色色, , 該法操作方便、重現(xiàn)性好該法操作方便、重現(xiàn)性好, , 同銀染法一樣同銀染法一樣, , 質(zhì)譜測(cè)定時(shí)也必須先脫色質(zhì)譜測(cè)定時(shí)也必須先脫色. .2-DE2-DE圖像分析技術(shù)圖像分析技術(shù)通過通過2-DE2-DE得到的蛋白質(zhì)分離圖譜，需要經(jīng)過攝像或得到的蛋白質(zhì)分離圖譜，需要經(jīng)過攝像或掃描轉(zhuǎn)換為以像素為基礎(chǔ)的、具有不同灰度強(qiáng)弱和掃描轉(zhuǎn)換為以像素為基礎(chǔ)的、具有不同灰度強(qiáng)弱和一定邊界方向的斑點(diǎn)電腦信號(hào)。一

17、定邊界方向的斑點(diǎn)電腦信號(hào)。2-DE獲得的蛋白質(zhì)圖譜圖像采集斑點(diǎn)檢測(cè)背景消減獲得蛋白質(zhì)相關(guān)信息圖像內(nèi)及圖像間的比較2-DE2-DE圖像分析軟件包操作過程：圖像分析軟件包操作過程：2-DE2-DE技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn) 優(yōu)點(diǎn)：可以同時(shí)直觀顯示數(shù)千個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)；優(yōu)點(diǎn)：可以同時(shí)直觀顯示數(shù)千個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)； 缺點(diǎn)：缺點(diǎn)： 極酸、極堿性蛋白質(zhì)，疏水性蛋白質(zhì)，極極酸、極堿性蛋白質(zhì)，疏水性蛋白質(zhì)，極大蛋白質(zhì)、極小蛋白質(zhì)以及低豐度蛋白質(zhì)用此種大蛋白質(zhì)、極小蛋白質(zhì)以及低豐度蛋白質(zhì)用此種技術(shù)難于有效分離；技術(shù)難于有效分離； 膠內(nèi)酶解過程費(fèi)時(shí)、費(fèi)力，難于與質(zhì)譜聯(lián)用實(shí)現(xiàn)膠內(nèi)酶解過程費(fèi)時(shí)、費(fèi)力，難于與質(zhì)譜聯(lián)用實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化；自動(dòng)

18、化； 丙烯酰胺有神經(jīng)毒作用。丙烯酰胺有神經(jīng)毒作用。新型非凝膠技術(shù)新型非凝膠技術(shù) 液相色譜法液相色譜法(liquid chromatography，LC) 毛細(xì)管電泳毛細(xì)管電泳(capillary electrophoresis，CE) 液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)（液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)（LC-MS/MS） 蛋白質(zhì)混合物直接通過液相色譜分離以代替蛋白質(zhì)混合物直接通過液相色譜分離以代替2-DE的分的分離，然后進(jìn)入離，然后進(jìn)入MS系統(tǒng)獲得肽段分子量，再通過串聯(lián)系統(tǒng)獲得肽段分子量，再通過串聯(lián)MS技技術(shù)，得到部分序列信息，最后通過計(jì)算機(jī)聯(lián)網(wǎng)查詢、鑒定術(shù)，得到部分序列信息，最后通過計(jì)算機(jī)聯(lián)網(wǎng)查詢、鑒定蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)。 多維色譜技

19、術(shù)（多維色譜技術(shù)（LC/LC-MS/MS） 多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)（三）蛋白質(zhì)組研究中的樣品分析鑒定（三）蛋白質(zhì)組研究中的樣品分析鑒定 傳統(tǒng)方法：蛋白質(zhì)微量測(cè)序傳統(tǒng)方法：蛋白質(zhì)微量測(cè)序 氨基酸組成分析氨基酸組成分析 新型蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)新型蛋白質(zhì)鑒定技術(shù) 質(zhì)譜（質(zhì)譜（MSMS）法）法 基本原理基本原理：樣品分子離子化后，根據(jù)離子間質(zhì)荷比：樣品分子離子化后，根據(jù)離子間質(zhì)荷比（m/zm/z）的差異來分離并確定樣品的分子量。）的差異來分離并確定樣品的分子量。 主要質(zhì)譜類型主要質(zhì)譜類型 基質(zhì)輔助激光解吸基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜（電離飛行時(shí)間質(zhì)譜（matrix-assisted l

20、aser desorption/ionization time of flight mass spectrometry，MALDI-TOF MS） 電噴霧質(zhì)譜（電噴霧質(zhì)譜（electrospray ionization mass spectrometry， ESI-MS） 質(zhì)譜分析目前是經(jīng)質(zhì)譜分析目前是經(jīng)2D -PAGE 分離的蛋白質(zhì)鑒定分離的蛋白質(zhì)鑒定的核心技術(shù)的核心技術(shù)（四）蛋白質(zhì)組學(xué)研究的生物信息學(xué)（四）蛋白質(zhì)組學(xué)研究的生物信息學(xué) 2D - PAGE分離的蛋白質(zhì)經(jīng)過識(shí)別與鑒定后，用分離的蛋白質(zhì)經(jīng)過識(shí)別與鑒定后，用圖像掃描儀數(shù)字化圖像掃描儀數(shù)字化2D - PAGE 膠上分離的蛋白質(zhì)膠上分離

21、的蛋白質(zhì)，在蛋白圖形工作站上，應(yīng)用軟件，對(duì)數(shù)字化的，在蛋白圖形工作站上，應(yīng)用軟件，對(duì)數(shù)字化的蛋白點(diǎn)的分布部位，斑點(diǎn)面積和灰階、背景過濾蛋白點(diǎn)的分布部位，斑點(diǎn)面積和灰階、背景過濾、2 - DE 匹配與比較，建立參考圖譜；匹配與比較，建立參考圖譜； 對(duì)蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫的搜索是蛋白質(zhì)組信息學(xué)對(duì)蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫的搜索是蛋白質(zhì)組信息學(xué)的一大特點(diǎn)；的一大特點(diǎn)； 當(dāng)用當(dāng)用2D - PAGE 分離一個(gè)蛋白質(zhì)組后分離一個(gè)蛋白質(zhì)組后,應(yīng)用質(zhì)譜技應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)測(cè)定能夠刻劃蛋白質(zhì)屬性的各種屬性參數(shù)術(shù)測(cè)定能夠刻劃蛋白質(zhì)屬性的各種屬性參數(shù)(attribute parameter) ,同時(shí)把已有數(shù)據(jù)庫同時(shí)把已有數(shù)據(jù)庫(如如OWL 或或dbEST) 中的每一個(gè)序列轉(zhuǎn)換成相應(yīng)屬性參數(shù)中的每一個(gè)序列轉(zhuǎn)換成相應(yīng)屬性參數(shù),形成屬性化的數(shù)據(jù)庫。然后以此屬性參數(shù)形成屬性化的數(shù)據(jù)庫。然后以此屬性參數(shù),形成屬形成屬性化的蛋白質(zhì)或核酸數(shù)據(jù)庫。若搜索不到性化的蛋白質(zhì)或核酸數(shù)據(jù)庫。若搜索不到,那可能那可能是新的蛋白質(zhì)是新的蛋白質(zhì),就須采用傳統(tǒng)的生化鑒定。就須采用傳統(tǒng)的生化鑒定。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 （一）蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫（一）蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫 （二）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（二）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 （三）蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫（三）蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫 （四）（四