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1、生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)實(shí)驗(yàn)安全與實(shí)驗(yàn)基本操作實(shí)驗(yàn)室常用試劑的使用安全二甲苯 無色液體,有芳香氣味,易揮發(fā)。用來制造、染料、塑料和藥物。屬低毒類,對(duì)皮膚和黏膜有刺激作用,高濃度有麻醉作用。神經(jīng)系統(tǒng)會(huì)受損害,還會(huì)使腎和肝受時(shí)性損傷。 眼睛接觸:蒸氣會(huì)刺激眼睛,液體導(dǎo)致嚴(yán)重刺激,發(fā)紅腫脹和灼傷。通常影響是暫時(shí)性的。皮膚接觸:產(chǎn)生灼傷感、干燥??梢杂梦氐木徛魉疀_洗至少20分鐘,用無摩擦性的肥皂有助于從皮膚上洗去二甲苯。 易燃,有爆炸危險(xiǎn)。屬于甲類防火危險(xiǎn)物質(zhì)。用二氧化碳或干粉或泡沫滅火劑,不宜用水。三氯甲烷 無色透明易揮發(fā)液體,有特殊的香甜氣味。沸點(diǎn):61.2,醫(yī)藥上用作麻醉劑。也用作萃取劑
2、和溶劑。 有很強(qiáng)的麻醉作用,在光的作用下,能被空氣中的氧反應(yīng)生成氯化氫和劇毒的光氣。通常加入12%乙醇,使生成的光氣與乙醇作用而生成碳酸乙酯,以消除其毒性。 吸入高濃度蒸汽時(shí),開始刺激眼、口腔、鼻孔粘摸,發(fā)生流淚、感覺麻醉、嘔吐、痙攣、直到昏睡、不省人事。 在空氣、水分和光的作用下,酸度增加,因而對(duì)金屬有強(qiáng)烈的腐蝕性乙醚 透明、無色、易揮發(fā)有芳香刺激性氣味的液體。沸點(diǎn):34.6;對(duì)人體有麻醉性能。當(dāng)吸入含量為3.5%時(shí),3040分鐘就可失去知覺。 人體過量吸入,會(huì)引起嚴(yán)重的急性中毒。呼氣中帶醚味,并出現(xiàn)嘔吐、出汗、噴嚏、咳嗽、頭痛、記憶力減退、無力、興奮。 微溶于水,易溶于鹽酸,能與醇、醚、石
3、油醚、苯、氯仿等有機(jī)溶劑混溶。應(yīng)儲(chǔ)存于陰涼、干燥、通風(fēng)的低溫庫房?jī)?nèi),庫溫最好控制在25以下。遠(yuǎn)離熱源、火種,避免陽光直射。 本品易燃。與強(qiáng)氧化劑反應(yīng)能起火爆炸。在空氣中與氧長(zhǎng)期接觸或受光照會(huì)生成不穩(wěn)定的過氧化物,受熱能自行著火爆炸。著火時(shí),可用干粉、泡沫、二氧化碳、沙土滅火。用水滅火無效,但可用水保持火場(chǎng)容器冷卻。乙醇 無色有酒味,易揮發(fā)的澄清液體。沸點(diǎn)78.5:用于溶劑、清洗劑、分析試劑等。屬微毒類,對(duì)眼睛黏膜有輕微刺激作用。 乙醇可使皮膚發(fā)干,長(zhǎng)期受大劑量作用時(shí),可使神經(jīng)系統(tǒng)、消化器官等發(fā)生嚴(yán)重的器質(zhì)性疾病。 易燃,手熱或遇明火有燃燒爆炸危險(xiǎn),燃燒時(shí),發(fā)出蘭色火焰。蒸氣能與空氣形成爆炸性混
4、合物,在火場(chǎng)中,受熱的容器有爆炸的危險(xiǎn)。著火時(shí),用二氧化碳、霧狀水、干粉、1211或抗泡沫滅火。用水冷卻火場(chǎng)中的容器,驅(qū)散蒸氣,趕出溢出液體,使其稀釋成為不燃性混合物冰醋酸 有酸性氣味的無色透明液體,沸點(diǎn):118.1。用于制造氯乙烯塑料、醋酐、有機(jī)醋酸酯、醋酸鹽(鉛、鋁、銅等)及醋酸纖維;也可用于染料、制藥、罐頭食品、食品防腐、色素生產(chǎn)等工業(yè)。 屬低毒類,可經(jīng)消化道、呼吸道、皮膚吸收,對(duì)眼、皮膚和上呼吸道有刺激作用。眼睛接觸:引起眼瞼水腫、結(jié)膜充血;皮膚接觸:輕者出現(xiàn)紅斑,重者出現(xiàn)化學(xué)灼傷,有水泡和疼痛。 吸入:當(dāng)空氣中蒸氣濃度不明時(shí),應(yīng)佩帶有黃色色標(biāo)濾毒盒(罐)的防毒面具。使用時(shí)應(yīng)有良好的通
5、風(fēng)條件和有效的防護(hù)用品,如有醋酸的泄露或?yàn)R污,應(yīng)以堿液中和,然后用水沖洗,經(jīng)稀釋的污水排入廢水系統(tǒng)。注 意 實(shí)驗(yàn)過程中產(chǎn)生的廢氣、廢液、廢渣大多數(shù)是有害的,必須經(jīng)過處理才能排放。少量有毒氣體可以通過排風(fēng)設(shè)備排出室外,被空氣稀釋。毒氣量大時(shí),必須處理后再排出。如氧化氮、二氧化硫等酸性氣體用堿液吸收??扇夹杂袡C(jī)廢液可于燃燒爐中通氧氣完全燃燒。 大家在實(shí)驗(yàn)室里,接觸到的化學(xué)試劑多半都有危害性,所以每個(gè)人都應(yīng)該注意保護(hù)自己,注意規(guī)范操作,同時(shí)對(duì)別人也是一種保護(hù),而不能因?yàn)閳D省事或者別的什么原因而放松對(duì)安全的注意。實(shí)驗(yàn)誤差絕對(duì)誤差(absolute error): 絕對(duì)誤差是測(cè)量值與真實(shí)值之差。 = x
6、 (:絕對(duì)誤差;x:測(cè)量值;:真實(shí)值) 絕對(duì)誤差是以測(cè)量值的單位為單位,可以是正值,也可以是負(fù)值。測(cè)量值越接近真實(shí)值,絕對(duì)誤差越小。 真實(shí)值是一個(gè)可以接近而不可達(dá)到的理論值。上式可以寫成: = x- 說明在已知絕對(duì)誤差值的情況下,真實(shí)值可以從測(cè)定值減去絕對(duì)誤差而求得。相對(duì)誤差(relative error): 為了反映誤差在測(cè)量結(jié)果中所占的比例,分析工作中經(jīng)常使用相對(duì)誤差。相對(duì)誤差是以真實(shí)值的大小為基礎(chǔ)表示的誤差值,沒有單位。 /=(x-)/ 通常以%, 或 ppm表示。 例如:測(cè)定純NaCl中Cl的百分含量為60.52%,而其真實(shí)含量(理論值)為60.66%。則絕對(duì)誤差=60.52%60.6
7、6% = -0.14% 相對(duì)誤差=(60.52% 60.66%) / 60.66% ×1000 = -2.3 如果不知道真實(shí)值,而知道絕對(duì)誤差值,則相對(duì)誤差也可以表示為: 相對(duì)誤差 = × 100% x 例如:用分析天平稱兩個(gè)重量,一個(gè)是0.0021g,另一個(gè)是0.5432g,兩個(gè)重量的絕對(duì)誤差都是0.0001g,可是相對(duì)誤差卻大不相同,一個(gè)是(1/21 )×100%,另一個(gè)是(1/5432 )×100%。 可見,由于兩個(gè)被測(cè)組分含量高低不同,即使絕對(duì)誤差相同,相對(duì)誤差也不同。對(duì)高含量組分測(cè)定的相對(duì)誤差應(yīng)當(dāng)要求小些,低含量組分測(cè)定的相對(duì)誤差要求允許大些。
8、 例如:用重量法和滴定法測(cè)量樣品主要成分,相對(duì)誤差需要達(dá)到千分之一,而用比色法測(cè)定樣品重微量成分時(shí),相對(duì)誤差只要求達(dá)到百分之幾即可2. 系統(tǒng)誤差系統(tǒng)誤差(systematic error)也叫“可定誤差”,是由某種確定的原因引起的,一般有固定的方向(正或負(fù))和大小,重復(fù)測(cè)定時(shí)重復(fù)出現(xiàn)。根據(jù)系統(tǒng)誤差的來源,可分為: (1) 方法誤差 方法誤差是由于不適當(dāng)?shù)膶?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)或所選方法不恰當(dāng)所引起的,通常影響較大。比如:滴定分析中終點(diǎn)與化學(xué)計(jì)量點(diǎn)不相符合、重量分析中沉淀的溶解度過大或有共沉淀等,都會(huì)產(chǎn)生誤差。 (2) 儀器或試劑誤差 是由于儀器未經(jīng)校準(zhǔn)或試劑不合規(guī)格引起的。例 如:天平砝碼不準(zhǔn)、容量?jī)x器刻度
9、不準(zhǔn)或試劑不純等,均能產(chǎn)生這種誤差。3) 操作誤差 操作誤差是由于分析者操作不符合要求引起的。 例如:分析者對(duì)滴定終點(diǎn)顏色改變的判斷能力不夠高,總是偏深或偏淺,便會(huì)產(chǎn)生誤差。 由于系統(tǒng)誤差是重復(fù)的以固定方向和大小出現(xiàn),所以能用加校正值的方法加以消除,但不能用增加平行測(cè)定次數(shù)的方法消除。3.隨機(jī)誤差(accidental error ): 也稱偶然誤差,是由于偶然的原因,如測(cè)量條件、實(shí)驗(yàn)室溫度、濕度等變動(dòng)而未能得到控制的條件波動(dòng)引起的,其大小和正負(fù)都不固定。 偶然誤差的出現(xiàn)看起來似乎沒有規(guī)律,但多次測(cè)量就會(huì)發(fā)現(xiàn)絕對(duì)值相同的正負(fù)偶然誤差出現(xiàn)的概率大致相等,它們之間能完全或部分抵消。因此通過增加平行
10、測(cè)定次數(shù),就可以減免測(cè)定結(jié)果中這種誤差。也可以通過統(tǒng)計(jì)學(xué)方法估計(jì)出偶然誤差值,并在測(cè)定結(jié)果中予以正確表達(dá)。 系統(tǒng)誤差和偶然誤差往往不能區(qū)分。比如:在觀察滴定終點(diǎn)的顏色變化時(shí),有人總是偏深,產(chǎn)生系統(tǒng)誤差。但多次測(cè)定中偏深程度不一樣,又必然有偶然誤差。5.提高分析準(zhǔn)確度的方法(1)選擇恰當(dāng)?shù)姆治龇椒?不同方法的準(zhǔn)確度和靈敏度不同。重量分析法和容量分析法靈敏度雖然不高,但對(duì)常量組分的測(cè)定可以獲得比較準(zhǔn)確的結(jié)果,一般相對(duì)誤差不超過千分之幾。但對(duì)于微量和痕量組分的分析,常常做不出來,談不上精確度。 儀器分析法對(duì)測(cè)定常量組分無法準(zhǔn)確,但對(duì)測(cè)定微量和痕量組分靈敏度很高,盡管相對(duì)誤差較大,但絕對(duì)誤差不大,能符
11、合準(zhǔn)確度的要求。 總之,必須根據(jù)分析對(duì)象,樣品情況以及對(duì)分析結(jié)果的要求,選擇恰當(dāng)?shù)姆治龇椒?。?)減小測(cè)量誤差 為了保證分析結(jié)果的準(zhǔn)確度,必須盡量減小各步的測(cè)量誤差。 例如:一般分析天平的稱量誤差為+0.0001g,用減重法稱量?jī)纱?,可能引起的最大誤差是+0.0002g,為了使稱量的相對(duì)誤差小于0.1%,取樣量就不能小于0.2g。 (3)消除測(cè)量中的系統(tǒng)誤差 A、校準(zhǔn)儀器:對(duì)砝碼、滴定管和移液管進(jìn)行校準(zhǔn)。 B、做對(duì)照實(shí)驗(yàn):用含量已知的標(biāo)準(zhǔn)試樣或純物質(zhì)當(dāng)樣品進(jìn)行分析,由分析結(jié)果和其已知含量的差值,確定分析的誤差。 C、做空白實(shí)驗(yàn):在不加樣品的情況下,以與樣品相同的方法、步驟進(jìn)行分析,把所得的結(jié)果
12、作為空白值從樣品分析結(jié)果中減去。這樣可以消除由于試劑不純或容器不符合要求所帶進(jìn)的誤差。8.有效數(shù)字 有效數(shù)字是指分析工作中實(shí)際測(cè)到的數(shù)字,允許最后一個(gè)數(shù)字是可疑數(shù),反映測(cè)量值的準(zhǔn)確度,要與測(cè)量的方法相適應(yīng)。 一般分析數(shù)據(jù)保留4位有效數(shù)字,保留的位數(shù)太多無實(shí)際意義,反而增加計(jì)算的麻煩。要注意0.0052的有效數(shù)字只有2位,3個(gè)0是用于定位的無效數(shù)字。 修約有效數(shù)字的原則是四舍六入五成雙。如23.455±0.546修約為23.46±0.55, 28.445±0.675修約為28.44±0.68,要避免出現(xiàn)0.00002±0.00001之類的數(shù)字,或
13、3658.2543±0.0058之類的數(shù)字。五、生物化學(xué)常用緩沖液(一)基本概念 Bronsted-Lowry酸堿理論(酸堿質(zhì)子理論): 1923年由丹麥化學(xué)家J.N.Brnsted和英國(guó)化學(xué)家T.M.Lowry同時(shí)提出了酸堿質(zhì)子學(xué)說,認(rèn)為凡能釋放質(zhì)子的分子或離子(如:H2O,HCl,NH4+,HSO4- 等)稱為酸,凡能接受質(zhì)子的分子或離子(如:H2O,NH3,Cl-等)稱為堿。因此,一種酸釋放質(zhì)子后即成為堿,稱為該酸的共軛堿,同樣一種堿與質(zhì)子結(jié)合后,形成對(duì)應(yīng)的酸,稱為該堿的共軛酸。 如鹽酸在水中的解離: HCl Cl- H+ HCl是酸,Cl-是它的共軛堿。 pH = pKa+l
14、og質(zhì)子受體/質(zhì)子供體 緩沖體系的設(shè)計(jì): 1960年,N.E.Good和他的同事們提出,適合生命科學(xué)研究使用的緩沖體系應(yīng)具有以下特性: pKa值在6-8之間; 在水中的溶解度高; 不易穿透生物膜; 鹽效應(yīng)小; 離子濃度、溶液組成和溫度對(duì)解離的影響小; 不與金屬離子生成復(fù)合物或沉淀; 該緩沖劑化學(xué)穩(wěn)定; 紫外和可見光波長(zhǎng)范圍內(nèi)光吸收小; 易制得高純度的鹽。(二)生物化學(xué)常用緩沖液 磷酸鹽緩沖液: 磷酸鹽是生物化學(xué)研究中使用最廣泛的一種緩沖劑,由於它們是二級(jí)解離,有二個(gè)pKa值,所以用它們配制的緩沖液,pH范圍最寬: NaH2PO4: pKa12.12, pKa27.21 Na2HPO4: pKa
15、17.21, pKa212.32 配酸性緩沖液: 用NaH2PO4,pH1-4, 配中性緩沖液: 用混合的兩種磷酸鹽,pH6-8, 配堿性緩沖液: 用Na2HPO4,pH10-12。 用鉀鹽比鈉鹽好,因?yàn)榈蜏貢r(shí)鈉鹽難溶,鉀鹽易溶,但若配制SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的緩沖液時(shí),只能用磷酸鈉而不能用磷酸鉀,因?yàn)镾DS(十二烷基硫酸鈉)會(huì)與鉀鹽生成難溶的十二烷基硫酸鉀。磷酸鹽緩沖液的優(yōu)點(diǎn)為: 容易配制成各種濃度的緩沖液; 適用的pH范圍寬; pH受溫度的影響?。?緩沖液稀釋后pH變化小,如稀釋十倍后pH的變化小于0.1。其缺點(diǎn)為: 易與常見的鈣Ca+離子、鎂Mg+離子以及重金屬離子締合生成沉淀; 會(huì)
16、抑制某些生物化學(xué)過程,如對(duì)某些酶的催化作用會(huì)產(chǎn)生某種程度的抑制作用。 Tris(三羥甲基氨基甲烷)緩沖液: Tris緩沖液在生物化學(xué)研究中使用的越來越多,有超過磷酸鹽緩沖液的趨勢(shì),如在SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳中已都使用Tris緩沖液,而很少再用磷酸鹽。 Tris緩沖液的常用有效pH范圍是在“中性”范圍,例如: Tris-HCl緩沖液: pH7.5-8.5 Tris-磷酸鹽緩沖液: pH5.0-9.0Tris-HCl緩沖液的優(yōu)點(diǎn)是: 因?yàn)門ris的堿性較強(qiáng),所以可以只用這一種緩沖體系配制pH范圍由酸性到堿性的大范圍pH值的緩沖液; 對(duì)生物化學(xué)過程干擾很小,不與鈣、鎂離子及重金屬離子發(fā)生沉淀。其
17、缺點(diǎn)是: 緩沖液的pH值受溶液濃度影響較大,緩沖液稀釋十倍,pH值的變化大于0.1; 溫度效應(yīng)大,溫度變化對(duì)緩沖液pH值的影響很大,例如:4時(shí)緩沖液的pH8.4,而37時(shí)的pH7.4,所以一定要在使用溫度下進(jìn)行配制,室溫下配制的Tris-HCl緩沖液不能用于0-4。 易吸收空氣中的CO2,所以配制的緩沖液要蓋嚴(yán)密封。 此緩沖液對(duì)某些pH電極發(fā)生一定的干擾作用,所以要使用與Tris溶液具有兼容性的電極。 有機(jī)酸緩沖液: 這一類緩沖液多數(shù)是用羧酸與它們的鹽配制而成,pH范圍為酸性,即pH3.0-6.0,最常用的是甲酸、乙酸、檸檬酸和琥珀酸等。 有機(jī)酸緩沖液的缺點(diǎn)是: 所有這些羧酸都是天然的代謝產(chǎn)物
18、,因而對(duì)生化反應(yīng)過程可能發(fā)生干擾作用; 檸檬酸鹽和琥珀酸鹽可以和過渡金屬離子(Fe3+、Zn+、Mg+等)結(jié)合而使緩沖液受到干擾; 這類緩沖液易與Ca+離子結(jié)合,所以樣品中有Ca+離子時(shí),不能用這類緩沖液。 硼酸鹽緩沖液: 常用的有效pH范圍是:pH8.5-10.0,因而它是堿性范圍內(nèi)最常用的緩沖液,其優(yōu)點(diǎn)是配制方便,只使用一種試劑,缺點(diǎn)是能與很多代謝產(chǎn)物形成絡(luò)合物,尤其是能與糖類的羥基反應(yīng)生成穩(wěn)定的復(fù)合物而使緩沖液受到干擾。 氨基酸緩沖液: 此緩沖液使用的范圍寬,可用于pH=2.0-11.0,例如最常用的有: 甘氨酸-HCl緩沖液:pH=2.0-5.0, 甘氨酸-NaOH緩沖液:pH=8.0
19、-11.0, 甘氨酸-Tris緩沖液:pH=8.0-11.0,(廣泛使用的SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的電極緩沖液), 組氨酸緩沖液:pH=5.5-6.5, 此類緩沖體系的優(yōu)點(diǎn)是:為細(xì)胞組份和各種提取液提供更接近的天然環(huán)境。 其缺點(diǎn)是: 與羧酸鹽和磷酸鹽緩沖體系相似,也會(huì)干擾某些生物化學(xué)反應(yīng)過程,如代謝過程等。 試劑的價(jià)格較高。 六、 pH值的測(cè)定測(cè)定溶液pH值通常有兩種方法,最簡(jiǎn)便但較粗略的方法是用pH試紙,分為廣泛和精密pH試紙兩種。 廣泛pH試紙的變色范圍是pH=1-14、9-14等,只能粗略確定溶液的pH值。 精密pH試紙,可以較精確地測(cè)定溶液的pH值,其變色范圍是2-3個(gè)pH單位,例如
20、有pH=1.4-3.0、5.4-7.0、9.5-13.0等許多種,可根據(jù)待測(cè)溶液的酸、堿性選用某一范圍的試紙。 測(cè)定的方法是將試紙條剪成小塊,用鑷子夾一小塊試紙,用玻璃棒蘸少許溶液與試紙接觸,試紙變色后與色階板對(duì)照,估讀出所測(cè)pH值。切不可將試紙直接放入溶液中,以免污染樣品溶液。 紫外可見分光光度法一、基本原理(一)Beer-Lambert 定律 當(dāng)一束單色光通過溶液時(shí),由于溶液吸收了一部分光能,光的強(qiáng)度就會(huì)減弱。設(shè)入射光的強(qiáng)度為I0,透過濃度為c,液層厚度為b的溶液后,透射光的強(qiáng)度I必定小于I0,隨濃度和厚度的增加,光被吸收的程度亦增加,透射光的強(qiáng)度則減小。透射光強(qiáng)度與入射光強(qiáng)度的比值,稱為
21、透光度(transmittance),以T表示。實(shí)驗(yàn)證明,當(dāng)液層厚度b和溶液濃度c按算術(shù)級(jí)數(shù)增加時(shí),透光度T按幾何級(jí)數(shù)減小,數(shù)學(xué)式為: A-lgTabc A:吸光度,又稱光密度“O.D”;T:透光度, TI / I。; a:吸光系數(shù)(L·mol1·cm1);比例常數(shù),稱吸光系數(shù) b:樣品光程(cm),通常使用1.0cm 的吸收池,則b=1cm; c:樣品濃度(mol/L)。吸光度與液層厚度和溶液濃度的乘積成正比,稱為朗伯比爾定律,簡(jiǎn)稱比爾定律,即光的吸收定律。其數(shù)學(xué)表達(dá)式為:A=abc 吸光度“A”有一個(gè)重要性質(zhì)是其具有加和性: 即混合物的總吸光度等于溶液中的各組份各自在該
22、波長(zhǎng)下吸光度的算術(shù)和。這是多元混合物分光光度法定量分析的基礎(chǔ)。 若溶液中各溶質(zhì)的吸光系數(shù)相同,則各溶質(zhì)吸光度的大小與溶質(zhì)濃度成比例。 例:尿嘧啶核苷酸溶液用1cm石英吸收池測(cè)定 260nm的吸光度為0.650,用同一吸收池測(cè)定純?nèi)軇┑奈舛葹?.070,已知其摩爾吸光系數(shù) = 8.2×103 M-1cm,計(jì)算其摩爾濃度。 L)。 AbC A(溶劑加樣品的吸光度)(溶劑的吸光度) A0.6500.0700.580 b1cm C=7.1×10-5 mol / L吸收池使用注意事項(xiàng): 要徹底清洗,尤其是盛過蛋白質(zhì)等溶液,干后形成一層膜,不易洗去,通常杯子不用時(shí)可放在 1洗潔凈液中
23、浸泡,去污效果好,使用時(shí)用水沖洗干凈,要求杯壁不掛水珠,還可以用綢布絲線或軟塑料制作一個(gè)小刷子清洗杯子。 嚴(yán)禁用手指觸摸透光面,因指紋不易洗凈。嚴(yán)禁用硬紙和布擦拭透光面,只能使用鏡頭紙和綢布。 嚴(yán)禁加熱烘烤。急用干的杯子時(shí),可用酒精蕩洗后用冷風(fēng)吹干。決不可用超聲波清洗器清洗。三、分光光度法的定性與定量方法(一)定性方法: 一系列不同波長(zhǎng)的單色光照射待測(cè)溶液,可測(cè)的一系列相應(yīng)的吸光度。以吸光度為縱坐標(biāo),以波長(zhǎng)為橫坐標(biāo)作圖,可以得到待測(cè)物質(zhì)的吸收曲線。通過與標(biāo)準(zhǔn)品比較而定性。 (二)定量方法: 根據(jù)比爾定律,物質(zhì)在一定波長(zhǎng)處的吸光度與濃度之間有線性關(guān)系。因此,只要選擇一定的波長(zhǎng)測(cè)定溶液的吸光度,即
24、可求出濃度。1.吸光系數(shù)法(絕對(duì)法): 根據(jù)比爾定律A= c l ,若 l 和吸光系數(shù)或E1%1cm已知,即可根據(jù)測(cè)得的A,求出被測(cè)物的濃度。 C = A / l 通?;駿1%1cm可以在手冊(cè)或文獻(xiàn)中查到。 示例見課本P10.2.標(biāo)準(zhǔn)曲線法: 在有些情況下,如單色光不純等情況,測(cè)得的吸光值隨所用儀器不同而有相當(dāng)大的變化。若此時(shí)用吸光系數(shù)換算成濃度,將產(chǎn)生很大的誤差。 但如果只用一臺(tái)固定的儀器,則可認(rèn)定在固定的工作狀態(tài)和測(cè)定條件下,濃度與吸光度之間的關(guān)系在許多情況下是線性關(guān)系或接近于線性關(guān)系。 A=KC(K只為比例常數(shù),而非物質(zhì)常數(shù)) 依據(jù)上式的關(guān)系進(jìn)行定量是分光光度法中比較簡(jiǎn)便易行的方法。標(biāo)準(zhǔn)
25、曲線的制作(1)配置一系列濃度不同的標(biāo)準(zhǔn)溶液。(2)在測(cè)定條件相同的情況下,分別測(cè)定其吸光度。(3)以標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度為橫坐標(biāo)(不必考慮顯色劑等引起的濃度變化),以相應(yīng)的吸光度為縱坐標(biāo),繪制A-C關(guān)系圖。(4)在相同條件下測(cè)出樣品溶液的吸光度,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出濃度。離心機(jī)的使用1.使用各種離心機(jī)時(shí),必須事先在天平上精密地平衡離心管和其內(nèi)容物,平衡時(shí)重量之差不得超過各個(gè)離心機(jī)說明書上所規(guī)定的范圍,每個(gè)離心機(jī)不同的轉(zhuǎn)頭有各自的允許差值,轉(zhuǎn)頭中絕對(duì)不能裝載單數(shù)的管子,當(dāng)轉(zhuǎn)頭只是部分裝載時(shí),管子必須互相對(duì)稱地放在轉(zhuǎn)頭中,以便使負(fù)載均勻地分布在轉(zhuǎn)頭的周圍。 2.離心前必須仔細(xì)檢查轉(zhuǎn)頭各孔內(nèi)有無異物。 3.若
26、要在低于室溫的溫度下離心時(shí)。轉(zhuǎn)頭在使用前應(yīng)放置在冰箱或置于離心機(jī)的轉(zhuǎn)頭室內(nèi)預(yù)冷。4.裝載溶液時(shí),要根據(jù)各種離心機(jī)的具體操作說明進(jìn)行,根據(jù)待離心液體的性質(zhì)及體積選用適合的離心管,有的離心管無蓋,液體不得裝得過多,以防離心時(shí)甩出,造成轉(zhuǎn)頭不平衡、生銹或被腐蝕,而制備性超速離心機(jī)的離心管,則常常要求必須將液體裝滿,以免離心時(shí)塑料離心管的上部凹陷變形。每次使用后,必須仔細(xì)檢查轉(zhuǎn)頭,及時(shí)清洗、擦干,轉(zhuǎn)頭是離心機(jī)中須重點(diǎn)保護(hù)的部件,搬動(dòng)時(shí)要小心,不能碰撞,避免造成傷痕,轉(zhuǎn)頭長(zhǎng)時(shí)間不用時(shí),要涂上一層上光臘保護(hù),嚴(yán)禁使用顯著變形、損傷或老化的離心管。5.離心過程中不得隨意離開,應(yīng)隨時(shí)觀察離心機(jī)上的儀表是否正常
27、工作,如有異常的聲音應(yīng)立即停機(jī)檢查,及時(shí)排除故障。 6.每個(gè)轉(zhuǎn)頭各有其最高允許轉(zhuǎn)速和使用累積限時(shí),使用轉(zhuǎn)頭時(shí)要查閱說明書,不得過速使用。每一轉(zhuǎn)頭都要有一份使用檔案,記錄累積的使用時(shí)間,若超過了該轉(zhuǎn)頭的最高使用限時(shí),則須按規(guī)定降速使用。 7.離心時(shí)不準(zhǔn)開蓋,不準(zhǔn)用手停止轉(zhuǎn)頭。移液器的使用 設(shè)定移液體積從大體積調(diào)節(jié)到小體積時(shí),為正常調(diào)節(jié)方法,逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)刻度即可;從小體積調(diào)節(jié)至大體積時(shí),可先順時(shí)針調(diào)至超過設(shè)定體積的刻度,再回調(diào)至設(shè)定體積,這樣可以保證最佳的精確度。 裝配移液器吸頭 單道移液器,將移液端垂直插入吸頭,左右微微轉(zhuǎn)動(dòng),上緊即可用移液器反復(fù)撞擊吸頭來上緊的方法是不可取的,這樣操作會(huì)導(dǎo)致移液器
28、部件 因強(qiáng)烈撞擊而松散,嚴(yán)重的情況會(huì)導(dǎo)致調(diào)節(jié)刻度的旋鈕卡住。 多道移液器,將移液器的第一道對(duì)準(zhǔn)第一個(gè)吸頭,傾斜插入,前后稍許搖動(dòng)上緊,吸頭插入后略超過O型環(huán)即可。 養(yǎng)護(hù): 1、如液體不小心進(jìn)入活塞室應(yīng)及時(shí)清除污染物; 2、移液器使用完畢后,把移液器量程調(diào)至最大值,且將移液器垂直放置在移液器架上; 3、根據(jù)使用頻率所有的移液器應(yīng)定期用肥皂水清洗或用 60 的異丙醇消毒,再用雙 蒸水清洗并晾干; 4、避免放在溫度較高處以防變形致漏液或不準(zhǔn); 5、發(fā)現(xiàn)問題及時(shí)找專業(yè)人員處理。 注意事項(xiàng) 1、當(dāng)移液器吸嘴有液體時(shí)切勿將移液器水平或倒置放置,以防液體流入活塞室腐蝕移液器活塞; 2、正確使用移液器吸液、排
29、液,以達(dá)高精準(zhǔn)度。尤其注意排液的 2) 、 3) 操作; 3、平時(shí)檢查是否漏液的方法: 吸液后在液體中停 1-3 秒觀察吸頭內(nèi)液面是否下降;如果液面下降首先檢查吸頭是否有問題,如有問題更換吸頭,更換吸頭后液面仍下降說明活塞組件有問題,應(yīng)找專業(yè)維修人員修理。 4、 需要高溫消毒的移液器應(yīng)首先 查閱所使用的移液器是否適合高溫消毒后再行處理。酪蛋白的制備原理:等電點(diǎn)沉淀(選擇性沉淀)利用蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)時(shí)溶解度最低的性質(zhì)。注意: 調(diào)節(jié)溶液到蛋白質(zhì)等電點(diǎn)時(shí),可以使蛋白質(zhì)溶解度最低,但是并不意味著蛋白質(zhì)會(huì)沉淀出來。40水浴預(yù)熱10分鐘(HAC緩沖液同時(shí)預(yù)熱)用滴管加入HAC緩沖液約2ml(pH 4.8)離
30、心,3000轉(zhuǎn)/分,15分鐘1、布朗運(yùn)動(dòng)加速蛋白分子的碰撞2、等電點(diǎn)附近蛋白質(zhì)的溶解度最低用4ml蒸餾水洗滌離心,3000轉(zhuǎn)/分,15分鐘除去沉淀中的可溶部分95%乙醇洗滌離心,2500轉(zhuǎn)/分,10分鐘除去沉淀中的脂類物乙醚2ml洗滌離心,2500轉(zhuǎn)/分,10分鐘脫水0.1N NaOH 2ml溶解加水至10ml酪蛋白是酸性蛋白質(zhì),溶解于堿性溶液中,方便下次雙縮脲法測(cè)定牛乳2ml40水浴預(yù)熱10分鐘(HAC緩沖液同時(shí)預(yù)熱)用滴管加入HAC緩沖液約2ml(pH4.8)離心,3000轉(zhuǎn)/分,15分鐘清液沉淀清液沉淀清液沉淀清液沉淀用4ml蒸餾水洗滌離心,3000轉(zhuǎn)/分,15分鐘95%乙醇洗滌離心,2
31、500轉(zhuǎn)/分,10分鐘乙醚2ml洗滌離心,2500轉(zhuǎn)/分,10分鐘0.1NNaOH2ml加水至10ml待測(cè)雙縮脲法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?.學(xué)習(xí)分光光度法測(cè)定的原理和方法2.學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)含量測(cè)定的原理和方法3. 掌握雙縮脲法測(cè)定蛋白質(zhì)含量的方法二、原理一、分光光度法的基本原理及方法(一)利用吸收光譜對(duì)物質(zhì)進(jìn)行定性分析2主要方法: (1)比較吸收光譜曲線 (2)比較最大吸收波長(zhǎng)蛋白質(zhì)的最大吸收波長(zhǎng)為280nm,核酸的最大吸收波長(zhǎng)為260nm(3)比較吸光度的比值(二)利用吸收光譜對(duì)物質(zhì)進(jìn)行定量分析1原理Beer-Lambert(比爾)定律: T=I/I0 A=lg1/T=lgI0/I A=KC
32、L其中:T為透光率;A為吸光率;I0為入射光強(qiáng)度;I為透射光強(qiáng)度;K為吸收系數(shù);C為溶液濃度;L為溶液光程的厚度2常用方法(1)標(biāo)準(zhǔn)曲線法§ 標(biāo)準(zhǔn)曲線與樣品的測(cè)定條件必須一致。(2)標(biāo)準(zhǔn)管法 CX/AX=CS/AS,已知CS,測(cè)定AS、AX,可求得CX。(3)摩爾吸光系數(shù)法C=A/e(e為L(zhǎng)=1cm,C為1 mol/L時(shí)的吸光系數(shù),也稱為摩爾吸光系數(shù)。3.樣品測(cè)試操作 打開電源開關(guān),使儀器預(yù)熱20分鐘 用“波長(zhǎng)設(shè)置”按鈕將波長(zhǎng)設(shè)置在您將要使用的分析波長(zhǎng)位置上 打開樣品室蓋,將擋光體插入比色皿架,并將其推或拉入光路 蓋好樣品室蓋,按“0%T”鍵調(diào)透射比零 取出擋光體,蓋好樣品室蓋,按“
33、100%T”調(diào)100%透射比 按“方式鍵”(MODE)將測(cè)試方式設(shè)置為吸光度方式(A) 將參比溶液和被測(cè)溶液分別倒入比色皿中 打開樣品室蓋,將盛有溶液的比色皿分別插入比色皿槽中,蓋上樣品室蓋 將參比溶液推入或拉入光路中,按“100%T”調(diào)零A 將被測(cè)溶液拉入光路中,此時(shí),顯示器上所顯示是被測(cè)樣品的吸光度參數(shù)實(shí)驗(yàn)完成后,關(guān)閉電源,洗凈比色皿,并蓋好蓋布。肝臟DNA的粗提取n 破碎細(xì)胞n 提取核蛋白n DNA核蛋白和RNA核蛋白分離n 蛋白和核酸分離原則n 低溫:抑制DNA酶的活性n 操作柔和:防止DNA斷鏈DNA分離純化的原理n DNA或DNP在0.14MNaCl鹽溶液中溶解度很低,而RNA則溶
34、于0.14MNaCl鹽溶液,利用這一性質(zhì)可將生物組織中的DNA與RNA分開n DNA在生物體內(nèi)是與蛋白質(zhì)形成復(fù)合物的形式存在的,因此提取脫氧核糖核蛋白復(fù)合物-DNP后,必須將其中蛋白去除n 其中蛋白質(zhì)部分可用SDS使之變性除去(同時(shí)破壞核酸分解酶)。n 進(jìn)一步純化則利用氯仿-異戊醇震蕩除蛋白,震蕩時(shí),蛋白質(zhì)變性,形成凝膠,并與DNA分開,DNA則留在水層中。n 利用DNA不溶于乙醇,因而用乙醇將DNA 從溶液中沉淀出來。離心機(jī)的使用n 平衡n 對(duì)稱放入,蓋上蓋n 設(shè)定轉(zhuǎn)速、時(shí)間n 離心開始n 完全停止后開蓋實(shí)驗(yàn)步驟n 1、取新鮮豬肝4g,用0.14mol/L NaCl 0.15mol/LEDT
35、A溶液洗去血液,剪碎。加入10ml 0.14mol/L NaCl 0.15mol/L EDTA溶液,置勻漿器中研磨。(初步破碎細(xì)胞)。(已做)n 2、取一支5mlEP管,裝入糊狀物(基本裝滿),離心5min(10000rpm),棄去上清液n 沉淀用0.14mol/l NaCl-0.15mol/l EDTA溶液洗三次。每次加入溶液后用吸管吹打均勻再離心(同上),直到上清液無血細(xì)胞。n 棄上清液,所得沉淀為DNP(DNA蛋白復(fù)合物)粗制品n 3、向上述沉淀物加入0.14mol/L NaCl 0.15mol/L EDTA溶液5ml,分裝于2支10mlEP管,然后每管滴加25%SDS溶液0.5mL,邊
36、加邊振蕩。加畢,置60水浴20min (不停振蕩),直至溶液變得粘稠并略透明,取出冷卻至室溫。此步驟使核酸與蛋白質(zhì)分離。 n 4、每管加入5 mol/l NaCl溶液1mL,蝴蝶形振蕩5min。加入約1倍體積的氯仿異戊醇混合液,蝴蝶形振蕩10min,離心10min(4000rpm)。 n 此步驟后溶液分三個(gè)相:上層水相(DNA);中層變性蛋白質(zhì)相;下層有機(jī)相和殘余的RNA。 n 5、吸出上清液,棄去沉淀。向上清液中緩慢加入1.52倍體積的95%乙醇,DNA沉淀析出,離心(4000rpm)10分鐘n 用玻棒攪出的絲狀物則為粗DNA血糖的測(cè)定原理 無蛋白血濾液 葡萄糖 堿性銅試劑 Cu(OH) 2
37、 磷鉬酸試劑 磷鉬酸 葡萄糖 Cu(OH)2 Cu2O Cu2O 磷鉬酸 鉬藍(lán)鉬藍(lán)的藍(lán)色深淺與葡萄糖的含量成正比,用比色法可測(cè)定血糖的含量 操作 ?臨床意義 (mg/dl) 正常懷疑糠尿病 空腹血糖110110-139140 餐后兩小時(shí)血糖140140-199200 服糖后兩小時(shí)糖140140-199200 1、 無蛋白血濾液的制備:取干試管一支,準(zhǔn)確加入蒸餾水3.5ml,血液0.1ml,2/3NH2SO40.2ml,10Na2WO4 0.2ml,混勻,待有澄清液出現(xiàn)后,過濾,收集濾液備用編號(hào)標(biāo)準(zhǔn)管測(cè)定管空白管標(biāo)準(zhǔn)葡萄糖液(1.0ml = 0.025mg)2.0無蛋白濾液(ml)2.0蒸餾水(
38、ml)2.0堿性銅試劑(ml)2.02.02.0充分搖勻,置沸水浴準(zhǔn)確煮沸8分鐘,取出切勿搖動(dòng),置于冷水浴冷卻磷鉬酸試劑(ml)2.02.02.0混勻,放置3分鐘蒸餾水(ml)3.03.03.0 將各試管搖勻后,用紅色濾光片或620nm,以空白管校零點(diǎn),比色。課后思考題 Folin-吳法測(cè)定血糖的優(yōu)缺點(diǎn)是什么? 進(jìn)行比色法測(cè)定時(shí),如果測(cè)得樣品的A值超過100%,該如何處理,為什么?質(zhì)粒DNA的提取實(shí)驗(yàn)?zāi)康膌 掌握:質(zhì)粒DNA提取的原理和方法;l 熟悉:堿裂法提取質(zhì)粒的基本操作步驟;l 了解:質(zhì)粒小抽提取試劑盒的組成和實(shí)驗(yàn) 原理。 實(shí)驗(yàn)原理l 在pH12.0-12.6堿性環(huán)境中,線性的大分子量細(xì)
39、菌染色體DNA變性,共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA雖然氫鍵也發(fā)生斷裂,但兩條互補(bǔ)鏈仍會(huì)緊密纏繞結(jié)合在一起。 l 將pH調(diào)至中性并有高鹽濃度存在的條件下,染色體DNA之間交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。大部分DNA和蛋白質(zhì)在去污劑SDS的作用下形成沉淀,質(zhì)粒DNA迅速復(fù)性,仍然為可溶狀態(tài)。l 通過離心,可去除大部分細(xì)胞碎片染色體DNA、RNA及蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA尚在上清中,分離上清,用兩倍體積乙醇沉淀質(zhì)粒DNA。實(shí)驗(yàn)步驟加5mL培養(yǎng)物于10 mL EP管,12000 r/min×2min 除去上清,加入100 µL 溶液I,中懸浮細(xì)菌沉淀,并轉(zhuǎn)入1.5 mL EP管中。 加入
40、200µL 溶液II,快速顛倒數(shù)次,冰浴2 min 加入150µL 溶液III,溫和振蕩10s,冰浴5min,12000 r/min×5min轉(zhuǎn)移上清到新EP管,加入等體積酚/氯仿 /異戊醇,溫和振蕩,抽提2次,12000r/min×2min 上層水相轉(zhuǎn)移到新EP管,加入2倍體積無水冰乙醇(-20 冰箱中放置),顛倒混勻,12000r/min´10 min 棄上清,沉淀中加1 mL70%乙醇,12000g×2min 去上清,沉淀物于37 恒溫箱中干燥至透明狀,后于 - 20 保存、待用。主要試劑及作用溶
41、液:由葡萄糖、EDTA、Tris-HCl組成 (保護(hù)、緩沖) 葡萄糖的作用是增加溶液的粘度(懸浮細(xì)胞) EDTA 的作用是絡(luò)合掉鎂等二價(jià)金屬離子, 防止DNA酶對(duì)質(zhì)粒分子的降解作用(保護(hù)作用) Tris-HCl 使溶菌液維持溶菌作用的最適PH范圍(緩沖作用)溶液II:由SDS(十二烷基硫酸鈉)與 NaOH 組成(裂解、變性) SDS:? NaOH(pH>12):破壞細(xì)胞膜,裂解細(xì)胞溶液III:HAc和 KAc組成的高鹽溶液 (復(fù)性,分離) HAc溶液能中和溶液的堿性,使染色體DNA 變性而發(fā)生纏繞,并使質(zhì)粒DNA復(fù)性。 KAc會(huì)與SDS形成溶解度很低的鹽,并與蛋白質(zhì)形成沉淀而除去;溶液中
42、的DNA也會(huì)與蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物纏繞成大分子而與小分子質(zhì)粒DNA分離。實(shí)驗(yàn)結(jié)果及討論 l 。 PCR技術(shù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)概述(一)概念 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaciton, PCR),即PCR技術(shù),是近年來發(fā)展起來的一種在體外快速擴(kuò)增特定基因或DNA序列的方法。 二、PCR反應(yīng)的原理和步驟PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。 PCR由變性-退火-延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,
43、以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備; 2、模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;3、引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。 重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需24分鐘,23小時(shí)就能將待擴(kuò)目的片段富集106109倍。所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。 PCR的三個(gè)反應(yīng)步驟反復(fù)進(jìn)行,使DNA擴(kuò)增量呈
44、指數(shù)上升。平均擴(kuò)增效率的理論值為100%,但在實(shí)際反應(yīng)中平均效率達(dá)不到理論值。反應(yīng)初期,靶序列DNA片段的增加呈指數(shù)形式,隨著PCR產(chǎn)物的逐漸積累,被擴(kuò)增的DNA片段不再呈指數(shù)增加,而進(jìn)入線性增長(zhǎng)期或靜止期,即出現(xiàn)“停滯效應(yīng)”,這種效應(yīng)稱平臺(tái)期。PCR反應(yīng)體系的主要成分和作用l DNA聚合酶l 模板l 引物l dNTPl 緩沖體系(一)DNA聚合酶 Taq DNA聚合酶來源于嗜熱水生菌的重組體,與一般的聚合酶所不同的是在高溫狀態(tài)仍具有活性。 可分為兩大類: 1、具有校正功能的(有35核酸酶活性) 比如:Vent,pfu,pwo等 2、不具有校正功能的 (無3 5核酸酶活性) 比如:一般的Taq
45、 DNA聚合酶(二)模板 核酸模板的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標(biāo)本。一般臨床檢測(cè)標(biāo)本,可采用快速簡(jiǎn)便的方法溶解細(xì)胞,裂解病原體,消化除去染色體的蛋白質(zhì)使靶基因游離,直接用于PCR擴(kuò)增。RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。 (三)引物 引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增。*(六)PCR反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)體系 五、PCR的反應(yīng)條件控制(
46、一)PCR反應(yīng)的溫度和時(shí)間控制 1、變性溫度與時(shí)間 變性溫度低,解鏈不完全是導(dǎo)致PCR失敗的最主要原因。一般情況下,9394lmin足以使模板DNA變性,若低于93則需延長(zhǎng)時(shí)間,但溫度不能過高,因?yàn)楦邷丨h(huán)境對(duì)酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物完全變性,就會(huì)導(dǎo)致PCR失敗。2、退火(復(fù)性)溫度與時(shí)間 退火溫度與時(shí)間,取決于引物的長(zhǎng)度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長(zhǎng)度。引物的復(fù)性溫度可通過以下公式幫助選擇合適的溫度: Tm值(解鏈溫度)=4(G+C)2(A+T) 復(fù)性溫度=Tm值-(510) 在Tm值允許范圍內(nèi),選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合,提高PCR反應(yīng)的特異性。復(fù)性
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