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1、CompanyLOGO大腸桿菌大腸桿菌DNA聚合酶聚合酶 I生物0822 0814151008 肖樂(lè)大腸桿菌大腸桿菌DNA聚合酶聚合酶 I的活性的活性5-3DNA聚合酶活性15-3外切核酸酶活性23-5外切核酸酶活性35-3DNA聚合酶活性聚合酶活性 在引物RNA-OH末端,以dNTP為底物,按模板DNA上的指令由DNApol使DNA鏈沿5 3方向延伸。 3 Mg2+,dNTP 5 5 3 DNA聚合酶I5-3外切核酸酶活性外切核酸酶活性 從53方向水解DNA生長(zhǎng)鏈前方的DNA鏈,主要產(chǎn)生5-脫氧核苷酸。這種酶活性只對(duì)DNA上配對(duì)部分(雙鏈)磷酸二酯鍵有切割活力作用,方向是53。 3 Mg2+
2、 5 5 3 DNA聚合酶I3-5外切核酸酶活性外切核酸酶活性 由3端水解DNA鏈,反應(yīng)底物是帶3-OH的雙鏈DNA或單鏈DNA,其活性從3-OH端降解ds-DNA,可被5 3聚合活性封閉,也可被帶5磷酸的dNMP抑制 5 Mg2+ Mg2+,dNTP 3 3 5 DNA聚合酶I DNA聚合酶I活性能發(fā)生的反應(yīng)活性能發(fā)生的反應(yīng)切口平移置換反應(yīng)活性置換反應(yīng)置換反應(yīng) 如果只有一種dNTP存在,3 5外切核酸活性將從3-OH端降解DNA,而5 3聚合酶活性又在合成DNA,然后在該位置發(fā)生一系列的合成和外切反應(yīng),直到露出與該dNTP互補(bǔ)的堿基。 3 5外切酶活性 5 3 5 3聚合酶活性切口平移切口平
3、移 首先在鎂離子存在下用少量DNaseI處理雙鏈DNA模板,產(chǎn)生少量切口。在切口處利用大腸桿菌DNA聚合酶I的5-3外切核酸酶活性是切口沿5-3方向移動(dòng),同時(shí)5-3DNA聚合酶活性又不斷合成DNA。 5 Mg2+ DNaseI 3 5 dNTP 大腸桿菌DNA聚合酶I 3 應(yīng)用應(yīng)用3-端的末端標(biāo)記切口平移法標(biāo)記DNA合成cDNA的第二鏈3-端的末端標(biāo)記端的末端標(biāo)記 先用此酶的35核酸外切酶活性,切除凸出的3-粘端,形成5-凸出粘端;在以其53聚合酶活性使其使其補(bǔ)平,在高濃度dNTP的條件下,3-端的外切反應(yīng)與dNTP的攙入反應(yīng)達(dá)到平衡。若dNTP中有放射性標(biāo)記的核苷酸,即可使產(chǎn)物成為3-末端的帶標(biāo)記的DNA。切口平移法標(biāo)記切口平移法標(biāo)記DNA 在Dnase的作用的基礎(chǔ)上產(chǎn)生連內(nèi)切口,應(yīng)用此酶的53聚合酶活性和53外切酶活性的同步聯(lián)合反應(yīng),使切口沿DNA鏈從5-端向3-端移動(dòng)。若用聚合反應(yīng)的原料dNTP帶有放射性核素-32P,就能使生成的雙鏈帶有標(biāo)記物。根據(jù)此原理可做DNA雜交探針。合成合成cDNA的第二鏈的第二鏈 單鏈cDNA3-端可形成發(fā)卡結(jié)構(gòu),便于DNA聚合酶I發(fā)揮
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