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1、二、 真核基因的啟動(dòng)子 啟動(dòng)子是一段特定的直接與RNA聚合酶及其轉(zhuǎn)錄因子相結(jié)合、決定基因轉(zhuǎn)錄起始與否的DNA序列。不同的啟動(dòng)子對(duì)RNA聚合酶的親和力不同,所結(jié)合的反式作用因子(trans-acting factors)也不同,因此,基因轉(zhuǎn)錄活性也很不相同。.典型的原核啟動(dòng)子有四大要素 轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),-10區(qū),-35區(qū)和-10區(qū)與-35區(qū)之間的間隔。 原核基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)通常是嘌呤,其序列為CAT(A為起始位點(diǎn))。-10區(qū)是一個(gè)6堿基保守序列(常以-10為中心)。T80A95t45A60A50T96,有助于DNA的解鏈。-35區(qū)是另一個(gè)6堿基保守序列(常以-35為中心)。T82T84G78A65
2、C54a45研究表明,當(dāng)-10區(qū)和-35區(qū)中心位置相距16-18bp時(shí),該啟動(dòng)子的功能較強(qiáng);相距較近或較遠(yuǎn)時(shí),起始轉(zhuǎn)錄的功能都相應(yīng)減弱。 .真核基因啟動(dòng)子 真核生物有3類RNA聚合酶,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄3類不同的啟動(dòng)子。 由RNA聚合酶I負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的rRNA基因,啟動(dòng)子(I類)比較單一,由轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近的兩部分序列構(gòu)成。第一部分是核心啟動(dòng)子(core promoter),由-45+20位核苷酸組成,單獨(dú)存在時(shí)就足以起始轉(zhuǎn)錄。另一部分由-170-107位序列組成,稱為上游調(diào)控元件,能有效地增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率。 由RNA聚合酶負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的是5SrRNA、tRNA和某些核內(nèi)小分子RNA(snRNA),其啟動(dòng)子(類)組
3、成較復(fù)雜,又可被分為三個(gè)亞類。兩類5S rRNA和tRNA基因的啟動(dòng)子是內(nèi)部啟動(dòng)子(internal promoter),位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的下游,都由兩部分組成。第三類啟動(dòng)子由三個(gè)部分組成,位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游。 由RNA聚合酶II負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的II類基因包括所有蛋白質(zhì)編碼基因和部分snRNA基因,后者的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)與III類基因啟動(dòng)子中的第三種類型相似,編碼蛋白質(zhì)的II類基因啟動(dòng)子在結(jié)構(gòu)上有共同的保守序列。轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)沒有廣泛的序列同源性,但第一個(gè)堿基為腺嘌呤,而兩側(cè)是嘧啶堿基。這個(gè)區(qū)域被稱為起始子(initiator, Inr),序列可表示為Py2CAPy5。Inr元件位于-3+5。僅由Inr元件組成的啟動(dòng)子是具有可被RNA聚合酶II識(shí)別的最簡(jiǎn)單啟動(dòng)子形式。 多數(shù)II類啟動(dòng)子有一個(gè)被稱為TATA盒的共有序列,通常處于-30區(qū),相對(duì)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的位置比較固定。TATA盒存在于所有真核生物中,TATA盒是一
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