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文檔簡介

1、2021/6/71 2021/6/72 一束頻率為V0的入射光,照射到氣體液 體或透明晶體樣品上,絕大部分可以透過, 大約有0.1%的入射光光子與分子發(fā)生碰撞 后向各個(gè)方向散射。有一部分散射光發(fā)生 了光子與分子之間的能量交換,即非彈性 碰撞,散射的頻率不再等于V0,而是Vi, 這種散射現(xiàn)象稱為拉曼散射。根據(jù)這個(gè)原 理所獲得的散射光譜,稱為拉曼光譜。 2021/6/73 若入射光與基態(tài)分子相碰撞而發(fā)生拉曼散射,分 子從光子那里獲得能量,從振動(dòng)基態(tài)躍遷到振動(dòng) 的激發(fā)態(tài),而散射光子的能量減小,散射光的頻 率低于入射光的頻率,這種形式的拉曼散射稱為 Stokes輻射,相應(yīng)的光譜線稱為Stokes線。如

2、果 與入射光相碰撞的分子是處于振動(dòng)的激發(fā)態(tài),結(jié) 果分子交出能量給光子,散射光子的能量增強(qiáng), 散射光的頻率大于入射光的頻率,這種形式的拉 曼散射稱為反-Stokes輻射,相應(yīng)的譜線為反- Stokes線。 2021/6/74 在振動(dòng)光譜中有九個(gè)譜峰,按 波數(shù)遞減的方向命名 為酰胺A、B及酰胺I至VII帶,各種酰胺(Amide)頻率: 在3000cm-1以上,有酰胺A(3280cm-1)及酰胺B (3090cm-1 ) ;在1700cm-1以下有酰胺 (1650cm-1)酰胺(1550cm-1)酰胺(1300 1250cm-1)酰胺(627cm-1)酰胺(725cm-1)酰胺 (600cm-1)及

3、酰胺(206cm-1)。 2021/6/75 酰胺A 3280cm-1 酰胺B 3090cm-1 酰胺 1650cm-1 酰胺 1550cm-1 酰胺 13001250cm-1 C=O伸縮、CN 伸縮和NH面內(nèi) 彎曲振動(dòng) NH面內(nèi)變形及 CN伸縮振動(dòng) CH伸縮振動(dòng) 振動(dòng)譜帶 振動(dòng)波數(shù) 歸屬 N-H伸縮 N-H伸縮(費(fèi)米 共振) 2021/6/76 酰胺 627cm-1 O=CN面內(nèi)彎曲振動(dòng) 酰胺 725cm-1 NH面外彎曲 酰胺 600cm-1 C=O面外彎曲 酰胺 206cm-1 CN扭曲振動(dòng) 振動(dòng)譜帶 振動(dòng)波數(shù) 歸屬 2021/6/77 此外,還有可能存在CCH3伸縮振動(dòng)頻 率(9108

4、90cm-1)以及骨架振動(dòng)頻率 (500cm-1以下)。 2021/6/78 酰胺I帶各子峰所對(duì)應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu): Table2 FT-Raman frequencies of protein amide I bands and their assignments to different secondary structure 單位/cm-1 1624 1631 1637 1645 1654 指認(rèn) -折疊 -折疊 卷曲及轉(zhuǎn)角 無規(guī)卷曲 -螺旋 1663 1668 1678 1685 16901700 -折疊 -折疊 轉(zhuǎn)角 轉(zhuǎn)角 轉(zhuǎn)角 2021/6/79 此外,Lippert等人用已知二級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋

5、白質(zhì) (聚-L-賴氨酸)的拉曼光譜得到一組強(qiáng)度參數(shù), 然后用蛋白質(zhì)拉曼光譜的酰胺III和酰胺I(重水 溶液)譜帶強(qiáng)度建立了一組聯(lián)立方程,從而求 解蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。 2021/6/710 根據(jù)Lippert等的方法,以聚-L-賴氨酸的三種構(gòu) 象為模型,利用四階聯(lián)立方程組: C (protein)I 12 40 p ro tein=fI 1240+fI 1240+ fRI R 1240 C(protein)I 1632 protein=fI 1632 +fI 1632 +fRI R 1632 C(protein)I 1660 protein=fI 1660+f I 1660+fRI R 1660

6、 f+f+fR=1 2021/6/711 聚-L-賴氨酸三種構(gòu)象的酰胺譜帶(1240,1632, 1660)對(duì)CH21448cm-1模式的相對(duì)強(qiáng)度數(shù)據(jù) 水溶液 重水溶液 1240 1632 1660 聚-L-賴氨酸,-螺旋 0.00 0.80 0.55 聚-L-賴氨酸, -折疊 1.20 0.72 0.88 聚-L-賴氨酸,無序 0.60 0.08 0.78 注:這些數(shù)據(jù)是Lippert等的修正值 2021/6/712 另外,在多肽和蛋白質(zhì)的拉曼光譜中,譜帶850和 830是酪氨酸殘基的對(duì)未取代基的有關(guān)振動(dòng)。由于 環(huán)的呼吸振動(dòng)和面外彎曲振動(dòng)倍頻之間的費(fèi)米共振, 它們總是成雙成對(duì)的出現(xiàn),而且這兩

7、譜帶的強(qiáng)度比 可表征酪氨酸殘基所處的環(huán)境,并定量的表示它呈 “暴露式”或“埋入式”。 0.5Nbury+1.25Nexpo=I850/I830 Nbury + Nexpo = 1 2021/6/713 蛋白質(zhì)主要表現(xiàn)出九個(gè)吸收譜帶,其中酰胺I (16001700cm-1)是C=O伸縮、CN伸縮和 NH面內(nèi)彎曲振動(dòng)的貢獻(xiàn),對(duì)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的 研究最有價(jià)值,其振動(dòng)頻率受C=O和NH之間氫 鍵的影響,通過這個(gè)可以測(cè)定氨基酸鏈的二級(jí)結(jié) 構(gòu)。 酰胺I帶的歸屬: 2021/6/714 16501658 -螺旋 1640 1610 -折疊 1700 1660 -轉(zhuǎn)角 1650 1640 無規(guī)卷曲 2021/

8、6/715 但是H2O在1640附近的吸收對(duì)其造成很大影 響,目前可以采用吹掃,差減及氘代等方法 消除水的干擾。 自然界存在的蛋白質(zhì)是許多種不同構(gòu)象的多 縮氨基酸,這樣就會(huì)使蛋白質(zhì)的酰胺I很復(fù) 雜,主要是-螺旋,鏈和無規(guī)則多肽片段 引起的峰重疊。由于這種重疊組分帶的帶寬 很大,使人們不可能從測(cè)出譜帶中鑒定。 2021/6/716 酰胺III帶由于信號(hào)較弱,過去很少應(yīng)用于蛋 白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)定,但由于水再次吸收帶沒 有吸收峰,解決了嚴(yán)重的水汽干擾,不同二 級(jí)結(jié)構(gòu)在III帶的光譜性質(zhì)特征明顯,擬合過 程中易于將其分開。尤其對(duì)于I 帶中因峰重 疊而難以區(qū)分的螺旋和無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),在 III帶中得以明顯的分離。 2021/6/717 酰胺III帶譜峰歸屬: 13301290 -螺旋 12

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