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文檔簡(jiǎn)介
1、 人體基因組結(jié)構(gòu)和突變 染色質(zhì)免疫沉淀 考古學(xué) Meta-Genomics DNA測(cè)序 血漿微量DNA測(cè)序 基因組DNA的隨機(jī)打斷 DNA片段的末端修復(fù) 將A堿基加入到DNA片段的3末端 在DNA片段的末端加上特定接頭 PCR擴(kuò)增連上接頭的DNA片段 文庫(kù)檢測(cè) DNA在Cluster Station的成簇?cái)U(kuò)增 IlluminaGenome Analyzer上的測(cè)序 生物信息組裝/分析 基因組DNA隨機(jī)打斷特定大小片段(2-10kb范圍可選) 末端修復(fù) 生物素標(biāo)記 環(huán)化 獲得來(lái)自大片段兩端共計(jì)400-600 bp的DNA片段 修飾、加接頭 PCR擴(kuò)增連上接頭的DNA片段 文庫(kù)檢測(cè) DNA在Clu
2、ster Station上的成簇?cái)U(kuò)增 Illumina Genome Analyzer上的測(cè)序 生物信息組裝/分析 從總 RNA中分離 small RNA 5接頭連接和純化 3接頭連接純化 RT-PCR擴(kuò)增 Small RNA文庫(kù)的純化 文庫(kù)的檢測(cè) DNA在Cluster Station成簇?cái)U(kuò)增 Illumina Genome Analyzer上的測(cè)序 生物信息學(xué)分析 mRNA的分離和cDNA第一鏈的合成 cDNA第二鏈的合成 限制性?xún)?nèi)切酶NlaIII的酶切 連接GEX NlaIII Adapter 1 限制性?xún)?nèi)切酶 MmeI 的酶切 連接GEX Adapter 2 Adapter連接cDNA
3、產(chǎn)物和PCR富集 文庫(kù)的檢測(cè) DNA在Cluster Station上的成簇?cái)U(kuò)增 IlluminaGenome Analyzer上的測(cè)序 生物信息學(xué)分析 Total RNA的DNase I 酶消化 mRNA 分離和隨機(jī)打斷 cDNA第一鏈和第二鏈的合成 DNA片段的末端修復(fù) 將“A”堿基加入到DNA片段的3末端 在DNA片段的末端加上特定接頭 PCR擴(kuò)增連上接頭的DNA片段 文庫(kù)的檢測(cè) DNA在Cluster Station上的成簇?cái)U(kuò)增 IlluminaGenome Analyzer上的測(cè)序 生物信息學(xué)分析 基因組DNA隨機(jī)打斷 DNA片段的末端修復(fù) 將 A 堿基加入到 DNA片段的3末端 D
4、NA片段末端加上特別處理的甲基化接頭 重亞硫酸鹽處理 去鹽處理 PCR擴(kuò)增連上接頭的DNA片段 文庫(kù)檢測(cè) DNA 在Cluster Station上的成簇?cái)U(kuò)增 Illumina Genome Analyzer上的測(cè)序 生物信息學(xué)分析 染色質(zhì)免疫共沉淀 目的DNA片段 DNA片段的末端修復(fù) 將 A 堿基加入到 DNA片段的3末端 DNA片段末端加上接頭 PCR擴(kuò)增加上接頭的DNA片段 文庫(kù)檢測(cè) DNA在Cluster Station成簇?cái)U(kuò)增 Illumina Genome Analyzer上的測(cè)序 生物信息學(xué)分析 Meta基因組的提取 DNA隨機(jī)打斷 DNA片段末端修復(fù) 將A堿基加入到DNA片段的3末端 在DNA片段的末端加上接頭 純化連接產(chǎn)物 PCR擴(kuò)增連上接頭的DNA片段 文庫(kù)的檢測(cè) DNA在Cluster Station的成簇?cái)U(kuò)增 Illumina Genome Analyzer上的測(cè)序 生物信息組裝/分析 收集10-15ml孕婦外周血 提取血漿中游離DNA Q-PCR定量總DNA含量 構(gòu)建DNA文庫(kù) Agilent和Q-PCR檢測(cè)文庫(kù)濃度 Cluster制備和Genome Analyz
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