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1、專(zhuān)題5DNA和蛋白質(zhì)技術(shù) 課題2 2多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增DNADNA片段 欄目鏈接 欄目鏈接 在刑事偵破案件中常需要對(duì)樣品DNA進(jìn)行分析,PCR技 術(shù)能快速擴(kuò)增DNA片段,在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)復(fù)制出上百萬(wàn)份的DNA 拷貝,有效地解決了因?yàn)闃悠分蠨NA含量太低而難以對(duì)樣品進(jìn) 行分析研究的問(wèn)題?,F(xiàn)在PCR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于遺傳病的診斷、 刑偵破案、古生物學(xué)、基因克隆和基因測(cè)序。 欄目鏈接 請(qǐng)思考: 1PCR技術(shù)的基本原理是什么? 2PCR反應(yīng)過(guò)程是怎樣的? 欄目鏈接 欄目鏈接 1生物體內(nèi)DNA復(fù)制的條件 (1)原料: _。 (2)模板:解旋后的每一條_。 (3)酶:打開(kāi)DNA雙鏈的_和合成DNA單鏈的 _。
2、(4)引物:為DNA聚合酶的起始提供_末端。 一、PCR的原理及反應(yīng)過(guò)程 4種脫氧核苷酸 DNA母鏈 解旋酶 DNA聚合酶 3 欄目鏈接 2PCR擴(kuò)增的原理 (1)概念:PCR即多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一種體外 _的技術(shù)。它能以極少量的DNA為模板,在幾 小時(shí)內(nèi)復(fù)制出上百萬(wàn)份的DNA拷貝。 (2)原理: DNA變性:在_的溫度范圍內(nèi),DNA的 _結(jié)構(gòu)將解體,雙鏈分開(kāi),這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為變性。 迅速擴(kuò)增DNA片段 80 100 雙螺旋 欄目鏈接 DNA復(fù)性:當(dāng)溫度緩慢降低后,兩條彼此分離的DNA鏈 又會(huì)重新_,這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為復(fù)性。 DNA合成:DNA聚合酶從引物_端開(kāi)始延伸 DNA鏈,DNA的合成方向總是從子
3、鏈的_端向_端 延伸。 結(jié)合成雙鏈 3 5 3 欄目鏈接 (3)條件: 模板:解旋后的每一條_。 引物:能分別與_結(jié)合的兩種引物。 原料: _。 酶:_DNA聚合酶。 其他條件:需要穩(wěn)定的_和能自動(dòng)調(diào)節(jié)溫度的溫控設(shè) 備。 DNA母鏈 兩條模板鏈 4種脫氧核苷酸 耐熱的 緩沖溶液 欄目鏈接 90 50 堿基互補(bǔ)配對(duì) 欄目鏈接 72 DNA聚合酶 堿基互補(bǔ)配對(duì)原則 欄目鏈接 1實(shí)驗(yàn)用具 (1)PCR儀:該儀器能自動(dòng)調(diào)控_,實(shí)現(xiàn)DNA的擴(kuò) 增。如果沒(méi)有PCR儀,可用3個(gè)_水浴鍋代替,操作時(shí) 按程序在3個(gè)水浴鍋中來(lái)回轉(zhuǎn)移PCR反應(yīng)的微量離心管。 (2)微量離心管:總?cè)莘e為_(kāi)mL,實(shí)際上是進(jìn)行 PCR反
4、應(yīng)的場(chǎng)所。 (3)微量移液器:用于向微量離心管中轉(zhuǎn)移PCR配方中的 液體,每吸取一種試劑后其上的一次性吸液槍頭都必須更換。 二、PCR的實(shí)驗(yàn)操作 溫度 恒溫 0.5 欄目鏈接 2實(shí)驗(yàn)步驟 用微量移液器 輕輕彈擊 欄目鏈接 10 欄目鏈接 3DNA含量的測(cè)定 (1)原理:利用DNA在_的紫外線波段有一強(qiáng)烈的 吸收峰。 (2)計(jì)算公式: DNA含量(g/mL)_稀釋倍數(shù)。 點(diǎn)撥:在PCR實(shí)驗(yàn)操作中,常用微量離心管作為反應(yīng)場(chǎng)所, 在操作時(shí),用微量移液器按照PCR反應(yīng)體系的配方在微量離心 管中依次加入各組分,再設(shè)計(jì)好PCR儀的循環(huán)程序就可以了。 260 nm 50(260 nm的讀數(shù)) 欄目鏈接 欄目
5、鏈接 一、生物體內(nèi)的DNA復(fù)制與PCR反 應(yīng)的比較 欄目鏈接 DNA單鏈有方向性,DNA母鏈的3端對(duì)應(yīng)著子鏈 的5端,即DNA的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械摹?注意不同酶的作用:解旋酶的作用是使DNA兩條鏈 的氫鍵斷開(kāi),而DNA聚合酶與DNA連接酶都是催化形成磷酸二 酯鍵的。 DNA聚合酶是將單個(gè)核苷酸加到已有的單鏈片段的 3端上,需要模板,而DNA連接酶連接的是兩條DNA片段的 缺口,不需要模板。 特 別 提 醒 欄目鏈接 例1標(biāo)準(zhǔn)的PCR過(guò)程一般分為變性、復(fù)性、延伸三大步, 這三大步需要的溫度依次是() A92 、50 、72 B72 、50 、92 C50 、92 、72 D80 、50 、72
6、欄目鏈接 解析:當(dāng)溫度上升到90 (9096 )以上時(shí),雙鏈DNA 解聚為單鏈,稱(chēng)之為變性;當(dāng)溫度下降到50 (4060 )左右 時(shí),兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條單鏈DNA結(jié)合;當(dāng)溫度 上升到72 (7075 )時(shí),溶液中的四種脫氧核苷酸(A、T、 C、G)在Taq DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則合 成新的DNA鏈,稱(chēng)為延伸。 答案:A 欄目鏈接 變式 訓(xùn)練 1DNA的復(fù)制需要引物,其主要原因是() A可加快DNA的復(fù)制速度 B引物可與DNA母鏈通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合 C引物的5端有助DNA聚合酶的延伸DNA鏈 DDNA聚合酶只能從3端延伸DNA鏈 欄目鏈接 變式 訓(xùn)練 解析:DN
7、A的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械模瑸榱嗣鞔_地表示 DNA的方向,通常將DNA的羥基(OH)末端稱(chēng)為3端,而磷 酸基團(tuán)的末端稱(chēng)為5端。DNA聚合酶不能從5端開(kāi)始合成 DNA,而只能從3端延伸DNA鏈。因此,DNA復(fù)制需要引物。 當(dāng)引物與DNA母鏈通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合后,DNA聚合酶就 能從引物的3端開(kāi)始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子 鏈的5端向3端延伸。 答案:D 欄目鏈接 二、PCR技術(shù)的基本原理 類(lèi)似于DNA的天然復(fù)制過(guò)程,由變性復(fù)性延伸三個(gè)基 本反應(yīng)步驟構(gòu)成: 1模板DNA的變性 模板DNA經(jīng)加熱至95 左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙 鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的DNA的雙鏈解開(kāi),使之成為單鏈,以
8、便 它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備。 2模板DNA與引物的退火(復(fù)性) 模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55 左右,引 物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合。 欄目鏈接 欄目鏈接 3引物的延伸 DNA模板引物結(jié)合物在Taq DNA聚合酶的作用下,以四種 脫氧核苷酸為反應(yīng)原料,DNA母鏈為模板,按堿基配對(duì)與半保 留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。 重復(fù)循環(huán)變性復(fù)性延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù) 制鏈”,而且這種新鏈又成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán) 需24 min,23 h就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。 欄目鏈接 PCR擴(kuò)增過(guò)程中的易錯(cuò)點(diǎn) PCR過(guò)程中
9、無(wú)解旋酶,破壞氫鍵需要升高溫度才能打 開(kāi)氫鍵,但此時(shí)的溫度還不能破壞磷酸二酯鍵,因此,熱變性 后是DNA單鏈,并未分解成單體。 復(fù)性時(shí)只是在引物和DNA單鏈之間形成氫鍵,兩條單 鏈之間并未形成氫鍵,因此復(fù)性后,無(wú)雙鏈DNA分子形成。 特 別 提 醒 欄目鏈接 三、PCR的實(shí)驗(yàn)操作 1操作步驟 (1)按PCR反應(yīng)體系的配方配制所需試劑。 (2)用微量移液器按照配方在微量離心管中依次加入各組 分。 (3)蓋嚴(yán)離心管口的蓋子,用手指輕輕彈擊管壁。 (4)將微量離心管放在離心機(jī)上,離心約10 s。 欄目鏈接 (5)將離心管放在PCR儀上,設(shè)置好PCR儀的循環(huán)程序。 以上過(guò)程可以概括為準(zhǔn)備、移液、混合、
10、離心、反應(yīng)五 大步。 欄目鏈接 2實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析 (1)實(shí)驗(yàn)中DNA含量的測(cè)定。 稀釋?zhuān)喝? L PCR反應(yīng)液,加入98 L蒸餾水,即將 樣品稀釋了50倍。 對(duì)照調(diào)零:以蒸餾水作空白對(duì)照,在波長(zhǎng)260 nm處, 將紫外分光光度計(jì)的讀數(shù)調(diào)至零。 測(cè)定:取DNA稀釋液100 L至比色杯中,測(cè)定260 nm 處的光吸收值。 計(jì)算:DNA含量(g/mL)50(260 nm的讀數(shù))稀釋 倍數(shù)。 欄目鏈接 (2)理論上DNA擴(kuò)增數(shù)目的計(jì)算。 DNA擴(kuò)增與DNA復(fù)制一樣,呈指數(shù)擴(kuò)增。若只有一個(gè) DNA為模板,則復(fù)制n次后有2n個(gè);若一開(kāi)始有a個(gè)模板,則復(fù) 制n次有a2n個(gè)DNA。 (3)DNA擴(kuò)增是否成功。 檢測(cè)DNA片段擴(kuò)增情況可以采用上述方法,也可以采用 電泳檢測(cè)的方法,可以通過(guò)在紫外線下直接觀察DNA帶的分布 及粗細(xì)程度來(lái)評(píng)價(jià)擴(kuò)增的效果。如果擴(kuò)增不成功,則要分析失 敗原因。可能的原因有:漏加了PCR的反應(yīng)成分、各反應(yīng)成分 的用量不當(dāng)、PCR程序設(shè)置不當(dāng)?shù)取?欄目鏈接 例2下列操作過(guò)程的敘述中錯(cuò)誤的是() APCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭、緩沖液
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