CBMWeb中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫.ppt

中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫 （Chinese BioMedical Literature Database）簡稱（CBM）,一、概述,中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫（CBMdisc）是中國醫(yī)學科學院醫(yī)學信息研究所開發(fā)研制的綜合性醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫收錄1978年以來1600多種中國生物醫(yī)學期刊、匯編和學術(shù)會議論文的文獻題錄，年報道量約40余萬篇，總計350余萬篇。該庫涵蓋了中文科技資料目錄-醫(yī)藥衛(wèi)生、中文生物醫(yī)學期刊文獻數(shù)據(jù)庫（CMCC）中收錄的所有文獻題錄。自1995年起，70%的文獻帶有文摘。文獻內(nèi)容涉及基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、藥學、中醫(yī)學及中藥學等生物醫(yī)學各個領域。,中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫的全部題錄均根據(jù)美國國立醫(yī)學圖書館的醫(yī)學主題詞表(即MeSH詞表)，以及中國中醫(yī)研究院圖書情報研究所出版的中醫(yī)藥學主題詞表進行了主題標引，并根據(jù)中國圖書館分類法醫(yī)學專業(yè)分類表第四版R類進行了分類標引。,二、數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)與著錄項目,CBMdisc數(shù)據(jù)庫2007年有11個文檔： CBMdisc07（2007.012007.8） CBMdisc06（2006.012006.12） CBMdisc05（2005.012005.12） CBMdisc04（2004.012004.12） CBMdisc03（2003.012003.12） CBMdisc02（2002.012002.12） CBMdisc01（2001.012001.12） CBMdisc2K（2000.012000.12） CBMdisc99（1998.011999.12） CBMdisc97（1995.011997.12） CBMdisc94（1978.011994.12）,CBMdisc數(shù)據(jù)庫的記錄包括30多個可檢索數(shù)據(jù)項,包括中文題目、英文題目、著者、第一著者、著者單位、期刊、核心期刊、出版年卷期、參考文獻、資助類別、關(guān)鍵詞、主題詞、特征詞、分類號等。,下面列出的是部分數(shù)據(jù)項（字段）的英文、中文檢索標識符，以及注釋：,CL 分類號 TI 中文題目 TT 英文題目 AU 著者 AD 地址 (第一著者地址) AB 文摘 IS ISSN (國際期刊代碼) (SO) 出處 (復合字段：TA,PY,VI,IP,PG) MH 主題詞 (MMH) MMH (主要概念主題詞) TW 關(guān)鍵詞,圖A CBMWeb題錄著錄詳細格式界面,三、檢索功能、途徑與方法（CBMwin4.0）,（一）檢索功能 1兼容性好 2詞表輔助檢索功能 3檢索入口多 4檢索功能完備 5全文獲取,（二）檢索途徑與方法,1基本檢索 2主題詞檢索 3分類檢索 4期刊檢索 5作者檢索 6索引檢索 7定題檢索,四、檢索結(jié)果的顯示與輸出,1顯示結(jié)果 2輸出與保存 3打印,五、CBMdisc檢索實例分析,例（一）卡托普利治療老年人高血壓（檢索年限：19782006.7）見圖37、圖38、圖39。 序號 命中文獻數(shù) 檢索表達式 #1 4359 卡托普利擴展全部樹/全副主題詞 #2 47870 高血壓擴展全部樹/ 全部副主題詞 #3 1270 #1 AND #2 #4 174 #3限定老年人；人類 #5 92746 老年人 #6 180 #3 AND #5 #7 88678 CT：老年人 #8 175 #3 AND #7 #9 180 #4 OR #6 OR #8 #10 1660 卡托普利 AND 高血壓 #11 210 卡托普利 AND 高血壓 AND 老年人,圖37 CBMWeb例（一）檢索策略,圖38 CBMWeb例（一）檢索結(jié)果顯示界面,圖39 CBMWeb例（一）檢索結(jié)果全文顯示界面,例（二）造血干細胞移植治療白血病（檢索年限：19782006.7）見圖40、圖41、圖42。 序號 命中文獻數(shù) 檢索表達式 #1 27277 白血病擴展全部樹/全部副主題 #2 2533 造血干細胞移植擴展全部樹/全部副主題 #3 456 #1 AND #2 #4 674 白血病 AND造血干細胞移植 #5 31196 白血病 #6 2825 造血干細胞移植 #7 674 #5 AND #6 #8 674 #3 OR #4,圖40 CBMWeb例（二）檢索策略,圖41 CBMWeb例（二）檢索結(jié)果顯示界面,圖42 CBMWeb例（二）檢索結(jié)果全文顯示界面,1心肌梗塞的血液動力學研究 2尼莫地平治療老年人高血壓 3小兒血液透析的護理 4口腔潰瘍的遺傳學研究 5甲硝唑治療牙周炎 6殼聚糖抗幽門螺桿菌的實驗研究 7抗菌新藥甲磺酸加替沙星的藥效學實驗研究 8胃癌組織血管生長因子表達與微血管密度的關(guān)系 9膽管結(jié)石的腹腔鏡手術(shù)治療 10納洛酮治療蛛網(wǎng)膜下腔出血,The End,中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)與目前流行的MEDLINE光盤檢索系統(tǒng)及相應的Internet 檢索系統(tǒng)PubMed具有良好的兼容性。,返回,檢索系統(tǒng)具有多種詞表輔助檢索功能，建有主題詞表、中英文主題詞輪排表、分類表、期刊表、索引詞表、作者表等多種詞表，且有豐富的注釋信息。,返回,檢索入口有：主題詞檢索、分類檢索、關(guān)鍵詞檢索、鏈接檢索、著者檢索地址、機構(gòu)檢索、期刊檢索、文獻類型檢索、資助項目檢索與參考文獻檢索 。,返回,CBM具有定題檢索功能；限定檢索功能；期刊庫定制功能；截詞檢索、通配符檢索，各種邏輯組配檢索功能；多種排序、顯示、拷盤、打印輸出功能；支持檢索策略的修改、保存、調(diào)用功能；具有選庫及多文檔檢索功能。,返回,利用中文期刊文獻數(shù)字對象唯一標識符技術(shù)和XML技術(shù)，與維普全文數(shù)據(jù)庫鏈接，實現(xiàn)了全文獲取功能，對于1989年以前的數(shù)據(jù)，提供人工全文服務。,返回,（1）任意字詞檢索 （2）字段限制符、范圍運算符和通配符檢索 （3）邏輯算符組配檢索 （4）限定檢索,返回,主題詞檢索主要是根據(jù)美國國立醫(yī)學圖書館的醫(yī)學主題詞表(即MeSH詞表)，以及中國中醫(yī)研究院圖書情報研究所出版的中醫(yī)藥學主題詞表進行了主題分析、標引，主要主題詞用*加以標識，詞表對表達文獻內(nèi)容的主題概念、名詞術(shù)語進行了規(guī)范化處理，還配備了副主題詞表與主題詞組配，檢索時盡量采用詞表的規(guī)范化主題詞、副主題詞進行檢索，以提高查全率和查準率。,（1）主題詞檢索 （2）主題詞輪排表檢索 A中文主題詞輪排表 B英文主題詞輪排表 C主題詞擴展檢索和非擴展檢索 D主題詞加權(quán)檢索和非加權(quán)檢索 E主題詞/副主題詞組配檢索 F副主題擴展檢索 G主題詞注釋表檢索,返回,分類表根據(jù)中國圖書館分類法醫(yī)學專業(yè)分類表第四版R類進行了分類標引。 部分類目根據(jù)需要依據(jù)中國圖書館分類法第四版進行了仿分。,（1）分類表使用注意幾點 A仿分類目： 例如： R34 醫(yī)學生物化學與分子生物學部分類目按Q5生物化學仿分，例如：蛋白質(zhì)為Q51，仿分類號為R341。 R35人體生物物理學按Q6生物物理學仿分，例如：生物光學為 Q63，仿分類號為R353。 R725小兒內(nèi)科學按R5內(nèi)科學仿分，例如：小兒傳染病為R725.1；小兒先天性心臟病為R725.411。 R726小兒外科學按R6外科學仿分，例如：小兒腹部外科學為R726.56；小兒腎臟手術(shù)為R726.992。 R932中藥學用R28，例如：植物藥為R282.71；中藥化學成分為R284.1；人參湯為R289.5。,B交替類目 以“ ”標識交替類目，以注釋說明采用的正式類目，例如：R214 氣功保健宜入R247.44；性病淋巴肉芽腫入 R759.5 等。 C動物實驗與實驗動物 凡文獻中涉及到動物、獸醫(yī)學采用主類號R-332，這一類號可以單獨檢索，也可與主類號組配檢索，例如：動物傳染病，用R51和R-332檢索。,D地理名稱 地理名稱為RZ類，排列在分類表的最后，中國地理名稱包括各省(市)、自治區(qū)，例如：RZ2中國；RZ21北京市；RZ231遼寧省；等等?？梢詥为殭z索，也可以與主類號組配檢索，例如：北京市病毒性肝炎的流行病學調(diào)查，采用 R512.601 和 RZ21 檢索。,（2）分類表檢索 點擊窗口“分類”按鈕進入分類檢索界面，可利用聯(lián)機分類表進行檢索，選擇檢索入口：分類導航、分類詞和分類號。輸入檢索詞，點擊“瀏覽”按鈕，系統(tǒng)顯示分類表?？蛇x擇擴展不擴展檢索，擴展表示對該類號及其下位類號進行查找，不擴展表示僅對該類檢索。見圖12、圖13、,可進行復分組配檢索：點擊“檢索”按鈕，系統(tǒng)彈出“選擇復分表”，該窗口最上面顯示了與復分號組配的主類號，下面列出可與當前主類號組配的所有復分號，選相應復分號與主類號組配，選擇“全部復分”：表示檢索當前主類號和復分號組配及不組配復分的文獻；選擇“無復分”：表示檢索與當前主類號無復分組配的文獻；選擇某一復分號：表示僅檢索與當前主類號組配復分號的文獻。見圖14、圖15。,圖12 CBMWeb分類檢索界面,圖13 CBMWeb分類檢索分類表顯示界面,圖14 CBMWeb分類檢索選擇復分號檢索界面,圖15 CBMWeb分類檢索結(jié)果顯示界面,返回,（1）期刊表檢索 （2）期刊代碼檢索更名的期刊 （3）期刊主題詞檢索 （4）期刊注釋信息 （5）核心期刊檢索,返回,（1）作者表檢索 點擊主頁面“作者檢索”，在輸入框內(nèi)輸入作者名或名稱片段，點擊“查找”按鈕，系統(tǒng)顯示包含檢索詞的作者列表。選擇作者名，使其反顯，點“查找”按鈕，即可檢索出該作者的文獻。見圖20、圖21。 （2）第一著者的檢索 點擊某作者第一作者的圖標，則檢索出該作者作為第一作者發(fā)表的文獻。見圖22。 （3）在“基本檢索”頁面著者的檢索 在“基本檢索”頁面選擇“作者”檢索入口，也可查找某作者的文獻。,圖20 CBMWeb作者檢索界面,圖21 CBMWeb作者檢索作者列表界面,圖22 CBMWeb作者檢索第一作者檢索結(jié)果顯示界面,返回,索引詞表顯示索引詞、命中文獻數(shù)、出現(xiàn)數(shù)。命中文獻數(shù)指文獻篇數(shù)，出現(xiàn)數(shù)指該索引詞的詞頻數(shù)。 點擊 主頁面“索引檢索”按鈕進入索引詞檢索界面，輸入檢索詞，點擊“查找”按鈕，顯示索引詞列表，選中檢索詞點擊“查找”按鈕，就可對索引詞表的詞進行檢索。也可直接通過瀏覽索引詞表的方式進行選詞檢索。見圖23、圖24、圖25。 索引詞表檢索僅在默認字段進行，即：題目、文摘、關(guān)鍵詞、地址、主題詞、刊名字段，而索引表顯示的命中文獻數(shù)為所有字段的檢出結(jié)果，故索引表的檢出文獻數(shù)與索引表中顯示的命中文獻數(shù)有時不一致。,圖23 CBMWeb索引檢索界面,圖24 CBMWeb索引檢索索引詞列表界面,圖25 CBMWeb索引檢索結(jié)果界面,返回,定題檢索是定制和跟蹤某一課題的最新文獻。 定題檢索的步驟如下： （1）制訂檢索策略：點擊主頁面“檢索史”按鈕，顯示已有的檢索策略，最多能夠保存1000條檢索策略, 每頁最多顯示100條檢索策略?？蓮闹羞x擇一個或多個檢索式并用邏輯算符 AND、OR 或NOT組成更恰當?shù)臋z索策略, 如 #1 and #2 或選擇相應的邏輯算符按鈕。超時退出系統(tǒng), 檢索歷史仍然保留, 您可繼續(xù)檢索。 如選擇“退出系統(tǒng)”, 檢索歷史清除。見圖26。,（2）登錄定題檢索畫面：初次使用先點擊“新注冊”，進入定題檢索用戶注冊主頁面，輸入“用戶名”、“密碼”和“重復密碼”，點擊“注冊”按鈕。見圖27、圖28。 （3）保存檢索策略：登錄定題檢索后，進行檢索策略存儲，在輸入框內(nèi)輸入這次檢索策略的名稱，也就是給該檢索策略取文件名，點擊“存儲檢索策略”。還可定制多個檢索策略，也可通過瀏覽檢索史，修改組織原有的檢索策略。見圖29。,（4）檢索策略調(diào)用：登錄定題檢索后，先前已經(jīng)保存的檢索策略名稱會顯示在頁面下方，可以點擊亮顯的檢索策略名稱瀏覽其對應的檢索式集合?？蛇x擇一個或多個檢索策略文件進行重新檢索、最新文獻檢索或刪除該檢索策略。 “最新文獻檢索”按鈕：是對末次檢索后至今數(shù)據(jù)庫中新添加的文獻進行檢索， 以追蹤獲取該課題的最新文獻。檢索后記錄下了更新日期。 “重新檢索”按鈕：是對數(shù)據(jù)庫中的所有文獻再次進行檢索。是定題檢索的一個附加功能。 “刪除檢索策略”按鈕：將不再需要的檢索策略文件刪除，必須經(jīng)常整理檢索策略。,圖26 CBMWeb檢索史界面,圖27 CBMwin定題檢索用戶登錄界面,圖28 CBMWeb定題檢索用戶注冊界面,圖29 CBMWeb定題檢索界面,圖30 CBMWeb定題檢索界面,返回,在檢索輸入框可輸入任意中英文字、詞、數(shù)字、帶有通配符的字詞和檢索史的序號如：#1。 檢索范圍由“檢索”后下拉菜單中的選項所決定，系統(tǒng)的默認狀態(tài)是“缺省”。見圖1。 缺省字段：表示輸入的檢索詞同時在中文題目、文摘、作者、主題詞、特征詞、關(guān)鍵詞、期刊這些主要字段檢索。 全部字段：表示輸入的檢索詞同時在所有可檢索的字符型字段中查找。 指定字段：表示輸入的檢索詞僅在某一指定字段內(nèi)檢索，如中文標題、作者、地址、期刊等。見圖2。,圖1 CBMWeb基本檢索界面,圖2 CBMWeb基本檢索結(jié)果顯示界面,返回,A可以不通過“檢索”后下拉菜單選擇檢索字段，而是在子窗口中輸入帶有字段限制符或范圍運算符的檢索式進行檢索。該系統(tǒng)使用的字段限制符用IN或=，使用格式為：檢索詞IN字段標識符，字段標識符可以是中文或英文，或字段標識符=檢索詞。例如：輸入“胃炎 IN TI”或“胃炎 IN 中文題目”，或輸入“張建 IN AU”，可檢出命中文獻中的著者必含有“張建”二字，可能包括“張建華、張建明等，此為非精確檢索。也可用“=”精確檢索，如：“AU=張建”，可檢出名叫張建的所有文獻。,B還可用范圍算符限定檢索選擇年代范圍。范圍算符包括以下幾個： (大于)； =(大于等于) ；(指定范圍)。 例如：輸入“PY=2002或 PY=2002-2004”可檢出文獻文獻出版年為2002、2003、2004年的所有文獻。,C可用單字通配符 ( ? )用半角的問號： 替代一個字符進行檢索。 例如：輸入“血?動力”，可檢索出含有以下字符串的文獻：血液動力、血流動力等等。 D任意通配符 ( * )： 替代任意個字符進行檢索。 例如：輸入“肝炎*疫苗”，可檢索出含有以下字符串的文獻：肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎減毒活疫苗、肝炎滅活疫苗等等。,返回,A邏輯算符的含義 AND: 檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B，常 用來縮小檢索范圍，提高查準率。 例：糖尿病 AND 胰島素 OR: 檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B，常用來擴 大檢索范圍，提高查全率。 例：糖尿病 OR 白內(nèi)障 AND NOT: 在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B 的記錄，常用來縮小檢索范圍，增強專指性，提高查準率。 例：高血壓 AND NOT 腦血管意外 B優(yōu)先級 優(yōu)先級的順序依次為：( ) AND NOT AND OR C. 邏輯組配檢索界面見圖3、圖4、圖5。,圖3 CBMWeb檢索史顯示界面,圖4 CBMWeb邏輯組配檢索界面,圖5 CBMWeb邏輯組配檢索結(jié)果界面,返回,可對已檢索出的文獻內(nèi)容再進一步的限定檢索，點擊“限定檢索”按鈕，對“限定檢索對話框”的內(nèi)容進行選定，點“確認”按鈕。見圖6、圖7。 限定檢索內(nèi)容劃分為若干組，有年代、文獻類型、題錄摘要、核心期刊、年齡組特征詞、性別特征詞、特征詞人類和動物、特征詞體外研究與特征詞妊娠。,圖6 CBMWeb限定檢索界面,圖7 CBMWeb限定檢索結(jié)果顯示界面,返回,點擊主頁面“主題檢索”按鈕進入主題詞檢索界面，輸入“主題詞” 點“查找”按鈕，顯示含該檢索詞的輪排表。在輪排表選擇主題詞，選擇是否加權(quán)，是否擴展，系統(tǒng)彈出“副主題詞表”。在“副主題詞表”選擇副主題詞，選擇是否擴展副主題詞，點“主題檢索”按鈕，就可進行主題詞檢索。 例如：欲查找有關(guān)“糖尿病藥物治療”方面的文獻。見圖8、圖9、圖10、圖11。,圖8 CBMWeb 主題檢索界面,圖9 CBMWeb主題檢索中文主題詞輪排表顯示界面,圖10 CBMWeb 主題檢索副主題詞表顯示界面,圖11 CBMWeb 主題檢索結(jié)果顯示界面,返回,默認狀態(tài)為在中文主題詞輪排表檢索, 在輸入框鍵入檢索詞，點“查找”按鈕，系統(tǒng)顯示含有該檢索詞的中文主題詞輪排表。見圖9。 中文主題詞輪排表包括中文主題詞和款目詞(同義詞)，詞條中帶有“見”字時，前面的詞為主題詞的同義詞，后面的詞為正式主題詞。,返回,系統(tǒng)支持用英文主題詞檢索。在檢索入口選擇“英文主題詞”檢索方式，系統(tǒng)轉(zhuǎn)入“英文主題詞輪排表”，在輸入框鍵入檢索詞，點“查找”按鈕，系統(tǒng)顯示含有該檢索詞的英文主題詞輪排表。 英文主題詞輪排表包括英文主題詞和款目詞(同義詞)，及主題詞中譯名。詞條中有“=”時，前面的詞為英文主題詞，后面為主題詞中譯名。詞條中帶有“見”字時，前面的詞為英文同義詞，后面為該同義詞所見的主題詞的中譯名。,返回,擴展檢索指對當前主題詞及其所有下位主題詞進行檢索，非擴展檢索則僅限于當前主題詞的檢索。默認狀態(tài)為擴展檢索，若不進行擴展檢索請選擇“不擴展”選項。,返回,加權(quán)檢索表示僅對加星號(*)主題詞 (主要概念主題詞) 檢索，非加權(quán)檢索表示對加星號主題詞和非加星號主題詞（非主要概念主題詞）均進行檢索。 默認狀態(tài)為非加權(quán)檢索，若進行加權(quán)檢索請對“加權(quán)”選框進行標記。,返回,副主題詞：用于對主題詞的某一特定方面加以限制，強調(diào)主題詞概念的某些專指方面。如：“胃腫瘤/病理學”表明文章并非討論胃腫瘤的所有方面，而是胃腫瘤有關(guān)病理學方面的研究。 主題詞與副主題詞的組配規(guī)則：副主題詞一共有94個，表明同一主題的不同方面。主題詞與副主題詞的組配有嚴格的規(guī)定，不是所有的副主題詞均能與每個主題詞進行組配，“副主題詞組配表”，列出了當前主題詞可以組配的所有副主題詞及其使用范圍注釋，有助于副主題詞的正確使用。,返回,有些副主題詞之間也存在上下位關(guān)系，如副主題詞“副作用”的下位詞包括“中毒”和“毒性”，擴展檢索指對該副主題詞及其下位副主題詞進行檢索，非擴展檢索則僅限于當前副主題詞。 “選擇副主題詞”列表，列出了可與當前主題詞組配的所有副主題詞及其注釋，副主題詞后有“(+)”表明有下位副主題詞，其下位詞注釋信息見詞條解釋。如：主題詞“獲得性免疫缺陷綜合征”與擴展副主題詞“診斷(+)”組配檢索。,返回,主題詞注釋表含有當前詞條的詳細信息，包括主題詞的中文名、英文名、同義詞、相關(guān)詞、主題詞范疇注釋、樹形結(jié)構(gòu)號、可組配的副主題詞、藥理作用主題詞、檢索回溯注釋、標引注釋等內(nèi)容。 這些信息可幫助檢索者正確使用主題詞，并為相關(guān)主題詞的使用提供有益的線索，有助于提高查全率和查準率。,輸入“主題詞”，點擊“查找”確認欲檢索的主題詞，再點擊“主題詞注釋”可選擇更泛指的上位詞或更專指的下位詞。確認主題詞后，選擇是否加權(quán)，是否擴展?？牲c擊“改換詞條”按鈕，再點擊“檢索”按鈕，系統(tǒng)彈出“副主題詞表”，在“副主題詞表” 選擇副主題詞，點“主題檢索”按鈕，即可檢索出所選主題詞的有關(guān)文獻。或在輸入框鍵入主題詞，點“查找”按鈕，轉(zhuǎn)入“主題詞輪排表”檢索。,返回,點擊主頁面“期刊檢索”按鈕，選擇檢索入口：包括期刊導航、期刊名稱、出版地、出版單位、期刊主題詞。輸入檢索詞：在檢索輸入框鍵入檢索詞，點“查找”按鈕，系統(tǒng)顯示含有該檢索詞的期刊列表。選擇“期刊名”或“期刊代碼”檢索。點“期刊檢索”按鈕進行檢索該刊所收錄的文獻。見圖16、圖17、圖18、圖19。,圖16 CBMWeb期刊檢索界面,圖17 CBMWeb期刊檢索期刊列表界面,圖18 CBMWeb期刊檢索選擇期刊代碼檢索界面,圖19 CBMWeb期刊檢索結(jié)果顯示界面,返回,醫(yī)科院信息所為每種期刊分配了內(nèi)部編碼，期刊更名時內(nèi)部編碼不變。選擇