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1、對該段序列進(jìn)行同源性搜索 首先進(jìn)入www.espasy.ory 點(diǎn)擊進(jìn)入Resources A.Z 點(diǎn)擊如下圖點(diǎn)擊BLAST 輸入蛋白質(zhì)序列 搜索得到同源性分析 如下3圖示:Score分值越大,相似性越高。E值越小,匹配度越好。所以蛋白序列應(yīng)與p04626相似性高匹配度好二、對該段序列進(jìn)行基本性質(zhì)分析: 蛋白質(zhì)的氨基酸組成、 等電點(diǎn)、相對分子質(zhì)量、親水性、 疏水性、消光系數(shù)、信號肽、跨膜區(qū)域等。氨基酸組成等電點(diǎn)、相對分子質(zhì)量消光系數(shù)親水性、疏水性打開/protscale如下圖(網(wǎng)速慢,讀圖等好久都讀不出來)TMPred 跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)預(yù)測,打開/software/TMPRED_form.html輸入已知序列三、分析該段序列的MOTIF四、對該段序列進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)的分析選擇符合條件的一個同源建模5、分析該序列所代表蛋白的修飾情況、所參與的代謝途徑、相互作用的蛋白,以及與疾病的相關(guān)性。蛋白質(zhì)的修飾后翻譯蛋白質(zhì)的相互作用所參與的代謝途徑,相關(guān)疾病
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