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轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合模體

TranscriptionFactorBindingMotifs(TFBMs)

2021.12.18T參考文獻(xiàn)：High-resolutiongenome-widemappingofHIF-bindingsitesbyChIP-seq.Blood.2011Jun9;117(23):e207-17.doi:10.1182背景轉(zhuǎn)錄因子(Transcription

Factor,

TF)；人類基因組中可編碼2000+個(gè)TFs；轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(Transcription

Factor

Binding

Site,

TFBS)；轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合模體(

Transcription

Factor

Binding

Motif,

TFBM)；Motif

可以用多種方法、模型去表示。TopsequencelogoListofthetop25DNAbindingmotifsforTnT3參考文獻(xiàn)：TroponinT3associateswithDNAconsensussequencethatoverlapswithp53bindingmotifs.ExpGerontol.

2018Jul15;108:35-40.doi:10.1016/j.exger.bits用一段序列來描述所有序列的堿基組成，稱之為一致性序列。參考文獻(xiàn)：High-resolutiongenome-widemappingofHIF-bindingsitesbyChIP-seq.Blood.20

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