地方雞保種效果評價技術(shù)規(guī)范

2DB13/TXXXX—XXXX地方雞保種效果評價技術(shù)規(guī)范本文件規(guī)定了地方雞保種效果評價的評價人員、評價頻次、評價目的、評價方法、評價內(nèi)容、結(jié)果判定等要求。本文件適用于河北省地方雞保種場保種效果評價。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中，注日期的引用文件，僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改單）適用于本文件。DB32/T1974-2012地方雞種保種場（基因庫）管理規(guī)范第三次全國畜禽遺傳資源普查技術(shù)規(guī)范3術(shù)語和定義本文件沒有需要界定的術(shù)語和定義。4評價人員評價人員由家禽遺傳育種、家禽疫病防控等領(lǐng)域具有高級職稱專家組成，組成人數(shù)為奇數(shù)，不少于3人。5評價頻次保種效果評價按照世代間隔，每年進(jìn)行1次。6評價目的對地方雞保種群工作進(jìn)行動態(tài)監(jiān)控，以便隨時調(diào)整保種方案。7評價方法3DB13/TXXXX—XXXX7.1采樣測定專家?guī)ш牻M織采樣人員赴保種場進(jìn)行采樣，并將樣本送至有檢測資質(zhì)的第三方公司進(jìn)行檢測。7.2現(xiàn)場查驗現(xiàn)場查驗保種群數(shù)量及種群外貌特征。7.3審核材料審核材料包括保種檔案及第三方公司出具的測定報告。8評價內(nèi)容8.1采樣測定測定的指標(biāo)和方法部分參考第三次全國畜禽遺傳資源普查技術(shù)規(guī)范。8.1.1生長性能隨機采集保種群的300日齡公、母雞各30只，測定指標(biāo)包括體重體尺及屠宰率等。8.1.2蛋品質(zhì)隨機采集產(chǎn)出后24h內(nèi)的蛋樣本60份，測定指標(biāo)包括蛋重、蛋殼顏色、蛋黃比例、哈氏單位等。8.1.3肉品質(zhì)隨機采集上市日齡商品雞公母雞胸肉樣20份，測定指標(biāo)包括剪切力、失水率、肉色、PH等。8.1.4全基因組重測序按每個家系1公，2母進(jìn)行血樣采集，樣本總數(shù)公雞≥30只，母雞≥60只，進(jìn)行基因組重測序，獲得全基因組水平合格有效SNP標(biāo)記信息，計算保種群的遺傳多樣性（觀察雜合度和核苷酸多樣度）及基于ROH的近交系數(shù)等參數(shù)進(jìn)行分析。8.2現(xiàn)場查驗8.2.1保種群數(shù)量保種群家系數(shù)量不少于30個，上籠數(shù)量母雞不少于450只，公雞不少于90只。8.2.2外貌特征。種群外貌特征包括羽色、腳色，脛色、耳葉顏色、膚色，冠型、腳趾數(shù)量、蛋殼顏色等特征性特征，及各性狀在群體中所占比例。8.3審核材料8.3.1保種檔案信息5.3.1.1審核實際保種工作與保種方案與是否一致。4DB13/TXXXX—XXXX5.3.1.2審核生產(chǎn)性能測定記錄、防疫記錄、系譜孵化出雛記錄、選配記錄、繁殖性能記錄等是否完整、科學(xué)、規(guī)范，記錄須符合DB32/T1974-2012的規(guī)定。5.3.1.3查看繁殖性能記錄，包括300日齡產(chǎn)蛋數(shù)、受精率、孵化率等，與品種標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比對。8.3.2測定數(shù)據(jù)5.3.2.1查看測定的體尺體重、屠宰性能及蛋肉品質(zhì)的數(shù)據(jù)，與品種標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比對。5.3.2.2查看全基因組重測序報告，通過保種群的遺傳多樣性（觀察雜合度和核苷酸多樣度）及基于ROH的近交系數(shù)來判定群體近交狀況。計算公式見附錄A分子測定指標(biāo)計算公式。9結(jié)果判定通過審核保種材料的規(guī)范性、完整性、科學(xué)性，遺傳材料保存狀況，比較世代間體型外貌等表型特征、生長性能、繁殖性能及分子檢測數(shù)據(jù)與上世代雞群記錄以及河北省地方標(biāo)準(zhǔn)《太行雞》（DB13/T2607—2017）、《壩上長尾雞》（DB13/T748—2017）是否發(fā)生偏差來綜合評價保種效果。保種效果評價結(jié)果根據(jù)各項評定指標(biāo)量化（見附錄B）評分得出結(jié)果，得分80分以上為合格。5DB13/TXXXX—XXXX1.觀察雜合度觀察雜合度He按式（1）計算：式中：Pi—第i種基因型的頻率。2.核苷酸多樣性核苷酸多樣性π按式（2）計算：…………式中：Xi—第i個序列的對應(yīng)頻率Xj—第j個序列的對應(yīng)頻率Πij—兩個序列之間不同位點所占百分比n—總樣本數(shù)2.近交系數(shù)近交系數(shù)FROH按照式（3）計算：式中：LROH—基因組中連續(xù)性純合片段（runsofhomozygosity，ROH）的總長度Lauto—基因組總長度。6DB13/TXXXX—XXXX表1地方雞保種效果評分表指標(biāo)分類評分指標(biāo)具體指標(biāo)賦分依據(jù)分值得分檔案記錄（10分）保種計劃保種計劃視其科學(xué)性、規(guī)范性賦分1保種技術(shù)方案保種技術(shù)方案1系譜選配方案1出雛記錄視其完整性性賦分1免疫記錄免疫記錄1生長性能記錄開產(chǎn)、43周齡體重視其科學(xué)性、規(guī)范性、完整性賦分1繁殖性能記錄開產(chǎn)蛋重、300日齡蛋重1開產(chǎn)日齡1個體記錄1受精率、孵化率記錄1體型外貌特征（10分）體型外貌特征羽色、脛色、膚色等視與品種標(biāo)準(zhǔn)相比變化情況賦分5不同類群占保種群的比例5生長性能（10分）生長性能300日齡體重體尺5300日齡屠宰性能測定5繁殖性能（10分）繁殖性能300日齡產(chǎn)蛋數(shù)5受精率、孵化率5蛋肉品質(zhì)（10分）蛋品質(zhì)蛋重、蛋黃比例、蛋殼顏色等5肉品質(zhì)剪切力、失水率、肉色、5實際群體數(shù)量（20分）實際群體數(shù)量保種群家系數(shù)量、每個家系公母雞比例、常年存欄數(shù)量。40個家系，每家系公母雞比例不低于1:5，群體數(shù)量400只以上得分子測定（30分）遺傳多樣性觀察雜合度視與其他世代相比變化情況賦分5核苷酸多樣性5有效群體數(shù)量采用家系等量留種方式