科研公開課文獻(xiàn)精讀（二）

科研公開課：文獻(xiàn)精讀（第二節(jié)）醫(yī)盟講師：魏曉為南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京醫(yī)院（南京市第一醫(yī)院）上節(jié)回顧文獻(xiàn)精讀的目的意義文獻(xiàn)精讀的必要基礎(chǔ)文獻(xiàn)精讀的目標(biāo)化閱讀模式本節(jié)內(nèi)容文獻(xiàn)的分類、管理文獻(xiàn)精讀的要素化閱讀文獻(xiàn)精讀的目標(biāo)化閱讀模式良好的科研習(xí)慣：文獻(xiàn)分類節(jié)約時(shí)間、復(fù)習(xí)方便、參考效率無序的下載+盲目的標(biāo)記=混亂的思維前車之鑒、后事之師下載后分類、標(biāo)記（事半功倍）分類：按文章類型、按時(shí)間、按內(nèi)容、按關(guān)鍵 詞標(biāo)記：精讀前：title

or

running

title、雜志名時(shí)間精讀后：加付必要關(guān)鍵詞及權(quán)重（*）無有效信息靈活運(yùn)用running

title信息不足過于冗長、易含非法字符精讀后加（*）文獻(xiàn)編輯管理工具Endnote（國外軟件）：英文文獻(xiàn)兼容性好，可直接從Pubmed檢索后保存到數(shù)據(jù)庫中。根據(jù)投稿要求隨時(shí)調(diào)整參考文獻(xiàn)格式查閱便利文章內(nèi)引用文獻(xiàn)自動(dòng)排序WORD兼容性好中文處理差NoteExpress（國內(nèi)軟件）：中文數(shù)據(jù)庫推薦文獻(xiàn)精讀三步走閱讀：要素化閱讀/需求性閱讀精讀≠全讀記錄：歷史、重要數(shù)據(jù)、關(guān)鍵功能、關(guān)鍵機(jī)制 優(yōu)美句式、多義用詞等等書寫：綜述、文獻(xiàn)解析整體性閱讀與要素化閱讀整體性閱讀（高水平閱讀）基本點(diǎn):一、辨清概念,明確方向; 二、闡明意圖,弄清思路 三、結(jié)合語境,解惑化難 四、知曉背景,加深理解要素化閱讀/需求性閱讀（新手）知識面的擴(kuò)充：綜述性文章、論著的abstract實(shí)驗(yàn)技術(shù)學(xué)習(xí)：論著的methods、results和figures學(xué)術(shù)背景學(xué)習(xí)：綜述性文章、論著的introduction科學(xué)思維辯證學(xué)習(xí)：論著的discussion文章句式書寫：隨讀隨記以上均為針對性強(qiáng)化閱讀，非拋棄性閱讀精讀的目標(biāo)這篇文獻(xiàn)所做工作的領(lǐng)域？這篇文獻(xiàn)的科學(xué)問題？轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)意義？你是否感興趣？這篇文獻(xiàn)具體的研究目標(biāo)是什么？這篇文獻(xiàn)中主要研究方法是什么？這個(gè)方法和技術(shù)細(xì)節(jié) 是否我是否弄明白了？如何借鑒？研究的主要結(jié)果？圖表是否明晰？結(jié)論是什么，是否回答了前言中的科學(xué)問題和研究目標(biāo)？ 如果沒有，存在什么疑問？這篇文獻(xiàn)的啟發(fā)性及創(chuàng)新性？綜述的精讀從讀中文綜述到讀英文綜述從讀綜述到寫綜述領(lǐng)會(huì)自己和他人實(shí)驗(yàn)工作的思路、線索和意義， 督促自己看更多的文獻(xiàn)培養(yǎng)、鍛煉自己的文獻(xiàn)閱讀能力、歸納能力、思 考能力和寫作能力綜述的基本框架題目、摘要、關(guān)鍵詞：研究的主題引文/前言：研究的原因、背景正文：排列式、對比式、階梯式的分段描述， 錦上添花的圖表小結(jié)：總結(jié)及展望綜述的閱讀要點(diǎn)閱讀題目、摘要、關(guān)鍵詞瀏覽正文分段標(biāo)題閱讀正文分段內(nèi)容，標(biāo)注關(guān)鍵內(nèi)容瀏覽小結(jié)題目、摘要、關(guān)鍵詞簡潔明了的題目（中、英文推薦）關(guān)鍵詞揭示翻譯后修飾的具體類型意境化的題目（學(xué)習(xí)欣賞、謹(jǐn)慎使用）關(guān)鍵詞揭示維生素C的多種表達(dá)方式，便于讀者理解瀏覽標(biāo)題作者習(xí)慣、主題內(nèi)容決定了正文的模式排列式：內(nèi)容無主次之分對比式：內(nèi)容相反，辨證式論述階梯式：層層引出，環(huán)環(huán)相扣排列式正文對比式正文階梯式正文流程式階梯：常用于臨床綜述化療認(rèn)知功能損傷易感人群臨床癥狀病因機(jī)理診斷與干預(yù)常見模式：背景、癥狀、診斷、治療階梯式正文故事式階梯：綜述閱讀后注意重要數(shù)據(jù)的參考文獻(xiàn)，標(biāo)記并下載閱讀注意作者舉證文獻(xiàn)的證據(jù)等級重視歸納性圖表的采集重要內(nèi)容嘗試翻譯注重翻譯的重要性在語言轉(zhuǎn)化的過程中加深對知識的消化、理解避免閱讀時(shí)信息的丟失、遺漏英語語言的學(xué)習(xí)爭取全文翻譯加強(qiáng)科研思維的鍛煉研究性論著的精讀第一階段：讀懂他人實(shí)驗(yàn)工作第二階段：模仿他人實(shí)驗(yàn)工作第三階段：結(jié)合他人實(shí)驗(yàn)工作基礎(chǔ)創(chuàng)新研究性論著的基本框架題目、摘要、關(guān)鍵詞（title，abstract，key

words）引文/前言：研究的原因、背景（introduction）實(shí)驗(yàn)材料及方法（materials

and

methods）實(shí)驗(yàn)結(jié)果（resuts）討論（discussion）論著的常見閱讀模式根據(jù)目的合理選擇閱讀順序抓住主題、分解細(xì)節(jié)提出問題、交流討論注意閱讀的深度和廣度，避免思維定勢根據(jù)目的合理選擇閱讀順序一般情況下，建議先abstract、introduction，然后discussion，最后results

、figures和methods。摘要的閱讀摘要又稱概要、內(nèi)容提要。摘要是以提供文獻(xiàn)內(nèi)容梗概 為目的，不加評論和補(bǔ)充解釋，簡明、確切地記述文獻(xiàn) 重要內(nèi)容的短文?；疽匕ㄑ芯磕康摹⒎椒?、結(jié)果和結(jié)論。重點(diǎn)是結(jié)

果和結(jié)論，有時(shí)也包括具有情報(bào)價(jià)值的其它重要的信息。多數(shù)文章看摘要，少數(shù)文章看全文摘要需要充分展示前沿性、創(chuàng)新性，這是你、審稿人、 評審專家讀下去的主要?jiǎng)恿σ牡拈喿x引文是科學(xué)對話的一種方法，是作者認(rèn)為對自己的研究

“有用”的資料，但同時(shí)也表明，引文的含義不是簡單 的，它并不是許多人認(rèn)為的那樣只是“定量”的、“客 觀”的。首先它是作者的“主觀”判斷，但有多少個(gè)作 者有這樣的“主觀”判斷，其引文的“數(shù)據(jù)”則是“客 觀”的。它既是定性的，又是定量的。引文閱讀的要點(diǎn)學(xué)習(xí)作者為提出科學(xué)問題（論述或證明該項(xiàng)研究的重要 意義）做出的鋪墊****引文內(nèi)容與同主題綜述的橫向比較注意重要背景數(shù)據(jù)的記錄、收集寫作模板注意歸納、總結(jié)性語句的使用、記錄、收集舉例說明：重要背景數(shù)據(jù)舉例說明：歸納、總結(jié)性語句討論(Discussion)的閱讀討論是文獻(xiàn)精讀的重要部分，這一部分考驗(yàn)的是作者以 及讀者的邏輯辯證思維能力。宋曾鞏《祭孔長源文》：

“維我與公，綢繆平昔，詩書討論，相求以益。”討論(Discussion)的閱讀這一部分把實(shí)驗(yàn)結(jié)果提高到理論認(rèn)識的部分，作者在討

論中著重闡述整篇論文中有創(chuàng)造性的內(nèi)容和獨(dú)到的見解， 并根據(jù)本文結(jié)果，歸納其內(nèi)在聯(lián)系，并將全部資料加以綜 合分析，然后構(gòu)成幾個(gè)觀念或提出自己的論點(diǎn)。討論中的最精彩的是作者的思維創(chuàng)新性以及如何辯證地與他人實(shí)驗(yàn)結(jié)果比較 邏輯思維能力的訓(xùn)練文獻(xiàn)的討論是一種潛在的辯論，是用一定的理由來說明自己對事物或問題的見解，化解對方的疑問，以便最后得到共同的認(rèn)識和意見。讀者、審稿專家、作者自己討論的常見框架本研究工作的依據(jù)與意義：即選擇本研究課題的背景材料，國內(nèi)外對于類似問題的研究進(jìn)展，本研究的重點(diǎn)是要解決什么問題。本研究方法的機(jī)理、特點(diǎn)與優(yōu)劣:應(yīng)說明研究方法的科學(xué)性,研究材料與對象的客觀真實(shí)性,以及研究數(shù)量的充分性等。應(yīng)交代研

究方法的機(jī)理，指出其明顯特點(diǎn),評價(jià)其較過去方法的優(yōu)越之處。此外，對本實(shí)驗(yàn)方法的不足之處，尤其是某些實(shí)驗(yàn)條件未能控制之處，以及明顯的缺點(diǎn)也應(yīng)一一說明。討論的常見框架研究結(jié)果的新發(fā)現(xiàn)、新效果及與過去文獻(xiàn)的比較：應(yīng)著重指出本研究結(jié)果的新發(fā)現(xiàn)、新效果，并應(yīng)對研究結(jié)果進(jìn)行分析和解釋。根據(jù)本研究的理論或國內(nèi)外的新學(xué)說、新見解，以及自己的實(shí)驗(yàn)依 據(jù)進(jìn)行闡述。根據(jù)本研究結(jié)果的理論意義和實(shí)踐意義兩方面討論。也可以將本研究的結(jié)果與過去的文獻(xiàn)進(jìn)行比較，或用別人的資料補(bǔ) 充和說明自己的結(jié)論和觀點(diǎn)，從而進(jìn)一步證實(shí)本研究結(jié)果的先進(jìn)性 和可靠性。討論的常見框架從本研究結(jié)果得出的新觀點(diǎn)、新結(jié)論、新理論：這部分通常

是對本研究工作的升華，是論文先進(jìn)性與創(chuàng)造性的重要體現(xiàn)。作者在此基礎(chǔ)上，提出自己的新見解，探求其本質(zhì)和規(guī)律，并上升到理論的水平。今后將進(jìn)一步研究的課題與設(shè)想：討論部分也可在肯定已取得的成績的基礎(chǔ)上提出目前研究的不足、今后努力的方向及有待進(jìn)一步解決的問題。你讀懂討論了嗎？作者研究的意義是什么？作者的結(jié)論是什么？作者的研究思路是如何開展的？實(shí)驗(yàn)結(jié)果的關(guān)聯(lián) 是什么？作者實(shí)驗(yàn)的缺陷或局限是什么？作者實(shí)驗(yàn)的爭議是什么？實(shí)驗(yàn)方法（Methods）抓住主題后的細(xì)節(jié)分解學(xué)習(xí)重要的實(shí)驗(yàn)方案、材料來源（重要）、實(shí)驗(yàn) 條件（重要、參考價(jià)值高）、生物學(xué)信息如引物 序列等（重要、參考價(jià)值高）理清結(jié)果與圖表中的特殊名詞與縮寫參考學(xué)習(xí)統(tǒng)計(jì)學(xué)方案實(shí)驗(yàn)方法特別關(guān)注點(diǎn)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的先進(jìn)性實(shí)驗(yàn)方法的嚴(yán)謹(jǐn)性和認(rèn)可度實(shí)驗(yàn)方法的互補(bǔ)性與自己課題的關(guān)聯(lián)性學(xué)習(xí)先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)十分重要拓展自己的知識面為課題、文章提升技術(shù)層次比如：H2O2檢測，一般試劑盒，如amplex等，新型檢 測技術(shù)：HyPer

fluorescence（實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測）比如細(xì)胞內(nèi)能量代謝，傳統(tǒng)方法ATP、乳酸測定 目前國際多采用新技術(shù)，如Seahorse細(xì)胞能量代謝檢測系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性和認(rèn)可度很多實(shí)驗(yàn)方法的本身存在非特異性，需要陽性對照、陰 性對照去排除相關(guān)干擾因素，閱讀文獻(xiàn)時(shí)需敏銳觀察到 作者實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性，學(xué)以致用。研究者的專業(yè)角度優(yōu)于試劑盒說明書實(shí)驗(yàn)方法的互補(bǔ)性注意文獻(xiàn)中對同一問題采用不同實(shí)驗(yàn)技術(shù)驗(yàn)證的 方法，這種互補(bǔ)性體現(xiàn)的是實(shí)驗(yàn)嚴(yán)謹(jǐn)度，值得我 們學(xué)習(xí)。最為典型的就是體內(nèi)實(shí)驗(yàn)與體外實(shí)驗(yàn)的互補(bǔ)性與自己課題的關(guān)聯(lián)性詳細(xì)記錄與自己課題密切相關(guān)的任何信息細(xì)胞株實(shí)驗(yàn)參數(shù)（密度、溫度、培養(yǎng)方式、給藥濃度等）目標(biāo)蛋白的亞型、抗體目標(biāo)基因的序列、引物設(shè)計(jì)信號通路的上游及下游等等。。。結(jié)果與圖表方法、結(jié)果、圖表相結(jié)合閱讀，減少理解的困難注意閱讀圖表注釋一般情況下，作者會(huì)根據(jù)思路將results分成幾塊，并設(shè) 置子標(biāo)題，引導(dǎo)讀者閱讀理解每一個(gè)子標(biāo)題就是一個(gè)新的發(fā)現(xiàn)或者一個(gè)結(jié)論注意文獻(xiàn)的supplement

data臨床研究文獻(xiàn)的閱讀與評價(jià)臨床研究的目的和假說臨床研究的設(shè)計(jì)（參考性）、樣本量結(jié)果的真實(shí)性和實(shí)用性文獻(xiàn)中所采用的觀測指標(biāo)文獻(xiàn)中所采用的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對“陰性”結(jié)果要有辯證的認(rèn)識一些閱讀技巧：注意特殊句式表達(dá)觀點(diǎn)的，比如”which

indicates/suggests/demonstrates that……”，之后的內(nèi)容才是重點(diǎn)。表達(dá)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的單詞，“significant”or

“non-significant”， “statistical”……總結(jié)式的單詞，“In

brief/In

conclusion/above

all……”學(xué)會(huì)抓住主題詞句善于發(fā)現(xiàn)每一段的主題詞句，往往在段落的第一句或最 后部分，理解主題詞句后可以更好的理解作者羅列的證 據(jù)。理解主題詞句，標(biāo)注暫時(shí)不能理解的證據(jù)及數(shù)據(jù)Ascorbic

acid

(AA),

commonly

known

as

vitamin

C,

has

a

somewhatcontroversial

history

as

a

therapeutic

drug

for

cancer

treatment

(9,10).

Emerging

studies

suggest

that

only

intraperitoneal

orintravenous

AA,

and

not

orally

administered

AA,

can

reachpharmacological

concentrations

that

can

kill

cancer

(10,

11).

However,although

clinical

trials

of

AA

have

demonstrated

the

differencesbetween

administration

routes

and

the

safety

of

intravenous

AA

(12,13),

there

is

still

a

lack

of

understanding

of

the

mechanisms

by

whichAA

kills

cancer

cells.

In

general,the

cytotoxicity

induced

by

AA

seemsto

be

primarily

mediated

by

hydrogen

peroxide

(H2O2)

generated

inextracellular

fluids

(14).

A

recent

elegant

study

demonstrated

thatpharmacologic

ascorbate

enhances

the

cytotoxic

effects

of

ionizingradiation

in

pancreatic

cancer

cell

lines,

but

not

in

non-tumorigenicpancreatic

ductal

epithelial

cells