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文檔簡介
基礎(chǔ)實松技能培洌
實膾操作手冊
實驗安排表
時間實驗名稱主要內(nèi)容
微量移液器的校準與使用
pH計的校準與使月
上午實驗一、基本實驗技能
電子天平的校準與使用
第一天常用儀器介紹
8.18液體培養(yǎng)基的配制
固體培養(yǎng)基的配制
下午實驗二、基本實驗準備
細菌的液體培養(yǎng)接種
實驗常用試劑配制等
第二天上午實驗三、植物基因組DNA提取植物基因組提取
8.19下午實驗四、感受態(tài)制備感受態(tài)制備
第三天I.T-實驗五、PCR擴增、瓊脂糖凝膠回收PCR反應(yīng)、產(chǎn)物回收純化
8.20下午實驗六、TA克隆-連接轉(zhuǎn)化連接轉(zhuǎn)化涂板
第四天上午實驗六、TA克隆?鑒定?菌落PCR簽定菌落PCR鑒定
8.21下午實驗七、植物RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄RNA提取逆轉(zhuǎn)錄
上午實驗六、TA克隆-鑒定-質(zhì)粒提取質(zhì)粒提取鑒定
第五天
下午實驗八、熒光定量PCR熒光定量
8.22
分子實驗總結(jié)
第六天上午實驗九、蛋白提取、蛋白定量蛋白提取、蛋白定量
8.24下午實驗十、蛋白電泳制膠、電冰、染色
第七天
全天實驗H--、WesternBlot實驗(DAB顯色)轉(zhuǎn)膜、封閉、一抗、二抗、顯色
8.25
包被、封閉、一抗、二抗、顯色、
上午實驗十二、ELISA檢測
終止
第八天
下午實驗十三、細胞培養(yǎng)細胞培養(yǎng)基本方法
8.26
蛋白實驗總結(jié)
三個實驗,DNA、RNA提取、熒光
定量PCR操作。每組派出一個學員
上午綜合測試(現(xiàn)場考核操作)
第九天進行抽簽,抽到一種實驗方案及一
8.27個學員,現(xiàn)場進行操作,結(jié)果評比。
下午總結(jié)報告評選優(yōu)秀學員和優(yōu)秀小組
植物基因組DNA提取
實驗材料:
植物樣本,植物基因組DNA提取試劑盒,B-疏基乙醇,氯仿,無水乙醇
實驗儀器、耗材:移液器、電泳儀、離心機、研缽、研缽棒、剪刀、天平、液氮
實驗前準備:
1.BufferGP1在使用前請加入代疏基乙醇,5mlBu^erGP1加5pl即疏基乙醇。加入p-
筑基乙醇的BufferGP1室溫可保存1個月。
2.預(yù)熱水浴鍋65度,珞加入配制好的疏基乙醇預(yù)熱。
3.第一次使用前應(yīng)按照試劑瓶標簽的說明在BufferGW1和BufferGW2中加入無水乙醇。
4.稱取植物樣本約100mg。
5.在研磨植物材料前,向研缽中倒入酒精,放入剪刀、鑰匙高溫消毒。
6.研缽、剪刀、鑰匙冷卻后,將液氮加入在研缽口以預(yù)冷研缽。
實驗步驟:
1.取植物新鮮組織約100mg,用剪刀將樣本剪碎,放入研缽,加入液氮充分研磨至粉末狀。
將粉末轉(zhuǎn)移到離心管中。
注意:凍存材料直接研磨,絕對不能化凍。而且粉末應(yīng)在化凍前轉(zhuǎn)移,否則內(nèi)源性DNase
有可能降解基因組DNAo
2.加入700H65℃預(yù)熱的BufferGP1(BufferGP1在使用前請加入B-筑基乙醇,5mlBuffer
GP1加53小毓基乙醵),迅速顛倒混勻后,將離心管置于65℃水浴20分鐘,水浴過
程中顛倒離心管混勻樣品數(shù)次。
3.加入7007氯仿.充分混勻,12,000rpm(?13,400xg)離心5分鐘。小心將上層水相
轉(zhuǎn)入一新的離心管中,加入700ulBufferGP2,充分混勻。
4.將上步所得溶液全部加入到已裝入收集管(CollectionTube)的吸附柱(SpinColumnDM)
中。若一次不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。10,000rpm(?11,500xg)離心1分鐘,倒
掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
5.向吸附柱中加入500ulBufferGW1(使用前檢杳是否"加入無水乙醇),10,000rpm離
心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
6.向吸附柱中加入500ulBufferGW2(使用前檢查是否已加入無水乙醇),10,000rpm離
心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
7.12,000rpm離心2分鐘,倒掉收集管中的廢液。將吸附柱置于室溫數(shù)分鐘,以徹底晾干。
(乙醇一定要吹干,否則電泳點樣時,樣品上漂)
8.將吸附柱置于一個新的離心管中,向吸附柱的中間部位懸空加入50ulBufferGE,室溫放
置2?5分鐘,10,000rpm離心1分鐘,收集DNA溶液,?20℃保存DNA。
9.電泳檢測。
感受態(tài)制備
實驗材料:
菌株:Top10(Str+)、LB固體培養(yǎng)基,LB液體培養(yǎng)基,洗脫液,保存液
實驗方法:Cacl2法制備TOP10感受態(tài)
實驗儀器、耗材:4度離心機,分光光度計、50ml離心管、-80度低溫冰箱
試劑配制方法:
1L液體LB培養(yǎng)基:10g蛋白陳+5g酵母粉+10g氯化鈉,加蒸鐳水至1000ml。
100ml固體LB培養(yǎng)基:1g蛋白陳+0.5g酵母粉+1g氯化鈉+1.5g瓊脂粉,加蒸儲水至
100mL
1L洗脫液:16.264gMgCI2?6H2。(80mM)+2.94gCaCI2-2H2O(20mM)
200ml保存液:2.205gCaCI2-2H2O(75mM)+30ml甘油(15%)
滅菌條件:122℃20min
實驗步驟:
1.菌種的劃線培養(yǎng)
第一天下午4:30分
從-80℃取甘油菌,在?次性LB平板上進行劃線接菌,在37。(:恒溫培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng)。
2.接菌小搖與培養(yǎng)基的制備
第二天下午4:30分
取過夜培養(yǎng)平板,用槍頭挑菌于50ml液體LB培養(yǎng)管內(nèi),37℃,250rpm搖菌過夜。
3.擴大培養(yǎng)
第三天早上8:30分
取過夜小搖菌液按1:100比例加入250ml三角瓶(含100ml液體LB培養(yǎng)基)進行
擴大培養(yǎng),期間監(jiān)測OD值。
4.冰凍,離心,收菌
當OD600=0.4~0.5之間時,將搖菌三角瓶置于冰上,冰浴30min。
然后將菌液分別加入50ml離心管中4℃,3500rpm,離心10min收集菌體,
5.洗脫,冰凍,離心
將收集的菌體加入洗脫液12.5ml,混勻,冰浴20min。
(每菌液量加12.5ml洗脫液,也可根據(jù)總體積調(diào)整洗脫液的大小。)
4℃,3500rpm,離心10min,收集菌體。
6.分裝保存
加入保存液5ml(每100ml菌液量),混勻,分裝細胞即可。
PCR擴增
實驗材料:
GFP模板(約750bp),GFPForwardPrimer,GFPReversePrimer,TaqMasterMix
實驗儀器、耗材:PCR儀、移液器、PCR管、1.5ml離心管、電泳儀、照膠儀
實驗步驟:
1.配制PCR反應(yīng)體系:
每組做兩個重復(fù)。
試劑50pl反應(yīng)體系
2xTaqMasterMix(含染料)25pl
GFPForwardPrimer,10pM1pl
GFPReversePrimer,10pM1Ml
Grp模板1pl
RNase-FreeWater22pl
Total50pl
2.PCR反應(yīng)條件:
步驟溫度時間
預(yù)變性94℃2min
變性94MC30s、
退火55℃30sr30個循環(huán)
1minJ
延伸72℃
終延伸72℃2min
3.結(jié)果檢測:反應(yīng)結(jié)束后,取35Hl反應(yīng)產(chǎn)物電泳檢測,并準備進行瓊脂糖凝膠回收。
瓊脂糖凝膠回收純化
實驗材料:瓊脂糖凝膠膠塊、瓊脂糖凝膠回收純化試劑盒、無水乙醇
實驗儀器、耗材:切膠儀/照膠儀、小刀、移液器、分光光度計、水浴鍋、1.5ml離心管
實驗前準備:預(yù)熱水浴鍋至50度。
實驗步驟
1、取2個1.5ml干凈的離心管,稱取空管重量,將重星標記于管型上。
2、將單一目的DNA條帶從瓊脂糖凝膠中切下(盡量切除多余部分),放入離心管中,稱重,
計算膠塊重量。
注意:若膠塊的體積過大,可將膠塊切成碎塊。
3、向膠塊中加入3倍體積BufferPG(如凝膠重為100mg,其體積可視為100pl,依此類推)。
4、50℃孵育10分鐘,其間每隔2-3分鐘溫和地上下顛倒離心管,以確保膠塊充分溶解。如果
還有未溶的膠塊,可再補加一些溶膠液或繼續(xù)放置幾分鐘,直至膠塊完全溶解
注意;1)當瓊脂糖凝膠濃度>2%時,適當延長孵育時間。
2)膠塊完全溶解后最好將膠溶液溫度降至室溫再上柱,因為吸附柱在較高溫度時結(jié)合
DNA的能力較弱。
5、柱平衡:向已裝入收集管(CollectionTube)中的吸附柱(SpinColumnDM)中加入200
plBufferPS,17,900xg(-13,000rpm)離心2分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重
新放回收集管中。
6、將步驟3或4所得溶液加入到己裝入收集管的吸附柱中,室溫放置2分鐘,17,900xg
(-13,000rpm)離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱放回收集管中。
注意:吸附柱容積為700川,若樣品體積大「700川可分批加入。
7、向吸附柱中力口入5003BufferPG,17,900xg(-13,000rpm)離心1分鐘,倒掉收集管中
的廢液,將吸附柱放回收集管中。
8、向吸附柱中加入750plBufferPW(使用前請先檢杳是否已加入無水乙醇),17,900xg
(-13,000rpm)離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱放回收集管中。
9、17,900xg(-13,000rpm)離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液。將吸附柱置尸室溫數(shù)分鐘,
以徹底晾干。
注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)(酶
切、PCR等)。為確保下游實驗不受殘留乙醉的影響,建議將吸附柱開蓋,置于室溫放置
數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的乙醇。
10、將吸附柱放到一個新的1.5ml離心管中,向吸附膜中間位置懸空滴加353BufferEB
(pH8.5),室溫放置2分鐘。17,900xg(-13,000rpm)離心1分鐘,收集DNA溶液。-20℃
保存DNA。
注意:1)洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液,應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5
(可以用NaOH將水的pH值調(diào)到此范圍)。
2)為了提高DNA的回收量,可將離心得到的溶液重新滴加到吸附柱中,重復(fù)步驟10,
3)洗脫體積不應(yīng)小于30pl,體積過少會影響回收效率。
4)如果使用TE洗脫,需要考慮其中含有的EDTA是否會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)。
5)I可收大于10kb的DNA片段時,BufferEB應(yīng)在50℃水浴中預(yù)熱,適當延長吸附和洗脫時間,
可增加回收效率。
11、結(jié)果檢測:
1)濃度檢測:對回收后的PCR產(chǎn)物進行濃度測定。
2)電泳檢測:取43回收前的PCR產(chǎn)物、2.5川回收前的PCR產(chǎn)物及5川回收后的PCR產(chǎn)物進
行電泳檢測。
TA克隆
連接、轉(zhuǎn)化、涂板、鑒定
一、連接:
實驗材料:pUC-T載體、回收純化的DNA片段(750bp)
實驗儀器、耗材:移液器、PCR管、PCR儀
實驗步驟:
1.計算插入片段的體積;
1)在進行克隆時,載體pUC-T和插入片段的摩爾比一股為1:2-1:10,本實驗我們選擇1:3。
2)本實驗使用的載體pUC-T濃度為50ng/川,50ng的摩爾數(shù)約為0.03pmol,因此本實驗插
入片段的摩爾數(shù)為0.09pmol,插入片段為750bp,那么本實驗插入片段DNA的使用量(ng)
=0.09x10-3x660x750(插入片段bp數(shù))=44.55ng。
3)插入片段的體積(3)=插入片段DNA的使用量(ng)/插入片段的濃度(ng/pl)
本次我們使用的插入片段為上次實驗中膠回收片段,因此膠回收片段的濃度為40.6ng//,那
么,插入片段的體枳(川)=44.55/40.6=1.097,即在反應(yīng)體系中加入13插入片段。
2.按以下體系配制反應(yīng)液:
每組做4個。
試劑體積
pUC-T(50ng/pl)1Ml
插入片段(750bp)Xpl
RNase-FreeWaterYpl
SolutionBuffer,2x5pl
Total103
3.混勻,22℃孵育30分鐘,或者16℃過夜連接。
二、轉(zhuǎn)化:
實驗材料:TOP10感受態(tài)細胞、自制感受態(tài)細胞、LB液體培養(yǎng)基
實驗儀器、耗材:移液器、超凈臺、浮漂、搖床、水浴鍋
實驗前準備:預(yù)熱水浴鍋至42度。
實驗步驟:
1.取TOP10感受態(tài)細胞置于冰浴中,待感受態(tài)細胞融化后,進行以下實驗。
2.實驗組:將103連接產(chǎn)物加入至1003Top10感受態(tài)細胞中,用移液器輕輕吹打混勻,
冰浴30分鐘。每組共做2個。
對照組:將10pl連接產(chǎn)物加入至1003自制感受態(tài)紐胞中,用移液器輕輕吹打混勻,冰浴
30分鐘。每組做2個。
3.將離心管置于42℃水浴,熱擊90秒,迅速將離心管轉(zhuǎn)移到冰浴中,冰上靜置2-3分鐘。
4.向離心管中加入900PL的LB液體培養(yǎng)基(不含抗生素),混勻后置于37℃搖床,150rpm
振蕩培養(yǎng)45分鐘,使菌體復(fù)蘇。
三、涂板、培養(yǎng):
實驗材料:LB固體培養(yǎng)基、LB液體培養(yǎng)基、氨苦、IPTG、X-gal
實驗儀器、耗材:涂布棒、超凈臺、移液器、培養(yǎng)箱
實驗步驟:
1.倒板:
在LB固體培養(yǎng)基中加入氨節(jié)后,進行倒板。
將100mg/mL的氨節(jié)稀釋1000倍使用。(300ml培養(yǎng)基+300PL的100mg/mL氨葦)
注意!培養(yǎng)基溫度應(yīng)在50-60度時,再加入氨茉。
2.將40PL的20mg/mL的X-gal和20PL50mg/mL的IPTG涂布于含氨茉青霉素的LB平板上,
用無菌的涂布棒均勻涂開。
3.離心,倒掉上清,將沉淀中全部轉(zhuǎn)化后的培養(yǎng)物,加到平板上,用無菌的涂布棒將細
胞均勻涂開。
4.將平板置于室溫下至液體被完全吸收,倒置平板,37℃培養(yǎng)箱,過夜培養(yǎng)。
四、觀察、鑒定:
1.觀察藍色和白色菌落,計算白色和藍色菌落數(shù)。
2.菌落PCR鑒定
實驗材料:TaqMasterMix>菌液、M13ForwardPrimer>M13ReversePrimer>LB液體培
養(yǎng)基、氨茉
實驗耗材:超凈臺、15ml離心管、搖床、PCR儀、移液器、LB液體培養(yǎng)基
實驗步驟:
選擇平板,每個平板挑取白色菌落(4個)和藍色菌落(2個),分另ij放入50plRNase-Free
Water中,取23進行菌落PCR鑒定。剩下的48川等待菌落PCR結(jié)果,選取陽性克隆,于當
日下午接種于5ml含氨節(jié)青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,置于37℃搖床,250rpm振蕩培養(yǎng)過夜,
用于第二日提取質(zhì)粒。
1)配制PCR反應(yīng)體系:
試劑203反應(yīng)體系
2xTaqMasterMix10pl
M13ForwardPrimer,10pM0.5pl
M13ReversePrimer,10pM0.5pl
菌液2Ml
RNase-FreeWater7Ml
Total20pl
2)配制除菌液外的預(yù)混體系,并分裝到PCR管中,每個管中加入183的預(yù)混體系。
3)模板加入:每個管中分別加入23菌液?;靹?,短暫離心。
4)PCR反應(yīng)條件:
步驟溫度時間
預(yù)變性94℃2min
變性94℃30s'
退火55℃30s>30個循環(huán)
延伸72℃1minJ
終延伸72℃2min
5)結(jié)果檢測:反應(yīng)結(jié)束后,取53反應(yīng)產(chǎn)物直接電泳檢測結(jié)果。
3.高純質(zhì)粒提取鑒定
實驗材料:菌液,高純質(zhì)粒提取試劑盒,無水乙醇
實驗儀器、耗材:移液器、電泳儀
實驗前準備:
1)BufferP1中力「入RNaseA。
2)第一次使用前應(yīng)按照試劑瓶標簽的說明在BufferPW中加入無水乙醇。
實驗步驟:
1.取2nli(根據(jù)培養(yǎng)菌體的濃度選擇合適的量,建議最多不超過5ml)過夜培養(yǎng)的菌液,加
入離心管中,12,000rpm(~13,400xg)離心2-3分鐘收集細菌,盡量吸棄全部上清。
注意:質(zhì)??截悢?shù)較低或>10kb時,可以使用更多菌液通過二次離心將菌體沉淀收集到同
一個離心管中,同時后續(xù)所加試劑BufferP1、P2及N3的量需加倍。所加試劑的量
必須能夠充分裂解菌體,菌體過多、裂解不充分都會降低質(zhì)粒的提取效率。
2.向留有菌體沉淀的離心管中加入250ulBufferP1(請先檢查是否已加入RNaseA),使用
移液器或渦旋振蕩器充分混勻,懸浮細菌沉淀。
注意:如果菌塊未徹底混勻,將會影響裂解效果,使提取量和純度偏低。
3.向離心管中加入250ulBufferP2,溫和地上下顛倒混勻6-8次,使菌體充分裂解,室溫放
置3-5分鐘。此時溶液應(yīng)變得清亮粘稠。
注意:不耍劇烈震蕩,以免造成所提質(zhì)粒中基因組DNA污染。如果溶液未變得清亮,提示
可能菌量過大,裂解不徹底,應(yīng)減少菌體量。
4.向離心管中加入350ulBufferN3,立即上下顛倒混勻6-8次,此時出現(xiàn)白色絮狀沉淀,室
溫放置5分鐘。12,000rpm離心10分鐘。
注意:BufferN3加入后應(yīng)立即混勻,避免產(chǎn)生局部沉淀。
5.柱平衡:向已裝入收集管(CollectionTube)的吸附柱(SpinColumnCM)中力口人2003
BufferPS,12,000rpm離心2分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
6.將步驟4中所得的上消液轉(zhuǎn)移到吸附柱(已裝入收集管)中,12,000rpm離心1分鐘,倒掉
收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
注意:吸附柱的最大容枳為7003,所以第4步中所得溶液分2次過柱。
7.向吸附柱中加入500ulBufferPB,12,000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附
柱重新放回收集管中,
注意:如果宿主菌是endA-宿主菌(DH5a,TOP10等),此步可省略。如果宿主菌是
endA+宿主菌(TG1,BL21,HB101,JM101,ET12567等),這些宿主菌含
有大量的核酸耐,易降解質(zhì)粒DNA.推薦采月此步,如果提取低搟貝質(zhì)粒推薦采用
此步。
8.向吸附柱中加入600川BufferPW(請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000rpm離心1
分鐘,倒掉收集管中的廢液。
9.重復(fù)步驟8。
10.將吸附柱重新放回收集管中,12,000rpm離心2分鐘,倒掉廢液,將吸附柱置于室溫干燥5
分鐘。
注意;這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續(xù)的防促反應(yīng)(酶
切、PCR等)。
11.將吸附柱置于一個新的收集管中,向吸附膜的中間部位加入50-100ulBufferEB,室溫放
置2-5分鐘,12,000rpm離心2分鐘,將質(zhì)粒溶液收集到離心管中。-20。(:保存質(zhì)粒。
注意:1)為了增加質(zhì)粒的回收效率,可將得到的溶液重新加入到吸附柱中,重復(fù)步驟11。
2)BufferEB在65—70℃水浴預(yù)熱,適當延長吸附和洗脫的時間,可以增加提取效率。
3)洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液,應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5
范圍內(nèi)(可以用NaOH將水的pH值調(diào)到此范圍),pH值低于7.0會降低洗脫效率。
4)洗脫緩沖液體積不應(yīng)少「503,體積過小影響回收效率。
12.結(jié)果檢測:取53產(chǎn)物進行電泳檢測。
植物總RNA提取
材料:
植物樣本,超純RNA提取試劑盒,氯仿,75%乙醇(無RNase的水配制)
實驗儀器、耗材:移液器、電泳儀、4度離心機、分光光度計、研缽、研缽棒、天平、
液氮
實驗前準備:
1.配制75%乙醇,用無RNase的水配制。
2.稱取植物樣本100mg。
3.在研磨植物材料前,向研缽中倒入酒精,放入剪刀、鑰匙高溫消毒。
4.研缽、剪刀、鑰匙冷卻后,將液氮加入在研缽中以預(yù)冷研缽。
實驗步驟:
注意:低溫冰上操作
1.樣品處理:稱取植物樣本100mg,將植物樣本剪碎后,放入研缽中,加入液氮,充分
研磨,研磨充分后,加入1mlBufferRLT,
注意:樣品體積不超過BufferRLT體積的10%。
2.樣品中加入BufferRLT后反更吹打幾次,使樣本充分裂解。室溫放置5分鐘,使蛋白核酸
復(fù)合物完全分離。
3.每1mlBufferRLT加入200山氯仿的比例加入氯仿,蓋好管蓋,劇烈振蕩15秒,室溫放
置2分鐘。
4.4℃12,000rpm(~13,400xg)離心10分鐘,此時樣品分為三層:紅色有機相,中間層和
上層無色水相,RNA主要在上層水相中,將上層水相移到一個新的RNase-Free離心管(自
備)中。
5.在得到的水相溶液中加入等體積的70%乙醇(無RNase的水配制),顛倒混勻。
6.將上步所得溶液全部加入到已裝入收集管(CollectionTube2ml)的吸附柱(SpinColumn
RM)中。若一次不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。12,000rpm離心20秒,倒掉收集管中的
廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
7.向吸附柱中加入/00JlBufferRW1,12,。。。rpm離心2U秒,倒掉收集管中的廢液,將吸
附柱重新放回收集管中。
8.向吸附柱中加入500HBufferRW2(使用前檢杳是否已加入無水乙醇),12,000rpm離
心20秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。
9.重復(fù)步驟8,,
10.12,000rpm離心2分鐘,倒掉收集管中的廢液。將吸附柱置于室溫數(shù)分鐘,以徹底晾干。
11.將吸附柱置于一個新的無RNase離心管(CollectionTube1.5ml)中,向吸附柱的中間部
位加入30-50ulRNase-FreeWater,室溫放置1分鐘,12,000rpm離心1分鐘,收集RNA
溶液,-70°C保存RNR,防止降解。
12.檢測:
1)電泳檢測。
2)RNA濃度和純度測定:
純度:OD260,,QD280=1.921<1.8蛋白質(zhì)或酚類污染>2.2RNA水解
濃度:RNA(且g/旦I)=40*OD26O乂稀釋倍數(shù)
逆轉(zhuǎn)錄CDNA合成
實驗材料:
HiFi-ScriptcDNA第一鏈合成試劑盒,RNA(植物RNA實驗提?。?/p>
實驗儀器、耗材:
PCR儀、PCR管、移液器
實驗步驟:
1.將RNA模板、PrimerMix.dNTPMix、DTT、RTBuffer>HiFi-ScriptRNase-FreeWater
溶解并置于冰上備用。
2.根據(jù)以下表格配置反應(yīng)體系,總體積為203。
RNA終濃度建議為印g,需要根據(jù)測定的RNA濃度,計算逆轉(zhuǎn)錄中需要的RNA體積。
試劑20pl反應(yīng)體系
dNTPMix,2.5mMEach4pl
PrimerMix2Ml
RNATemplateXpl(1|jg)
5xRTBuffer4pl
DTT,0.1M2Ml
HiFi-Script,200U/pl1pl
RNase-FreeWaterY
Total20pl
3.渦旋震蕩混勻,短暫離心,使管壁上的溶液收集到管底。
4.42℃孵育50分鐘,85'C孵育5分鐘。反應(yīng)結(jié)束后,短暫離心,置于冰上冷卻。
5.逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可直接用于PCR和熒光定量PCR,或置于-20℃長期保存。
熒光定量PCR
實驗材料:
UltraSYBRGreenMixture,cDNA,actinForwardPrimer、actinReversePrimer
實驗儀器、耗材:
熒光定量PCR儀、PCR管、1.5ml離心管、移液器、八連管離心機
實驗步驟:
1.模板稀釋:
注意:每稀釋一個倍數(shù),需要將溶液混勻,并短暫離心。
編號模板稀釋倍數(shù)水用量模板用量
110倍90pl10pl(原液)
2100倍90pl10pl(從1號管?。?/p>
2.配制PCR預(yù)混反應(yīng)體系:
做8個樣本,配制10個樣本的預(yù)混體系,配制方式如下:
配制10個樣本的
試劑20pl反應(yīng)體系
預(yù)混體系
2xUltraSYBRMixture100pl10pl
ForwardPrimer,10pM4pl0.4pl
ReversePrmer,10pM4pl0.4pl
AcDNAOpl2Ml
RNase-FreeWater72pl7.2pl
Total18020
3.將配制的預(yù)混體系,分裝到八連管中。共8個孔,每個孔中加入183的預(yù)混體系。
4.模板加入:
每個孔中分別加入2「模板,加樣順序如下:
加樣孔12345678
樣品原原稀釋稀釋稀釋稀釋水水
液液10倍10倍100倍100倍
加入體積2pl2pl2pl2pl2pl2pl2Pl2Ml
5.混勻,短暫離心,使管壁上的溶液收集到管底。
6.熒光定量PCR反應(yīng)程序:
步驟溫度時間
預(yù)變性95℃10min
變性95℃10sI
40個循環(huán)
1min)
退火/延伸60℃
融解曲線分析
注意事項:
1.首先配制預(yù)混體系,再將預(yù)混體系分裝到八連管中。
2.稀釋模板時,需要混勻。
3.不要直接在八連管管壁或管蓋上做標記!
植物總蛋白提取
實驗材料:植物樣本、植物蛋自抽提試劑
實驗儀器、耗材:研缽、研缽棒、移液器、1.5ml離心管、4度離心機、天平、液氮
注意:低溫冰上操作
實驗前準備:
1.將蛋白酶抑制劑混合物加入植物蛋白抽提試劑中,按照1:99比例加入,使蛋白酶抗制劑
混合物在抽提試劑中成1x工作液。
配制方法:990川植物蛋白抽提試劑+10川蛋白能抑制劑混合物,冰上放置待用。
2.稱取植物樣本約100mg。
3.在研磨植物材料前,先將液氮加入在研缽中以預(yù)冷研缽。
實驗步驟:
1.稱量100mg植物組織,用剪刀將樣本剪碎,放入研缽,加入液氮充分研磨至粉末狀。
將粉末轉(zhuǎn)移到離心管中。
2.按照組織:抽提試劑=1:5(g/ml)的比例加入蛋白抽提試劑,100mg植物組織加入5003
蛋白抽提試劑。渦旋混勻,冰上孵育30分鐘,期間渦旋混勻3次。
3.4℃12,000rpm,離心20分鐘。
4.將上清轉(zhuǎn)移至新的離心管中。冰上放置,準備蛋臼定量,或?qū)⑻崛〉牡鞍?20℃保存。
蛋白定量
實驗材料:提取的植物蛋白、BCA定量試劑盒
實驗儀器、耗材:移液器、酶標儀/分光光度計、酶標條、酶標板、1.5ml離心管、PCR管
實驗步驟:
1.標準品稀釋(按照下表進行標準品稀釋)。
管號稀釋液用量(U1)標準品用雷(ul)最終濃度(ugml)
A01002000
B2002001000
C200200(從B管中?。?00
D200200(從C管中?。?50
E200200(從D管中?。?25
F400100(從E管中?。?5
G20000(空白)
3.配置BCA工作液:根據(jù)標準品和樣品的數(shù)量,將試劑A和試劑B以50:1的體枳比
混勻(6mlA液+120plB液)
微孔法:
1)將253稀釋好的樣品與稀釋好的標準品分別添加于96孔板的微孔中。
2)各孔中加入200plBCA工作液,充分混勻。
3)蓋上96孔板蓋,37℃孵育30分鐘。
4)冷卻至室溫。
5)用酹標儀測定562nm處的吸光值。
6)繪制標準曲線,計算樣品中的蛋白濃度。
試管法:
1)將1003稀釋好的樣品與稀釋好的BSA標準品分別加到作好標記的試管中。
2)各試管中各加入2mlBCA工作液,充分混勻。
3)37℃水浴中孵育30分鐘或室溫孵育2小時。
4)將各管冷卻至室溫。
5)用分光光度計測定562nm處的吸光值。
6)繪制標準曲線,計算樣品中的蛋白濃度。
注意事項:
標準品測定需在10min內(nèi)完成,否則會影響蛋白定量的準確度。
蛋白電泳(制膠、SDS-PAGE電泳)
實驗材料:
SDS凝膠制備試劑盒、電泳緩沖液、提取的蛋白或全細胞裂解液、廣譜彩虹預(yù)
染中分子量蛋白Marker、SDSLoadingBuffer:還原,5x)、G250蛋白快速染色
試劑、若干蒸儲水
實驗儀器、耗材:
蛋白電泳儀、制膠儀、水平搖床、15ml離心管、5ml移液器、微量移液器、1.5ml離心管
配制溶液:
?配制10%APS溶液:-20度保存
0.5gAPS+5ml蒸儲本、2.5gAPS+25ml蒸儲水
?配制200ml電泳緩沖液:CVV0045Tris-GlycineSDS(ph8.3,10X)
2()mlTris-GlycincSDS+180nil蒸儲水
?配制1mlloadingbuffer:
200ul5Xloadingbuffer+800ul蒸儲水
實驗步驟:
一.制膠:
1.參照凝膠模具說明書,裝配好凝膠模具。
2.根據(jù)分離蛋白的大小配制分離膠和濃縮膠。
SDS分離膠的濃度與最佳分離范圍
SDS分離膠濃度最佳分離范圍
6%膠50-150kD
8%膠30-90kD
10%膠20-80kD
12%膠12-60kD
15%膠10-40kD
3.配制10%分離膠:
將不同體積的30%Acr-Bis(29:1),分離膠緩沖液和雙蒸水在小燒杯或試管中混合。
加入10%APS和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。
配制SDS分離膠
分離所需各組分體積(單位:ml)
凝膠
膠濃30%Acr-分離膠緩汨液
體積雙蒸水10%APSTEMED
度Bis(29:1)(4x)
10%5ml2.081.671.250.050.002
10ml4.173.332.50.10.004
15ml6.255.03.750.150.006
20ml8.36.750.20.008
4.待膠濯至距離玻璉板頂端1.5cm的時候停止灌狡,加入蒸儲水水封。靜置40分鐘
至1小時。
5.待分離膠凝固后(水層膠層中間出現(xiàn)折線),倒掉蒸儲水,用濾紙將水溶液吸干。
6.配制5%濃縮膠:
配制5%SDS濃縮膠
所需各組分體積(單位:ml)
凝膠
30%Acr-Bis(濃縮膠緩沖液10%APTEME
體積雙蒸水
29:1)(4x)SD
2ml1.140.340.50.020.002
4ml2280.6810.040.004
6ml3.421.021.50.060.006
8ml4.561.362.00.080.008
7.將濃縮膠溶液加至分離膠的上面,直至凝膠溶液到達前玻璃板的頂端。
注意:灌膠速度要快,防止凝膠。
8.將梳子插入凝膠內(nèi),避免產(chǎn)生氣泡。靜置20分鐘,等待濃縮膠聚合。
9.待凝膠聚合后,小心地拔出梳子,以免破壞加樣孔。趕走氣泡。
二.SDS電泳:
1.在電泳槽的內(nèi)外槽灌至電泳緩沖液。
2.制備樣品:
1)植物蛋白樣品:
根據(jù)植物蛋白定量結(jié)果,計算蛋白提取液加入量,制備上樣溶液。
蛋白提取液+5x上樣緩沖液+蒸儲水
制備的樣品,煮沸5分鐘,12,000rpm離心5分鐘,取上清,上樣。
2)全細胞裂解液:可以直接上樣,上樣203,約40ug.
3.上樣:K562全細胞裂解液上樣順序如下:
泳道12345678910
樣品1x上樣Marker樣品樣品樣品樣品樣品樣品樣品1x上樣
緩沖液1234567緩沖液
體積10pl5pl20320pl20pl20pl20川20320川10pl
4.電泳:濃縮膠80V,約20分鐘,分離膠100V,約1小時。
四、考馬斯亮藍染色
注:將提取的植物蛋白進行電泳,電泳后進行考馬斯亮藍染色。全細胞裂解液電泳后,進行
westernblot檢測。
1.將電泳后的PAGE膠取出放入容器中,加入適量蒸偏水(以充分覆蓋PAGE膠為
宜),加熱至沸騰后5分鐘,棄去蒸儲水:
2.加入適量考馬斯亮藍染色液(液面覆蓋凝膠即可)加熱至沸騰后5分鐘,棄染色液;
3.加入適量蒸儲水,加熱至沸騰后5分鐘,棄蒸儲水,重復(fù)此步驟至背景清晰。
4.觀察拍照。
WesternBlot
溶液配制:
?配制500ml1XTBST溶液:
50mlTBST(ph8.3,10X)+450ml蒸儲水
?配制100ml5%牛奶封閉液:4度保存
5克脫脂奶粉+100ml1XTBST
?配制100ml轉(zhuǎn)膜緩沖液(甲醇):CW0044Tris-Glycine(ph8.3,10X)
1()mlTris-Glycine+20ml甲醇+70ml蒸鏘水(4度保存)
一.轉(zhuǎn)膜及染色
實驗材料:NC膜、濾紙、轉(zhuǎn)膜緩沖液、麗春紅染色試劑
實驗儀器、耗材:轉(zhuǎn)膜儀
實驗步驟:
1.電泳完成后,小心打開玻璃板,去除濃縮膠,將分離膠剝離后,放入轉(zhuǎn)膜緩沖液中平衡。
2.用剪刀剪相同大
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