微生物學檢驗技術(shù) 課件 15項目十五：細菌分類與命名

項目十五細菌分類與命名思維導圖項目十五細菌分類與命名學習目標1．掌握基本概念。2．熟悉細菌的分類等級和命名。3．了解細菌分類方法。4．具有分析細菌分級、命名的能力。5．能正確讀懂、看懂細菌的分類等級、會書寫細菌命名的格式。項目十五細菌分類與命名一、概述項目十五細菌分類與命名一、概述1.細菌分類

是根據(jù)每種細菌各自的特征，并按照它們的親緣關(guān)系分門別類，以不同等級編排成系統(tǒng)。分類有兩種：①以細菌的形態(tài)和生理生化特性為依據(jù)的表型特征分類法②用化學分析和核酸分析一、概述2.細菌命名

是在分類基礎(chǔ)上，給予每種細菌一個科學名稱，使之在生產(chǎn)實踐、臨床實踐和科學研究工作中相互交流成為可能。按照細菌命名的法規(guī)，能保證所有的科研工作者以同樣方式給予細菌命名。

是將未知細菌按分類原則放入系統(tǒng)中某一適當位置和已知細菌比較其相似性，用對比分析方法確定細菌的分類地位。若與已知細菌相同即采用已知菌的名稱，不同者則按命名原則確定一個新名稱。一、概述3.細菌鑒定二、細菌的分類項目十五細菌分類與命名

細菌的分類等級和其他生物相同，依次為界（kingdom）門（division）綱（class）目（order）科（family）屬（genus）種（species）。二、細菌的分類（一）分類等級

種是細菌分類的基本單位，將生物學性狀基本相同的細菌群體歸成一個菌種；性狀相近、關(guān)系密切的若干菌種組成一個菌屬，相近的屬歸為一科；由不同來源分離的同一種、同一亞種或同一型的細菌，稱為株（strain），在細菌的分類、鑒定和命名時以模式菌為依據(jù)，也可作為質(zhì)量控制的標準。二、細菌的分類（二）分類方法1.生理學與生物化學分類法細菌的形態(tài)，染色以及細菌的特殊結(jié)構(gòu)是最早和最基本的分類依據(jù)；而細菌的生理生化特征一直作為分類的主要依據(jù)。（1）傳統(tǒng)分類法：傳統(tǒng)分類的原則是將生物的基本性質(zhì)分為主要的和次要的（主次原則），然后將主次順序一級一級地往下分，直至最小區(qū)分。按細胞形態(tài)、革蘭染色性、鞭毛及代謝特點作為較高一級分類依據(jù)?？?、屬、種水平的分類主要依靠生化特性和抗原結(jié)構(gòu)。

（2）數(shù)值分類法：數(shù)值分類法集數(shù)字、電子、信息及自動化分析技術(shù)于一體，將細菌的一些基本性質(zhì)視為同等重要（等重要原則），采用標準化、成品化和配套生化反應(yīng)試劑條，檢測細菌的數(shù)十個生理生化特性。每個細菌都能產(chǎn)生一套陰陽性結(jié)果，然后轉(zhuǎn)換成數(shù)字，通過電子計算機進行復雜計算，比較每一株與其他類同株，測定其相似度。根據(jù)相似度，區(qū)分細菌的種群，并確定各種細菌的親緣關(guān)系。2.遺傳學分類法?遺傳學分類是以細菌的核酸、蛋白質(zhì)等在組成的同源程度分類。該分類法具有下述的優(yōu)點：①對細菌的“種”有一個較為一致的概念；②使分類不會出現(xiàn)經(jīng)常性或根本性的變化；③可制定可靠的細菌鑒定方案；④有利于了解細菌的進化和原始親緣關(guān)系。目前較為穩(wěn)定的應(yīng)用遺傳學的細菌分類方法有下列幾種：a.DNAG+Cmol％測定;b.核酸同源值測定;c.核糖體RNA堿基序列測定。二、細菌的分類（二）分類方法三、細菌的命名項目十五細菌分類與命名三、細菌的命名細菌的命名

自1998年1月以來,所有微生物科學名稱列于英特網(wǎng)在線數(shù)據(jù)庫中,細菌名錄每月更新。20世紀后期,細菌學家開始用DNA-RNA雜交技術(shù)和測定細菌G+C含量,對細菌進行分類和命名。進入21世紀,則將表型特征與16SrRNA測序相結(jié)合來分類和命名細菌。

由于測序的普及,可將微生物第一時間正確分類到合適的科和屬。隨著國際微生物系統(tǒng)分類學技術(shù)水平的不斷提高,一些微生物菌種的分類學地位發(fā)生了變遷,名稱也隨之發(fā)生變化。

細菌的命名依據(jù)《國際細菌命名法典》(TheInternationalCodeofNomenclatureofBacteria）的規(guī)定，學名用拉丁文，遵循“雙名法”。所謂“雙名法”就是每一種細菌的拉丁文名稱由屬名和種名兩部分構(gòu)成，屬名在前，是名詞，第一個字母必須大寫，其余均應(yīng)小寫，即使種名是以人名或地名命名的，種名頭一個字母也用小寫。整個屬名及種名在出版物中應(yīng)排成斜體。三、細菌的命名細菌的命名(1）出現(xiàn)在分類學文獻中的細菌拉丁文學名，在屬名和種名之后，往往還要加上首次定名人（加括號）、現(xiàn)名定名人和現(xiàn)名定名年份，這些均用正體排字。但在一般獸醫(yī)學及醫(yī)學微生物學文獻中，屬名和種名之后的部分均予省略。例如大腸埃希菌的學名全名是Escherichiacoli(Migula1895)CastellanietChalmers1919，指的是Migula于1895年命名此菌為Bacilluscoil,Castellani及Chalmers于1919年改為現(xiàn)名的。三、細菌的命名

命名的注意事項(2)拉丁文學名應(yīng)按拉丁文字母的發(fā)音規(guī)則讀念，但由于受英語的影響，不少人是按英語的讀法來讀細菌拉丁文名的，這在國際學術(shù)交流中常常遇到。(3)只確定屬名、未確定種名的某一株細菌，其拉丁文學名可在屬名之后加sp.（正體字）；如果同屬未定種名的若干菌株，則用spp．取代、p.,spp．為species復數(shù)的簡寫。(4)如果是新種，在新種的拉丁文學名之后還要加上“sp.nov.”,nov是novel的縮寫。三、細菌的命名

命名的注意事項(5）亞種用subsp.（正體字）表示，這是subspecies的縮寫，例如Pasteurellamultocidasubsp.septic，中譯名為多殺性巴氏桿菌敗血亞種。(6)少數(shù)拉丁文學名會因研究的進展等原因而改變，比如Clostridiumwelchii（魏氏梭菌）、Aeromonaspunctata（斑點氣單胞菌）等是曾用名，現(xiàn)今的國外文獻已不再沿用，分別改為Clostridiuniperfringens（產(chǎn)氣莢膜梭菌）和Aeromonascaviae（豚鼠氣單胞菌）。(7)細菌的拉丁文學名在翻譯為中文時，由于譯者不同，往往同物異名，可造成不必要的混亂，為此應(yīng)盡可能采用公認的譯名。三、細菌的命名

命名的注意事項(8)譯名應(yīng)盡可能準確，例如Edwardsiellatarda，應(yīng)譯為遲緩愛德華菌，tarda有遲緩或遲鈍之意，該菌有動力，并不遲鈍，但生長緩慢。(9)按照國家出版局的規(guī)定，細菌名稱中涉及外國人名譯為漢語時，除極少數(shù)特別著名、沿用已久者外，均省略“氏”字，除非取詞頭字母發(fā)音。例如Brucella譯為布氏桿菌屬，Yersinia譯為耶爾森菌屬；Pasteurella譯為巴氏桿菌屬，Listeria譯為李氏桿菌屬。三、細菌的命名

命名的注意事項(