微生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù) 課件 15項(xiàng)目十五：細(xì)菌分類與命名

項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名思維導(dǎo)圖項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名學(xué)習(xí)目標(biāo)1．掌握基本概念。2．熟悉細(xì)菌的分類等級(jí)和命名。3．了解細(xì)菌分類方法。4．具有分析細(xì)菌分級(jí)、命名的能力。5．能正確讀懂、看懂細(xì)菌的分類等級(jí)、會(huì)書寫細(xì)菌命名的格式。項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名一、概述項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名一、概述1.細(xì)菌分類

是根據(jù)每種細(xì)菌各自的特征，并按照它們的親緣關(guān)系分門別類，以不同等級(jí)編排成系統(tǒng)。分類有兩種：①以細(xì)菌的形態(tài)和生理生化特性為依據(jù)的表型特征分類法②用化學(xué)分析和核酸分析一、概述2.細(xì)菌命名

是在分類基礎(chǔ)上，給予每種細(xì)菌一個(gè)科學(xué)名稱，使之在生產(chǎn)實(shí)踐、臨床實(shí)踐和科學(xué)研究工作中相互交流成為可能。按照細(xì)菌命名的法規(guī)，能保證所有的科研工作者以同樣方式給予細(xì)菌命名。

是將未知細(xì)菌按分類原則放入系統(tǒng)中某一適當(dāng)位置和已知細(xì)菌比較其相似性，用對(duì)比分析方法確定細(xì)菌的分類地位。若與已知細(xì)菌相同即采用已知菌的名稱，不同者則按命名原則確定一個(gè)新名稱。一、概述3.細(xì)菌鑒定二、細(xì)菌的分類項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名

細(xì)菌的分類等級(jí)和其他生物相同，依次為界（kingdom）門（division）綱（class）目（order）科（family）屬（genus）種（species）。二、細(xì)菌的分類（一）分類等級(jí)

種是細(xì)菌分類的基本單位，將生物學(xué)性狀基本相同的細(xì)菌群體歸成一個(gè)菌種；性狀相近、關(guān)系密切的若干菌種組成一個(gè)菌屬，相近的屬歸為一科；由不同來源分離的同一種、同一亞種或同一型的細(xì)菌，稱為株（strain），在細(xì)菌的分類、鑒定和命名時(shí)以模式菌為依據(jù)，也可作為質(zhì)量控制的標(biāo)準(zhǔn)。二、細(xì)菌的分類（二）分類方法1.生理學(xué)與生物化學(xué)分類法細(xì)菌的形態(tài)，染色以及細(xì)菌的特殊結(jié)構(gòu)是最早和最基本的分類依據(jù)；而細(xì)菌的生理生化特征一直作為分類的主要依據(jù)。（1）傳統(tǒng)分類法：傳統(tǒng)分類的原則是將生物的基本性質(zhì)分為主要的和次要的（主次原則），然后將主次順序一級(jí)一級(jí)地往下分，直至最小區(qū)分。按細(xì)胞形態(tài)、革蘭染色性、鞭毛及代謝特點(diǎn)作為較高一級(jí)分類依據(jù)?？?、屬、種水平的分類主要依靠生化特性和抗原結(jié)構(gòu)。

（2）數(shù)值分類法：數(shù)值分類法集數(shù)字、電子、信息及自動(dòng)化分析技術(shù)于一體，將細(xì)菌的一些基本性質(zhì)視為同等重要（等重要原則），采用標(biāo)準(zhǔn)化、成品化和配套生化反應(yīng)試劑條，檢測(cè)細(xì)菌的數(shù)十個(gè)生理生化特性。每個(gè)細(xì)菌都能產(chǎn)生一套陰陽性結(jié)果，然后轉(zhuǎn)換成數(shù)字，通過電子計(jì)算機(jī)進(jìn)行復(fù)雜計(jì)算，比較每一株與其他類同株，測(cè)定其相似度。根據(jù)相似度，區(qū)分細(xì)菌的種群，并確定各種細(xì)菌的親緣關(guān)系。2.遺傳學(xué)分類法?遺傳學(xué)分類是以細(xì)菌的核酸、蛋白質(zhì)等在組成的同源程度分類。該分類法具有下述的優(yōu)點(diǎn)：①對(duì)細(xì)菌的“種”有一個(gè)較為一致的概念；②使分類不會(huì)出現(xiàn)經(jīng)常性或根本性的變化；③可制定可靠的細(xì)菌鑒定方案；④有利于了解細(xì)菌的進(jìn)化和原始親緣關(guān)系。目前較為穩(wěn)定的應(yīng)用遺傳學(xué)的細(xì)菌分類方法有下列幾種：a.DNAG+Cmol％測(cè)定;b.核酸同源值測(cè)定;c.核糖體RNA堿基序列測(cè)定。二、細(xì)菌的分類（二）分類方法三、細(xì)菌的命名項(xiàng)目十五細(xì)菌分類與命名三、細(xì)菌的命名細(xì)菌的命名

自1998年1月以來,所有微生物科學(xué)名稱列于英特網(wǎng)在線數(shù)據(jù)庫中,細(xì)菌名錄每月更新。20世紀(jì)后期,細(xì)菌學(xué)家開始用DNA-RNA雜交技術(shù)和測(cè)定細(xì)菌G+C含量,對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類和命名。進(jìn)入21世紀(jì),則將表型特征與16SrRNA測(cè)序相結(jié)合來分類和命名細(xì)菌。

由于測(cè)序的普及,可將微生物第一時(shí)間正確分類到合適的科和屬。隨著國(guó)際微生物系統(tǒng)分類學(xué)技術(shù)水平的不斷提高,一些微生物菌種的分類學(xué)地位發(fā)生了變遷,名稱也隨之發(fā)生變化。

細(xì)菌的命名依據(jù)《國(guó)際細(xì)菌命名法典》(TheInternationalCodeofNomenclatureofBacteria）的規(guī)定，學(xué)名用拉丁文，遵循“雙名法”。所謂“雙名法”就是每一種細(xì)菌的拉丁文名稱由屬名和種名兩部分構(gòu)成，屬名在前，是名詞，第一個(gè)字母必須大寫，其余均應(yīng)小寫，即使種名是以人名或地名命名的，種名頭一個(gè)字母也用小寫。整個(gè)屬名及種名在出版物中應(yīng)排成斜體。三、細(xì)菌的命名細(xì)菌的命名(1）出現(xiàn)在分類學(xué)文獻(xiàn)中的細(xì)菌拉丁文學(xué)名，在屬名和種名之后，往往還要加上首次定名人（加括號(hào)）、現(xiàn)名定名人和現(xiàn)名定名年份，這些均用正體排字。但在一般獸醫(yī)學(xué)及醫(yī)學(xué)微生物學(xué)文獻(xiàn)中，屬名和種名之后的部分均予省略。例如大腸埃希菌的學(xué)名全名是Escherichiacoli(Migula1895)CastellanietChalmers1919，指的是Migula于1895年命名此菌為Bacilluscoil,Castellani及Chalmers于1919年改為現(xiàn)名的。三、細(xì)菌的命名

命名的注意事項(xiàng)(2)拉丁文學(xué)名應(yīng)按拉丁文字母的發(fā)音規(guī)則讀念，但由于受英語的影響，不少人是按英語的讀法來讀細(xì)菌拉丁文名的，這在國(guó)際學(xué)術(shù)交流中常常遇到。(3)只確定屬名、未確定種名的某一株細(xì)菌，其拉丁文學(xué)名可在屬名之后加sp.（正體字）；如果同屬未定種名的若干菌株，則用spp．取代、p.,spp．為species復(fù)數(shù)的簡(jiǎn)寫。(4)如果是新種，在新種的拉丁文學(xué)名之后還要加上“sp.nov.”,nov是novel的縮寫。三、細(xì)菌的命名

命名的注意事項(xiàng)(5）亞種用subsp.（正體字）表示，這是subspecies的縮寫，例如Pasteurellamultocidasubsp.septic，中譯名為多殺性巴氏桿菌敗血亞種。(6)少數(shù)拉丁文學(xué)名會(huì)因研究的進(jìn)展等原因而改變，比如Clostridiumwelchii（魏氏梭菌）、Aeromonaspunctata（斑點(diǎn)氣單胞菌）等是曾用名，現(xiàn)今的國(guó)外文獻(xiàn)已不再沿用，分別改為Clostridiuniperfringens（產(chǎn)氣莢膜梭菌）和Aeromonascaviae（豚鼠氣單胞菌）。(7)細(xì)菌的拉丁文學(xué)名在翻譯為中文時(shí)，由于譯者不同，往往同物異名，可造成不必要的混亂，為此應(yīng)盡可能采用公認(rèn)的譯名。三、細(xì)菌的命名

命名的注意事項(xiàng)(8)譯名應(yīng)盡可能準(zhǔn)確，例如Edwardsiellatarda，應(yīng)譯為遲緩愛德華菌，tarda有遲緩或遲鈍之意，該菌有動(dòng)力，并不遲鈍，但生長(zhǎng)緩慢。(9)按照國(guó)家出版局的規(guī)定，細(xì)菌名稱中涉及外國(guó)人名譯為漢語時(shí)，除極少數(shù)特別著名、沿用已久者外，均省略“氏”字，除非取詞頭字母發(fā)音。例如Brucella譯為布氏桿菌屬，Yersinia譯為耶爾森菌屬；Pasteurella譯為巴氏桿菌屬，Listeria譯為李氏桿菌屬。三、細(xì)菌的命名

命名的注意事項(xiàng)(