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醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室WelcometoStudyMedicalStatisticsMedicalStatistics2024/10/31第5章方差分析第五章方差分析
醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)Analysisofvariance(ANOVA)
主講:漆光紫副教授2024/10/31第5章方差分析方差分析的用途1、檢驗(yàn)兩個(gè)或多個(gè)樣本均數(shù)間的差異有無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;注意:兩個(gè)樣本均數(shù)的比較可以采用t檢驗(yàn)或F檢驗(yàn),兩個(gè)以上樣本均數(shù)的比較只能用F檢驗(yàn)。2、回歸方程的線性假設(shè)檢驗(yàn);3、檢驗(yàn)兩個(gè)或多個(gè)因素間有無交互作用。
2024/10/31第5章方差分析應(yīng)用條件(P63)1、各個(gè)樣本是相互獨(dú)立的隨機(jī)樣本;2、各個(gè)樣本來自正態(tài)總體;3、各個(gè)處理組的總體方差方差相等,即方差齊。
t檢驗(yàn)的應(yīng)用條件??2024/10/31第5章方差分析不滿足應(yīng)用條件時(shí)處理方法
1、進(jìn)行變量變換,以達(dá)到方差齊或正態(tài)的要求
2、采用非參數(shù)法(秩和檢驗(yàn))
3、使用近似F檢驗(yàn)
t檢驗(yàn)也類似?。。?024/10/31第5章方差分析方差分析的思路
小樣本多個(gè)樣本均數(shù)比較正態(tài)性檢驗(yàn)(矩法、W檢驗(yàn)、D檢驗(yàn))方差齊性檢驗(yàn)(Bartlett法、Levene法)
完全隨機(jī)設(shè)計(jì)或隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)方差分析
滿足條件多個(gè)實(shí)驗(yàn)組與一個(gè)對(duì)照組比較
多個(gè)樣本間的兩兩比較LSD法:降低βDuncan法:降低α
SNK法不滿足條件變量變換秩和檢驗(yàn)P>a慎重做出推斷或增加樣本含量繼續(xù)研究P≤a2024/10/31第5章方差分析第一節(jié)方差分析的基本思想離均差平方和變異度總例數(shù)n(自由度n-1)SS/(n-1)消除n的影響方差均方MS2024/10/31第5章方差分析組內(nèi)各觀察值之間各不相同(組內(nèi)變異)V組內(nèi)=N-K
各組均數(shù)也不相等(組間變異)V組間=K-1
MS組內(nèi)=SS組內(nèi)/(N-k)
MS組間=SS組間/(k-1)
2024/10/31第5章方差分析總變異
組內(nèi)變異
組間變異
個(gè)體差異個(gè)體差異+處理的作用SS組間
SS組內(nèi)
SS總=SS組內(nèi)+SS組間
2024/10/31第5章方差分析MS組內(nèi)
處理因素?zé)o效MS組間
MS組內(nèi)=MS組間
2024/10/31第5章方差分析MS組內(nèi)
處理因素?zé)o效MS組間
MS組間F=——————=1
MS組內(nèi)Fisher2024/10/31第5章方差分析MS組內(nèi)
MS組間
處理因素F=—————>1
MS組間MS組內(nèi)2024/10/31第5章方差分析如何判斷是否有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義呢?F0.05FF>F0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義2024/10/31第5章方差分析將計(jì)算得到的F值與F分布的界值相比較,2024/10/31第5章方差分析方差分析的基本思想是什么?
答:方差分析的基本思想是:根據(jù)研究資料設(shè)計(jì)的類型及研究目的,把全部觀察值總變異分解為兩個(gè)或多個(gè)組成部分,其總自由度也分解為相應(yīng)的幾個(gè)部分。例如完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的方差分析,可把總變異分解為組間變異和組內(nèi)變異,即SS總=SS組內(nèi)+SS組間,總的自由度也分解為相應(yīng)的兩部分,即ν總=ν組內(nèi)+ν組間。2024/10/31第5章方差分析離均差平方和除以自由度得均方(MS),MS組內(nèi)=SS組內(nèi)/V組內(nèi);MS組間=SS組間/V組間;組間均方(MS組間)與誤差均方(MS誤差)之比為F值。
MS組間F=——————=1
MS組內(nèi)2024/10/31第5章方差分析
如果各組處理的效應(yīng)一樣,則組間均方等于組內(nèi)均方,即F=1;但由于抽樣誤差,F(xiàn)值不正好等于1,而是接近1;如果F值較大,遠(yuǎn)離1,說明組間均方大于誤差均方,反映各處理組的效應(yīng)不一樣,即各組均數(shù)差別有意義,至于F值多大才能認(rèn)為差別有意義,可查F界值表(方差分析用)來確定。2024/10/31第5章方差分析各種復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的方差分析的原理都類似,均在于分解變異總變異隨機(jī)因素(誤差)來源明確與能夠解釋的部分,根據(jù)設(shè)計(jì)細(xì)分為各種因素引起的效應(yīng)計(jì)算各部分的MS,并與MS誤差比較求得F值,再與F界值比較下結(jié)論。2024/10/31第5章方差分析第二節(jié)完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的方差分析設(shè)計(jì)方法將條件相似的研究對(duì)象A組B組C組效應(yīng)隨機(jī)2024/10/31第5章方差分析例如:P63例5-12024/10/31第5章方差分析二、完全隨機(jī)設(shè)計(jì)方差分析的步驟
=SS總SS組間SS組內(nèi)+例5-1變異的分解2024/10/31第5章方差分析分析步驟:1、建立檢驗(yàn)假說和確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)H0:(四組血清IL-2水平總體均數(shù)相等)H1:四組血清IL-2水平總體均數(shù)不等或不全相等α=0.052、計(jì)算F值(見課本)3、確定P值和作出推斷結(jié)論直接計(jì)算間接估計(jì)(查表)2024/10/31第5章方差分析1、如果方差分析有差別,只說明總的有差別,各組中哪兩組間是否有差別,還要進(jìn)一步做兩兩比較。注意2、如果方差分析無差別,分析結(jié)束。2024/10/31第5章方差分析t檢驗(yàn)與完全隨機(jī)設(shè)計(jì)方差分析的關(guān)系兩樣本均數(shù)比較:二者是等價(jià)的。多樣本均數(shù)間比較:只能用方差分析。不能拆開兩兩作t檢驗(yàn),否則,犯一類錯(cuò)誤的概率增加。2024/10/31第5章方差分析四、多個(gè)樣本均數(shù)的兩兩比較
多個(gè)樣本均數(shù)比較經(jīng)F檢驗(yàn)后,若得出有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)論后,要進(jìn)一步推斷哪些組之間有差別,哪些組之間沒有差別,還是所有各組之間都有差別,要解決這些問題,就要進(jìn)一步做均數(shù)間的兩兩比較,又稱多重比較。
(multiplecomparison)2024/10/31第5章方差分析
由于涉及的對(duì)比組數(shù)大于2,就不能應(yīng)用前面介紹的t檢驗(yàn),只能使用下面介紹的方法。若仍用前述前述的t檢驗(yàn)方法,對(duì)每?jī)蓚€(gè)對(duì)比組作比較,會(huì)使犯第一類錯(cuò)誤(拒絕了實(shí)際上成立的H0所犯的錯(cuò)誤)的概率α增大,即可能把本來無差別的兩個(gè)總體均數(shù)判為有差別。
2024/10/31第5章方差分析例如有4個(gè)樣本均數(shù),可以進(jìn)行兩兩比較的次數(shù)=4!/[2!(4-2)!]=6次,即有6個(gè)兩兩對(duì)比組,若每次比較的檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,則每次比較不犯第一類錯(cuò)誤的概率為(1-0.05),那末6次比較均不犯第一類錯(cuò)誤的概率為(1-α)=(1-0.05)6,這時(shí)犯第一類錯(cuò)誤的概率,也就是總的顯著性水準(zhǔn)α變?yōu)?-(1-0.05)6=0.27,比0.05大多了。因此,多重比較不宜用前述t檢驗(yàn)分別作兩兩比較。次數(shù)=2024/10/31第5章方差分析為避免增大犯第一類錯(cuò)誤的概率,不能使用t檢驗(yàn),而應(yīng)使用專門的方法。多重比較的方法較多,如SPSS軟件中就有18種方法,應(yīng)根據(jù)資料特點(diǎn)(方差是否齊性)和研究目的來選用。
2024/10/31第5章方差分析兩兩比較方法多個(gè)樣本均數(shù)間每?jī)蓚€(gè)均數(shù)的比較
多個(gè)實(shí)驗(yàn)組分別與對(duì)照組均數(shù)間的兩兩比較
LSD-t檢驗(yàn)
SNK
q檢驗(yàn)
2024/10/31第5章方差分析LSD-t檢驗(yàn):
主要應(yīng)用于證實(shí)性實(shí)驗(yàn)研究,在設(shè)計(jì)階段就根據(jù)研究目的或?qū)I(yè)知識(shí)決定某些均數(shù)間的兩兩比較,例如多個(gè)處理組與對(duì)照組的比較,處理后不同時(shí)間與處理前的比較等;
SNK檢驗(yàn):
主要用于探索性研究,在研究設(shè)計(jì)階段未預(yù)先考慮或未預(yù)料到,經(jīng)數(shù)據(jù)結(jié)果的提示后才決定的,這類情況往往涉及到多個(gè)均數(shù)間每?jī)蓚€(gè)均數(shù)的比較。2024/10/31第5章方差分析1、多個(gè)實(shí)驗(yàn)組與一個(gè)對(duì)比組均數(shù)間的兩兩比較----LSD—t檢驗(yàn)
LSD-t檢驗(yàn),又稱最小顯著差法(LSD法)(Leastsignificancedifferencetest)2024/10/31第5章方差分析式中,、為兩個(gè)對(duì)比組的樣本均數(shù);為方差分析中算得的誤差均方;nA和nB分別為兩對(duì)比組的樣本例數(shù)。這里的t檢驗(yàn)公式與第4章介紹的兩均數(shù)比較的t檢驗(yàn)的公式有所不同,區(qū)別點(diǎn)在于合并方差和自由度的計(jì)算上,
但仍是按算得的t值查附表2,t界值表,作出推斷結(jié)論。查t界值表,下結(jié)論。2024/10/31第5章方差分析例對(duì)例5.1方差分析的基礎(chǔ)上,對(duì)不同大鼠模型的IL-2水平進(jìn)行多重比較。1)建設(shè)假設(shè),確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)
H0:μA=μBH1:μA≠μB2024/10/31第5章方差分析2)計(jì)算統(tǒng)計(jì)量t值。
由于各組的例數(shù)都一樣,均為8例,而且在進(jìn)行方差分析時(shí),已知=0.175。所以,任意兩個(gè)比較組的標(biāo)準(zhǔn)誤均為:=0.20922024/10/31第5章方差分析
只是由于公式的分子()各組不同,所以會(huì)得出不同的t值。經(jīng)計(jì)算,各兩兩比較組算得t值,見表5-4。2024/10/31第5章方差分析
3)確定p值,做出統(tǒng)計(jì)推斷。按自由度=32-4=28,查附表2,t界值表,得出P值。按a=0.05水準(zhǔn),由多重比較結(jié)果可知,尚不能認(rèn)為丙組與丁組的IL-2水平的差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義外,其余5個(gè)比較組間的差別都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。有差別的組間,到底是哪個(gè)組比對(duì)照組高,哪個(gè)組低呢?要結(jié)合各組的均數(shù)來比較。見表5-1。2024/10/31第5章方差分析2、多個(gè)樣本均數(shù)間任意兩個(gè)均數(shù)間的比較
用于探索性研究,即在研究設(shè)計(jì)階段未預(yù)先考慮或未預(yù)料到,經(jīng)方差分析拒絕H0后,才決定的多個(gè)均數(shù)間每?jī)蓚€(gè)的事后比較。常用q檢驗(yàn)(又稱Student-Newman-Keuls,SNK法)
。2024/10/31第5章方差分析檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量
這里的q檢驗(yàn),所得q值隨組內(nèi)自由度(v)和組數(shù)(a)不同而不同。2024/10/31第5章方差分析
a指樣本均數(shù)排序后兩對(duì)比組間所包含的組數(shù),通俗點(diǎn),即組間的跨度。如1組與4組比較,包括的組數(shù)=4,即包括其本身跨度為4個(gè)單位。2024/10/31第5章方差分析
舉例:對(duì)例5.1方差分析的基礎(chǔ)上,對(duì)不同大鼠模型的IL-2水平進(jìn)行SNK法的多重比較。
先將樣本均數(shù)從小到大排序,對(duì)比組次從1-4,即均數(shù)排序(從小到大)處理組(原組號(hào))甲乙丙丁均數(shù):0.29131.02002.14882.2650
例數(shù):8888排序號(hào)(組次):12342024/10/31第5章方差分析1)建設(shè)假設(shè),確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)
H0:μA=μBH1:μA≠μB2)計(jì)算統(tǒng)計(jì)量q值。
由于各組的例數(shù)都一樣,均為8例,而且在進(jìn)行方差分析時(shí),已知=0.175。所以,任意兩個(gè)比較組的標(biāo)準(zhǔn)誤均為:=0.14792024/10/31第5章方差分析查附表4
只是由于公式的分子()各組不同,所以會(huì)得出不同的q值
。經(jīng)計(jì)算,各兩兩比較組算得q值,見表5-5。2024/10/31第5章方差分析
第(5)、(6)兩欄是由附表4,q界值表,
當(dāng)自由度在表中能找到時(shí),直接選擇P=0.05和P=0.01時(shí)對(duì)應(yīng)q值,當(dāng)自由度在表中不能找到時(shí),根據(jù)a和自由度用內(nèi)插值法計(jì)算出的P=0.05和P=0.01對(duì)應(yīng)的q值。2024/10/31第5章方差分析內(nèi)插值法計(jì)算q值。公式:
q=q1+(q2–q1)(v–v1)/(v2–v1),
v1與v2分別為v左右相鄰的自由度,q1為v1對(duì)應(yīng)的q值,q2為v2對(duì)應(yīng)的q值。如本列,當(dāng)檢驗(yàn)水準(zhǔn)為0.05,a=4,v=28時(shí),v1=20,v2=30,q1=3.96,q2=3.85;所以:q=q1+(q2–q1)(v–v1)/(v2–v1))
=3.96+(3.85-3.96)*(28-20)/(30-20)
=3.96+(-0.11)*(8)/10=3.96+(-0.088)=3.87。
2024/10/31第5章方差分析第二節(jié)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的方差分析
隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)亦稱配伍組設(shè)計(jì)。它涉及兩個(gè)因素,一個(gè)研究因素,另一個(gè)是配伍組因素。
(RandomizedBlockDesign)2024/10/31第5章方差分析
隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的要點(diǎn):隨機(jī)區(qū)組是配對(duì)設(shè)計(jì)的擴(kuò)大。每一個(gè)對(duì)子有兩個(gè)對(duì)象(配對(duì));而每一個(gè)配伍組會(huì)多于兩個(gè)對(duì)象(配伍)。同一個(gè)配伍組中的對(duì)象條件相同或相近,每個(gè)配伍組中對(duì)象隨機(jī)給予一種處理。2024/10/31第5章方差分析A處理B處理配對(duì)設(shè)計(jì)A處理B處理C處理配伍設(shè)計(jì)對(duì)子區(qū)組ABABC2024/10/31第5章方差分析治療前、后治療:A藥
B藥
C藥配對(duì)設(shè)計(jì)配伍設(shè)計(jì)同一病人2024/10/31第5章方差分析1、隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)方差分析中變異的分解
總變異(SS總)處理組變異(SS處理)配伍組變異(SS配伍)誤差(SS誤差=SS組內(nèi)
)2024/10/31第5章方差分析各組均數(shù)也不
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