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文檔簡介
醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析作業(yè)指導(dǎo)書TOC\o"1-2"\h\u32588第1章研究設(shè)計基礎(chǔ) 3100601.1研究類型與設(shè)計 3156241.1.1觀察性研究 3284311.1.2實驗性研究 4271281.1.3混合研究 4179671.2研究問題與假設(shè) 427871.2.1研究問題 4123311.2.2研究假設(shè) 4101981.3研究對象與樣本選擇 413431.3.1研究對象 4284071.3.2樣本選擇 432362第2章數(shù)據(jù)收集與整理 5130402.1數(shù)據(jù)來源與收集方法 5211632.1.1數(shù)據(jù)來源 5188832.1.2數(shù)據(jù)收集方法 5304872.2數(shù)據(jù)整理與清洗 5140682.2.1數(shù)據(jù)整理 5247632.2.2數(shù)據(jù)清洗 693412.3數(shù)據(jù)儲存與管理 6241622.3.1數(shù)據(jù)儲存 620212.3.2數(shù)據(jù)管理 64535第3章統(tǒng)計描述與圖表展示 6321003.1描述性統(tǒng)計分析 626573.1.1集中趨勢度量 6289433.1.2離散程度度量 7233013.2圖表制作與展示 7118583.2.1條形圖 7325963.2.2餅圖 7287363.2.3折線圖 7254893.2.4散點圖 785923.3數(shù)據(jù)可視化 784933.3.1熱力圖 7125973.3.2地圖 7249463.3.3箱線圖 7186713.3.43D散點圖 77760第4章假設(shè)檢驗與推斷統(tǒng)計 8238914.1常見的假設(shè)檢驗方法 8314344.1.1單樣本t檢驗 828364.1.2雙樣本t檢驗 8306154.1.3方差分析(ANOVA) 850164.1.4卡方檢驗 8117574.1.5非參數(shù)檢驗 869324.2P值與顯著性水平 8188414.2.1P值的計算 873764.2.2顯著性水平的選取 812224.3誤差分析與力量計算 8282254.3.1誤差分析 8151484.3.2力量計算 912300第5章方差分析與應(yīng)用 960075.1單因素方差分析 9174755.1.1原理與概念 9136085.1.2假設(shè)檢驗 9233765.1.3數(shù)據(jù)要求 987685.1.4計算步驟 9300585.2多因素方差分析 9182865.2.1原理與概念 9257405.2.2假設(shè)檢驗 10129625.2.3數(shù)據(jù)要求 10315545.2.4計算步驟 10243615.3重復(fù)測量方差分析 10140295.3.1原理與概念 10122285.3.2假設(shè)檢驗 10264725.3.3數(shù)據(jù)要求 10128845.3.4計算步驟 1112213第6章相關(guān)分析與回歸分析 11169176.1相關(guān)性分析 11155176.1.1皮爾遜相關(guān)系數(shù) 1111496.1.2斯皮爾曼等級相關(guān)系數(shù) 11248736.1.3肯德爾等級相關(guān)系數(shù) 11241156.1.4相關(guān)性假設(shè)檢驗 11240896.1.5相關(guān)分析中的注意事項 11104406.2線性回歸分析 1169856.2.1簡單線性回歸模型 11304766.2.2最小二乘法參數(shù)估計 1123376.2.3回歸模型的假設(shè)檢驗 11259106.2.4回歸模型的診斷 11211576.2.5回歸系數(shù)的解釋 1169796.3多元回歸分析 1132926.3.1多元回歸模型構(gòu)建 1269516.3.2參數(shù)估計與解釋 12139976.3.3假設(shè)檢驗與模型選擇 124696.3.4多元回歸分析中的多重共線性問題 12134116.3.5多元回歸分析的應(yīng)用示例 1222814第7章多變量統(tǒng)計分析 1231787.1主成分分析 12189407.1.1基本原理 1259117.1.2應(yīng)用場景 12147897.1.3步驟與方法 1285567.2因子分析 12292677.2.1基本原理 13172077.2.2應(yīng)用場景 13133617.2.3步驟與方法 13273967.3聚類分析 13192597.3.1基本原理 13303867.3.2應(yīng)用場景 13167427.3.3步驟與方法 139651第8章非參數(shù)統(tǒng)計方法 13267508.1非參數(shù)檢驗概述 13230978.2秩和檢驗與符號秩檢驗 14315188.2.1秩和檢驗 1422738.2.2符號秩檢驗 14220678.3配對樣本非參數(shù)檢驗 1429337第9章生存分析與應(yīng)用 1560869.1生存數(shù)據(jù)的特點與描述 15252989.2生存函數(shù)與風險函數(shù) 1553469.3常用生存分析方法 1615432第10章結(jié)果解釋與論文撰寫 162657010.1統(tǒng)計結(jié)果的解釋與呈現(xiàn) 161250310.1.1描述性統(tǒng)計 16842410.1.2假設(shè)檢驗結(jié)果 16953310.1.3結(jié)果呈現(xiàn) 161435410.2常見統(tǒng)計錯誤與誤區(qū) 17198510.2.1樣本量不足 17233210.2.2數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換錯誤 172278910.2.3誤用統(tǒng)計方法 171582110.2.4結(jié)果解釋偏差 172473110.3醫(yī)學(xué)論文結(jié)構(gòu)與撰寫要點 172270610.3.1結(jié)構(gòu) 17488410.3.2撰寫要點 17第1章研究設(shè)計基礎(chǔ)1.1研究類型與設(shè)計在醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析中,選擇合適的研究類型與設(shè)計對于獲取有效、可靠的研究結(jié)果。研究類型可分為觀察性研究與實驗性研究兩大類。1.1.1觀察性研究觀察性研究主要包括橫斷面研究、縱向研究和隊列研究等。這類研究的特點是對研究對象進行觀察和調(diào)查,不對研究條件進行人為干預(yù)。1.1.2實驗性研究實驗性研究主要包括隨機對照試驗、臨床試驗和動物實驗等。這類研究的特點是對研究對象進行人為干預(yù),以探討因果關(guān)系。1.1.3混合研究混合研究是將觀察性研究與實驗性研究相結(jié)合的研究方法,以彌補單一研究方法的不足。1.2研究問題與假設(shè)在醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析中,明確研究問題是關(guān)鍵。研究問題應(yīng)具有科學(xué)性、可行性和重要性?;谘芯繂栴},提出相應(yīng)的研究假設(shè),以便進行后續(xù)的實驗驗證。1.2.1研究問題研究問題應(yīng)具有以下特點:(1)科學(xué)性:研究問題需基于現(xiàn)有醫(yī)學(xué)知識和理論體系,具有科學(xué)依據(jù)。(2)可行性:研究問題應(yīng)在現(xiàn)有技術(shù)條件下能夠得到解決。(3)重要性:研究問題應(yīng)對醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展具有重要意義。1.2.2研究假設(shè)研究假設(shè)是對研究問題可能答案的預(yù)測,應(yīng)具有明確、具體、可驗證的特點。1.3研究對象與樣本選擇在醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析中,選擇合適的研究對象和樣本對于研究結(jié)果的可靠性。1.3.1研究對象研究對象應(yīng)根據(jù)研究問題、研究假設(shè)和研究設(shè)計進行選擇。研究對象可以是患者、健康人群、動物等。1.3.2樣本選擇樣本選擇應(yīng)遵循以下原則:(1)代表性:樣本應(yīng)能代表總體特征,以便研究結(jié)果的推廣。(2)隨機性:樣本應(yīng)采用隨機抽取的方法,以減少抽樣誤差。(3)有效性:樣本量應(yīng)滿足統(tǒng)計學(xué)要求,以保證研究結(jié)果的可靠性。(4)可比性:實驗組與對照組的樣本應(yīng)在性別、年齡、病情等方面具有可比性,以減少混雜因素的影響。第2章數(shù)據(jù)收集與整理2.1數(shù)據(jù)來源與收集方法醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)收集是保證研究質(zhì)量的基礎(chǔ)。本章節(jié)主要闡述數(shù)據(jù)來源的選取及收集方法。2.1.1數(shù)據(jù)來源醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)主要來源于以下幾方面:(1)臨床試驗:通過招募志愿者或患者參與研究,收集實驗數(shù)據(jù)。(2)生物樣本:采集生物組織、細胞、血液等樣本,進行實驗室檢測分析。(3)醫(yī)療數(shù)據(jù)庫:利用已建立的電子病歷、健康檔案等數(shù)據(jù)庫進行數(shù)據(jù)挖掘。(4)文獻資料:通過查閱國內(nèi)外相關(guān)文獻,獲取研究數(shù)據(jù)。(5)問卷調(diào)查:設(shè)計針對性強的問卷,收集患者或研究對象的個人信息和健康狀況。2.1.2數(shù)據(jù)收集方法數(shù)據(jù)收集方法包括:(1)現(xiàn)場調(diào)查:直接深入研究對象所在的現(xiàn)場,進行面對面調(diào)查。(2)遠程調(diào)查:通過電話、網(wǎng)絡(luò)等方式進行數(shù)據(jù)收集。(3)醫(yī)學(xué)檢測:利用醫(yī)學(xué)設(shè)備和技術(shù),對研究對象進行生理、生化等指標的檢測。(4)生物信息學(xué)方法:通過生物信息學(xué)技術(shù),如基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等,收集生物大數(shù)據(jù)。2.2數(shù)據(jù)整理與清洗收集到的原始數(shù)據(jù)往往存在一定的錯誤和冗余,需要進行整理與清洗。2.2.1數(shù)據(jù)整理數(shù)據(jù)整理主要包括以下幾個方面:(1)數(shù)據(jù)分類:按照研究需求和數(shù)據(jù)類型,對數(shù)據(jù)進行分類。(2)數(shù)據(jù)編碼:將非數(shù)值型的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為計算機可處理的編碼。(3)數(shù)據(jù)格式化:統(tǒng)一數(shù)據(jù)格式,便于后續(xù)分析。2.2.2數(shù)據(jù)清洗數(shù)據(jù)清洗主要包括以下幾個方面:(1)去除重復(fù)數(shù)據(jù):通過數(shù)據(jù)篩選,刪除重復(fù)記錄。(2)糾正錯誤數(shù)據(jù):檢查數(shù)據(jù)中的錯誤,并進行糾正。(3)填補缺失值:對缺失的數(shù)據(jù)進行填補,可采用均值、中位數(shù)等方法。(4)數(shù)據(jù)規(guī)范化:將數(shù)據(jù)范圍縮放到同一級別,便于分析。2.3數(shù)據(jù)儲存與管理數(shù)據(jù)儲存與管理是保證數(shù)據(jù)安全、高效使用的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。2.3.1數(shù)據(jù)儲存(1)數(shù)據(jù)庫儲存:利用數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)(如MySQL、Oracle等)儲存數(shù)據(jù)。(2)文件儲存:將數(shù)據(jù)以文件形式儲存,如CSV、Excel等格式。(3)云儲存:利用云服務(wù)提供商提供的儲存空間,進行數(shù)據(jù)儲存。2.3.2數(shù)據(jù)管理(1)數(shù)據(jù)備份:定期對數(shù)據(jù)進行備份,防止數(shù)據(jù)丟失。(2)數(shù)據(jù)權(quán)限管理:設(shè)置不同級別的數(shù)據(jù)訪問權(quán)限,保證數(shù)據(jù)安全。(3)數(shù)據(jù)更新:及時更新數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)的時效性。(4)數(shù)據(jù)共享:在保證數(shù)據(jù)安全的前提下,與其他研究者共享數(shù)據(jù),促進學(xué)術(shù)交流。第3章統(tǒng)計描述與圖表展示3.1描述性統(tǒng)計分析描述性統(tǒng)計分析是對數(shù)據(jù)進行概括和總結(jié)的過程,旨在揭示數(shù)據(jù)的基本特征。本節(jié)將詳細介紹如何進行描述性統(tǒng)計分析,包括集中趨勢和離散程度的度量。3.1.1集中趨勢度量(1)均值:計算數(shù)據(jù)集的算術(shù)平均數(shù),用以描述數(shù)據(jù)的平均水平。(2)中位數(shù):將數(shù)據(jù)集按大小順序排列后,位于中間位置的數(shù)值,用以描述數(shù)據(jù)的中間水平。(3)眾數(shù):數(shù)據(jù)集中出現(xiàn)次數(shù)最多的數(shù)值,用以描述數(shù)據(jù)的典型水平。3.1.2離散程度度量(1)標準差:衡量數(shù)據(jù)集的離散程度,反映數(shù)據(jù)值與均值的平均偏差。(2)方差:標準差的平方,同樣用于衡量數(shù)據(jù)的離散程度。(3)四分位數(shù):將數(shù)據(jù)集分為四等份的數(shù)值,包括第一四分位數(shù)(Q1)、第二四分位數(shù)(中位數(shù))和第三四分位數(shù)(Q3),用于描述數(shù)據(jù)的分布情況。3.2圖表制作與展示圖表是展示數(shù)據(jù)分布和關(guān)系的重要工具。本節(jié)將介紹如何制作和展示常用的圖表。3.2.1條形圖條形圖用于展示分類數(shù)據(jù),可以反映各類別的頻數(shù)或比例。3.2.2餅圖餅圖適用于展示各分類在總體中的占比情況,可以清晰地顯示各部分的比例關(guān)系。3.2.3折線圖折線圖用于展示數(shù)據(jù)隨時間或其他變量的變化趨勢。3.2.4散點圖散點圖用于展示兩個變量之間的關(guān)系,可以觀察數(shù)據(jù)的分布特征和相關(guān)性。3.3數(shù)據(jù)可視化數(shù)據(jù)可視化是指將數(shù)據(jù)以圖形、圖像等形式展示出來,以便更好地觀察和分析數(shù)據(jù)。以下是一些常用的數(shù)據(jù)可視化方法:3.3.1熱力圖熱力圖通過顏色深淺來表示數(shù)據(jù)的大小,適用于展示矩陣型數(shù)據(jù)。3.3.2地圖地圖用于展示地理空間數(shù)據(jù),可以反映不同地區(qū)的數(shù)據(jù)分布和差異。3.3.3箱線圖箱線圖用于展示數(shù)據(jù)的分布情況,包括中位數(shù)、四分位數(shù)和異常值。3.3.43D散點圖3D散點圖可以展示三個變量之間的關(guān)系,有助于發(fā)覺數(shù)據(jù)中的隱藏模式。通過本章的學(xué)習,讀者可以掌握統(tǒng)計描述和圖表展示的基本方法,為醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析提供有力的支持。第4章假設(shè)檢驗與推斷統(tǒng)計4.1常見的假設(shè)檢驗方法假設(shè)檢驗是統(tǒng)計學(xué)中用于判斷樣本數(shù)據(jù)是否支持某個假設(shè)的方法。以下為醫(yī)學(xué)研究中常見的假設(shè)檢驗方法:4.1.1單樣本t檢驗單樣本t檢驗主要用于比較樣本均值與總體均值是否存在顯著差異。適用于樣本量較小且總體標準差未知的情況。4.1.2雙樣本t檢驗雙樣本t檢驗用于比較兩個獨立樣本的均值是否存在顯著差異。包括等方差雙樣本t檢驗和非等方差雙樣本t檢驗。4.1.3方差分析(ANOVA)方差分析用于比較三個或三個以上獨立樣本的均值是否存在顯著差異。包括單因素方差分析和多因素方差分析。4.1.4卡方檢驗卡方檢驗主要用于計數(shù)數(shù)據(jù),檢驗兩個分類變量之間的獨立性或擬合優(yōu)度。4.1.5非參數(shù)檢驗當數(shù)據(jù)不滿足正態(tài)分布或等方差性時,可以使用非參數(shù)檢驗。如:曼惠特尼U檢驗、威爾科克森符號秩檢驗等。4.2P值與顯著性水平在假設(shè)檢驗中,P值表示在原假設(shè)為真時,觀察到的統(tǒng)計量或更極端值出現(xiàn)的概率。顯著性水平(α)是事先設(shè)定的用于判斷拒絕原假設(shè)的閾值。4.2.1P值的計算根據(jù)不同的假設(shè)檢驗方法,采用相應(yīng)的統(tǒng)計量計算P值。4.2.2顯著性水平的選取顯著性水平(α)通常取0.01、0.05或0.1。選擇合適的顯著性水平可以降低犯第一類錯誤的概率。4.3誤差分析與力量計算4.3.1誤差分析誤差分析主要包括以下兩類:(1)第一類錯誤:拒絕原假設(shè),實際上原假設(shè)為真。(2)第二類錯誤:接受原假設(shè),實際上原假設(shè)為假。4.3.2力量計算力量(Power)是指正確拒絕原假設(shè)的概率,即1第二類錯誤的概率。在進行假設(shè)檢驗之前,可以根據(jù)樣本量、效應(yīng)量等因素進行力量計算,以保證實驗具有足夠的統(tǒng)計功效。第5章方差分析與應(yīng)用5.1單因素方差分析5.1.1原理與概念單因素方差分析(OnewayANOVA)主要用于比較三個或以上樣本均值是否存在顯著差異。其基本原理是根據(jù)觀測值與各組均值之間的離差平方和,評估各組均值之間是否存在顯著性差異。5.1.2假設(shè)檢驗(1)零假設(shè)(H0):各樣本均值無顯著差異;(2)備擇假設(shè)(H1):至少有一個樣本均值與其他樣本均值存在顯著差異。5.1.3數(shù)據(jù)要求(1)各樣本數(shù)據(jù)應(yīng)滿足正態(tài)分布;(2)各樣本方差應(yīng)相等;(3)樣本間獨立。5.1.4計算步驟(1)計算組內(nèi)平方和(SSW);(2)計算組間平方和(SSB);(3)計算F統(tǒng)計量;(4)查表得到F臨界值,進行假設(shè)檢驗;(5)給出P值,判斷顯著性水平。5.2多因素方差分析5.2.1原理與概念多因素方差分析(MANOVA)主要用于研究兩個或以上因素對觀測變量的影響,以及這些因素之間的交互作用。其核心思想是分析不同因素水平組合下的樣本均值是否存在顯著差異。5.2.2假設(shè)檢驗(1)零假設(shè)(H0):各因素及其交互作用對觀測變量無顯著影響;(2)備擇假設(shè)(H1):至少有一個因素或交互作用對觀測變量有顯著影響。5.2.3數(shù)據(jù)要求(1)各樣本數(shù)據(jù)滿足正態(tài)分布;(2)各樣本方差相等;(3)樣本間獨立;(4)各因素水平數(shù)相等或近似。5.2.4計算步驟(1)構(gòu)建方差分析表;(2)計算主效應(yīng)和交互效應(yīng)的平方和;(3)計算各效應(yīng)的F統(tǒng)計量;(4)查表得到F臨界值,進行假設(shè)檢驗;(5)給出P值,判斷顯著性水平。5.3重復(fù)測量方差分析5.3.1原理與概念重復(fù)測量方差分析(RepeatedMeasuresANOVA)主要用于比較同一組受試者在不同時間點或條件下的觀測值是否存在顯著差異。5.3.2假設(shè)檢驗(1)零假設(shè)(H0):各時間點或條件下的觀測值無顯著差異;(2)備擇假設(shè)(H1):至少有一個時間點或條件下的觀測值與其他時間點或條件下的觀測值存在顯著差異。5.3.3數(shù)據(jù)要求(1)各時間點或條件下的數(shù)據(jù)滿足正態(tài)分布;(2)各時間點或條件下的方差相等;(3)受試者內(nèi)部各時間點或條件下的觀測值獨立;(4)受試者之間獨立。5.3.4計算步驟(1)計算總平方和(SST);(2)計算組內(nèi)平方和(SSW);(3)計算組間平方和(SSB);(4)計算重復(fù)測量效應(yīng)的平方和;(5)計算各效應(yīng)的F統(tǒng)計量;(6)查表得到F臨界值,進行假設(shè)檢驗;(7)給出P值,判斷顯著性水平。第6章相關(guān)分析與回歸分析6.1相關(guān)性分析相關(guān)性分析旨在探究兩個或多個變量間的相互關(guān)系。本章首先介紹皮爾遜相關(guān)系數(shù)和斯皮爾曼等級相關(guān)系數(shù),以評價定量變量間的線性相關(guān)程度;通過肯德爾等級相關(guān)系數(shù),分析分類變量間的關(guān)聯(lián)性。還將討論相關(guān)性的假設(shè)檢驗,以及如何處理相關(guān)分析中的常見問題。6.1.1皮爾遜相關(guān)系數(shù)6.1.2斯皮爾曼等級相關(guān)系數(shù)6.1.3肯德爾等級相關(guān)系數(shù)6.1.4相關(guān)性假設(shè)檢驗6.1.5相關(guān)分析中的注意事項6.2線性回歸分析線性回歸分析用于研究因變量與自變量之間的線性關(guān)系。本章將從簡單線性回歸模型入手,闡述最小二乘法估計參數(shù)的原理,并探討回歸模型的假設(shè)檢驗和診斷。6.2.1簡單線性回歸模型6.2.2最小二乘法參數(shù)估計6.2.3回歸模型的假設(shè)檢驗6.2.4回歸模型的診斷6.2.5回歸系數(shù)的解釋6.3多元回歸分析多元回歸分析擴展了線性回歸的范疇,允許同時考慮多個自變量對因變量的影響。本章將介紹多元回歸模型的構(gòu)建、參數(shù)估計、假設(shè)檢驗以及在實際應(yīng)用中應(yīng)注意的問題。6.3.1多元回歸模型構(gòu)建6.3.2參數(shù)估計與解釋6.3.3假設(shè)檢驗與模型選擇6.3.4多元回歸分析中的多重共線性問題6.3.5多元回歸分析的應(yīng)用示例通過本章的學(xué)習,讀者將掌握相關(guān)分析與回歸分析的基本原理、方法及其在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用。這將有助于提高醫(yī)學(xué)實驗數(shù)據(jù)分析的準確性和科學(xué)性,為后續(xù)研究提供有力支持。第7章多變量統(tǒng)計分析7.1主成分分析7.1.1基本原理主成分分析(PrincipalComponentAnalysis,PCA)是一種常用的多變量統(tǒng)計分析方法,其目的是在眾多變量中提取主要信息,通過降維的方式簡化數(shù)據(jù)集,同時盡可能保留原始數(shù)據(jù)的信息。7.1.2應(yīng)用場景在醫(yī)學(xué)研究中,主成分分析可用于基因表達數(shù)據(jù)的降維、疾病特征提取等。7.1.3步驟與方法(1)數(shù)據(jù)標準化:對原始數(shù)據(jù)進行標準化處理,消除不同變量量綱和數(shù)量級的影響。(2)計算協(xié)方差矩陣:求出各變量間的協(xié)方差矩陣,以反映變量間的相關(guān)程度。(3)求解特征值和特征向量:求解協(xié)方差矩陣的特征值和特征向量。(4)選擇主成分:根據(jù)特征值大小,選擇前k個主成分,k需滿足累計貢獻率大于等于85%。(5)構(gòu)造主成分得分:將原始數(shù)據(jù)投影到所選主成分上,得到主成分得分。7.2因子分析7.2.1基本原理因子分析(FactorAnalysis)是一種摸索變量之間潛在結(jié)構(gòu)的方法,旨在找出影響多個觀測變量的共同因子。7.2.2應(yīng)用場景在醫(yī)學(xué)研究中,因子分析可用于探討疾病與眾多影響因素之間的潛在關(guān)系。7.2.3步驟與方法(1)確定因子個數(shù):根據(jù)研究問題和數(shù)據(jù)特點,確定因子個數(shù)。(2)計算因子載荷:求出各變量與因子之間的相關(guān)系數(shù),即因子載荷。(3)因子旋轉(zhuǎn):為了使因子結(jié)構(gòu)更清晰,進行因子旋轉(zhuǎn),使各因子載荷在0和1之間分化。(4)因子得分:根據(jù)因子載荷,計算各樣本在各個因子上的得分。7.3聚類分析7.3.1基本原理聚類分析(ClusterAnalysis)是一種將樣本或變量按照相似性進行分類的方法,旨在發(fā)覺數(shù)據(jù)中的自然分群。7.3.2應(yīng)用場景在醫(yī)學(xué)研究中,聚類分析可用于疾病亞型劃分、基因表達譜分析等。7.3.3步驟與方法(1)選擇距離度量:根據(jù)數(shù)據(jù)類型和特點,選擇合適的距離度量方法,如歐氏距離、馬氏距離等。(2)確定聚類方法:選擇合適的聚類算法,如Kmeans、層次聚類等。(3)確定聚類個數(shù):根據(jù)實際問題和經(jīng)驗,確定聚類個數(shù)。(4)進行聚類分析:根據(jù)選定的聚類方法和距離度量,對數(shù)據(jù)進行聚類分析。(5)評估聚類效果:通過輪廓系數(shù)、同質(zhì)性指數(shù)等指標評估聚類效果。第8章非參數(shù)統(tǒng)計方法8.1非參數(shù)檢驗概述非參數(shù)檢驗是一類不依賴于數(shù)據(jù)分布形態(tài)的統(tǒng)計方法,適用于樣本量較小、數(shù)據(jù)分布不明確或不滿足正態(tài)分布條件的情況。非參數(shù)檢驗主要包括秩和檢驗、卡方檢驗、KruskalWallis檢驗等。本章主要介紹非參數(shù)檢驗的基本概念及其在醫(yī)學(xué)研究與實驗數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用。8.2秩和檢驗與符號秩檢驗8.2.1秩和檢驗秩和檢驗(RankSumTest)是常用的非參數(shù)檢驗方法,主要用于比較兩個獨立樣本的中位數(shù)是否存在顯著差異。其基本思想是將兩個樣本的數(shù)據(jù)混合并按大小排序,賦予每個數(shù)據(jù)一個秩次,然后計算兩個樣本的秩和,根據(jù)特定的統(tǒng)計分布進行假設(shè)檢驗。(1)計算步驟步驟一:將兩個獨立樣本的數(shù)據(jù)混合,并按大小排序,賦予每個數(shù)據(jù)一個秩次。步驟二:計算每個樣本的秩和,記為T1和T2。步驟三:根據(jù)樣本量n1、n2和相應(yīng)的統(tǒng)計分布(如Wilcoxon分布),確定檢驗的統(tǒng)計量及P值。(2)應(yīng)用示例在醫(yī)學(xué)研究中,秩和檢驗可用于比較兩組患者的生存時間、治療效果等。8.2.2符號秩檢驗符號秩檢驗(SignedRankTest)是秩和檢驗的一種特殊形式,主要用于比較兩個相關(guān)樣本的中位數(shù)是否存在顯著差異。(1)計算步驟步驟一:計算每對相關(guān)樣本的差異,并賦予正、負號。步驟二:將差異的絕對值按大小排序,賦予秩次。步驟三:根據(jù)正、負秩次,計算檢驗的統(tǒng)計量及P值。(2)應(yīng)用示例在醫(yī)學(xué)研究中,符號秩檢驗可用于比較同組患者在不同時間點的觀察指標是否存在顯著差異。8.3配對樣本非參數(shù)檢驗配對樣本非參數(shù)檢驗主要用于比較兩個相關(guān)樣本的分布是否存在顯著差異。在醫(yī)學(xué)研究中,此類檢驗常用于比較同組患者在接受不同治療方法或干預(yù)措施前后的觀察指標。常用的配對樣本非參數(shù)檢驗方法包括:(1)配對樣本秩和檢驗(2)配對樣本符號秩檢驗(3)配對樣本KruskalWallis檢驗這些檢驗方法在實際應(yīng)用中,可根據(jù)數(shù)據(jù)類型、分布特性及研究目的進行選擇。需要注意的是,在應(yīng)用非參數(shù)檢驗時,應(yīng)保證樣本量足夠,以提高檢驗的效能。同時對于檢驗結(jié)果的解釋,應(yīng)結(jié)合實際研究背景及專業(yè)知識進行綜合分析。第9章生存分析與應(yīng)用9.1生存數(shù)據(jù)的特點與描述生存數(shù)據(jù)是指在一段時間內(nèi),觀察個體是否發(fā)生特定事件(如死亡、疾病進展等)的數(shù)據(jù)。這類數(shù)據(jù)具有以下特點:(1)非完整數(shù)據(jù):生存數(shù)據(jù)中,部分個體的觀察時間可能未達到研究終點,導(dǎo)致數(shù)據(jù)不完整。(2)右刪失:生存數(shù)據(jù)通常存在右刪失現(xiàn)象,即部分個體在研究結(jié)束時仍未發(fā)生事件,無法觀察到確切的事件發(fā)生時間。(3)時間依賴性:生存數(shù)據(jù)隨時間變化,需要考慮時間因素對事件發(fā)生的影響。生存數(shù)據(jù)描述主要包括以下內(nèi)容:(1)生存時間:指從觀察開始到事件發(fā)生的時間。(2)生存狀態(tài):指觀察結(jié)束時個體是否發(fā)生事件。(3)風險集:指在某一特定時間點,可能發(fā)生事件的個體集合。9.2生存函數(shù)與風險函數(shù)生存函數(shù)和風險函數(shù)是生存分析中的兩個重要概念。(1)生存函數(shù)生存函數(shù)S(t)表示個體在時間t后仍生存的概率,即生存函數(shù)S(t)=P(T>t),其中T表示生存時間。(2)風險函數(shù)風險函數(shù)h(t)表示個體在時間t后立即發(fā)生事件的概率,即風險函數(shù)h(t)=P(T=tT>t)。風險函數(shù)與生存函數(shù)的關(guān)系為:h(t)=dS(t)/dt。9.3常用生存分析方法(1)KaplanMeier法:KaplanMeier法是一種非參數(shù)生存分析方法,通過計算累積生存函數(shù)來描述生存數(shù)據(jù),適用于小樣本數(shù)據(jù)。(2)Logrank檢驗:Logrank檢驗是一種常用的生存曲線比較方法,用于比較兩組生存時間的差異。(3)Cox比例風險模型:Cox比例風險模型是一種半?yún)?shù)生存分析方法,通過建立風險函數(shù)與協(xié)變量之間的關(guān)系,評估協(xié)變量對生存時間的影響。(4)參數(shù)模型:參數(shù)模型通過假設(shè)生存時間服從某種特定分布(如Weibull分布、Exp
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