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文檔簡介
生物醫(yī)藥基地westernblot技術手冊
1.westernblot主要試劑的配方
1.15義電泳緩沖液配方(IL)
Tris-Base15.1g
甘氨酸(Glycine)94g
SDS5g
留意事項:
a.加水時應盡量避開氣泡的產(chǎn)生,否則會造成過多SDS的損耗。
b.配制好的溶液放于4度冰箱保存,使用時用純水稀釋至IX使用。
1.2IX轉(zhuǎn)膜液配方[1L)
甘氨酸(Glycine)2.9g
Tris-Base5.8g
SDS0.37g
甲醇200ml
留意事項:
a.參加適量的純水,用磁力轉(zhuǎn)子將各組分溶解后參加甲醇溶液,最終
用純水定容至1L(甲醇氣味大,通風廚內(nèi)配制,并留意戴口罩)。
b.加水時應盡量避開氣泡的產(chǎn)生,否則會造成過多SDS的損耗。
1.310XTBS配方UL)
Tris-Base24.2g
NaCl80g
留意事項:
參加適量的純水溶解各組分后,使用濃鹽酸或濃氫氧化鈉溶液調(diào)整
溶液的PH至7.6(一般溶解后溶液是偏堿的,所以選用濃鹽酸調(diào)整
PH至7.6即可)。
b.使用PH計調(diào)整溶液的PH前,要依據(jù)說明書校準PH計。
c.PH調(diào)整至7.6后,用純水定容至1L,使用時稀釋10倍至1義使用。
d.配制TBST時,在1XTBS中依據(jù)1:1000的比例參加吐溫20充分
混勻即可。
1.430%丙烯酰胺單體儲存液配方(100ml)
丙烯酰胺(Acrylamide)29g
N,N、?亞甲雙丙烯酰胺
(N,N'-MethyleneBisacrylamide)1g
留意事項:
a.將各組分溶于總體積為60ml的純水中,加熱至37C完全溶解,用
純水定容至100ml。
b.用裝0.45|im膜的濾器過濾,置于棕色瓶中保存于4℃冰箱保存。
c.丙烯酰胺有神經(jīng)毒性,操作時戴手套,并留意不要造成試驗臺面
等的污染。
1.5上液(IMTris-HClPH=6.8)配方(50ml)
Tris-Base6.057g
三蒸水40ml
留意事項:用濃鹽酸調(diào)整PH至6.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰
箱保存。
1.6下液fIMTris-HCl,pH8.8)[50ml)
Tris-Base9.08g
三蒸水40ml
留意事項:用濃鹽酸調(diào)整PH至8.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰
箱保存。
2.WesternBlot主要流程
2.1蛋白樣品的提取
2.1.1常用裂解液及其特點
產(chǎn)品編號POO13P00J3BP00I3CP0013DP0013EP0013G
Western及IP
產(chǎn)品名稱RIPA裂解液(強)RIPA裂解液(中)RIPA裂解液(弱)NPT0裂解液SDS裂解液
細胞裂解液
1%NP-40,
1%TritonX-1%TritonX-100,1%1%NP-4O,0.5%
有效裂解成分0.25%!%NP-401%SDS
100deoxycholate,0.1%SDSdeoxycholate,0.1%SDS
deoxycholate
裂解強度溫和強中溫和溫和強
對膜蛋白的提取一般很好較好一般一般很好
對胞漿蛋白的提取很好很好很好很好很好很好
對核蛋白的提取較好很好較好較好較好很好
胞漿磷酸化素門提取很好很好很好很好很好很好
細胞核轉(zhuǎn)錄因子提取很好很好很好很好很好很好
含蛋白酶抑制劑是是是是是是
含磷酸酯酶抑制劑是是是是是足
主要用途W(wǎng)B,IP.co-lPWB,IPWB.IPWB,IP,co-IPWB,IP.co-IPWB.ChIP
2.1.2醫(yī)藥基地常用蛋白質(zhì)提取方法
(1)RIPA強裂解法:
a.取適量胰酶消化細胞[針對對貼壁細胞,懸浮細胞可省略此步),
收取細胞,PBS洗兩遍,600g離心5min,盡量去除PBS,向細胞沉
淀中參加適量的預加了蛋白醐抑制劑PMSF的RIPA強裂解液(803
——200ul不等,依據(jù)自己細胞量的多少定)。
b.冰上裂解40min,每5min猛烈渦旋一次。
c.充分裂解后,14000rpm,4℃離心15min,將上清轉(zhuǎn)至另一預冷的
EP管中(不要吸到管底的沉淀)。
留意事項:
a.整個過程盡量在冰上操作,由于蛋白在常溫降解速度很快,而在
冰上則能顯著的減慢這一過程。
b.PMSF有毒,留意戴手套,并留意不要造成試驗臺面等的污染。
(2)SDS煮沸法(此方法對Caspase家族切割條帶具有特效):
a.收取細胞,PBS洗兩遍,600g離心5min,盡量去除PBS。
b.向細胞沉淀中參加適量的預加了蛋白酶抑制劑PMSF的SDS裂解
液(80ul—2003不等,依據(jù)自己細胞量的多少定)。
c.將EP管放在加熱器上95-100℃加熱20min以上,加熱至樣品中的
核酸粘稠物(細胞內(nèi)核酸)完全溶解為止。
d.充分裂解后,14000rpm,4℃離心15min,將上清轉(zhuǎn)至另一預冷的
EP管中(不要吸到管底的沉淀)。
留意事項:
a.由于加熱的溫度很高為95℃,煮沸的全過程中,不要離開蛋白樣
品,防止EP管炸開而損失蛋白樣品,甚至蛋白樣品被蒸干。具體技
巧與方法:放物體壓住EP管,待加熱時間快完畢時,停頓加熱,冷
卻到肯定時間,輕輕拿開物體,輕輕拿出EP管。
b.盡快將核酸粘稠物煮化,縮短提取蛋白時間。具體技巧與方法:
加熱前適度渦旋,加熱過程中用剪去尖端的槍頭吹打樣品。
c.提取的蛋白樣品置于?20℃保存。
⑶細胞刮法(針對貼壁細胞)
a.倒掉培育基,PBS洗培育皿2次。
b.吸盡殘留的PBS,參加預加了PMSF的SDS裂解液50-500U1,快速
用細胞刮將細胞刮下,并將裂解后的細胞轉(zhuǎn)移到EP管中,其他步驟
同SDS煮沸法。
留意事項:整個過程盡量在冰上操作以減慢蛋白的降解。
2.2蛋白樣品的定量
本試驗室承受BCA法測定蛋白質(zhì)濃度,具體步驟:
a.將各蛋白樣品稀釋20倍(依據(jù)自己蛋白樣品的濃度可加大稀釋倍
數(shù))至總體積為40ul或以上,以供每個樣品3個復孔。
b.將蛋白樣品和蛋白標準品參加96孔板中,每孔10ul,每個樣品3
個復孔。
c.配制顯色液,充分混勻,參加96孔板,每孔lOOulo
d.37℃孵育30min,酶標儀檢測吸光度。
留意事項:
a.盡量將樣品加在96孔板的中間位置,避開酶標儀檢測時的邊緣效
應。
b.參加樣品和顯色液的過程中盡量避開氣泡的產(chǎn)生。
c.選用準確度高的移液槍,盡量使用進口的槍頭。
2.3SDS聚丙烯酰胺凝膠的配制
2.3.1不同濃度膠的最正確分別范圍
SDS-分別膠濃度最正確分別范
6類膠50-150kD
8用膠30-90kD
10%膠20-80kD
|12%膠
12-60kD
15%膠10-40kD
2.3.2不同濃度膠的配制
成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(若升)
_________6%膠5ml10ml15ml201nl30ml50nli
蒸藤水2.04.06.08.012.020.0
30%Acr-Bis(29:l)1.02.03.04.06.010.0
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%過硫酸鉉0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0040.0080.0120.0160.0240.04
成分配制不同體積SDS-分別膠所需各成分的體積(圣升)
8%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸飽水1.73.356.710.016.7
30%Aci-Bis(29:l)1.32.74.05.38.013.3
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%過硫酸鉞0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0030.0060.0090.0120.0180.03
成分配制不同體枳SDS-分別股所需各成分的體積(毫升)
10%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸徽水1.32.74.05.38.013.3
30%Acr-Bis(29:l)1.73.35.06.710.016.7
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%過疏酸鉞0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(亮升)
12%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸懦水1.02.03.04.06.010.0
30%Acr-Bis(29:l)2.04.06.08.012.020.0
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%過硫酸鐐0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(宅升)
15%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸馀水0.51.01.52.03.05.0
30%Acr-Bis(29:l)2.55.07.510.015.025.0
IMTris,pll8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%過硫酸核0.05|0.1|0.150.2I0.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
依據(jù)如下表格配制SDS-的濃縮膠(也稱為積存膠、上層
膠)
成分配制不同體積SDS-濃縮股所需各成分的體積(定升)
8|10|
5%股2346
5.5|
蒸飾水1.42.12.74.16.8
30%Acr-Bis(29:l)0.330.50.671.01.31.7
IMTris,pH6.80.250.380.5|0.751.01.25
10%SDS0.020.030.040.060.080.1
10%過硫酸筱0.020.030.040.060.080.1
TEMED0.0020.0030.0040.0060.0080.01
2.4WesternBlot主要步驟
(1)樣品制備(具體方法參見2.1.2)
進展Western雜交時還需設置內(nèi)或外參照,通常用beta-actin和
GAPDHo
留意事項:一般上樣20?30pg已足夠,如待檢蛋白為低豐度蛋白,
可加大上樣量至lOOgg,但電泳條帶易拖尾,可制備亞細胞組份濃縮
目的蛋白或承受更敏感的檢測方法。
(2)電泳分別(參照SDS-電泳方法)
留意事項:
a.膠版都是周密的玻璃器材,使用時輕拿輕放,制止將膠板放到烘
箱烘烤。
b.電泳槽和膠槽中的電泳液要充分,可以避開跑出“笑臉”和“哭
臉'。
C.依據(jù)試驗者的樣品數(shù)選擇相應的泳道數(shù),樣品的兩側需參加蛋白
marker,便于剪切目的蛋白條帶。剩余的泳道參加等體積的1XSDS
填充,以平衡鹽離子電壓,這樣可以防止蛋白條帶跑歪。兩側的蛋白
marker可選擇不同的用量,然后依據(jù)蛋白marker的深和淺區(qū)分點樣
的挨次。
d.WesternBlot中使用過的任何器材、試劑、儀器,全部要放歸原位
或恢復到使用前的狀態(tài)。
(3)轉(zhuǎn)膜
雜交膜的選擇是打算Westernblot成敗的重要環(huán)節(jié)°應依據(jù)雜交
方案、被轉(zhuǎn)移蛋白的特性以及分子大小等因素,選擇適宜材質(zhì)、孔徑
和規(guī)格的雜交膜。用于Westernblot的膜主要有兩種:硝酸纖維素膜
(NC)和PVDF膜(基地目前使用)。NC膜是蛋白印跡試驗的標準固
相支持物,在低離子轉(zhuǎn)移緩沖液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負電荷的蛋白質(zhì)會
與膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結合在一起,但在非離子型的去污劑
作用下,結合的蛋白還可以被洗脫下來。依據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大
小,選擇不同孔徑的NC膜。由于隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分
子量蛋白的結合就越結實。通常用0.45摩和0.2即兩種規(guī)格的NC
膜。大于20kD的蛋白可用0.45pm的膜,小于20kD的蛋白就要用
0.2|im的膜了,如用0.45|xm的膜就會發(fā)生“Blowthrough”的現(xiàn)象。
PVDF膜靈敏度、區(qū)分率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,格外適合于
低分子量蛋白的檢測。但PVDF膜在使用之前必需分別用純甲醇、純
水、轉(zhuǎn)膜液浸泡飽和5mino
蛋白質(zhì)常用的轉(zhuǎn)移方法主要有兩種:槽式濕轉(zhuǎn)(基地目前使用)
和半干轉(zhuǎn)移。前者操作簡潔,轉(zhuǎn)移效率高;而后者適用于大膠的蛋白
轉(zhuǎn)移,所用緩沖液少。
操作步驟:
a.將膠浸于轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10mino如檢測小分子蛋白,可省略此
步,因小分子蛋白簡潔集中出膠。
b.依據(jù)膠的大小剪取膜和濾紙6片,放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡lOmino
c.裝配轉(zhuǎn)移三明治:海綿+3層濾紙+膠+膜+3層濾紙+海綿,每層放
好后,用試管趕去氣泡。切記:膠放于負極面(黑色面)。
d,將轉(zhuǎn)移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面對黑色面),加轉(zhuǎn)移緩
沖液,插上電極,選擇穩(wěn)流200mA,l-2h(依據(jù)分子量的大小打算電
泳時間)。留意:應再次檢查“三明治”和電極是否裝配正確,電源
是否接通。
e.轉(zhuǎn)膜完畢后,切斷電源,取出雜交膜
留意事項:
a.PVDF膜是比較貴重的試驗用品,使用時要節(jié)約使用,依據(jù)膠的大
小來裁剪PVDF膜。
b.做“三明治”的過程中,膜與膠之間不能有氣泡。
c.活化PVDF膜要充分,假設消滅點點白斑,說明活化不充分,需
要延長活化時間。
d,轉(zhuǎn)膜液可回收4次使用,回收次數(shù)過多影響試驗結果。
e.分子量大的蛋白需延長轉(zhuǎn)膜時間,小分子量蛋白則可適當增加轉(zhuǎn)
膜液中甲醇的比例。
f.轉(zhuǎn)膜完畢后,將膜與膠接觸的一面標記為正面。
(4)免疫雜交與顯色
a.用25mlTBS洗膜5min,室溫,搖動。
b.置膜于25ml封閉緩沖液中l(wèi)h,室溫,搖動。
c.15mlTBS/T洗3次(5min/T)。
d.參加適宜稀釋度的一抗,室溫孵育l-2h(一抗無法回收)或4℃
過夜(一抗可回收屢次),緩慢搖動。
留意事項:
a.一抗為貴重的試驗用品,使用前必讀:本試驗室有比較齊全和充
分的抗體庫,全部(或大局部)購置的抗體在基地OA系統(tǒng)中均有具
體資料記錄,首先試驗者需要在OA系統(tǒng)中確定基地購置了目的蛋白
相關的抗體,然后確定所購置的抗體的生產(chǎn)商以及貨號,再依據(jù)這些
信息登陸相應生產(chǎn)商的網(wǎng)頁,具體查閱試驗者馬上使用一抗的用途
(VCB、IP、Flow、IF等)、一抗來源(便于選擇適宜的二抗)、目的
條帶的分子量大小(便于依據(jù)蛋白marker剪切目的條帶)、一抗的特
異性、一抗使用的稀釋比例。把握這些資料前方能開頭下一步的試驗。
b
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