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文檔簡(jiǎn)介
Q/LB.□XXXXX-XXXXDB37/T4754.1—2024前言本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。本文件是DB37/T4754《動(dòng)物疫病鑒別檢測(cè)技術(shù)》的第1部分。DB37/T4754已經(jīng)發(fā)布了以下部分:第1部分:豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒。請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。本文件由山東省畜牧獸醫(yī)局提出并組織實(shí)施。本文件由山東省畜牧業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口。引言動(dòng)物疫病是影響山東省畜牧業(yè)健康發(fā)展的重要因素之一。不同病原或者相同病原的不同血清型/基因型引起疫病的臨床病癥具有一定程度的相似性,一些疫病弱毒疫苗的使用也干擾了病原的檢測(cè)。動(dòng)物疫病鑒別檢測(cè)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)的建立,規(guī)定了對(duì)不同病原、相同病原的不同血清型/基因型以及弱毒疫苗株的鑒別檢測(cè),為山東省動(dòng)物疫病精準(zhǔn)防控提供了技術(shù)支持,對(duì)于促進(jìn)畜牧業(yè)健康發(fā)展具有重要意義。豬瘟病毒(Classicalswinefever,CSFV)屬于黃病毒科瘟病毒屬成員,是引起豬瘟的病原體。豬瘟嚴(yán)重危害養(yǎng)豬業(yè),世界動(dòng)物衛(wèi)生組織將其列為必須通報(bào)的動(dòng)物疫病之一,我國(guó)將其列為二類動(dòng)物傳染病。豬是豬瘟病毒的唯一宿主。在自然條件下,病毒經(jīng)口腔和鼻腔途徑進(jìn)入宿主,也可通過損傷的皮膚或傷口感染,感染的豬在潛伏期便可排出病毒,病毒隨病豬的分泌物和排泄物污染的飼料和飲水進(jìn)入機(jī)體。我國(guó)從20世紀(jì)50年代便開始廣泛應(yīng)用兔化弱毒疫苗做預(yù)防注射,在控制豬瘟中起到重要的作用,隨著養(yǎng)豬業(yè)的不斷發(fā)展,集約化養(yǎng)豬場(chǎng)規(guī)模越來越大,國(guó)內(nèi)生豬的交易和流通日趨頻繁,給豬瘟的防制帶來了挑戰(zhàn)。各地豬瘟仍時(shí)有發(fā)生,而且多表現(xiàn)為非典型、慢性及隱性狀態(tài),并出現(xiàn)豬瘟病毒的持續(xù)感染和妊娠母豬帶毒綜合征。這給獸醫(yī)臨床診斷帶來了很大困難。中國(guó)豬瘟弱毒疫苗的全面應(yīng)用,使生豬攜帶豬瘟疫苗毒成為常態(tài),導(dǎo)致常規(guī)的豬瘟病毒核酸檢測(cè)難以區(qū)分豬瘟病毒的強(qiáng)毒感染和免疫接種的疫苗弱毒,迫切需要建立一種快速、特異的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)來區(qū)分豬瘟強(qiáng)毒和豬瘟疫苗弱毒,為保障我省養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展發(fā)揮引領(lǐng)和示范作用。本標(biāo)準(zhǔn)制定后,作為《動(dòng)物疫病鑒別檢測(cè)技術(shù)》的1部分,《動(dòng)物疫病鑒別檢測(cè)技術(shù)》擬由以下部分構(gòu)成。第1部分:豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒。目的在于規(guī)范豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒SYBRGreenI熒光RT-PCR鑒別檢測(cè)技術(shù)的操作,便于檢測(cè)技術(shù)在豬瘟臨床診斷、流行病學(xué)調(diào)查、檢驗(yàn)檢疫、豬瘟疫苗質(zhì)量控制等方面的穩(wěn)定應(yīng)用。第2部分:兔出血癥病毒經(jīng)典型與兔出血癥病毒2型。目的在于規(guī)范兔出血癥病毒經(jīng)典型與兔出血癥病毒2型實(shí)時(shí)熒光RT-PCR鑒別檢測(cè)技術(shù)的操作,便于檢測(cè)技術(shù)在兔瘟臨床診斷、流行病學(xué)調(diào)查、檢驗(yàn)檢疫等方面的穩(wěn)定應(yīng)用。第3部分:禽腺病毒Ⅰ群與禽腺病毒Ⅲ群。目的在于規(guī)范禽腺病毒Ⅰ群與Ⅲ群PCR鑒別檢測(cè)技術(shù)的操作,便于檢測(cè)技術(shù)在禽腺病毒病臨床診斷、流行病學(xué)調(diào)查、檢驗(yàn)檢疫等方面的穩(wěn)定應(yīng)用。動(dòng)物疫病鑒別檢測(cè)技術(shù)第1部分:豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒范圍本文件規(guī)定了豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒SYBRGreenI熒光RT-PCR鑒別檢測(cè)。本文件適用于豬瘟強(qiáng)毒與豬瘟疫苗弱毒的鑒別檢測(cè)。規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范術(shù)語和定義本文件沒有需要界定的術(shù)語和定義。試驗(yàn)原理本文件通過特異性引物,在RT-PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增出了豬瘟疫苗弱毒126bp及豬瘟強(qiáng)毒335bp的目的產(chǎn)物,當(dāng)SYBRGreenI熒光染料與擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合時(shí),熒光信號(hào)增強(qiáng),從擴(kuò)增產(chǎn)物上釋放出來時(shí),熒光信號(hào)急劇減弱,不同DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,Tm值不同,通過Tm值的差異及熒光信號(hào)的變化實(shí)現(xiàn)了豬瘟疫苗弱毒與豬瘟強(qiáng)毒擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒別。SYBRGreenI是一種只與雙鏈DNA小溝結(jié)合的染料。試劑和材料除非另有說明,僅使用分析純?cè)噭?。水:GB/T6682,一級(jí)。焦碳酸二乙酯(DEPC)水。取1?mLDEPC加入水至1?000?mL,充分震蕩混勻,靜置24?h后,121?℃高壓滅菌15?min,2?℃~8?℃保存?zhèn)溆?。磷酸鹽緩沖溶液(PBS)。取Na2HPO4.12H2O2.9?g,KCl0.2?g,KH2PO40.2?g,NaCl8?g,溶于800?mL水中,充分?jǐn)嚢枞芙?,滴加濃鹽酸將pH調(diào)節(jié)至7.4,加水定容至1?000?mL,121?℃高壓滅菌15?min,2?℃~8?℃保存?zhèn)溆?。氫氧化鈉溶液(3%)。稱取3?g氫氧化鈉,溶于少量水中,放置室溫后,加水定容至100?mL。乙二胺四乙酸(EDTA)溶液(4%)。稱取4?g乙二胺四乙酸二鈉,加水定容至100?mL。引物:引物名稱和序列見附錄A。商品化病毒核酸提取試劑盒。商品化一步法熒光RT-PCR反應(yīng)試劑。豬瘟疫苗弱毒陽性對(duì)照:市售商品化豬瘟兔化弱毒疫苗(傳代細(xì)胞源)。豬瘟疫苗弱毒陰性對(duì)照:DEPC水。豬瘟強(qiáng)毒陽性對(duì)照:含有豬瘟強(qiáng)毒株擴(kuò)增目的基因的陽性質(zhì)粒。豬瘟強(qiáng)毒陰性對(duì)照:DEPC水。飲用水:清潔、無異味,pH值在6.5~8.5之間。儀器設(shè)備二級(jí)生物安全柜。熒光PCR檢測(cè)儀。電子天平:精度0.01?g。高速冷凍離心機(jī):轉(zhuǎn)速≥12?000?r/min。瞬時(shí)離心機(jī):轉(zhuǎn)速≥6?000?r/min。低溫冰柜:-70?℃以下。高壓蒸汽滅菌器。干熱滅菌器。樣品采樣工具扁桃體采樣器:鼻鉗子、開口器和采樣槍。使用前均用3%的氫氧化鈉溶液浸泡消毒5?min~10?min,飲用水流水沖洗2?min。剪子、鑷子經(jīng)160?℃干熱滅菌2?h。采樣采樣要求:采樣過程按照NY/T541執(zhí)行,采樣及樣品處理過程中應(yīng)戴一次性手套,樣品間不得交叉污染。扁桃體樣品:鼻鉗子固定活豬上顎,用開口器打開口腔,用采樣槍采集扁桃體,滅菌牙簽挑至1.5?mL離心管,編號(hào)標(biāo)記。內(nèi)臟樣品:采集病死或安樂死的豬、兔各種內(nèi)臟器官(脾臟、淋巴結(jié)、腎臟、肺臟、盲腸等)裝入一次性塑料袋或其他滅菌容器,編號(hào)標(biāo)記。全血樣品:用無菌注射器采集全血,注入含有1/10體積4%的EDTA溶液的無菌容器內(nèi),充分混勻后編號(hào)備用。排泄物樣品:用棉拭子挑取少許新鮮糞便樣品于離心管內(nèi),加入1?mLPBS,震蕩混勻,編號(hào)標(biāo)記。細(xì)胞培養(yǎng)物:取1?mL細(xì)胞培養(yǎng)物置于離心管內(nèi),編號(hào)標(biāo)記。疫苗樣品:隨機(jī)抽取豬瘟活疫苗樣品3瓶,分別加入2?mLPBS,溶解,編號(hào)標(biāo)記。樣品的運(yùn)輸及保存運(yùn)輸:采集的樣品密封后,采用保溫箱加冰密封,在2?℃~8?℃條件下24?h內(nèi)運(yùn)送到實(shí)驗(yàn)室。保存:采集的樣品在2?℃~8?℃條件下保存,時(shí)間不超過24?h;-20?℃不超過3個(gè)月,-70?℃不超過5年。試驗(yàn)步驟樣品處理扁桃體樣品:樣品加入5倍體積4?℃預(yù)冷的DEPC水,充分研磨,4?℃、10?000?r/min離心5?min,取上清液轉(zhuǎn)入離心管中編號(hào)備用。內(nèi)臟樣品:樣品加入5倍體積4?℃預(yù)冷的DEPC水,充分研磨,4?℃、10000r/min離心5?min,取上清液轉(zhuǎn)入離心管中編號(hào)備用。排泄物樣品:4?℃、10?000?r/min離心5?min,取上清液0.5?mL轉(zhuǎn)入離心管中編號(hào)備用。細(xì)胞培養(yǎng)物:10?000?r/min離心5?min,取上清液0.5?mL轉(zhuǎn)入離心管中編號(hào)備用。疫苗樣品:10?000?r/min離心5?min,取上清液0.5?mL轉(zhuǎn)入離心管中編號(hào)備用。全血樣品:全血樣品可直接用做核酸提取。核酸抽提進(jìn)行豬瘟病毒檢測(cè)時(shí),生物安全按照GB19489執(zhí)行,采用商品化試劑盒提取病毒核酸。熒光RT-PCR檢測(cè)反應(yīng)體系的配制反應(yīng)體系的配制見附錄B。加樣在各設(shè)定的熒光RT-PCR管中分別加入陽性對(duì)照、陰性對(duì)照和提取的試樣溶液2?μL,蓋緊管蓋,混勻,瞬時(shí)離心1?min。測(cè)定參考儀器參數(shù),選擇SYBRGreenI熒光通道。參考擴(kuò)增條件:第一階段,42?℃反轉(zhuǎn)錄5?min;第二階段,95?℃預(yù)變性10?s;第三階段,95?℃變性5?s,55?℃退火10?s,72?℃延伸20?s,40個(gè)循環(huán)。72?℃時(shí)設(shè)置采集熒光。第四階段,溶解曲線分析,60?℃1?min,以0.1?℃/s的速率升溫,直到97?℃,整個(gè)過程連續(xù)采集熒光,繪制擴(kuò)增產(chǎn)物的熔解曲線。結(jié)果判定質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)豬瘟病毒疫苗弱毒陰性對(duì)照:無Ct值,無典型擴(kuò)增曲線,在熔解曲線Tm值為81.5?℃±0.5?℃范圍內(nèi)未出現(xiàn)熔解峰。陽性對(duì)照:Ct值<30.0,并出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值在81.5?℃±0.5?℃出現(xiàn)熔解峰,參見附錄C(圖C.1)。若陰、陽性對(duì)照組結(jié)果不成立,則視為無效檢驗(yàn)。豬瘟病毒強(qiáng)毒陰性對(duì)照:無Ct值,無典型擴(kuò)增曲線,在熔解曲線Tm值在83.3?℃±0.9?℃范圍內(nèi)未出現(xiàn)熔解峰。陽性對(duì)照:Ct值<30.0,并出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值在83.3?℃±0.9?℃出現(xiàn)熔解峰,參見附錄C(圖C.2)。若陰、陽性對(duì)照組結(jié)果不成立,則視為無效檢驗(yàn)。陰陽性結(jié)果的判定豬瘟病毒疫苗弱毒若檢測(cè)樣品無Ct值并且無典型的擴(kuò)增曲線,在熔解曲線Tm值為81.5?℃±0.5?℃范圍內(nèi)未出現(xiàn)熔解峰,則判為豬瘟病毒疫苗弱毒核酸陰性。若檢測(cè)樣品Ct值≤30.0,出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值為81.5?℃±0.5?℃出現(xiàn)熔解峰,則判為豬瘟病毒疫苗弱毒核酸陽性。若檢測(cè)樣品30.0<Ct值≤35.0,出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值為81.5?℃±0.5?℃出現(xiàn)熔解峰,則判為可疑??梢蓸颖具M(jìn)行雙孔重復(fù)試驗(yàn),若任一孔或兩孔重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果為陽性者判為豬瘟病毒疫苗弱毒核酸陽性,否則為陰性。豬瘟病毒強(qiáng)毒若檢測(cè)樣品無Ct值并且無典型的擴(kuò)增曲線,在熔解曲線Tm值為83.3?℃±0.9?℃范圍內(nèi)未出現(xiàn)熔解峰,則判為豬瘟病毒強(qiáng)毒陰性。若檢測(cè)樣品Ct值≤30.0,出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值在83.3?℃±0.9?℃出現(xiàn)熔解峰,則判為豬瘟病毒強(qiáng)毒核酸陽性。若檢測(cè)樣品30.0<Ct值≤35.0,出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,且熔解曲線Tm值在83.3?℃±0.9?℃出現(xiàn)熔解峰,則判為可疑??梢蓸颖具M(jìn)行雙孔重復(fù)試驗(yàn),若任一孔或兩孔重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果為陽性者判為豬瘟病毒強(qiáng)毒核酸陽性,否則為陰性。
(資料性)
引物引物名稱和序列見表A.1。引物名稱和序列引物名稱引物序列(5′—3′)豬瘟病毒疫苗弱毒上游引物GGTCTCCACAGGGGGGGT豬瘟病毒疫苗弱毒下游引物ACTATTCTGTAACCTGTCTCATTT豬瘟病毒強(qiáng)毒上游引物TGGCACATGGAGTTGAATCAT豬瘟病毒強(qiáng)毒下游引物TGCGTCTCATTGAAAAACTCTA引物用DEPC水溶解并稀釋至100?μmol/L后,-20?℃保存?zhèn)溆?;根?jù)需要配制10μmol/L工作液,-20?℃保存供檢測(cè)使用。
(資料性)
熒光RT-PCR反應(yīng)體系配制豬瘟病毒疫苗弱毒熒光RT-PCR反應(yīng)體系配制見表B.1。豬瘟病毒疫苗弱毒熒光RT-PCR反應(yīng)體系試劑1個(gè)檢測(cè)反應(yīng)的加入量2×OneStepTBGreenRT-PCRBufferⅢ12.5?μLPrimeScriptRTEnzymeMixⅡ0.5?μLExTaqHS(5?U/μL)0.5?μL豬瘟病毒疫苗弱毒上游引物1.0?μL豬瘟病毒疫苗弱毒下游引物1.0?μLRNaseFreedH2O7.5?μL試樣溶液2.0?uL總體積25.0?μL豬瘟病毒強(qiáng)毒熒光RT-PCR反應(yīng)體系配制見表B.2。豬瘟病毒強(qiáng)毒熒光RT-PCR反應(yīng)體系試劑1個(gè)檢測(cè)反應(yīng)的加入量2×OneStepTBGreenRT-PCRBufferⅢ12.5?μLPrimeScriptRTEnzymeMixⅡ0.5?μLExTaqHS(5?U/μL)0.5?μL豬瘟病毒強(qiáng)毒上游引物1.0?μL豬瘟病毒強(qiáng)
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