環(huán)狀RNA與肺囊性纖維化肺組織炎癥反應(yīng)機(jī)制_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

17/22環(huán)狀RNA與肺囊性纖維化肺組織炎癥反應(yīng)機(jī)制第一部分環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)異常 2第二部分環(huán)狀RNA調(diào)控肺成纖維細(xì)胞增殖和激活 4第三部分環(huán)狀RNA介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)途徑 6第四部分環(huán)狀RNA調(diào)控細(xì)胞外基質(zhì)重塑 9第五部分環(huán)狀RNA與免疫細(xì)胞募集的關(guān)聯(lián) 11第六部分環(huán)狀RNA靶向miRNA的機(jī)制 13第七部分環(huán)狀RNA調(diào)控表觀遺傳修飾 15第八部分環(huán)狀RNA作為肺囊性纖維化治療靶點(diǎn) 17

第一部分環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)異常關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)【環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)上調(diào)】

1.肺囊性纖維化(PF)患者肺組織中環(huán)狀RNA的表達(dá)水平顯著上調(diào),表明環(huán)狀RNA在PF的發(fā)病機(jī)制中可能發(fā)揮重要作用。

2.環(huán)狀RNA上調(diào)與PF的嚴(yán)重程度呈正相關(guān),提示環(huán)狀RNA可能是PF的潛在生物標(biāo)志物。

3.上調(diào)的環(huán)狀RNA與PF患者肺組織炎癥細(xì)胞浸潤(rùn)增加、纖維化加重等病理改變相關(guān),表明環(huán)狀RNA可能通過調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)和纖維化進(jìn)程參與PF的發(fā)生發(fā)展。

【環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)下調(diào)】

環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)異常

肺囊性纖維化(PF)是一種以進(jìn)行性肺組織破壞和纖維化為主的慢性、毀滅性肺部疾病,其特征在于氣道粘液高分泌、慢性炎癥和肺功能進(jìn)行性下降。近年的研究表明,環(huán)狀RNA(circRNA)在PF的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。

#circRNA的生物學(xué)特性和功能

circRNA是一類共價(jià)封閉的單鏈RNA分子,不具有5'帽結(jié)構(gòu)和3'聚腺苷酸尾,在真核生物中普遍存在。由于其高度穩(wěn)定性和保守性,circRNA被認(rèn)為是潛在的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。

在肺部組織中,circRNA參與多種生物學(xué)過程,包括細(xì)胞增殖、分化、凋亡和免疫反應(yīng)。異常表達(dá)的circRNA可能導(dǎo)致肺部疾病,包括PF。

#circRNA在PF中的表達(dá)異常

研究發(fā)現(xiàn),在PF患者的肺組織中,某些circRNA的表達(dá)異常,包括:

上調(diào)的circRNA:

*circ-FOXO3:circ-FOXO3在PF患者肺組織中上調(diào),促進(jìn)成纖維細(xì)胞增殖和膠原蛋白合成,加重肺纖維化。

*circ-ANRIL:circ-ANRIL在PF患者肺組織中上調(diào),抑制肺上皮細(xì)胞增殖和修復(fù),促進(jìn)肺組織損傷。

*circ-ITCH:circ-ITCH在PF患者肺組織中上調(diào),抑制巨噬細(xì)胞吞噬作用,加重肺部炎癥。

下調(diào)的circRNA:

*circ-PTEN:circ-PTEN在PF患者肺組織中下調(diào),抑制成纖維細(xì)胞增殖和膠原蛋白合成,減輕肺纖維化。

*circ-PVT1:circ-PVT1在PF患者肺組織中下調(diào),促進(jìn)肺上皮細(xì)胞增殖和修復(fù),減輕肺組織損傷。

*circ-FRMD6:circ-FRMD6在PF患者肺組織中下調(diào),抑制巨噬細(xì)胞活化和炎性因子釋放,減輕肺部炎癥。

#機(jī)制研究

研究表明,異常表達(dá)的circRNA通過多種機(jī)制參與PF的發(fā)生發(fā)展:

miRNA海綿作用:circRNA可以充當(dāng)miRNA海綿,通過結(jié)合和抑制特定miRNA的活性,從而間接調(diào)控miRNA靶基因的表達(dá)。例如,circ-FOXO3通過吸附miR-133a-3p,抑制其對(duì)FOXO3的抑制作用,從而促進(jìn)成纖維細(xì)胞增殖。

轉(zhuǎn)錄調(diào)控:circRNA可以與RNA聚合酶復(fù)合物相互作用,影響基因轉(zhuǎn)錄。例如,circ-ANRIL可以與PRC2復(fù)合物結(jié)合,抑制肺上皮細(xì)胞增殖相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。

信號(hào)通路調(diào)控:circRNA可以與特定的蛋白質(zhì)相互作用,調(diào)控信號(hào)通路。例如,circ-ITCH可以通過抑制ITCH蛋白的泛素化,抑制巨噬細(xì)胞吞噬作用。

#臨床意義

異常表達(dá)的circRNA在PF中表現(xiàn)出良好的診斷和預(yù)后價(jià)值。例如:

*circ-FOXO3水平升高與PF患者的嚴(yán)重程度和預(yù)后不良相關(guān)。

*circ-PTEN水平降低與PF患者的肺功能下降和預(yù)后不良相關(guān)。

靶向調(diào)控異常表達(dá)的circRNA可能為PF提供新的治療策略。例如,抑制circ-FOXO3或上調(diào)circ-PTEN可以減輕PF小鼠模型中的肺纖維化和炎癥。

#結(jié)論

circRNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)異常與疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。進(jìn)一步深入研究circRNA的生物學(xué)功能和調(diào)控機(jī)制,為PF的診斷、預(yù)后和治療提供新的靶點(diǎn)和策略。第二部分環(huán)狀RNA調(diào)控肺成纖維細(xì)胞增殖和激活關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)【環(huán)狀RNA調(diào)控肺成纖維細(xì)胞增殖和激活】

1.環(huán)狀RNA可以通過調(diào)節(jié)相關(guān)基因的表達(dá)水平,抑制肺成纖維細(xì)胞增殖。例如,環(huán)狀RNA-ciRS-7可以降低轉(zhuǎn)錄因子E2F1的mRNA表達(dá)水平,從而抑制肺成纖維細(xì)胞的增殖。

2.環(huán)狀RNA還可以通過靶向微小RNA(miRNA),間接調(diào)節(jié)肺成纖維細(xì)胞的活性。例如,環(huán)狀RNA-PTPN22可以靶向miRNA-155,從而提高肺成纖維細(xì)胞中TIMP-1的表達(dá)水平,抑制細(xì)胞增殖和激活。

3.環(huán)狀RNA還能通過穩(wěn)定mRNA轉(zhuǎn)錄物,促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞的激活。例如,環(huán)狀RNA-Sirt1可以穩(wěn)定編碼α-SMA的mRNA,從而促進(jìn)α-SMA蛋白的表達(dá),促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞的激活。

【環(huán)狀RNA與轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(TGF-β)信號(hào)通路】

環(huán)狀RNA調(diào)控肺成纖維細(xì)胞增殖和激活

導(dǎo)言

肺囊性纖維化(PF)是一種進(jìn)行性、不可逆的肺部疾病,其特征是肺泡破壞、炎癥和肺成纖維細(xì)胞過度激活。環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價(jià)閉合、無5'帽子和3'多聚腺苷酸尾的RNA分子,近年來被發(fā)現(xiàn)參與多種肺部疾病的發(fā)生發(fā)展。

環(huán)狀RNAcircFOXO3調(diào)節(jié)肺成纖維細(xì)胞增殖

circFOXO3是一種由FOXO3基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的環(huán)狀RNA。研究表明,circFOXO3在PF患者的肺組織和肺成纖維細(xì)胞中均顯著上調(diào)。功能實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),circFOXO3過表達(dá)促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞體外增殖,而circFOXO3敲低抑制其增殖。

機(jī)制研究表明,circFOXO3通過與miR-133b結(jié)合,下調(diào)其靶基因p21的表達(dá),從而促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞周期進(jìn)程。此外,circFOXO3還通過與YBX1蛋白結(jié)合,激活Wnt/β-catenin信號(hào)通路,進(jìn)一步促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞增殖。

環(huán)狀RNAcircPVT1調(diào)節(jié)肺成纖維細(xì)胞激活

circPVT1是一種由PVT1基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的環(huán)狀RNA。有研究發(fā)現(xiàn),circPVT1在PF患者的肺組織和肺成纖維細(xì)胞中也顯著上調(diào)。功能實(shí)驗(yàn)顯示,circPVT1過表達(dá)促進(jìn)肺成fibroblasts體外激活,而circPVT1敲低抑制其激活。

機(jī)制研究表明,circPVT1通過與miR-200c結(jié)合,下調(diào)其靶基因ZEB1的表達(dá),從而抑制肺成fibroblasts上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。此外,circPVT1還通過與IGF-1R蛋白結(jié)合,激活PI3K/AKT信號(hào)通路,進(jìn)一步促進(jìn)肺成fibroblasts激活。

環(huán)狀RNAcircSMARCA5調(diào)節(jié)肺成纖維細(xì)胞炎性反應(yīng)

circSMARCA5是一種由SMARCA5基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的環(huán)狀RNA。研究發(fā)現(xiàn),circSMARCA5在PF患者的肺組織和肺成纖維細(xì)胞中顯著下調(diào)。功能實(shí)驗(yàn)顯示,circSMARCA5過表達(dá)抑制肺成fibroblasts體外炎性反應(yīng),而circSMARCA5敲低促進(jìn)其炎性反應(yīng)。

機(jī)制研究表明,circSMARCA5通過與miR-155結(jié)合,下調(diào)其靶基因SOCS1的表達(dá),從而激活STAT3信號(hào)通路,抑制肺成fibroblasts炎性反應(yīng)。此外,circSMARCA5還通過與NF-κB蛋白結(jié)合,抑制其核易位,進(jìn)一步抑制肺成fibroblasts炎性反應(yīng)。

結(jié)論

綜上所述,環(huán)狀RNA在肺成纖維細(xì)胞增殖、激活和炎性反應(yīng)中發(fā)揮重要調(diào)控作用。靶向環(huán)狀RNA可能為開發(fā)治療PF的新型治療策略提供潛在靶點(diǎn)。第三部分環(huán)狀RNA介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)途徑關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)受環(huán)狀RNA調(diào)控的炎癥反應(yīng)途徑

主題名稱:環(huán)狀RNA與細(xì)胞因子產(chǎn)生

1.環(huán)狀RNA可通過與RNA結(jié)合蛋白相互作用,調(diào)節(jié)細(xì)胞因子mRNA的穩(wěn)定性、剪切和翻譯。

2.例如,circ-PRKCI通過與hnRNPA1結(jié)合而穩(wěn)定IL-17AmRNA,促進(jìn)肺囊性纖維化T細(xì)胞中的IL-17A產(chǎn)生。

3.環(huán)狀RNA還能與microRNA競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合位點(diǎn),間接影響細(xì)胞因子表達(dá)。

主題名稱:環(huán)狀RNA與炎癥信號(hào)通路激活

環(huán)狀RNA介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)途徑

環(huán)狀RNA(circRNA)是一種封閉環(huán)狀的非編碼RNA分子,在炎癥反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。它們通過多種機(jī)制調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞的活化、遷移和功能,從而影響肺囊性纖維化(IPF)肺組織的炎癥反應(yīng)。

1.作為miRNA海綿

circRNA可以與microRNA(miRNA)結(jié)合,充當(dāng)miRNA海綿,阻礙miRNA與靶mRNA的結(jié)合。這種競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合可以調(diào)節(jié)靶mRNA的表達(dá),從而影響免疫細(xì)胞的活性。

在IPF中,circRNA-CDYL可與miR-34a結(jié)合,上調(diào)靶基因TGFβ1的表達(dá)。TGFβ1是一種促炎因子,促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)化,加重肺組織纖維化。

2.調(diào)節(jié)lncRNA表達(dá)

circRNA還可以與長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)相互作用,影響其表達(dá)和功能。lncRNA參與炎癥反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,circRNA介導(dǎo)的lncRNA調(diào)節(jié)可以影響免疫細(xì)胞的激活和炎癥反應(yīng)。

在IPF中,circRNA-ITCH可與lncRNA-GAS5結(jié)合,促進(jìn)GAS5的降解。GAS5是一種抑炎因子,其降解會(huì)抑制巨噬細(xì)胞的吞噬和抗炎反應(yīng),加重肺組織炎癥。

3.靶向RNA結(jié)合蛋白

circRNA可以與RNA結(jié)合蛋白(RBP)相互作用,影響RBP的定位、翻譯和功能。RBP參與炎癥反應(yīng)信號(hào)通路的調(diào)控,circRNA介導(dǎo)的RBP調(diào)節(jié)可以影響免疫細(xì)胞的激活和炎癥反應(yīng)。

在IPF中,circRNA-Foxo3可與RBP-HuR結(jié)合,促進(jìn)HuR的定位于TNF-αmRNA,增強(qiáng)TNF-αmRNA的翻譯。TNF-α是一種促炎因子,其表達(dá)上調(diào)會(huì)加重肺組織炎癥。

4.影響細(xì)胞信號(hào)通路

circRNA還可以直接與細(xì)胞信號(hào)通路中的關(guān)鍵分子相互作用,影響信號(hào)通路的激活和炎癥反應(yīng)。

在IPF中,circRNA-ZNF608可與STAT3結(jié)合,抑制STAT3的激活。STAT3是一種促炎信號(hào)通路中的轉(zhuǎn)錄因子,其抑制會(huì)減弱肺成纖維細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)化,緩解肺組織纖維化。

5.參與環(huán)狀RNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

circRNA可以與miRNA和mRNA形成調(diào)控網(wǎng)絡(luò),共同影響免疫細(xì)胞的炎癥反應(yīng)。

在IPF中,circRNA-HIF1a可與miR-122結(jié)合,上調(diào)靶基因CCL2的表達(dá)。CCL2是一種趨化因子,其表達(dá)上調(diào)會(huì)促進(jìn)單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞向肺組織遷移,加重肺組織炎癥。

以上機(jī)制表明,circRNA在肺囊性纖維化肺組織炎癥反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。它們通過靶向miRNA、lncRNA、RBP和信號(hào)通路,影響免疫細(xì)胞的活化、遷移和功能,調(diào)控炎癥反應(yīng)的發(fā)生和發(fā)展。因此,靶向circRNA可能成為肺囊性纖維化治療的新策略。第四部分環(huán)狀RNA調(diào)控細(xì)胞外基質(zhì)重塑環(huán)狀RNA調(diào)控細(xì)胞外基質(zhì)重塑

細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)是細(xì)胞與其周圍環(huán)境之間的橋梁,由多種蛋白質(zhì)、糖胺聚糖和蛋白聚糖組成。ECM在組織發(fā)育、穩(wěn)態(tài)和疾病進(jìn)程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。肺囊性纖維化(PF)是一種慢性進(jìn)行性肺部疾病,以ECM過度沉積和組織重塑為特征。

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類閉合的、非編碼RNA分子,近年來被發(fā)現(xiàn)廣泛參與各種生理和病理過程。研究表明,circRNA可以調(diào)控ECM重塑,在PF的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用。

circRNA與膠原蛋白合成

膠原蛋白是ECM的主要成分,在PF中過度沉積。circRNA可以通過多種途徑調(diào)控膠原蛋白的合成。例如,circRNA_0001662可以與膠原蛋白Iα1(COL1A1)mRNA結(jié)合,促進(jìn)其穩(wěn)定性,從而增加膠原蛋白的產(chǎn)生。circRNA_0016773則可以通過抑制microRNA-195的活性,促進(jìn)膠原蛋白IIIα1(COL3A1)的表達(dá)。

circRNA與纖維連接蛋白表達(dá)

纖維連接蛋白(fibronectin)是ECM中另一種重要的成分,在PF中表達(dá)增加。circRNA可以調(diào)控纖維連接蛋白的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),circRNA_0004042可以與microRNA-133b結(jié)合,抑制其對(duì)纖維連接蛋白mRNA的降解作用,從而增加纖維連接蛋白的表達(dá)。circRNA_001569還可以通過與YBX1蛋白相互作用,促進(jìn)纖維連接蛋白的轉(zhuǎn)錄。

circRNA與ECM降解

ECM降解在組織重塑過程中至關(guān)重要。基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)是一類負(fù)責(zé)ECM降解的蛋白酶。circRNA可以調(diào)控MMPs的表達(dá),影響ECM的降解過程。例如,circRNA_0025048可以與microRNA-143結(jié)合,抑制其對(duì)MMP9mRNA的降解作用,從而增加MMP9的表達(dá)。circRNA_0000745則可以通過與microRNA-181b結(jié)合,抑制其對(duì)MMP2mRNA的降解作用,促進(jìn)MMP2的表達(dá)。

circRNA調(diào)控細(xì)胞行為和ECM重塑

circRNA還可以通過調(diào)控細(xì)胞行為,間接影響ECM重塑。例如,circRNA_0010236可以通過與microRNA-145結(jié)合,抑制其對(duì)TGF-β受體IImRNA的降解作用,從而激活TGF-β信號(hào)通路,促進(jìn)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),導(dǎo)致ECM重塑。circRNA_0000745則可以通過與microRNA-181b結(jié)合,抑制其對(duì)CTGFmRNA的降解作用,從而增加CTGF的表達(dá),促進(jìn)成纖維細(xì)胞增殖和ECM合成。

circRNA作為PF治療靶點(diǎn)

隨著對(duì)circRNA在ECM重塑中的作用的深入了解,circRNA成為PF治療的潛在靶點(diǎn)。研究表明,靶向circRNA可以調(diào)控ECM重塑,減緩PF的進(jìn)展。例如,抑制circRNA_0001662可以減少膠原蛋白合成,改善PF小鼠模型的肺功能。抑制circRNA_0010236則可以通過抑制EMT,減輕PF小鼠模型的肺纖維化。

綜上所述,circRNA在ECM重塑中發(fā)揮重要作用,在PF發(fā)病機(jī)制中具有關(guān)鍵意義。靶向circRNA為PF治療提供了新的策略。第五部分環(huán)狀RNA與免疫細(xì)胞募集的關(guān)聯(lián)關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)環(huán)狀RNA與單核細(xì)胞募集

1.環(huán)狀RNA可以調(diào)節(jié)單核細(xì)胞歸巢受體CCR2的表達(dá),影響單核細(xì)胞向肺組織遷移。

2.特定環(huán)狀RNA可以通過與miRNA相互作用,釋放miRNA抑制的CCR2mRNA,從而促進(jìn)單核細(xì)胞募集。

3.環(huán)狀RNA還可能參與單核細(xì)胞與內(nèi)皮細(xì)胞之間的粘附分子表達(dá)調(diào)控,影響單核細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移。

環(huán)狀RNA與中性粒細(xì)胞募集

1.環(huán)狀RNA可以調(diào)控中性粒細(xì)胞趨化因子(如CXCL1、CXCL2)的表達(dá),影響中性粒細(xì)胞向肺組織遷移。

2.特定環(huán)狀RNA可以作為miRNA的海綿,釋放miRNA抑制的中性粒細(xì)胞趨化因子mRNA,從而促進(jìn)中性粒細(xì)胞募集。

3.環(huán)狀RNA還可能影響中性粒細(xì)胞與內(nèi)皮細(xì)胞之間的粘附分子表達(dá),調(diào)節(jié)中性粒細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移。

環(huán)狀RNA與淋巴細(xì)胞募集

1.環(huán)狀RNA可以調(diào)節(jié)淋巴細(xì)胞激活和分化的相關(guān)因子表達(dá),影響淋巴細(xì)胞向肺組織遷移。

2.特定環(huán)狀RNA可以通過與miRNA相互作用,釋放miRNA抑制的淋巴細(xì)胞趨化因子mRNA,從而促進(jìn)淋巴細(xì)胞募集。

3.環(huán)狀RNA還可能參與淋巴細(xì)胞與抗原呈遞細(xì)胞之間的相互作用,影響淋巴細(xì)胞活化和遷移。環(huán)狀RNA與免疫細(xì)胞募集的關(guān)聯(lián)

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類具有共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。近年來,研究發(fā)現(xiàn)circRNA在各種疾病中發(fā)揮重要作用,包括肺囊性纖維化(IPF)。IPF是一種慢性、進(jìn)行性致死性肺部疾病,其主要特征是肺泡壁增厚、肺纖維化和免疫細(xì)胞募集。

環(huán)狀RNA與中性粒細(xì)胞募集

*circRNA-0026257:在IPF小鼠模型中,circRNA-0026257的表達(dá)上調(diào)。該circRNA與β-arrestin2相互作用,促進(jìn)β-arrestin2的穩(wěn)定性,進(jìn)而激活STAT3信號(hào)通路,誘導(dǎo)中性粒細(xì)胞趨化因子CXCL1的產(chǎn)生和中性粒細(xì)胞募集。

*circRNA-0001946:circRNA-0001946在IPF患者的肺組織中上調(diào)。該circRNA通過海綿吸附miR-330-5p,解除miR-330-5p對(duì)CXCL9和CXCL10(中性粒細(xì)胞趨化因子)的抑制作用,促進(jìn)中性粒細(xì)胞募集。

環(huán)狀RNA與巨噬細(xì)胞募集

*circRNA-0004581:circRNA-0004581在IPF肺組織中表達(dá)增加。該circRNA通過海綿吸附miR-206,解除miR-206對(duì)CC-趨化因子配體2(CCL2)的抑制作用,促進(jìn)CCL2的產(chǎn)生和巨噬細(xì)胞募集。

*circRNA-0007611:circRNA-0007611在IPF患者的外周血單核細(xì)胞(PBMC)中上調(diào)。該circRNA與HuR蛋白結(jié)合,促進(jìn)HuR蛋白的穩(wěn)定性,進(jìn)而激活TNF-α信號(hào)通路,誘導(dǎo)CXCL1和CXCL10的產(chǎn)生和巨噬細(xì)胞募集。

環(huán)狀RNA與淋巴細(xì)胞募集

*circRNA-0000204:circRNA-0000204在IPF小鼠模型中表達(dá)增加。該circRNA通過海綿吸附miR-145-5p,解除miR-145-5p對(duì)IFN-γ的抑制作用,促進(jìn)IFN-γ的產(chǎn)生和淋巴細(xì)胞募集。

*circRNA-ITCH:circRNA-ITCH在IPF肺組織中表達(dá)降低。該circRNA與ITCHE3泛素連接酶相互作用,抑制ITCH酶的活性,進(jìn)而穩(wěn)定miR-206的表達(dá)。miR-206可以抑制CCL20(淋巴細(xì)胞趨化因子)的產(chǎn)生,從而抑制淋巴細(xì)胞募集。

結(jié)論

環(huán)狀RNA通過調(diào)控免疫細(xì)胞趨化因子和信號(hào)通路,在IPF肺組織炎癥反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。這些circRNA可以作為IPF的新型診斷和治療靶點(diǎn),為探索IPF的發(fā)病機(jī)制和開發(fā)新的治療策略提供新的見解。第六部分環(huán)狀RNA靶向miRNA的機(jī)制環(huán)狀RNA靶向miRNA的機(jī)制

環(huán)狀RNA(circRNA)作為一類新型且重要的非編碼RNA分子,可以通過靶向miRNA,抑制其對(duì)靶基因的調(diào)控,從而影響細(xì)胞的功能。在肺囊性纖維化(IPF)的炎癥反應(yīng)機(jī)制中,circRNA靶向miRNA的機(jī)制主要包括以下幾種:

1.circRNA通過miRNA應(yīng)答元件(MRE)直接結(jié)合miRNA

circRNA上存在大量與miRNA互補(bǔ)的MRE序列,當(dāng)circRNA與miRNA結(jié)合時(shí),可以形成雙鏈結(jié)構(gòu),阻斷miRNA與靶基因mRNA的結(jié)合,從而抑制miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控。例如,研究表明,circ_0005309通過直接結(jié)合miR-145,抑制其對(duì)KLF15的調(diào)控,從而促進(jìn)IPF肺組織中的炎癥反應(yīng)。

2.circRNA間接競(jìng)爭(zhēng)miRNA結(jié)合位點(diǎn)

circRNA可以與miRNA結(jié)合形成RNA雙鏈結(jié)構(gòu),從而與miRNA靶基因mRNA競(jìng)爭(zhēng)miRNA結(jié)合位點(diǎn),間接抑制miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控。例如,circ_001569通過與miR-206結(jié)合,與miR-206的靶基因PTEN競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合,從而抑制miR-206對(duì)PTEN的調(diào)控,進(jìn)而促進(jìn)IPF肺組織中的炎癥反應(yīng)。

3.circRNA與RNA結(jié)合蛋白(RBP)結(jié)合,共同調(diào)控miRNA

circRNA可以與某些RBP結(jié)合,形成circRNA-RBP復(fù)合物,共同調(diào)控miRNA的活性。例如,circ_0000337與HuR結(jié)合,抑制HuR與miR-125b的結(jié)合,從而促進(jìn)miR-125b對(duì)靶基因VAV3的調(diào)控,進(jìn)而抑制IPF肺組織中的炎癥反應(yīng)。

4.circRNA通過miRNA海綿作用,吸收miRNA

circRNA可以充當(dāng)miRNA的海綿,通過大量結(jié)合miRNA,降低miRNA的濃度,從而減弱miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控作用。例如,circ_0006310通過海綿吸附大量miR-141,降低miR-141的濃度,從而減弱miR-141對(duì)靶基因CXCL12的調(diào)控,進(jìn)而促進(jìn)IPF肺組織中的炎癥反應(yīng)。

5.circRNA通過調(diào)節(jié)miRNA生物合成途徑,影響miRNA的表達(dá)

circRNA可以調(diào)節(jié)miRNA的生物合成途徑,影響miRNA的表達(dá)水平。例如,circ_0022907通過抑制Drosha的活性,抑制miRNA的生成,從而影響肺組織中的炎癥反應(yīng)。

總之,circRNA靶向miRNA的機(jī)制是復(fù)雜且多樣的,通過與miRNA直接結(jié)合、競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合位點(diǎn)、與RBP結(jié)合、充當(dāng)海綿以及調(diào)節(jié)miRNA生物合成途徑等方式,circRNA可以影響miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控,從而參與IPF肺組織炎癥反應(yīng)的調(diào)控過程。進(jìn)一步研究circRNA靶向miRNA的機(jī)制將有助于深入理解IPF的發(fā)生發(fā)展機(jī)制,為開發(fā)新的治療靶點(diǎn)提供依據(jù)。第七部分環(huán)狀RNA調(diào)控表觀遺傳修飾關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)【環(huán)狀RNA介導(dǎo)DNA甲基化修飾】

1.環(huán)狀RNA可與DNA甲基化酶相結(jié)合,阻礙其對(duì)靶基因啟動(dòng)子的甲基化,從而上調(diào)基因表達(dá)。

2.環(huán)狀RNA通過與甲基化結(jié)合域蛋白相互作用,直接參與DNA甲基化修飾過程,調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。

3.環(huán)狀RNA作為靶向適配器,將DNA甲基化酶等表觀遺傳修飾因子募集到特定基因位點(diǎn),介導(dǎo)DNA甲基化修飾。

【環(huán)狀RNA調(diào)控組蛋白修飾】

環(huán)狀RNA調(diào)控表觀遺傳修飾

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特異的非編碼RNA分子,呈環(huán)狀結(jié)構(gòu),不具有5'帽和3'尾。近年來,研究發(fā)現(xiàn)circRNA在表觀遺傳修飾中發(fā)揮著重要作用,調(diào)控基因表達(dá)。在肺囊性纖維化(IPF)中,circRNA與表觀遺傳修飾異常密切相關(guān),參與肺組織炎癥反應(yīng)的調(diào)控。

調(diào)控DNA甲基化

circRNA可通過與DNA甲基化酶(DNMTs)或TET蛋白相互作用,調(diào)控DNA甲基化水平。DNMTs負(fù)責(zé)添加DNA甲基化標(biāo)記,而TET蛋白則負(fù)責(zé)去除DNA甲基化。研究表明,circRNA-0026213可與DNMT3A結(jié)合,抑制其活性,從而降低靶基因啟動(dòng)子區(qū)域的DNA甲基化,促進(jìn)基因表達(dá)。此外,circRNA-0002654可與TET2結(jié)合,增強(qiáng)其活性,促進(jìn)靶基因啟動(dòng)子區(qū)域的DNA甲基化消除,也促進(jìn)基因表達(dá)。

調(diào)控組蛋白修飾

circRNA還可以通過與組蛋白修飾酶相互作用,調(diào)控組蛋白修飾。組蛋白修飾,如甲基化、乙?;土姿峄?,影響著染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),circRNA-0006127可與組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶EZH2結(jié)合,抑制其活性,從而降低靶基因啟動(dòng)子區(qū)域組蛋白H3K27me3修飾水平,促進(jìn)基因表達(dá)。此外,circRNA-0000463可與組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶p300結(jié)合,增強(qiáng)其活性,促進(jìn)靶基因啟動(dòng)子區(qū)域組蛋白H3K27ac修飾水平,也促進(jìn)基因表達(dá)。

調(diào)控miRNA的活性

circRNA還可作為miRNA競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)切核酸(ceRNA),通過與miRNA結(jié)合,抑制其對(duì)靶mRNA的抑制作用,從而間接調(diào)控基因表達(dá)。研究表明,circRNA-0007665可與miR-30b結(jié)合,抑制其對(duì)靶基因MMP9的抑制作用,從而促進(jìn)MMP9表達(dá)和細(xì)胞遷移。此外,circRNA-0005330可與miR-200a結(jié)合,抑制其對(duì)靶基因E-cadherin的抑制作用,從而促進(jìn)E-cadherin表達(dá)和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)抑制。

在IPF中的作用

在IPF中,circRNA的表觀遺傳修飾調(diào)控異常與疾病進(jìn)展密切相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),IPF患者肺組織中circRNA-0007665表達(dá)上調(diào),通過抑制miR-30b對(duì)MMP9的抑制作用,促進(jìn)MMP9表達(dá),加劇炎癥反應(yīng)和肺纖維化。此外,circRNA-0005330表達(dá)下調(diào),通過抑制miR-200a對(duì)E-cadherin的抑制作用,抑制EMT,減輕肺纖維化。

結(jié)論

總之,circRNA參與表觀遺傳修飾調(diào)控,通過調(diào)控DNA甲基化、組蛋白修飾和miRNA活性間接調(diào)控基因表達(dá),在IPF肺組織炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。進(jìn)一步闡明circRNA在表觀遺傳修飾中的分子機(jī)制和靶點(diǎn),為IPF的診斷和治療提供了新的靶向干預(yù)策略。第八部分環(huán)狀RNA作為肺囊性纖維化治療靶點(diǎn)關(guān)鍵詞關(guān)鍵要點(diǎn)環(huán)狀RNA作為肺囊性纖維化治療靶點(diǎn)

1.環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中的表達(dá)異常:肺囊性纖維化(IPF)患者肺組織中特定環(huán)狀RNA的表達(dá)水平發(fā)生改變,某些環(huán)狀RNA如circKIF4A和circPVT1顯著上調(diào),而circFoxo3和circHIPK3則下調(diào)。

2.環(huán)狀RNA調(diào)控肺囊性纖維化機(jī)制:環(huán)狀RNA通過多種機(jī)制參與肺囊性纖維化進(jìn)程,包括:miRNA海綿效應(yīng)、mRNA穩(wěn)定或降解、蛋白翻譯調(diào)控和信號(hào)通路激活。例如,circKIF4A通過miRNA海綿作用抑制miR-206,從而促進(jìn)肺成纖維細(xì)胞的增殖和遷移。

3.環(huán)狀RNA靶向治療策略:環(huán)狀RNA異常表達(dá)為IPF治療提供了新的靶點(diǎn)。靶向抑制上調(diào)的環(huán)狀RNA或上調(diào)下調(diào)的環(huán)狀RNA有望改善肺囊性纖維化。研究表明,siRNA敲降circKIF4A可抑制IPF小鼠模型中的肺纖維化。

siRNA介導(dǎo)的環(huán)狀RNA靶向療法

1.siRNA技術(shù)簡(jiǎn)介:siRNA(小干擾RNA)是一種合成雙鏈RNA分子,可特異性沉默靶基因表達(dá)。siRNA與環(huán)狀RNA的靶序列結(jié)合,誘導(dǎo)其降解,從而調(diào)控環(huán)狀RNA的表達(dá)。

2.siRNA遞送系統(tǒng):有效的siRNA遞送系統(tǒng)是環(huán)狀RNA靶向療法的關(guān)鍵。脂質(zhì)體、聚合物納米顆粒和病毒載體等遞送系統(tǒng)可將siRNA遞送至肺部靶細(xì)胞。

3.siRNA治療潛力:siRNA介導(dǎo)的環(huán)狀RNA靶向療法在IPF治療中具有巨大潛力。研究顯示,siRNA敲降circKIF4A可改善肺纖維化,減少膠原沉積和炎癥反應(yīng)。

環(huán)狀RNA靶向治療的前沿進(jìn)展

1.環(huán)狀RNA生物標(biāo)志物:環(huán)狀RNA異常表達(dá)可作為IPF的生物標(biāo)志物,用于疾病診斷、預(yù)后評(píng)估和治療反應(yīng)監(jiān)測(cè)。血清或組織中的特定環(huán)狀RNA水平與IPF的嚴(yán)重程度和預(yù)后相關(guān)。

2.環(huán)狀RNA聯(lián)合療法:環(huán)狀RNA靶向治療可與其他抗炎、抗纖維化或免疫調(diào)節(jié)藥物聯(lián)合使用,以增強(qiáng)治療效果。例如,siRNA敲降circKIF4A與吡非尼酮聯(lián)合治療可顯著改善IPF小鼠模型中的肺纖維化。

3.個(gè)性化治療:基于環(huán)狀RNA表達(dá)譜的個(gè)性化治療策略有望提升IPF治療的療效。通過分析患者的環(huán)狀RNA表達(dá)特征,可選擇最有效的靶向療法,提高個(gè)體化治療效果。環(huán)狀RNA作為肺囊性纖維化治療靶點(diǎn)

環(huán)狀RNA概述

環(huán)狀RNA(circularRNA,circRNA)是一類具有環(huán)形結(jié)構(gòu)、無5'帽和3'尾的非編碼RNA分子。與線性RNA不同,circRNA形成共價(jià)閉合環(huán),使其更加穩(wěn)定,不易被核酸外切酶降解。近年的研究表明,circRNA在肺囊性纖維化(IPF)的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。

circRNA與肺囊性纖維化

IPF是一種慢性進(jìn)行性肺部疾病,其特征是肺泡上皮細(xì)胞損傷、肺纖維化和肺功能下降。circRNA在IPF肺組織中表達(dá)異常,并且與疾病的嚴(yán)重程度和預(yù)后相關(guān)。

研究發(fā)現(xiàn),某些circRNA在IPF肺組織中上調(diào)表達(dá),例如circRNA_0006632、circRNA_0000203和circRNA_100876。這些circRNA通過與miRNA競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合靶基因,調(diào)控肺泡上皮細(xì)胞的增殖、凋亡和遷移,從而促進(jìn)IPF的進(jìn)展。

例如,circRNA_0006632通過競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合miR-125b,上調(diào)肺泡上皮細(xì)胞中TGF-β1的表達(dá),促進(jìn)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),加重IPF肺纖維化。

circRNA作為治療靶點(diǎn)

由于circRNA在IPF發(fā)病機(jī)制中的重要作用,它們成為潛在的治療靶點(diǎn)。針對(duì)circRNA的治療策略主要集中在以下幾個(gè)方面:

circRNA抑制劑

circRNA抑制劑,如反義寡核苷酸(ASO)和短發(fā)夾RNA(shRNA),可以特異性靶向并抑制circRNA的表達(dá)。研究表明,circRNA抑制劑可以減輕IPF肺纖維化,改善肺功能。

例如,circRNA_0006632抑制劑通過靶向circRNA_0006632,下調(diào)TGF-β1的表達(dá),抑制EMT,改善IPF小鼠模型的肺纖維化。

circRNA競(jìng)爭(zhēng)性吸附劑

circRNA競(jìng)爭(zhēng)性吸附劑,如海綿RNA或修飾的circRNA,可以與特定circRNA競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA,從而恢復(fù)circRNA與miRNA的正常結(jié)合。

例如,miR-125b海綿RNA通過與circRNA_0006632競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-125b,恢復(fù)miR-125b對(duì)TGF-β1的抑制作用,從而抑制IPF肺纖維化。

circRNA靶向治療

circRNA靶向治療包括通過藥物或納米顆粒將circRNA靶向遞送到肺組織。這種方法可以提高circRNA靶向治療的效率和特異性。

例如,負(fù)載circRNA_0006632抑制劑的脂質(zhì)體納米顆粒被遞送到IPF小鼠模型的肺組織中,特異性抑制circRNA_0006632的表達(dá),改善肺纖維化。

結(jié)論

環(huán)狀RNA在肺囊性纖維化中發(fā)揮著重要的作用。通過靶向circRNA,我們可以開發(fā)新型的治療策略,為IPF患者帶來新的治療選擇。進(jìn)

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