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分子生物學(xué)習(xí)題集(2012版)目錄習(xí)題一基因、基因組、基因組學(xué)和基因的化學(xué)本質(zhì)2習(xí)題二DNA的復(fù)制、重組、損傷、修復(fù)以及突變6習(xí)題三DNA轉(zhuǎn)錄、逆轉(zhuǎn)錄及其轉(zhuǎn)錄后加工10習(xí)題四翻譯及其后加工14習(xí)題五基因表達(dá)的調(diào)控18習(xí)題六基因工程以及其他現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)22習(xí)題一基因、基因組、基因組學(xué)和基因的化學(xué)本質(zhì)一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、SNP2、satelliteDNA3、annealing4、RFLP5、physicalmap二、填空題(每空1分,共15分)1、Tm是指DNA熱變性時候的熔點,雙鏈DNA中若____含量多,則其Tm值高。2、DNA分子中存在三類核苷酸序列,高度重復(fù)序列、中度重復(fù)序列和單拷貝序列。tRNA、rRNA以及組蛋白等由__________________編碼,而大多數(shù)蛋白質(zhì)由_______________編碼。3、硝酸纖維素膜可結(jié)合單鏈核酸。將RNA變性后轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上再進(jìn)行雜交,稱為________________印跡法;將DNA變性后轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上再進(jìn)行雜交,稱為________________印跡法。4、蛋白質(zhì)組是指_________________________________________________________。5、維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要因素是_______________,它由范德華力和疏水作用構(gòu)成。6、現(xiàn)在普遍使用的測定DNA一級結(jié)構(gòu)的方法是Sanger提出的_________法。7、真核生物構(gòu)成染色質(zhì)的蛋白質(zhì)有_________和____________兩類。染色質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)為_________,二級結(jié)構(gòu)是________纖維。8、DNA在酸性溶液中會發(fā)生_________,所以DNA應(yīng)該存放在堿性溶液中;RNA在堿性溶液中發(fā)生______,所以RNA應(yīng)該存放在酸性溶液中。9、如果一種DNA溶液的A260/A280<1.6,那么這種DNA樣品嚴(yán)重受到_________的污染。三、判斷題(每題1分,共10分)1、原核細(xì)胞和真核細(xì)胞的差別之一是前者無染色體結(jié)構(gòu),后者有染色體結(jié)構(gòu)。()2、基因組是指某一種生物所具有的全部基因的總稱。()3、真核生物基因的大小通常是外顯子的數(shù)目和長度決定的。()4、在所有的真核生物中,內(nèi)含子的長度和序列是高度保守的。()5、酵母的基因普遍要比人的基因小,因此,酵母基因組編碼的蛋白質(zhì)普遍要比人基因組編碼的蛋白質(zhì)要小。()6、在自由的四種核苷酸混合溶液中,任何堿基之間都可以形成氫鍵而發(fā)生配對。()7、大幅度增加或減少溶液的pH都會導(dǎo)致一種雙鏈DNA的Tm下降。()8、富含GC的DNA雙螺旋比富含AT的DNA雙螺旋穩(wěn)定的主要原因是GC堿基對比AT堿基對多一個氫鍵。()9、超螺旋DNA的能量狀態(tài)總是高于相同序列的松弛型DNA。()10、用氯化銫梯度超離心純化質(zhì)粒DNA時,蛋白質(zhì)在離心管的最上部,RNA懸浮在中間,而DNA沉在底部。()四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、有關(guān)蛋白質(zhì)組不正確的敘述是()A、翻譯后加工可導(dǎo)致同一個翻譯產(chǎn)物形成幾種不同的蛋白質(zhì)B、蛋白質(zhì)之間的相互作用可形成組織特異性蛋白質(zhì)復(fù)合物C、環(huán)境因素對一個細(xì)胞的蛋白質(zhì)組無影響D、一個病態(tài)細(xì)胞的蛋白質(zhì)組可能與一個健康細(xì)胞的蛋白質(zhì)組有所不同2、DNA在細(xì)胞核內(nèi)被包裝成30nm的染色質(zhì)纖維。在試管里加入某種物質(zhì)可以人為破壞這種結(jié)構(gòu)(包括10nm染色質(zhì)纖維),你認(rèn)為這種物質(zhì)是()A、NaClB、輔酶C、核糖核酸酶D、ATP3、序列特異性DNA結(jié)合蛋白與DNA結(jié)合的主要作用力是()A、離子鍵B、氫鍵C、疏水作用D、范德華力4、基因組中含有的轉(zhuǎn)座子最多的生物是()A、細(xì)菌B、噬菌體C、酵母D、玉米5、導(dǎo)致DNA雙螺旋具有大溝和小溝的原因是()A、AT堿基對與GC堿基對的外形不同B、嘌呤堿基大,形成大溝,而嘧啶堿基小,形成小溝C、DNA結(jié)合蛋白將DNA扭曲成特定的形狀D、兩條鏈上的磷酸核糖骨架不是完全相對稱的6、噬菌體基因組DNA上的堿基發(fā)生糖基化和甲基化修飾的主要功能是()A、促進(jìn)基因組DNA整合到宿主基因組上B、保護(hù)病毒DNA受到限制性酶的水解C、有利于核酸正確的排列D、穩(wěn)定DNA,防止突變7、雙螺旋DNA具有的典型特征包括()A、沿著一條鏈?zhǔn)谴鬁?,另外一條鏈?zhǔn)切螧、堿基對的排列與螺旋軸平行C、嘌呤堿基和嘧啶堿基的數(shù)目相同D、螺旋的方向總是右手8、在許多不同物種中,具有高度保守的序列一般是()A、假基因B、特定的間隔序列C、不重要的蛋白質(zhì)的基因D、非常重要的蛋白質(zhì)的基因9、以下有關(guān)染色質(zhì)的敘述不正確的是()A、原核生物無染色質(zhì)結(jié)構(gòu),真核生物才有染色質(zhì)結(jié)構(gòu)
B、染色質(zhì)由DNA、RNA、組蛋白和非組蛋白構(gòu)成C、染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體D、組蛋白是一種序列特異性DNA結(jié)合蛋白10、關(guān)于一種真核生物的基因組的最佳定義是()A、這種生物所有的編碼蛋白質(zhì)的基因
B、這種生物細(xì)胞核所有的DNAC、這種生物所有的遺傳物質(zhì)D、這種生物的單倍體細(xì)胞所具有的所有染色體五、問答題(每題10分,共40分)1、如果有人在大腸桿菌細(xì)胞里發(fā)現(xiàn)一種新的蛋白質(zhì),它既含有跨膜的結(jié)構(gòu)域,又含有與DNA結(jié)合的結(jié)構(gòu)域,下面顯示的是這種蛋白質(zhì)的部分氨基酸序列:…Ala-Leu-Phe-Ala-Gly-Ile-Val-Glu-Asn-Ser-Thr-Ala-Asp-Trp-His-Arg-Lys-His-Arg…(1)你認(rèn)為哪一段氨基酸序列最有可能發(fā)現(xiàn)在跨膜的結(jié)構(gòu)域?為什么?(2)如果進(jìn)一步的實驗證明這種蛋白質(zhì)并不是一種跨膜蛋白,而是位于細(xì)胞質(zhì)。那么,你認(rèn)為(1)中所指的氨基酸序列位于蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的什么部分?(3)指出這種蛋白質(zhì)分子中最有可能與DNA結(jié)合、發(fā)生相互作用的氨基酸序列?為什么?(4)你認(rèn)為這些氨基酸更可能與堿基還是磷酸核糖骨架相互作用?(5)何種次級鍵是蛋白質(zhì)與DNA之間作用最強(qiáng)的化學(xué)鍵?2、大腸桿菌DNA的GC含量是0.532(摩爾分?jǐn)?shù))。(1)計算大腸桿菌DNA在0.05mol/LNaCl溶液中的Tm。(2)你認(rèn)為DNA退火溫度是大于、等于還是小于Tm?為什么?(3)嗜熱菌能夠生存在高達(dá)100℃的環(huán)境,你認(rèn)為這一類細(xì)菌可以使用哪些手段維持其DNA在高溫下仍然處于雙螺旋狀態(tài)。(4)某些生物喜歡生活在熱水之中!例如,某些細(xì)菌適宜生活在近乎沸騰的熱泉中,如果將它們放在正常的溫度下(37℃左右),反而不利于它們的生存。為什么37℃對于適宜生活在95℃下的生物體內(nèi)的蛋白質(zhì)的功能是有害的?3、(1)有人在純化質(zhì)粒DNA的時候,由于某種原因?qū)⒉糠旨兓腄NA在室溫下放在水里面近一個月的時間。等他想到這件事的時候,他可以接著繼續(xù)純化還是需要從頭來重新純化?為什么?如果他純化的是RNA,又該如何處理?(2)冰凍的乙醇經(jīng)常被用來沉淀DNA。乙醇溫度的重要性何在?它對短的DNA還是長的DNA更加重要?為什么?4、(1)“生命需要的必需基因的最低數(shù)目究竟有多少”一直是科學(xué)家感興趣的問題。迄今為止,最小的生物的基因組來自寄生的支原體,其大小為5×105bp。試估計這種生物最多需要多少個編碼蛋白質(zhì)的基因。這些蛋白質(zhì)基因的功能會是什么?如何能夠更精確的確定所需要的必需基因的數(shù)目?(2)全基因組序列分析已經(jīng)導(dǎo)致像大腸桿菌這樣的細(xì)菌幾乎所有的蛋白質(zhì)基因得以確定。然而,如果要用類似的方法想毫不含糊的確定大多數(shù)真核生物基因組編碼蛋白質(zhì)的基因,則非常困難。給出一個原因解釋以上現(xiàn)象。習(xí)題二DNA的復(fù)制、重組、損傷、修復(fù)以及突變一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、Okazakifragment2、semiconservativereplication3、NER4、nonsensemutation5、suppressormutation二、填空題(每空1分,共15分)1、體內(nèi)DNA復(fù)制一般以______為引物,復(fù)制的方向總是__________,催化引物合成的酶稱為_________。而體外復(fù)制DNA通常用人工合成的__________________為引物。2、DNA甲基化修飾的甲基供體是______________________。原核細(xì)胞DNA上被修飾的堿基一般是__,真核細(xì)胞的DNA被修飾的堿基通常位于_________內(nèi)的__。3、大腸桿菌染色體DNA復(fù)制的起始區(qū)稱為________,酵母染色體DNA復(fù)制的起始區(qū)稱為______,兩者均富含____堿基對。4、大腸桿菌DNA連接酶使用________作為能源,病毒和真核細(xì)胞的DNA鏈接酶則使用______作為能源。用于基因工程的DNA連接酶一般來自_____________。5、參與大腸桿菌染色體DNA復(fù)制的主要聚合酶是_________________,該酶在復(fù)制體上組裝成不對稱的二聚體,分別負(fù)責(zé)前導(dǎo)鏈和后隨鏈的合成。三、判斷題(每題1分,共10分)1、岡崎片段只由DNA組成。()2、端粒酶帶有自己的DNA模板。()3、細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制既需要DNA聚合酶,也需要RNA聚合酶。()4、同源重組和位點特異性重組都形成Holliday中間體結(jié)構(gòu)。()5、如果HIV是一種DNA病毒,那么治療的難度將大大降低。()6、轉(zhuǎn)座重組既可以導(dǎo)致基因的失活,也可以導(dǎo)致基因的激活。()7、癌癥一般發(fā)生在人年邁的時候,其主要原因是隨著年紀(jì)的增大,人體內(nèi)的抑癌基因逐步失活。()8、在一個基因的編碼區(qū)內(nèi)發(fā)生的核苷酸的插入或缺失總是導(dǎo)致移碼突變。()9、一個正在進(jìn)行雙向復(fù)制的真核細(xì)胞的DNA分子,當(dāng)兩個相鄰的復(fù)制叉相遇的時候,一個復(fù)制叉的前導(dǎo)鏈總是跟另外一個復(fù)制叉的后隨鏈相遇。()10、DNA損傷的修復(fù)機(jī)制完全依賴于每一個DNA具有兩個拷貝,每一個拷貝分別屬于同源染色體中的一個。()四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、原核生物DNA復(fù)制不需要()A、DNA聚合酶ⅠB、DNA解鏈酶C、DNA連接酶D、端粒酶2、大腸桿菌染色體DNA復(fù)制所需要的DNA聚合酶有()A、DNA聚合酶ⅠB、DNA聚合酶ⅡC、DNA聚合酶ⅢD、DNA聚合酶Ⅰ和Ⅲ3、DNA連接酶需要被連接的兩個DNA片段分別具有()A、3’-OH和5’-eq\o\ac(○,P)B、5’-OH和3’-eq\o\ac(○,P)
C、3’-OH和5’-OHD、5’-eq\o\ac(○,P)和3’-eq\o\ac(○,P)4、端粒酶是一種()A、依賴于DNA的DNA聚合酶B、依賴于DNA的RNA聚合酶C、依賴于RNA的DNA聚合酶D、依賴于RNA的RNA聚合酶5、假定一個轉(zhuǎn)座子插入到某一個基因的可讀框內(nèi),并產(chǎn)生11bp的靶點重復(fù),當(dāng)轉(zhuǎn)座子離開以后,留下重復(fù)序列,那么,這最終將導(dǎo)致()A、轉(zhuǎn)換B、顛換C、移碼突變D、易位6、將兩段寡脫氧核苷酸片段5’-ACCACGTAACGGA-3’和5’-GTTAC-3’與DNA聚合酶一起加到含有dATP、dGTP、dCTP和dTTP的反應(yīng)混合物之中,預(yù)測反應(yīng)的終產(chǎn)物被參入的各堿基的比例是()A、2C:1TB、1G:1TC、3G7、如果一個具有放射性的DNA分子在沒有放射性標(biāo)記的dNTP溶液里進(jìn)行兩輪復(fù)制,那么得到的四個子代DNA分子的放射性分布是()A、兩股各有一半帶有放射性B、所有都含有放射性C、兩個沒有放射性D、有一個DNA分子的兩條鏈具有放射性8、細(xì)胞內(nèi)的突變主要發(fā)生在()A、DNA復(fù)制B、DNA修復(fù)C、轉(zhuǎn)錄D、翻譯9、堿基類似物導(dǎo)致DNA發(fā)生突變的主要原因是()
A、插入到堿基之間,使DNA發(fā)生斷裂B、使C變成TC、能夠與不同的堿基配對D、促進(jìn)DNA的脫嘌呤10、人類基因組比大腸桿菌基因組大700倍左右,然而,人類基因組復(fù)制的時間僅比大腸桿菌基因組復(fù)制長6~8倍。這是因為()A、組蛋白的存在提高了人染色體DNA的復(fù)制速率B、人類基因組的GC含量低,兩條鏈更容易解鏈C、人基因組的許多序列在復(fù)制中直接跳過去,因為只有3%~5%的序列編碼蛋白質(zhì)D、人染色體DNA上具有多個復(fù)制起始區(qū),大腸桿菌只有一個五、問答題(每題10分,共40分)1、(1)在使用雙脫氧法測定DNA一級結(jié)構(gòu)的時候,如果在反應(yīng)系統(tǒng)中添加SSB,可以提高DNA的得率,為什么?現(xiàn)在測序使用的酶一般都是耐熱的DNA聚合酶,使用這樣的DNA聚合酶有什么好處?(2)大腸桿菌細(xì)胞內(nèi)的SSB的主要功能是什么?你如何確定它是不是DNA復(fù)制的一種必需成分?2、(1)有人將狗體內(nèi)的己糖激酶與狼體內(nèi)的己糖激酶的氨基酸序列進(jìn)行了比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩者完全相同?;诖?,你能否認(rèn)為這兩種生物體內(nèi)的己糖激酶基因從來沒有突變過嗎?為什么?(2)有人從使用羥胺誘發(fā)的突變中篩選到一種拷貝數(shù)極高的質(zhì)粒,其在大腸桿菌內(nèi)的拷貝數(shù)遠(yuǎn)高于野生型的質(zhì)粒,究其原因是DNA復(fù)制頻率提高了。經(jīng)過序列分析發(fā)現(xiàn),突變體的質(zhì)粒在復(fù)制起始區(qū)周圍的一個啟動子序列發(fā)生了突變。試提出一種機(jī)制解釋質(zhì)??截悢?shù)增加的現(xiàn)象,同時設(shè)計一個實驗來證明你的解釋。3、假定你一直在尋找一個具有更高進(jìn)行性的DNA聚合酶,用于PCR研究。你從幾種不同來源的細(xì)菌培養(yǎng)物中分別得到了幾種DNA聚合酶的粗品,現(xiàn)在要使用長達(dá)幾千堿基的單鏈DNA作為模板,測定酶活性。(1)除了在測活系統(tǒng)中添加DNA模板和DNA聚合酶抽提物以外,還應(yīng)該加入哪些成分?(2)如果你在粗抽提物中發(fā)現(xiàn)了一種具高進(jìn)行性的DNA聚合酶,需要進(jìn)一步純化它。在用不同的引物一模板測定活性以后,你驚奇地發(fā)現(xiàn),如果以短DNA引物/單鏈環(huán)狀DNA模板測定活性,進(jìn)行性不高。但是,如果你以線形的模板啟動反應(yīng),然后迅速地環(huán)化模板,則發(fā)現(xiàn)延伸的進(jìn)行性非常高。對此現(xiàn)象請給予合理的解釋。如果你使用上面的環(huán)狀模板、短的DNA引物測定活性,則發(fā)現(xiàn)在加入無DNA聚合酶的細(xì)胞粗抽提物以后,純化好的DNA聚合酶能像使用線形模板一樣,很好地使用環(huán)狀模板。對此你又如何解釋?如何驗證你的解釋?(3)你本以為在測活系統(tǒng)中加入大腸桿菌的SSB可能會刺激DNA的合成,但結(jié)果不然。然而,如果你加的是T4噬菌體的SSB,則能刺激DNA的合成。另外,在有ATP的情況下加入RecA,結(jié)果也能刺激DNA的合成,但如果使用不能水解的ATP類似物代替ATP,則對DNA的合成無刺激。對此,試提出合理的解釋。4、(1)DNA復(fù)制起始區(qū)一般具有哪些特征?(2)細(xì)菌染色體只有一個復(fù)制起始區(qū),而真核細(xì)胞染色體具有多個復(fù)制起始區(qū),為什么?(3)使用何種方法可以得到一個染色體DNA上的復(fù)制起始區(qū)序列?習(xí)題三DNA轉(zhuǎn)錄、逆轉(zhuǎn)錄及其轉(zhuǎn)錄后加工一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、Pribnowbox2、cis-actingelement3、enhancer4、corepromoter5、mRNAediting二、填空題(每空1分,共15分)1、一個基因的有意義鏈?zhǔn)侵竉________,它的序列與mRNA______。2、大腸桿菌的RNA聚合酶由_________和__因子組成,參與轉(zhuǎn)錄起始的是______,而參與延伸的是_________。3、真核細(xì)胞核mRNA前體后加工最重要的三種方式是______、______和______。4、snRNA即是____________,它的主要功能是參與_____________________________;snoRNA即是_______________,它的主要功能是參與____________________后加工。5、使用______________方法可以確定原核細(xì)胞的啟動子序列,使用________________方法可以確定真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄的起始點。三、判斷題(每題1分,共10分)1、原核生物與真核生物的RNA聚合酶在結(jié)構(gòu)上具有高度的同源性,構(gòu)成原核生物RNA聚合酶的每一個亞基在真核細(xì)胞內(nèi)都有同源的亞基。()2、內(nèi)含子在剪接反應(yīng)中被切除,所以一種蛋白質(zhì)的基因如果在內(nèi)含子內(nèi)發(fā)生突變,一般不會影響到這種蛋白質(zhì)的功能。()3、與蛋白質(zhì)酶不同的是,核酶的活性不受溫度的影響。()4、RNA病毒因為無DNA基因組,所以其生活史省去了從DNA到RNA的過程。()5、真核細(xì)胞mRNA的加帽反應(yīng)需要GTP。()6、mRNA的剪接總是產(chǎn)生套索結(jié)構(gòu)。()7、AAUAAA是真核細(xì)胞mRNA的主要加尾信號,該序列在加尾反應(yīng)完成以后被切除。()8、多數(shù)真核生物mRNA的降解開始于“脫帽”,隨后是“去尾”。()9、mRNA前體上與5’10、既然內(nèi)含子大都是遺傳“垃圾”,所以在RNA剪接的時候不必進(jìn)行精確的切除。()四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、tRNA基因的轉(zhuǎn)錄不需要的轉(zhuǎn)錄因子是()A、TFⅢAB、TFⅢBC、TFⅢCD、TFⅢD2、在正常的生長條件下,某一細(xì)菌基因的啟動子的普里布諾框由TCGACT突變成TATACT,由此而引起該基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生變化,以下幾項描述中正確的是()A、該基因的轉(zhuǎn)錄增加B、該基因的轉(zhuǎn)錄降低C、該基因不能轉(zhuǎn)錄D、該基因的轉(zhuǎn)錄沒有變化3、如果你想設(shè)計一種新的抗菌藥物,其作用對象是原核細(xì)胞的RNA聚合酶,那么,你所設(shè)計的藥物作用的最佳靶點應(yīng)該是()A、α亞基B、β亞基C、ω亞基D、σ因子4、以下不會出現(xiàn)在一個cDNA克隆中的序列是()A、加尾信號B、多腺苷酸尾巴C、5’5、DNA復(fù)制過程中合成RNA引物與細(xì)胞內(nèi)其他RNA的差別在于()A、T代替UB、由DNA聚合酶催化C、只能以DNA-RNA雜交雙鏈形式存在D、合成的方向是3’→6、真核細(xì)胞的TATA框()A、與-35區(qū)一道起作用B、存在于所有編碼蛋白質(zhì)基因的啟動子上C、將RNA聚合酶定位到啟動子上D、存在于-10區(qū)7、原核細(xì)胞內(nèi)受RNA聚合酶全酶濃度的提高而加速的轉(zhuǎn)錄步驟是()A、封閉的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成B、啟動子清空C、轉(zhuǎn)錄延伸D、轉(zhuǎn)錄終止8、某些發(fā)生在RNA聚合酶β亞基上的突變能夠阻止依賴于ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止,你認(rèn)為下列最有可能在體外恢復(fù)依賴于ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止的條件是()A、降低轉(zhuǎn)錄體系中的ATP濃度B、降低轉(zhuǎn)錄體系中的GTP、CTP和UTP的濃度C、使用強(qiáng)啟動子啟動轉(zhuǎn)錄D、在轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)中加入核糖體9、RNA聚合酶和DNA聚合酶所具有的共同性質(zhì)是()A、都需要模板和引物B、都具有自我校對的活性C、都需要Mg2+D、都能夠?qū)е翫NA發(fā)生解鏈10、以下屬于轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制是()A、DNA分子上的C發(fā)生甲基化修飾B、轉(zhuǎn)錄因子與啟動子結(jié)合C、RNA分子上的C脫氨基轉(zhuǎn)變成UD、基因擴(kuò)增五、問答題(每題10分,共40分)1、(1)如果將由RNA聚合酶Ⅱ催化轉(zhuǎn)錄的一個蛋白質(zhì)的基因讓RNA聚合酶Ⅰ或RNA聚合酶Ⅲ來轉(zhuǎn)錄,那么,這種蛋白質(zhì)的mRNA前體還能經(jīng)歷哪些后加工反應(yīng)?為什么?(2)細(xì)菌體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄和翻譯在時空上是偶聯(lián)的,但真核生物并沒有這樣的偶聯(lián)關(guān)系。然而,真核細(xì)胞內(nèi)卻有其他的過程與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián),你認(rèn)為它們是哪些過程?產(chǎn)生這種偶聯(lián)機(jī)制的直接原因是什么?2、假定枯草桿菌基因組一共具有7300個基因,其中5125個基因在營養(yǎng)型細(xì)胞內(nèi)表達(dá),而在芽孢形成中只有3532個基因表達(dá)(假設(shè)枯草桿菌的全基因組序列和所有基因的編碼序列均已經(jīng)被確定)。(1)使用何種技術(shù)可以快速確定這5125個在營養(yǎng)型細(xì)胞表達(dá)的基因和3532個在芽孢形成中表達(dá)的基因?(2)將營養(yǎng)型細(xì)胞內(nèi)表達(dá)的基因數(shù)和在芽孢形成中表達(dá)的基因數(shù)相加并非是7300,為什么?(3)一種枯草桿菌突變體已失去了產(chǎn)生芽孢的能力,只能以營養(yǎng)型細(xì)胞生長,你認(rèn)為哪些基因的突變能產(chǎn)生這種表型?3、下圖顯示的是一種細(xì)菌的幾個相鄰的基因結(jié)構(gòu)圖譜?;虻拿Q用帶有數(shù)字的ORF表示,每一個ORF似乎是一個基因,但還沒有得到專門的鑒定。某些ORF后來被證明參與Arg的合成,因此這些基因也用arg來表示,圖中彎曲的箭頭為轉(zhuǎn)錄起始點。圖中單純的數(shù)字是基因之間的核苷酸數(shù)目。(1)已有證據(jù)表明一種調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合位點與argF的啟動子序列重疊。部分證據(jù)來自DNA酶Ⅰ足跡實驗,受這種調(diào)節(jié)蛋白保護(hù)的區(qū)域有29nt,從-10區(qū)的中間延伸到-35區(qū)的上游。試畫出導(dǎo)致上升結(jié)論的足跡實驗的結(jié)果,需要同時給出對照實驗。(2)從(1)給出的信息來看,你認(rèn)為調(diào)節(jié)蛋白最有可能是激活蛋白還是阻遏蛋白?為什么?(3)下圖顯示的是靠近ORF5起點區(qū)域的一段RNA序列,這種結(jié)構(gòu)有什么意義?它來自哪一個轉(zhuǎn)錄物?(4)在細(xì)菌的培養(yǎng)基中加入Arg,能夠提高ORF4的轉(zhuǎn)錄。這意味著ORF4編碼的蛋白質(zhì)的功能是什么?ORF4有可能參與合成Arg嗎?為什么?4、(1)有人得到一種哺乳動物的細(xì)胞系:它的一個基因的啟動子被細(xì)菌的強(qiáng)啟動子序列(-35區(qū)和-10區(qū)一致序列)取代,因此,可以被細(xì)菌的RNA聚合酶有效識別。然而,當(dāng)他將帶有原核生物轉(zhuǎn)錄所有必需成分的質(zhì)粒(獨立的實驗證明,這些質(zhì)粒能夠高表達(dá)出有功能的蛋白質(zhì))導(dǎo)入到上述細(xì)胞系的時候,發(fā)現(xiàn)這個受原核生物啟動子驅(qū)動的基因表達(dá)的效率很低,最后只產(chǎn)生很少的mRNA。對此現(xiàn)象試提出兩種可能的機(jī)制給予解釋。(2)在真核細(xì)胞內(nèi),RNA聚合酶Ⅱ發(fā)生磷酸化修飾是基因表達(dá)十分重要和關(guān)鍵的一步。試回答:①催化磷酸化的激酶是什么?②磷酸化的具體對象是什么?③磷酸化的主要功能是什么?習(xí)題四翻譯及其后加工一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、Shine-Dalgarnosequence2、wobblerule3、signalhypothesis4、N-endrule5、translationalframeshift二、填空題(每空1分,共15分)1、翻譯的時候肽鏈延伸的方向總是____________,而閱讀mRNA模板的方向總是__________。2、核糖體上與tRNA結(jié)合的部位有A、P和E,其中與空載tRNA結(jié)合的是__,與起始tRNA結(jié)合的部位是__。3、翻譯的起始密碼子通常是______,有時也可以是______。然而,它們都編碼______。終止密碼子則有_______、______和______。4、原核生物和真核生物在翻譯的時候第一個被參入的氨基酸分別是__________________和____________。5、原核生物在蛋白質(zhì)生物合成的時候,參與起始階段的起始因子有3種,其中與起始tRNA結(jié)合的是______;參與延伸階段的延伸因子有3種,其中與氨酰-tRNA結(jié)合的是__________;終止釋放因子有3種,其中能夠水解GTP的是______。三、判斷題(每題1分,共10分)1、通過封閉多肽離開通道起作用的抗生素一定結(jié)合在核糖體的小亞基上。()2、抑制轉(zhuǎn)肽酶活性的抗生素通常與核糖體的大亞基結(jié)合。()3、根據(jù)擺動法則,tRNA上的反密碼子在第三個位置的核苷酸處于搖擺的位置。()4、如果將細(xì)胞質(zhì)中的mRNA導(dǎo)入到線粒體基質(zhì)內(nèi)翻譯,通常得不到有功能的蛋白質(zhì)產(chǎn)物。()5、參與糖酵解和糖異生途徑的酶都沒有信號肽。()6、甲硫氨酸的密碼子只有一個(AUG),但起始密碼子可以是AUG,也可以是GUG或UUG。由于GUG和UUG編碼的是其他氨基酸,故如果以它們作為起始密碼子的話,第一個參入的氨基酸將不再是Met。()7、密碼子第一位堿基發(fā)生的突變要比第三位發(fā)生的突變的危害要大得多。()8、催化大腸桿菌其實甲硫氨酰-tRNA合成的氨酰-tRNA合成酶識別的氨基酸是甲酰甲硫氨酸。()9、核糖體大亞基的主要功能是催化肽鍵的形成,而小亞基主要是結(jié)合mRNA和tRNA。()10、與tRNA相連的氨基酸本身在決定何種氨基酸參入到正在延伸的肽鏈上不起任何作用。()四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、不是通過模擬tRNA的結(jié)構(gòu)與核糖體結(jié)合的蛋白質(zhì)是()A、IF2B、EF-GC、RF2D、eRF22、一種新發(fā)現(xiàn)的抗生素能夠抑制細(xì)菌的蛋白質(zhì)合成。如果將這種抗生素加到以AUGUUUUUUUAG為模板的體外翻譯系統(tǒng)之中,則只形成一種二肽產(chǎn)物fMet-Phe。根據(jù)以上信息,你認(rèn)為該抗生素抑制()A、翻譯的起始B、氨酰-tRNA進(jìn)入A部位C、核糖體移位D、翻譯的終止3、在中度脅迫條件下,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)發(fā)生變性或去折疊。有助于細(xì)胞度過脅迫條件而提高表達(dá)或開始表達(dá)的基因是()A、編碼糖酵解途徑的酶B、編碼分子伴侶C、編碼RNA聚合酶ⅡD、編碼核糖體亞基4、大腸桿菌16SrRNA的3’端序列是5’-CACCUCCUUAOH-35、嘌呤霉素通過分子模擬抑制翻譯,被它模擬的分子是()A、肽酰-tRNAB、氨酰-tRNAC、肽酰轉(zhuǎn)移酶D、終止釋放因子6、假定一個編碼蛋白質(zhì)(由200個氨基酸組成)的基因由2個外顯子和1個內(nèi)含子組成。以下幾種突變中最有可能阻止這種蛋白質(zhì)不能合成的是()A、第2個外顯子內(nèi)發(fā)生一個插入突變B、基因的內(nèi)含子區(qū)域缺失5個核苷酸C、內(nèi)含子內(nèi)發(fā)生一個堿基置換D、第2個外顯子內(nèi)發(fā)生一個無義突變7、以下有關(guān)翻譯進(jìn)位的敘述正確的是()A、EF-Tu在結(jié)合氨酰-tRNA的時候水解GTPB、在EF-Tu釋放以后,氨酰-tRNA必須旋轉(zhuǎn),肽鍵才能形成C、aa-tRNA-EF-Tu在與EF-Ts結(jié)合的時候水解GTPD、EF-Tu能夠與EF-G同時與核糖體結(jié)合8、在核糖體上,mRNA的結(jié)合部位和轉(zhuǎn)肽酶的活性中心分別位于()A、兩個亞基之間;大亞基B、兩個亞基之間;小亞基C、大亞基;小亞基D、小亞基;大亞基9、在一個真核細(xì)胞內(nèi),由一種特定的mRNA翻譯出來的蛋白質(zhì)的量部分取決于()A、DNA甲基化的程度B、mRNA降解的速率C、某些轉(zhuǎn)錄因子的存在D、mRNA含有的內(nèi)含子的數(shù)目10、一種轉(zhuǎn)基因突變細(xì)菌有望用于人體疫苗,為了獲得FDA的批準(zhǔn),突變的性質(zhì)需要預(yù)先知道,而最重要的是回復(fù)突變成野生型的可能性更需要明確。你認(rèn)為獲得FDA批準(zhǔn)可能性最低的突變是()A、點突變B、插入突變C、缺失突變D、染色體重排五、問答題(每題10分,共40分)1、(1)原核生物與真核生物在識別起始密碼子的機(jī)制上有何不同?這種差別與原核生物的mRNA多數(shù)是多順反子及真核生物的mRNA絕大多數(shù)是單順反子有無某種關(guān)系?為什么?(2)在大腸桿菌細(xì)胞里表達(dá)來自嗜熱菌的基因現(xiàn)在已經(jīng)是十分普遍的實驗技術(shù)。然而,有時表達(dá)的效果不錯,有時表達(dá)得則不理想。Ishida和Oshima在研究中發(fā)現(xiàn),在大腸桿菌細(xì)胞里表達(dá)量極低的基因在緊靠RBS附近含有回文序列。如果將此序列去除,這些基因的表達(dá)量將大大提高。為什么這種回文序列在嗜熱菌體內(nèi)對基因表達(dá)不構(gòu)成問題,但在大腸桿菌卻能降低基因翻譯的效率?(3)遺傳密碼的哪些性質(zhì)有利于基因從一種生物向另外一種生物的轉(zhuǎn)移(通過基因工程或自然轉(zhuǎn)移)?哪些性質(zhì)不利于基因從一種生物向另外一種生物的轉(zhuǎn)移?2、如果你分離到一個病毒的400nt的DNA片段,它能編碼至少兩種不同的蛋白質(zhì),一個長度是120個氨基酸殘基,另一個的長度為80個氨基酸殘基。(1)你認(rèn)為這種現(xiàn)象普遍嗎?(2)試提出兩個模型解釋以上現(xiàn)象。(3)如果你測定這兩種蛋白質(zhì)的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)它們無序列同源性,那么,你能排除哪一個模型?為什么?3、如果你在研究某一個細(xì)菌基因的表達(dá),發(fā)現(xiàn)這個基因能正常地轉(zhuǎn)錄,但轉(zhuǎn)錄出來的mRNA不能正常地被啟動翻譯。(1)你認(rèn)為哪些突變可以產(chǎn)生這樣的后果?(2)你如何進(jìn)一步確定這種細(xì)菌究竟發(fā)生了何種突變?(3)如果你得到這種突變細(xì)菌的回復(fù)突變體,即一種新的突變讓這個基因恢復(fù)正常的翻譯起始,但新突變的位點與原來突變的位點不同,那么,相對于第一次突變,第二次突變會是什么?4、某些細(xì)菌的某些蛋白質(zhì)基因(如大腸桿菌乳糖操縱子的阻遏蛋白LacI)以GUG而不是AUG作為起始密碼子,對此現(xiàn)象請回答以下問題:(1)在這些基因的翻譯產(chǎn)物中,第一個參入的氨基酸仍然是甲酰甲硫氨酸嗎?(2)為什么其基因內(nèi)部的AUG不能作為起始密碼子?(3)如果將此GUG突變成AUG,這些基因的翻譯效率會有何變化?(4)起始tRNA如何識別GUG?這種現(xiàn)象可以用擺動法則解釋嗎?習(xí)題五基因表達(dá)的調(diào)控一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、antisenseRNA2、operon3、house-keepinggene4、regulon5、riboswitch二、填空題(每空1分,共15分)1、原核生物基因表達(dá)的“默認(rèn)”狀態(tài)是表達(dá),因此基因表達(dá)調(diào)控的方式主要是_________,而真核生物基因表達(dá)的“默認(rèn)”狀態(tài)是不表達(dá),故其基因表達(dá)調(diào)控的方式主要是______。2、操縱子一般由____________、____________和____________三種成分組成。3、參與基因表達(dá)調(diào)控的調(diào)節(jié)蛋白分為____________和____________兩種,操縱子上與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的核苷酸序列通常稱為____________,在正調(diào)控中起作用的是____________。4、大腸桿菌的乳糖操縱子表達(dá)受到_________和_________兩種機(jī)制的調(diào)節(jié),而色氨酸操縱子受到_________和______兩種機(jī)制的調(diào)控。5、乳糖操縱子的天然誘導(dǎo)物是_________,實驗室里常用________作為乳糖操縱子的安慰誘導(dǎo)物,以誘導(dǎo)β-半乳糖苷酶的產(chǎn)生。三、判斷題(每題1分,共10分)1、某些蛋白質(zhì)不僅可以作為阻遏蛋白還可以作為激活蛋白參與基因表達(dá)的調(diào)控。()2、轉(zhuǎn)錄因子都具有與DNA結(jié)合的模體結(jié)構(gòu)。()3、真核細(xì)胞核的三種RNA聚合酶負(fù)責(zé)的基因轉(zhuǎn)錄都受到增強(qiáng)子的調(diào)節(jié)。()4、大腸桿菌乳糖操縱子和阿拉伯糖操縱子既受到負(fù)調(diào)控,也受到正調(diào)控。()5、大腸桿菌和枯草桿菌在色氨酸弱化子的結(jié)構(gòu)上非常相似,都需要前導(dǎo)序列中含有色氨酸的密碼子。()6、調(diào)節(jié)基因一般都位于操縱子的附近,這種構(gòu)造有利于調(diào)節(jié)基因?qū)Σ倏v子的控制。()7、管家基因在細(xì)胞里始終表達(dá),因此沒有也不需要對其表達(dá)進(jìn)行調(diào)控。()8、激活蛋白參與正調(diào)控,其濃度越高,激活基因表達(dá)的效果就越好。()9、組蛋白的乙?;揎検强赡娴?,但組蛋白的甲基化是不可逆的。()10、細(xì)菌中弱化子的作用方式是在翻譯水平來控制轉(zhuǎn)錄。()四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、如果將大腸桿菌乳糖操縱子的啟動子換成強(qiáng)啟動子,那么實現(xiàn)乳糖操縱子最高表達(dá)的條件將是()A、高乳糖,低葡萄糖B、高乳糖,高葡萄糖C、低乳糖,低葡萄糖D、A和B2、有一種突變株大腸桿菌即使在有高濃度葡萄糖的時候,乳糖操縱子也呈現(xiàn)高水平的表達(dá)。此突變株最有可能()A、乳糖操縱子的阻遏蛋白因突變而失去活性
B、比野生型表達(dá)較少的cAMPC、CAP發(fā)生突變,導(dǎo)致其沒有cAMP也有活性D、催化cAMP合成的腺苷酸環(huán)化酶喪失活性3、以下是關(guān)于大腸桿菌乳糖操縱子敘述,其中正確的是()A、乳糖是天然的誘導(dǎo)物,IPTG是安慰誘導(dǎo)物B、CAP-cAMP的結(jié)合使DNA彎曲C、CAP與DNA結(jié)合的結(jié)構(gòu)域含有螺旋-環(huán)-螺旋模體D、其啟動子為強(qiáng)啟動子4、以下關(guān)于RNAi的敘述中,錯誤的是()A、可特異性地導(dǎo)致mRNA的降解B、可特異性地抑制mRNA的翻譯C、只存在于真核生物D、通常抑制特定mRNA的轉(zhuǎn)錄5、下圖顯示的是大腸桿菌色氨酸操縱子前導(dǎo)序列的大致結(jié)構(gòu):
以下可導(dǎo)致色氨酸操縱子表達(dá)提高的突變是()A、將兩個UGG突變成GGGB、序列3發(fā)生的突變減弱其與序列4的配對,但不影響2與3之間的配對C、序列3發(fā)生的突變減弱其與序列2的配對,但不影響3與4之間的配對D、以上都不是6、如果一個突變導(dǎo)致大腸桿菌色氨酸操縱子前導(dǎo)序列內(nèi)的SD序列不起作用,那么,色氨酸操縱子的表達(dá)受到的影響將是()A、在高Trp條件下的表達(dá)升高B、在低Trp條件下的表達(dá)升高C、在高Trp條件下的表達(dá)下降D、在低Trp條件下的表達(dá)下降7、如果使用定點突變的手段將大腸桿菌色氨酸操縱子前導(dǎo)肽的起始密碼子突變成UGA,那么色氨酸操縱子將()A、不管細(xì)胞內(nèi)Trp水平的高低,總是被阻遏B、不管細(xì)胞內(nèi)Trp水平的高低,總是被表達(dá)C、在有Trp的時候才表達(dá)D、在沒有Trp的時候才表達(dá)8、大腸桿菌的CRP被認(rèn)為直接與RNA聚合酶相互作用,而激活很多操縱子的表達(dá)。支持這種觀點的證據(jù)是()A、發(fā)生在RNA聚合酶α亞基上的突變可阻止CRP的激活B、某些CRP突變體(crp-)呈顯性突變C、某些CRP結(jié)合位點與啟動子的-35區(qū)序列重疊D、CRP只有結(jié)合cAMP以后才有活性9、屬于表觀遺傳變化的是()A、DNA甲基化B、DNA缺失C、DNA突變D、DNA擴(kuò)增10、選擇性剪接是真核生物基因表達(dá)的一種重要手段,以下各種選擇性剪接方式中不可能發(fā)生的是()A、外顯子跳過B、內(nèi)含子保留C、改變外顯子連接的順序D、可變的5’五、問答題(每題10分,共40分)1、酵母細(xì)胞內(nèi)有兩種蛋白質(zhì)——蛋白A和蛋白B,它們都由管家基因編碼。然而,蛋白A的量始終高于蛋白B,對此試提出兩種可能的機(jī)制給予合理的解釋。2、一些被稱為抗誘導(dǎo)物(anti-inducer)的化合物能夠與阻遏蛋白(例如乳糖操縱子的阻遏蛋白)結(jié)合,抑制誘導(dǎo)物對特定基因表達(dá)的誘導(dǎo)。試就此抗誘導(dǎo)物的作用機(jī)制給予解釋。3、如果使用DNA芯片技術(shù)分別測定酵母菌在基本培養(yǎng)基和完全培養(yǎng)基上的基因表達(dá)情況,那么,哪些基因在基礎(chǔ)培養(yǎng)基上生長的酵母菌內(nèi)大量表達(dá)?哪些基因在兩種不同的培養(yǎng)基上生長的酵母菌體內(nèi)都表達(dá)?4、大腸桿菌的乳糖透過酶既能運輸乳糖,也能運輸乳糖酸(lactobionicacid)。但是,β-半乳糖苷酶水解乳糖酸的效率并不高。某些大腸桿菌突變體內(nèi)的β-半乳糖苷酶發(fā)生了突變,使其能夠更好地水解乳糖酸。這樣的突變體能夠生活在以乳糖酸為唯一碳源的培養(yǎng)基上。然而,如果培養(yǎng)基中沒有IPTG,突變體就不能生長。對此你如何解釋?你如何進(jìn)一步驗證你的解釋?習(xí)題六基因工程以及其他現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)一、名詞解釋(每題3分,共15分)1、genetherapy2、geneknock-out3、proteinengineering4、DNAchip5、geneknock-in二、填空題(每空1分,共15分)1、制備cDNA文庫需要的工具酶有____________、限制性酶和_______________。2、限制性內(nèi)切酶一般分為___類,用于基因工程的屬于第二類,這一類在組成上一般為_________,識別的序列通常具有______特征,切點位于識別序列內(nèi)部。3、Southern、Northern和Western印跡分別被用來檢測DNA、RNA和_________,它們所使用的探針分別是______、核酸和______。4、____________是應(yīng)用于蛋白質(zhì)工程中的最主要的手段。5、實時PCR主要用于_____________________________。6、在分子克隆中,能催化黏端又能催化平端DNA連接的DNA連接酶是___________________。7、雙向電泳的第一相是進(jìn)行____________,第二相是進(jìn)行________________。8、小的核酸(低于1000nt)通常使用_______________凝膠電泳進(jìn)行分離,大的核酸一般使用_________凝膠電泳來分離。三、判斷題(每題1分,共10分)1、PCR只能擴(kuò)增雙鏈DNA,不能擴(kuò)增單鏈DNA。()2、CCGG和GGCC序列受同一種限制性酶的識別、切割。()3、限制性酶只能切開雙鏈DNA。()4、Ti質(zhì)粒來源于低等植物,目前被廣泛用于植物基因工程。()5、單核苷酸多態(tài)性(SNP)可導(dǎo)致限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)。()6、基因組計劃表明,人類基因組序列的大多數(shù)對應(yīng)于內(nèi)含子序列。()7、Southern印跡和Northern印跡的主要差別是前者使用特定的DNA分子為探針,后者使用RNA分子為探針。()8、只有用相同的限制性酶獲得的DNA片段末端才能用DNA連接酶連接起來。()9、PCR和末端終止法測序都需要RNA引物。()10、使用TaqDNA聚合酶進(jìn)行PCR反應(yīng),得到的產(chǎn)物在3’四、單項選擇題(每題2分,共20分)1、一種典型的限制性酶切割DNA,切點切開后的結(jié)構(gòu)是()A、上面一條鏈?zhǔn)?’-eq\o\ac(○,P),下面一條鏈?zhǔn)?’-eq\o\ac(○,P)
B、上面一條鏈?zhǔn)?’-eq\o\ac(○,P),下面一條鏈?zhǔn)?’-eq\o\ac(○,P)
C、兩條鏈都是5’-eq\o\ac(○,P)
D、兩條鏈都是3’-eq\o\ac
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