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文檔簡介
1/1anxa10對人原發(fā)性肝癌細(xì)胞株hepg2中的vegfaakt3pik3ca基因表達(dá)影響的研究摘要目的:
1、構(gòu)建攜帶增強(qiáng)綠色熒光蛋白(EGFP)的人膜聯(lián)蛋白A10基因(ANXA10)過表達(dá)慢病毒,然后轉(zhuǎn)染人肝癌細(xì)胞株HepG2。
2、采用轉(zhuǎn)錄組測序的方法檢測ANXA10過表達(dá)慢病毒對HepG2基因表達(dá)譜所產(chǎn)生的影響,初步闡明ANXA10對HepG2生物學(xué)行為的影響、可能涉及的基因及相關(guān)的信號通路,為原發(fā)性肝癌形成中的ANXA10作用的深入研究奠定基礎(chǔ)。
方法:
構(gòu)建攜帶增強(qiáng)綠色熒光蛋白(EGFP)的人膜聯(lián)蛋白A10基因(ANXA10)過表達(dá)慢病毒LV-ANXA10,體外培養(yǎng)的HepG2分為三組:
實(shí)驗(yàn)組、空載體對照組和空白對照組,各組分別轉(zhuǎn)染LV-ANXA10、慢病毒空載體以及等量的Polybrene(病毒及空載體以MOI=10濃度轉(zhuǎn)染),轉(zhuǎn)染72小時(shí)后使用熒光倒置顯微鏡觀察增強(qiáng)綠色熒光蛋白(EGFP)的表達(dá)情況,從而來確定ANXA10的轉(zhuǎn)染效率,轉(zhuǎn)染后96小時(shí)和120小時(shí)分別提取三組細(xì)胞的RNA行轉(zhuǎn)錄組測序比較三組細(xì)胞相同時(shí)間點(diǎn)及同組細(xì)胞不同時(shí)間點(diǎn)基因表達(dá)譜的差異,并采用qPCR驗(yàn)證部分差異表達(dá)基因。
結(jié)果:
1、ANXA10過表達(dá)慢病毒能影響HepG2的基因表達(dá)譜。
通過對轉(zhuǎn)錄組信息的分析,發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)染后96小時(shí)的空白對照組與實(shí)驗(yàn)組比較發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有69個(gè),其中26個(gè)基因上調(diào),43個(gè)基因下調(diào);空載體對照組與實(shí)驗(yàn)組相比發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有53個(gè),其中25個(gè)基因上調(diào),28個(gè)基因下調(diào);空載體對照組與空白對照組比較發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有12個(gè),其中8個(gè)基因上調(diào),4個(gè)基因下調(diào)。
而在轉(zhuǎn)染后120小時(shí)的空白對照組與實(shí)驗(yàn)組的比較中發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有742個(gè),其中110個(gè)基因上調(diào),632個(gè)基因下調(diào);空載體對照組與實(shí)驗(yàn)組的比較中發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有313個(gè),其中168個(gè)基因上調(diào),145個(gè)基因下調(diào);空載體對照組與空白對照組比較發(fā)生顯著轉(zhuǎn)錄差異的基因有36個(gè),其中24個(gè)基因上調(diào),12個(gè)基因下調(diào)。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)染96小時(shí)及120小時(shí),實(shí)驗(yàn)組與空載體對照組及空白對照組比較VEGFA、AKT3、IIPIK3CA的表達(dá)均是下調(diào)的,而空載體對照組與空白對照組比較無上述變化。
2、采用熒光定量PCR技術(shù)驗(yàn)證,其結(jié)果表明,兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)組與空載體對照組及空白對照組三組比較,實(shí)驗(yàn)組中VEGFA、AKT3、PIK3CAmRNA表達(dá)明顯下調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.05),但空載體對照組與空白對照組相比較無明顯差異(Pgt;0.05),與轉(zhuǎn)錄組測序的分析結(jié)果吻合,從而證實(shí)VEGFA、AKT3、PIK3CA在轉(zhuǎn)染過表達(dá)慢病毒ANXA10的HepG2細(xì)胞和轉(zhuǎn)染空載慢病毒的HepG2細(xì)胞及HepG
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