DB42-T 2215-2024 甘藍型油菜品種真實性及其實質(zhì)性派生品種MNP鑒定法

DB42DB42/T2215—2024甘藍型油菜品種真實性及其實質(zhì)性派生品種MNP鑒定法Rapeseedvarietiesauthenticityandessentialderivedvarieties—MNPtestmethod2024-03-26發(fā)布2024-05-26實施湖北省市場監(jiān)督管理局發(fā)布I III 1 1 1 1 2 2 2 3 5本文件按照GB/T1.1—2020《標準化本文件實施應(yīng)用中的疑問，可咨詢湖北省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳，聯(lián)系電話郵箱：1本文件規(guī)定了油菜品種鑒定多核苷酸多態(tài)性（multiplenucleotidepolymorphism,本文件適用于甘藍型油菜（BrassicanapusL.）3.3平均覆蓋倍數(shù)averagecoverage檢出的標記位點detectedm利用多重聚合酶鏈式反應(yīng)擴增(PCR)和二代高通量測序，獲得樣品基因組上的MNP標記位點的多態(tài)25.17.1操作要求按多重PCR擴增與文庫構(gòu)建試劑盒的說明書進行DNA質(zhì)控、多重PCR擴增、文庫構(gòu)建與純化。高通量測序的平均覆蓋倍數(shù)設(shè)置為700倍以上，測序拼接后完整長度大于標記引物7.6測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制38.1結(jié)果計算GS——待測品種與對照品種的遺傳相似度（%8.2結(jié)果判定4當(dāng)待測品種與對照品種的遺傳相似度（GS8.3結(jié)果表述例1：待測品種A與對照品種B比較位點數(shù)為502，差異位點數(shù)為2，遺例3：待測品種A與對照品種B比較位點數(shù)為487，差異位點數(shù)為1525序號體1GGGTTTGCATGTTTAATAAAAACTGTGTGTGTATGGTTCG2ACCAGCCAAACACAAAAGACTAATTTATATCAGAGGTTTTCTCCTC3TGTTGCCTCTAAGTTTCAACGGATATTCTCACATTAGCTACTC4TCCAATTACCGATACAAGAGACTGCAAAGTCTCCCACACTGGAAA5AAATAAAATTCAGTTTCTAATGCGATTTC6TATCTAGGGAAGTTCTAACA7GATACGAAGTTTTCAAATCAGTAAATAGAAGTGTAGTCAATTATTGTTG8ATAAAATGTGGAAAGCAAACCAAAATACTTAAATGGAGAGATTCGA9AAGTACGTCTCCGATGAATGACGTTTGATTGCCTTCAGTACGTCTTTCTGTAATCACATCGCGAAAACAAACCGAAATTCTGAAAATCGGATGAAAAGCAGACCTACGTGAGATTCTCTCTTTCTAAATAAAATAATCACGCAAGTCACAATACATCAAATTCTCACTAACATGATCCAATGATTGATTGAGCTCTGAACCGAACTTGAAGCAAAATTAGTGTTTCAATCATTATGAATGTGTCTACCACGGGAATTCAAAGAAATTCCGACATTTGGAGAACCTATAGAGCGGAATAAATGTTGAAGAAGTATGGCTGCTGTTCAAAGTGTTCCAATCAAATCAAATCAAAT6序號體CATTGGTACGTTAGTTTATAGAATTTCATTGTCAGACTGTGTTAACGATCACAGCATATAACTTCATGTATGCAAAGCACAAAGACAACAATACCAGCTTCAAATGGAGTTTAGATCCCGAATGAAGTCGAAGATAAGACCGAACTTTTTGAAAAAGTTTGAGGCAATTGTTCTAACAAACCTTGAAAATGTCTCGGAGGATCCATTATAAAAGCATTGTCTGTGCAATTTAATCCACGAATTCAAATTTATGATGAGCAGCTCCAGTGATACATCTCCTCGCATAAGCGGTAGTGAGAAAGAAAGTTCGTTACAAACTATGACAGATGTGAACGTATAGCTAACATCATTTAGATAGACGATTTTACAAGCGACAATTGATAGTTGGTGAACTTTTATATGCAAATGTTTACTTCTTTAAAAGGGCTATCATTAGTAAAGAGTCTTTAAGTACCTCAACTGTCCACTGGCAATACGTAATTGATTTATTTCACTCGTTTTCATATACAACTCAGAGACTTGAAAGCCTTTCTTTTTAGACTCTATTTCTGTGGGAATTTTAGACTTGCGCAAAATTATTTTTGATTTTTGAATTATATTGGAGTATTTTTTGTGAAAGGGTTTAAACAACTCAAAAATCCTTCCAGATGTTACATAAGTTAAGAGATTCTTCAAATAGAAGTTCATGAGAAGTGAACATTATTGGTCATTCATCCCTGAATCGCGTGATAGC7序號體ACATTTATACCCGTGCTGGAAAAGATCATATCAGCTAAATTTTGAGCCTTCCTAGTAAATGCATATGCATAGCTTCGGTGGACTAACCAGCGATCGCTTCCAGATATTTTACAACTTTATAACATGTATTCGACATGTTTTGCAATACTATGTTTCCGACCTGAGATCTCTAGACATTTAATCAGTGTGAATCTGGCTTTATTTGGTGTTGATTAACCATGTGTTCTTTTTAGATGGTTTAATTTTCTCTTTTCCAAATCTGTAAATTTGAGAGGATTATGGAATTGATTTTGTGATGACTTCTACGTGATTATGAGATGAAACAAGAATTCCAACGCTCTTTAGTTGCAATTGAAATGCACCGTTCATAGTTCCTATCCAAAAGCTCTAATAATAATGGATCATGCATTTAGGCATTACTATTTGATCGAAAACGATCGATTTCAAAAGAGTCTTAGAGTGGTATCACTACAATAAATATGCAATTCATGATCTGAATTCCATAGAGAAACTAGGTGAATCTCAAGAATCCACGAATGGATATTCTTTCTGATAGTGTGATGCATGTAAAATCATTAATTGAAAATCTTGCATGACAACTGGCATATACTGACATCTGTTGAGTATACAAGTACTTTACTAGGGGAAAACAAGTTAAAAGTCATTTAATCCTTTAAGAACCCAAACTAAGGCAAGACACAATTTATCAATTCTAGTTTCTTGTTTTCAGTGAACATTTTGGTAGAATTGTTGAATGGTCAGTAACCTTATACTTGAA8序號體AGCAAAAGCCATGTAACCATTATATTTCATTAACCCTCGAGAGACTCTTCTAAATCGTTTTGGTTATGAATGATTTAGTGATTGTTGTCTCAGCTAGAAATACGACTCTGAACGTAGAGGAATTTACATGGTGAAACATAAATTTGCAAGCCTAAAGCAAAAATAAAAGATCAAGAAAAATTATGATGGCGATTTTGCTCAAAATCCATAGAAAAGTACAAGACAACGGTTCATTTCAAAAATATGTCAACTTTCAAGGCCTAAAGAATACCATAATATTTTAAATGGCCATGTTTCATCATTCATTTCATCCAACGGCTTTTAGCCCATAATATATTCAGAAACTGCCGACATGTCTTATTAATGTTAGCCCTATGAATAGTCGATCCTATTAACATAGACAAGTCTGGGAATATGTTCACTACAAAATGACCACGGCGCGAATCTTAACCTAGTTTGTCAATATAATCATCTTCAACCATATGATTGTTTGGATAAACTCTCTTAACACATGATCATCCATGTTTTATGCCCTTACAGTGCCTATACAGTCTAAGTGAACCTTGATATCAAAACTTCCAATTCAGACAACCGTTTTCATCATTAATTTGCAGAAAGATGGAGTTGTTGAAGTGCACCAAAATAGAATCATCGTATTATGTCCAACTTTTTCATGGAGTTTTGCTGAAATAATAGAGTGGAGTTGGAGAAATTTTTACTGGAGAGAAATAGAGTAAGAA9序號體AAGCTGACTTAGGATTTGTGAAACTTAATAGTTTGTGGTGCTCCATTCAATTTTTGTTTGATTTGTTTCCAATCTCATTTGGTTTCTAAACAGCCATAACCACAAACAAAGGTGATGATTGTTTCGCCTATTAGCCCAATTCAAATAAAACCTCATAATTCGATCATAGCTAAATGTCTAGAGTTCTTTTTCTTAGTTGCCAGAAAACATCACGAAAATGTATCACCATAAGAAGAAACCAACAAGCACTTCATGTATTAAAATATCCACTACGGTTTTACTCTAAGGAGGAAACTAACACATTAAAAAATCTCAACAAATATGAGAGAGTTTTACTAAGCAAGATGATGATATGAGCTTATAAAGCTTTTGGAACATCAAATTTGGTGTGAGATGGGATGTTACATTAAAATTCAAAGAACCTTTTGAACCCACCCAAATGATTAGCAAGATGCGAGAAAATGAGTGGACCATAAATTTTTGTCTTACGGAGAACTTATTCACTCATGCATAATTTTTGGACTGTAAGGTAGACAAGACAACTTTCTCAACTAACAGAATGATTCAGGAGAGACAAACGATAGCAAGCTATGAGGAGAAATTTTTTCTTATTCCTTCGTTGCATAACTTAGCATGATACATCTTGTGTTTCTTTACAAAAACGATACGGTAAACAGCCAAATTTTAAAGTACTTTTTCAATTTGTTACGGTTGATCGCTATATCACATGTACTTACGTTAATAGATTTGGTGGTGATAGGAGAAACATAAAACTTGTGCTCTTAAACAAACTCACCCAACAATTTGAGAATGATTGGAATTGGAACGGATGAACCATGTCAAAAGACTCAA序號體AGAACGAAATTACAAGCAAATAGTTCAGCTGACAAAGATGTCGTGTATAATGGTTTACGTTTTTGTTGTCTGTGCTACTTCGTGTAGTTCATAATGTCATCATCGAAAGCTATATGATCTTCATACATCACGTTAGCCGGACTAGTATATCATATTCTTGTCGAGACTACAACAGAATCAGTGGATGAGTTTCAAAAACTCGGTGCAGATTTATTCTTTGACGTAGAATCCGTCAACTTTCTAAAATATACCATTGACAAGATGCTTGATGAATTCATCATTTATGACTGGACAAACAAATATTTTATCACAGAGAAAAAGCACCATTGAATCGACCTTTTACACGCTAATCTCTCCGAAATTTGACCTCTTACAATTAAGACATGAAGATTTTCTTACATAAGCCTTCAAACTTCTTGTTTTGATGCAATAAGCGTACATGATATTAATTAATTTCCAGTGGCATAATCTGTAAGTAGGTTATATTTGGATATTTTCTCTCTGTTTAATGCTTAATAGGAAGTTTTAAGAGGGCATGCACCCCTCCCACATCTAAACTGGTACAGATAATTGTGGTCACTATCGCATAACTCTGAATTTTTAACGGAG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