pubmed文獻(xiàn)檢索課件

PubMed網(wǎng)上MEDLINE檢索5/9/20241pubmed文獻(xiàn)檢索課件

基本情況檢索方法結(jié)果處理5/9/20242pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本情況5/9/20243pubmed文獻(xiàn)檢索課件PubMed簡介PubMed系統(tǒng)是由美國國立生物技術(shù)信息中心（NCBI）開發(fā)的用于檢索MEDLINE數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。5/9/20244pubmed文獻(xiàn)檢索課件進(jìn)入PubMed的方法Http:///pubmed5/9/20245pubmed文獻(xiàn)檢索課件數(shù)據(jù)來源MEDLINEInProcessCitations

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5/9/20246pubmed文獻(xiàn)檢索課件Medline收錄文獻(xiàn)起止時(shí)間1948年以來醫(yī)學(xué)、護(hù)理、牙科、獸醫(yī)、衛(wèi)生保健、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)70多個(gè)國家和地區(qū)的5000多種生物期刊,在線圖書書目文摘條目2000萬條5/9/20247pubmed文獻(xiàn)檢索課件InProcess1998年開始建立，是一個(gè)臨時(shí)性醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫收錄由出版商提供的尚未經(jīng)過規(guī)范化處理的新數(shù)據(jù)提供簡單的書目信息和文摘數(shù)據(jù)每周轉(zhuǎn)入MEDLINE一次有inprocess的標(biāo)記5/9/20248pubmed文獻(xiàn)檢索課件Publisher-SuppliedCitations

由出版商提供的電子文獻(xiàn)記錄，不屬于MEDLINE收錄范圍的標(biāo)記為:[PubMed]或[PubMed–assuppliedbypublisher]出版商提供的先于印刷版文獻(xiàn)出現(xiàn)的網(wǎng)絡(luò)版題錄[Epubaheadofprint]5/9/20249pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202410pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索方法5/9/202411pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本檢索功能Limits檢索功能高級檢索功能主題詞數(shù)據(jù)庫檢索功能其他檢索功能5/9/202412pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本檢索功能自動詞語匹配功能強(qiáng)制檢索功能截詞檢索布爾檢索字段檢索5/9/202413pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動詞語匹配功能

自動詞語匹配是PubMed最具特色的檢索功能之一，PubMed會自動對輸入的檢索詞進(jìn)行分析、匹配、轉(zhuǎn)換并檢索，是一種智能化的檢索過程。5/9/202414pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動詞語匹配基本原理對輸入的檢索詞，系統(tǒng)首先在多個(gè)索引詞表

MeSH轉(zhuǎn)換表刊名轉(zhuǎn)換表著者索引及轉(zhuǎn)換表進(jìn)行搜索、比對，并自動轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH主題詞、著者或刊名5/9/202415pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動詞語匹配基本原理再將檢索詞在allfields（所有字段）中檢索，并執(zhí)行“OR”布爾邏輯運(yùn)算。如果輸入多個(gè)檢索詞或短語詞組，系統(tǒng)會繼續(xù)將其拆分為單詞后分別在allfields（所有字段）中檢索，單詞之間的布爾邏輯關(guān)系為“AND”。5/9/202416pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202417pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202418pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202419pubmed文獻(xiàn)檢索課件如果在3個(gè)轉(zhuǎn)換表中都沒有把詞組分開重復(fù)進(jìn)行自動匹配直到找到匹配詞為止。如果還沒有找到匹配詞系統(tǒng)將把單個(gè)詞用邏輯”與”組配并到所有字段中檢索。5/9/202420pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202421pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202422pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202423pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202424pubmed文獻(xiàn)檢索課件singlecell("singleperson"[MeSHTerms]OR("single"[AllFields]AND"person"[AllFields])OR"singleperson"[AllFields]OR"single"[AllFields])AND("cell"[AllFields]OR"cells"[MeSHTerms]OR"cells"[AllFields])5/9/202425pubmed文獻(xiàn)檢索課件強(qiáng)制檢索功能如果將短語作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用“”將其引起來。系統(tǒng)不進(jìn)行自動詞語匹配的轉(zhuǎn)換系統(tǒng)不能進(jìn)行擴(kuò)展檢索5/9/202426pubmed文獻(xiàn)檢索課件“singlecell”

single-cell

singlecell[ti]

5/9/202427pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202428pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202429pubmed文獻(xiàn)檢索課件截詞檢索截詞符“*”可代表多個(gè)字符PubMed一次最多可以檢索出600個(gè)詞形變異詞。截詞功能只限于單詞，對詞組無效5/9/202430pubmed文獻(xiàn)檢索課件布爾檢索布爾運(yùn)算符AND，OR，NOT必須大寫從左至右進(jìn)行布爾運(yùn)算以通過加圓括符改變運(yùn)算順序5/9/202431pubmed文獻(xiàn)檢索課件

檢索詞后附加字段標(biāo)識字段標(biāo)識要用方括號括起來，位于檢索詞之后例如dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]字段限定檢索5/9/202432pubmed文獻(xiàn)檢索課件字段標(biāo)識字段名稱簡要說明ADAffiliation第一責(zé)任者的工作單位、地址，合同號ALLAllFields全字段AUAuthorName著者姓名IPIssue期刊的期號TAJournalTitle期刊名稱或ISSN號LALanguage語言文種MAJRMeSHMajorTopic主要MeSH主題詞MHMeSHTerms全部MeSH主題詞PGPageNumber期刊頁碼DPPublicationDate文獻(xiàn)出版日期PTPublicationType文獻(xiàn)類型包括綜述、臨床試驗(yàn)、通信等TWTextWords題名詞和文摘詞TITitlewords題名詞VIVolume期刊卷號5/9/202433pubmed文獻(xiàn)檢索課件Limits限定檢索功能出版日期出版類型語種研究對象限制檢索子集年齡性別可以對全文、文摘限制檢索可以限制檢索字段5/9/202434pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202435pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202436pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202437pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202438pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202439pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202440pubmed文獻(xiàn)檢索課件練習(xí)查找1997-2000高血壓（hypertension）與鼻出血（nosebleed）的有關(guān)文獻(xiàn)5/9/202441pubmed文獻(xiàn)檢索課件高級檢索(advancedsearch)檢索欄searchbox檢索編輯器searchbuilder檢索史history更多資源moreresources檢索細(xì)節(jié)details5/9/202442pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202443pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索編輯器searchbuilder5/9/202444pubmed文獻(xiàn)檢索課件查找微量元素銅、鐵、鋅與白血病的文獻(xiàn)CopperIronZincleukemia5/9/202445pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202446pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202447pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202448pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202449pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202450pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202451pubmed文獻(xiàn)檢索課件MeshDatabase檢索瀏覽Mesh詞表選擇規(guī)范化主題詞選擇副主題詞查看主題詞注釋瀏覽樹狀結(jié)構(gòu)表建立檢索式5/9/202452pubmed文獻(xiàn)檢索課件利用MeSH主題詞檢索有關(guān)艾滋病的文獻(xiàn)5/9/202453pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202454pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202455pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202456pubmed文獻(xiàn)檢索課件MeSH主題詞檢索是PubMed最具特色的檢索功能之一，能保證較好的查全率和查準(zhǔn)率。這是因?yàn)椋海?）主題詞對同一概念的不同表達(dá)方式進(jìn)行了規(guī)范。（2）主題詞可以組配相應(yīng)的副主題詞，使檢索結(jié)果更加專指。5/9/202457pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202458pubmed文獻(xiàn)檢索課件（3）用主題詞的樹狀結(jié)構(gòu)表，可以很方便進(jìn)行主題詞的擴(kuò)展檢索（Explode）。默認(rèn)狀態(tài)下，系統(tǒng)自動對含有下位概念的主題詞進(jìn)行擴(kuò)展檢索，點(diǎn)選DoNotExplodethisterm則不進(jìn)行主題詞擴(kuò)檢。

5/9/202459pubmed文獻(xiàn)檢索課件4）應(yīng)用MeSH主題詞的MajorTopic（主要主題詞）檢索：可以使檢索結(jié)果更加準(zhǔn)確。點(diǎn)選RestrictionsSearchtoMajorTopicheadingsonly，限定檢索結(jié)果為主要主題詞。5/9/202460pubmed文獻(xiàn)檢索課件建立檢索式如果有多個(gè)主題詞，可以先分別對每個(gè)主題詞進(jìn)行檢索，再在高級檢索的SearchHistory中用檢索序號進(jìn)行布爾邏輯運(yùn)算；也可以通過主題詞檢索頁面的PubMedsearch直接建立檢索式5/9/202461pubmed文獻(xiàn)檢索課件膝關(guān)節(jié)滑囊炎的診斷，要求膝關(guān)節(jié)為主要主題詞5/9/202462pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202463pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202464pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202465pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202466pubmed文獻(xiàn)檢索課件其他檢索功能5/9/202467pubmed文獻(xiàn)檢索課件特定文獻(xiàn)檢索點(diǎn)擊singlecitationmatcher或batchcitationmatcher按界面提示輸入所知信息點(diǎn)擊search5/9/202468pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202469pubmed文獻(xiàn)檢索課件ClinicalQueries臨床咨詢研究范疇:一般疾病的病因?qū)W、預(yù)后、診斷、預(yù)防以及治療FindingSystematicReviews：提供系統(tǒng)評價(jià)、meta分析、臨床試驗(yàn)綜述臨床指南等循證醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息的查找MedicalGeneticsSearches5/9/202470pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202471pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索結(jié)果的處理顯示保存與輸出

5/9/202472pubmed文獻(xiàn)檢索課件顯示—默認(rèn)格式5/9/202473pubmed文獻(xiàn)檢索課件顯示設(shè)置5/9/202474pubmed文獻(xiàn)檢索課件保存與輸出5/9/202475pubmed文獻(xiàn)檢索課件其他工具M(jìn)YNCBISAVEHISTORY5/9/202476pubmed文獻(xiàn)檢索課件小結(jié)1、PubMed基本檢索提供的自動詞語匹配功能一般適合檢索經(jīng)驗(yàn)有限的初級用戶，也適合對課題做初步檢索，大致了解檢索結(jié)果的分布情況。因?yàn)樽詣釉~語匹配檢索有較好的查全率，但因?yàn)樽詣舆M(jìn)行詞語拆分，查準(zhǔn)率有時(shí)不能令人滿意。5/9/202477pubmed文獻(xiàn)檢索課件2.PubMed的主題詞檢索是其最具特色的功能之一，能保證較好的查準(zhǔn)率及查準(zhǔn)率。主題詞組配副主題詞使檢索結(jié)果更為專指，限定在主要主題詞檢索能使結(jié)果更準(zhǔn)確。5/9/202478pubmed文獻(xiàn)檢索課件3.但是主題詞檢索也有一些固有的缺陷，比如很多專指的概念沒有相應(yīng)的主題詞，一些新出現(xiàn)的概念要幾年后才收錄為主題詞這種情況下，不宜采用主題詞檢索，采用字段限定檢索等方法也能得到較好的查準(zhǔn)率。此外，主題詞檢索還可能會漏掉一些最新的文獻(xiàn)（inprocesscitations），這也是需要注意的。5/9/202479pubmed文獻(xiàn)檢索課件4.熟練運(yùn)用PubMed限定功能，和臨床查詢、引文匹配等工具能大大提高檢索效率。5/9/202480pubmed文獻(xiàn)檢索課件作業(yè)

1．查找有關(guān)活體供（Livingdonor）肝移植（livertransplantation）的有關(guān)信息，要求查找2005年以來的臨床試驗(yàn)，并且用英文發(fā)表的文獻(xiàn)2.用Meshdatabase檢索主要內(nèi)容為前列腺癌(prostatecancer)的文獻(xiàn)。將檢索的結(jié)果的題錄和文摘存儲到本地硬盤