2015年圈養(yǎng)大熊貓繁殖管理策略建議及種群概況

中國國家林業(yè)局野生動植物保護(hù)司大熊貓保護(hù)管理辦公室美國大熊貓保護(hù)基金會GPCF2015年圈養(yǎng)大熊貓繁殖管理策略建議及種群概況2014年11月11-12日由世界自然保護(hù)聯(lián)盟/保護(hù)繁育專家組IU由史密森保護(hù)生物學(xué)研究所提供資助項目執(zhí)行總結(jié)本文是2014年11月11-12日在中國重慶所召開會議的報告。該會議旨在對大熊貓遷地種群分析予以更新，提出2015年度繁殖建議。這已是第13次為大熊貓的遺傳管理目前遷地大熊貓種群的數(shù)量維持在375只的規(guī)模(雄性179只，雌性216只，1只性別不明),他們生活在全世界72個不同的大熊貓飼養(yǎng)機構(gòu)中。在2014年共計出生34只幼仔，10只個體死亡，1只放歸野外。中國機構(gòu)間進(jìn)行了53只熊貓交換，出境4只(馬來西亞和比利時),3只從美國回到中國。當(dāng)前圈養(yǎng)種群的總體遺傳狀況健康(遺傳多樣性=97%.4),其中包括54只建群者遺傳表達(dá)，如果另外10只個體能夠繁殖成功的話，其遺傳因素也可在現(xiàn)有種群中得到表達(dá)。該種群中有5只幼仔為近親繁殖的后代，其近交系數(shù)>4%。大熊貓譜系顯示其中有48只仍存活個體，或有存活后代的個體的父本不詳，大部分是2006年及之后出生的，是與多個雄性自然交配及/或人工受精造成的。當(dāng)前遷地種群的基因庫中約有9%的后代是源自這些血緣不清個體的。父本不清的幼仔，以及當(dāng)年出生的所有幼仔進(jìn)行親子鑒定。本報告附有需要進(jìn)行父權(quán)鑒定的大熊貓清單(見第12頁)。應(yīng)繼續(xù)計劃在明年內(nèi)解決盡可能多的此類不確定情2014年的種群增長率為7%,保持了一定的數(shù)量增長，同時加強了遺傳管理。作為遺傳管理策略的一部分，側(cè)重繁殖有遺傳價值的個體，來保存遺傳多樣性及減少近親繁目前遷地大熊貓種群繁殖的目標(biāo)為：“在200年內(nèi)至少保留90%野生大熊貓的遺傳多樣性的目標(biāo)種群大小(400-600只)”。這個規(guī)模和基因構(gòu)成的種群應(yīng)該能夠為未來需2015GeneticManagement內(nèi)容遷地大熊貓管理項目3數(shù)據(jù)分析和譜系估測4數(shù)量狀況5遺傳狀況2015年繁殖建議7附錄A:為分析而做出的繁殖種群假設(shè)10附錄B:大熊貓個體因父本不清對遺傳測算的影響11附錄C:圈養(yǎng)大熊貓種群平均親緣關(guān)系值MK排序表15附錄D:2015年繁殖季大熊貓配對MSI值(2014年11月于重慶發(fā)布)20遷地大熊貓管理項目簡介本文是2014年11月11-12日在中國重慶所召開會議的報告，該會議旨在對大熊貓遷地種群分析和繁殖計劃予以更新。參會者更新了種群譜系，提出了2015年在中國境內(nèi)需要繁殖的雌性、以及與她們配對的雄性(或精液)。本次會議由中國動物園協(xié)會CAZG、成都大熊貓繁育研究基地、及重慶動物園主辦，其中技術(shù)研討會由世界自然保護(hù)聯(lián)盟IUCNSSC保護(hù)繁育專家組CBSG主持。技術(shù)會議的目標(biāo)是：●更新遷地大熊貓種群數(shù)量和遺傳分析結(jié)果；以及●為達(dá)到這些目標(biāo)制定大熊貓繁殖和管理建議。種群目標(biāo)2009年技術(shù)委員會修改了項目目標(biāo)，即“在200年內(nèi)至少保留90%野生大熊貓的遺傳多樣性，目標(biāo)種群500只(400-600只)”。由于氣候變化及棲息地破壞等重大威脅的不確定性，目標(biāo)中采納了更長的時間段。適應(yīng)新目標(biāo)的增長率可能是緩慢的，應(yīng)加強遺傳管理、自然繁殖和親子育幼行為。為了維持有遺傳生存力的遷地種群以支持野外種群，遺傳管理是最有效的方法。為達(dá)到500只的種群目標(biāo)，需在現(xiàn)有396只的基礎(chǔ)上增加104只個體(見圖1)。圖1:2000至2014年遷地大熊貓種群增長情況。2015GeneticManagement數(shù)據(jù)分析和譜系假設(shè)數(shù)據(jù)來源于中國動物園協(xié)會謝鐘女士編輯的2014年11月11日版國際大熊貓譜系，使用的軟件是ISIS單種群分析及記錄保存系統(tǒng)(SPARKS)1.66版。使用PMxv1.2軟件(由Pollak,Lacy和Ballou開發(fā))進(jìn)行了種群數(shù)量和遺傳分析。所用數(shù)據(jù)的截止日期為使用分子遺傳學(xué)分析已成功地辨別出很多親子關(guān)系，譜系中仍有48只熊貓父本不清，很多是2006年至2014年出生的(列在附錄B中)。這50只親子關(guān)系不明的熊貓導(dǎo)致現(xiàn)有遺傳庫的9%信息不確定。的親子關(guān)系基礎(chǔ)上對所有不確定父本計算親緣值(方法參見Lacyetal.2011)。確的親子鑒定不僅會影響種群的遺傳數(shù)據(jù)(如遺傳多樣性、建群者數(shù)量),也會影響個體的遺傳數(shù)據(jù)(評價親緣系數(shù)、MSI值)。我們必須盡快為這48只大熊貓用分子遺傳學(xué)分析開展親子鑒定，否2015GeneticManagement種群數(shù)量概況目前遷地大熊貓種群的數(shù)量維持在396只的規(guī)模上(雄性179只，雌性216只，1只性別不明),他們在全世界72個不同的大熊貓飼養(yǎng)機構(gòu)中生活著。2014年出生34只幼仔，有10只死亡，1只放歸野外。過去幾年的繁殖使得2005至2010年間種群增長率保持在9-15%。2011年的增長率更低為5%,2012年為3%,原因大體是更加側(cè)重有遺傳價值個體的繁殖，而不是重視數(shù)量。目前的增長率是為了適應(yīng)野外放歸的需求，2014年達(dá)到7%。現(xiàn)有種群的年齡結(jié)構(gòu)很健康，預(yù)計在未來會繼續(xù)增長(見圖2)。更大比例的成年熊貓參與了繁殖，尤其是雌性(從2002年的41%到2014年的46%),對增長和有效種群大小(Ne)都有積極貢獻(xiàn)。雌性大熊貓的繁殖年齡通常在5-20歲間，而雄性大熊貓的繁殖能力可以持續(xù)到20歲之后。圈養(yǎng)大熊貓的平均代間隔為11年。每胎產(chǎn)1或2只幼仔的概率幾乎相等(有5個每胎產(chǎn)3只幼仔的)。圈養(yǎng)大熊貓的平均胎產(chǎn)仔數(shù)是1.5只。雄性大熊貓活到15歲的成活率大約為50%,25%的雄性活到23歲，只有10%的雄性活到28歲。而雌性的存活率要稍微好些，50%的雌性活到19歲，25%的雌性活到28歲，10%的個體活到34歲。這些數(shù)值也包括了對野外獲得個體的年齡所做的估算。Years圖2.2014年種群的年齡性別結(jié)構(gòu)。深藍(lán)色為繁殖年齡的個體；淺藍(lán)色是未成體(底部)或過了生育年齡的(頂部)熊貓；黃色是性別不明的個體。2015GeneticManagement遺傳概況大熊貓遷地種群主要源自54只野外獲得的大熊貓建群者(建群者指從野外獲得并成功在現(xiàn)有種群中繁殖出后代的個體)。還有10只野外獲得的熊貓尚未繁殖出成活的后代，但因為年齡和身體問題沒有被排除在外(這些個體是潛在的建群者)。理論上講，遷地種群的遺傳多樣性占野生種群遺傳多樣性的97.4%。該水平的遺傳多樣性所代表的建群者染色體等價數(shù)(FGE)為19.1。也就是說，該種群的遺傳多樣性水平與一個由19只互無血緣關(guān)系的個體建成的新種群一致。建群者的遺傳貢獻(xiàn)高度扭曲，基因庫的26%僅僅衍生自4只建群者(見圖3)。如果該種群的管理處于理想狀態(tài)之下且其他10只潛在建群者的基因能被全部融入種群的話，則該種群的遺傳多樣性水平可提升至99%。那么該種群的建群者染色體等價數(shù)(FGE)將變更為54(見表1)。通過管理使得種群的平均血緣關(guān)系最小化已被證實為保持種群遺傳多樣性的最佳方法。依據(jù)平均血緣關(guān)系進(jìn)行管理將自動把那些后代數(shù)量尚少，遺傳價值尚未得到完全體現(xiàn)的建群者的后代推薦為優(yōu)先的繁殖者，并限制過度代表的建群者繁殖。表1.2014年遷地種群遺傳概況#Founders建群者#Potentialadditionalfounders潛在新增建群者Genediversityretained保存的遺傳多樣性0.9738Potentialgenediversityretained保存的潛在遺傳多樣性0.9908Genevalue遺傳價值0.9733Foundergenomeequivalents(FGE)建群者染色體值PotentialFGE潛在的建群者染色體值Meaninbreeding平均近親交配率0.0022圖3.54只建群者對遷地種群基因庫的遺傳貢獻(xiàn)。每個柱子表示單只建群者的貢獻(xiàn)。16%的基因庫僅僅衍生自2只建群者(即最左邊的建群者：308和287號)。約50%來自僅10個建群者。2015GeneticManagement現(xiàn)有種群的近親繁殖率很低，只有5只近交系數(shù)大于4%的近親繁殖的動物。盡管現(xiàn)有種群在遺傳學(xué)上是健康的，但每個機構(gòu)內(nèi)的動物基因則較接近，且機構(gòu)內(nèi)實現(xiàn)基因不相關(guān)個體間的配對越來越困難。現(xiàn)有的20只近親繁殖的個體中，14只是近兩年(2013年和2014年)出生的。隨著圈養(yǎng)種群繁殖的增長和野外獲得個體的相對減少，近親繁殖的可能性將增加。因此未來在機構(gòu)間進(jìn)行熊貓交換就顯得非常重要，以強熊貓和精液交換，以增加有利于遺傳多樣性的繁殖機會。此過程已經(jīng)開始，2014年中國機構(gòu)間的熊貓交換達(dá)到了53只。從2010年起，繁殖重點從高速的數(shù)量增長(高數(shù)量)轉(zhuǎn)變?yōu)閺娬{(diào)遺傳管理(高質(zhì)量)。為維持健康的遷地種群，對數(shù)量增長的需求降低，對幼崽的需求減少，而更加關(guān)注MSI(交配適宜性指數(shù)一參見附錄D)分值低的配對和MK(平均親緣指數(shù))低的個體進(jìn)行繁殖，從而保存種群的遺傳多樣性。建議繁殖MSI分值等于和低于4的配對，還應(yīng)該更多強調(diào)讓未產(chǎn)生后代的10個潛在建群者(野外獲得的大熊貓)產(chǎn)生后代，以及繁殖更有遺傳價值(稀有)的族系。2012至2014年的繁殖策略均得以很好的執(zhí)行。2012和2013年產(chǎn)生幼崽的配對，其MSI分值均在1-4,其中2/3的MSI為1-3。與之對比，2014年出生的幼崽的配對中，只有40%的MSI值為1-3。持續(xù)執(zhí)行此策略，即繁殖低MSI值的配對和低MK值的個在2014年重慶技術(shù)會議上，對10個中國機構(gòu)的65只雌性個體，以及1只海外的雌性(使用中國出口的精液)做出了繁殖的具體建議(牽涉到50只不同的雄性個體)。詳最佳配對或評估配對的MSI分值。繁殖重點將放在遺傳價值寶貴的雌性(低MK值)和遺傳價值好的雄性(配對MSI值低，且/或低MK值)。幾乎所有建議參加繁殖的配對MSI值均在1-4。但是有些特例的雄性有高遺傳價值(如：潛在建群者),而其配對的機會較低，則在建議中仍然為其配對，即使最有可能成功繁殖的雌性遺傳價值中等或偏低(這樣的配對在MSI表里顯示為3f或4f)。為了改進(jìn)遺傳管理，建議有些育齡雌性不參與2015年的繁殖，通常是對種群遺傳貢獻(xiàn)低的雌性(有很多近親，是過度繁殖的建群者后代)。有的配對請注意下表是在中國境內(nèi)的熊貓的配對建議。2015年境外的熊貓將要繁殖的沒有在此表中(除了多倫多),且在附錄C2015GeneticManagement表2.2015年技術(shù)年會為中國境內(nèi)熊貓所做的繁殖建議名字地點年齡親緣指數(shù)建議與之繁殖的雄性CHENGDU成都動物園390,532,573,831CHENPANDA基地386,510,520EryatouCHENPANDA基地520,532,540,573,574,614CHENPANDA基地386,520,624,649CHENPANDA基地377,532,540,574,584YuanyuanCHENPANDA基地377,390,532CHENPANDA基地532,614,649CHENPANDA基地9377,390,520,831XiaoyatouCHENPANDA基地8386,520,540,584CHENPANDA基地8377,390,520,624CHENPANDA基地8532,573,574,649MengMengCHENPANDA基地8342,386,520,532,540,573,574,584,614,624,627,628,649,711,718,724,726,731,738,788,792,793,831AibingCHENPANDA基地7377,584,624,649,831XiangBingCHENPANDA基地7386,390,624,831CHENPANDA基地7377,390,532,624,831CHENPANDA基地7377,390,520,532,624,831CHENPANDA基地7377,386,390,532,573,614,624NiNiCHENPANDA基地6377,390,520,532,649MeiBingCHENPANDA基地6377,532,584CHENPANDA基地5386,532,624BeiChuanCHENPANDA基地80342,624,831YalaoerCHONGQING重慶488,502,503,563,579,586,623,661,674,689,719CHONGQING重慶488,502,503,563,579,586,623,661,674,689,719CHONGQING重慶8488,502,503,563,579,586,623,661,YingYingDJYGPBC都江堰繁育中心488,502,563,586,674,719,748,752MeiXiDJYGPBC都江堰繁育中心8488,542,579,623,661,719,743DJYGPBC都江堰繁育中心0542,579,623,661DJYGPBC都江堰繁育中心5488,502,503,542,579,623,661,719DJYGPBC都江堰繁育中心4488,502,542,563,579,586,689,719,WenLiGUANGZHOU廣州5386,390,520,532,540GUANGZHOU廣州5386,390,520,532,540YalaodaLOUGUANTA樓觀臺377,460,540,574,703LOUGUANTA樓觀臺520,532,540,573,574,614,649,738LOUGUANTA樓觀臺460,520,703LOUGUANTA樓觀臺9377,703,713,715ChengchengLOUGUANTA樓觀臺80377,624,703DabaoLOUGUANTA樓觀臺80377,624,703FengFengLOUGUANTA樓觀臺5703,713,7152015GeneticManagement雌名字地點年齡MK平圪親緣指數(shù)with建議與之繁殖的雄性LOUGUANTA樓觀臺5377,703,715MeiQingPANYU番禺613,744,747,751PANYU番禺9455,744,747,751PANYU番禺5455,613,744,747MinMinSHANGHAI上海6502,542,579,623,661,689,719,743WOLONG臥龍503,542,579,623,661,674WOLONG臥龍502,503,579,623,661WOLONG臥龍8488,502,563,579,586,623,661,689YAANBC雅安502,503,563,579,586,623,661,674,YAANBC雅安488,502,503,563,586,674,689,719,743,748,752YAANBC雅安502,503,579,623,661YAANBC雅安502,503,579,623,661YAANBC雅安488,502,623,661,674,719,748,752HaiziYAANBC雅安542,579,623,661,752YingHuaYAANBC雅安488,502,503,563,579,586,623,661,674,689YAANBC雅安502,503,579,623,661YAANBC雅安488,502,503,674,719,743YAANBC雅安8502,503,563,586,674,719YAANBC雅安8488,502,503,674,689,719,748,752YAANBC雅安7502,579,623,661,719,743WenYuYAANBC雅安7502,563,623,661,674,719XinNierYAANBC雅安7488,503,563,586,719,743,748,752WangJiaYAANBC雅安70542,579,623,661,674YAANBC雅安5488,503,719,743,748,752YAANBC雅安5488,502,563,586,674,689,743YaoManYAANBC雅安5488,502,719,743,748YAANBC雅安50542,579,623,661,719TORONTO多倫多7532,573,574.614(叢成都基地進(jìn)口精液)2015GeneticManagement附錄A:為分析而做出的繁殖種群假設(shè)數(shù)據(jù)來源于中國動物園協(xié)會謝鐘女士編輯的2014年11月11日版國際大熊貓譜系，使用的軟件是ISIS單種群分析及記錄保存系統(tǒng)(SPARKS)v1.66版。且使用(SPARKS)量和遺傳分析。對1990年1月1日至2014年11月11日期間的圈養(yǎng)大熊貓種群進(jìn)行今年沒有對28只年老、有慢性病、或計劃放歸的大熊貓個體進(jìn)行遺傳分析。見下表。種群有遺傳貢獻(xiàn)。此種群遺傳分析包括368只熊貓。譜系號地點性別Age年齡ABERDEHK香港F雌~36Tooold太老CHONGQING重慶F雌~32Tooold太老FUCHOW福州F雌~34Tooold太老CHENGDU成都動物園F雌Tooold太老DJYGPBC都江堰繁育中心M雄~29Tooold太老CHENPANDA基地F雌~31Tooold太老CHENPANDA基地F雌Tooold太老BEIJING北京F雌Tooold太老MEXICOCTY墨西哥城F雌Tooold太老MEXICOCTY墨西哥城F雌Tooold太老CHENGDU成都動物園F雌Tooold太老SHANGHAI上海F雌~31Tooold太老FUCHOW福州F雌~25Tooold太老404GUILIN桂林F雌Poorhealth體衰418DJYGPBC都江堰繁育中心F雌~26Tooold太老444LOUGUANTA樓觀臺F雌~26Tooold太老LOUGUANTA樓觀臺F雌~29Tooold太老LINYIBG臨沂動植物園M雄Poorhealth體衰DJYGPBC都江堰繁育中心M雄~27Tooold太老DJYGPBC都江堰繁育中心M雄~25Tooold太老FUCHOW福州M雄~27Tooold太老DJYGPBC都江堰繁育中心F雌~19Tooold太老HUAYING四川廣元華耋山M雄3Scheduledforrelease計劃放歸WOLONG臥龍F雌2Scheduledforrelease計劃放歸WOLONG臥龍F雌1Scheduledforrelease計劃放歸WOLONG臥龍M雄1Scheduledforrelease計劃放歸WOLONG臥龍F雌1Scheduledforrelease計劃放歸YAANBC雅安M雄1Scheduledforrelease計劃放歸2015GeneticManagement附錄B:大熊貓個體因父本不清對遺傳測算的影響關(guān)于父權(quán)的假定為最大限度地爭取繁殖成功的機會，通常會讓圈養(yǎng)種群中雌性大熊貓先與雄性進(jìn)行自然交配，然后再用兩個或更多雄性的精液對其實施人工授精。列入譜系中的大熊貓有38-48只父本不清，它們?nèi)匀淮婊钣谑溃⑶?或產(chǎn)生了后代(見下表。父本不清但未產(chǎn)生后代就去世的個體不包括在內(nèi))。其中有許多是2006至2014年新出生的對父本不清的動物，本譜系列出了其所有潛在和可能的真實父本的雄性。確定潛在者2.當(dāng)同時使用自然交配和人工受精對雌性進(jìn)行繁殖：過去的案例中，使用遺傳分子學(xué)進(jìn)行親子鑒定的結(jié)果顯示，幾乎所有進(jìn)行自然交配的雄性都被認(rèn)定為真實父本。人工受精使用的雄性為真實父本的可能性為2%。3.在同時進(jìn)行自然交配和人工受精的案例中，所有采用同種手段的雄性均予以同等的4.所有動物的所有潛在父本的所有可能性總和為100%。5.在有的案例中，基于獲得的額外信息，在分析之前有些可能性被添加到了2013年6.在2002年首次做種群分析前出生的8只動物，雖然沒有相關(guān)交配手段的信息(是自然交配還是人工受精),但仍有一只雄性被選為其父本。對這些動物的分析采用了C:δ201(AI),Z202(AI)andZ174(NM)確定任一當(dāng)前和未來圈養(yǎng)大熊貓種群個體間的親子關(guān)系，對于準(zhǔn)確的估價每只大熊貓2015GeneticManagement系號可能的父本是否通過分子遺傳分析確認(rèn)?相關(guān)說明，及2014年譜系中的信息分析中使用的父本沒有說明是本交還是人工；譜系中標(biāo)186位父本2001年分析中排除了202的可能性whichNMorAl.1991年說明里寫可能是174,201,或202;譜系中寫的174,沒有標(biāo)是本交還是人工由于是本交，2011年說明使用了174;2014年譜系里寫的1741991年說明使用了201,但說也可能是這里的任何一個。且注明是首次使用冷凍精液成功的例子1991年說明里寫可能是135或109,但可能是筆誤應(yīng)該是149;譜系中149作為父本說明寫可能是150或186;譜系中186作為父本by2001analysis2001分析中父本問題未解決2013年譜系中308為父本；2014年譜系改為多父本2013年譜系里329是父本；2014年譜系改為多父本by2001analysis2001分析中父本問題未解決2013年譜系里329是父本；2014年譜系改為多父本butdisputed?2001確認(rèn)了父本但有爭議2001年分析認(rèn)為329為父本，但其雙胞胎496的父本為308;2013年譜系里329是父本；2014年譜系改為多父本1999年譜系寫的369無評論；譜系中寫的394;2014年譜系改為多父本2015GeneticManagement2001年譜系寫的308,357作為人工授精；2013譜系寫的308;2014年譜系改為多父本No否2001年譜系寫的308,357作為人工授精；2013譜系寫的308;2014年譜系改為多父本unknown)2013譜系寫的394;2014年譜系改為多父本(可能性的基礎(chǔ)未知)394(60%);308(38%);357(2%)308,394(NM);357(Al)unknown)2013譜系寫的394;2014年譜系改為多父本(可能性的基礎(chǔ)未知)394(60%);308(38%);357(2%)394listedin2014stud2014譜系寫的3942013譜系寫的399;2014年譜系改為多父本MULTin2014SB;NMwith4244x,NMwith3991x2013譜系寫的424;2014年譜系改為多父本；與424本交4次，與399本交1次424(80%);399(20%)424(49%);503(49%);467(2%)327,621(Al)BothAl兩個均為本交Al人工658(50%);697(50%)496(NM);394,454(AI)496(96%);394(2%);454(2%)Needtoverifymethods需確認(rèn)方法623,661(NM)542(50%);623(50%)579(33%);623(33%);661(33%)579(50%);623(50%’540(50%);649(50%)2015GeneticManagement488(98%);503(2%)579(50%);623(50%)661(NM);488(Al)540(50%);584(50%)2015GeneticManagement譜系號親緣指數(shù)譜系號親緣指數(shù)地點年齡0DJYGPBC都江堰繁育中心0LOUGUANTA樓觀臺0DJYGPBC都江堰繁育中心0LOUGUANTA樓觀臺80LOUGUANTA樓觀臺80CHENPANDA基地80YAANBC雅安5YAANBC雅安7YAANBC雅安YAANBC雅安0YAANBC雅安DJYGPBC都江堰繁育中心3YAANBC雅安1YAANBC雅安YAANBC雅安2DJYGPBC都江堰繁育中心2YAANBC雅安0MEMPHIS孟菲斯LOUGUANTA樓觀臺5LOUGUANTA樓觀臺0LOUGUANTA樓觀臺5HUAYING華鑒山4LOUGUANTA樓觀臺1YAANBC雅安7KOBEPARK神戶DJYGPBC都江堰繁育中心NZP-WASH華盛頓LOUGUANTA樓觀臺BEIJING北京197827181附錄C:圈養(yǎng)大熊貓種群平均親緣關(guān)系值MK排序表下列大熊貓個體是按照繁殖的遺傳價值列出的(雄性在左側(cè)，雌性在右側(cè)。性別未知來自野外的熊貓兩邊均有，為斜體字)。在頂端的個體是平均親緣值(MK)小的，因為它們的基因未被充分代表，因此也是最有價值的繁殖者。在表底是MK值高的個體，是基因在種群中被過分代表的。表中間的粗橫線是種群的MK平均值(0.0262),該橫線以上的都是基因未被充分代表的，是優(yōu)先考慮的繁殖者，能增加種群的遺傳多樣性。對2015年中國境內(nèi)圈養(yǎng)大熊貓(或精液)做出繁殖建議的標(biāo)為藍(lán)色。雄性的紅色斜體數(shù)字表示2015年建議與其配對的雌性個體數(shù)量。使用排序低的雄性(如在平均親緣表中接近底部的Males雄譜系號親緣指數(shù)地點Age年齡0DJYGPBC都江堰繁育中心0LOUGUANTA樓觀臺70LOUGUANTA樓觀臺50LOUGUANTA樓觀臺50.0004CHENPANDA基地0.0012ABERDEHK香港0.0018CHENPANDA基地0.0026YAANBC雅安0.0028YAANBC雅安00.0033YAANBC雅安80.0033YAANBC雅安10.0036YAANBC雅安0.0042YAANBC雅安10.0047YAANBC雅安04150.0050SANDIEGOZ圣地亞哥0.0075CHENPANDA基地0.0090LOUGUANTA樓觀臺50.0093LOUGUANTA樓觀臺00.0110YAANBC雅安70.0112DJYGPBC都江堰繁育中心40.0129SANJIANG三江50.0136CHENPANDA基地00.0140SHENZHEN深圳40.0140CHENPANDA基地40.0142EMEIEP峨眉仙芝竹尖生態(tài)園50.0146YAANBC雅安00.0159CHENPANDA基地60.0165YAANBC雅安0.0165DJYGPBC都江堰繁育中心90.0166CHENPANDA基地61192271113譜系號親緣指數(shù)地點年齡譜系號親緣指數(shù)地點年齡YAANBC雅安6EDINBURGH愛丁堡VIENNA維也納CHENPANDA基地6WEIFANGJ濰坊YAANBC雅安8ABERDEHK香港9YAANBC雅安ATLANTA亞特蘭大YAANBC雅安5CHIANGMAI清邁YAANBC雅安CHENPANDA基地6BEIJING北京4CHENPANDA基地CHENPANDA基地MEMPHIS孟菲斯YAANBC雅安0BEAUVAL法國6DEQING德慶9LOUGUANTA樓觀臺YAANBC雅安8SHANGHAI上海3CHENPANDA基地PANYU番禺9YAANBC雅安7LOUGUANTA樓觀臺6CHENPANDA基地4CHENPANDA基地8ATLANTA亞特蘭大1SHENZHEN深圳4ATLANTA亞特蘭大1YAANBC雅安0CHENPANDA基地LANGZHONG閬中5YAANBC雅安CHENPANDA基地CHENPANDA基地2YAANBC雅安7LOUGUANTA樓觀臺SINGAPORE新加坡7LINYIBG臨沂YICHANG宜昌9ATLANTA亞特蘭大YAANBC雅安YAANBC雅安DJYGPBC都江堰繁育中心9YAANBC雅安8CHENPANDA基地DJYGPBC都江堰繁育中心5SANDIEGOZ圣地亞哥2YAANBC雅安WAKAYAMA和歌山Y(jié)AANBC雅安5YAANBC雅安GUANGZHOU廣州5ADELAIDE阿德雷德9GUANGZHOU廣州5CHENPANDA基地6YAANBC雅安CHENPANDA基地4CHENPANDA基地7CHENPANDA基地4CHENPANDA基地7MADRIDZ馬德里1MADRIDZ馬德里NANJING南京4LOUGUANTA樓觀臺9PANYU番禺5CHENPANDA基地YAANBC雅安YAANBC雅安0LANCHOW蘭州YAANBC雅安6MADRIDZ馬德里TAIYUAN太原4YAANBC雅安0CHENPANDA基地8LIUGONGDA劉公島6YANGZHOU揚州CHANGSHA長沙4TIANMUHU天目湖6LANGZHONG閬中7NZP-WASH華盛頓1JINAN濟南4YAANBC雅安12015GeneticManagement376732譜系號親緣指數(shù)地點年齡譜系號親緣指數(shù)地點年齡0.0253VIENNA維也納10.0239CHENPANDA基地70.0253WOLONG臥龍00.0240CHENPANDA基地90.0255YAANBC雅安10.0240CHENPANDA基地80.0261YAANBC雅安0.0240YAANBC雅安70.0263CHENPANDA基地20.0240CHANGSHA長沙40.0263CHENPANDA基地20.0242CHENPANDA基地0.0264LOUGUANTA樓觀臺60.0243YAANBC雅安50.0266YAANBC雅安10.0243YAANBC雅安50.0267TAIYUAN太原40.0243JINAN濟南40.0267WOLONG臥龍00.0244YAANBC雅安90.0269CHENPANDA基地0.0244DJYGPBC都江堰繁育中心40.0269ANJIBAMB安吉0.0244YAANBC雅安00.0269XIUNING休寧70.0250CHENPANDA基地30.0269DJYGPBC都江堰繁育中心70.0251CHENPANDA基地30.0271CHENPANDA基地0.0252DJYGPBC都江堰繁育中心80.0271CHENPANDA基地90.0252SHANGHAI上海30.0271LIUZHOU柳州70.0253WOLONG臥龍80.0271DEQING德慶50.0255YAANBC雅安0.0273LINYIBG臨沂0.0255YAANBC雅安10.0273CHENPANDA基地20.0257KUALALUM吉隆坡80.0279PAIRIDAI比利時50.0258CHENPANDA基地00.0279WEIFANGJ濰坊50.0258CHENPANDA基地00.027950.0260YAANBC雅安60.0279DJYGPBC都江堰繁育中心20.0263WOLONG臥龍0.0279DJYGPBC都江堰繁育中心10.0264CHENPANDA基地50.0281FUCHOW福州0.0264YAANBC雅安10.0282DJYGPBC都江堰繁育中心0.0267CHENPANDA基地0.0282CHENPANDA基地10.0267YAANBC雅安00.0282CHENPANDA基地10.0268CHENPANDA基地20.0284DAFENG大豐0.0269YYAANBC雅安20.0285NANJING南京40.0270SHIJIAZHU石家莊80.0286CHENPANDA基地0.0271CHENPANDA基地70.0286PANYU番禺50.0271DJYGPBC都江堰繁育中心10.0287YAANBC雅安10.0272YAANBC雅安70.0287CHENPANDA基地10.0272DJYGPBC都江堰繁育中心50.0287CHENPANDA基地10.0274SINGAPORE新加坡60.0289FUCHOW福州0.0274SHANGHAI上海60.0289HEFEIW合肥野生0.0274CHENPANDA基地10.0289ANJIBAMB安吉0.0275LOUGUANTA樓觀臺10.0290EDINBURGH愛丁堡0.0279CHENPANDA基地10.0290CHENPANDA基地60.0279YAANBC雅安00.0290WAKAYAMA和歌山40.0282WOLONG臥龍0.0290DJYGPBC都江堰繁育中心20.0282TAIPEI臺北2015GeneticManagement-PaMales雄28512譜系號親緣指數(shù)地點年齡譜系號親緣指數(shù)地點年齡0.0290BEIJING北京0.0282YAANBC雅安70.0290BEIJING北京10.0283WOLONG臥龍0.0290CHENPANDA基地00.0285CHENPANDA基地60.0291CHENPANDA基地00.0286YAANBC雅安20.0293PANYU番禺50.0286DJYGPBC都江堰繁育中心20.0293CHENPANDA基地10.0290TAIHUEP太湖0.0294SHIJIAZHU石家莊0.0290CHENPANDA基地60.0294WENZHOU溫州0.0290WAKAYAMA和歌山40.0294HANGCHOW杭州30.0290WAKAYAMA和歌山20.0295DJYGPBC都江堰繁育中心0.029160.0295WUHAN武漢90.0291CHENPANDA基地00.0297CHENPANDA基地0.0293CHENPANDA基地0.0297WOLONG臥龍00.0293PANYU番禺50.0298TAIPEI臺北0.0293CHENPANDA基地10.0301XIXIAKOU西霞口90.0294CHENGDU成都動物園0.0301TIANMUHU天目湖60.0294CHENPANDA基地70.0303KUALALUM吉隆坡80.0294HANGCHOW杭州30.0306HANGZHOUW杭州野生40.0295PANYU番禺90.0307NZP-WASH華盛頓0.0295PAIRIDAI比利時50.0309CHONGQING重慶0.0297YAANBC雅安0.0310TORONTO多路多60.0297TAIHUEP太湖0.0312CHONGQING重慶0.0297TAIPEI臺北10.0312DJYGPBC都江堰繁育中心80.0300ABERDEHK香港90.0312DALIAN大連40.0300GUILIN桂林80.0318CHONGQING重慶10.0301TOKYOUENO東京90.0319WENLINGS威寧80.0301DALIAN大連40.0325CHENPANDA基地00.0302CHENPANDA基地10.0328NINGBO寧波60.0303ADELAIDE阿德雷德80.0328CHENPANDA基地20.0304CHANGSHA長沙30.0330FUCHOW福州0.0305LOUGUANTA樓觀臺0.0331CHENPANDA基地0.0305CHENPANDA基地0.0334FUCHOW福州80.0305BEIJING北京40.0338BEIJING北京0.0306PANYU番禺0.0344SHANGHAI上海0.0307CHENPANDA基地0.0344TOKYOUENO東京90.0308CHONGQING重慶0.0344CHENPANDA基地00.0308CHENPANDA基地0.0350WENZHOU溫州70.0309SHANGHAL上海30.0350DAFENG大豐70.0309SHANGHAI上海30.0362LIUZHOU柳州70.0310YAANBC雅安10.0362MACAOCMA澳門60.0311CHENPANDA基地0.0362CHENPANDA基地60.0312CHONGQING重慶0.0371LOUGUANTA樓觀臺0.0312YUNNANW云南野生80.0381PANYU番禺00.0314DALIAN大連42015GeneticManagement譜系號MK平均親緣指數(shù)地點年齡0.0381PANYU番禺00.0382ZIBOYSH淄博野生80.0389PANYU番禺10.0392XIXIAKOU西霞口90.0394CHENPANDA基地80.0394CHENPANDA基地80.0399ZIBOYSH淄博野生80.0399WUXI無錫80.0399ANJIBAMB安吉40.0399FUDETJ天津30.0408DJYGPBC都江堰繁育中心0.0442PANYU番禺0.0457BEIJING北京2譜系號親緣指數(shù)地點年齡CHONGQING重慶8TORONTO多路多7CHONGQING重慶3CHONGQING重慶1LOUGUANTA樓觀臺0VIENNA維也納PANYU番禺CHENPANDA基地2YAANBC雅安FUDETJ天津3CHENPANDA基地0WOLONG臥龍WAKAYAMA和歌山NINGBO寧波6WOLONG臥龍CHENPANDA基地CHENPANDA基地8CHIANGMAI清邁LOUGUANTA樓觀臺1CHENPANDA基地CHENPANDA基地8CHENPANDA基地3CHENPANDA基地3HANGZHOUW杭州野生9LIUGONGDA劉公島7CHENPANDA基地1CHENPANDA基地1CHENPANDA基地7YAANBC雅安WOLONG臥龍CHENPANDA基地7PANYU番禺0CHENPANDA基地5QINGDAO青島6BEAUVAL法國6ANJIBAMB安吉4CHANGSHA長沙3SANDIEGOZ圣地亞哥附錄D:2015年繁殖季大熊貓配對MSI值(2014年11月重慶會議發(fā)布)盡管重慶會議上為雌性個體指定了雄性配對，現(xiàn)實中總是有殖。在這種情況下，我們提供了完整的MSI表。這樣所有機構(gòu)在指定雄性不可得的情●沒必要試圖讓所有雌性參與繁殖。應(yīng)側(cè)重有遺傳價值的雌性，為遷地種群產(chǎn)生幼●MSI值在1-3的配對應(yīng)優(yōu)先考慮，尤其是有多種選擇的機構(gòu)，這將增強遺傳多樣此要選擇MK值低于0.0262的繁殖以保存遺傳多樣性。MSI表上每只雌性和雄性●潛在的建群著或其它有高遺傳價值的熊貓都應(yīng)該盡可能地與其它高價值的個體進(jìn)低價值的(MSI>4)配對。為了標(biāo)注出這些個案，潛在建群者的配對MSI高于3的都被改為了3f(如能增加遺傳多樣性),或4f(如對遺傳多樣性的改變GD≤0)。里是它們配對的MSI分值。每個動物的MK分值在其譜系號后面。根據(jù)百分比數(shù)值將MK標(biāo)成不同顏色，深綠是繁殖上最有遺傳價值的動物(低MK),其次是淺綠色、黃色表示中等價值，然后是橙色，最后在MK表底部的是紅色。紅色動物是指其基因過度被代表，除非為了種群數(shù)量原因需要其幼崽(如放歸用),否則不應(yīng)繁殖。潛在2015GeneticManagementPMx軟件包括MateRx工具，是設(shè)計和開發(fā)的旨在創(chuàng)立一種指導(dǎo)種群遺傳管理決策的(或MSI),其數(shù)值是通過雌雄親本的平均親緣關(guān)系值、雌雄親本平均親緣關(guān)系的差值分為有利(分值=1、2或3)或有害(分值=4、5、MSI值如果為4、5或6預(yù)示著至少會有1方面產(chǎn)生不良的影響。MSI值的含義1=非常有益的配對2=中等有益的配對3=稍有益處的配對4=稍有害處的配對5=有害的配對，僅在種群數(shù)量分析認(rèn)為必要時，才可以使用；6=非常有害的配對(只有在種群數(shù)量的重要性高于遺傳多樣性時才可以使用?；蛘哌@是高遺傳價值個體繁殖的唯一最佳可能)。注：如配對中的一個動物是潛在建群者(野外獲得，沒有存活的子孫或后代),即優(yōu)低遺傳價值的而不繁殖它們(MSI太高)。修改后MSI=3f意味著未來對遺傳多樣性特的種群歷史和種群結(jié)構(gòu)，需要訓(xùn)練有素的種群生物學(xué)家予以種群可能有類似的特征，如建群者少、已在圈養(yǎng)條件下繁殖多量極少、或者種群中的多個個體來源或出身不明等，以致于一般性管●MSI值(以及MK值)軟件得到的結(jié)果時效性很強：MSI的等級分類也只在種群未發(fā)生實質(zhì)性變化時才有效。本MSI表的數(shù)據(jù)一年后應(yīng)被認(rèn)定無效。2015GeneticManagement0.0310.0190.0160.0240.0664446646LELEABERDEHK444222442434WANGWANGADELAIDE4423343324XIAOJIAOANJIBAMB445-44543424QINGZAlANJIBAMB445344543446ZHENHAOANJIBAMB44444-446450.018YANGYANGATLANTA4442-442140.021YUANZIBEAUVAL3344444423440.046DADIBEIJING5556665566450.034GUGUBEIJING554444444440.0290.0290.025MENGDABEIJING444333443444MENGERBEIJING444333443444444444444340.00gXIAOPINGPINGCHENPANDA6664446643460.0210.022KEBICHENPANDA33422243234BINGDIANCHENPANDA445-445433240.027FUFUCHENPANDA4443334434240.030XIONGBINGCHENPANDA44544454444-0.027LONGBINGCHENPANDA445444544440.029QIUBINGCHENPANDA44544454444 0.033YONGYONGCHENPANDA4444444444440.027XINGBINGCHENPANDA44544454444-0.002QIAOQIAOCHENPANDA6664446644460.039LESHANCHENPANDA44444-446450.039LESHUICHENPANDA44444446450.021MEILANCHENPANDA444-4423440.016GONGZICHENPANDA44633342144SHUYUNCHENPANDA44444-444440.017YINGYINGCHENPANDA4463226421440.024YALINCHENPANDA44424444334YINGYINGABERDEHKADELAIDEANJIBAMBLUNLUNMEILUNMEIHUANHUANHUANATLANTAATLANTAATLANTABEAUVALDABAITUBEIJINGXIAOBAITUBEIJINGBEIJINGCHANGSHACHANGSHA33443234444544454444-446444642144444444443344444444443344AOLIAOCHENPANDA444344443444SIYICHENPANDA4444444444450.0260.0290.0290.0280.028444333443444444333443444444333443444444333443444444333443444444333443444YAERCHENPANDA444444444444XINGYUANCHENPANDA444444444445CHENGJIUCHENPANDA446333642144MAODACHENPANDA44546654444445444544446ZHENDUOCHENPANDA44444-44445CHUANGCHUANGCHIANGMAI346222642334LINGLINGCHONGQING444444464644444444464444LONGSHENGDAFENG444333443444OINGFENGDAFENG454445544440.0314444444444440.027444333446444XIMENGDJYGPBC555444564644PENGPENGDJYGPBC444333443444DAILIDJYGPBC2015BreedingSeasonMalesVMKName444333444444444444443324446333642234TAOTAODJYGPBC444444444444HUAAODJYGPBC4333443424444222443324AOAODJYGPBC4463336462444-4333444444HANHANDJYGPBC-433344344443334434444443334434444463336441340.0284333443444445344543446LONGLONGFEIFUCHOW6443334434443FUCHOW55444444444JIAOXIAOFUCHOW44-44-444440.040QIAOQIAOFUDETJ44444446450.0294443334444440.0314444334444440.0290.030445344543446FUWAKUALALUM-4333444444LANZILANCHOW4454445433444443334434240.022444222443324DIDILINYIBG444333443444NINGNINGLIUGONGDA53335433240.02744544454444-44444444440.0213442224423242015BreedingSeason5554445544444442224423244443444434440.009446444643244446444643244KAIKAIMACAOCMA44444444440.0250.024445-44543324XINGBAOMADRIDZ4444444433443342224424234443334463244443334444440.033YOUYOUNINGBO444444544440.031TIANTIANNZP-WASH444334444440.028XINGHUIPAIRIDAI43334434440.044LINLINPANYU55666-56645YOUYOUPANYU4442224424240.0290.0240.029YINKEPANYU-4333443444XIANGLUPANYU-44444434244443334444440.03944444-546440.038JUXIAO-2PANYU44444-54644JUXIAO-3PANYU44444546446664446643460.024XIAOLIWUSANDIEGOZ4442224433244463336441440.0344454445644444442224463242015BreedingSeasonYINGYINGABERDEHKADELAIDEANJIBAMBLUNLUNMEILUNMEIHUANHUANHUANDABAITUXIAOBAITU0YAYUNJUNJUNATLANTAATLANTAATLANTABEAUVALBEIJINGBEIJINGBEIJINGCHANGSHACHANGSHA44444442344464446421444453445444444222446324TUANTUANTAIPEI4443334444444443334444244333444444BILITOKYOUENO445444564444AMAOTORONTO44544454444-444333443424LONGHUIVIENNA446222642134444333443424444233443244544454444-0.018RONGRONGWEIFANGJ44222442234XINGRUIWEIFANGJ-4333443444HUANHUANWENLINGS4444444444YAGUANGWENZHOU4453445444-JIYOUWENZHOU44444444440.0270.0250.0300.030NANA-1WOLONG444333444424FEIFEI-WOLONG444333446324444333444444444333444444WUYIWUXI44444-446454333443424XIANZIXIXIAKOU4433344444JINGJINGXIXIAKOU5444454644YUANYUANYAANBC44422244-3240.017WUGANGYAANBC446333641340.026-43334433242015BreedingSeasonMSIGiantPandas50.0310.0190.0160.02400MEISHENGYAANBC444233443324666444664446444333443324BAIYANGYAANBC666444664-46666444664446446333646244444222446324ANANYAANBC446322642434HUAHUYAANBC666444664646HUABAOYAANBC-443334444444333444324HUAYANGYAANBC666444664446GONGGONGYAANBC4333444424444222444324444333444324666444664446WANGJIA-YAANBC6664446644464463336422344422244432444444-4464544444-446442015BreedingSeasonMSIGiantPandas6Females>MKNameMalesVMKNameLocationCHANGSHACHENGDUCHENPANDAERYATOUCHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENPANDA446664LELEABERDEHK442224443WANGWANGADELAIDE433242442XIAOJIAOANJIBAMB5-33--4--3QINGZAlANJIBAMB5--3-4--4ZHENHAOANJIBAMB544454--4YANGYANGATLANTA4-42434440.021YUANZIBEAUVAL43224434440.046DADIBEIJING55666545560.034GUGUBEIJING44444444440.0290.0290.025MENGDABEIJING443334444MENGERBEIJING443334 444ERXICHANGSHA444-4444440.00gXIAOPINGPINGCHENPANDA644 4646640.0210.022KEBICHENPANDA432224344 BINGDIANCHENPANDA522-3--20.027FUFUCHENPANDA44333444430.030XIONGBINGCHENPANDA5433444--40.027LONGBINGCHENPANDA5433444-40.029QIUBINGCHENPANDA5433444--40.033YONGYONGCHENPANDA444444 4440.027XINGBINGCHENPANDA5433444--40.002QIAOQIAOCHENPANDA66444666640.039LESHANCHENPANDA544454-40.039544454一40.021MEILANCHENPANDA4444-434440.016GONGZICHENPANDA64434444SHUYUNCHENPANDA44444-4440.017YINGYINGCHENPANDA644343440.024YALINCHENPANDA4-42424442015BreedingSeason0.0270.0340.033MalesVMKNameLocationCHANGSHACHENGDUCHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENPANDACHENP4444YONGBINGCHENPANDA543344--4YUANLINCHENPANDA642-4444DEDECHENPANDA44444244ABAOCHENPANDA44444244AOLIAOCHENPANDA44-434-444SIYICHENPANDA444445-6-40.0260.0290.029CHENGSHUANGCHENPANDA444434444-CHENGDU