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文檔簡介
ICS11.020
C62
DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3762.3—2020
新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范
第3部分:核酸熒光PCR檢測程序
TechnicalspecificationsforSARS-CoV-2detection
Part3:Real-timefluorescencePCRtestprocedure
2020-03-02發(fā)布2020-03-03實(shí)施
江蘇省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T3762.3—2020
新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序
1范圍
本部分規(guī)定了新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室核酸熒光PCR檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗材、試劑與材料、樣
本前處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增、結(jié)果判定。
本部分適用于新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室核酸熒光PCR檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法原衛(wèi)生部辦公廳
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則原衛(wèi)生部檢驗(yàn)中心
新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南國家衛(wèi)生健康委
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件
3.1
熒光PCRreal-timefluorescencePCR
一種新型定量試驗(yàn)技術(shù),通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)
時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過程,結(jié)合相應(yīng)的軟件對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,計(jì)算待測樣本模板的初始濃度,用于鑒別病原
微生物。
4環(huán)境與設(shè)施
4.1實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)及級(jí)別要求
應(yīng)按照《新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南》的要求,未經(jīng)培養(yǎng)的感染性材料的操作在采用可靠的
方法滅活前進(jìn)行核酸提取及臨床樣本的滅活等操作,應(yīng)在生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-2)進(jìn)行,同時(shí)采
用生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-3)的個(gè)人防護(hù);感染性材料或活病毒在采用可靠的方法滅活后進(jìn)行的核
酸檢測操作應(yīng)在BSL-2進(jìn)行。核酸擴(kuò)增應(yīng)在基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,臨床檢測機(jī)構(gòu)基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室應(yīng)滿足
GB19489、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則》相
關(guān)要求。
4.2操作人員資質(zhì)及防護(hù)要求
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DB32/T3762.3—2020
實(shí)驗(yàn)操作人員應(yīng)經(jīng)過生物安全培訓(xùn)并取得上崗證,在身體健康狀態(tài)良好的情況下準(zhǔn)入。操作人員按
BSL-3級(jí)實(shí)驗(yàn)室個(gè)人防護(hù)的要求進(jìn)行防護(hù),需配備N95及以上級(jí)別防護(hù)口罩、醫(yī)用無紡布帽、護(hù)目鏡或
防護(hù)面屏、連體防護(hù)服、一次性手術(shù)衣、一次性PE手套、乳膠手套、鞋套、防水靴套等防護(hù)裝備。
5設(shè)備與耗材
5.1設(shè)備
生物安全柜、離心機(jī)、渦旋振蕩器、水浴或金屬浴、核酸提取儀、熒光定量PCR儀。
5.2耗材
N95及以上防護(hù)口罩、醫(yī)用無紡布帽、護(hù)目鏡、連體防護(hù)服、一次性PE手套、一次性手術(shù)衣、乳膠
手套、防水靴套、微量移液器及各種配套帶濾芯Tip頭、1.5mLEP管、凍存管、凍存盒。
6試劑與材料
6.1試劑
核酸提取試劑盒、新型冠狀病毒熒光PCR檢測試劑盒。
6.2材料
消毒劑:75%乙醇;有效氯5500mg/L的消毒液(需每天新鮮配制);生理鹽水或磷酸鹽緩沖液
(PH=7.4);4%NaOH或含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液或0.1%二硫蘇糖醇的磷酸鹽緩沖液。
7樣本前處理與核酸提取
7.1樣本前處理
7.1.1進(jìn)入BSL-2實(shí)驗(yàn)室,需由兩人同時(shí)操作。
7.1.2在生安柜內(nèi)打開第二層包裝,取出待檢樣本,核對(duì)送檢單,若管壁外有不明液體,應(yīng)用含氯消
毒液擦拭。
7.1.3樣本滅活:56℃水浴或金屬浴滅活30min。
7.1.4特殊樣本處理:痰液樣本:加入檢測等體積4%NaOH或含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液或0.1%
二硫蘇糖醇的磷酸鹽緩沖液室溫放置15min~20min液化痰液;糞便樣本:以生理鹽水或磷酸鹽緩沖液
制備10%的便懸液,輕輕吹吸3~5次,靜止10min,8000rpm離心5min,在生物安全柜中取上清
進(jìn)行下一步試驗(yàn)。
7.1.5將樣本混勻后分裝于2mL帶螺旋蓋內(nèi)有墊圈凍存管。在凍存管上標(biāo)記,注明姓名、樣本類型、
日期等。吸取部分樣本進(jìn)行核酸提取。所有凍存管旋緊管蓋后需用封口膜密封。
7.2核酸提取
7.2.1核酸提取按照核酸提取試劑盒或核酸提取儀操作說明進(jìn)行。
7.2.2取出提取好的核酸,轉(zhuǎn)入1.5mLEP管,注明姓名、樣本類型、日期等。
7.2.3將核酸管放入核酸轉(zhuǎn)運(yùn)盒,連同樣本轉(zhuǎn)運(yùn)盒進(jìn)行盒內(nèi)外消毒后轉(zhuǎn)出生安柜。
2
DB32/T3762.3—2020
7.2.4實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,生安柜內(nèi)清場:使用后的核酸提取條/板放入垃圾袋,包扎垃圾袋,含氯消毒液噴
灑消毒外表面,將一次性軟吸收墊噴灑含氯消毒液后折疊。手消毒后將垃圾袋和一次性軟吸收墊一起帶
出生安柜放入核心區(qū)中號(hào)垃圾袋。試管架,試驗(yàn)臺(tái)面、移液器等噴灑含氯消毒液消毒30min后用清水
擦拭。關(guān)閉生安柜,紫外燈消毒30min。
7.2.4.1消毒一次性手術(shù)衣、脫一次性手術(shù)衣放入中號(hào)垃圾袋,包扎垃圾袋。消毒垃圾袋外表面、核
酸和樣本轉(zhuǎn)運(yùn)盒。退出核心區(qū),將中號(hào)垃圾袋放入緩沖區(qū)大號(hào)垃圾袋內(nèi)。
7.2.4.2每日固定時(shí)間對(duì)核心區(qū)進(jìn)行過氧化氫終末消毒,消毒前應(yīng)以塑料袋覆蓋機(jī)器如核酸提取儀、
離心機(jī)等,記錄終末消毒記錄。
7.2.4.3在緩沖區(qū)按合理程序脫卸個(gè)人防護(hù)用品。脫內(nèi)層手套前開啟核心間紫外燈消毒30min。
7.2.4.4出緩沖區(qū),開啟緩沖區(qū)紫外燈消毒。將垃圾袋放入高壓滅菌器中121℃,30min,并記錄。
7.2.4.5將核酸交核酸檢測人員。樣本轉(zhuǎn)入病毒樣本專用專人保管冰箱。
8擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增
8.1按所用檢測試劑盒說明書配制熒光PCR擴(kuò)增體系,至少建立2套熒光PCR擴(kuò)增體系。
8.2在生安柜內(nèi)加核酸模板,然后進(jìn)行熒光PCR擴(kuò)增。
8.3在實(shí)驗(yàn)記錄本記錄加樣位置和樣本編號(hào)。
8.4未用完核酸樣本轉(zhuǎn)入病毒樣本專用專人保管冰箱。
8.5按所用試劑盒說明書在儀器上設(shè)置擴(kuò)增參數(shù)進(jìn)行擴(kuò)增。
9結(jié)果判定
9.1閾值設(shè)定
閾值設(shè)定原則以閾值線剛好超過陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn),結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn)。
9.2質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
9.2.1樣本內(nèi)參基因要求
樣本內(nèi)參RNP基因出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線呈S型,且Ct值小于或等于35。
9.2.2一般要求
檢測結(jié)果中的陰、陽性對(duì)照均符合以下情況,如對(duì)照不成立,此次試驗(yàn)視為無效。
9.2.3陰性對(duì)照
陰性對(duì)照無擴(kuò)增曲線,或Ct值大于40。
9.2.4陽性對(duì)照
陽性對(duì)照出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線呈S型,且Ct值小于或等于30。
9.3結(jié)果判斷
9.3.1陽性判定:實(shí)驗(yàn)室確認(rèn)陽性病例需滿足以下兩個(gè)條件中的一個(gè):
3
DB32/T3762.3—2020
a)同一份樣本中新型冠狀病毒2個(gè)靶標(biāo)(ORF1ab、N)實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測結(jié)果均為陽性。
如果出現(xiàn)單個(gè)靶標(biāo)陽性的檢測結(jié)果,則需要重新采樣,重新檢測。如果仍然為單靶標(biāo)陽性,判
定為陽性。
b)兩種不同類型樣本實(shí)時(shí)熒光RT-PCR同時(shí)出現(xiàn)單靶標(biāo)陽性,或同種類型樣本兩次采樣檢測中均
出現(xiàn)單個(gè)靶標(biāo)陽性的檢測結(jié)果,可判定為陽性。
9.3.2陰性判定:在對(duì)照成立下,如果樣本檢測沒有出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,或Ct值大于40,則判定為陰性。
9.3.3不確定結(jié)果:在對(duì)照成立下,如果檢測樣本的擴(kuò)增曲線不典型,結(jié)果不確定,建議重復(fù)。如果
核酸檢測結(jié)果陰性不能排除新型冠狀病毒感染,需要排除可能產(chǎn)生假陰性的因素,包括:樣本質(zhì)量差,
比如口咽等部位的呼吸道樣本;樣本收集的過早或過晚;沒有正確的保存、運(yùn)輸和處理樣本;技術(shù)本身
存在的原因,如病毒變異、PCR抑制等。新型冠狀病毒核酸熒光PCR擴(kuò)增結(jié)果判斷。
_________________________________
4
DB32/T3762.3—2020
前言
DB32/T3762《新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范》目前分為以下部分:
——第1部分:生物樣本采集、運(yùn)輸和保存;
——第2部分:病毒分離與鑒定;
——第3部分:核酸熒光PCR檢測程序;
——第4部分:重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增程序;
——第5部分:血清IgM和IgG抗體酶聯(lián)免疫吸附檢測程序;
——第6部分:血清IgM和IgG抗體膠體金免疫層析檢測程序;
——第7部分:空氣樣本檢測與評(píng)估;
——第8部分:物體表面檢測與評(píng)估;
——第9部分:醫(yī)務(wù)人員職業(yè)暴露檢測與評(píng)估。
本部分為DB32/T3762的第3部分。
本部分按照GB/T1.1-2009給出的規(guī)則起草。
本部分由江蘇省衛(wèi)生健康委員會(huì)提出。
本部分由江蘇省衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口。
本部分起草單位:江蘇省疾病預(yù)防控制中心、南京醫(yī)科大學(xué)、蘇州第五人民醫(yī)院、蘇州大學(xué)附二院、
昆山市疾病預(yù)防控制中心。
本部分主要起草人:崔侖標(biāo)、朱寶立、朱小娟、葛以躍、程軍平、徐佳南、錢志遠(yuǎn)、羅曉明、沈歡
喜。
I
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新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序
1范圍
本部分規(guī)定了新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室核酸熒光PCR檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗材、試劑與材料、樣
本前處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增、結(jié)果判定。
本部分適用于新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室核酸熒光PCR檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法原衛(wèi)生部辦公廳
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則原衛(wèi)生部檢驗(yàn)中心
新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南國家衛(wèi)生健康委
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件
3.1
熒光PCRreal-timefluorescencePCR
一種新型定量試驗(yàn)技術(shù),通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)
時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過程,結(jié)合相應(yīng)的軟件對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,計(jì)算待測樣本模板的初始濃度,用于鑒別病原
微生物。
4環(huán)境與設(shè)施
4.1實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)及級(jí)別要求
應(yīng)按照《新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南》的要求,未經(jīng)培養(yǎng)的感染性材料的操作在采用可靠的
方法滅活前進(jìn)行核酸提取及臨床樣本的滅活等操作,應(yīng)在生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-2)進(jìn)行,同時(shí)采
用生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-3)的個(gè)人防護(hù);感染性材料或活病毒在采用可靠的方法滅活后進(jìn)行的核
酸檢測操作應(yīng)在BSL-2進(jìn)行。核酸擴(kuò)增應(yīng)在基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,臨床檢測機(jī)構(gòu)基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室應(yīng)滿足
GB19489、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則》相
關(guān)要求。
4.2操作人員資質(zhì)及防護(hù)要求
1
DB32/T3762.3—2020
實(shí)驗(yàn)操作人員應(yīng)經(jīng)過生物安全培訓(xùn)并取得上崗證,在身體健康狀態(tài)良好的情況下準(zhǔn)入。操作人員按
BSL-3級(jí)實(shí)驗(yàn)室個(gè)人防護(hù)的要求進(jìn)行防護(hù),需配備N95及以上級(jí)別防護(hù)口罩、醫(yī)用無紡布帽、護(hù)目鏡或
防護(hù)面屏、連體防護(hù)服、一次性手術(shù)衣、一次性PE手套、乳膠手套、鞋套、防水靴套等防護(hù)裝備。
5設(shè)備與耗材
5.1設(shè)備
生物安全柜、離心機(jī)、渦旋振蕩器、水浴或金屬浴、核酸提取儀、熒光定量PCR儀。
5.2耗材
N95及以上防護(hù)口罩、醫(yī)用無紡布帽、護(hù)目鏡、連體防護(hù)服、一次性PE手套、一次性手術(shù)衣、乳膠
手套、防水靴套、微量移液器及各種配套帶濾芯Tip頭、1.5mLEP管、凍存管、凍存盒。
6試劑與材料
6.1試劑
核酸提取試劑盒、新型冠狀病毒熒光PCR檢測試劑盒。
6.2材料
消毒劑:75%乙醇;有效氯5500mg/L的消毒液(需每天新鮮配制);生理鹽水或磷酸鹽緩沖液
(PH=7.4);4%NaOH或含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液或0.1%二硫蘇糖醇的磷酸鹽緩沖液。
7樣本前處理與核酸提取
7.1樣本前處理
7.1.1進(jìn)入BSL-2實(shí)驗(yàn)室,需由兩人同時(shí)操作。
7.1.2在生安柜內(nèi)打開第二層包裝,取出待檢樣本,核對(duì)送檢單,若管壁外有不明液體,應(yīng)用含氯消
毒液擦拭。
7.1.3樣本滅活:56℃水浴或金屬浴滅活30min。
7.1.4特殊樣本處理:痰液樣本:加入檢測等體積4%NaOH或含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液或0.1%
二硫蘇糖醇的磷酸鹽緩沖液室溫放置15min~20min液化痰液;糞便樣本:以生理鹽水或磷酸鹽緩沖液
制備10%的便懸液,輕輕吹吸3~5次,靜止10min,8000rpm離心5min,在生物安全柜中取上清
進(jìn)行下一步試驗(yàn)。
7.1.5將樣本混勻后分裝于2mL帶螺旋蓋內(nèi)有墊圈凍存管。在凍存管上標(biāo)記,注明姓名、樣本類型、
日期等。吸取部分樣本進(jìn)行核酸提取。所有凍存管旋緊管蓋后需用封口膜密封。
7.2核酸提取
7.2.1核酸提取按照核酸提取試劑盒或核酸提取儀操作說明進(jìn)行。
7.2.2取出提取好的核酸,轉(zhuǎn)入1.5mLEP管,注明姓名、樣本類型、日期等。
7.2.3將核酸管放入核酸轉(zhuǎn)運(yùn)盒,連同樣本轉(zhuǎn)運(yùn)盒進(jìn)行盒內(nèi)外消毒后轉(zhuǎn)出生安柜。
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DB32/T3762.3—2020
7.2.4實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,生安柜內(nèi)清場:使用后的核酸提取條/板放入垃圾袋,包扎垃圾袋,含氯消毒液噴
灑消毒外表面,將一次性軟吸收墊噴灑含氯消毒液后折疊。手消毒后將垃圾袋和一次性軟吸收墊一起帶
出生安柜放入核心區(qū)中號(hào)垃圾袋。試管架,試驗(yàn)臺(tái)面、移液器等噴灑含氯消毒液消毒30min后用清水
擦拭。關(guān)閉生安柜,紫外燈消毒30min。
7.2.4.1消毒一次性手術(shù)衣、脫一次性手術(shù)衣放入中號(hào)垃圾袋,包扎垃圾袋。消毒垃圾袋外表面、核
酸和樣本轉(zhuǎn)運(yùn)盒。退出核心區(qū),將中號(hào)垃圾袋放入緩沖區(qū)大號(hào)垃圾袋內(nèi)。
7.2.4.2每日固定時(shí)間對(duì)核心區(qū)進(jìn)行過氧化氫終末消毒,消毒前應(yīng)以塑料袋覆蓋機(jī)器如核酸提取儀、
離心機(jī)等,記錄終末消毒記錄。
7.2.4.3在緩沖區(qū)按合理程序脫卸個(gè)人防護(hù)用品。脫內(nèi)層手套前開啟核心間紫外燈消毒30min。
7.2.4.4出緩沖區(qū),開啟緩沖區(qū)紫外燈消毒。將垃圾袋放入高壓滅菌器中121℃,30min,并記錄。
7.2.4.5將核酸交核酸檢測人員。樣本轉(zhuǎn)入病毒樣本專用專人保管冰箱。
8擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增
8.1按所用檢測試劑盒說明書配制熒光PCR擴(kuò)增體系,至少建立2套熒光PCR擴(kuò)增體系。
8.2在生安柜內(nèi)加核酸模板,然后進(jìn)行熒光PCR擴(kuò)增。
8.3在實(shí)驗(yàn)記錄本記錄加樣位置和樣本編號(hào)。
8.4未用完核酸樣本轉(zhuǎn)入病毒樣本專用專人保管冰箱。
8.5按所用試劑盒說明書在儀器上設(shè)置擴(kuò)增參數(shù)進(jìn)行擴(kuò)增。
9結(jié)果判定
9.1閾值設(shè)定
閾值設(shè)定原則以閾值線剛好超過陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn),結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn)。
9.2質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
9.2.1樣本內(nèi)參基因要求
樣本內(nèi)參RNP基因出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線呈S型,且Ct值小
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