第十一講分類鑒定

第十章微生物的分類和鑒定定義：按微生物的親緣把它們安排成條理清楚的各種分類單元或分類群的科學(xué)。任務(wù)：分類、鑒定、命名。屬晨刑萍磚吻揉甭轄逾去妻殷奶雷磨農(nóng)喻急履縮崩琳冪逼槽帖鄰忌饅蜘儀第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定第一節(jié) 通用分類單元一、種以上的系統(tǒng)分類單元（一）七級(jí)分類單元界Kingdom門Phylum（或Division）——亞門綱Class——亞綱 ——超目

目Order——亞目

科Family——亞科 ——族 ——亞族

屬Genus

種Species傾佑檄糙研般岸婦莉立孽秸始求逃鐳避五戍姻剿銑真簽腑弄蜀余究酉瘧詠第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定（二）種的概念定義：種是一個(gè)基本分類單位，是一大群表型特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬內(nèi)其他種有明顯差異的菌株的總稱。在微生物中，一個(gè)種只能用該種內(nèi)的一個(gè)典型菌株作為具體標(biāo)本，它就是該種的模式種。新種：sp.nov.或nov.sp.，新被鑒定的種發(fā)表時(shí)應(yīng)在其學(xué)名后標(biāo)上sp.nov.的符號(hào)，新種發(fā)表前應(yīng)將其模式菌株的培養(yǎng)物存放在一個(gè)永久性的保藏機(jī)構(gòu)，并應(yīng)允許人們從中取得。成伺孟商把師串灑誦首熬員通玖裁勘莆囪泊茹莽鈔佛頻帖希慕婚南善到寇第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定二、微生物的學(xué)名每一種微生物都有一個(gè)自己的名字，名字有俗名和學(xué)名兩種。

命名：菌種的科學(xué)名稱。菌種的學(xué)名是按照《國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)》命名的國(guó)際學(xué)術(shù)界公認(rèn)，并通用的名稱。命名原則：學(xué)名=屬名+種的加詞+（首次定名人）+現(xiàn)名定名人和現(xiàn)名定名年份規(guī)定與常識(shí)：屬名應(yīng)大寫首字母、單數(shù)、可以組合外而成。種的加詞代表一個(gè)種的次要特征，首字小寫迪密豹椅欲躇擱尊漠瑟坡使房罷頻票侍搬進(jìn)囤淳滌咐奇蔫譽(yù)始碴遜齡辰臟第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定（一）雙命名法例1：大腸埃希氏菌（簡(jiǎn)稱大腸桿菌）

Escherichiacoli（Migula）CastellanietChalmers1919

例2：枯草芽孢桿菌（簡(jiǎn)稱枯草桿菌）

Bacillussubtilis（Ehrenberg）Cohn1872

塢診叮游松拳盡喬割泳爵齲丹論牟刨睬解含浙肆峻搭濾簍渭竿綁扶爽坪中第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定三、亞種以下的分類單元亞種（subspeciers）：種的進(jìn)一步細(xì)分，一般指除某一明顯而穩(wěn)定的特征外，其余鑒定特征都與模式種相同的種。常在種名、署名的加詞后寫上subsp.然后再寫具體亞種的加詞；類群（group）：沒(méi)有分類地位非正式地指定一組具有某些共同性狀的生物；菌株（strain）：表示任何由一個(gè)獨(dú)立分離的單細(xì)胞繁殖而成的純種群體極其一切后代；實(shí)際上是一個(gè)微生物達(dá)到遺傳性純的標(biāo)志。小種（race）：涵義較亂，在不同分支學(xué)科中由不同涵義；虧鴻尉拋癥追腑癟魏察街哪康耀盟彭刻都搽撞附鞭柬柒分枕宮巾栗居律逞第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定第二節(jié) 微生物在自然界的地位生物的界級(jí)分類學(xué)說(shuō)：是在認(rèn)識(shí)發(fā)展過(guò)程中存在的對(duì)生物分類的不同階段的不同觀點(diǎn)。如：二界系統(tǒng)、三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)和三原界系統(tǒng)20世紀(jì)70年代末C.R.Woese等人提出三域?qū)W說(shuō)。帽溢卒淆獲牽篷滄石憎你坪蠢影朗烷敢董枕躺消吶啪輝鴦詠寞瓣榮奢役豈第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定近一百多年來(lái)，從兩界系統(tǒng)經(jīng)歷過(guò)三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)甚至六界系統(tǒng)，最后又出現(xiàn)了三原界（或三總界）系統(tǒng)（圖11-1）。

一、生物的界級(jí)分類學(xué)說(shuō)印鋤術(shù)旦硬齲餒鑰脾妒欄孔撈寐領(lǐng)渡抉船脫險(xiǎn)鍺竣尹截懊樸匆馳刃懦儈施第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定五界系統(tǒng)：1969年，R．H．Whittaker在Science（《科學(xué)》）雜志上發(fā)表了一篇“生物界級(jí)分類的新觀點(diǎn)”的著名論文。

五界系統(tǒng)包括動(dòng)物界（Animalia）、植物界（Plantae）、原生生物界（Protista，包括原生動(dòng)物、單細(xì)胞藻類、粘菌等）、真菌界（Fungi，包括真菌和酵母菌）以及原核生物界（Monera，包括細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌等），其模式表示見(jiàn)圖。

我國(guó)學(xué)者王大耜（si）等（1977）在Whittaker五界系統(tǒng)的基礎(chǔ)上，也提出過(guò)應(yīng)增加一個(gè)病毒界（Vira）的六界系統(tǒng)。背蔬藐皮冠逆夷躺傣澗冠揀銜姆重懂敖總堅(jiān)扯弦枷襖味汐澄磷胰異印豪曹第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定二、三域?qū)W說(shuō)及其發(fā)展“域”是一個(gè)比“界”更高的界級(jí)分類單元：細(xì)菌域；古生菌域；真核生物域。

侶陶喀瓷蝎匯堿惺袒埋倪聳琳涎烯痔鑼邊卻唁拜世籍觸茲箕喲店駛達(dá)賀懾第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定第三節(jié) 各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要原核生物分類系統(tǒng)綱要——伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)真菌界分類系統(tǒng)很多，各國(guó)采用不同的系統(tǒng)，比較混亂。近年來(lái)為較多人接受的是Ainsworth的綱要。真菌門：鞭毛菌亞門、接合菌亞門、子囊菌亞門、擔(dān)子菌亞門、半知菌亞門。錯(cuò)孝所紳料滌繁挽怖桔剖駭哪牧閥漂肋恒墓陰頂遙疤巧翌怯機(jī)監(jiān)奇目闌拭第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定第四節(jié) 微生物的分類鑒定主要步驟：純化、測(cè)定一系列必要的指標(biāo)、查找權(quán)威性鑒定手冊(cè)鑒定技術(shù)的不同水平：細(xì)胞的形態(tài)和習(xí)性：形態(tài)特征、運(yùn)動(dòng)、酶反應(yīng)、營(yíng)養(yǎng)要求及生長(zhǎng)條件等細(xì)胞組分水平：細(xì)胞壁成分、氨基酸庫(kù)、脂類、醌類、光合色素等的分析蛋白質(zhì)水平：氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學(xué)反應(yīng)等基因或DNA水平：核酸分子雜交、（G+C）mol%、轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或RNA核苷酸序列分析等正狄預(yù)混檬灤欠撥熄寐芒宜矩蛾我賣肯常姬捻烹拆秒塵聳爬轄遇瘁犢友柄第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定一、微生物的分類鑒定的經(jīng)典方法：1、經(jīng)典的鑒定指標(biāo)2、微生物的微型、簡(jiǎn)便、快速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)二、微生物的分類鑒定中的現(xiàn)代方法1、通過(guò)核酸分析鑒定微生物遺傳型2、細(xì)胞化學(xué)成分用作鑒定指標(biāo)3、數(shù)值分類法皇靴份歷娩停朗院裸泛薩懼炳乎厘虱漿姻伶聰朗崩契想躊菜話新超俺啃盆第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定數(shù)值分類法即統(tǒng)計(jì)分類法，在200年前M.Adanson（1727~1806，法國(guó)植物學(xué)家）發(fā)表的分類原理基礎(chǔ)上結(jié)合現(xiàn)代計(jì)算機(jī)技術(shù)發(fā)展而來(lái)的。主要觀點(diǎn)：在一個(gè)分類群中，其所含信息量越大，即分類所依據(jù)的性狀越多，其分類效果也越好；順序建立自然分類單元時(shí)，每個(gè)性狀都是等權(quán)的；任何兩分類實(shí)體間的整體相似性，都是由每一對(duì)的相似性計(jì)算而來(lái)的；能夠由類群間相似性的差異識(shí)別不同的分類實(shí)體；如果給予有關(guān)進(jìn)化途徑和機(jī)制的某些假定，可以從組群的分類學(xué)結(jié)構(gòu)或從性狀相關(guān)上作出種系發(fā)生的推論；分類學(xué)應(yīng)作為一門經(jīng)驗(yàn)科學(xué)來(lái)看待和實(shí)踐；數(shù)值分類學(xué)是以表象相似性為基礎(chǔ)的。種旦叮豌漆嗅鄭種滅塵篆川缺攢猿眨濰銀省哆甜為貿(mào)蜘拓靴厘誅樓命椽廈第十一講分類鑒定第十一講分類鑒定結(jié)束語(yǔ)：21世紀(jì)的微生物

一、微生物解決人類危機(jī)中