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生物質(zhì)譜信號(hào)處理和質(zhì)量控制楊芃原教授復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系年8月19日廣州南方醫(yī)科大學(xué)1/26那些是有用信號(hào),那些是沒(méi)有用信號(hào)2/26(1)95%置信限時(shí)判定蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索得分大于HLPP要求下限,和(2)被判定蛋白質(zhì)可信性和檢索數(shù)據(jù)庫(kù)總?cè)萘恳约氨粰z索蛋白質(zhì)長(zhǎng)度成負(fù)相關(guān),并符合HLPP要求標(biāo)準(zhǔn),和(3)被判定蛋白質(zhì)可信性和其肽段串聯(lián)質(zhì)譜(氨基酸序列譜)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索后匹配肽段數(shù)成正相關(guān),并最少不低于HLPP要求標(biāo)準(zhǔn)--2個(gè)匹配肽段;或等同于(3)(4)被判定蛋白質(zhì)可信性和其肽段質(zhì)譜(肽譜)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索后匹配肽段數(shù)成正相關(guān),并最少不低于HLPP要求標(biāo)準(zhǔn)—99%置信限時(shí)5個(gè)匹配肽。3/26<1milcounts<1bilcounts>1bilcounts二項(xiàng)式分布珀松分布高斯分布蛋白質(zhì)/肽質(zhì)譜信號(hào)測(cè)量4/26I02σx0信號(hào)測(cè)量誤差5/26噪音分布信號(hào)分布噪音平均值A(chǔ)噪音近似值B信號(hào)和噪音完全分辨6/26噪音分布信號(hào)分布噪音平均值A(chǔ)噪音近似值B交蓋信號(hào)和噪音不完全分辨,統(tǒng)計(jì)學(xué)變得主要7/26噪音分布信號(hào)分布ABH1H0P10P01ab信號(hào)和噪音分辨定義8/26噪音分布信號(hào)分布ABH1H0P10=5%a=b95%,2s信號(hào)置信限高,置信度也高,假陽(yáng)性率低9/26噪音分布信號(hào)分布ABH1H0P10=50%95%,2s信號(hào)置信限高,置信度差,假陽(yáng)性率高10/26增加信噪比11/26蛋白質(zhì)長(zhǎng)度決定假陽(yáng)性概率Prand,氨基酸序列隨機(jī)匹配12/26反轉(zhuǎn)庫(kù)搜索降低假陽(yáng)性率13/26蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)大小而產(chǎn)生新置信限Ndb為數(shù)據(jù)庫(kù)序列數(shù)目
14/2615/26正常氨基酸序列信號(hào)16/26-[M+H]+,酸性條件-[M+Na]+,[M+K]+,鹽體系-[M+NH4]+,銨鹽緩沖體系-[M+X]+,X=溶劑或緩沖液陽(yáng)離子-[2M+H]+,高濃度時(shí)形成二聚體-[M+H+S]+,溶劑添加物17/2618/2619/26分子重排20/26當(dāng)為偶電子離子時(shí),電荷不會(huì)轉(zhuǎn)移。偶電子碎片反應(yīng)時(shí)氫會(huì)發(fā)生重排21/26b,y離子產(chǎn)生和控制22/26蛋白質(zhì)修飾23/26MyoglobinGLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG測(cè)幾個(gè)肽段序列?24
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