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文檔簡(jiǎn)介
手足口病標(biāo)本采集
及檢測(cè)技術(shù)方案1目錄1病原學(xué)5二、標(biāo)本采集注意事項(xiàng)6三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程7四、生物安全4一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸2國(guó)外流行概況3我國(guó)流行概況2病原學(xué)
手足口?。╤and,footandmonthdisease,HFMD)是由腸道病毒引起的急性傳染病,多發(fā)于10歲以下嬰幼兒,以手、足、口腔等部位皮膚黏膜的皮疹、皰疹、潰瘍?yōu)榈湫捅憩F(xiàn),個(gè)別患者可出現(xiàn)心肌炎、肺水腫、無(wú)菌性腦脊髓膜炎、腦炎等并發(fā)癥。手足口病并不是一種新發(fā)傳染病,自1957年首次報(bào)道以來(lái),曾在許多國(guó)家和地區(qū)多次流行。2006年世界衛(wèi)生組織公布該病在須申報(bào)疾病的發(fā)病率中居第四位。該病全年皆可發(fā)生,我國(guó)以夏秋季多發(fā),是可防、可治且預(yù)后較好的小兒常見(jiàn)傳染病。中華人民共和國(guó)衛(wèi)生部于2008年5月2日起,將該病列為丙類(lèi)傳染病管理。背景知識(shí)3病原學(xué)
引起手足口?。℉FMD)的病毒屬于小RNA病毒科腸道病毒屬,包括:
柯薩奇病毒
A組(CoxasckievirusA,CVA)的2、4、5、7、9、10、16型等
B組(CoxasckievirusB,CVB)的1、2、3、4、5型等;
腸道病毒71型(HumanEnterovirus71,EV71);
??刹《荆‥chovirus,ECHO)等。
背景知識(shí)4病原學(xué)其中以EV71和CVA16為主要病原。近年來(lái)我國(guó)陸續(xù)出現(xiàn)這兩種病原引起的HFMD季節(jié)性流行,局部呈強(qiáng)流行態(tài)勢(shì)。由此,HFMD的有關(guān)研究日益受到人們的重視。目前對(duì)于HFMD感染尚沒(méi)有特效的疫苗和藥物,主要采用對(duì)癥和支持治療,積極防止發(fā)生并發(fā)癥,因此加強(qiáng)疾病及病原的監(jiān)測(cè)、準(zhǔn)確處置疫情、開(kāi)展健康教育是控制的關(guān)鍵。背景知識(shí)5國(guó)外流行概況
手足口病是一種全球性傳染病,世界大部分國(guó)家和地區(qū)均有此病流行的報(bào)道。
1957年首先發(fā)生于加拿大,并于同年在新西蘭被最早加以描述和報(bào)告。
1958年加拿大初步查出CVA16病毒為本病病原。澳大利亞、美國(guó)、瑞典是最早出現(xiàn)手足口病的國(guó)家之一。
1959年英國(guó)伯明翰、美國(guó)加利福尼亞地區(qū)發(fā)生流行,并從患者皰疹液中分離出CVA16,并根據(jù)本病病變分布特點(diǎn),被正式命名為“手足口病”
。6國(guó)外流行概況
1972年EV71病毒引起的手足口病在美國(guó)被首次確認(rèn),此后EV71感染與CVA16感染交替出現(xiàn),成為手足口病的主要病原體。日本是手足口病發(fā)病較多的國(guó)家,歷史上發(fā)生過(guò)多次CVA16,EV71引起的大規(guī)模流行。7我國(guó)流行概況
1981年我國(guó)首次在上海市暴發(fā)手足口病。此后,北京、河北、天津、福建、吉林、山東、湖北、青海、廣東和河南等省市陸續(xù)出現(xiàn)該病報(bào)道。
1983年天津發(fā)生由CVA16引起的手足口病暴發(fā)流行,5~10月間發(fā)生病例7000余例,經(jīng)過(guò)兩年散發(fā)流行后,1986年出現(xiàn)了以托兒所及幼兒園為主的疫情暴發(fā)。
1995年武漢病毒研究所從手足口患兒標(biāo)本中分離到EV71。
1998年深圳市防疫站同樣分離到EV71。8我國(guó)流行概況
1998年我國(guó)臺(tái)灣地區(qū)發(fā)生EV71感染引起的手足口病和皰疹性咽峽炎流行,檢測(cè)哨點(diǎn)共報(bào)告129106例患者,重癥患者405例,死亡78例,多為五歲以下幼兒。
2000年山東省招遠(yuǎn)市手足口病暴發(fā),市人民醫(yī)院共接診患兒1698例,最小年齡5個(gè)月,最大14歲,3例合并心肌炎死亡。
2008年安徽阜陽(yáng)市發(fā)生較大規(guī)模手足口病疫情,共報(bào)告病例6606例,其中23例死亡。9一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸(二)咽拭子標(biāo)本(三)血清標(biāo)本(四)皰疹液(六)尸檢標(biāo)本(一)糞便標(biāo)本(七)腦脊液標(biāo)本(五)肛拭子標(biāo)本10(一)糞便標(biāo)本
采集病人發(fā)病3日內(nèi)的糞便標(biāo)本,用于病原檢測(cè)。糞便標(biāo)本采集量5-8g/份,采集后立即放入無(wú)菌采便管內(nèi),外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽,
4℃暫存12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室;-20℃以下低溫冷凍保藏;
長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸11(二)咽拭子標(biāo)本采集病人發(fā)病3日內(nèi)的咽拭子標(biāo)本,用于病原檢測(cè)。用專(zhuān)用采樣棉簽,適度用力拭抹咽后壁和兩側(cè)扁桃體部位,應(yīng)避免觸及舌部;迅速將棉簽放入裝有3-5ml保存液(含5%牛血清維持液或生理鹽水,推薦使用維持液)的15ml外螺旋蓋采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密封,以防干燥,外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。
4℃暫存并在12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室,-20℃以下低溫冷凍保藏,需長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸12(三)血清標(biāo)本
在手足口病流行年份中應(yīng)采集EV71和CVA16感染的手足口病患兒的雙份血清。采集急性期(發(fā)病0-7d)和恢復(fù)期(發(fā)病14-30d)雙份配對(duì)血清用于闡明和分析EV71和CVA16感染后IgG和IgM抗體的動(dòng)態(tài)變化,評(píng)價(jià)血清學(xué)抗體試劑盒的敏感性和特異性。靜脈采集3-5ml全血,置于真空無(wú)菌采血管中,自凝后,分離血清,將血清移到2ml外螺旋的血清保存管中,外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。將血清置于-20℃以下冰箱中冷凍保存。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸13(四)皰疹液
在手足口病的實(shí)驗(yàn)室診斷中,從皰疹液中分離到病毒即可確診該病毒為病因,可同時(shí)采集多個(gè)皰疹作為一份標(biāo)本。先用75%的酒精對(duì)皰疹周?chē)钠つw進(jìn)行消毒,然后用消毒針將皰疹挑破用棉簽蘸取皰疹液,迅速將棉簽放入內(nèi)裝有3-5ml保存液(含5%牛血清維持液或生理鹽水,推薦使用維持液)的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密封,采樣管外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。所采集標(biāo)本4℃暫存立即(12h內(nèi))送達(dá)實(shí)驗(yàn)室,-20℃以下低溫冷凍保藏,需長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸14(五)肛拭子標(biāo)本采集病人發(fā)病3日內(nèi)的肛拭子標(biāo)本,用于病原檢測(cè)。用專(zhuān)用采樣棉簽,從患兒肛門(mén)輕輕插入,適度用力弧型左右擦拭數(shù)下,拔出后,迅速將棉簽放入裝有3-5ml保存液(含5%牛血清細(xì)胞維持液)的15ml外螺旋的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋,并密封,以防干燥。采樣管外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸15(六)尸檢標(biāo)本采集腦、肺和腸淋巴結(jié)等重要組織標(biāo)本,每一采集部位分別使用單獨(dú)的消毒器械。每種組織應(yīng)多部位取材,每部位應(yīng)取2-3份約5-10g的組織,淋巴結(jié)2個(gè),分別置于15ml-50ml無(wú)菌的有外螺旋蓋的凍存管中,采樣管外表貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸16(七)腦脊液標(biāo)本出現(xiàn)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀的病例,可采集腦脊液標(biāo)本,進(jìn)行病毒分離或核酸檢測(cè)。采集時(shí)間為出現(xiàn)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀后3天內(nèi),采集量為1.0-2.0ml。采集后立即裝入無(wú)菌帶墊圈的凍存管中,4℃暫存立即(12h內(nèi))送達(dá)實(shí)驗(yàn)室,-20℃以下低溫冷凍保藏,需長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。但EV71感染神經(jīng)系統(tǒng)時(shí),很難在腦脊液中檢測(cè)到EV71病原。一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸17一、采集標(biāo)本的種類(lèi)、保存和運(yùn)輸臨床標(biāo)本在運(yùn)輸和貯存過(guò)程中要避免反復(fù)凍融。標(biāo)本采集后要全程冷藏或冷凍保存和運(yùn)輸,12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室。依照《人間傳染的病原微生物名錄》,腸道病毒或潛在含有腸道病毒的標(biāo)本按B類(lèi)包裝,置于冷藏保存盒內(nèi)運(yùn)輸,盡量縮短運(yùn)輸時(shí)間??刹捎藐懧坊蚝娇盏榷喾N運(yùn)輸方式,但在運(yùn)輸過(guò)程中應(yīng)采取保護(hù)措施,避免強(qiáng)烈震動(dòng)、重力擠壓等現(xiàn)象。在送到省、地、市級(jí)CDC實(shí)驗(yàn)室時(shí),包裝盒內(nèi)應(yīng)帶冰且包裝完整。在上送標(biāo)本的同時(shí),需附帶相關(guān)的《手足口病病例臨床標(biāo)本采樣登記表》。18標(biāo)本種類(lèi)采集方法保存運(yùn)輸糞便發(fā)病3日內(nèi)的糞便,5-8g/份,立即放入無(wú)菌采便管內(nèi),貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。4℃暫存12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室;-20℃以下低溫冷凍保藏;長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。避免反復(fù)凍融。全程冷藏或冷凍保存和運(yùn)輸,12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室。按B類(lèi)包裝,盡量縮短運(yùn)輸時(shí)間??刹捎藐懧坊蚝娇盏榷喾N運(yùn)輸方式,在運(yùn)輸過(guò)程中應(yīng)采取保護(hù)措施。咽拭子發(fā)病3日內(nèi)的咽拭子,專(zhuān)用采樣棉簽,拭抹咽后壁和兩側(cè)扁桃體部位,避免觸及舌部;迅速將棉簽放入裝有3-5ml保存液的15ml外螺旋蓋采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密封,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。血清采集急性期(發(fā)病0-7d)和恢復(fù)期(發(fā)病14-30d)雙份配對(duì)血清。靜脈采集3-5ml全血,置于真空無(wú)菌采血管中,自凝后,分離血清,將血清移到2ml外螺旋的血清保存管中,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。-20℃以下冰箱中冷凍保存。皰疹液用75%的酒精對(duì)皰疹周?chē)钠つw進(jìn)行消毒,然后用消毒針將皰疹挑破用棉簽蘸取皰疹液,迅速將棉簽放入內(nèi)裝有3-5ml保存液(含5%牛血清維持液或生理鹽水,推薦使用維持液)的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密封,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。4℃暫存12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室;-20℃以下低溫冷凍保藏;長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。19標(biāo)本種類(lèi)采集方法保存運(yùn)輸肛拭子發(fā)病3日內(nèi)的肛拭子,用專(zhuān)用采樣棉簽,從患兒肛門(mén)輕輕插入,適度用力弧型左右擦拭數(shù)下,拔出后,迅速將棉簽放入裝有3-5ml保存液的15ml外螺旋的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。4℃暫存12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室;-20℃以下低溫冷凍保藏;長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。避免反復(fù)凍融。全程冷藏或冷凍保存和運(yùn)輸,12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室。按B類(lèi)包裝,盡量縮短運(yùn)輸時(shí)間??刹捎藐懧坊蚝娇盏榷喾N運(yùn)輸方式,在運(yùn)輸過(guò)程中應(yīng)采取保護(hù)措施。尸檢標(biāo)本腦、肺和腸淋巴結(jié)等重要組織標(biāo)本,每一采集部位分別使用單獨(dú)的消毒器械。每種組織應(yīng)多部位取材,每部位應(yīng)取2-3份約5-10g的組織,淋巴結(jié)2個(gè),分別置于15ml-50ml無(wú)菌的有外螺旋蓋的凍存管中,旋緊管蓋,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。腦脊液出現(xiàn)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀的病例,采集出現(xiàn)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀后3天內(nèi),采集量為1.0-2.0ml。采集后立即裝入無(wú)菌帶墊圈的凍存管中,旋緊管蓋,貼上帶有唯一識(shí)別號(hào)碼的標(biāo)簽。4℃暫存12小時(shí)內(nèi)送達(dá)實(shí)驗(yàn)室;-20℃以下低溫冷凍保藏;長(zhǎng)期保存的標(biāo)本存于-70℃冰箱。20二、標(biāo)本采集注意事項(xiàng)用于分子生物學(xué)診斷的標(biāo)本采集與病毒分離標(biāo)本的采集方法一樣。對(duì)于血清學(xué)診斷,急性期血清應(yīng)該在發(fā)病后盡早采集,恢復(fù)期血清在發(fā)病兩周后采集。用于采集咽拭子的無(wú)菌拭子要放在標(biāo)本保存液中,如含5%牛血清維持液。為了保證檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和有效性,標(biāo)本應(yīng)在病例發(fā)病后盡早采集,盡快檢測(cè)。不能立即檢測(cè)的標(biāo)本應(yīng)冷凍保存。
在手足口病的實(shí)驗(yàn)室診斷中,從皰疹液或腦脊液中分離到病毒即可診斷該病毒為病因。21標(biāo)本保存液的配置保存液Eagle`s液(MEM)80.5ml3%L-谷氨酰胺200mM1.0ml胎牛血清5.0ml7.5%NaHCO3溶液3.5ml青、鏈霉素(各10000U/ml)10ml22三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)(一)病毒分離23(一)病毒分離2.病毒分離細(xì)胞系3.標(biāo)本的處理4.接種和觀察(病毒分離)5.病毒分離結(jié)果解釋1.試劑配置三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程24(一)病毒分離1.試劑配置(1)細(xì)胞的生長(zhǎng)液、維持液的配制見(jiàn)下表:生長(zhǎng)液(GM)維持液(MM)Eagle`s液(MEM)86.5ml92.5ml3%L-谷氨酰胺200mM1.0ml1.0ml胎牛血清10.0ml2.0ml7.5%NaHCO3溶液2.5ml3.5ml青、鏈霉素(各10000U/ml)1.0ml1.0ml三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程25(一)病毒分離(2)糞便標(biāo)本和肛拭子的處理液完全PBS液中加入P.S溶液,終濃度為青霉素100單位/ml,鏈霉素為100μg/ml。
完全PBS液的配置:取以下1份B液和1份C液加到8份A液中即為完全PBS工作液。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程26(一)病毒分離用600~800ml蒸餾水溶解以上鹽類(lèi),加蒸餾水補(bǔ)至1000ml,10psi(70Kpa)15分鐘高壓滅菌,即為不完全PBS工作液(不含鈣、鎂離子)。試劑品名加入量NACL8.00gKCL0.20gNa2HPO4(無(wú)水)0.91gKH2PO40.12gA液:三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程27(一)病毒分離B液:試劑品名加入量MgCl2.6H2O0.10g試劑品名加入量CaCl20.10g溶解于100ml蒸餾水中,10psi(70Kpa)15分鐘高壓滅菌。C液:溶解于100ml蒸餾水中,10psi(70Kpa)15分鐘高壓滅菌。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程28(一)病毒分離2.病毒分離細(xì)胞系許多細(xì)胞系可支持人腸道病毒(如EV71、CVA16)生長(zhǎng)。對(duì)于檢測(cè)手足口病的病原來(lái)說(shuō),建議所有懷疑含EV71、CVA16等腸道病毒感染的標(biāo)本均需接種到以下兩種細(xì)胞系:RD細(xì)胞,來(lái)源于人橫紋肌肉瘤細(xì)胞。HEp-2細(xì)胞,來(lái)源于人喉癌上皮細(xì)胞。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程29(一)病毒分離3.標(biāo)本的處理(1)糞便標(biāo)本和肛拭子的處理操作步驟:1)在離心管上標(biāo)記標(biāo)本號(hào);2)每管中加入10mlPBS、1g玻璃珠、1ml氯仿;3)在生物安全柜中將每一份糞便標(biāo)本取大約2g加入標(biāo)記好的離心管中(確保離心管上的標(biāo)號(hào)與原始標(biāo)本的標(biāo)號(hào)一致);肛拭子為2ml;4)剩余的原始標(biāo)本最好留在原容器中,凍存于-20℃;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程30(一)病毒分離5)確保擰緊離心管,用機(jī)械震蕩器劇烈震蕩20min;6)在確保離心機(jī)的蓋子蓋好和離心桶密封的情況下,用冷凍離心機(jī)在1500g條件下離心20min;7)在生物安全柜中將每1份標(biāo)本的上清液分別吸入2個(gè)有外螺旋蓋的凍存管中(如果上清液不清澈,應(yīng)再用氯仿處理1次);8)1管糞便懸液凍存于-20℃作為備份,另1管存于4-8℃以備接種。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程31(一)病毒分離(2)皰疹液標(biāo)本的處理皰疹液標(biāo)本通常直接用于RNA提取或病毒分離。(3)腦脊液標(biāo)本的處理腦脊液標(biāo)本通常直接用于病毒分離。(4)咽拭子標(biāo)本的處理咽拭子要在標(biāo)本運(yùn)輸(保存)液中充分?jǐn)噭?dòng)(至少40下),以洗下拭子上粘附的病毒及含有病毒的細(xì)胞等,用于病毒分離時(shí),需要凍融一次(防止多次凍融),使細(xì)胞破裂,釋放病毒顆粒。然后在4℃條件下,10000rpm離心20min,用上清接種到細(xì)胞上或直接提取RNA。如果發(fā)現(xiàn)有細(xì)菌污染,須用濾器過(guò)濾除菌。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程32(一)病毒分離4.接種和觀察(病毒分離)(1)通常使用8ml的斜面試管培養(yǎng)細(xì)胞,傳細(xì)胞時(shí),每管加細(xì)胞培養(yǎng)液1.5ml。顯微鏡下觀察單層細(xì)胞,以確保細(xì)胞是健康、無(wú)污染的。一個(gè)健康的單層細(xì)胞會(huì)在傳代后48小時(shí)左右形成;(2)倒掉生長(zhǎng)液(GM),換上1-1.2ml的維持液(MM);(3)每一份標(biāo)本需要同時(shí)接種2支RD細(xì)胞和2支HEp-2細(xì)胞,正確標(biāo)記每支細(xì)胞培養(yǎng)管(包括標(biāo)本的編號(hào)、日期、傳代數(shù));(4)每一種細(xì)胞至少標(biāo)記一管作為陰性對(duì)照;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程33(一)病毒分離(5)每支試管接種0.2ml的標(biāo)本懸液,培養(yǎng)溫度要求36℃。(或者使用吸附的方法接種病毒:接種標(biāo)本前,倒掉生長(zhǎng)液(GM),每支試管接種0.2ml的標(biāo)本懸液,培養(yǎng)溫度為36℃;吸附1小時(shí)后,換上1.5ml的維持液(MM)。同樣每份標(biāo)本需同時(shí)接種2支RD細(xì)胞和2支HEp-2細(xì)胞)。(6)使用倒置顯微鏡每天觀察細(xì)胞培養(yǎng)管,以觀察有特征性的腸道病毒致細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)的出現(xiàn)(如細(xì)胞變圓,折光增強(qiáng)并脫離管壁等);三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程34(一)病毒分離(7)記錄接種管和對(duì)照管細(xì)胞所發(fā)生的變化至少一周,記錄CPE(1+—4+)、提示細(xì)胞受毒性反應(yīng)、老化或污染的影響而發(fā)生的變化(1+,<25%;2+,25%-50%;3+,50%-75%;4+,75%-100%);(8)如果有特征性的腸道病毒CPE出現(xiàn),要如實(shí)記錄,并觀察直到75%的細(xì)胞發(fā)生變化(3+CPE),然后儲(chǔ)藏在-20℃以備二次傳代;(9)第一代培養(yǎng)見(jiàn)可疑細(xì)胞病變時(shí)應(yīng)繼續(xù)傳代,待細(xì)胞病變穩(wěn)定出現(xiàn)后-20℃或-70℃凍存;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程35(一)病毒分離(10)一代陽(yáng)性分離物再傳二代,如果又有明顯的CPE出現(xiàn),將病毒保存在-20℃冰箱(二代病毒)。因二代病毒滴度高于一代病毒,所以選用二代病毒進(jìn)行鑒定;(11)如果7d之后沒(méi)有CPE出現(xiàn),那么盲傳1代繼續(xù)觀察7d。(注意:同一病例標(biāo)本的細(xì)胞培養(yǎng)物不能混在一起再傳代,例如:不同細(xì)胞的培養(yǎng)物應(yīng)單獨(dú)傳代);(12)盲傳兩代后,仍然沒(méi)有出現(xiàn)CPE的,則判定為陰性;(13)注意:如果接種后24h內(nèi)出現(xiàn)CPE,很可能是標(biāo)本中的非特異性成分導(dǎo)致的毒性反應(yīng)。取三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程36(一)病毒分離100μl陽(yáng)性分離物傳二代,繼續(xù)觀察;或者在接種標(biāo)本吸咐1h后用維持液清洗細(xì)胞層,可能會(huì)降低毒性反應(yīng);(14)幾個(gè)概念:A:毒性反應(yīng):如果在接種后1-2d內(nèi)細(xì)胞快速凋亡,這可能是由于標(biāo)本中含有毒性物質(zhì)而導(dǎo)致的非特異性毒性反應(yīng)。這些已接種標(biāo)本的試管應(yīng)在-20℃凍存,融化后取0.2ml接種到同一類(lèi)型細(xì)胞中(此時(shí)是第二代)。如果又出現(xiàn)了毒性反應(yīng),那么應(yīng)該取原始標(biāo)本用PBS稀釋10倍,再次接種到同種細(xì)胞中。這時(shí)應(yīng)被認(rèn)為是第一代。
三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程37(一)病毒分離B:微生物污染:由于細(xì)菌污染而造成培養(yǎng)液混濁或細(xì)胞死亡經(jīng)常使病毒造成的CPE無(wú)法確定或根本無(wú)法出現(xiàn)。重新取原始標(biāo)本,用氯仿或抗生素處理,按上述步驟重新接種到新鮮細(xì)胞上。C:盲傳:有時(shí)一周之后傳代細(xì)胞會(huì)老化,甚至細(xì)胞對(duì)照也出現(xiàn)了病變。這時(shí)已接種標(biāo)本的試管應(yīng)在-20℃凍存,融化后取0.2ml接種到同一類(lèi)型的新鮮單層細(xì)胞中,再觀察7-10d。如果盲傳兩代后仍然沒(méi)有產(chǎn)生CPE,那么認(rèn)為這個(gè)標(biāo)本是陰性的。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程38(一)病毒分離5.病毒分離結(jié)果解釋RD細(xì)胞支持HFMD的主要病原體——CVA16和EV71等多種腸道病毒的復(fù)制,CVA16和EV71均能在RD細(xì)胞培養(yǎng)中引起特殊的腸道病毒致細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE),表現(xiàn)為細(xì)胞圓縮、分散、胞漿內(nèi)顆粒增加,最后細(xì)胞自管壁脫落。但相同滴度的CVA16和EV71在RD細(xì)胞中生長(zhǎng)的速度不同,EV71的生長(zhǎng)速度要快于CVA16,表現(xiàn)為EV71感染RD細(xì)胞后出現(xiàn)CPE的時(shí)間比CVA16早,EV71接種細(xì)胞后出現(xiàn)CPE很快,但CVA16一般要經(jīng)過(guò)2次以上傳代才出現(xiàn)明顯的CPE。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程39(一)病毒分離
若在使用RD細(xì)胞分離的同時(shí)再增加HEp-2細(xì)胞,可提高腸道病毒的分離率(分離出其他可能致HFMD的病原體,如一些柯薩奇B組病毒)。但CVA16和EV71在HEp-2細(xì)胞中均不繁殖。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程40(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度1.液體配制2.攻擊病毒CCID50滴定和滴度梯度制備3.稀釋血清4.病毒中和抗體測(cè)定的操作步驟中和實(shí)驗(yàn)的檢測(cè)原理5.結(jié)果判定三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程41(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度比較患者急性期血清與恢復(fù)期血清中和抗體滴度,可作為腸道病毒感染的血清學(xué)診斷方法,最常用的是中和實(shí)驗(yàn),即用微量板法測(cè)定抗體滴度,是目前人腸道病毒抗體檢測(cè)的最常用方法,該方法精確且具有型特異性。作為腸道病毒感染的診斷方法之一,可以測(cè)定血清中腸道病毒中和抗體的滴度,通常用急性期血清與恢復(fù)期血清滴度進(jìn)行比較,抗體滴度4倍或4倍以上增高證明病毒感染。但是,腸道病毒隱性感染也很常見(jiàn),所以在評(píng)估檢測(cè)結(jié)果時(shí)就要小心一些。在中和實(shí)驗(yàn)中,一般要用人腸道病毒參考毒株(即原型株,EV71原型株為BrCr株,三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程42(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度CVA16原型株為G-10株)或流行株,有時(shí)同時(shí)(或單獨(dú))使用臨床分離株會(huì)有助于得到更準(zhǔn)確的檢測(cè)結(jié)果。使用對(duì)腸道病毒敏感的細(xì)胞,如RD細(xì)胞。用病毒(血清)稀釋液(下面液體配制中的C液,可用維持液代替)稀釋血清和制備病毒懸液,因?yàn)槭怯貌《緛?lái)確定血清中抗體的滴度,所以要使用參考病毒(原型株),但有時(shí)使用所分離到的毒株(臨床分離株)有助于得到更準(zhǔn)確的檢測(cè)結(jié)果,但分離株的滴度(100CCID50/0.05ml)要事先測(cè)定。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程43(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度中和實(shí)驗(yàn)的檢測(cè)原理:病毒感染敏感靶細(xì)胞后,引起細(xì)胞形態(tài)學(xué)變化,出現(xiàn)CPE,特異性中和抗體與病毒結(jié)合后,可使病毒顆粒失去感染性,抑制CPE的出現(xiàn)。1.液體配制三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程44(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度A液:血清處理液:(100ml中含下列試劑成份)B液:細(xì)胞營(yíng)養(yǎng)液:(按生長(zhǎng)液配方配制,100ml中含下列試劑成份)
C液:病毒(血清)稀釋液:(按維持液配方配制,100ml中含下列液體)MEM85ml85ml93ml3%L-谷氨酰胺1ml1ml1ml7.5%碳酸氫鈉2ml2ml2ml
HEPES 1ml1ml胎牛血清2ml10ml2ml青、鏈霉素(各10000U/ml)10ml1ml1ml三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程45(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度2.攻擊病毒CCID50滴定和滴度梯度制備(1)將增殖后的病毒懸液凍融3次,然后在4℃、12000rpm條件下離心10min,取上清液分裝于10支凍存管中,每管1.5ml,一般每管應(yīng)在一次試驗(yàn)中用完,有剩余應(yīng)高壓后廢棄;(2)加Eagle液10倍系列稀釋為10-1至10-8病毒液,各加入細(xì)胞板內(nèi),每孔50μl,每稀釋度4孔細(xì)胞;(3)每孔加細(xì)胞懸液50μl,同時(shí)設(shè)細(xì)胞對(duì)照(50μl稀釋液+50μl細(xì)胞懸液),36℃培養(yǎng)7d,觀察細(xì)胞病變;(4)按Behrens-K?rber公式計(jì)算出分離病毒株的CCID50;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程46(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度logCCID50=L-d(S-0.5),其中:L=實(shí)驗(yàn)中使用的最低稀釋度的對(duì)數(shù)值;d=稀釋梯度的對(duì)數(shù)值;S=終判時(shí)陽(yáng)性部分的總和(即出現(xiàn)CPE的細(xì)胞孔所占的比例之和)。(5)正式試驗(yàn)前應(yīng)先滴定攻擊病毒2-3次,取其平均值,求出每0.05ml中含100CCID50的病毒載量;(6)按照計(jì)算好的稀釋比例配制攻擊病毒,求出試驗(yàn)所需的病毒總量(即100CCID50/0.05ml);三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程47(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度(7)取3支小試管,每只加病毒稀釋液(液體配制中的C液)0.9ml;(8)用帶濾芯的吸尖(ART吸尖)吸0.1ml已經(jīng)稀釋好的攻擊病毒液(即100CCID50/0.05ml)到第一支小試管中,換另一支ART吸尖,輕輕并徹底地混勻,避免產(chǎn)生大量氣溶膠,按照此方法依次稀釋至1CCID50/0.05ml和0.1CCID50/0.05ml。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程48(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度3.稀釋血清(1)發(fā)病1-3d內(nèi)采取患者急性期血清,發(fā)病后2-4周采取恢復(fù)期血清,分別凍存在-20℃?zhèn)錂z。(2)取無(wú)菌小試管若干支(每份血清使用一支)置試管架上,每管加血清處理液(上面液體配制中的A液)0.3ml,加待測(cè)血清0.1ml,蓋緊塞子,震搖混勻,放4℃冰箱過(guò)夜,即為1:4稀釋血清。次日56℃、30min滅活。(3)打開(kāi)獨(dú)立無(wú)菌包裝48孔組織培養(yǎng)板,縱向使用,每孔加血清稀釋液(上面液體配制中的C液)0.3ml,每份血清使用一排,每排4孔。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程49(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度使用移液器吸取處理過(guò)的血清0.1ml加入第一孔(即為1:16),吹吸8-10次,吸0.1ml加入第二孔(即為1:64),依次至1:1024,血清稀釋的過(guò)程中不必更換吸尖。即每份血清標(biāo)本進(jìn)行4倍倍比稀釋?zhuān)?:4、1:16、1:64、1:256、1:1024。(4)每份血清標(biāo)本的每個(gè)稀釋度都要平行做兩孔。4.病毒中和抗體測(cè)定的操作步驟:(1)取一塊96孔板橫向使用,每塊板可以做8份(4對(duì))待測(cè)血清,版面設(shè)計(jì)如下圖所示。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程50(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度A1-A2孔(B1-B2、C1-C2、D1-D2、E1-E2、F1-F2、G1-G2、H1-H2)中每孔加入1:1024稀釋度的待測(cè)血清0.05ml,不必更換吸尖,在A3-A4孔(B3-B4、C3-C4、D3-D4、E3-E4、F3-F4、G3-G4、H3-H4)中每孔加入1:256稀釋度的待測(cè)血清0.05ml,A5-A6孔(B5-B6、C5-C6、D5-D6、E5-E6、F5-F6、G5-G6、H5-H6)中每孔加入1:64稀釋度的待測(cè)血清0.05ml,A7-A8孔(B7-B8、C7-C8、D7-D8、E7-E8、F7-F8、G17-G8、H7-H8)中每孔加入1:16稀釋度的待測(cè)血清0.05ml,三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程51(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度A9-A10孔(B9-B10、C9-C10、D9-D10、E9-E10、F9-F10、G9-G10、H9-H10)中每孔加入1:4稀釋度的待測(cè)血清0.05ml,A11-A12孔(B11-B12、C11-C12、D11-D12、E11-E12、F11-F12、G11-G12、H11-H12)為每份待測(cè)血清對(duì)照孔,每孔中補(bǔ)加稀釋液0.05ml;(2)上述孔中分別加入病毒0.05ml(病毒滴度事先已經(jīng)稀釋為100CCID50/0.05ml);(3)蓋好蓋子后用微量板混勻器混勻,放入36℃CO2孵箱中孵育2h;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程52(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度
三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程53(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度(4)另取一塊96孔板縱向使用,做100CCID50/0.05ml病毒滴度的核實(shí)(每次實(shí)驗(yàn)都必須做)。每孔先加病毒稀釋液(試劑配制中的C液)0.05ml,然后從0.1CCID50/0.05ml加起,每孔0.05ml,每個(gè)稀釋度8孔,不必更換吸尖,一直加至100CCID50/0.05ml;同時(shí)留出4孔做為細(xì)胞對(duì)照孔,每孔加入0.1ml病毒稀釋液,然后放入4℃冰箱中暫存;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程54(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程55(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度(5)在孵育期間,用消化液消化細(xì)胞,準(zhǔn)備細(xì)胞懸液,細(xì)胞懸液的濃度為2×105個(gè)/ml,每塊96孔板至少需要準(zhǔn)備10ml;(6)孵育結(jié)束后每個(gè)待測(cè)血清孔、血清對(duì)照孔(待檢標(biāo)本板)和病毒回滴孔和細(xì)胞對(duì)照孔(病毒回滴板)分別加入0.1ml細(xì)胞懸液,然后用微量板混勻器混勻,放入36℃CO2孵箱中孵育培養(yǎng);(7)使用倒置顯微鏡每天觀察CPE,并記錄病毒滴定結(jié)果,以不產(chǎn)生細(xì)胞病變的血清最高稀釋度的倒數(shù)為終點(diǎn)效價(jià)。當(dāng)100CCID50/0.05ml的病毒對(duì)照孔出現(xiàn)完全病變時(shí),判定最終結(jié)果(約5~7d);(8)注意:如果病毒對(duì)照結(jié)果(病毒回滴)不在32~320CCID50/0.05ml的范圍內(nèi),實(shí)驗(yàn)無(wú)效,就要重復(fù)實(shí)驗(yàn)。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程56(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度5.結(jié)果判定當(dāng)最高稀釋度血清的2孔中有1孔出現(xiàn)細(xì)胞病變,另一孔不出現(xiàn)細(xì)胞病變,該稀釋度的倒數(shù)計(jì)即為該血清標(biāo)本的中和抗體效價(jià);當(dāng)高稀釋度2孔完全病變,相鄰低稀釋度2孔完全不病變,則兩者平均稀釋度的倒數(shù)即為該血清標(biāo)本的中和抗體效價(jià);當(dāng)兩個(gè)相鄰稀釋度血清均出現(xiàn)1孔細(xì)胞病變,另1孔不出現(xiàn)細(xì)胞病變,則兩者平均稀釋度的倒數(shù)即為該血清標(biāo)本的中和抗體效價(jià)。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程57(二)測(cè)定人雙份血清標(biāo)本的中和抗體滴度對(duì)于HFMD的雙份血清中和實(shí)驗(yàn)結(jié)果來(lái)說(shuō),如果恢復(fù)期血清較急性期血清EV71或CVA16中和抗體滴度出現(xiàn)4倍或4倍以上增高即可確診;如果恢復(fù)期血清較急性期血清其它腸道病毒中和抗體滴度出現(xiàn)4倍或4倍以上增高可證實(shí)該腸道病毒感染,是否為病因需要其它相關(guān)實(shí)驗(yàn)證實(shí);如果單份血清中和抗體滴度大于1:256也有診斷意義,血清中和抗體滴度為1:128判定為可疑陽(yáng)性。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程58(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)2.逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)3.電泳分析4.結(jié)果解釋1.RNA提取三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程59(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)1.RNA提取可使用多種商業(yè)化試劑盒來(lái)提取RNA,針對(duì)臨床標(biāo)本應(yīng)選擇質(zhì)量較高的“用于臨床標(biāo)本病毒RNA提取的試劑盒”,也可使用全自動(dòng)RNA提取儀進(jìn)行提取。針對(duì)病毒分離物,核酸提取比較容易,大部分商業(yè)化RNA提取試劑盒都可有效的提取到RNA。RNA提取依據(jù)使用的試劑不同,嚴(yán)格按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程60
2.逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)(2)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(3)RT-PCR擴(kuò)增反應(yīng)和條件(1)引物序列合成三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程61(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)2.逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)(1)引物序列合成國(guó)家脊灰實(shí)驗(yàn)室自行設(shè)計(jì)3對(duì)引物,分別為人腸道病毒通用引物、EV71特異性引物和CVA16特異性引物。各省CDC依據(jù)引物序列在質(zhì)量有保證的公司合成,引物合成后,需要做預(yù)實(shí)驗(yàn),保證引物合成沒(méi)有質(zhì)量問(wèn)題后,分發(fā)給地市級(jí)CDC。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程62(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)1)人腸道病毒(包括EV71、CVA16)核酸檢測(cè)通用引物序列:PE2(上游):5`-TCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCC-3`PE1(下游):5`-ACACGGACACCCAAAGTAGTCGGTCC-3`三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程63(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)2)EV71核酸檢測(cè)引物序列:EV71-S(上游):5`-GCAGCCCAAAAGAACTTCAC-3`EV71-A(下游):5`-ATTTCAGCAGCTTGGAGTGC-3`三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程64(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)3)CVA16核酸檢測(cè)引物序列:CVA16-S(上游):5`-ATTGGTGCTCCCACTACAGC-3`CVA16-A(下游);5`-TCAGTGTTGGCAGCTGTAGG-3`三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程65(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)(2)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)1)在PCR記錄紙(實(shí)驗(yàn)記錄紙)上記錄本次實(shí)驗(yàn)操作者姓名,實(shí)驗(yàn)日期,所鑒定標(biāo)本的名稱(chēng)以及標(biāo)本的順序,與PCR儀排列的順序一致。2)標(biāo)記好加標(biāo)本和對(duì)照的PCR管(陽(yáng)性對(duì)照,陰性對(duì)照和試劑對(duì)照)。A:陽(yáng)性對(duì)照:參比RNA,省級(jí)CDC提供(只是在初次使用,常規(guī)不建議使用,以防污染)。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程66(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)B:陰性對(duì)照:使用正常細(xì)胞RNA或臨床標(biāo)本腸道病毒陰性的RNA(每次實(shí)驗(yàn)要設(shè)立)。C:試劑對(duì)照:用去離子水代替標(biāo)本(試劑初次使用時(shí)必須做)。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程67(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)
(3)RT-PCR擴(kuò)增反應(yīng)和條件1)從臨床標(biāo)本或病毒中提取的RNA和各種RT-PCR試劑應(yīng)該一直放在冰浴盒上;2)配下列試劑主溶液:
10×PCRBuffer·····························································5.0μldNTPs(2.5mMeach)···················································2.0μl上游引物(0.1μg/μl)····················································1.0μl下游引物(0.1μg/μl)····················································1.0μlRNA酶抑制劑(RNasin,40U/μl)······································0.5μlTaqDNA聚合酶(5U/μl)···············································0.5μlAMV逆轉(zhuǎn)錄酶(10U/μl)················································1.0μl模板RNA·······································································3.0μlRNaseFreedH2O··························································36.0μl50.0μl三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程68(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)3)在PCR儀上進(jìn)行RT-PCR反應(yīng),反應(yīng)步驟如下:42℃························45min95℃························3min95℃··················20s45℃··················25s
×32個(gè)循環(huán)72℃························30s72℃························10min4℃························Soak三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程69(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)3.電泳分析(1)將已經(jīng)聚合的3%的瓊脂糖凝膠放在電泳裝置上;(2)在帕拉膜(Parafilm)上加上6×電泳載樣緩沖液(每個(gè)反應(yīng)需1μl)。再加上5μl的PCR反應(yīng)產(chǎn)物與之混合;(3)將電泳緩沖液倒在電泳裝置中,用吸尖將樣品與載樣緩沖液的混合溶液加到孔中;(4)蓋上蓋子,接通電源,以10V/cm電壓(恒定電壓)電泳,大約35-40min,直到溴酚藍(lán)跑到凝膠的底部的時(shí)候,停止電泳;三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程70(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)(5)將膠取出,并注意保持凝膠的方向;(6)在1μg/ml的溴化乙錠溶液中染色15min;(注意:溴化乙錠溶液是有毒、致畸、并且致腫瘤的物質(zhì),操作時(shí)要加小心,并戴雙層手套。如果儲(chǔ)存在避光的容器中,溴化乙錠溶液可以重復(fù)使用。溴化乙錠廢棄物按醫(yī)療廢棄物中化學(xué)品的有關(guān)規(guī)定處理。)(7)在蒸餾水中涮一下凝膠;(8)在紫外透射儀下觀察PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果,并照相作記錄。有條件的實(shí)驗(yàn)室可以使用全自動(dòng)電泳分析儀。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程71(三)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)4.結(jié)果解釋使用全自動(dòng)電泳分析儀的實(shí)驗(yàn)室可以通過(guò)儀器自動(dòng)讀取PCR產(chǎn)物大小,來(lái)判斷結(jié)果。通過(guò)瓊脂糖凝膠做PCR產(chǎn)物電泳的實(shí)驗(yàn)室,需要參照DNA分子量對(duì)照對(duì)照,比較標(biāo)本的PCR產(chǎn)物與陽(yáng)性對(duì)照的PCR產(chǎn)物在凝膠上的位置以及大小來(lái)解釋結(jié)果。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程72RT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果解釋表待檢標(biāo)本RT-PCR結(jié)果鑒定結(jié)果HEV(-),EV71(-),CVA16(-)非腸道病毒(NEV)HEV(+),EV71(-),CVA16(-)非EV71、CVA16的其它腸道病毒HEV(+),EV71(+),CVA16(-)EV71HEV(+),EV71(-),CVA16(+)CVA16三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程73(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)2.Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)(1)OneStepReal-timePCR法檢測(cè)EV71病毒核酸(單通道檢測(cè))(2)OneStepReal-timePCR法同時(shí)檢測(cè)EV71和CVA16核酸(雙通道檢測(cè))1.病毒核酸提取三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程74(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)1.病毒核酸提取參考常規(guī)RT-PCR病毒核酸提取步驟和注意事項(xiàng)。2.Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)依據(jù)不同廠家的試劑盒,嚴(yán)格按相應(yīng)說(shuō)明書(shū)操作和判斷結(jié)果。有5種試劑盒,分別為OneStepReal-timePCR法檢測(cè)EV71病毒核酸(單通道檢測(cè));OneStepReal-timePCR法檢測(cè)CVA16核酸(單通道檢測(cè));OneStepReal-timePCR法檢測(cè)腸道病毒核酸(單通道檢測(cè));三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程75(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)OneStepReal-timePCR法同時(shí)檢測(cè)EV71和CVA16核酸(雙通道檢測(cè));OneStepReal-timePCR法同時(shí)檢測(cè)EV71和腸道病毒核酸(雙通道檢測(cè))。下面舉2個(gè)例子來(lái)說(shuō)明單通道檢測(cè)和雙通道檢測(cè)的操作規(guī)程和注意事項(xiàng)。(1)OneStepReal-timePCR法檢測(cè)EV71病毒核酸(單通道檢測(cè))①反應(yīng)體系配置:反應(yīng)體系共25μl,模板量可根據(jù)樣本情況自行決定(臨床標(biāo)本通常使用5μl的RNA模板量),不夠部分以水補(bǔ)足。如選用另外試劑盒,反應(yīng)體系及條件隨之變化。三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程76(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)a.從試劑盒中取出相應(yīng)的試劑,反應(yīng)液在室溫融化后,瞬時(shí)離心,按n+1配置反應(yīng)體系(n=樣本數(shù)+1管陽(yáng)性對(duì)照+1管陰性對(duì)照),每個(gè)測(cè)量反應(yīng)體系配置如下表:試劑組成1份樣品的量熒光RT-PCR反應(yīng)液12.5μl逆轉(zhuǎn)錄酶0.5μlTaq酶0.5μl引物和探針1.5μlH2O5μl三、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)操作流程77(四)Real-timeRT-PCR(rRT-PCR)b.將上述反應(yīng)液混勻離心后,按照每管20μL分裝于各熒光PCR儀適用的PCR管中。c.加樣:將提取好的樣本RNA,分別加入上述分裝好的PCR反應(yīng)管中,模
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