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文檔簡介

造血干細胞捐獻者血樣的

HLA基因定型及資料錄入

鄧志輝

深圳市輸血醫(yī)學研究所

2005年5月16日主要工作流程一、各“工作站”將審核、遴選合格的造血干細胞捐獻者血樣(貼有骨髓條碼),以及捐獻者樣本清單(捐獻者姓名及骨髓編號),一并送達我研究所免疫遺傳實驗室;二、免疫遺傳實驗室對捐獻者血樣進行HLA-A、B和DRB1基因定型,對送檢血樣的HLA基因定型結(jié)果負責;

三、出具“捐獻者HLA基因分型檢測結(jié)果”報告。主要內(nèi)容(1)捐獻者HLA基因定型血樣的運輸(2)HLA相關(guān)基本概念(3)HLA分型(定型)技術(shù)HLA血清學分型技術(shù)HLA基因分型技術(shù)捐獻者HLA基因定型血樣的運輸注意事項:1、因“登記表”中填寫的內(nèi)容審核不合格血樣、以及經(jīng)HBV等化驗檢查健康不合格的血樣,予以剔除;2、檢查血樣管有無破管;3、路途遠、條件許可,可放置適量干冰;4、由專人運送,防震、防顛覆;5、合格的HLA基因定型血樣與捐獻者樣本清單一并送往組織配型實驗室。人類白細胞抗原(HumanLeucocyteAntigen,HLA)1958年,Dausset采用白細胞凝集實驗,檢測出第一個人類白細胞抗原Mac(A2)。為高度復雜的遺傳多態(tài)性系統(tǒng),每個人的HLA千差萬別,即人體生物學的“身份證”,不同的民族、同一民族不同的地域,HLA基因及單倍型分布有其特點,HLA為人類主要組織相容性系統(tǒng)(MHC),與移植排斥反應密切相關(guān),又稱移植抗原。是機體“識別自身”、“排除異已”的主要遺傳標記,參與免疫應答反應。HLA基因家族位于人類第6號染色體短臂,全長3.6Mb,HLA基因家族是迄今為止最復雜、多態(tài)性最豐富、免疫功能相關(guān)基因最集中、與疾病關(guān)聯(lián)最密切的一個區(qū)域。HLA抗原的分類HLA-I類:由一條具有多態(tài)性的α多肽鏈和一條沒有多態(tài)性的

2微球蛋白通過非共價鍵組成異二聚體。經(jīng)典HLA-I類抗原:包括HLA-A、B、C位點抗原,分布于幾乎所有有核細胞表面上。如T淋巴細胞、B淋巴細胞等,血小板上吸附HLA-A、B抗原。非經(jīng)典HLA-I類抗原:包括HLA-E、G、F位點抗原,抗原在特定時間選擇性分布。HLA-II類:由34KD的

鏈和29KD的β鏈以非共價鍵連接而成,包括HLA-DR、DP、DQ抗原;僅分布于B淋巴細胞、巨噬細胞、樹突細胞等少數(shù)細胞表面。HLA-Ⅲ類:主要包括補體分子C2、C4及Bf等。HLA基因定位于人類第6號染色體短臂(6p21.31),全長3.6Mb,占人類基因組堿基數(shù)的0.1%。HLA-I類基因:有10個遺傳座位,靠近染色體頂端,HLA-A、B、C、E、G、F為表達基因,H、J、K、L為假基因,無基因產(chǎn)物。

HLA-Ⅱ類基因:靠近染色體著絲粒端,主要包括HLA-DR、DP、DQ基因座。HLA基因結(jié)構(gòu)體細胞為二倍體,同源染色體之間相互配對,每一HLA位點有2個等位基因,一個來自于母親,另一個來自于父親。檢測HLA-A、B和DRB1三個位點,有6個等位基因,即6個HLA分型數(shù)據(jù)。檢出的HLA抗原及等位基因2003年世界衛(wèi)生組織(WHO)HLA因子命名委員會命名的HLA等位基因:HLA座位等位基因特異性HLA-A25024HLA-B49049HLA-Cw11913HLA-DRB131517HLA-DPB1996HLA-DQB1537HLA系統(tǒng)等位基因豐富,每個人的等位基因型千差萬別,可以說在隨機人群中,難以有完全相同的。HLA的命名1、血清學命名:遺傳位點后用數(shù)字表示,如A1、A2、A3、B5等。

以大寫字母A、B、C…表示HLA的遺傳座位;HLA特異性以數(shù)字表示;除HLA-A、B位點抗原的特異性的命名數(shù)字不重復外,其它位點抗原連續(xù)獨立命名;C位點抗原以Cw為字首命名,以和補體系統(tǒng)區(qū)別。2、HLA等位基因命名原則:位點后加“*”,再加數(shù)字表示。如DRB4*0103102N第1、2位數(shù)表示HLA抗原的特異性,第3、4位數(shù)表示等位基因(亞型),結(jié)尾加N表示無效等位基因或不表達基因。HLA等位基因所對應的血清學特異性,可查閱過WHO公布的HLA字典。

HLA低分辨水平基因定型:確定HLA基因前2位數(shù)。HLA高分辨水平基因定型:確定HLA基因第4位以后的數(shù)字。HLA的生物學功能HLA參與免疫應答反應,與抗原肽結(jié)合形成HLA-抗原肽復合物,抗原提呈細胞將此復合物交由T淋巴細胞處理,T細胞上的T細胞受體(TCR)能夠?qū)乖岢始毎系腍LA-抗原肽復合物產(chǎn)生雙識別,從而介導免疫反應。T細胞受體對HLA-抗原肽復合物的

雙識別作用人類白細胞抗原(HLA)的應用HLA分型在骨髓和器官移植組織型法醫(yī)學親子鑒定和個體識別人類種群學安全輸血疾病相關(guān)聯(lián)的研究等領(lǐng)域(如HLA-B27)HLA分型技術(shù)1、傳統(tǒng)的血清學和細胞學分型方法

因需要有活性的細胞、定型血清或分型細胞來源困難、分型準確性較差等原因,已逐步被淘汰。2、PCR為基礎(chǔ)的HLA基因分型技術(shù)分型所需要的血樣量少,不需要有活性的細胞,實驗重復性好、結(jié)果的準確性高,易于質(zhì)控和準標化。HLA基因分型技術(shù)取代了血清學方法。當前的“中國造血干細胞捐獻者資料庫”的建庫技術(shù),不同于以往的“中華骨髓庫”。前者采用基因定型技術(shù)檢測HLA-A、B、DRB1基因,后者采用血清學方法檢測HLA-A、B抗原。“中國造血干細胞捐獻者資料庫”對捐獻者血樣HLA基因分型技術(shù)的要求對HLA-A、B和DRB1進行基因分型,分辨率達低分辨水平。結(jié)果既報告每一樣本的基因型,同時報告對應的特異性。通過各省級組織配型實驗室室內(nèi)質(zhì)控,以及國家“HLA質(zhì)控實驗室”組織的室間質(zhì)控對HLA基因分型的準確性進行質(zhì)量監(jiān)控。HLA基因分型技術(shù)PCR-序列特異性引物(PCR-SSP)PCR-SSO流式磁珠分析HLA測序分型(SBT)PCR-序列特異性寡核苷酸探針(PCR-SSOP)基因芯片技術(shù)參比鏈介導的構(gòu)象分析(RSCA)

HLA單倍體基因測序HLA基因分型的步驟

1、DNA提取2、PCR擴增3、PCR擴增產(chǎn)物的檢測4、結(jié)果分析(判別受檢者HLA基因型)5、HLA基因定型報告

PCR-序列特異性引物(PCR-SSP)分型技術(shù)

基本原理:

使用序列特異性引物(SSP)特異性擴增HLA等位基因,電泳分離PCR擴增產(chǎn)物,根據(jù)是否存在PCR產(chǎn)物以及片段大小,確定相應基因。主要步驟:1、DNA提取2、PCR擴增3、瓊脂糖凝膠電泳檢測4、結(jié)果分析PCR-序列特異性引物(PCR-SSP)分型技術(shù)PCR-序列特異性引物

(PCR-SSP)分型技術(shù)特點:簡便、快速、直觀等,特別適合于尸腎移植的組織配型;所需設(shè)備簡單,易于開展;為常規(guī)采用的經(jīng)典HLA基因分型技術(shù)。應用:適合于經(jīng)典HLA-Ⅰ、Ⅱ類分子的基因分型分辨率:低分辯、高分辯基因分型水平。PCR-SSO流式磁珠分析技術(shù)

基本原理:以反向核酸雜交為基礎(chǔ),雜交產(chǎn)物采用流式磁珠儀進行自動檢測,為高通量HLA基因定型技術(shù)。PCR-SSO流式磁珠分析技術(shù)的特點(一)實驗原理、引物設(shè)計、擴增產(chǎn)物的檢測等,與SSP分型技術(shù)不同。PCR擴增反應結(jié)束后,將標記探針的磁珠直接加入PCR產(chǎn)物中,微量離心管(反應板)置于PCR擴增儀上進行分子雜交;雜交產(chǎn)物用流式磁珠儀進行自動進樣檢測,用HLA分析軟件確定HLA基因型。

流式磁珠分析技術(shù)的特點(二)配合DNA全自動DNA提取儀及多個PCR基因擴增儀,具有高通量、操作簡便、快速特點。適合骨髓庫、臍血庫大批量樣本的HLA基因分型工作?;诹魇酱胖榉治黾夹g(shù),已有多家商品化、低分辯水平的HLA基因分型試劑盒??捎糜贖LA-A、B、C、DRB1和DQB1座位的基因分型。HLA測序分型(SBT)技術(shù)HLA-座位檢測對象HLA-A第2,3,4外顯子的正、反向序列HLA-B第2,3,4外顯子的正、反向序列HLA-Cw第2,3外顯子正、反向序列HLA-DRB1第2外顯子正、反向序列,Condon86反向序列。HLA-DQB1第2外顯子正、反向序列,第3外顯子的反向測序。若存在DQB1*0201/0202或0301/0309,分析第3外顯子的測序結(jié)果。HLA測序分型(SBT)技術(shù)國際公認的HLA基因分型方法,高分辨率、高精度;HLA測序分型技術(shù)較復雜,受實驗室設(shè)備條件、試劑價格的限制,以往能夠開展HLA測序分型的實驗室尚不多;隨著非血緣關(guān)系造血干細胞移植供/受者對HLA高分辯確認實驗,以及人類學研究、HLA與疾病相關(guān)聯(lián)等領(lǐng)域的需要,SBT技術(shù)的開展已日益增多。HLA測序分型(SBT)技術(shù)可在同一PCR反應條件、同一測序反應的條件下,對不同HLA座位進行同步擴增,簡化了實驗操作;隨著毛細管電泳基因測

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