藥物代謝酶作用靶點基因檢測技術(shù)指南

FDA140余種藥物的藥品標簽中增加藥物基因組信息，涉及的藥其特性（MGMT基因甲基化）的檢測列入疾病的治療指南。藥物反應(yīng)相關(guān)基因及其FDA和我國食品藥品監(jiān)督管理局（CFDA）都已批準了一系列DNA樣本進行基因檢測。而RNARNA降解，使得檢測結(jié)果不準確，影響臨床判斷。因此，RNA檢測試劑的研發(fā)相對滯后。目 可操作性的SOP編 附錄A.基因及突變名稱、核酸信 附錄B.縮略 附錄D.藥物代謝酶和藥物作用靶點基因相關(guān)的藥 藥物代謝酶和藥物作用靶點基因特性的變化可通過影響藥物的體內(nèi)濃度和靶組織準化指導(dǎo)。Ct值（thresholdPCR反應(yīng)的熒光強度超過設(shè)定的閾值所需的循環(huán)數(shù)。CtPCR反應(yīng)Ct值就越小。RNA（ribonucleicDNA類似的單鏈核酸，由核糖核苷酸按照一定的順序排列而成，含RNA（mRNARNA（tRNARNA。rsss建立、dbSNPSNP命名體系，rsSNP代表已獲得官方認可和推薦SNP（referenceSNP，ssSNPSNPSNPTETETrisEDTADNADNADNA分子中，使正常核苷酸序列恢復(fù)的核甘酸修復(fù)方式，這種DNA雙螺旋上錯配的堿基對，還可修復(fù)因復(fù)制打滑而產(chǎn)生的核苷酸插入或缺失。MMR的過程需要區(qū)分母鏈和子鏈，做到只切除子鏈上錯誤的核苷酸，而DNAIIIDNADNA。DNA復(fù)制的必需原料胸腺嘧啶表示紫外光照射下被檢測物吸收的光密度，260nm波長下的吸光值（DNA吸收峰是一種可用于指示正常生物學(xué)過程、病理過程和/或?qū)χ委熂捌渌深A(yù)措施反應(yīng)性AAA的特性可包括但不僅限于單核苷酸多態(tài)性、短序列重復(fù)次數(shù)多態(tài)性、單倍型、DNA修飾如甲基化、核苷酸的插入/缺失、拷貝數(shù)變ARNA序列、A表達水平、RNA處理過程（如剪接和編輯。檢出限（limitof健康保險隱私及責任法案（healthinsuranceportabilityandaccountabilityact，1996年頒布的、醫(yī)療服務(wù)行業(yè)必須遵守的法案。該法案制定了一系列安聚合酶鏈反應(yīng)（polymerasechainDNA拷貝擴增到百萬數(shù)量級。攜帶遺傳信息的功能。DNA為一種雙鏈分子，通過核苷酸堿基對間的氫鍵維系。DNA（A（G（GDNADNA（gDNA）DNA。CT值比較法測定目的基因的相對表達量，以比較兩個或多個樣藥物不良反應(yīng)（adversedrugreaction,（或）根據(jù)臨床檢驗實驗室的條件確定合適的分子診斷項目和恰當?shù)臉颖咎幚硎谴_保核RNAEDTA或枸櫞酸鹽抗凝。采樣前需在采樣管或注射器上標注標本信息。全血標本采集外2~3mL并置于采血管中，將采血管輕輕顛倒混勻數(shù)次以確保充分抗凝，避免RNARNA穩(wěn)定劑的采樣管，或采樣后盡快將全RNA50L4小時。干血斑標（A微衛(wèi)星不穩(wěn)定等，需采集組織標本進行檢測?？捎玫慕M織標本包括新鮮組織、活檢組織、石蠟包埋組織和石蠟切片。在沒有大量脂肪細胞侵潤的情況下，10mgDNARNA10g。無菌條件下取米粒大小手術(shù)或活檢組織（25mg；腫瘤組織要求未壞死腫瘤組織比例>70％。穿刺取實體腫瘤組織時，取得的細胞數(shù)與穿刺針的粗細有關(guān)，21G細針每次獲得100個細胞，19G細針每次獲得150個細胞，支氣管活檢每次獲得300個細胞，CT介導(dǎo)的細針穿刺每次可獲得500量需達到200~400個。在某些情況下，要求同時采集無病變的組織或外周血作為對10％中性緩沖甲醛溶液固定組織標本，避免使用含重金屬離BouinDNA3小時后明顯發(fā)生，且時間較大的組織（如手術(shù)切除標本）固定6～48小時。甲醛固定的石蠟包埋組織不適于用作RNA檢測，但在沒有其他標本可供選擇時，可考慮選擇沒有污染部分提取的RNARNA序列的長度最好<130bp。組織標本切片時應(yīng)特別注意避DNA10μm4～8張，面積HE>50％片上畫出癌巢，對腫瘤細胞密集區(qū)域進行標注。DNA測序法要求腫瘤細胞至少占組50％。應(yīng)采取措施避免核酸交叉污染，制備不同患者病理切片標本時，需DNARNA20RNA分RNA穩(wěn)定劑中。DNA8小RNA10分鐘內(nèi)送達實驗室4小時內(nèi)送達實驗室；如果標本中添加了RNA穩(wěn)定劑，則可室溫運送或郵寄。標本的長距離運送應(yīng)符合生物意書；核實標本采集及送檢之間的時間間隔（要求采樣1周以內(nèi)；檢查標本的量和外HE染色，由有經(jīng)驗的病理醫(yī)師評價腫瘤細胞的數(shù)量是否滿足檢50ng/μL50kb。拒收無標簽、標簽不清晰、采PCR反應(yīng)。鹽析法提取可能存在蛋白質(zhì)及其他物質(zhì)的50ng/μL。DNADNADNATE緩沖液中可放DNA0oCDNA原液保存于-70oC或可防蒸發(fā)DNADNA的能力更強。DNA最適于保存在異質(zhì)同晶聚合物材料的塑料管或經(jīng)特殊處理的聚丙烯塑的提取用異硫氰酸胍結(jié)合酚-氯仿提取法，要求提取后的AD0介于之間，瓊脂糖電泳≥2。因RN很容易被降解，純化好的最好沉淀在無水乙醇中-70或更低溫度下保存。A需儲存在滅菌、疏水、并用焦碳酸二乙酯（pH7.1~7.5）溶液中。純化的RNA在首次凍融后3小時內(nèi)保持穩(wěn)定，但反復(fù)凍融可導(dǎo)酸片段；通過毛細管電泳分離這些片段后讀取待測核酸的堿基序列。Sanger法測序是PCR-SangerPCRPCR產(chǎn)物純化、測序反應(yīng)、測204DNADNA聚合酶、ATP硫酸4dNTP的DNA測序試劑和陽性質(zhì)控品五大類。所需儀器為PCR儀和焦磷酸測序儀。為避免假陽性和變（<3％）10多個堿基，不能對長片段進行分析。3）PCR法PCR（Taqman和分子信標染料或特殊設(shè)計的引物來指示擴增產(chǎn)物的增加。Taqman5’端核酸酶4條寡核苷酸鏈，其中兩條為等位基因特異性探SNP檢測時，PCR擴增的退火過程導(dǎo)致探針與模板雜交結(jié)合，當引物延伸至探針處時，DNA5’5’端報告基團從探針上切除，使之與淬滅基團CYP2C9、VKORC1PCR-熒光檢測試劑盒。DNAPCR擴增、熒光標記等程序，按堿基配對原理與芯片雜交，再通過熒DNA基因分型時屬于定性檢測，靈敏度為50ng/μL?；蛐酒ǚ治鰰r需設(shè)置陰性對液體使用前振蕩混勻，雜交和洗片操作務(wù)必在避光條件下進行，PCR反應(yīng)液和定位參照SNPCFDA已批準ACE、VKORC1多態(tài)性檢測的基因芯片試劑盒。PCR擴增，并通過瓊脂糖凝膠電泳或毛PCRACE插入缺失多態(tài)性；毛細管電UGT1A1*28多態(tài)性和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）進SNP的檢測。PCR反應(yīng)的熔解曲線分析進行基因分型。PCR擴增的熔解曲線取決PCR儀監(jiān)測這種細微的溫度變化，確定所擴增的目的片段中是否DNA的變性過程不存在熒光分子的重排，其特異度得到大幅提又稱為擴增阻滯突變系統(tǒng)PCR（AmplificationRefractoryMutationSystemPCR，PCRPCRDNA3’端配對的堿基，反之則有。因此，AS-PCR反應(yīng)需要兩條等位基因特異的引物和一條共用的反向引物，兩模板完全配對時，PCRPCR產(chǎn)物可通過凝膠電泳進行分析和基因型的判斷。該方法也可與實時熒光定量PCR結(jié)合起來進行基因分型。該方法可以用于檢測性識別某一特定序列和結(jié)構(gòu)DNA，并對其進行剪切的原理。限制性內(nèi)切酶通常識別雙DNADNA切斷，從而產(chǎn)生較短的DNA片段。由于限制性內(nèi)切酶識別序列的嚴格性，一個堿基的變化都可以導(dǎo)致酶切活SNP位點在某一限制性內(nèi)切酶的識別位點上，將SNPPCR產(chǎn)物與相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶進行溫育。SNP分型。固定石蠟包埋）DNA探針與該靶標進行分子雜交，從而檢測相關(guān)（FISH缺點腫瘤組織中突變比例較低的體細高通量，高靈敏需要特殊儀器設(shè)缺失突變和未知例高于5％的各種類型SNP量的比例可用于成本低，靈敏度需要特殊儀器設(shè)開展各種類型SNPSanger突變比例小于無需特殊的儀器SNP分型靈活度低，成本的實驗室對已知固定位原位雜交在細胞核原位對基因的異常進行項目適于臨床應(yīng)用的證據(jù)最少[1]1A（ClinicalPharmacogeneticsImplementationconsortiumCPICCPIC藥物基因組學(xué)指南的醫(yī)學(xué)會、以及美國國家衛(wèi)生研究院藥物基因組學(xué)研究網(wǎng)絡(luò)（PharmagenomicsResearch目的意義進行了論證；1B級項目有確切的臨床證據(jù)提示相關(guān)性，且這種相關(guān)性被具有影響藥物反應(yīng)中的作用機制和被測靶分子（DNARNA）的不同，個體化用藥分子檢mRNA表達檢測四種類型（?？鼗顒雍蛢x器維護的能力，可對試劑和質(zhì)控品的出入庫及使用情況、設(shè)備保養(yǎng)等情況進行準確記錄，進行數(shù)據(jù)分析。實驗室工作人員在培訓(xùn)后書面確認其已接受適當?shù)呐嘤?xùn)，閱讀并理解了相關(guān)。實驗室應(yīng)對實驗室工作人員進行處事能力考核和周期性能力再考核，定期開展內(nèi)部培訓(xùn)。外部培訓(xùn)包括國家衛(wèi)生計生委臨床檢驗中心和國家衛(wèi)生計生委個體化醫(yī)學(xué)檢測培訓(xùn)基地等機構(gòu)組織開展的各種技術(shù)培訓(xùn)。原則上按照《個體化醫(yī)學(xué)檢測質(zhì)量保證指南》的要求進行。臨床檢驗實驗室應(yīng)用的體外診斷試劑包括國家藥品食品監(jiān)督管理總局（A）生委個體化醫(yī)學(xué)檢測試點單位通過性能評定、具有嚴格標準操作規(guī)程（）的自配試劑（T）。所有試劑都需進行性能評價。實驗室所購買的商業(yè)化的儀器應(yīng)根據(jù)說明書進行驗證。在報告結(jié)果之前實驗室應(yīng)該證明其性能能夠滿足廠家規(guī)定的準確度、精密度、線性與可報告范圍和參考區(qū)間。實驗室還應(yīng)該為每個檢測系統(tǒng)建立性能規(guī)個體化醫(yī)學(xué)分子檢測包括定性檢測和定量檢測。定性檢測的性能驗證指標主要包括重復(fù)性/精密度、準確度（突變型的檢測能力臨床實驗室標準化協(xié)會（I）的EPl一2文件進行。定量檢測監(jiān)測體系性能驗證的指標主要包括準確度、精密度、線性、可報告范圍、檢出限、參考區(qū)間、靈敏度、特異性等。過繪制受試者工作特征曲線（receiveroperatingcharacteristic，ROC）確定診斷閾值，試劑的性能評估包括樣品的類型與數(shù)量、所選擇的參比方法、評價指標、準確度、重復(fù)性與精密度、線性范圍、檢測范圍、分析的靈敏度與特異性、參考區(qū)間或cut-off研制技術(shù)規(guī)范》。因擴增有或無、微衛(wèi)星不穩(wěn)定的程度（低、中、高2。表2.藥物代謝酶和藥物作用靶點基因檢測項目及其用藥指導(dǎo) ALDH2*2多態(tài)性檢 攜帶ALDH2*2等位基因的心絞痛患者盡可能改用CYP2C9*3多態(tài)性檢 將CYP2C9和VKORC1基因型代入華法林劑量計CYP2C19*2和*3多態(tài)性檢測PM50％并嚴密監(jiān)測血藥濃度；PM基因型患者應(yīng)用伏立CYP2D6*10多態(tài)性檢測攜帶CYP2D6*10佳，阿米替林的起始劑量應(yīng)降至常規(guī)用藥劑量的25CYP3A5*3多態(tài)性檢 減少CYP3A5*3/*3基因型患者他克莫司的用藥劑CYP3A5*3CYP4F2*3多態(tài)性檢 降低CYP4F2*3純合子基因型患者華法林及香豆類抗凝藥（醋硝香豆素、苯丙香豆素）DPYD*2A等位基因檢 攜帶DPYD*2A等位基因的患者應(yīng)慎用5-FU卡培 NAT1和NAT2慢代謝型基因型患者反復(fù)給予異煙SLCO1B1521T>C多態(tài)性檢 攜帶521C等位基因的患者慎用辛伐他汀和西立伐FDA推薦劑量表（2。TPMT多態(tài)性檢 降低低酶活性基因型患者MP的用藥劑量雜合子TPMT活性極高MPTPMT突變UGT1A1多態(tài)性檢 ACEI/D多態(tài)性 DD基因型的高血壓患者建議選用福辛普利進行降壓治療；DD基因型的高血壓合并左心室肥大和舒張期ADRB1多態(tài)性檢 Gly389基因型高血壓患者建議不選用美托洛爾降壓APOE多態(tài)性檢 基因型為E2/E2的高血脂癥患者建議選用普伐他ANKK1rs1800497多態(tài)性檢 攜帶rs1800497A等位基因的患者應(yīng)用第二代抗精（dMMR）檢測建議dMMR5-FU的化療方案。G6PD基因多態(tài)性檢測 HLA-B位點等位基因檢測攜帶HLA-B*1502IFNL3多態(tài)性檢 Rs12979860T等位基因攜帶者聚乙二醇干擾素α-2aα-2bHCV感染的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）檢測MSI-H5-FUPML-RARα融合基因檢 PML-RARα融合基因陽性的APL患者可用As2O3

TOP2A基因異常的乳腺癌患者建議采用含蒽環(huán)類藥VKORC1-1639G>A多態(tài)性檢 攜帶-1639A等位基因的個體應(yīng)減少華法林的用藥ERCC1mRNA表達檢 建議ERCC1mRNA低表達的非小細胞肺癌患者選RRM1mRNA表達檢 建議RRM1mRNA低表達的患者選用吉西他濱為DNA樣本至少藥物代謝酶和藥物作用靶點基因檢測的質(zhì)量控制與保證是個體化醫(yī)學(xué)檢測質(zhì)量保檢測的靶核酸、確定要使用的試驗方法和建立試驗性能確認/驗證的計劃和程序。確認/如何分析性能規(guī)范，如何規(guī)定試驗的局限性；出現(xiàn)問題時的糾正措施。SOP驗室安全措施等臨床檢驗的各個環(huán)節(jié)。SOP的編寫應(yīng)注意通俗易懂、注重細節(jié)、清晰明SOPSOP統(tǒng)計學(xué)質(zhì)量控制方法主要包括兩大類：陽性樣本測定重復(fù)性統(tǒng)計質(zhì)控方法和假陽性的統(tǒng)計質(zhì)控方法。陽性質(zhì)控品測定重復(fù)性統(tǒng)計能較準確的反映實驗室儀器、試劑、實驗員操作的穩(wěn)定性，也是實驗室實時監(jiān)控檢測結(jié)果是否可信的重要手段，其主要統(tǒng)計控制方法包括基線測定、Levey-Jenningsestgrd積和（SM）質(zhì)控方法及“即刻法”質(zhì)控方法。假陽性的統(tǒng)計質(zhì)控方法包括根據(jù)日常患者結(jié)果陽性率的Levey-Jennings質(zhì)控圖和直接概率計算法兩種，其中質(zhì)控圖法是目前臨床檢驗中應(yīng)用較為廣泛的一種方法，適合于質(zhì)控樣本多次重復(fù)、檢測結(jié)果可用數(shù)值表示且呈正態(tài)分布的情況。s質(zhì)控圖法的具體做法是：樣本處理（核酸提?。r加入流程陰參，所有步驟與待測樣本一致；加模板時，各檢測位點均應(yīng)設(shè)置陰性對照（即以流程陰參）與一定比例的突變型/野生型陽性標準品23。擴增時注意前后批次陰參和陽參的孔槽擺放位置的隨機性。所有陰參、陽參的檢測結(jié)果應(yīng)符合預(yù)期值，記錄各個陽性質(zhì)控品擴增產(chǎn)物檢測結(jié)果。用Levey-Jennings質(zhì)控圖進行統(tǒng)計分析，根據(jù)質(zhì)控規(guī)則判斷檢測結(jié)果是否在控。質(zhì)控規(guī)則如下：（EQAEQAEQA評分包括絕對評分和相對評分。絕對評分就是看實驗室對該次所有質(zhì)評樣本檢測EQA還需對檢測報告A.基因命名依據(jù)人類基因命名委員會（humangenenomenclaturecommittee，HGNC）1979HGNC數(shù)據(jù)，其主要原則包括：“G”或“h人類的字母“hasc.78-2A。>（復(fù)制的第一個至最后一個核苷酸的序列。SNPdbSNP數(shù)據(jù)庫中的參考號，CYP450同工酶等位基因命名與人類CYP450等位基因命名委員會DNAmRNANCBIGenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫參考序列（ReferenceSequence，RefSeqDNA序列GenBankNT、NCAC加下劃線標注，其中以“NT_”BAC10號染色體上的片段NT_030059，NT_030059.14mRNANM加下劃線（NM_）CYP2C19mRNA序列注冊NM_000769RNA（microRNA，miRNA）miRBase序B.ACE：angiotensinconvertingenzyme ACEI：angiotensinconvertingenzymeinhibitor ADRB1：-adrenergicreceptor1 1腎上腺素受體ALDH2：aldehydedehydrogenase ANKK1：ankyrinrepeatandkinasedomaincontaining1 APOE：ApolipoproteinE 載脂蛋白EARMS-PCR：amplificationrefractorymutationsystemPCR CDS：codingDNAreference DNACFDA：ChinafoodanddrugadministrationCPIC：ClinicalPharmacogeneticsImplementation CYP450:CytochromeP450 細胞色素P450CYP2C19：CytochromeP4502C19P4502C19CYP2C9：CytochromeP4502C9P4502C9CYP2D6：CytochromeP4502D6P4502D6CYP3A5：CytochromeP4503A5P4503A5dMMR：deficientmismatchrepair錯配修復(fù)蛋白缺失DNA：deoxyribonucleicacid脫氧核糖核酸dNTP：deoxy-ribonucleosidetriphosphate脫氧核苷三磷酸DPYD：dihydropyrimidinedehydrogenase二氫嘧啶脫氫酶DRD2：dopaminereceptorD2 多巴胺受體D2EDTA：ethylenediaminetetraaceticacid EM：extensivemetabolizer EQA：externalqualityassessmentERCC1：excisionrepaircross-complimentationgroup1 FDA：foodanddrugadministrationFFPE：Formalinfixedandparaffinembedded甲醛固定與石蠟包埋FISH：fluorescentinsituhybridization熒光原位雜交 G6PD：glucose-6-phosphatedehydrogenase葡萄糖-6-Genomic HCV：hepatitisvirus HGNC：humangenenomenclaturecommitteeHIPAA：healthinsuranceportabilityandaccountability HLA：Humanleukocyteantigens HRM：highresolutionmelt IM：intermediatemetabolizer ISH：Insitu LDT：laboratorydevelopedtestMGMT：O6-methylguanineDNAmethyltransfersseO6-甲基鳥嘌呤-DNA-甲基轉(zhuǎn)移酶MMR：mismatchrepair MS：microsatellite微衛(wèi)星MSI：microsatelliteinstability微衛(wèi)星不穩(wěn)定性MSS：microsatellitestability NCCN：NationalComprehensiveCancer NSCLC：non-smallcelllungcancerOATP1B：organicaniontransportingpolypeptidemember1B1有機陰離子轉(zhuǎn)運多肽1B1PCR：polymerasechainreaction PD：pharmacodynamicsPGRN：PharmagenomicsResearch 藥物代謝動力學(xué)PM：poormetabolizer PML：promyelocyticleukemia早幼粒細胞性白血病RCT：randomcontroltrial RARα：Retinoicreceptorα 維甲酸受體αRefSNPalleleSNPRR：ribonuclease RRM-1：ribonucleasereductasemodulator1 核糖核苷酸還原酶調(diào)節(jié)亞基1SLCO1B1：solutecarrierorganicaniontransporterfamily,member1B1 肽1B1SNP：singlenucleotidepolymorphismSOP：standardoperation SJS/TEN：Stevens-Johnsonsyndrome/toxicepidermalnecrolysis Stevens-Johnson綜合征/TE：Tris-EDTA三羥甲基氨基甲烷- 6-TGN：6-thioguaninenucleotide TIMP：thioinosinemonophosphate TOP2A：topoisomeraseIIalpha，拓撲異構(gòu)酶IITPMT：thiopurineS-methyltransferase UGT1A1：UDP-glucuronosyltransferase1family,polypeptideA1尿苷二磷酸葡萄糖醛酸1A1UM：ultrarapid VKORC1：vitaminKepoxidereductasecomplex,subunit1 K環(huán)氧化物還原酶復(fù)1C.ALDH2*22（ALDH2）同時具有乙醛脫氫酶和酯酶活性，參與乙醇、硝酸甘油等藥物的代謝。ALDH2代謝活化硝酸甘油成其活性代謝產(chǎn)物一氧化氮。CYP2C9*3CYP2C9P450酶（CYP）P45020％。CYP2C9參與抗凝血藥、抗驚厥藥、降糖藥、非甾體類解熱鎮(zhèn)痛抗炎均為治療指數(shù)較窄的藥物。CYP2C9活性變化可導(dǎo)致這些藥物體內(nèi)濃度出現(xiàn)較大變化，CYP2C9*3（rs1057910，A1075C，Ile359Leu）CYP2C9酶活性降低，CYP2C9*3純合子個體酶活性僅為該位點野生型純合子基因型個體（攜帶CYP2C9*1或Arg144/Ile359等位基因4~6CYPC2C9*20％，CYPC2C9*3的頻率為3％。CYP2C9遺傳多態(tài)性導(dǎo)致其酶活性變化，從而導(dǎo)致藥物代謝種族和個體敏感性增加可導(dǎo)致嚴重出血事件。華法林由S-和R-兩種消旋體構(gòu)成，其中S-華法林的R-5倍。85S-華法林在體內(nèi)經(jīng)CYP2C9代謝為無活性66％，因此華法林的給藥劑量需相應(yīng)降低[2-4]FDA已批準修改華法林產(chǎn)品說明CYP2C9基因檢測[5]CYP2C9*3等位基因可用于指導(dǎo)中國人群確定華法林的起始用藥劑量，并預(yù)測藥物毒性，結(jié)合國際標準化比值CYP2C9CYP2C9CYP2C19*2CYP2C19*3物的代謝。CYP2C19遺傳變異可導(dǎo)致酶活性的個體差異，使人群出現(xiàn)超快代謝者（ultrarapidmetabolizer，UM、快代謝者（extensivemetabolizer，EM2CYP2C19酶缺陷的主要等位基因。CYP2C19*2導(dǎo)致剪接缺失，CYP2C19*3為終止密碼子突變。EMCYP2C19*1等位基因，IMCYP2C19*2或CYP2C19*3雜合子基因型；PM個體包括CYP2C19*2/*2CYP2C19*2/*3和CYP2C19*3/*375~85PMCYP2C19*220~25％PMCYP2C19*3所致。雷以防止支架內(nèi)再梗。氯吡格雷主要經(jīng)CYP2C19代謝活化后發(fā)揮抗血小板效應(yīng)。使用；CYP2C19*2或*3基因型個體對氯吡格雷療效降低，建議更換成普拉格雷或替卡格雷；CYP2C19*2或*3血液中阿米替林與去甲替林的濃度比，影響阿米替林的療效和不良反應(yīng)的產(chǎn)生。CYP2C19PM個體血漿阿米替林與去甲替林濃度的比值顯著升高，5-羥色胺再攝取的抑CYP2C19突變等位基因患者阿米替林的起始用藥劑量有助于降低初始治療的失敗率。CPICCYP2C19EMIMCYP2C19PM基因型個體阿米50％，并進行治療藥物監(jiān)測[1]。伏立康唑是一種廣譜三唑類抗真菌藥，CYP2C19是其主要代謝酶之一。CYP2C19EMPM個體間伏立康唑的血液濃度存在顯著差異，PM個體在應(yīng)用常規(guī)劑量藥物時可能出現(xiàn)毒副反應(yīng)，建議減少用藥劑量；EMIM個體可給予常規(guī)劑量。在常規(guī)劑量CYP2C19基因型，以確保用藥安全[5]。CYP2D6*10（EM（IM1％。CYP2D670多種遺傳變異。不同突變類型對酶活性和藥物代deletionCYP2D6*（G1934A（C188TCYP2D6基因型檢測，以確保藥物的療效[5]。CYP2D6IMPM丹司瓊的預(yù)防惡心嘔吐的作用減弱。CPIC3CYP2D6UMCYP3A5*3CYP3A5（rs776746CYP3A5*3SNPCYP3A5mRNACYP3A5蛋白，從而2860%--80%。莫司的血藥濃度升高，不良反應(yīng)增加。CPICCYP3A5*3/*3基因型的移植司的起始劑量為0.15mg/kg/day；CYP3A5*1/*3基因型患者他克莫司的起始劑量為0.20mg/kg/day；CYP3A5*1/*10.25mg/kg/day。0.075mg/kg/dayCYP3A5*1/*3克莫司的起始劑量為0.15mg/kg/day；他克莫司穩(wěn)定劑量=5.409–2.584*CYP3A5GGa–1.732*CYP3A5GAb+0.279*1236Tc+0.205*ABCB1G2677Td-0.163*donortypee-0.149*CCBf-0.140*infectiong-0.197*ABCB1C1236T:0forCC,1forCTorABCB1G2677T:1forGGorGT,2for移植類型：活體移植=1，其他 感染：感染=1，未出現(xiàn)高血壓：高血壓=1，未出現(xiàn)=0CYP4F2*3雜合子其次，CYP4F2*3純合子活性最低。CYP4F2*3純合子個體酶活性下降導(dǎo)致維生應(yīng)用華法林時出血的風險顯著增加。CPICCYP4F2*3純合子基因型個體DPYD*2AFU5-FU5-FU，用于結(jié)腸癌和對紫杉醇及多柔比5-FU5-FU而發(fā)揮抗腫瘤作用。855-FU經(jīng)二氫嘧啶脫氫酶（DPYD）代謝滅活。DYPD酶5-FU5-FU蓄積，引起嚴重粘膜炎、粒細胞減少癥、神經(jīng)系統(tǒng)癥狀甚至死亡。DPYD1號染色體短臂，141986A>G多態(tài)性（DPYD*2A）是最常見的引起酶活性下降的遺傳340DPYDDPYD*2A等位基因，605-FU4DPYD酶活性正?；颊咧?，5-FU10％[89]DPYD*2A多態(tài)性5-FU治療導(dǎo)致致命性毒性反應(yīng)發(fā)生風險。FDA5-FU說明書DPYD多態(tài)性進行檢測的建議[5]。CPIC5-FU、卡培他濱和替加氟前對DPYD多態(tài)性進行檢測，攜帶DPYD*2A等位基因的患者慎用5-利福平、氨基水楊酸和對氨基苯甲酸等藥物的代謝；NAT2僅表達于肝臟和腸道，參與型乙酰化代謝者和中間型乙?；x者。亞洲人中慢型乙?；x者的發(fā)生率為28種NAT1NAT1*4NAT1的野生型等位基因。NAT1*20、*21、*23、*24、*25、*27NAT1*4功能類似，而*14A、*14B、*15、*17和*22導(dǎo)致慢乙?；硇?，*10和*11導(dǎo)致酶活性升高。此外，還存在編碼無酶活性的截短蛋白NAT1*10NAT1*11純合子和雜合子基因型視為快型乙?；x基NAT1基SNPSNP進行檢測和分型。異煙肼受NAT145~110分4.5小時。慢代謝型個體反復(fù)給藥后易引起蓄積中毒，引起周圍神經(jīng)炎。FDANAT1基因列為藥物基因組生NAT2N-乙?；D(zhuǎn)移酶基因命名委員會已發(fā)NAT2*5B、*5B、*5C、*5D、*5E、*5F、*5G、*5H、*5I、*6A、*6B、*6C、*6D、*6E、*7B、*12D、*14A、*17和*19。NAT2基因多態(tài)性NAT2的NAT2SNPrs1801280、rs1799930、rs1799931和rs1801279FDANAT2列為異煙肼個體化用藥的基因組標記物，推薦在使用NAT2基因型進行檢測[4]NAT2慢代謝型（攜帶兩個慢代謝型等SLCO1B110~15OATP1B1對其底物的攝取能力，使他汀類藥物如普伐他汀、阿托伐他汀和羅蘇伐他汀等的血藥濃度升高。SLCO1B1521T>C多（突變型純合子521C等位基SLCO1B1基因型選擇他汀類藥物進行治1.SLCO1B1521T>C5-4211-10-TPMTMP和6-MP常用于惡性腫瘤的化療，AZP則主要用于自身免疫性疾病及器官移植患者。AZP6-MP。6-MP經(jīng)次黃嘌呤-鳥嘌呤磷monophosphateTIMP6-硫鳥嘌呤核苷酸（6-thioguaninenucleotide，6-TGN）6-MPTPMT6-甲巰基嘌呤(6-methylMP，6-MMP)。TPMT6-MP6-TNG的水平呈負相關(guān)，TPMT（嚴重的骨髓抑制增加。TPMT酶活性分布存在多態(tài)性現(xiàn)象，TPMT遺傳變異是導(dǎo)致其酶活性降低的主要原TPMT*（rs1800462238G>CAla80Prors142345719A>Gyr240Cys460G>AAla154ThrTPMTSNP或單倍型。TPMT3（TPMT*1/*1TPMT活性，雜TPMTTPMT酶活性極低甚至缺乏。此外，2種突變等位基因純合子（TPMT*2/TPMT*3ATPMT*3A/TPMT*3C）個體也缺乏酶活性[12]。90％，突變雜合子基因型100.3TPMT*3雜合子基因型2.2TPMT*2等位基因。藥物，以避免發(fā)生嚴重的造血系統(tǒng)毒性；TPMT6-MPTPMT*3B或*3C的兒童應(yīng)用順17倍，TPMT突變等位基因預(yù)測順鉑致聽力喪失的陽性預(yù)測UGT1A13810％，導(dǎo)致化療提前終止。SN-38在肝臟中經(jīng)尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶（UGT1A1）葡萄糖醛酸化滅活，38GTATATAUGT1A1*286TA（A6UGT1A1*1（A7UGT1A1*28rs3064744SN-38SN-38葡萄糖醛苷12.550％。UGT1A1*6（G71R，211G>A）是東方3倍[13]。FDA已批準對藥物說明書進行修改，明確UGT1A1基因型檢測，以提高其用藥安全[5]。ACEI/D血管緊張素轉(zhuǎn)換酶（angiotensinconvertingenzyme，ACE）是腎素-血管緊張素系統(tǒng)D56.2％、60.339.0％。ACEI/DACE的水平，DDACE的活性升高，降壓療效增強；在高血壓合并左心室肥大和舒張期充盈障礙的患者中，DD基因型患者IDII基因型患者；II基因型患者應(yīng)ACEIACEI/DACEIADRB1腎上腺素受體（-adrenergicreceptor）G蛋白偶聯(lián)受體超家族，包含1、2和3Gs蛋白偶聯(lián)調(diào)節(jié)細胞內(nèi)cAMP和LCa2+受體激動劑和1受體編碼基因ADRB1多態(tài)性可影響受體阻斷劑如美托洛爾的療效[16]。ADRB1Gly389A（rs1801253Gly389Arg3倍；Arg389純合子基因型心衰APOEE（ApolipoproteinE，APOE）是一種存在于乳糜微粒和中間密度脂蛋白中APOErs42935（c.388T>CCys130Arg）rs7412Trs7412Crs7412C型（E2/E2、E3/E3、E4/E4、E2/E3、E2/E4E3/E4。E3/E3是最常見的基因型，人群60％。LDLLDLFDA已將ANKK11（ankyrinrepeatandkinasedomaincontaining1，ANKK1）為rs1800497（c.2317G>A，Glu713Lys）DRD2Taq1AT等DRD2rs1800497A等位基因的患者在應(yīng)用第二代抗精神病藥治療期間靜坐不GG基因型患者。CPICANKK1rs1800497多1B級藥物基因組標記物，指出通過檢測該多態(tài)性可降低抗精神病藥不良反應(yīng)IFNL3丙型肝炎病毒（hepatitisvirusC，HCV）感染通常采用聚乙二醇化干擾素聯(lián)合利巴70CTTT型患者獲得持續(xù)病毒應(yīng)答率只有20~50CC37％。美國肝臟病學(xué)會和歐洲肝臟病2011HCVIFNL3基因多態(tài)性作為基線預(yù)測聚乙二醇化干擾FDAα-2a、聚乙二醇干擾素α-2bIFNL3rs12979860基因型進行檢測的建議[5]。IFNL3rs12979860HCV感染的個體化治療，從而提高其治療水平。PML-RARα擾細胞內(nèi)正常的PML和RARα信號通路，使粒細胞分化阻滯于早幼粒階段，從而導(dǎo)APL的發(fā)生。APLPML-RARα融合基因檢測對于指導(dǎo)選擇治療方案、APL的預(yù)后具有重要意義[17]。TOP2A基因（topoisomeraseIIalpha，TOPII）DNAII，該酶通過TOP2A基因異常：TOP2A基因擴增和基因缺失。TOP2A基因異常的乳腺癌患VKORC1（-1639G>A）的單核苷酸突變rs9923231可影響VKORC1的表達，是導(dǎo)致華法林用藥劑量個體差異的主要原因之一。與該位點AA基因型患者相比，-1639GA和GG基因型患者平均華法林劑量分別增加52％（95％CI：41~64％）和102％CI85~118％VKORC1多態(tài)性在不同種族不同人群中可解釋約27％華法林用藥劑量的個體差異。7%CYP2C9G>A6-4-2.5-5-3.5-2.5-華法林穩(wěn)定劑量D(mg/day[1.432+0.338VKORC1-1639AG)0.579VKORC1-1639GG)–0.263×(CYP2C9*1*3)–0.852×(CYP2C9*3*3)-0.004Age+0.264×BSA0.057×AVR+0.065×Sex+0.085×Smokinghabit+0.057×Atrialfibrillation+Aspirin-0.0592×Amiodarone]注解：VKORC1-1639AG表示患者為-1639AG1，為-1639AA或-1639GG0；VKORC1-1639GG表示患者為-1639GG1，為-1639AA或-1639AG0；CYP2C9*1*3CYP2C9*1*3基因型1CYP2C9*1*1CYP2C9*3*30；CYP2C9*3*3表示患CYP2C9*3*31CYP2C9*1*1CYP2C9*1*3基因型是取值為0；Age表示年齡，取整歲；BSA表示體表面積，BSA=0.0061×身高+0.0128×體重-0.1529；AVR1；Sex1，0；Smokinghabit10；Atrialfibrillation10；Aspirin表示10；Amiodarone表示患者同時服用10。dMMR35位。80％的結(jié)直腸癌為散發(fā)（Lynch綜合征IIIII5-FU化G6PD（如紅細胞PH-6（eeD）-6-DX糖，在應(yīng)用部分藥物如乙酰苯胺、呋喃旦叮、呋喃唑酮、呋喃西林、氯喹、伯氨喹啉、G6PD140人群最常見的突變類型，累計頻率達86％。FDA已批準在氯喹、氨苯砜和拉布立酶藥G6PD[5]。G6PD突變進行檢測，G6PD缺乏的患者HLA-B人類白細胞抗原（Humanleukocyteantigens，HLA）是人類主要組織相容性復(fù)合體HLAHLA-A、-B、-C系列抗原，廣泛表達于各組織有核細HLA-D/DR、-DP、DQB細胞和抗原提呈細胞，III類抗原都與器官移植有關(guān)，其中Ⅱ類抗原更為重要；Ⅲ類分子為補體成分。近年來發(fā)現(xiàn)一些藥物的嚴重不良反應(yīng)與人類白細胞抗原基因多態(tài)性有關(guān)，如HLA-B*1502等位基因與卡馬西平和苯妥英所致Stevens-Johnson綜合征/中毒性表皮壞死松解癥（Stevens-Johnsonsyndrome/toxicepidermalnecrolysis，SJS/TEN）相關(guān)，HLA-B*5801SJS/TEN相關(guān)；HLA-B*5701等位基因與阿巴卡韋所致藥物性肝損害相關(guān)[19,20]FDA已批準在卡馬西平藥品說明書中增加漢族及東南亞裔人群在服用卡馬西平前進行HLA-B*1502等位基因篩查的建議，HLA-B*1502陽性的個體應(yīng)HLA-B*5701SJS/TEN[5]。CPICHLA-B*1502作為預(yù)測卡馬西1AHLA-B*5801作為預(yù)測別嘌呤醇皮1AHLA-B*5701作為預(yù)測阿巴卡韋所致藥物超敏反1A級藥物基因組標記物[1]。MGMT制其基因表達，高甲基化可導(dǎo)致MGMT基因沉默，MGMT活性下降。約45%~70%的神DNA短小序列或單核苷酸區(qū)域。在人類基因組中，DNA進行復(fù)制時，由于微衛(wèi)星重復(fù)序列錯配（微衛(wèi)星突變）情況下，DNA錯配修復(fù)基因（MMR）MMR定性（MSI-。正常情況下稱為微衛(wèi)星穩(wěn)定(microsatellitestability，MSS)。MSI5-FU15％的結(jié)直腸癌由于IIIII期結(jié)腸癌患者預(yù)后以及是否可從氟尿嘧啶輔助治療中獲益的指標。ERCC1mRNADNA損傷可通過核苷酸剪切修復(fù)酶的作用是識別并切除修復(fù)“DNA-鉑”復(fù)合物的限速酶。ERCC1表達水平與鉑類藥物的療效呈負相關(guān)，ERCC1mRNA表達水平低的非小細胞肺癌患者在接受鉑類與吉西他濱聯(lián)合化療方案或以鉑類為主的化療后療效更好，總生存期顯著延長。NCCN非小細胞肺癌的臨床治療指南（2010）ERCC1mRNA表達水平作為預(yù)測鉑類藥物療效的生物標記物，ERCC1mRNA呈高表達水平的患者耐藥，低表達水平者敏感。RRM1mRNADNA的合成，或通過抑瘤。RR由兩個亞基RRM1和RRM2組成，調(diào)節(jié)亞基RRM1（ribonucleasereductasemodulator1，RRM-1）RRM1基因編碼。臨床研究發(fā)現(xiàn)，RRM1mRNA表達水平與吉在晚期非小細胞肺癌患者，腫瘤組織中RRM1mRNA表達水平與中位數(shù)生存期相關(guān)，RRM1低表達者的中位生存期顯著延長。NCCN非小細胞肺癌的臨床治療指南（2011）D. 6-巰基嘌呤、6- ACE PML- 鉑類藥物（順鉑、卡鉑和奧沙利鉑 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