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肺癌中PVT1的表達及調(diào)控機制

ExpressionandregulationmechanismofPVT1inlungcancer報告人：何山川篇名摘要背景實驗總結個人觀點背景肺癌是常見的惡性腫瘤之一，2017年美國癌癥協(xié)會資料統(tǒng)計，肺癌在所有新發(fā)惡性腫瘤中發(fā)生率排第二位，死亡率排第一位。對人們的生命健康是一種巨大的威脅。肺癌的發(fā)生因素是多方面的，主要包括易感基因的遺傳、環(huán)境污染以及吸煙飲食等生活方式等。手術、化療和放療為現(xiàn)階段肺癌的主要治療方法，但對肺癌患者機體本身存在較大的殺傷性。分子靶向治療已經(jīng)被證明具有高效性’高度選擇性等優(yōu)良特點，但由于缺乏可靠靶點在臨床運用中并不廣泛，因此尋找肺癌治療的新靶點對于分子靶向治療十分重要。背景LncRNA(Longnon-codingRNA)是人體內(nèi)一大類復雜的RNA分子,其長度大于200nt，不編碼任何蛋白質(zhì)。早期的研究認為lncRNA屬于“噪聲”，現(xiàn)有許多研究表明，lncRNA可通過多種機制在轉錄水平以及轉錄后水平調(diào)控細胞生命活動，而且與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展有密切關系，這為肺癌的診斷和治療提供新的理論依據(jù)。lncRNA定義：

長度在200-100000nt之間的RNA分子不編碼蛋白

lncRNA參與細胞內(nèi)多種過程調(diào)控種類、數(shù)量、功能都不明確分類:lncRNA功能背景PVT1（Plasmacytomavarianttranslocation1）是一段長度為1957nt重要lncRNA分子，目前已有較多研究證實PVT1在癌癥的發(fā)生過程中充當促癌因子，PVT1在乳腺癌、卵巢癌及宮頸癌等許多癌癥細胞中都呈現(xiàn)高表達趨勢，因頻繁出現(xiàn)變異位點導致原癌基因的激活，與腫瘤發(fā)展密切相關。MTT法檢測分析得出結論，PVT1可增強乳腺癌細胞的增殖能力，干擾PVT1后可使乳腺癌細胞的增殖和侵襲能力均下降，因此PVT1可以作為一種新型分子標記物。目前關于PVT1影響腫瘤發(fā)生的作用機制研究側重PVT1與其鄰居基因MYC的互相影響，加上其自身能編碼miRNA，PVT1與其編碼的miRNA（如miR-1204、miR-1207）也是當前研究的熱點。Yang等發(fā)現(xiàn)，PVT1在非小細胞肺癌組織中的表達明顯高于鄰近的正常組織和正常支氣管上皮細胞，但PVT1具體如何調(diào)控肺癌的發(fā)生發(fā)展，其如何促進肺癌腫瘤的惡化，在肺癌中與哪些基因進行相互作用，其內(nèi)源競爭ceRNA（CompetingendogenousRNAs）作用機制是否在肺癌中扮演重要角色，這些都尚未可知。因此，深入的研究PVT1在肺癌中的調(diào)控機制具有重要意義，且根據(jù)調(diào)控機制可能獲得潛在的診斷或預后指標及基因治療的靶點。目的本文通過TCGA數(shù)據(jù)庫篩選出差異表達顯著lncRNA，以PVT1為研究對象，分析其在肺癌中分子調(diào)控機制，探討PVT1與miRNAs、mRNAs以及蛋白質(zhì)之間的關系，為更深層次地研究肺癌發(fā)生發(fā)展中分子調(diào)控機制提供數(shù)據(jù)支撐和理論參考。方法收集肺癌患者組織樣本TCGA數(shù)據(jù)庫篩選肺癌中差異表達的lncRNA實時熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測肺癌組織中l(wèi)ncRNA的表達水平利用軟件和數(shù)據(jù)庫分析和預測PVT1在肺癌lncRNA-miRNA-mRNA中可能的相互作用網(wǎng)絡結果和分析收集到來自浙江省腫瘤醫(yī)院的單原發(fā)性肺腺癌組織及癌旁組織（共7例）同時實驗開展過程中收集到1例肺部陳舊性病灶患者與1例健康血漿樣本樣本質(zhì)量分析顯示樣本RNA的提取質(zhì)量與完整性符合后續(xù)qRT-PCR實驗要求結果和分析結果和分析結果和分析qRT-PCR結果顯示：肺癌患者相比肺部陳舊性病灶患者EXOC3-AS1、PVT1表達出現(xiàn)了明顯差異結果和分析軟件分析預測出PVT1在肺癌中l(wèi)ncRNA-miRNA-mRNA的相互作用網(wǎng)絡結果和分析為更進一步了解PVT1在肺癌發(fā)生發(fā)展中的影響，利用分析工具對所預測的靶mRNAs可能參與的生物學功能進行富集分析，富集結果如圖6，其中富集相關性與顏色深淺成正比，由生物學過程到細胞過程相關性越來越強。深色較集中在細胞信號的傳遞以及黏附作用過程中。結果表明mRNAs靶基因PCDHA家族基因以及NOVA1等高度富集到細胞與胞間信號傳遞、細胞間黏附作用和系統(tǒng)的發(fā)育過程等生物學進程，與癌癥相通路相關。討論PVT1在惡性腫瘤調(diào)控機制中可能發(fā)揮的作用：討論PVT1在惡性腫瘤調(diào)控機制中可能發(fā)揮的作用：討論局限但本研究存在一些不足：1.樣本數(shù)量較少，實驗結果存在一定局限性。2.主要是對肺腺癌患者進行的研究3.PVT1預測的互作因子在細胞中能否相互作用，可否直接影響腫瘤細胞的增殖遷移，還需要進一步深入實驗和探討。個人觀點在前期研究發(fā)現(xiàn)，PVT1作為lncRNA（以RNA形式發(fā)揮作用）發(fā)揮促癌功能Cell報道：lncRNA