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文檔簡介
DNA的提取及鑒定DNA的提取及鑒定一、動物肝臟中DNA的提取一.實驗目的學習和掌握用濃鹽法從動物組織中提取DNA的原理和技術了解分離提取DNA的一般原理一、動物肝臟中DNA的提取一.實驗目的DNA的主要來源1.動物組織及器官:脾、肝、胸腺、魚類精子等。2.植物:種子的胚芽等3.微生物:細菌、酵母菌等核酸和蛋白質在生物體中以核蛋白的形式存在,其中DNA主要存在于細胞核中,RNA主要存在于核仁及細胞質中。DNA的主要來源核酸提取的主要步驟:1.破碎細胞:研磨、組織勻漿、超聲波、凍融;一硫氰酸胍、堿裂解;酶解(溶菌酶)2.除去與核酸結合的蛋白質以及多糖、脂類等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白質變性(SDS、異硫氰酸胍等)、蛋白酶處理、高鹽洗滌3.除去其他不需要的核酸分子4.沉淀核酸,去除鹽類,有機溶劑等雜質核酸提取的主要步驟:生物體組織細胞中的脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),大部分與蛋白質結合,以核蛋白——脫氧核糖核蛋白(DNP)和核糖核蛋白(RNP)的形式存在,這兩種復合物在不同的電解質溶液中的溶解度有較大差異。在低濃度的NaCl溶液中,DNP的溶解度隨NaCl濃度的增加而逐漸降低,當NaCl濃度達到0.14mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的1%(幾乎不溶);但當NaCl濃度繼續(xù)升高時,DNP的溶解度又逐漸增大,當NaCl濃度增至0.5mol/L時,DNP的溶解度約等于純水中的溶解度,當NaCl濃度繼續(xù)增至1.0mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的2倍(溶解度很大)。而RNP則不一樣,它在濃NaCl溶液和稀NaCl溶液中的溶解度都很大。因此,可以利用不同濃度的NaCl溶液將DNP和RNP分別抽提出來。
二.實驗原理生物體組織細胞中的脫氧核糖核酸(DNA的提取及鑒定ppt課件將抽提得到的DNP用十二烷基硫酸鈉(SDS)處理,DNA即與蛋白質分開,可用氯仿-異丙醇將蛋白質沉淀除去,而DNA溶于溶液中,加入適量的乙醇,DNA即析出,進一步脫水干燥,即得白色纖維狀的DNA粗制品。為了防止DNA(或RNA)酶解,提取時加入乙二胺四乙酸
(EDTA)。大部分多糖在用乙醇或異丙醇分級沉淀時即可除去。
DNA中的2-脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍色反應。將抽提得到的DNP用十二烷基硫酸鈉(動植物的DNA核蛋白能溶于水及高濃度的鹽溶液,但在0.14mol/l的鹽溶液中溶解度很低,而RNA核蛋白則溶于0.14mol/l鹽溶液,可利用不同濃度的氯化鈉溶液,將脫氧核糖核蛋白和核糖核蛋白從樣品中分別抽提出來。在核酸分子中,由于磷酸基的存在,使其酸性占優(yōu)勢,
DNA或RNA都能溶于水中,而不溶于有機溶劑。用絡合劑EDTA抑制核酸水解酶的活力,同時用去污劑SDS把蛋白質和DNA分開,再用氯仿-異丙醇作為蛋白質的變性劑沉淀蛋白質,最后用乙醇把DNA沉淀出來。動植物的DNA核蛋白能溶于水及高濃三、提取DNA的注意事項1.避免過酸、過堿及高溫2.加入DNA酶抑制劑:檸檬酸、氰化物、砷酸鹽、EDTA、SDS、苯酚等3.蛋白變性劑反映不宜過于劇烈,以防機械張力使核酸鏈破壞。4.加入RNA降解酶除RNA5.操作迅速三、提取DNA的注意事項1.避免過酸、過堿及高溫四、實驗器材1.搗碎機
2.離心機
3.手術剪
4.離心管
5.刻度吸管
6.燒杯(100ml,250ml)
7.玻棒
8.新鮮動物肝臟
9.石英比色皿
10.量筒(10ml,100ml)11.容量瓶(50ml)四、實驗器材1.搗碎機五、實驗試劑1、0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉溶液(pH6.8)。2、0.015mol/LNaCl-0.0015mol/L檸檬酸三鈉溶液:氯化鈉0.828克及檸檬酸三鈉0.341克溶于蒸餾水,稀釋至1000ml。3、95%乙醇(A.R.)。4、NaCl固體(A.R.)。5、5%SDS溶液:5gSDS溶于100ml水中。6、氯仿(A.R.)。7、V(氯仿):V(異戊醇)混合液20:1五、實驗試劑1、0.1mol/LNaCl-0.05mol/六、實驗操作1)粗提1.稱取豬肝8g于100ml的小燒杯中,用剪刀剪碎,加入2倍重的0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉緩沖液(16ml),高速勻漿。2.將勻漿液(~25ml)轉移到100ml離心管中,在4000r/min下離心10min,棄去上清液。沉淀中繼續(xù)加入25ml緩沖液,攪拌均勻后于4000r/min離心20min,取沉淀。2)分離DNP、除蛋白3.將上述沉淀轉移至250ml燒杯中,加入40ml0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉緩沖液、21ml氯仿/異戊醇、4ml5%SDS,用保鮮膜封口,振搖30min。4.緩慢加入3.6gNaCl(事先在研缽中研成粉末)使體系終濃度為1mol/L。將混合液轉移至離心管中于3500r/min離心20min,取上清水相(用滴管吸取并量體積)。六、實驗操作1)粗提3)沉淀DNA5.在水相中加入等體積95%乙醇,邊加邊用玻璃棒朝一個方向慢慢攪動直至溶液澄清,將DNA凝膠纏繞在玻璃棒上,用濾紙吸去多余的乙醇,得DNA粗品?!咀ⅰ坑貌0衾p繞DNA有困難時,亦可緩慢搖動燒杯以助于DNA聚集。
6.將DNA粗品用5mmol/LNaOH溶解并定容至50ml,作為待測樣品。3)沉淀DNADNA鑒定或定量(二苯胺法):
顏色反應可先完成標準曲線的制作,或配置一個標準管。DNA鑒定或定量(二苯胺法):DNA的提取及鑒定ppt課件CECS694-02IntroductiontoBioinformaticsUniversityofLouisvilleSpring2004Dr.EricRouchka(二)二苯胺法測定DNA含量二、原理
核酸含量的測定方法包括紫外吸收法、定磷法和分別針對DNA和RNA的顏色反應方法本實驗采用針對DNA的二苯胺法測DNA的含量。在酸性溶液中,DNA與二苯胺共熱生成藍色化合物,該物質在595nm有最大吸收,在40~400mg/mL范圍內其峰值與DNA含量成正比
100℃冰醋酸,少量硫酸藍色物DNA+CECS694-02IntroductiontoDNA鑒定或定量(二苯胺法):
空白管標準管測定管標準DNA溶液01.0待測樣品溶液1.0蒸餾水2.01.01.0二苯胺試劑4.04.04.060°C水浴30-40min,冷卻,595nm比色。計算:C測=C標*A測/A標w=C測*50ml/8g(DNAμg/g樣品)
DNA鑒定或定量(二苯胺法
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