知識發(fā)現(xiàn)工具入門

知識發(fā)現(xiàn)工具入門12/04/20141第1頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月

誰能讀這么多？

誰需要讀這么多?

發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新是不是一個數(shù)字的游戲?“首先必需認(rèn)識到，科研工作者都十分寶貴自己的時間，除極少數(shù)和自己工作關(guān)系十分密切的論文以外，絕大多數(shù)讀者都不會閱讀全文?！?/p>

-鄒承魯“我的科學(xué)之路”，2003年10月序言：為什么我們需要知識發(fā)現(xiàn)工具？第2頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月內(nèi)容綱要SciFinder的前世今生SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑SciFinder初體驗(yàn)實(shí)戰(zhàn)演練小結(jié)與習(xí)題12/04/20143第3頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder的前世今生ChemicalAbstracts1907：紙質(zhì)版1977：光盤版SciFinderAcademic1997：客戶端Now：網(wǎng)絡(luò)版12/04/20144第4頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder的前世今生12/04/20145SciFinder與CA（CD/Print）的區(qū)別數(shù)據(jù)庫CA（print）CA（CD）SciFinder包含文獻(xiàn)起始日期190719771907（上萬條記錄回溯到1900年前）得到最新信息的延遲幾個月一個多月一天主題檢索√√√普通物質(zhì)名稱檢索××√分子式檢索√√√結(jié)構(gòu)式（亞結(jié)構(gòu)式）檢索××√相似結(jié)構(gòu)式檢索××√反應(yīng)式（類反應(yīng)式）檢索××√分析與二次檢索××√檢索效率低不高高效檢索速度慢尚可快捷第5頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder的前世今生12/04/20146覆蓋多個學(xué)科傳統(tǒng)化學(xué)有機(jī)化學(xué)、高分子、應(yīng)用化學(xué)和化學(xué)工程、物理化學(xué)、無機(jī)化學(xué)和分析化學(xué)。生命科學(xué)遺傳學(xué),基因組學(xué),酶學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),實(shí)驗(yàn)內(nèi)科學(xué),生物化學(xué),生物技術(shù)學(xué),分子生物學(xué),微生物學(xué),細(xì)胞生物學(xué),藥理學(xué)等第6頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder的前世今生數(shù)據(jù)多元化CA（1907-）Medline醫(yī)學(xué)庫專利全文（歐洲、美國等61家機(jī)構(gòu)授權(quán)）180多國的文獻(xiàn)50多個語種12/04/20147第7頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder的前世今生12/04/20148SciFinder涵蓋了化學(xué)相關(guān)領(lǐng)域超過98%的文獻(xiàn)第8頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月溶劑，催化劑，產(chǎn)率等期刊專利論文會議報(bào)告物質(zhì)基因合成信息CAPlusMedlineRegistryCASReactChemcatsChemlistSciFinder的前世今生SciFinder內(nèi)容模塊12/04/20149第9頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑文獻(xiàn)檢索（References）CAPLUSSM

文摘數(shù)據(jù)庫MedlineNationalLibraryofMedicine數(shù)據(jù)庫物質(zhì)檢索（Substances）CASREGISTRYSM

物質(zhì)數(shù)據(jù)庫CHEMCATS--商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫CHEMLIST--管制數(shù)據(jù)庫反應(yīng)檢索（Reaction）CASREACT化學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)庫12/04/201410第10頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑12/04/201411主題機(jī)構(gòu)名專利號作者名（亞）結(jié)構(gòu)俗名分子式官能團(tuán)相似結(jié)構(gòu)文獻(xiàn)反應(yīng)物質(zhì)第11頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑知識發(fā)現(xiàn)目標(biāo)：獲得不知道的信息知識發(fā)現(xiàn)過程12/04/201412廣域檢索策略層層分析與精煉獲取結(jié)果獲得創(chuàng)意第12頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)SciFinderWeb的系統(tǒng)要求Windows用戶支持IE7.x或者FireFox2.xMac用戶支持Firefox和Safari首次需注冊@ OR @Java安裝（初次畫分子結(jié)構(gòu)時提示）信息來源：圖書館主頁12/04/201413第13頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)通過圖書館主頁獲取相關(guān)信息12/04/201414第14頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)進(jìn)入數(shù)據(jù)庫介紹頁面12/04/201415第15頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)進(jìn)入數(shù)據(jù)庫介紹頁面12/04/201416第16頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)進(jìn)入數(shù)據(jù)庫介紹頁面12/04/201417第17頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫注冊12/04/201418第18頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫注冊12/04/201419第19頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫注冊12/04/201420交大郵箱醫(yī)學(xué)院郵箱便于找回密碼第20頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫注冊12/04/201421通過鏈接確認(rèn)第21頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫登錄（）12/04/201422第22頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月SciFinder初體驗(yàn)數(shù)據(jù)庫主界面12/04/201423保存過的結(jié)果集郵件提醒結(jié)果集3個主要檢索入口及檢索選項(xiàng)對多個檢索式進(jìn)行邏輯運(yùn)算第23頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練文獻(xiàn)檢索主題檢索

例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究物質(zhì)檢索標(biāo)示符檢索

例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析結(jié)構(gòu)式檢索

例3:結(jié)構(gòu)檢索反應(yīng)檢索官能團(tuán)檢索

例4:由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)12/04/201424第24頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究策略制定nanostructuredmaterialsofpharmaceuticals檢索結(jié)果12/04/201425第25頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉12/04/201426第26頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉12/04/201427第27頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉12/04/201428一共12種分析方式一共6種精煉途徑第28頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉12/04/201429第29頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201430實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉第30頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201431實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉第31頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201432實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉第32頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201433實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉第33頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201434實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉第34頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月12/04/201435實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索例1:納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉文獻(xiàn)類型內(nèi)容分類第35頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：文獻(xiàn)檢索小結(jié)構(gòu)建主題檢索策略以介詞連接主要檢索詞能夠自動識別同義詞，近義詞，縮寫，并有截詞，斷詞等功能選擇恰當(dāng)?shù)慕Y(jié)果集合使用分析精煉功能縮小范圍學(xué)會Analyze/Refine功能的組合使用使用Categorize自動分類通過跳轉(zhuǎn)獲取更多信息可實(shí)現(xiàn)從文獻(xiàn)到物質(zhì)，反應(yīng)，引文的跳轉(zhuǎn)12/04/201436第36頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析baidu獲取物質(zhì)信息紫杉醇:Paclitaxel,TAXOL…CASNo:33069-62-412/04/201437第37頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析檢索獲得物質(zhì)詳細(xì)信息12/04/201438檢索框，可輸入物質(zhì)學(xué)名、俗名、CASNo等信息第38頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析檢索獲得物質(zhì)詳細(xì)信息12/04/201439第39頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析查看生物活性12/04/201440第40頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例2:紫杉醇的生物活性及靶點(diǎn)分析查看靶點(diǎn)12/04/201441第41頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索精確結(jié)構(gòu)檢索亞結(jié)構(gòu)檢索相似結(jié)構(gòu)檢索Markush檢索12/04/201442第42頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3:結(jié)構(gòu)檢索12/04/201443畫圖版，用于輸入結(jié)構(gòu)式第43頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索不需要安裝JAVA的結(jié)構(gòu)編輯器12/04/201444鉛筆重復(fù)基團(tuán)工具元素周期表可變基團(tuán)碳鏈工具選擇工具旋轉(zhuǎn)工具環(huán)鎖定工具正電子橡皮常用基團(tuán)R基團(tuán)定義工具可變位置連接工具模版工具原子鎖定工具鏡面旋轉(zhuǎn)工具負(fù)電子索套選擇工具常見環(huán)，多元環(huán)工具C原子和單鍵恢復(fù)工具結(jié)構(gòu)檢索選擇單雙鍵，RS構(gòu)型，不確定鍵定義工具結(jié)構(gòu)和反應(yīng)切換功能第44頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索需要安裝JAVA的結(jié)構(gòu)編輯器12/04/201445輸入物質(zhì)信息獲取結(jié)構(gòu)式第45頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索繪制結(jié)構(gòu)式12/04/201446第46頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索選擇立體構(gòu)型匹配度12/04/201447第47頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索得到物質(zhì)的鹽、聚合物、混合物或者配合物等等12/04/201448第48頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索12/04/20144933069-62-4第49頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索12/04/201450第50頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索得到物質(zhì)的所有修飾信息1547條12/04/201451第51頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索分析與精煉12/04/201452八大限定結(jié)構(gòu)再次限定同位素限定金屬包含限定商業(yè)化限定可提供性質(zhì)限定性質(zhì)數(shù)據(jù)限定可提供參考限定原子附屬性限定六大分析生物活性分析商業(yè)化分析元素分析反應(yīng)可行性分析物質(zhì)角色分析靶點(diǎn)分析第52頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索12/04/201453第53頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索12/04/201454第54頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索12/04/201455第55頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索12/04/201456第56頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索特定物質(zhì)[SpecificSubstance]以特定化學(xué)結(jié)構(gòu)所陳述的特定物質(zhì)，會被標(biāo)示CASNo.預(yù)測性物質(zhì)[PropheticSubstance]不會被標(biāo)示CASNo.一個Markush可以陳述上百或上千的化學(xué)物質(zhì)找到其他途徑無法檢索到的專利幫助進(jìn)行初步的專利評估12/04/201457第57頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索12/04/201458第58頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索12/04/201459第59頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索12/04/201460第60頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：物質(zhì)檢索例3：結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索12/04/201461第61頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月相似

結(jié)構(gòu)檢索亞結(jié)構(gòu)檢索精確結(jié)構(gòu)檢索實(shí)戰(zhàn)演練：結(jié)構(gòu)檢索小結(jié)精確結(jié)構(gòu)檢索：結(jié)果包含鹽和混合物等，母體結(jié)構(gòu)不能修改，不能修飾亞結(jié)構(gòu)檢索：結(jié)構(gòu)必須存在，母體結(jié)構(gòu)不能修改，但可以被修飾相似結(jié)構(gòu)檢索：母體結(jié)構(gòu)可修改可被修飾，給出相似度Markush檢索：獲得專利文獻(xiàn)中的預(yù)測性物質(zhì)12/04/201462第62頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：反應(yīng)檢索例4:由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)12/04/201463第63頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：反應(yīng)檢索例4:由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)acidhalide——aldehyde12/04/201464第64頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演練：反應(yīng)檢索例4:由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)12/04/201465第65頁，課件共73頁，創(chuàng)作于2023年2月實(shí)戰(zhàn)演