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分子生物學(xué)常用檢測(cè)技術(shù)詳解演示文稿本文檔共25頁;當(dāng)前第1頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分優(yōu)選分子生物學(xué)常用檢測(cè)技術(shù)本文檔共25頁;當(dāng)前第2頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分DNA—四種核苷酸(A-T-C-G)組成的多聚骨架所有組成DNA的核苷酸dATP,dTTP,dCTP,dGTP都由三種成分組成:1)一個(gè)2’-脫氧核糖(戊糖)2)一個(gè)含氮堿基嘌呤:A\G嘧啶:T/C3)三個(gè)磷酸基團(tuán)各單個(gè)核苷酸由5’和3’-碳形成的磷酸二酯鍵連接在一起本文檔共25頁;當(dāng)前第3頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分變性、復(fù)性、退火和淬火本文檔共25頁;當(dāng)前第4頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分基因本文檔共25頁;當(dāng)前第5頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分分子生物學(xué)常用技術(shù)

PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))核酸分子雜交基因芯片技術(shù)(biochip)DNA測(cè)序(DNAsequencing)DNA重組技術(shù)(DNArecombination)本文檔共25頁;當(dāng)前第6頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分

一、聚合酶鏈反應(yīng)

(PolymeraseChainReaction,PCR)體外基因擴(kuò)增技術(shù)

特異性強(qiáng)靈敏度高操作簡(jiǎn)單、省時(shí)對(duì)待檢原始材料質(zhì)量要求低高效率的基因擴(kuò)增技術(shù)本文檔共25頁;當(dāng)前第7頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分(一)PCR原理原理雙鏈DNA變性

退火鏈延伸

(膜板)

(雙鏈分成單鏈)

(膜板與引物雜交)

(DNA合成)不斷重復(fù)本文檔共25頁;當(dāng)前第8頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分PCR反應(yīng)體系Mg2+Mn2+dCTPdGTPdTTPdATPTaq

DNA聚合酶模板引物

和或和(二)PCR反應(yīng)的設(shè)計(jì)及影響因素本文檔共25頁;當(dāng)前第9頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分PCR的種類熒光定量PCR通用引物PCR多重PCR巢式PCRRT-PCR原位PCR免疫PCR……本文檔共25頁;當(dāng)前第10頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分TaqMan探針reverseprimerRQforwardprimer3'3'5'5'3'5'5'1.PolymerisationprobeRQ3'3'5'5'3'5'5'2.StranddisplacementQ3'3'5'5'3'5'5'3.CleavageR3'5'5'3'5'5'4.PolymerisationcompletedQRR=ReporterQ=Quencher3'熒光定量PCR本文檔共25頁;當(dāng)前第11頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分定量PCR的數(shù)學(xué)原理PCR理論方程N(yùn)=N0x(1+E)nN:擴(kuò)增數(shù)量N0:起始模板數(shù)量E:擴(kuò)增效率N:循環(huán)數(shù)

Log[DNA]循環(huán)數(shù)線性增長(zhǎng)期Linear平臺(tái)期Plateauy=

N0(1+e)n指數(shù)增長(zhǎng)期Geometric本文檔共25頁;當(dāng)前第12頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分定量PCR的數(shù)學(xué)原理Rn(熒光強(qiáng)度)循環(huán)數(shù)CycleNumber指數(shù)增長(zhǎng)期平臺(tái)期CT=-klogN0+bCt

(Cyclethreshold)值:是指每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定域值(threshold)時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。本文檔共25頁;當(dāng)前第13頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分PCR的臨床應(yīng)用對(duì)病原微生物核酸進(jìn)行快速檢測(cè)彌補(bǔ)免疫檢測(cè)的缺陷縮短診斷的窗口期(如HBV,HIV)用于藥物療效監(jiān)測(cè)和評(píng)估用于腫瘤基因表達(dá)方面的研究用于遺傳病的診斷本文檔共25頁;當(dāng)前第14頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分項(xiàng)目標(biāo)本采集HBV無菌注射器抽取2毫升靜脈血或其它體液注入無菌試管或抗凝管。HCVEB1.鼻咽拭子或體液標(biāo)本。2.也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。CMV1.尿液:中段晨尿20ml于加蓋試管。其他體液標(biāo)本或咽拭子。也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。TB1.痰液:患者深部咳痰1~3ml于無菌加蓋試管。2.其他組織標(biāo)本:留于無菌試管。3.也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。MP呼吸道病毒

咽拭子樣本采集要求本文檔共25頁;當(dāng)前第15頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分項(xiàng)目標(biāo)本采集所需容器CT男性:尿道分泌物:細(xì)小棉拭子伸入尿道約2~4厘米,旋轉(zhuǎn)數(shù)圈取出分泌物(應(yīng)略帶粘膜)。前列腺液、精液。女性:陰道分泌物:用無菌生理鹽水洗去宮頸外分泌物,再用無菌棉拭子插入宮頸內(nèi),停5秒后旋動(dòng)棉拭子采取分泌物。尿道分泌物:同上一次性無菌帶蓋的試管。NGUUTPHPVHSV本文檔共25頁;當(dāng)前第16頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分二、核酸分子雜交根據(jù)核酸變性和復(fù)性的原理,不同來源的變性單鏈核酸分子在合適的條件下,通過堿基互補(bǔ)形成雙鏈雜交體的過程稱為核酸分子雜交(molecularhybridization)。本文檔共25頁;當(dāng)前第17頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分1、遺傳病的診斷2、病原體的鑒定3、癌基因突變的檢測(cè)4、組織配型5、親子鑒定核酸分子雜交的臨床應(yīng)用本文檔共25頁;當(dāng)前第18頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分三、基因芯片技術(shù)基質(zhì)材料分,有尼龍膜、玻璃片、塑料、硅膠晶片、微型磁珠等。本文檔共25頁;當(dāng)前第19頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分

用點(diǎn)樣法固定在玻璃板上的DNA探針陣列原位合成法在玻璃等硬質(zhì)表面上直接合成的寡核苷酸探針陣列本文檔共25頁;當(dāng)前第20頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分基因芯片技術(shù)的應(yīng)用1、藥物篩選和新藥開發(fā)2、疾病診斷3、環(huán)境保護(hù)4、司法5、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)本文檔共25頁;當(dāng)前第21頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分四、測(cè)序技術(shù)CTTGATCTTCAGGTAGGCCTGAATCCT(一)一代測(cè)序技術(shù)本文檔共25頁;當(dāng)前第22頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分(二)二代測(cè)序技術(shù)Illumina公司的Solexa和Hiseq應(yīng)該說是目前全球使用量最大的第二代測(cè)序機(jī)器,這兩個(gè)系列的技術(shù)核心原理是相同的。Illumina/SolexaGenomeAnalyzer測(cè)序的基本原理是邊合成邊測(cè)序。在Sanger等測(cè)序方法的基礎(chǔ)上,通過技術(shù)創(chuàng)新,用不同顏色的熒光標(biāo)記四種不同的dNTP,當(dāng)DNA聚合酶合成互補(bǔ)鏈時(shí),每添加一種dNTP就會(huì)釋放出不同的熒光,根據(jù)捕捉的熒光信號(hào)并經(jīng)過特定的計(jì)算機(jī)軟件處理,從而獲得待測(cè)DNA的序列信息。本文檔共25頁;當(dāng)前第23頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分本文檔共25頁;當(dāng)前第24頁;編輯于星期三\1點(diǎn)59分技術(shù)特點(diǎn)比較第一代測(cè)序技術(shù)的

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