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日期:2017.11.10217蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能01蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括:一級結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
*
蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈中主鏈骨架原子的局部空間排布,不涉及氨基酸側(cè)鏈的構(gòu)象。
*穩(wěn)定因素:氫鍵二級結(jié)構(gòu)的主要結(jié)構(gòu)單位——肽單元(peptideunit)二級結(jié)構(gòu)的主要化學鍵——氫鍵(hydrogenbond)肽單元(peptideunit)
肽鍵與相鄰的兩個α-C原子所組成的殘基,稱為肽單元、肽單位、肽平面或酰胺平面(amideplane)。它們均位于同一個平面上,且兩個α-C原子呈反式排列。常見的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
肽單元上Cα所連的兩個單鍵的旋轉(zhuǎn)角度,決定兩個相連肽單元的相對空間位置,由于肽平面和氨基酸殘基側(cè)鏈R基對多肽鏈構(gòu)象的限制作用,二級結(jié)構(gòu)只有以下幾種主要形式:α-螺旋
(α-helix)β-折疊(β-pleatedsheet)β-轉(zhuǎn)角
(β–turnorβ-bend)無規(guī)卷曲
(randomcoil)α-helix多個肽平面通過Cα的旋轉(zhuǎn),相互之間緊密盤曲成穩(wěn)固的右手螺旋。主鏈螺旋上升,每3.6個氨基酸殘基上升一圈,螺距0.54nm。肽平面和螺旋長軸平行。氨基酸的側(cè)鏈伸向螺旋的外側(cè)。螺旋的穩(wěn)定是靠氫鍵。氫鍵方向與長軸平行。
β-pleatedsheet①是肽鏈相當伸展的結(jié)構(gòu),肽平面之間折疊成鋸齒狀,相鄰肽平面間呈110°角。②依靠兩條肽鏈或一條肽鏈內(nèi)的兩段肽鏈間的羰基氧與亞氨基氫形成氫鍵,使構(gòu)象穩(wěn)定。也就是說,氫鍵是穩(wěn)定β-折疊的主要化學鍵。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,由于氨基酸殘基側(cè)鏈R基的相互作用進一步盤曲或折迭而形成的特定構(gòu)象。也就是整條多肽鏈中所有原子或基團在三維空間的排布位置。
肌紅蛋白(myoglobin,Mb)一條長為153個氨基酸的多肽鏈和一個血紅素輔基組成。共有8段-螺旋結(jié)構(gòu)(A-H)功能:儲存O2蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括:
蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的形成和穩(wěn)定主要靠次級鍵,包括氫鍵、鹽鍵、疏水鍵以及范德華力等。此外,某些蛋白質(zhì)中二硫鍵也起著重要的作用。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)二條或二條以上具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈組成的蛋白質(zhì)。其中,每條具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈稱為亞基(subunit)。由兩個或兩個以上亞基之間彼此以非共價鍵相互作用形成的更為復雜的空間構(gòu)象,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。
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