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文檔簡介
關(guān)于地中海貧血的分子基礎(chǔ)及產(chǎn)前診斷第1頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月遺傳性血紅蛋白病Geneticdisordersofhumanhemoglobin
異常血紅蛋白
Abnormalhemoglobin,Structuralvariants
地中海貧血(地貧)
Thalassemias-thalassemia
-thalassemia
遺傳性持續(xù)性胎兒血紅蛋白
Hereditarypersistenceoffetalhemoglobin(HPFH)第2頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Thalassemia地中海貧血是全球最大的單基因遺傳病之一中國南方不同高發(fā)地區(qū)人群攜帶率1
~
23%研究背景第3頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月全球血紅蛋白病人群負(fù)荷WHO地區(qū)人口(百萬)出生(百萬)純合子出生(千)非洲65030.0230美洲73017.55.0亞洲315084.0120.0歐洲78011.01.6大洋洲300.50.2合計(jì)5340143.0356.8第4頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月中國南方地中海貧血人群攜帶率
地區(qū)攜帶率(%)
地貧β地貧
廣東8.532.54
廣西14.956.78
四川1.922.18
臺(tái)灣4.201.10
香港5.023.41Xu,etal.JClinPathol2004,57:517-22.
Cai,etal.ChiJEpidemiol
2002,23:281-5.
第5頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月排序出生缺陷分析例數(shù)發(fā)生頻率(/萬)1先天性心臟病26019.662重型地貧20815.733多指20015.124肢體短縮1118.395唇裂/腭裂1098.24廣州市主要出生缺陷的發(fā)生率(1998-2001)
第6頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Pedigreefor-thalassemiainatypicalfamily.地中海貧血:常染色體隱性遺傳病第7頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地貧是嚴(yán)重致死、致殘性遺傳性血液病常染色體隱性遺傳病受累基因:地貧-珠蛋白基因(16p13.3)
β地貧-β珠蛋白基因(11p15.3)突變純合子:重型地貧-致死
中間型地貧
-致殘病理學(xué)基礎(chǔ):/β鏈比例失衡第8頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地貧純合子:致死性出生缺陷重型地貧:胎兒水腫綜合征
早產(chǎn)死胎或出生前后死亡
可導(dǎo)致嚴(yán)重產(chǎn)科并發(fā)癥
無理想治療方法重型地貧
出生后1年內(nèi)發(fā)病
多于未成年前因嚴(yán)重貧血而夭折
輸血和去鐵治療可維持,代價(jià)昂貴第9頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月家系樣品采集現(xiàn)場中間型地貧是嚴(yán)重致殘性遺傳病第10頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月研究地中海貧血的意義
重癥地貧患兒的出生是世界公認(rèn)的公共衛(wèi)生問題
通過產(chǎn)前診斷阻止重癥患兒出生是首選預(yù)防措施
WHO優(yōu)先推薦在發(fā)展中國家實(shí)施預(yù)防的遺傳性疾病
預(yù)防地貧是中國南方高發(fā)區(qū)減少出生缺陷的戰(zhàn)略需求研究背景第11頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月中國需要解決的研究主題
發(fā)展用于臨床和預(yù)防的分子診斷技術(shù)
高發(fā)地區(qū)人群中的遺傳流行病學(xué)調(diào)查
開展人群水平的地中海貧血預(yù)防第12頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月指導(dǎo)制定計(jì)劃大人群監(jiān)控和預(yù)防用于基因分型用于產(chǎn)前診斷
診斷篩查預(yù)防地中海貧血的研究策略研究背景遺傳流行病學(xué)調(diào)查建立一系列診斷標(biāo)準(zhǔn)和診斷技術(shù)第13頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地中海貧血的臨床特征小細(xì)胞低色素性溶血型貧血(中、重度)黃疸肝脾腫大(脾大明顯)骨髓擴(kuò)增發(fā)育遲緩合并感染Bart’s水腫胎(α地貧,宮內(nèi)或出生后半小時(shí)內(nèi)死亡)第14頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地中海貧血的血液學(xué)表型特征
RBC參數(shù)
MCVMCH
細(xì)胞形態(tài)變化
Hb電泳分析
HbA2
()或()HbBart’sHbH()HbE()第15頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地貧血象:紅細(xì)胞著色不足、異形紅細(xì)胞和骨髓成紅血細(xì)胞增多癥第16頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月血紅蛋白電泳圖譜123451.正常人HB2.輕型地貧3.異常HBE雜合子4.新生兒HBBart’s(地貧標(biāo)準(zhǔn)型)5.HBHNormalAA2AEBart’sAFHA+-500V,25min第17頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地貧發(fā)生的分子病理學(xué)經(jīng)典機(jī)制
α地貧:基因缺失使基因功能丟失地貧:結(jié)構(gòu)基因變異使轉(zhuǎn)錄異常第18頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月
-50kb-10kb0kb10kb20kb30kb
(--SEA)Deletion(-
4.2)Deletion(-
3.7)Deletion21導(dǎo)致α地貧的不同類型的基因缺失第19頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月α
GlobingenesaffectedbythalassemiadeletionSilentcarrierThalassemiatraitHbHdiseaseHydropsfetalisNormal第20頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月α地貧疾病嚴(yán)重程度的單倍型順序21T
2–
–1
2T1
–1T
––第21頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Hematologicaldataoftheproposituseandherfamilymembers.
Ι1Ι2Ⅱ1Ⅱ2Ⅱ3Ⅱ4Ⅱ5Ⅲ1Ⅲ2Sex/age(Y)F/49M/54M/33F/27F/25M/22F/35F/1M/5Hb(g/L)118150173126135135118112141RBC(×1012)5.634.965.706.234.514.575.876.095.02MCV(fL)64.585.788.162.187.882.363.056.278.5MCH(pg)21.030.230.420.229.929.520.118.428.1HbA(%)97.897.593.197.096.695.796.990.097.4HbA2(%)2.202.503.272.983.373.283.122.182.65HbF(%)003.6200007.790Genotype--11.1/ααΑα/ααΑα/αα--11.1/ααΑα/ααΑα/αα--11.1/αα--11.1/ααΑα/αα第22頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月JiaSQ,etal.JClinPathol,2004;57:164-7.
第23頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月DifferentpointmutationsreducingglobingeneexpressionEXON1IVS1
EXON2EXON3
IVS2PromotermutationRNAsplicingInitiationmutationFrameshiftNonsensePoly(A)signalRund.&Rachmilewitz.N.Engl.J.Med.2005,353:1135-46.
第24頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月世界上不同種族的常見β地貧突變類型
種族突變類型
地中海人
IVS-1,position110(GA)CD39,nonsense(CAGTAG)IVS-1,position1(GA)IVS-2,position745(CG)IVS-1,position6(TC)IVS-2,position1(GA)黑人
29,(AG);88,(CT)Poly(A),(AATAAAAACAAA)第25頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月東南亞人,中國人
CD41-42,Frameshift(CTTT)IVS-2,position654(CT)
28,(AG);HbE(GA)CD17,nonsense(AAGTAG)IVS-1,position5(GC)亞洲印地安人
IVS-1,position5(GC)619-bpdeletionCD8-9,Frameshift(+G)IVS-1,position1(GT)CD41-42,Frameshift(CTTT)第26頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月SexProbandfemale
Motherfemale
Father
maleBrothermale
Husband
maleRBC(x1012)5.7
4.84.75.86.4Hb(g/L)
139
105154144145MCV(fl)
73.6
68.288.273.467.1MCH(pg)23.6
21.833.024.722.8MCHC(g/L)
357
320374336340RDW(%)
0.149
0.1520.1320.1440.159HbA(%)
94.3
93.697.294.097.1HbA2(%)
5.7
6.42.86.02.9Genotype
β-90/βN
β-90/βNβN/βNβ-90/βNβN/βNβ/αratio
2.130
2.2193.7162.2385.341Resultsofbloodanalysis,DNAdiagnosisandmRNAdetectioninthefamilymembers.第27頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Sequencingofthe-globingeneamplifiedfromtheprobandHeterozygosityfortheCTsubstitutionatposition-90oftheβ-globingene第28頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月近年來發(fā)現(xiàn)的部分中國南方新突變基因
突變?chǔ)林榈鞍谆?1.1大片段缺失α珠蛋白基因
2CD118(+TCA)β珠蛋白基因
90(C→T)β珠蛋白基因73(A→T)β珠蛋白基因28(A→C)β珠蛋白基因
CDs15/16(+G)β珠蛋白基因CD38(A)第29頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地中海貧血的產(chǎn)前診斷
胎兒取樣技術(shù)
DNA診斷技術(shù)
-地貧的診斷-地貧的診斷第30頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月羊膜穿刺(amniocentesis)
抽取胎兒樣品示意圖第31頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月植入前基因診斷
Preimplantationgeneticdiagnosis(PGD)超聲產(chǎn)前診斷
Prenataldiagnosis:Ultrasoundmeasurement
母體外周血分離胎兒細(xì)胞進(jìn)行產(chǎn)前診斷
Prenataldiagnosis:Fetalcellsinthematernalcirculation母體血漿或血清中胎兒DNA分析
AnalysisoffetalDNAinmaternalplasmaandserum目前及今后的胎兒產(chǎn)前診斷新技術(shù)第32頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月DingC,ChiuRW,LauTK,LeungTN,ChanLC,ChanAY,CharoenkwanP,NgIS,LawHY,MaES,XuX,WanapirakC,SanguansermsriT,LiaoC,AiMA,ChuiDH,CantorCR,LoYM.
MSanalysisofsingle-nucleotidedifferencesincirculatingnucleicacids:Applicationtononinvasiveprenataldiagnosis.
ProcNatlAcadSciUSA.200420;101(29):10762-7.第33頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月單堿基延伸產(chǎn)物的質(zhì)譜分析MFF父親的突變類型SABER:singleallelebaseextensionreaction第34頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月分子量FMStandardprotocol
SABERprotocol在母血漿DNA中排除父親的β地貧突變——++雙親基因型不同:第35頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月CaseCD41/42-CTTTIVS2654CTnt–28AGCD17ATStandardprotocolSABERFetalgenotypeWeeksgestation1FMN/N112FMN/N183F
MN/N214MFF
/N185MF
F
/M176FM
F/N117FM
F/N148FN/N79
FF/N1210MF
N/N1711F
F/N2012M&FN.A.N.A.N/N18鑒定母血漿DNA中的父親β地貧突變第36頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月單倍型分析用于鑒定母血漿DNA中的父親等位基因CaseMotherFatherHBBmutantalleleHBBWTalleleSNPGallelePaternalHBBmutationFetalHBBgenotype3CCGCGC
N/N11CCGCGC
F/N12CCGCGC
N.A.N/N第37頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地中海貧血的產(chǎn)前診斷
胎兒取樣技術(shù)
DNA診斷技術(shù)
-地貧的診斷-地貧的診斷第38頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月DNA診斷技術(shù)多重PCR(multiplexPCR)等位基因特異性性寡核苷酸雜交(ASO)反向點(diǎn)雜交(RDB)變性高效液相色譜(DHPLC)基于微孔板
(microtiterwell-based)高通量檢測
實(shí)時(shí)PCR(real-timePCR)第39頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月
-50kb-10kb0kb10kb20kb30kb
(--SEA)Deletion(-
4.2)Deletion(-
3.7)Deletion21導(dǎo)致α地貧的不同類型的基因缺失第40頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Locationofprimersanddetectionof--SEAdeletionbygap-PCR第41頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Genotypingofthe--SEAallelesbyGap-PCR
第42頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月ChongSS,etal.Blood.2000;95(1):360-2.第43頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月寡核苷酸探針雜交技術(shù)第44頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月ASO探針檢測
-地貧基因診斷結(jié)果第45頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月PCRBBBBBBgDNAHybridizationDetectionStreptavidin-PODColorSignalMMembraneASONMNMNMSubstrate(TMB)反向點(diǎn)雜交技術(shù)第46頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月RDBanalysis:applicationtorapidprenataldiagnosisforeightβthalassaemiamutations.GenotypeFatherCDs41-42(CTTT)/NMotherIVS-2-654(CT)/NFetusCDs41-42/IVS-2-654Normalcontrol
N/N第47頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Human-globingeneandthePCRamplicons5’UTREXON1IVS1EXON2IVS2IVS2EXON33’UTRFA(453bp)FB(364bp)FC(423bp)-90,-73,-29,-28cd2cd13-14,cd14-15,cd15-16,cd17cd26,cd27-28IVS1-1,IVS1-5cd37,cd38cd41-42,cd43cd71-72IVS2-5,IVS2-16IVS2-654,IVS2-666第48頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月FragmentMutationpatternsNormalpatternsTotalMutationMutation+SNPHeterozygousHomozygousFA12221237FB5152224FC03227Total1740566868uniquelyprofiledDHPLCpatternsobservedfrom795DNAsamples第49頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月實(shí)驗(yàn)結(jié)果第50頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月實(shí)驗(yàn)結(jié)果第51頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月實(shí)驗(yàn)結(jié)果第52頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月實(shí)驗(yàn)結(jié)果第53頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月實(shí)驗(yàn)結(jié)果第54頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月中國南方和β地中海貧血的預(yù)防計(jì)劃人群篩查預(yù)防計(jì)劃的策略
醫(yī)院水平(Hospital-based)的預(yù)防計(jì)劃
社區(qū)水平(community-based)的預(yù)防計(jì)劃
家系擴(kuò)展篩查(screeningextendedfamilies)第55頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Carrierscreeningforandthalassemiainpregnancy:theresultsofan11-yearprospectiveprograminGuangzhouMaternalandNeonatalHospitalGuangzhouMaternalandNeonatalHospitalLiaoCLiJHuangYNLiQMFengQZhongHZCuiYYSouthernMedicalUniversityMoQHLiLYHuaLZhangJZZengRJiaSQXuXMPrenatDiagn2004,25:163-71第56頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月地貧攜帶者篩查及產(chǎn)前診斷流程被檢對(duì)象(婚前或孕中期)血液學(xué)分析(MCV,HbA2變化)排除地貧地貧攜帶者遺傳咨詢,配偶檢查血液學(xué)分析(MCVHbA2變化)地貧攜帶者排除地貧遺傳咨詢雙親基因分析胎兒產(chǎn)前診斷第57頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月年份篩查廣州總篩查孕婦數(shù)孕婦數(shù)丈夫數(shù)
篩查發(fā)現(xiàn)的檢測出的完成的產(chǎn)前陽性孕婦數(shù)陽性夫婦數(shù)診斷數(shù)α地貧
(%)β地貧(%)α地貧(%)β地貧(%)α/β地貧(%)α地貧(%)β地貧(%)1993398968393350232(5.8)129(3.2)13(3.7)8(2.3)10(2.9)12(92.3)7(87.5)1994456471617421265(5.8)164(3.6)18(4.3)8(1.9)9(2.1)16(88.9)8(100)1995390271751361227(5.8)142(3.6)17(4.7)7(1.9)12(3.3)15(88.2)7(100)1996499474460464285(5.7)181(3.6)19(4.1)8(1.7)12(2.6)17(89.5)8(100)1997439271989401250(5.7)158(3.6)21(5.2)7(1.7)10(2.5)18(85.7)7(100)1998453275378425263(5.8)172(3.8)17(4.0)8(1.9)12(2.8)17(100)8(100)1999501680141465285(5.7)186(3.7)24(5.2)8(1.7)14(3.0)23(95.8)8(100)OutcomesofscreeningprograminGZMNH1993-2003
第58頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月年份篩查廣州總篩查孕婦數(shù)孕婦數(shù)丈夫數(shù)
篩查發(fā)現(xiàn)的檢測出的完成的產(chǎn)前陽性孕婦數(shù)陽性夫婦數(shù)診斷數(shù)α地貧
(%)β地貧(%)α地貧(%)β地貧(%)α/β地貧(%)α地貧(%)β地貧(%)2000449281817418256(5.7)172(3.8)21(5.0)7(1.7)16(3.8)21(100)7(100)2001452180152411254(5.6)164(3.6)17(4.1)8(1.9)12(2.9)17(100)8(100)2002469580667415260(5.6)163(3.4)16(3.9)8(1.9)11(2.7)16(100)8(100)2003412486393372227(5.5)152(3.6)15(4.0)6(1.6)13(3.5)15(100)6(100)Total49221
860758
4503
2804(5.7)
1783(3.6)
198(4.4)
83(1.8)
131(2.9)
187(95.8)
82(98.8)
(cont’d)第59頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月診斷結(jié)果基因型例數(shù)正常
30雜合子(total)35CDs41-42(TCTT)/N14IVS-2-654(C>T)/N8-28(A>G)/N5CD17(A>T)/N3CD26(G>A)/N2-29(A>G)/N1CDs27-28(+C)/N1Unknown/NorNormal1Prenataldiagnosisin83fetusesat-riskforthalassemia第60頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月診斷結(jié)果基因型例數(shù)純合子或雙重雜合子(總數(shù))18CDs41-42(TCTT)/IVS-2-654(C>T)6CDs41-42(TCTT)/-28(A>G)4CDs41-42(TCTT)/CD17(A>T)2IVS-2-654(C>T)/CD17(A>T)2CDs41-42(TCTT)/CDs41-42(TCTT)1CDs41-42(TCTT)/CDs27-28(+C)1IVS-2-654(C>T)/CDs71-72(+A)1IVS-2-654(C>T)/CD43(G>T)1總數(shù)83(cont’d)第61頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月胎兒診斷
產(chǎn)前診斷例數(shù)
α地貧β地貧
總數(shù)
(%)
正常413069(25.6)攜帶者9235125(46.3)受累胎兒*541872(26.7)胎兒流產(chǎn)213(1.11)誤診000.0總數(shù)(%)187(69.3)83(30.7)270(100)Resultsin266pregnancieswhereaprecisediagnosiswasachieved*ThreeHbHdiseaseinvolved第62頁,課件共71頁,創(chuàng)作于2023年2月Detectionofthe--SEA/deletionby1%agarosegelelectrophoresisofamplifiedfragments
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