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文檔簡(jiǎn)介
分子生物學(xué)
MolecularBiology
浙江大學(xué)羅建紅該課件根據(jù)GENESVII制作遺傳學(xué)簡(jiǎn)史
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)2002HumangenomesequencedWhoandwhatexperimentsbuildupthesemilestones?關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Avirulent(無(wú)毒力的)mutantsofavirushavelostthecapacitytoinfectahostcellproductively,thatis,tomakemorevirus.
Transfection
(轉(zhuǎn)染)ofeukaryoticcellsistheacquisitionofnewgeneticmarkersbyincorporationofaddedDNA.
Transformingprinciple
(轉(zhuǎn)化要素)isDNAthatistakenupbyabacteriumandwhoseexpressionthenchangesthepropertiesoftherecipientcell.
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)支持核心概念的標(biāo)志性實(shí)驗(yàn)Griffith,1928:肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
Averyetal.,1944:轉(zhuǎn)化要素的純化并鑒定為DNAHersheyandChase,1952:噬菌體T2感染細(xì)菌真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)DNA是轉(zhuǎn)化的要素Griffith,1928:肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化(transformation)實(shí)驗(yàn)thecapsularpolysaccharidethesmoothPneumococcaltypestheanimalcannotdestroythebacteriaarevirulentAveryetal.,1944:轉(zhuǎn)化要素的純化并鑒定為DNA
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)噬菌體T2的遺傳物質(zhì)是DNAHersheyandChase,1952:
噬菌體T2感染細(xì)菌,
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)DNA的轉(zhuǎn)染可使真核細(xì)胞獲得新表型
第1章基因是DNA第1節(jié)DNA是遺傳物質(zhì)關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Antiparallel(逆向平行)strandsofthedoublehelixareorganizedinoppositeorientation,sothatthe5′endofonestrandisalignedwiththe3′endoftheotherstrand.Basepairing(堿基配對(duì))describesthespecific(complementary)interactionsofadeninewiththymineorofcytosinewithguanosineinaDNAdoublehelix(theformerisreplacedbyadeninewithuracilindoublehelicalRNA).
Complementary(互補(bǔ))basepairsaredefinedbythepairingreactionsindoublehelicalnucleicacids(AwithTinDNAorwithUinRNA,andCwithG).
Supercoiling(超螺旋)describesthecoilingofaclosedduplexDNAinspacesothatitcrossesoveritsownaxis.
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋構(gòu)成DNA的組分
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋
多核苷酸鏈的組成:
磷酸核糖骨架和堿基
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋WatsonandCrickin1953
X-raydiffractiondatashowedthatDNAhastheformofaregularhelix,makingacompleteturnevery34?(3.4nm),withadiameterof~20?(2nm).Sincethedistancebetweenadjacentnucleotidesis3.4?,theremustbe10nucleotidesperturn.
ThedensityofDNAsuggeststhatthehelixmustcontaintwopolynucleotidechains.Theconstantdiameterofthehelixcanbeexplainedifthebasesineachchainfaceinwardandarerestrictedsothatapurineisalwaysoppositeapyrimidine,avoidingpartnershipsofpurine-purine(toothick)orpyrimidine-pyrimidine(toothin).
Irrespectiveoftheactualamountsofeachbase,theproportionofGisalwaysthesameastheproportionofCinDNA,andtheproportionofAisalwaysthesameasthatofT.SothecompositionofanyDNAcanbedescribedbytheproportionofitsbasesthatisG+C.Thisrangesfrom26%to74%fordifferentspecies.
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋平展的堿基對(duì)
垂直于
磷酸核糖骨架
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋二條DNA鏈形成雙螺旋Eachbasepairisrotated~36aroundtheaxisofthehelixrelativetothenextbasepair.So~10basepairsmakeacompleteturnof360.Thetwistingofthetwostrandsaroundoneanotherformsadoublehelixwithanarrowgroove(~12?across)andawidegroove(~22?across),ascanbeseenfromthescalemodelofFigure1.8.Thedoublehelixisright-handed;theturnsrunclockwiselookingalongthehelicalaxis.ThesefeaturesrepresenttheacceptedmodelforwhatisknownastheB-formofDNA
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋
A-T和G-C的配對(duì)使嘌呤總是面對(duì)嘧啶,并使DNA雙螺旋維持恒定的寬度。
第1章基因是DNA第2節(jié)DNA雙螺旋WatsonandCrick's1953NaturepaperproposingadoublehelixstructureforDNA:
AstructureforDeoxyriboseNucleicAcid
2April1953
MOLECULARSTRUCTUREOFNUCLEICACIDSWewishtosuggestastructureforthesaltofdeoxyribosenucleicacid(D.N.A.).Thisstructurehasnovelfeatureswhichareofconsiderablebiologicalinterest.…WearemuchindebtedtoDr.JerryDonohueforconstantadviceandcriticism,especiallyoninteratomicdistances.WehavealsobeenstimulatedbyaknowledgeofthegeneralnatureoftheunpublishedexperimentalresultsandideasofDr.M.H.F.Wilkins,Dr.R.
E.Franklinandtheirco-workersatKing'sCollege,London.Oneofus(J.D.W.)hasbeenaidedbyafellowshipfromtheNationalFoundationforInfantileParalysis.J.D.WATSONF.H.C.CRICKMedicalResearchCouncilUnitfortheStudyofMolecularStructureofBiologicalSystems,CavendishLaboratory,Cambridge.VOL171,page737,1953
關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)DNA聚合酶(DNApolymerases)areenzymesthatsynthesizeadaughterstrand(s)ofDNA(underdirectionfromaDNAtemplate).Maybeinvolvedinrepairorreplication.
DNA酶(DNAases)areenzymesthatattackbondsinDNA.
內(nèi)切酶(Endonucleases)cleavebondswithinanucleicacidchain;theymaybespecificforRNAorforsingle-strandedordouble-strandedDNA.
外切酶(Exonucleases)cleavenucleotidesoneatatimefromtheendofapolynucleotidechain;theymaybespecificforeitherthe5′or3′endofDNAorRNA.
DNA母鏈(ParentalstrandsofDNA)arethetwocomplementarystrandsofduplexDNAbeforereplication.
復(fù)制叉(Replicationfork)isthepointatwhichstrandsofparentalduplexDNAareseparatedsothatreplicationcanproceed.
核糖酶(Ribonucleases)areenzymesthatdegradeRNA.Exo(ribo)nucleasesworkprogressively,typicallydegradingonebaseatatimefromthe3′endtowardthe5′end.Endo(ribo)nucleasesmakesinglecutswithintheRNAchain.
RNA聚合酶(RNApolymerases)areenzymesthatsynthesizeRNAusingaDNAtemplate(formallydescribedasDNA-dependentRNApolymerases).
RNA酶(RNAases)areenzymesthatdegradeRNA.
半保留復(fù)制(Semiconservativereplication)isplishedbyseparationofthestrandsofaparentalduplex,eachthenactingasatemplateforsynthesisofacomplementarystrand.
第1章基因是DNA第3節(jié)DNA的半保留性復(fù)制堿基配對(duì)為DNA復(fù)制提供了核心機(jī)制
第1章基因是DNA第3節(jié)DNA的半保留性復(fù)制DNA復(fù)制是半保留性的
第1章基因是DNA第3節(jié)DNA的半保留性復(fù)制Meselson-Stahlexperimentof1958DensitygradientcentrifugationN15orN14medium復(fù)制叉是指是從解旋的親代雙鏈與新復(fù)制的子代雙鏈之間的DNA區(qū)
第1章基因是DNA第3節(jié)DNA的半保留性復(fù)制關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)DNA或RNA的變性(DenaturationofDNAorRNA)describesitsconversionfromthedouble-strandedtothesingle-strandedstate;separationofthestrandsismostoftenplishedbyheating.
雜交(Hybridization)isthepairingofcomplementaryRNAandDNAstrandstogiveanRNA-DNAhybrid.
融解(Melting)ofDNAmeansitsdenaturation.
融解溫度(Meltingtemperature)ofDNAisthemid-pointofthetransitionwhenduplexDNAtodenaturedbyheatingtoseparateintosinglestrands.
復(fù)性(Renaturation)isthereassociationofdenaturedcomplementarysinglestrandsofaDNAdoublehelix.
第1章基因是DNA第4節(jié)通過(guò)堿基配對(duì),核酸鏈間可以雜交堿基配對(duì)不僅發(fā)生于雙鏈DNA,也發(fā)生于單鏈RNA(或DNA)分子內(nèi)和分子間的相互作用
第1章基因是DNA第4節(jié)通過(guò)堿基配對(duì),核酸鏈間可以雜交變性的DNA單鏈能復(fù)性為雙鏈形式
第1章基因是DNA第4節(jié)通過(guò)堿基配對(duì),核酸鏈間可以雜交濾膜雜交可確認(rèn)溶液中的變性DAN(或RNA)中是否含有與固定于濾膜上的核酸鏈互補(bǔ)的序列
第1章基因是DNA第4節(jié)通過(guò)堿基配對(duì),核酸鏈間可以雜交關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Backgroundlevelofmutation
(本底突變)
describestherateatwhichsequencechangesaccumulateinthegenomeofanorganism.Itreflectsthebalancebetweentheoccurrencespontaneousmutationsandtheirremomvalbyrepairsystems,andischaracteristicforanyspecies.
Deletions(缺失)aregeneratedbyremovalofasequenceofDNA,theregionsoneithersidebeingjoinedtogether.
Inducedmutations(誘導(dǎo)突變)resultfromtheactionofamutagen(whichmayactdirectlyonthebasesinDNA)orindirectly,butineithercasetheresultisachangeinthesequenceofDNA.
Insertions(插入)areidentifiedbythepresenceofanadditionalstretchofbasepairsinDNA.
Leaky
mutants(滲漏突變)havesomeresidualfunction,eitherbecausethemutantproteinispartiallyactive(inthecaseofamissensemutation),orbecauseasmallamountofwild-typeproteinismade(inthecaseofanonsensemutation).
Mutagens(致突變?cè)?/p>
increasetherateofmutationbyinducingchangesinDNAsequence,directlyorindirectly.
Pointmutations
(點(diǎn)突變)
arechangesinvolvingsinglebasepairs.
Revertants
(回復(fù)突變體)arederivedbyreversionofamutantcellororganism.
Spontaneous
mutations(自發(fā)突變)occurastheresultofnaturaleffects,dueeithertomistakesinDNAreplicationortoenvironmentaldamage.
Suppression
(抑制作用)describestheoccurrenceofchangesthateliminatetheeffectsofamutationwithoutreversingtheoriginalchangeinDNA.
ExtragenicSuppressor
(基因外抑制物)isusuallyagenecodingamutanttRNAthatreadsthemutatedcodoneitherinthesenseoftheoriginalcodonortogiveanacceptablesubstitutefortheoriginalmeaning.
Transition
(轉(zhuǎn)換)isamutationinwhichonepyrimidineissubstitutedbytheotherorinwhichonepurineissubstitutedfortheother.
Transversion
(顛換)isamutationinwhichapurineisreplacedbyapyrimidineorviceversa.
第1章基因是DNA第5節(jié)突變,即DNA序列的改變堿基的化學(xué)修飾能誘導(dǎo)突變
第1章基因是DNA第5節(jié)突變,即DNA序列的改變堿基同類(lèi)物摻入DNA也能誘導(dǎo)突變
basemispairing
bromouracil(BrdU),
第1章基因是DNA第5節(jié)突變,即DNA序列的改變關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Backmutation(回復(fù)突變)reversestheeffectofamutationthathadinactivatedagene;thusitrestoreswildtype.
Forwardmutations(正向突變)inactivateawild-typegene.
Hotspot(熱點(diǎn))isasiteatwhichthefrequencyofmutation(orbination)isverymuchincreased.
Modifiedbases(堿基修飾)areallthoseexcepttheusualfourfromwhichDNA(T,C,A,G)orRNA(U,C,A,G)aresynthesized;theyresultfrompostsyntheticchangesinthenucleicacid.
Neutralsubstitutions(中性替代)inaproteinarethosechangesofaminoacidsthatdonotaffectactivity.
Silentmutations(靜默突變)donotchangetheproductofagene.
第1章基因是DNA第7節(jié)突變熱點(diǎn)自發(fā)突變可發(fā)生于E.coli
lacI
的全基因,但是具有高發(fā)的熱點(diǎn)
第1章基因是DNA第7節(jié)突變熱點(diǎn)10x,even100x5-甲基胞嘧啶的脫氨基產(chǎn)生胸腺嘧啶(引起C-G變?yōu)門(mén)-A),然而,胞嘧啶脫氨基產(chǎn)生尿嘧啶后,通常會(huì)被清除,并由胞嘧啶取代。
Thereasonfortheexistenceofthehotspotsisthat5-methylcytosinesuffersspontaneousdeaminationatanappreciablefrequency.
第1章基因是DNA第7節(jié)突變熱點(diǎn)
堿基的化學(xué)修飾能引起突變
Thedeaminationofcytosinegeneratesuracil.However,E.colicontainsanenzyme,uracil-DNA-glycosidase,thatremovesuracilresiduesfromDNA.ThisactionleavesanunpairedGresidue,anda"repairsystem"theninsertsaCbasetopartnerit.ThenetresultofthesereactionsistorestoretheoriginalsequenceoftheDNA.
第1章基因是DNA第7節(jié)突變熱點(diǎn)關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Cistron(順?lè)醋樱?/p>
isthegeneticunitdefinedbythecis/transtest;equivalenttogene.
Complementationgroup
(互補(bǔ)組)isaseriesofmutationsunabletocomplementwhentestedinpairwisecombinationsintrans;definesageneticunit(thecistron).
Gene(cistron)isthesegmentofDNAinvolvedinproducingapolypeptidechain;itincludesregionsprecedingandfollowingthecodingregion(leaderandtrailer)aswellasinterveningsequences(introns)betweenindividualcodingsegments(exons).
Onegene:oneenzymehypothesisisthebasisofmoderngenetics:thatageneisastretchofDNAcodingforasinglepolypeptidechain.*ThemutationresponsibleforcreatingMendel’swrinkled-peamutantwasidentifiedonlyin1990asanalterationthatinactivatesthegeneforastarchbranchingenzyme!*morepreciselyexpressedasonegene:onepolypeptidechain
第1章基因是DNA第8節(jié)順?lè)醋邮且欢蜠NA,與基因同義基因編碼蛋白質(zhì)。通過(guò)突變體蛋白質(zhì)的特征可以闡明基因是否顯性。隱性等位基因不產(chǎn)生蛋白(或產(chǎn)生無(wú)功能的蛋白),因而對(duì)表型沒(méi)有貢獻(xiàn)。
第1章基因是DNA第8節(jié)順?lè)醋邮且欢蜠NA,與基因同義通過(guò)互補(bǔ)檢驗(yàn)定義順?lè)醋?/p>
Thecomplementationtestisusedtodeterminewhethertwomutationslieinthesamegeneorindifferentgenes.
第1章基因是DNA第8節(jié)順?lè)醋邮且欢蜠NA,與基因同義關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Gain-of-function
mutation
(功能獲得突變)representsacquisitionofanewactivity.Itisdominant.
Leaky
mutants(滲漏突變)havesomeresidualfunction,eitherbecausethemutantproteinispartiallyactive(inthecaseofamissensemutation),orbecauseasmallamountofwild-typeproteinismade(inthecaseofanonsensemutation).
Loss-of-functionmutation
(功能喪失突變)
inactivatesagene.Itisrecessive.
Nullmutation
(無(wú)效突變)
completelyeliminatesthefunctionofagene,usuallybecauseithasbeenphysicallydeleted.
Polymorphism
(多態(tài)性)referstothesimultaneousoccurrenceinthepopulationofgenomesshowingallelicvariations(asseeneitherinallelesproducingdifferentphenotypesor-forexample-inchangesinDNAaffectingtherestrictionpattern).
第1章基因是DNA第9節(jié)多等位基因的特性w基因位點(diǎn)有一系列等位基因,其表型從野生型顏色(紅色)到色素完全缺乏(inD.melanogaster)
。
第1章基因是DNA第9節(jié)多等位基因的特性ABO血型基因位點(diǎn)編碼半乳糖轉(zhuǎn)移酶,其特異性決定了血型
第1章基因是DNA第9節(jié)多等位基因的特性Thereisnotnecessarilyauniquewild-typealleleatanyparticularlocus.Controlofthehumanbloodgroupsystemprovidesanexample.Lackoffunctionisrepresentedbythenulltype,Ogroup.ButthefunctionalallelesAandBprovideactivitiesthatarecodominantwithoneanotheranddominantoverOgroup.關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Bivalent(雙價(jià)體)isthestructurecontainingallfourchromatids(tworepresentingeachhomologue)atthestartofmeiosis.
Breakageandreunion(斷裂和重接)describesthemodeofgeneticbination,inwhichtwoDNAduplexmoleculesarebrokenatcorrespondingpointsandthenrejoinedcrosswise(involvingformationofalengthofheteroduplexDNAaroundthesiteofjoining).
Chiasma(交叉)(pl.chiasmata)isasiteatwhichtwohomologouschromosomesappeartohaveexchangedmaterialduringmeiosis.
Crossing-over(交換)describesthereciprocalexchangeofmaterialbetweenchromosomesthatoccursduringmeiosisandisresponsibleforgeneticbination.
HybridDNA(雜合DNA)isanothertermforheteroduplexDNA.
第1章基因是DNA第10節(jié)重組是DNA片段的交換交叉的形成和重組的產(chǎn)生geneticlinkagefrequencyofbinationlinkagemapcentiMorganAcrucialconceptintheconstructionofageneticmapisthatthedistancebetweengenesdoesnotdependontheparticularallelesthatareused,butonlyonthegeneticloci.
第1章基因是DNA第10節(jié)重組是DNA片段的交換重組與二個(gè)母本雙鏈DNA之間互補(bǔ)鏈的配對(duì)有關(guān)
第1章基因是DNA第10節(jié)重組是DNA片段的交換ThecomplementarityofthetwostrandsofDNAisessentialforthebinationprocess.binationinvolvesaprocessinwhichthesinglestrandsintheregionofthecrossoverexchangetheirpartners(hybridDNA).perfectmatchmismatch關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Codon(密碼子)isatripletofnucleotidesthatrepresentsanaminoacidoraterminationsignal.
Frameshiftmutation(移碼突變)resultsfromaninsertionordeletionthatchangesthephaseoftriplets,sothatallcodonsaremisreadafterthesiteofmutation.
Geneticcode
(遺傳密碼)isthecorrespondencebetweentripletsinDNA(orRNA)andaminoacidsinprotein.
Initiationcodon
(起始密碼子)isaspecialcodon(usuallyAUG)usedtostartsynthesisofaprotein.
ORF
(開(kāi)放閱讀框)isanopenreadingframe;presumedlikelytocodeforaprotein.
Readingframe
(閱讀框)isoneofthreepossiblewaysofreadinganucleotidesequenceasaseriesoftriplets.
Terminationcodon
(終止密碼子)isoneofthree(UAG,UAA,UGA)thatcausesproteinsynthesistoterminate.
第1章基因是DNA第11節(jié)遺傳密碼為三聯(lián)子移碼突變表明遺傳密碼是以不重疊三聯(lián)子的方式從一個(gè)固定的起始點(diǎn)讀出
第1章基因是DNA第11節(jié)遺傳密碼為三聯(lián)子HowasequenceofnucleotidesinDNArepresentsasequenceofaminoacidsinprotein?Codonsarewrittenintheconventional5′→3′direction.開(kāi)放閱讀框始于AUG、以三聯(lián)子連續(xù)之,直至終止密碼子
第1章基因是DNA第11節(jié)遺傳密碼為三聯(lián)子關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Codingregion
(編碼區(qū))isapartofthegenethatrepresentsaproteinsequence.
Leader
(前導(dǎo)序列)isanontranslatedsequenceatthe5′endofanmRNAprecedingthestartcodon.
RNAsplicing
(RNA剪接)istheprocessofexcisingthesequencesinRNAthatcorrespondtointrons,sothatthesequencescorrespondingtoexonsareconnectedintoacontinuousmRNA.
Trailer(拖尾序列)isanontranslatedsequenceatthe3′endofanmRNAfollowingtheterminationcodon.
Transcription
(轉(zhuǎn)錄)issynthesisofRNAonaDNAtemplate.
Translation(翻譯)issynthesisofproteinonthemRNAtemplate.
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系色氨酸合成酶基因的重組圖譜與氨基酸序列相符
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系ThecolinearityofgeneandproteinRNA是通過(guò)以DNA的一條鏈為模板
指導(dǎo)互補(bǔ)堿基配對(duì)合成的
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系基因可以長(zhǎng)于蛋白質(zhì)編碼的序列
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系在細(xì)菌,轉(zhuǎn)錄和翻譯發(fā)生于同一區(qū)間(compartment)
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系在真核細(xì)胞,轉(zhuǎn)錄發(fā)生于細(xì)胞核,而翻譯發(fā)生于細(xì)胞漿
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系基因表達(dá)是一個(gè)多步驟的過(guò)程
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系非連續(xù)的基因通過(guò)前體RNA表達(dá)出來(lái),
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系真核細(xì)胞mRNA的修飾:5’端加帽和3’端加poly(A)
第1章基因是DNA第12節(jié)編碼序列與蛋白質(zhì)的關(guān)系cis
configuration(順式)describestwositesonthesamemoleculeofDNA.
trans
configuration(反式)oftwositesreferstotheirpresenceontwodifferentmoleculesofDNA(chromosomes).
第1章基因是DNA第13節(jié)順式作用位點(diǎn)和反式作用分子關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)i.g.twomutationsDNA上的調(diào)控區(qū)具有蛋白結(jié)合位點(diǎn),而編碼區(qū)則表達(dá)為RNA
第1章基因是DNA第13節(jié)順式作用位點(diǎn)和反式作用分子Soagenecanbeinactivatedeitherbyamutationinacontrolsiteorbyamutationinacodingregion.
cis-作用位點(diǎn)控制鄰近DNA,但并不影響其他等位基因
第1章基因是DNA第13節(jié)順式作用位點(diǎn)和反式作用分子一個(gè)蛋白的trans-作用突變將會(huì)影響受該蛋白控制基因的二個(gè)等位基因
第1章基因是DNA第13節(jié)順式作用位點(diǎn)和反式作用分子
關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)
第1章基因是DNA第14節(jié)DNA和RNA均可提供遺傳信息Centraldogma(中心法則)describesthebasicnatureofgeneticinformation:sequencesofnucleicacidcanbeperpetuatedandinterconvertedbyreplication,transcription,andreversetranscription,buttranslationfromnucleicacidtoproteinisunidirectional,becausenucleicacidsequencescannotberetrievedfromproteinsequences.
Prion(毒蛋白)isaproteinaceousinfectiousagent,whichbehavesasaninheritabletrait,althoughitcontainsnonucleicacid.ExamplesarePrPSc,theagentofscrapieinsheepandbovinespongiformencephalopathy,(McKinleyetal,1983)andPsi,whichconfersaninheritedstateinyeast.
Reversetranscription(逆轉(zhuǎn)錄)issynthesisofDNAonatemplateofRNA;plishedbyreversetranscriptaseenzyme.
Scrapie(羊的搔癢病原)isainfectiveagentmadeofprotein.
Virion(病毒體)isthephysicalvirusparticle(irrespectiveofitsabilitytoinfectcellsandreproduce).
Viroid(類(lèi)病毒)isasmallinfectiousnucleicacidthatdoesnothaveaproteincoat.中心法則:核酸的信息可以傳承或轉(zhuǎn)譯,但信息一旦翻譯為蛋白質(zhì)就不可逆了.
第1章基因是DNA第14節(jié)DNA和RNA均可提供遺傳信息雙鏈或單鏈核酸均通過(guò)堿基配對(duì)原則合成互補(bǔ)鏈而復(fù)制
第1章基因是DNA第14節(jié)DNA和RNA均可提供遺傳信息不同物種基因組中核酸的量差異巨大
第1章基因是DNA第14節(jié)DNA和RNA均可提供遺傳信息PSTV(土豆紡棰管類(lèi)病毒)RNA是一個(gè)環(huán)形分子,形成廣泛的雙鏈結(jié)構(gòu),并被許多鏈內(nèi)環(huán)所中斷.嚴(yán)重型和溫和型僅是三個(gè)位點(diǎn)的不同.
第1章基因是DNA第14節(jié)DNA和RNA均可提供遺傳信息
二個(gè)經(jīng)典的實(shí)驗(yàn)證實(shí)DNA是遺傳物質(zhì):1、從一株肺炎雙球菌分離到的DAN能使另一株獲得其特征;2、從親代噬菌體向子代遺傳的唯一組分是DNA后來(lái),也已知DNA的轉(zhuǎn)染可使真核細(xì)胞獲得新的特征。
DAN是由二條逆向平行的核苷酸鏈形成的雙螺旋,而核苷酸則由單核苷酸通過(guò)
5’3’磷酸二酯鍵連接而成。
DAN雙螺旋的外部為核苷酸鏈骨架,嘌呤和嘧啶堿基以A與T和G與C互補(bǔ)配對(duì)的方式堆積于雙螺旋的中心。在半保留復(fù)制時(shí),DNA雙鏈相互分離,并利用互補(bǔ)堿基配對(duì)的方式合成子鏈。RNA轉(zhuǎn)錄也采用互補(bǔ)堿基配對(duì)的方式,因此,RNA代表了DNA雙鏈中的某一鏈。
DNA可以編碼蛋白質(zhì)。遺傳密碼揭示了DNA序列和蛋白質(zhì)序列之間的關(guān)系。DNA雙鏈中僅有其中一條鏈編碼蛋白質(zhì)。DNA編碼序列由一系列密碼子組成,它們有一個(gè)固定的起點(diǎn)。一個(gè)密碼子由3個(gè)連續(xù)的核苷酸構(gòu)成,代表一個(gè)氨基酸。
染色體由連續(xù)的
DNA雙螺旋長(zhǎng)鏈構(gòu)成,含有許多基因。每個(gè)基因(或稱(chēng)順?lè)醋樱?/p>
被轉(zhuǎn)錄成RNA產(chǎn)物,若是蛋白質(zhì)編碼基因則進(jìn)而翻譯成多肽鏈。一個(gè)基因的RNA或蛋白質(zhì)產(chǎn)物稱(chēng)為反式作用。通過(guò)互補(bǔ)試驗(yàn)將基因定義為一個(gè)一定長(zhǎng)度DNA片段的單元。DNA上調(diào)節(jié)毗鄰基因活性的某一位點(diǎn)稱(chēng)為順式作用。
第1章基因是DNA小結(jié)-1
一個(gè)基因可以有多個(gè)等位基因,功能缺失性突變是產(chǎn)生隱性等位基因的原因。無(wú)效等位基因是指功能完全缺失的基因,功能獲得性突變則產(chǎn)生顯性等位基因。基因突變包括DNA中A-T和C-G堿基對(duì)序列的改變。編碼區(qū)序列的突變可以導(dǎo)致相應(yīng)蛋白氨基酸序列的改變。而一個(gè)堿基的插入或缺失引起的移碼突變會(huì)改變后續(xù)的閱讀框,這就導(dǎo)致突變位點(diǎn)后一系列新的氨基酸序列。點(diǎn)突變只改變一個(gè)密碼子相應(yīng)的氨基酸種類(lèi)。點(diǎn)突變可以通過(guò)原突變位點(diǎn)的回復(fù)突變而復(fù)原。插入突變也可能因插入堿基的丟失而回復(fù),但缺失突變無(wú)法恢復(fù)。原始位點(diǎn)的基因突變可以因另一個(gè)不同的基因突變而被間接抑制。突變誘導(dǎo)物可以增加自發(fā)突變的機(jī)率,突變可以集中發(fā)生在熱點(diǎn)序列,其中一種熱點(diǎn)是由5—脫氧嘧啶脫氨基造成的。正向突變的發(fā)生機(jī)率是每一代106,而回復(fù)突變很少見(jiàn)。且并不是所有突變都會(huì)影響表型。盡管細(xì)胞中由DNA攜帶所有的遺傳信息,而病毒有單鏈或雙鏈DNA或RNA基因組。而類(lèi)病毒是比較低級(jí)的病原體,只有少量環(huán)狀RNA,而且沒(méi)有保護(hù)殼。其RNA并不能編碼蛋白,它的永續(xù)性和發(fā)病機(jī)理還不清楚。羊搔癢病病毒是一個(gè)蛋白性的傳染物質(zhì)。
第1章基因是DNA小結(jié)-2關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)bp(堿基對(duì))
isanabbreviationforbasepairs;distancealongDNAismeasuredinbp.
Restrictionenzymes(限制性酶)
recognizespecificshortsequencesofDNAandcleavetheduplex(sometimesattargetsite,sometimeselsewhere,dependingontype).
Restrictionmap
(限制性酶切圖譜)
isalineararrayofsitesonDNAcleavedbyvariousrestrictionenzymes.
Genetic(linkage)map
遺傳圖譜,根據(jù)基因座(有表型)或位點(diǎn)之間的重組頻率,單位為cM(厘摩)
Physicalmap
物理圖譜,根據(jù)限制性酶切圖譜或序列測(cè)定,單位為bp,kb
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜DNA能被限制性酶切成大小不等的片段,進(jìn)而通過(guò)凝膠電泳分離
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜CanweproceedfurtherfromthesedatatogenerateamapthatplacesthesitesofbreakageatdefinedpositionsontheDNA?
雙酶切技術(shù)能分析二個(gè)切點(diǎn)的相對(duì)位置
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜根據(jù)雙重酶切片段的重疊,可以分析A-片段和B-片段之間的聯(lián)系,進(jìn)而繪制限制性酶切基因圖譜
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜末端標(biāo)記的限制性酶切片段,其大小之間反映了切點(diǎn)到標(biāo)記末端的距離。有助于限制性酶切圖譜的構(gòu)建。
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜限制性酶切圖譜是DAN上間隔一定距離酶切位點(diǎn)的線性序列。下圖是根據(jù)限制性酶A和B
雙重酶切產(chǎn)生的片段所構(gòu)建的。
第2章從基因到基因組第1節(jié)限制性酶切基因圖譜SotheDNAisdividedintoaseriesofregionsofdefinedlengthsthatliebetweensitesrecognizedbytherestrictionenzymes.AnimportantfeatureisthatarestrictionmapcanbeobtainedforanysequenceofDNA,irrespectiveofwhethermutationshavebeenidentifiedinit,or,indeed,whetherwehaveanyknowledgeofitsfunction.關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)Haplotype
(半合子型)istheparticularcombinationofallelesinadefinedregionofsomechromosome,ineffectthegenotypeinminiature.OriginallyusedtodescribedcombinationsofMHCalleles,itnowmaybeusedtodescribeparticularcombinationsofRFLPs.
SNP
(singlenucleotidepolymorphism,單核苷酸多態(tài)性)isanysiteatwhichasinglenucleotidehaschangedwhentwo(haploid)genomesarecompared.
Geneticpolymorphism(遺傳多態(tài)性)referstothecoexistenceofmultipleallelesatalocus.
第2章從基因到基因組第2節(jié)基因組差異有多大?一個(gè)突變?nèi)舾淖兿拗泼盖形稽c(diǎn),則該突變能被限制性片段分析所檢出
第2章從基因到基因組第2節(jié)基因組差異有多大?restrictionfragmentlengthpolymorphism(RFLP)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性
某家系3代限制性位點(diǎn)多態(tài)性分析,在DNA片段標(biāo)志水平展示了孟德?tīng)柗蛛x律。在所有可能的配對(duì)重組中,發(fā)現(xiàn)所用的限制性標(biāo)志中存在4個(gè)等位型,在每一世代中獨(dú)立分離。
第2章從基因到基因組第2節(jié)基因組差異有多大?
第2章從基因到基因組第2節(jié)基因組差異有多大?Sobinationfrequencycanbemeasuredbetweenarestrictionmarkerandavisiblephenotypicmarker,andageneticmapcanincludebothgenotypicandphenotypicmarkers.
限制性多態(tài)性可以作為遺傳標(biāo)志用于從表型(如眼的顏色)測(cè)量重組距離。該圖僅顯示了該雙倍體
對(duì)應(yīng)于其他基因組等位基因的DNA片段。如果一個(gè)限制性標(biāo)志與一個(gè)特定的表型相關(guān),那么,這個(gè)限制性位點(diǎn)肯定位于復(fù)雜該表型的基因附近。若突變使條帶由正常式樣變成病人式樣,那末該突變則與疾病基因非常接近。
第2章從基因到基因組第2節(jié)基因組差異有多大?限制性標(biāo)志意義:遺傳病的診斷疾病基因的克隆1、真核基因常常是非連續(xù)的Exon
(外顯子)isanysegmentofaninterruptedgenethatisrepresentedinthematureRNAproduc
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