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文檔簡(jiǎn)介
蛋白質(zhì)的基本單位第1頁(yè)/共44頁(yè)胺基(Aminogroup)
羧基(Carboxylicacid)
氫原子Aminoacid,Protein,Enzyme,Coenzyme張憲彰96/10/02第2頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸
(Aminoacid)
為蛋白質(zhì)的基本單位。有20種不同的胺基酸。每個(gè)胺基酸之間以勝肽(peptidebond)連結(jié)。勝肽鍵是由兩個(gè)胺基酸分別提供羧基和胺基,兩者之間經(jīng)脫水反應(yīng)(失去H2O)後所生成的。第3頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸的分類1.非極性或疏水性的R基群(Non-polarorhydrophobicRgroups)2.不帶電荷或親水性的R基群(UnchargedorhydrophilicRgroups)3.帶負(fù)電荷的R基群(NegativelychargedRgroups)4.帶正電荷的R基群(PositivelychargedRgroups)第4頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸的種類中文名(英文名)結(jié)構(gòu)縮寫功用丙胺酸
(Alanine)Ala(A)是肌肉組織及腦部中樞神經(jīng)的能源之一,可幫助產(chǎn)生抗體,協(xié)助糖類及有機(jī)酸的代謝。
纈胺酸(Valine)Val(V)促進(jìn)腦力,改善肌肉協(xié)調(diào)功能及安定情緒。白胺酸(Leucine)Leu(L)是身體許多重要生化成份的原料,包括與能量代謝有關(guān)的物質(zhì),以及腦中與警覺(jué)性有關(guān)的神經(jīng)傳導(dǎo)物。異白胺酸(Isoleucine)Ile(I)脯胺酸(Proline)Pro(P)對(duì)於維持關(guān)節(jié)及肌腱的正常功能有舉足輕重的地位,它還可以強(qiáng)化心肌的功能。
Hydroxyproline,(-OH)4-Hydroxyproline非極性或疏水性的R基群第5頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸的種類中文名(英文名)結(jié)構(gòu)縮寫功用甲硫胺酸(Methionine)Met(M)能防止頭髮、皮膚及指甲之病變,可以降低膽固醇濃度、降低肝脂肪、防止中毒、協(xié)助腎臟排泄「阿摩尼亞」(Ammonia)。
苯丙胺酸(Phenylalanine)Phe(F)是腦部及神經(jīng)細(xì)胞製造神輕傳導(dǎo)物「新腎上腺素」的原料,新腎上腺素可以使我們精神上保持警覺(jué),改善記憶及對(duì)抗憂鬱。
色胺酸(Tryptophan)Trp(W)是天然的精神鬆弛劑,能改善睡眠,減輕焦慮及憂慮,改善頭痛,加強(qiáng)免疫功能,減少心臟血管疾病機(jī)會(huì)。甘胺酸(Glycine)Gly(G)協(xié)助從血液中釋放氧氣到組織細(xì)胞,幫助荷爾蒙的製造,加強(qiáng)免疫功能。
絲胺酸(Serine)Ser(S)幫助肌肉及肝臟儲(chǔ)存肝糖,協(xié)助製造抗體,合成神經(jīng)纖維之外鞘。
非極性或疏水性的R基群不帶電荷或親水性的R基群第6頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸的種類中文名(英文名)結(jié)構(gòu)縮寫功用酥胺酸(Threonine)Thr(T)是人體膠原蛋白,及牙齒紶瑯質(zhì)之重要成份,它還可以防止肝臟脂肪堆積,及促進(jìn)胃腸道功能更平順。
半胱胺酸(Cysteine)Cys(C)清除自由基,延續(xù)老化及抗輻射,抗空氣污染,中和毒物,它是皮膚構(gòu)造的重要成分(10~14%),幫助皮膚再生,使?fàn)C傷及外傷加速癒合。
酪胺酸(Tyrosine)Tyr(Y)它是腦中神經(jīng)傳導(dǎo)物之一,可協(xié)助克服憂鬱、改善記憶。促進(jìn)甲狀腺,腎上腺及腦下垂體之功能。天門冬醯酸(Asparagine)Asn(N)在1806年最先由蘆筍汁中分離出來(lái)而得名。麩胺醯酸(Glutamine)Gln(Q)不帶電荷或親水性的R基群第7頁(yè)/共44頁(yè)胺基酸的種類中文名(英文名)結(jié)構(gòu)縮寫功用天門冬胺酸(Asparticacid)(Aspartate)Asp(D)幫助阿摩尼亞(Ammonia)排泄,恢復(fù)疲勞,增加身體耐力。
麩胺酸(Glutamicacid)(Glutamate)Glu(E)又稱腦細(xì)胞的食物,可以提高腦部功能,促進(jìn)傷口癒合,減輕疲勞,減輕酒癮,降低對(duì)醣類之嗜好。它還可促進(jìn)生長(zhǎng)激素合成,增加肌肉量及減少脂肪囤積。離胺酸(Lysine)Lys(K)可幫助鈣質(zhì)吸收,促進(jìn)膠原蛋白形成,幫助抗體荷爾蒙及酵素之製造,可以輔助治療單純性泡疹。精胺酸(Arginine)Arg(R)可增強(qiáng)人體對(duì)抗細(xì)菌、病毒及腫瘤之免疫力、促進(jìn)生長(zhǎng)激素之分泌,促進(jìn)傷口癒合及肝細(xì)胞再生,還能促進(jìn)肌肉形成及減少脂肪囤積。組胺酸(Histidine)His(H)是人體血紅素的主要成份之一,可以用來(lái)治療類風(fēng)溼關(guān)節(jié)炎,過(guò)敏疾病、貧血病,缺乏組胺酸會(huì)造成聽(tīng)力減退。組織胺(Histamine)帶負(fù)電荷的R基群帶正電荷的R基群第8頁(yè)/共44頁(yè)蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu):二級(jí)結(jié)構(gòu):因兩α碳上的R基團(tuán)與前後相鄰基團(tuán)的吸引力或排斥力,使得兩相鄰勝肽鍵平面間的轉(zhuǎn)動(dòng)限制在一定角度範(fàn)圍,而造成規(guī)律的兩種主要構(gòu)形為α螺旋(αhelix)和β長(zhǎng)帶(β
sheet),其主要構(gòu)成力量都是氫鍵。
三級(jí)結(jié)構(gòu):分子內(nèi)各部分的二級(jí)結(jié)構(gòu)再相互組合,構(gòu)成完整的球形。四級(jí)結(jié)構(gòu):數(shù)個(gè)相同或不同的三級(jí)結(jié)構(gòu)分子再結(jié)合成一較大的複合體,才能進(jìn)行完整的活性功能,構(gòu)成四級(jí)結(jié)構(gòu)的每單位分子,稱為次體(subunit)。一級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)構(gòu)KKGGLVAH第9頁(yè)/共44頁(yè)
蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)第10頁(yè)/共44頁(yè)四級(jí)結(jié)構(gòu)(QuateruaryStructure):
一些蛋白質(zhì)由二個(gè)以上的peptide鏈(次單位)組成,代表蛋白質(zhì)的整體結(jié)構(gòu)。
第11頁(yè)/共44頁(yè)三位一體密碼(Thetripletcode)-mRNA與蛋白質(zhì)的關(guān)係傳訊RNA(mRNA)(messengerRNA)2.核醣RNA(rRNA)(ribosomalRNA)3.轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)(transferRNA)第12頁(yè)/共44頁(yè)三種RNA各有所司1.信使RNA(mRNA,messengerRNA)
用來(lái)傳遞DNA的遺傳訊息並作為蛋白質(zhì)合的模板,佔(zhàn)RNA總量5%。2.核醣RNA(rRNA,ribosomalRNA)
用來(lái)將mRNA所攜帶的蛋白質(zhì)胺基酸訊息序列,轉(zhuǎn)譯成相對(duì)應(yīng)的胺基酸,佔(zhàn)RNA總量的15%。3.轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA,transferRNA)
核糖體RNA,是組成核糖核蛋白的主要成份。第13頁(yè)/共44頁(yè)rRNA是構(gòu)成核糖體的成份,且具有酵素活性,一些蛋白質(zhì)會(huì)經(jīng)過(guò)核孔進(jìn)入細(xì)胞核,在核仁附近與rRNA結(jié)合成兩種次單元(大單元及小單元,若是真核生物其大單元為60S,小單元為40S),這兩個(gè)次單元會(huì)再次經(jīng)過(guò)核孔離開(kāi)細(xì)胞核,到達(dá)細(xì)胞質(zhì)中並組合成為mRNA-核醣體複體(mRNA-ribosomalcomplex)。
rRNA的結(jié)構(gòu)和功能RibosomalRNA(rRNA)isacomponentoftheribosomes,theproteinsyntheticfactoriesinthecell.EukaryoticribosomescontainfourdifferentrRNAmolecules:18s,5.8s,28s,and5srRNA.ThreeoftherRNAmoleculesaresynthesizedinthenucleolus,andoneissynthesizedelsewhere.rRNAmoleculesareextremelyabundant.Theymakeupatleast80%oftheRNAmoleculesfoundinatypicaleukaryoticcell.http://www.biochem.uwo.ca/meds/medna/rRNA.html第14頁(yè)/共44頁(yè)
tRNA的結(jié)構(gòu)和功能攜帶胺基酸來(lái)完成蛋白質(zhì)合成:tRNA為單股RNA,折疊成苜蓿葉型(十字形),它包含一個(gè)補(bǔ)密碼及攜帶一個(gè)對(duì)應(yīng)的胺基酸,當(dāng)一連串不同tRNA上面的這些補(bǔ)密碼與mRNA上的一連串密碼子互相配對(duì)時(shí),其所攜帶的胺基酸就會(huì)連接在一起(這個(gè)過(guò)程皆發(fā)生在核糖體上,如同上面所提到的rRNA
具有酵素活性,它可以協(xié)助胺基酸的連接)
第15頁(yè)/共44頁(yè)mRNA與蛋白質(zhì)的合成mRNA是攜帶DNA訊息,經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)譯作用合成功能性的蛋白質(zhì)。DNA會(huì)經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄作用,將其遺傳密碼經(jīng)過(guò)mRNA送到細(xì)胞質(zhì)中轉(zhuǎn)譯出蛋白質(zhì),來(lái)表現(xiàn)遺傳性狀,mRNA中每三個(gè)鹼基序列稱為密碼子(如GGA,CUA,)。(這麼做可確保原始遺傳訊息不會(huì)被破壞;且因?yàn)镽NA是單股,容易被分解,故在mRNA進(jìn)行轉(zhuǎn)譯後,可確保細(xì)胞質(zhì)不會(huì)有過(guò)量的RNA且不會(huì)過(guò)度轉(zhuǎn)譯太多蛋白質(zhì))mRNA是以DNA為模板轉(zhuǎn)錄的單鏈多聚核苷酸,每三個(gè)鹼基代表一個(gè)氨基酸訊息,稱三聯(lián)體密碼。起始密碼子(AUGorGUG)與tRNA作用後便可進(jìn)行蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)譯。第16頁(yè)/共44頁(yè)DNA-mRNA-ProteinGeneticinformationProtein(enzyme)PCRtechnology(轉(zhuǎn)錄)(轉(zhuǎn)譯)第17頁(yè)/共44頁(yè)一種新的胺基酸,命名為「對(duì)氨基苯丙氨酸」(p-aminophenylalanine,簡(jiǎn)稱pAF)前加州LaJolla,Scripps研究中心,目前任職賓州Lancaster,Franklin&Marshall學(xué)院的RyanMehl博士就質(zhì)疑:「為何生命只選定20個(gè)胺基酸?是否更多的胺基酸能產(chǎn)生更強(qiáng)勢(shì)的生物?在物競(jìng)天擇的壓力下,能否更有效的適應(yīng)環(huán)境?」為了釐清問(wèn)題,Mehl博士與Scripps研究中心PeterSchultz教授所領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì),利用大腸桿菌的生命代謝路徑,由簡(jiǎn)單的碳素來(lái)源成功產(chǎn)生了一種新的胺基酸,並命名為「對(duì)氨基苯丙氨酸」(p-aminophenylalanine,簡(jiǎn)稱pAF)。研究結(jié)果分析顯示,pAF在20種自然胺基酸的強(qiáng)力競(jìng)爭(zhēng)下、依然能夠結(jié)合成新的蛋白質(zhì)。第18頁(yè)/共44頁(yè)第21個(gè)胺基酸如何拼碼?如何併入蛋白質(zhì)合成序列?
該研究團(tuán)隊(duì)將原本是蛋白質(zhì)合成時(shí)、訊息RNA序列上,作為停止合成蛋白質(zhì)指令的密碼,改換為非自然形成的第21種胺基酸,並建立了全新的蛋白質(zhì)合成路徑。這項(xiàng)研究的特殊之處在於生物合成,這種細(xì)菌能自我合成新胺基酸,有別於從培養(yǎng)基供應(yīng)的非自然形成胺基酸。研究還發(fā)現(xiàn),只需要鹽類及基本碳源,這種新創(chuàng)造出的細(xì)菌,便能進(jìn)行後續(xù)演化功能,包括從合成新種胺基酸到組成新蛋白質(zhì),可謂是全新的非自然物種。由於大腸桿菌長(zhǎng)久以來(lái)便以快速增殖能力著稱,再加上細(xì)菌產(chǎn)生第21種胺基酸造成突變,難免使人們產(chǎn)生此種細(xì)菌變成強(qiáng)勢(shì)物種,造成失控及擴(kuò)散的疑慮!為此,該研究團(tuán)隊(duì)將此新物種的白胺酸(Leucine)生物合成能力破壞(白胺酸為20種必須胺基酸之一),如此便可控制這種細(xì)菌免於擴(kuò)散實(shí)驗(yàn)室之外、引發(fā)未知的後續(xù)問(wèn)題。第19頁(yè)/共44頁(yè)酵素(Enzyme)酵素的命名:
最初酵素命名並無(wú)法定規(guī)則,但都附有-in
或-zyme
等字尾,如trypsin,renin
及l(fā)ysozyme等;後來(lái)漸以該酵素催化的反應(yīng)加上-ase
字尾為名,再冠上此反應(yīng)的反應(yīng)物,如histidinedecarboxylase(反應(yīng)物+反應(yīng)-ase)。酵素的分類:
1.氧化還原酶(Oxidoreductases):電子或質(zhì)子轉(zhuǎn)移。
2.轉(zhuǎn)移酶(Transferases):官能基團(tuán)的轉(zhuǎn)移。
3.水解酶(Hydrolases):加水或脫水分子。
4.異構(gòu)酶(
Isomerases):同一分子內(nèi)基團(tuán)之轉(zhuǎn)移。
5.裂解酶(Lyases):共價(jià)鍵生成或裂解。
6.連接酶(Ligases):消耗ATP生成分子間新鍵。酵素主要由蛋白質(zhì)所構(gòu)成,然許多酵素還需加上其它物質(zhì)。第20頁(yè)/共44頁(yè)全酶(Holoenzyme)的組成一般酵素由蛋白質(zhì)構(gòu)成,但某些酵素為醣蛋白或脂蛋白,有些要加上輔助因子(cofactor,coenzyme),才能成為功能完全的酵素稱之為全酶,若全酶失去了輔助因子,剩下的部份稱為原酶(apoenzyme),輔助因子都是人體無(wú)法自行合成,須由外界攝取者,我們?nèi)粘3缘木S他命丸,就幾乎全是輔助因子。
(apoenzyme)第21頁(yè)/共44頁(yè)輔酶(Coenzyme)二十種胺基酸的基團(tuán)中,不是屬於非極性者,就是相當(dāng)溫和的酸性或鹼性機(jī)團(tuán),酵素活性區(qū)經(jīng)常需要較強(qiáng)的官能基來(lái)引發(fā)催化反應(yīng),為補(bǔ)足此缺點(diǎn),且增加酵素的反應(yīng)能力,部份酵素因此納入蛋白質(zhì)以外的輔助因子參與其構(gòu)造,作為催化的重要反應(yīng)基團(tuán)。輔助因子:
1.金屬離子:如Zn2+,Mg2+,Mn2+,Fe2+,Cu2+,K+,以離子鍵結(jié)合在His,Cys,Glu等胺基酸。
2.有機(jī)小分子:分子構(gòu)造稍複雜而多樣又稱輔酶,如維生素B群、葉酸(folicacid)。輔酶的作用:
a.改變酵素構(gòu)形,b.協(xié)助催化反應(yīng),c.直接提供反應(yīng)基團(tuán)
第22頁(yè)/共44頁(yè)酵素的催化反應(yīng)在反應(yīng)物轉(zhuǎn)變成生成物的過(guò)程中,會(huì)有一介於兩者之間的中間過(guò)渡狀態(tài),是整個(gè)催化反應(yīng)最難達(dá)致的步驟,所以酵素的活性區(qū)是提供一個(gè)催化口袋,此口袋可以穩(wěn)定中間過(guò)渡狀態(tài)的形成。也就是說(shuō),酵素可以使過(guò)渡狀態(tài)比較容易形成,所需要的能量(活化能)比較低。第23頁(yè)/共44頁(yè)酵素的活性區(qū)(1)可穩(wěn)定過(guò)渡狀態(tài):過(guò)渡狀態(tài)分子的構(gòu)造中,經(jīng)常都有相當(dāng)高的局部電荷,而催化口袋內(nèi)的適當(dāng)位置上,剛好佈置有可以中和掉此局部高電荷的基團(tuán),因而得以穩(wěn)定過(guò)渡狀態(tài)。(2)防止水分子干擾:在水溶液中,許多離子間的鍵結(jié)或反應(yīng)都會(huì)被水分子干擾,故凹陷的催化口袋可隔離大多數(shù)水分子,使離子間的反應(yīng)順利進(jìn)行。(3)具高反應(yīng)性基團(tuán):在活性區(qū)內(nèi)的胺基酸基團(tuán),有些可以因?yàn)樘貏e的空間排列,而使得原本反應(yīng)性低的基團(tuán)(例如
Ser-OH),因?yàn)楦浇渌鶊F(tuán)的影響(如His可奪取其H+),而變成具有高反應(yīng)性的基團(tuán)(如Ser-O-)。(4)有輔酶幫助反應(yīng):活性區(qū)通常也是輔脢的結(jié)合區(qū),輔脢分子都帶有強(qiáng)大的電荷基團(tuán),可直接參與反應(yīng)或者輔助反應(yīng)進(jìn)行。
第24頁(yè)/共44頁(yè)酵素與基質(zhì)的反應(yīng)式酵素[E]與受質(zhì)或基質(zhì)[S]一定要先結(jié)合在一起成為[ES],然後才能得到生成物[P],因此[ES]的生成速度與消失速度一樣,則反應(yīng)液中的[ES]濃度為恆定,此稱為steadystatetheory。
第25頁(yè)/共44頁(yè)(I)(II)(III)(IV)酵素動(dòng)力學(xué)第26頁(yè)/共44頁(yè)酵素動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)中間圖表示當(dāng)基質(zhì)[S]濃度的高低變化時(shí),會(huì)影響酵素反應(yīng)的速率。左邊圖因直接作圖法只能以漸近估計(jì)求得Vmax,若x及y軸分別改為1/[S]及1/vo,可作出一條直線,由x軸上的交點(diǎn)求1/Km,由y軸交點(diǎn)求1/Vmax。右邊圖表示若Km越高,若要達(dá)到最高速率時(shí),所添加基質(zhì)的濃度也要越高,表示該基質(zhì)與酵素的親和力並不是很好。Vmax/2第27頁(yè)/共44頁(yè)酵素活性單位一般測(cè)定酵素活性時(shí),是在單位時(shí)間內(nèi)測(cè)定所得到生成物的量,如圖所示。若生成物以μmole表示,則酵素每分鐘催化產(chǎn)生得到1μmole,稱為一個(gè)活性單位,若活性單位再除以蛋白質(zhì)的mg數(shù)目,即得比活性。在一定時(shí)間內(nèi)測(cè)量生成物時(shí),要注意生成物的生成量與反應(yīng)時(shí)間要成正比,如上圖反應(yīng)時(shí)間在30min之內(nèi)都可以,但是反應(yīng)時(shí)間在之外時(shí)生成物已不成線性關(guān)係,測(cè)出來(lái)的活性將會(huì)不準(zhǔn)。
第28頁(yè)/共44頁(yè)酵素的抑制一般細(xì)胞內(nèi)的抑制劑都是屬於可逆性的抑制,也就是說(shuō)當(dāng)抑制劑去除後,酵素得以恢復(fù)原來(lái)的活性。但有些外來(lái)的抑制劑,或者是人工合成的化學(xué)抑制劑,都是對(duì)酵素分子造成共價(jià)性的永久抑制,是為不可逆性的抑制。第29頁(yè)/共44頁(yè)三種酵素抑制機(jī)制
第30頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例–Oxidoreductases一.氧化還原酵素(Oxidoreductase)
oxidase(氧化酶)、oxygenase(加氧酶)、peroxidase(過(guò)氧化酶)、dehydrogenase(脫氫酶)、reductase(還原酶)等多種。此種酵素作用於氧化還原反應(yīng),使物質(zhì)與氫脫離或氧結(jié)合,如:食物在體內(nèi)產(chǎn)生熱量時(shí),此酵素作用出現(xiàn).e.g.
L-lactatedehydrogenase(LDH,EC7)(S)-lactate+NAD+
pyruvate+NADH+H+
malatedehydrogenase(MDH,EC7)(S)-malate+NAD+
oxaloacetate+NADH+H+
第31頁(yè)/共44頁(yè)1.Oxidase:
以氧為氧化劑,對(duì)受質(zhì)進(jìn)行氧化催化。如:Glucoseoxidase(GOD,GOx,EC)Glucose+O2
gluconicacid+H2O22.Oxygenase:
以氧為氧化劑,催化受質(zhì)與氧原子結(jié)合的反應(yīng)。如:(Rubisco,EC9)
Ribulose1,5bisphosphate+O2
2-phosphoglycolate+3-phosphoglycerate+2H+
Rubisco:ribulose-1,5-bisphosphatecarboxylase/oxygenase3.Peroxidase:
以化學(xué)物質(zhì)為還原劑,將過(guò)氧化氫還原催化成H2O。如:(Horseraddishperoxidase,HRP,EC1.11.1.x)
ROOR'+electrondonor(2e-)+2H+→ROH+R'OH
(1)Ascorbateperoxidase:催化以ascorbicacid為還原劑。
(2)Glutathioneperoxidase:催化以glutathione為還原劑。
(3)Catalase(EC):亦為一種peroxidase,為催化H2O2為還原劑。
2H2O2
O2+2H2O第32頁(yè)/共44頁(yè)4.Dehydrogenase:
催化由受質(zhì)移走氫原子的反應(yīng),所移走的氫原子,會(huì)轉(zhuǎn)給酵素的輔酶(coenzymes,如NADP+、NAD+或FAD等)。該酵素要在有輔酶的情況下,始能進(jìn)行催化反應(yīng)且常具其逆反應(yīng)之催化性,即從輔酶(coenzymes,如NADPH、NADH或FADH2等)轉(zhuǎn)移氫原子給受質(zhì)。如:(1)Malate+NAD+-(MDH)oxaloacetate+NADH+H+(2)Succinate+FAD-(succinatedehydrogenase,
EC)
fumarate+FADH2(3)Glucose6-phosphate+NADP++H2O-(glucose6-phosphatedehydrogenase,EC9)6-phosphogluconate+NADPH+2H+(4)Acetaldedyde+NADH+H+-(ADH,EC)->alcohol+NAD+(5)pyruvate+NADH+H+-(LDH)lactate+NAD+
5.Reductase:
泛指可催化對(duì)受質(zhì)進(jìn)行還原反應(yīng)的酵素。如上述的peroxidase或dehydrogenase(催化其逆反應(yīng)時(shí))均是一種reductase。Reductase還有許多種類,如:
(1)
nitratereductase:催化將硝酸(nitrate,NO3-)還原成亞硝酸(nitrite,NO2-)的反應(yīng):2H++NO3-+2e-NO2-+H2O。(2)
nitritereductase:催化將亞硝酸(nitrite,NO2-)還原成氨(NH4+)的反應(yīng):8H++NO2-+6e-NH4++2H2O。第33頁(yè)/共44頁(yè)Glucose-6-phosphatedehydrogenase(G6PDH)deficiency
第34頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例-二.轉(zhuǎn)移酵素(transferase)EC2
轉(zhuǎn)移酶是一種催化一個(gè)分子(稱為供體)的官能團(tuán)(如甲基或磷酸鹽團(tuán))轉(zhuǎn)移至另一個(gè)分子(稱為受體)的酶。例如以下的化學(xué)反應(yīng)就是轉(zhuǎn)移酶:兩分子之間的原子或官能基的轉(zhuǎn)移。
A-X+BA+B-X
Cholineacetyltransferase(EC
)isanenzymewhichissynthesizedwithinthebodyofaneuron.Itisthentransferredtothenerveterminalviaaxoplasmicflow.ItjoinsAcetylCoAtocholine,resultingintheformationoftheneurotransmitter
acetylcholine.Acetylcholine(乙醯膽鹼)Choline(膽鹼)第35頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例-三.水解酵素(Hydrolase)EC3
1.水解酶是一種催化化學(xué)鍵的水解的酶,催化以下的化學(xué)反應(yīng)就是水解酶:A-B+H2OA-OH+B-H
2.此種酵素功能為水解化合物,食物進(jìn)入體內(nèi)經(jīng)水解後,以助體內(nèi)消化。如澱粉水解成葡萄糖以利體內(nèi)吸收
Glycosidehydrolases(EC3.2.1.x)glucose-6-phosphate(G6P)ishydrolyzedtoglucosebytheglucose-6-phosphatase(G6Pase,EC)complex第36頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例-四.裂解酵素(Lysase)EC4
從基質(zhì)內(nèi)取走官能基,但非經(jīng)過(guò)水解。
EC4.1包括分解C-C鍵的裂合酶,如脫羧酶
EC4.2包括分解C-O鍵的裂合酶,如脫水酶
EC4.3包括分解C-N鍵的裂合酶EC4.4包括分解C-S鍵的裂合酶EC4.5包括分解碳鹵鍵的裂合酶EC4.6包括分解P-O鍵的裂合酶,如腺苷環(huán)化酶
EC4.99包括其他裂合酶第37頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例-五.異構(gòu)酵素(Isomerase)EC5
異構(gòu)酶是一種催化同分異構(gòu)體轉(zhuǎn)換的酶。亦即,使某種物質(zhì)中的原子重新組合成為異構(gòu)物
β-甲氨基-L-丙氨酸,(英文β-methylaminoL-alanine,簡(jiǎn)稱BMAA),是一種神經(jīng)毒素,能在蘇鐵科植物種子中找到。這一種非蛋白胺基酸,與非必要胺基酸丙氨酸(alanine)十分相似,是由念珠藻屬的藍(lán)藻產(chǎn)生,而這些藍(lán)藻大都生長(zhǎng)於植物的根部。
L-alanine
D-alanine
第38頁(yè)/共44頁(yè)各種酵素的反應(yīng)例-六.接合酵素(Ligases)EC6
連接酶,或稱連結(jié)酶及結(jié)合酶,是一種催化兩種大型分子以一種新的化學(xué)鍵結(jié)合一起的酶,一般會(huì)涉及水解其中一個(gè)分子的團(tuán)。亦即,連結(jié)兩個(gè)分子,並隨之分解ATP中的焦磷酸鹽鍵.
A-b+CA-C+bA-c+D-bA-D+b+c
如:X+Y+ATP
X-Y+ADP+Pi
第39頁(yè)/共44頁(yè)酵素的命名.tw/BCbasics/Enzyme12.htm#1a.早期命名:
最初酵素命名並無(wú)法定規(guī)則,但都附有-in或-zyme等字尾,例如trypsin,renin及l(fā)ysozyme等;
後來(lái)漸以該酵素催化的反應(yīng)加上-ase字尾為名,再冠上此反應(yīng)的反應(yīng)物,如histidinedecarboxylase(反應(yīng)物+反應(yīng)-ase)。b.系統(tǒng)命名法:
1965年命名系統(tǒng)化,把所有酵素依催化反應(yīng)分成六大類,以四組數(shù)字名之(IUBMB系統(tǒng));例如histidinecarboxylase為EC2:
MainClass
:4Lyases分裂C-C,C-O,C-N鍵
Subclass
:4.1C-Clyase分裂C-C鍵
Sub-subclass:4.1.1Carboxylase分裂C-COO鍵
序列號(hào)碼:22第22個(gè)4.
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